Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3772
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3772, 1606 aa
1>>>pF1KE3772 1606 - 1606 aa - 1606 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3415+/-0.00128; mu= 18.5334+/- 0.076
mean_var=107.3417+/-21.200, 0's: 0 Z-trim(102.9): 154 B-trim: 26 in 1/49
Lambda= 0.123791
statistics sampled from 7010 (7176) to 7010 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.565), E-opt: 0.2 (0.22), width: 16
Scan time: 3.970
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6201.1 PREX2 gene_id:80243|Hs108|chr8 (1606) 10699 1923.4 0
CCDS13410.1 PREX1 gene_id:57580|Hs108|chr20 (1659) 4126 749.5 2e-215
CCDS42754.1 ARHGEF4 gene_id:50649|Hs108|chr2 ( 670) 675 132.9 3.4e-30
CCDS2165.1 ARHGEF4 gene_id:50649|Hs108|chr2 ( 690) 675 132.9 3.5e-30
CCDS66517.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13 ( 574) 651 128.6 5.9e-29
CCDS66518.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13 ( 596) 651 128.6 6e-29
CCDS9305.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13 ( 652) 651 128.6 6.5e-29
CCDS53857.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13 (1277) 651 128.8 1.1e-28
CCDS55430.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX ( 463) 644 127.3 1.2e-28
CCDS83477.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX ( 495) 644 127.3 1.2e-28
CCDS35315.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX ( 516) 644 127.3 1.3e-28
CCDS55429.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX ( 414) 637 126.0 2.6e-28
CCDS73553.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13 ( 512) 607 120.7 1.2e-26
CCDS6331.1 DEPTOR gene_id:64798|Hs108|chr8 ( 409) 523 105.6 3.4e-22
CCDS4829.1 FGD2 gene_id:221472|Hs108|chr6 ( 655) 365 77.6 1.5e-13
CCDS81679.1 FGD4 gene_id:121512|Hs108|chr12 ( 673) 360 76.7 2.9e-13
CCDS8727.1 FGD4 gene_id:121512|Hs108|chr12 ( 766) 360 76.7 3.2e-13
CCDS76544.1 FGD4 gene_id:121512|Hs108|chr12 ( 851) 360 76.7 3.5e-13
CCDS34552.1 PLEKHG1 gene_id:57480|Hs108|chr6 (1385) 363 77.4 3.6e-13
CCDS76545.1 FGD4 gene_id:121512|Hs108|chr12 ( 878) 360 76.7 3.6e-13
CCDS76690.1 PLEKHG3 gene_id:26030|Hs108|chr14 (1219) 354 75.8 9.8e-13
CCDS8221.1 ARHGEF17 gene_id:9828|Hs108|chr11 (2063) 353 75.8 1.7e-12
CCDS56338.1 ARHGEF38 gene_id:54848|Hs108|chr4 ( 777) 344 73.9 2.4e-12
CCDS6979.1 VAV2 gene_id:7410|Hs108|chr9 ( 839) 339 73.0 4.7e-12
CCDS48053.1 VAV2 gene_id:7410|Hs108|chr9 ( 878) 339 73.0 4.9e-12
CCDS9521.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs108|chr13 ( 646) 327 70.8 1.7e-11
CCDS45069.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs108|chr13 ( 753) 327 70.8 1.9e-11
CCDS32009.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs108|chr13 ( 782) 327 70.8 2e-11
CCDS69619.1 FGD3 gene_id:89846|Hs108|chr9 ( 724) 323 70.1 3e-11
CCDS43849.1 FGD3 gene_id:89846|Hs108|chr9 ( 725) 323 70.1 3e-11
>>CCDS6201.1 PREX2 gene_id:80243|Hs108|chr8 (1606 aa)
initn: 10699 init1: 10699 opt: 10699 Z-score: 10325.4 bits: 1923.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10699; 100.0% identity (100.0% similar) in 1606 aa overlap (1-1606:1-1606)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSEDSRGDSRAESAKDLEKQLRLRVCVLSELQKTERDYVGTLEFLVSAFLHRMNQCAASK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 MSEDSRGDSRAESAKDLEKQLRLRVCVLSELQKTERDYVGTLEFLVSAFLHRMNQCAASK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 VDKNVTEETVKMLFSNIEDILAVHKEFLKVVEECLHPEPNAQQEVGTCFLHFKDKFRIYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 VDKNVTEETVKMLFSNIEDILAVHKEFLKVVEECLHPEPNAQQEVGTCFLHFKDKFRIYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 EYCSNHEKAQKLLLELNKIRTIRTFLLNCMLLGGRKNTDVPLEGYLVTPIQRICKYPLIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 EYCSNHEKAQKLLLELNKIRTIRTFLLNCMLLGGRKNTDVPLEGYLVTPIQRICKYPLIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 KELLKRTPRKHSDYAAVMEALQAMKAVCSNINEAKRQMEKLEVLEEWQSHIEGWEGSNIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 KELLKRTPRKHSDYAAVMEALQAMKAVCSNINEAKRQMEKLEVLEEWQSHIEGWEGSNIT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 DTCTEMLMCGVLLKISSGNIQERVFFLFDNLLVYCKRKHRRLKNSKASTDGHRYLFRGRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 DTCTEMLMCGVLLKISSGNIQERVFFLFDNLLVYCKRKHRRLKNSKASTDGHRYLFRGRI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 NTEVMEVENVDDGTADFHSSGHIVVNGWKIHNTAKNKWFVCMAKTPEEKHEWFEAILKER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 NTEVMEVENVDDGTADFHSSGHIVVNGWKIHNTAKNKWFVCMAKTPEEKHEWFEAILKER
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 ERRKGLKLGMEQDTWVMISEQGEKLYKMMCRQGNLIKDRKRKLTTFPKCFLGSEFVSWLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 ERRKGLKLGMEQDTWVMISEQGEKLYKMMCRQGNLIKDRKRKLTTFPKCFLGSEFVSWLL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 EIGEIHRPEEGVHLGQALLENGIIHHVTDKHQFKPEQMLYRFRYDDGTFYPRNEMQDVIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 EIGEIHRPEEGVHLGQALLENGIIHHVTDKHQFKPEQMLYRFRYDDGTFYPRNEMQDVIS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 KGVRLYCRLHSLFTPVIRDKDYHLRTYKSVVMANKLIDWLIAQGDCRTREEAMIFGVGLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 KGVRLYCRLHSLFTPVIRDKDYHLRTYKSVVMANKLIDWLIAQGDCRTREEAMIFGVGLC
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 DNGFMHHVLEKSEFKDEPLLFRFFSDEEMEGSNMKHRLMKHDLKVVENVIAKSLLIKSNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 DNGFMHHVLEKSEFKDEPLLFRFFSDEEMEGSNMKHRLMKHDLKVVENVIAKSLLIKSNE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 GSYGFGLEDKNKVPIIKLVEKGSNAEMAGMEVGKKIFAINGDLVFMRPFNEVDCFLKSCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 GSYGFGLEDKNKVPIIKLVEKGSNAEMAGMEVGKKIFAINGDLVFMRPFNEVDCFLKSCL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 NSRKPLRVLVSTKPRETVKIPDSADGLGFQIRGFGPSVVHAVGRGTVAAAAGLHPGQCII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 NSRKPLRVLVSTKPRETVKIPDSADGLGFQIRGFGPSVVHAVGRGTVAAAAGLHPGQCII
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 KVNGINVSKETHASVIAHVTACRKYRRPTKQDSIQWVYNSIESAQEDLQKSHSKPPGDEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 KVNGINVSKETHASVIAHVTACRKYRRPTKQDSIQWVYNSIESAQEDLQKSHSKPPGDEA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 GDAFDCKVEEVIDKFNTMAIIDGKKEHVSLTVDNVHLEYGVVYEYDSTAGIKCNVVEKMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 GDAFDCKVEEVIDKFNTMAIIDGKKEHVSLTVDNVHLEYGVVYEYDSTAGIKCNVVEKMI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 EPKGFFSLTAKILEALAKSDEHFVQNCTSLNSLNEVIPTDLQSKFSALCSERIEHLCQRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 EPKGFFSLTAKILEALAKSDEHFVQNCTSLNSLNEVIPTDLQSKFSALCSERIEHLCQRI
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 SSYKKFSRVLKNRAWPTFKQAKSKISPLHSSDFCPTNCHVNVMEVSYPKTSTSLGSAFGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 SSYKKFSRVLKNRAWPTFKQAKSKISPLHSSDFCPTNCHVNVMEVSYPKTSTSLGSAFGV
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 QLDSRKHNSHDKENKSSEQGKLSPMVYIQHTITTMAAPSGLSLGQQDGHGLRYLLKEEDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 QLDSRKHNSHDKENKSSEQGKLSPMVYIQHTITTMAAPSGLSLGQQDGHGLRYLLKEEDL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 ETQDIYQKLLGKLQTALKEVEMCVCQIDDLLSSITYSPKLERKTSEGIIPTDSDNEKGER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 ETQDIYQKLLGKLQTALKEVEMCVCQIDDLLSSITYSPKLERKTSEGIIPTDSDNEKGER
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE3 NSKRVCFNVAGDEQEDSGHDTISNRDSYSDCNSNRNSIASFTSICSSQCSSYFHSDEMDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 NSKRVCFNVAGDEQEDSGHDTISNRDSYSDCNSNRNSIASFTSICSSQCSSYFHSDEMDS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE3 GDELPLSVRISHDKQDKIHSCLEHLFSQVDSITNLLKGQAVVRAFDQTKYLTPGRGLQEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 GDELPLSVRISHDKQDKIHSCLEHLFSQVDSITNLLKGQAVVRAFDQTKYLTPGRGLQEF
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE3 QQEMEPKLSCPKRLRLHIKQDPWNLPSSVRTLAQNIRKFVEEVKCRLLLALLEYSDSETQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 QQEMEPKLSCPKRLRLHIKQDPWNLPSSVRTLAQNIRKFVEEVKCRLLLALLEYSDSETQ
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE3 LRRDMVFCQTLVATVCAFSEQLMAALNQMFDNSKENEMETWEASRRWLDQIANAGVLFHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 LRRDMVFCQTLVATVCAFSEQLMAALNQMFDNSKENEMETWEASRRWLDQIANAGVLFHF
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE3 QSLLSPNLTDEQAMLEDTLVALFDLEKVSFYFKPSEEEPLVANVPLTYQAEGSRQALKVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 QSLLSPNLTDEQAMLEDTLVALFDLEKVSFYFKPSEEEPLVANVPLTYQAEGSRQALKVY
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE3 FYIDSYHFEQLPQRLKNGGGFKIHPVLFAQALESMEGYYYRDNVSVEEFQAQINAASLEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 FYIDSYHFEQLPQRLKNGGGFKIHPVLFAQALESMEGYYYRDNVSVEEFQAQINAASLEK
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE3 VKQYNQKLRAFYLDKSNSPPNSTSKAAYVDKLMRPLNALDELYRLVASFIRSKRTAACAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 VKQYNQKLRAFYLDKSNSPPNSTSKAAYVDKLMRPLNALDELYRLVASFIRSKRTAACAN
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE3 TACSASGVGLLSVSSELCNRLGACHIIMCSSGVHRCTLSVTLEQAIILARSHGLPPRYIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 TACSASGVGLLSVSSELCNRLGACHIIMCSSGVHRCTLSVTLEQAIILARSHGLPPRYIM
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600
pF1KE3 QATDVMRKQGARVQNTAKNLGVRDRTPQSAPRLYKLCEPPPPAGEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 QATDVMRKQGARVQNTAKNLGVRDRTPQSAPRLYKLCEPPPPAGEE
1570 1580 1590 1600
>>CCDS13410.1 PREX1 gene_id:57580|Hs108|chr20 (1659 aa)
initn: 5028 init1: 1608 opt: 4126 Z-score: 3980.9 bits: 749.5 E(32554): 2e-215
Smith-Waterman score: 6131; 57.4% identity (80.8% similar) in 1640 aa overlap (5-1600:31-1654)
10 20 30
pF1KE3 MSEDSRGDSRAESAKDLEKQLRLRVCVLSELQKT
: : . .:.. :.:::::.:::.:. :
CCDS13 MEAPSGSEPGGDGAGDCAHPDPRAPGAAAPSSGPGPCAAARESERQLRLRLCVLNEILGT
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 ERDYVGTLEFLVSAFLHRMNQCAASKVDKNVTEETVKMLFSNIEDILAVHKEFLKVVEEC
::::::::.:: ::::::. : .:..:.:..:::.::.::::::::: :::.:: ..: :
CCDS13 ERDYVGTLRFLQSAFLHRIRQNVADSVEKGLTEENVKVLFSNIEDILEVHKDFLAALEYC
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 LHPEPNAQQEVGTCFLHFKDKFRIYDEYCSNHEKAQKLLLELNKIRTIRTFLLNCMLLGG
:::::..:.:.:. ::.::::: .:.::::::::: .::.::::: :.:.:::.::::::
CCDS13 LHPEPQSQHELGNVFLKFKDKFCVYEEYCSNHEKALRLLVELNKIPTVRAFLLSCMLLGG
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 RKNTDVPLEGYLVTPIQRICKYPLILKELLKRTPRKHSDYAAVMEALQAMKAVCSNINEA
::.::.::::::..::::::::::.:::: :::: :: :. ::. ::::::.:::::::.
CCDS13 RKTTDIPLEGYLLSPIQRICKYPLLLKELAKRTPGKHPDHPAVQSALQAMKTVCSNINET
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 KRQMEKLEVLEEWQSHIEGWEGSNITDTCTEMLMCGVLLKISSGNIQERVFFLFDNLLVY
::::::::.::. :::::::::::.:: ::..:. :.:::::.::::::.::::::::::
CCDS13 KRQMEKLEALEQLQSHIEGWEGSNLTDICTQLLLQGTLLKISAGNIQERAFFLFDNLLVY
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320
pF1KE3 CKRKHRRLKNSKAST------DGHRYLFRGRINTEVMEVENVDDGTADFHSSGHIVVNGW
:::: : . .:: :: .: :.:::::::::::::::.:::::.::.:. :.:::
CCDS13 CKRKSR-VTGSKKSTKRTKSINGSLYIFRGRINTEVMEVENVEDGTADYHSNGYTVTNGW
310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 KIHNTAKNKWFVCMAKTPEEKHEWFEAILKERERRKGLKLGMEQDTWVMISEQGEKLYKM
::::::::::::::::: :::..:..::..:::.:..::::::.:..:::.:.:::::.:
CCDS13 KIHNTAKNKWFVCMAKTAEEKQKWLDAIIREREQRESLKLGMERDAYVMIAEKGEKLYHM
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 MC-RQGNLIKDRKRKLTTFPKCFLGSEFVSWLLEIGEIHRPEEGVHLGQALLENGIIHHV
: .. ::::::.:::.: ::::::.:::.:::::::: . ::::.::::::::::::::
CCDS13 MMNKKVNLIKDRRRKLSTVPKCFLGNEFVAWLLEIGEISKTEEGVNLGQALLENGIIHHV
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KE3 TDKHQFKPEQMLYRFRYDDGTFYPRNEMQDVISKGVRLYCRLHSLFTPVIRDKDYHLRTY
.:::::: ::..:::::::::. :.:..:..:::::::::::::.::::.:.::::.::
CCDS13 SDKHQFKNEQVMYRFRYDDGTYKARSELEDIMSKGVRLYCRLHSLYTPVIKDRDYHLKTY
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KE3 KSVVMANKLIDWLIAQGDCRTREEAMIFGVGLCDNGFMHHVLEKSEFKDEPLLFRFFSDE
:::. ..::.:::.:::::.:::::. .:::::.:::::::::::::.:: ::: .::
CCDS13 KSVLPGSKLVDWLLAQGDCQTREEAVALGVGLCNNGFMHHVLEKSEFRDESQYFRFHADE
540 550 560 570 580 590
570 580 590 600 610 620
pF1KE3 EMEGSNMKHRLMKHDLKVVENVIAKSLLIKSNEGSYGFGLEDKNKVPIIKLVEKGSNAEM
::::.. :.. ...:.:.:::..:: ::: .: .::: .:.:::. ..: :..:: ::.
CCDS13 EMEGTSSKNKQLRNDFKLVENILAKRLLILPQEEDYGFDIEEKNKAVVVKSVQRGSLAEV
600 610 620 630 640 650
630 640 650 660 670 680
pF1KE3 AGMEVGKKIFAINGDLVFMRPFNEVDCFLKSCLNSRKPLRVLVSTKPRETVKIPDSADGL
::..::.::..:: ::::.:::.::. .:.. . ::.:::.::.:: .: .::::. : :
CCDS13 AGLQVGRKIYSINEDLVFLRPFSEVESILNQSFCSRRPLRLLVATKAKEIIKIPDQPDTL
660 670 680 690 700 710
690 700 710 720 730 740
pF1KE3 GFQIRGFGPSVVHAVGRGTVAAAAGLHPGQCIIKVNGINVSKETHASVIAHVTACRKYRR
::::: .: :.:::::. : :::: ::::.:::: :: .. :. : : :. ::
CCDS13 CFQIRGAAPPYVYAVGRGSEAMAAGLCAGQCILKVNGSNVMNDGAPEVLEHFQAFRS-RR
720 730 740 750 760 770
750 760 770 780 790 800
pF1KE3 PTKQDSIQWVYNSIESAQE---DLQKSHSKPPGDEAGDAFDCKVEEVIDKFNTMAIIDGK
::.:.. :.::: . . : : :..: . . . ... .
CCDS13 EEALGLYQWIYHTHEDAQEARASQEASTEDPSGEQAQEEDQADSAFPLLSLGPRLSLCED
780 790 800 810 820 830
810 820 830 840 850 860
pF1KE3 KEHVSLTVDNVHLEYGVVYEYDSTAGIKCNVVEKMIEPKGFFSLTAKILEALAKSDEHFV
. :.:::::::::.:::::: ::::..:.:.::..::.: :.::::::::.: .: ::
CCDS13 SPMVTLTVDNVHLEHGVVYEYVSTAGVRCHVLEKIVEPRGCFGLTAKILEAFAANDSVFV
840 850 860 870 880 890
870 880 890 900 910 920
pF1KE3 QNCTSLNSLNEVIPTDLQSKFSALCSERIEHLCQRISSYKKFSRVLKNRAWPTFKQAKSK
.:: : .:. .: : . .: .:. ..: . :::. :..:. ::.:. : :::: .
CCDS13 ENCRRLMALSSAIVTMPHFEFRNICDTKLESIGQRIACYQEFAAQLKSRVSPPFKQAPLE
900 910 920 930 940 950
930 940 950 960 970 980
pF1KE3 ISPLHSSDFCPTNCHVNVMEVSYPKTSTSLGSAFGVQLDSRKHNSHDKENKSSEQGKLSP
:: . ::::::::.:.::::::::. :.: .:.... .:: . . :::.:.:
CCDS13 PHPLCGLDFCPTNCHINLMEVSYPKTTPSVGRSFSIRF-GRKPSLIGLD---PEQGHLNP
960 970 980 990 1000 1010
990 1000 1010 1020
pF1KE3 MVYIQHTITTMAAPS--------------GL----------SLGQQDGHGLRYLLKEEDL
: : :: :::::::: :: .:::.: .:: .:::.::
CCDS13 MSYTQHCITTMAAPSWKCLPAAEGDPQGQGLHDGSFGPASGTLGQED-RGLSFLLKQEDR
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE3 ETQDIYQKLLGKLQTALKEVEMCVCQIDDLLSSITYSPK--------LERKTSEGIIPTD
: :: : .:. ::..::::... : ::. :::.:: . :. .: .. .
CCDS13 EIQDAYLQLFTKLDVALKEMKQYVTQINRLLSTITEPTSGGSCDASLAEEASSLPLVSEE
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE3 SDNEKGERNS-KRVCFNVAGDEQEDSGHDTISNRDSYSDCNSNRNSIASFTSICSSQCSS
:. ....... :.:::.:: ..::::::::.: :::::.:::::.:. :.::. :. ::
CCDS13 SEMDRSDHGGIKKVCFKVAEEDQEDSGHDTMSYRDSYSECNSNRDSVLSYTSVRSN--SS
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE3 YFHSDEMDSGDELPLSVRISHDKQDKIHSCLEHLFSQVDSITNLLKGQAVVRAFDQTKYL
:. :::: :::::: ..:: :::::.:.::::::.:::::. :::: .. :::..::..
CCDS13 YLGSDEMGSGDELPCDMRIPSDKQDKLHGCLEHLFNQVDSINALLKGPVMSRAFEETKHF
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KE3 TPGRGLQEFQQEMEPKLSCPKRLRLHIKQDPWNLPSSVRTLAQNIRKFVEEVKCRLLLAL
...::::.:. : . . ... :..::::::.:..::..::...::. : .:::::
CCDS13 PMNHSLQEFKQKEECTIRGRSLIQISIQEDPWNLPNSIKTLVDNIQRYVEDGKNQLLLAL
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KE3 LEYSDSETQLRRDMVFCQTLVATVCAFSEQLMAALNQMFDNSKENEMETWEASRRWLDQI
:. .:.: ::::: .:::.:::.::.::.::.:::. ..:. : : . .:::.::.:.
CCDS13 LKCTDTELQLRRDAIFCQALVAAVCTFSKQLLAALGYRYNNNGEYEESSRDASRKWLEQV
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KE3 ANAGVLFHFQSLLSP-NLTDEQAMLEDTLVALFDLEKVSFYFKPSEEEPLVANVPLTYQA
: .:::.: :::::: .. .:..:::: :.: .:..:.: :: .:. :::. . :.
CCDS13 AATGVLLHCQSLLSPATVKEERTMLEDIWVTLSELDNVTFSFKQLDEN-YVANTNVFYHI
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KE3 EGSRQALKVYFYIDSYHFEQLPQRLKNGGGFKIHPVLFAQALESMEGYYYRDNVSVEEFQ
::::::::: ::.::::: .::.::..:.....: .::...::..:: . ..:..:
CCDS13 EGSRQALKVIFYLDSYHFSKLPSRLEGGASLRLHTALFTKVLENVEGLPSPGSQAAEDLQ
1440 1450 1460 1470 1480 1490
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KE3 AQINAASLEKVKQYNQKLRAFYLDKSNSPPNSTSKAAYVDKLMRPLNALDELYRLVASFI
.::: :::::.:: .:::::::..:: : .... :. .:.:.::.:::::: ::. ::.
CCDS13 QDINAQSLEKVQQYYRKLRAFYLERSNLPTDASTTAVKIDQLIRPINALDELCRLMKSFV
1500 1510 1520 1530 1540 1550
1500 1510 1520 1530 1540 1550
pF1KE3 RSKRTAACANTACSASGVGLLSVSSELCNRLGACHIIMCSSGVHRCTLSVTLEQAIILAR
. : :: .. :.::. .::::: :::::...::..:..: ::::.:::: ::::
CCDS13 HPKPGAA------GSVGAGLIPISSELCYRLGACQMVMCGTGMQRSTLSVSLEQAAILAR
1560 1570 1580 1590 1600
1560 1570 1580 1590 1600
pF1KE3 SHGLPPRYIMQATDVMRKQGARVQNTAKNLGVRDRTPQSAPRLYKLCEPPPPAGEE
:::: :. ::::::.::::: ::. :::: :.:. ::.:::::.::.::
CCDS13 SHGLLPKCIMQATDIMRKQGPRVEILAKNLRVKDQMPQGAPRLYRLCQPPVDGDL
1610 1620 1630 1640 1650
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10 20 30
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pF1KE3 QKTERDYVGTLEFLVSAFLHRMNQCAASKVDKNVTEETVKMLFSNIEDILAVHKEFLKVV
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CCDS42 LSTERDYIKHLRDICEGYVR---QCR-KRADM-FSEEQLRTIFGNIEDIYRCQKAFVKAL
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: .: :. :.:.:.::.:.:::::: : :::: : .: :. : ::.::: : . :
CCDS42 L--QKMIDISLDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTHPQHRDFKDVEAALHAMKNVAQLI
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pF1KE3 NEAKRQMEKLEVLEEWQSHIEGWEGSNITDTCTEMLMCGVLLKISSGNI--QERVFFLFD
:: ::..:... . .::: :: ::: .. .:... : : .... . :.:.:::::
CCDS42 NERKRRLENIDKIAQWQSSIEDWEGEDLLVRSSELIYSGELTRVTQPQAKSQQRMFFLFD
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. :.:::. : : : .::.. . .:: ...:: :.: : . :..
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pF1KE3 KIHNTAK-NKWFVCMAKTPEEKHEWFEAILKERERRKGLKLGMEQDTWVMISEQGEKLYK
..: : .. ..: : ::.:..:..:. .::: .. ..:.: :.:
CCDS42 RLHRGATGDSHLLCTRK-PEQKQRWLKAFARERE-----QVQLDQETGFSITE-------
580 590 600 610 620
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. :. ... :...: ::
CCDS42 -LQRKQAMLNASKQQVTGKPKGRRTAAPPPRLPGPYPADIIPFSEPQSQAS
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10 20 30
pF1KE3 MSEDSRGDSRAESAKDLEKQLRLRVCVLSEL
.:: : ..:.:.:: ..:. :..:.
CCDS21 EGWFPASFVRLRVNQDEPADDDAPLAGNSGAED--GGAEAQSSKD-----QMRTNVINEI
240 250 260 270 280 290
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pF1KE3 QKTERDYVGTLEFLVSAFLHRMNQCAASKVDKNVTEETVKMLFSNIEDILAVHKEFLKVV
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CCDS21 LSTERDYIKHLRDICEGYVR---QC--RKRADMFSEEQLRTIFGNIEDIYRCQKAFVKAL
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pF1KE3 EECLHPEPNAQQEVGTCFLHFKDKFRIYDEYCSNHEKAQKLLLELNKIRTIRTFLLNCML
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CCDS21 EQRFNRERPHLSELGACFLEHQADFQIYSEYCNNHPNACVELSRLTKLSKYVYFFEACRL
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pF1KE3 LGGRKNTDVPLEGYLVTPIQRICKYPLILKELLKRTPRKHSDYAAVMEALQAMKAVCSNI
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CCDS21 L--QKMIDISLDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTHPQHRDFKDVEAALHAMKNVAQLI
410 420 430 440 450 460
220 230 240 250 260
pF1KE3 NEAKRQMEKLEVLEEWQSHIEGWEGSNITDTCTEMLMCGVLLKISSGNI--QERVFFLFD
:: ::..:... . .::: :: ::: .. .:... : : .... . :.:.:::::
CCDS21 NERKRRLENIDKIAQWQSSIEDWEGEDLLVRSSELIYSGELTRVTQPQAKSQQRMFFLFD
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pF1KE3 NLLVYCKRKHRRLKNSKASTDGHRYLFRGRINTEVMEVENVDDGTA-DFHSSGHIVVNGW
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CCDS21 HQLIYCKKDLLR-------RDVLYY--KGRLDMDGLEVVDLEDGKDRDLHVS---IKNAF
530 540 550 560 570
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pF1KE3 KIHNTAKNKWFVCMAKTPEEKHEWFEAILKERERRKGLKLGMEQDTWVMISEQGEKLYKM
..: : . . .. ::.:..:..:. .::: .. ..:.: :.:
CCDS21 RLHRGATGDSHLLCTRKPEQKQRWLKAFARERE-----QVQLDQETGFSITE--------
580 590 600 610 620
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pF1KE3 MCRQGNLIKDRKRKLTTFPK-----CFLGSEFVSWLLEIGEIHRPEEGVHLGQALLENGI
. :. ... :...: :: :.:
CCDS21 LQRKQAMLNASKQQVTGKPKAVGRPCYLTRQKHPALPSNRPQQQVLVLAEPRRKPSTFWH
630 640 650 660 670 680
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10 20 30
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pF1KE3 EECLHPEPNAQQEVGTCFLHFKDKFRIYDEYCSNHEKAQKLLLELNKIRTIRTFLLNCML
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CCDS66 EKQYNKEEPHLSEIGSCFLQNQEGFAIYSEYCNNHPGACLELANLMKQGKYRHFFEACRL
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160 170 180 190 200 210
pF1KE3 LGGRKNTDVPLEGYLVTPIQRICKYPLILKELLKRTPRKHSDYAAVMEALQAMKAVCSNI
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CCDS66 L--QQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTTQEHGDYSNIKAAYEAMKNVACLI
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220 230 240 250 260 270
pF1KE3 NEAKRQMEKLEVLEEWQSHIEGWEGSNITDTCTEMLMCGVLLKISS-GNIQERVFFLFDN
:: ::..:... . .:: : :::: .: : .:.. : : ::.. :. :.:.:::::.
CCDS66 NERKRKLESIDKIARWQVSIVGWEGLDILDRSSELIHSGELTKITKQGKSQQRTFFLFDH
350 360 370 380 390 400
280 290 300 310 320
pF1KE3 LLVYCKRKHRRLKNSKASTDGHRYLFRGRINTEVMEVENVDDGT-ADFHSSGHIVVNGWK
:: ::. : : : .::.. . ::. .. :: : . : : :..:
CCDS66 QLVSCKKDLLR-------RDMLYY--KGRLDMDEMELVDLGDGRDKDCNLS---VKNAFK
410 420 430 440 450
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 IHNTAKNKWFVCMAKTPEEKHEWFEAILKERER-RKGLKLGMEQDTWVMISEQGEKLYKM
. . . .. .. :: :.: .:..: ::.: .. ..::: :::. .:: .
CCDS66 LVSRTTDEVYLFCAKKQEDKARWLQACADERRRVQEDKEMGME------ISENQKKLAML
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pF1KE3 MCRQGNLIKDRKRKLTTFPKCFLGSEFVSWLLEIGEIHRPEEGVHLGQALLENGIIHHVT
.... :..
CCDS66 NAQKAGHGKSKGYNRCPVAPPHQGLHPIHQRHITMPTSVPQQQVFGLAEPKRKSSLFWHT
510 520 530 540 550 560
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10 20 30
pF1KE3 MSEDSRGDSRAESAKDLEKQLRLRVCVLSEL
::.. .. . :.. ..:. :. :.
CCDS66 SEDKEAWFPASFVRLRVNQEELSENSSSTPSEEQDEEASQSRHRHCENKQQMRTNVIREI
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40 50 60 70 80 90
pF1KE3 QKTERDYVGTLEFLVSAFLHRMNQCAASKVDKNVTEETVKMLFSNIEDILAVHKEFLKVV
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CCDS66 MDTERVYIKHLRDICEGYIR---QC--RKHTGMFTVAQLATIFGNIEDIYKFQRKFLKDL
200 210 220 230 240
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 EECLHPEPNAQQEVGTCFLHFKDKFRIYDEYCSNHEKAQKLLLELNKIRTIRTFLLNCML
:. . : .:.:.:::. .. : ::.:::.:: : : .: : : :. : :
CCDS66 EKQYNKEEPHLSEIGSCFLQNQEGFAIYSEYCNNHPGACLELANLMKQGKYRHFFEACRL
250 260 270 280 290 300
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 LGGRKNTDVPLEGYLVTPIQRICKYPLILKELLKRTPRKHSDYAAVMEALQAMKAVCSNI
: .. :. ..:.:.::.:.:::::: : :::: : ..:.::. . : .::: : :
CCDS66 L--QQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTTQEHGDYSNIKAAYEAMKNVACLI
310 320 330 340 350 360
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 NEAKRQMEKLEVLEEWQSHIEGWEGSNITDTCTEMLMCGVLLKISS-GNIQERVFFLFDN
:: ::..:... . .:: : :::: .: : .:.. : : ::.. :. :.:.:::::.
CCDS66 NERKRKLESIDKIARWQVSIVGWEGLDILDRSSELIHSGELTKITKQGKSQQRTFFLFDH
370 380 390 400 410 420
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pF1KE3 LLVYCKRKHRRLKNSKASTDGHRYLFRGRINTEVMEVENVDDGT-ADFHSSGHIVVNGWK
:: ::. : : : .::.. . ::. .. :: : . : : :..:
CCDS66 QLVSCKKDLLR-------RDMLYY--KGRLDMDEMELVDLGDGRDKDCNLS---VKNAFK
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pF1KE3 IHNTAKNKWFVCMAKTPEEKHEWFEAILKERER-RKGLKLGMEQDTWVMISEQGEKLYKM
. . . .. .. :: :.: .:..: ::.: .. ..::: :::. .:: .
CCDS66 LVSRTTDEVYLFCAKKQEDKARWLQACADERRRVQEDKEMGME------ISENQKKLAML
480 490 500 510 520
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pF1KE3 MCRQGNLIKDRKRKLTTFPKCFLGSEFVSWLLEIGEIHRPEEGVHLGQALLENGIIHHVT
.... :..
CCDS66 NAQKAGHGKSKGYNRCPVAPPHQGLHPIHQRHITMPTSVPQQQVFGLAEPKRKSSLFWHT
530 540 550 560 570 580
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10 20 30
pF1KE3 MSEDSRGDSRAESAKDLEKQLRLRVCVLSEL
::.. .. . :.. ..:. :. :.
CCDS93 SEDKEAWFPASFVRLRVNQEELSENSSSTPSEEQDEEASQSRHRHCENKQQMRTNVIREI
190 200 210 220 230 240
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pF1KE3 QKTERDYVGTLEFLVSAFLHRMNQCAASKVDKNVTEETVKMLFSNIEDILAVHKEFLKVV
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CCDS93 MDTERVYIKHLRDICEGYIR---QC--RKHTGMFTVAQLATIFGNIEDIYKFQRKFLKDL
250 260 270 280 290 300
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 EECLHPEPNAQQEVGTCFLHFKDKFRIYDEYCSNHEKAQKLLLELNKIRTIRTFLLNCML
:. . : .:.:.:::. .. : ::.:::.:: : : .: : : :. : :
CCDS93 EKQYNKEEPHLSEIGSCFLQNQEGFAIYSEYCNNHPGACLELANLMKQGKYRHFFEACRL
310 320 330 340 350 360
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 LGGRKNTDVPLEGYLVTPIQRICKYPLILKELLKRTPRKHSDYAAVMEALQAMKAVCSNI
: .. :. ..:.:.::.:.:::::: : :::: : ..:.::. . : .::: : :
CCDS93 L--QQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTTQEHGDYSNIKAAYEAMKNVACLI
370 380 390 400 410 420
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 NEAKRQMEKLEVLEEWQSHIEGWEGSNITDTCTEMLMCGVLLKISS-GNIQERVFFLFDN
:: ::..:... . .:: : :::: .: : .:.. : : ::.. :. :.:.:::::.
CCDS93 NERKRKLESIDKIARWQVSIVGWEGLDILDRSSELIHSGELTKITKQGKSQQRTFFLFDH
430 440 450 460 470 480
280 290 300 310 320
pF1KE3 LLVYCKRKHRRLKNSKASTDGHRYLFRGRINTEVMEVENVDDGT-ADFHSSGHIVVNGWK
:: ::. : : : .::.. . ::. .. :: : . : : :..:
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. . . .. .. :: :.: .:..: ::.: .. ..::: :::. .:: .
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.... :..
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. . . .. .. :: :.: .:..: ::.: .. ..::: :::. .:: .
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.... :..
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230 240 250 260 270 280
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230 240 250 260 270 280
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]