Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3769
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3769, 916 aa
1>>>pF1KE3769 916 - 916 aa - 916 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8547+/-0.000969; mu= 13.4838+/- 0.058
mean_var=104.7241+/-21.310, 0's: 0 Z-trim(107.6): 90 B-trim: 143 in 1/50
Lambda= 0.125329
statistics sampled from 9611 (9702) to 9611 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.664), E-opt: 0.2 (0.298), width: 16
Scan time: 3.890
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2794.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3 ( 916) 6276 1146.1 0
CCDS2793.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3 ( 963) 4664 854.7 0
CCDS14277.1 USP11 gene_id:8237|Hs108|chrX ( 963) 2651 490.7 5.5e-138
CCDS8963.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12 ( 952) 1639 307.7 6.6e-83
CCDS58251.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12 ( 981) 1639 307.7 6.8e-83
CCDS58832.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3 ( 313) 1622 304.4 2.1e-82
CCDS58250.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12 ( 235) 1134 216.1 6.1e-56
CCDS32697.1 USP32 gene_id:84669|Hs108|chr17 (1604) 960 185.1 9.4e-46
CCDS43090.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3 (1318) 947 182.7 4e-45
CCDS56256.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3 (1372) 947 182.7 4.2e-45
CCDS56255.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3 (1384) 947 182.7 4.2e-45
CCDS56254.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3 (1419) 947 182.7 4.3e-45
CCDS11069.2 USP6 gene_id:9098|Hs108|chr17 (1406) 899 174.0 1.7e-42
CCDS61632.1 USP8 gene_id:9101|Hs108|chr15 (1012) 646 128.2 7.8e-29
CCDS10137.1 USP8 gene_id:9101|Hs108|chr15 (1118) 646 128.2 8.5e-29
CCDS8422.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 ( 605) 548 110.4 1.1e-23
CCDS58189.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 ( 362) 543 109.4 1.3e-23
CCDS8423.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 ( 396) 537 108.3 3e-23
CCDS58370.1 USP3 gene_id:9960|Hs108|chr15 ( 476) 466 95.5 2.5e-19
CCDS32265.1 USP3 gene_id:9960|Hs108|chr15 ( 520) 466 95.5 2.7e-19
CCDS680.1 USP33 gene_id:23032|Hs108|chr1 ( 828) 384 80.8 1.2e-14
CCDS679.1 USP33 gene_id:23032|Hs108|chr1 ( 911) 384 80.8 1.3e-14
CCDS678.1 USP33 gene_id:23032|Hs108|chr1 ( 942) 384 80.8 1.3e-14
CCDS30920.1 USP21 gene_id:27005|Hs108|chr1 ( 565) 377 79.4 2.1e-14
CCDS43892.1 USP20 gene_id:10868|Hs108|chr9 ( 914) 370 78.3 7.5e-14
CCDS58516.1 USP43 gene_id:124739|Hs108|chr17 (1118) 342 73.2 3e-12
CCDS45610.1 USP43 gene_id:124739|Hs108|chr17 (1123) 342 73.2 3e-12
>>CCDS2794.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3 (916 aa)
initn: 6276 init1: 6276 opt: 6276 Z-score: 6133.4 bits: 1146.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6276; 100.0% identity (100.0% similar) in 916 aa overlap (1-916:1-916)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MAEGGGCRERPDAETQKSELGPLMRTTLQRGAQWYLIDSRWFKQWKKYVGFDSWDMYNVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 MAEGGGCRERPDAETQKSELGPLMRTTLQRGAQWYLIDSRWFKQWKKYVGFDSWDMYNVG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 EHNLFPGPIDNSGLFSDPESQTLKEHLIDELDYVLVPTEAWNKLLNWYGCVEGQQPIVRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 EHNLFPGPIDNSGLFSDPESQTLKEHLIDELDYVLVPTEAWNKLLNWYGCVEGQQPIVRK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 VVEHGLFVKHCKVEVYLLELKLCENSDPTNVLSCHFSKADTIATIEKEMRKLFNIPAERE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 VVEHGLFVKHCKVEVYLLELKLCENSDPTNVLSCHFSKADTIATIEKEMRKLFNIPAERE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 TRLWNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQNEDGTWPRQTLQSNGSGFSASY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 TRLWNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQNEDGTWPRQTLQSNGSGFSASY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 NCQEPPSSHIQPGLCGLGNLGNTCFMNSALQCLSNTAPLTDYFLKDEYEAEINRDNPLGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 NCQEPPSSHIQPGLCGLGNLGNTCFMNSALQCLSNTAPLTDYFLKDEYEAEINRDNPLGM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 KGEIAEAYAELIKQMWSGRDAHVAPRMFKTQVGRFAPQFSGYQQQDSQELLAFLLDGLHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 KGEIAEAYAELIKQMWSGRDAHVAPRMFKTQVGRFAPQFSGYQQQDSQELLAFLLDGLHE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 DLNRVKKKPYLELKDANGRPDAVVAKEAWENHRLRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPECAKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 DLNRVKKKPYLELKDANGRPDAVVAKEAWENHRLRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPECAKV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 SVTFDPFCYLTLPLPLKKDRVMEVFLVPADPHCRPTQYRVTVPLMGAVSDLCEALSRLSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 SVTFDPFCYLTLPLPLKKDRVMEVFLVPADPHCRPTQYRVTVPLMGAVSDLCEALSRLSG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 IAAENMVVADVYNHRFHKIFQMDEGLNHIMPRDDIFVYEVCSTSVDGSECVTLPVYFRER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 IAAENMVVADVYNHRFHKIFQMDEGLNHIMPRDDIFVYEVCSTSVDGSECVTLPVYFRER
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 KSRPSSTSSASALYGQPLLLSVPKHKLTLESLYQAVCDRISRYVKQPLPDEFGSSPLEPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 KSRPSSTSSASALYGQPLLLSVPKHKLTLESLYQAVCDRISRYVKQPLPDEFGSSPLEPG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 ACNGSRNSCEGEDEEEMEHQEEGKEQLSETEGSGEDEPGNDPSETTQKKIKGQPCPKRLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 ACNGSRNSCEGEDEEEMEHQEEGKEQLSETEGSGEDEPGNDPSETTQKKIKGQPCPKRLF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 TFSLVNSYGTADINSLAADGKLLKLNSRSTLAMDWDSETRRLYYDEQESEAYEKHVSMLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 TFSLVNSYGTADINSLAADGKLLKLNSRSTLAMDWDSETRRLYYDEQESEAYEKHVSMLQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 PQKKKKTTVALRDCIELFTTMETLGEHDPWYCPNCKKHQQATKKFDLWSLPKILVVHLKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 PQKKKKTTVALRDCIELFTTMETLGEHDPWYCPNCKKHQQATKKFDLWSLPKILVVHLKR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 FSYNRYWRDKLDTVVEFPIRGLNMSEFVCNLSARPYVYDLIAVSNHYGAMGVGHYTAYAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 FSYNRYWRDKLDTVVEFPIRGLNMSEFVCNLSARPYVYDLIAVSNHYGAMGVGHYTAYAK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 NKLNGKWYYFDDSNVSLASEDQIVTKAAYVLFYQRRDDEFYKTPSLSSSGSSDGGTRPSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 NKLNGKWYYFDDSNVSLASEDQIVTKAAYVLFYQRRDDEFYKTPSLSSSGSSDGGTRPSS
850 860 870 880 890 900
910
pF1KE3 SQQGFGDDEACSMDTN
::::::::::::::::
CCDS27 SQQGFGDDEACSMDTN
910
>>CCDS2793.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3 (963 aa)
initn: 4664 init1: 4664 opt: 4664 Z-score: 4557.8 bits: 854.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6056; 94.9% identity (95.0% similar) in 948 aa overlap (16-916:16-963)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MAEGGGCRERPDAETQKSELGPLMRTTLQRGAQWYLIDSRWFKQWKKYVGFDSWDMYNVG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 MAEGGGCRERPDAETQKSELGPLMRTTLQRGAQWYLIDSRWFKQWKKYVGFDSWDMYNVG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 EHNLFPGPIDNSGLFSDPESQTLKEHLIDELDYVLVPTEAWNKLLNWYGCVEGQQPIVRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 EHNLFPGPIDNSGLFSDPESQTLKEHLIDELDYVLVPTEAWNKLLNWYGCVEGQQPIVRK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 VVEHGLFVKHCKVEVYLLELKLCENSDPTNVLSCHFSKADTIATIEKEMRKLFNIPAERE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 VVEHGLFVKHCKVEVYLLELKLCENSDPTNVLSCHFSKADTIATIEKEMRKLFNIPAERE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE3 TRLWNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQNEDGTWPRQTLQSN--------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS27 TRLWNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQNEDGTWPRQTLQSKSSTAPSRN
190 200 210 220 230 240
240 250
pF1KE3 ---------------------------------------GSGFSASYNCQEPPSSHIQPG
:::::::::::::::::::::
CCDS27 FTTSPKSSASPYSSVSASLIANGDSTSTCGMHSSGVSRGGSGFSASYNCQEPPSSHIQPG
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 LCGLGNLGNTCFMNSALQCLSNTAPLTDYFLKDEYEAEINRDNPLGMKGEIAEAYAELIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 LCGLGNLGNTCFMNSALQCLSNTAPLTDYFLKDEYEAEINRDNPLGMKGEIAEAYAELIK
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KE3 QMWSGRDAHVAPRMFKTQVGRFAPQFSGYQQQDSQELLAFLLDGLHEDLNRVKKKPYLEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 QMWSGRDAHVAPRMFKTQVGRFAPQFSGYQQQDSQELLAFLLDGLHEDLNRVKKKPYLEL
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420 430
pF1KE3 KDANGRPDAVVAKEAWENHRLRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPECAKVSVTFDPFCYLTLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 KDANGRPDAVVAKEAWENHRLRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPECAKVSVTFDPFCYLTLP
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470 480 490
pF1KE3 LPLKKDRVMEVFLVPADPHCRPTQYRVTVPLMGAVSDLCEALSRLSGIAAENMVVADVYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 LPLKKDRVMEVFLVPADPHCRPTQYRVTVPLMGAVSDLCEALSRLSGIAAENMVVADVYN
490 500 510 520 530 540
500 510 520 530 540 550
pF1KE3 HRFHKIFQMDEGLNHIMPRDDIFVYEVCSTSVDGSECVTLPVYFRERKSRPSSTSSASAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 HRFHKIFQMDEGLNHIMPRDDIFVYEVCSTSVDGSECVTLPVYFRERKSRPSSTSSASAL
550 560 570 580 590 600
560 570 580 590 600 610
pF1KE3 YGQPLLLSVPKHKLTLESLYQAVCDRISRYVKQPLPDEFGSSPLEPGACNGSRNSCEGED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 YGQPLLLSVPKHKLTLESLYQAVCDRISRYVKQPLPDEFGSSPLEPGACNGSRNSCEGED
610 620 630 640 650 660
620 630 640 650 660 670
pF1KE3 EEEMEHQEEGKEQLSETEGSGEDEPGNDPSETTQKKIKGQPCPKRLFTFSLVNSYGTADI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 EEEMEHQEEGKEQLSETEGSGEDEPGNDPSETTQKKIKGQPCPKRLFTFSLVNSYGTADI
670 680 690 700 710 720
680 690 700 710 720 730
pF1KE3 NSLAADGKLLKLNSRSTLAMDWDSETRRLYYDEQESEAYEKHVSMLQPQKKKKTTVALRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 NSLAADGKLLKLNSRSTLAMDWDSETRRLYYDEQESEAYEKHVSMLQPQKKKKTTVALRD
730 740 750 760 770 780
740 750 760 770 780 790
pF1KE3 CIELFTTMETLGEHDPWYCPNCKKHQQATKKFDLWSLPKILVVHLKRFSYNRYWRDKLDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 CIELFTTMETLGEHDPWYCPNCKKHQQATKKFDLWSLPKILVVHLKRFSYNRYWRDKLDT
790 800 810 820 830 840
800 810 820 830 840 850
pF1KE3 VVEFPIRGLNMSEFVCNLSARPYVYDLIAVSNHYGAMGVGHYTAYAKNKLNGKWYYFDDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 VVEFPIRGLNMSEFVCNLSARPYVYDLIAVSNHYGAMGVGHYTAYAKNKLNGKWYYFDDS
850 860 870 880 890 900
860 870 880 890 900 910
pF1KE3 NVSLASEDQIVTKAAYVLFYQRRDDEFYKTPSLSSSGSSDGGTRPSSSQQGFGDDEACSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 NVSLASEDQIVTKAAYVLFYQRRDDEFYKTPSLSSSGSSDGGTRPSSSQQGFGDDEACSM
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 DTN
:::
CCDS27 DTN
>>CCDS14277.1 USP11 gene_id:8237|Hs108|chrX (963 aa)
initn: 2506 init1: 1343 opt: 2651 Z-score: 2590.8 bits: 490.7 E(32554): 5.5e-138
Smith-Waterman score: 2711; 48.1% identity (72.3% similar) in 907 aa overlap (12-901:79-952)
10 20 30 40
pF1KE3 MAEGGGCRERPDAETQKSELGPLMRTT-LQRGAQWYLIDSR
:.. .. : : : :. : .:.:....
CCDS14 ANPAAAAAAVAAAAAVTEDREPQHEELPGLDSQWRQIENGESGRERPLRAGESWFLVEKH
50 60 70 80 90 100
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 WFKQWKKYVGFDSWDMYNVGEHNLFPGPIDNSGLFSDPESQTLKEHLIDELDYVLVPTEA
:.:::. :: . : . ::: :.:. ::.: . ::: :.. ::::.:. :
CCDS14 WYKQWEAYVQGGDQD------SSTFPGCINNATLFQDEINWRLKEGLVEGEDYVLLPAAA
110 120 130 140 150 160
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 WNKLLNWYGCVEGQQPIVRKVVEHGLFVKHCKVEVYLLELKLCENSDPTNVLSCHFSKAD
:. :..::: .:: :: :::.: . . ::::: .:: : ...: . . .::..:
CCDS14 WHYLVSWYGLEHGQPPIERKVIE---LPNIQKVEVYPVELLLVRHNDLGKSHTVQFSHTD
170 180 190 200 210
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 TIATIEKEMRKLFNIPAERETRLWNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQNE
.:. . . :. : . ...:::: : .. ..: :: ::.: ::....: ...
CCDS14 SIGLVLRTARERFLVEPQEDTRLWAKNSEGSLDRLYDTHITVLDAALETGQLIIMETRKK
220 230 240 250 260 270
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 DGTWPRQTLQSNGSGFSASYNCQEPPSSHIQPGLCGLGNLGNTCFMNSALQCLSNTAPLT
::::: :. ....: .: . . :::.::: :::::::::::::::::. ::
CCDS14 DGTWPSAQLHVMNNNMS-----EEDEDFKGQPGICGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLT
280 290 300 310 320 330
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 DYFLKDEYEAEINRDNPLGMKGEIAEAYAELIKQMWSGRDAHVAPRMFKTQVGRFAPQFS
.:::.. : :.: ::::::::::::::.:.:: :::. ..:..::..::.:: ::
CCDS14 EYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYADLVKQAWSGHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFL
340 350 360 370 380 390
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 GYQQQDSQELLAFLLDGLHEDLNRVKKKPYLELKDANGRPDAVVAKEAWENHRLRNDSVI
::::.::::::.:::::::::::::::: :.:: :: :::: ::.:::.::. ::::::
CCDS14 GYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVKKKEYVELCDAAGRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVI
400 410 420 430 440 450
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 VDTFHGLFKSTLVCPECAKVSVTFDPFCYLTLPLPLKKDRVMEVFLVPADPHCRPTQYRV
:::::::::::::::.:..:::::::::::..:::... ::.:::..: ::. .: :.:.
CCDS14 VDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDPFCYLSVPLPISHKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRL
460 470 480 490 500 510
470 480 490 500 510 520
pF1KE3 TVPLMGAVSDLCEALSRLSGIAAENMVVADVYNHRFHKIFQMDEGLNHIMPRDDIFVYEV
.:: : .:::: :::. .::. : :.::::..:::.:..:..: :. :. :::::::::
CCDS14 VVPKKGKISDLCVALSKHTGISPERMMVADVFSHRFYKLYQLEEPLSSILDRDDIFVYEV
520 530 540 550 560 570
530 540 550 560 570
pF1KE3 CST--SVDGS-ECVTLPVYFRERK-SRPSSTSSAS-ALYGQPLLLSVPKHKLTLESLYQA
. ...:: : ...:::.::: .: ..: . :.:.:::.:::. ..: :.::..
CCDS14 SGRIEAIEGSREDIVVPVYLRERTPARDYNNSYYGLMLFGHPLLVSVPRDRFTWEGLYNV
580 590 600 610 620 630
580 590 600 610 620 630
pF1KE3 VCDRISRYVKQPLPDEFGSSPLEPGACNGSRNSCEGEDEEEMEHQEEG---KEQLSETEG
. :.:::: .: :. .:... . ::.... : .. : :
CCDS14 LMYRLSRYVTKPNSDDED---------DGDEKEDDEEDKDDVPGPSTGGSLRDPEPEQAG
640 650 660 670 680
640 650 660 670 680
pF1KE3 SGEDEPGNDPSETTQKKIKGQPCPKR----LFTFSLVNSYGTADINSLAADGKLLKLNSR
. . : . .: :.: :::.. ::: ::.: .. . ....
CCDS14 PSSGVTNRCPFLLDNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQTVNSNGTSDRTTSPEE-----VHAQ
690 700 710 720 730 740
690 700 710 720 730 740
pF1KE3 STLAMDWDSETRRLYYDEQESEAYEKHVSMLQPQKKKKTTVALRDCIELFTTMETLGEHD
.:.::. : .. :::: :.:.: :: . .:: . : :..:::::::.::: ...
CCDS14 PYIAIDWEPEMKKRYYDEVEAEGYVKHDCVGYVMKK--APVRLQECIELFTTVETLEKEN
750 760 770 780 790
750 760 770 780 790 800
pF1KE3 PWYCPNCKKHQQATKKFDLWSLPKILVVHLKRFSYNRYWRDKLDTVVEFPIRGLNMSEFV
:::::.::.:: ::::.::: ::.::..:::::::... :.::::.:::::: :..::::
CCDS14 PWYCPSCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDTLVEFPIRDLDFSEFV
800 810 820 830 840 850
810 820 830 840 850 860
pF1KE3 CNLS--ARP--YVYDLIAVSNHYGAMGVGHYTAYAKNKLNGKWYYFDDSNVSLASEDQIV
. . . : : :::::::::::.: ::::..: :: .:.:.::::..:: ..:.::
CCDS14 IQPQNESNPELYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHYFDDNSVSPVNENQIE
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870 880 890 900 910
pF1KE3 TKAAYVLFYQRRDDEFYKTPSLSSSGSSDGGTRPSSSQQGFGDDEACSMDTN
.::::::::::.: :: .::: . . :. :
CCDS14 SKAAYVLFYQRQD---VARRLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFMDVN
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:::::. : .::.:... :..:.:..: :::.:::::::::::::::::: :..:
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:::.:.::::::::::: :::::::.. .::.. .::::::: :::::.::.:.:: :.:
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:::::::::::.: :.: :.:.:::::::::::::: .:::::::: : ..
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..: .:. .:: .. :::::::.:::::::::::.:::::: :::.:::.:.:. :
CCDS89 PSYTAYKNYDYSEPGRNNEQPGLCGLSNLGNTCFMNSAIQCLSNTPPLTEYFLNDKYQEE
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.: ::::::.::::..:::::::::::. ..:.:: ::::::::::::::::::: ::::
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:::::::::::::..::::..::::.:::: :::.:::::: ::::.::: ::::::::
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::::::::.:::::::::::::::.::.:..::.:: :: .: ::.:.:: .: . ::
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: ::: :::: :..:.:.:.::::::.:: :::.:. :: ::::.:.:. . .. .: :
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.:: .:: : : :: . ..:.:.:::.:..::... : ..::. . :. ::::
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: . :. : : . :. .: :: ::: .: . .: ::.:.: .:
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: :.: ::. :. ::: ::::::.. :. :..::: . : .
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:.:. :: ::.::: . .. :.::. .: .::: :. . . :: : :.:::::::: :
CCDS89 LRLDERSFLALDWDPDLKKRYFDENAAEDFEKHESV-EYKPPKKPFVKLKDCIELFTTKE
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:: .:::::::::.:::::::.:::::: .::::::::::.:: ::::::.:.::: :
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950
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CCDS58 VVEQGMFVKHCKVEVYLTELKLCENGNMNNVVTRRFSKADTIDTIEKEIRKIFSIPDEKE
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:::::::.:::::: :::.:::.:.:. :.: ::::::.::::..:::::::::::. ..
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:::.:::::: ::::.::: ::::::::::::::::.:::::::::::::::.::.:..
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::.:: :: .: ::.:.:: .: . ::: ::: :::: :..:.:.:.::::::.:: :
CCDS58 EVYLVRMDPLTKPMQYKVVVPKIGNILDLCTALSALSGIPADKMIVTDIYNHRFHRIFAM
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.::... : ..::. . :. :::: : . :. : : . :. .: ::
CCDS58 AVPRNN-TEDKLYNLLLLRMCRYVKISTETEETEGSLH--CCKDQNINGNGPNGIHEEGS
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::: .: . .: ::.:.: .:: :.: ::. :. ::: ::::
CCDS58 PSEMETDEPDDESSQDQELPSENENSQSEDSVGGDNDSENGLCTEDTCKGQLTGHKKRLF
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pF1KE3 TFSLVNSYGTADINSLAAD-------GKLLKLNSRSTLAMDWDSETRRLYYDEQESEAYE
::.. :. :..::: . : . :.:. :: ::.::: . .. :.::. .: .:
CCDS58 TFQF-NNLGNTDINYIKDDTRHIRFDDRQLRLDERSFLALDWDPDLKKRYFDENAAEDFE
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pF1KE3 KHVSMLQPQKKKKTTVALRDCIELFTTMETLGEHDPWYCPNCKKHQQATKKFDLWSLPKI
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CCDS58 KHESV-EYKPPKKPFVKLKDCIELFTTKEKLGAEDPWYCPNCKEHQQATKKLDLWSLPPV
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CCDS58 LVVHLKRFSYSRYMRDKLDTLVDFPINDLDMSEFLINPNAGPCRYNLIAVSNHYGGMGGG
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840 850 860 870 880
pF1KE3 HYTAYAKNKLNGKWYYFDDSNVSLASEDQIVTKAAYVLFYQRRDDE----FYKTPSLSSS
::::.:::: .:::::::::.:: :::::::.::::::::::.: :. ...
CCDS58 HYTAFAKNKDDGKWYYFDDSSVSTASEDQIVSKAAYVLFYQRQDTFSGTGFFPLDRETKG
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pF1KE3 GSSDGGTRPSSSQQGFGDDEACSMDTN
.:. : : :.. .:..
CCDS58 ASAATGI-PLESDEDSNDNDNDIENENCMHTN
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CCDS58 MAEGGGCRERPDAETQKSELGPLMRTTLQRGAQWYLIDSRWFKQWKKYVGFDSWDMYNVG
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CCDS58 EHNLFPGPIDNSGLFSDPESQTLKEHLIDELDYVLVPTEAWNKLLNWYGCVEGQQPIVRK
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VVEHGLFVKHCKVEVYLLELKLCENSDPTNVLSCHFSKADTIATIEKEMRKLFNIPAERE
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pF1KE3 TRLWNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQNEDGTWPRQTLQSNGSGFSASY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. : :
CCDS58 TRLWNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQNEDGTWPRQTLQSKVSFFLPRL
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pF1KE3 NCQEPPSSHIQPGLCGLGNLGNTCFMNSALQCLSNTAP--LTDYFLKDEYEAEINRDNPL
.:. .: :.. :.. :: : .:: :...:. .: : . . :
CCDS58 ECNGAILAH-----CNFCLPGSSNSPASA----SRVAPSHLANFFF---FEMESHSVTKL
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: .. ::...
CCDS58 ECGGAVS-AYSRVQVMLLPQPPEWLG
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CCDS58 DQNVYPGPIDNSGLLKDGDAQSLKEHLIDELDYILLPTEGWNKLVSWYTLMEGQEPIARK
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CCDS58 VVEQGMFVKHCKVEVYLTELKLCENGNMNNVVTRRFSKADTIDTIEKEIRKIFSIPDEKE
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pF1KE3 TRLWNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQNEDGTWPRQTLQSNGSGFSASY
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CCDS58 TRLWNKYMSNTFEPLNKPDSTIQDAGLYQGQVLVIEQKNEDGTWPRGPSTPKKPLEQSC
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pF1KE3 LIDSRWFKQWKKYVGFDSWDMYNVGEHNLFPGPIDNSGLFS-DP--------ESQTLKE-
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CCDS32 FARQHNTSDNNNQCLLGANGNILLHLNPQKPGAIDNQPLVTQEPVKATSLTLEGGRLKRT
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pF1KE3 -HLIDELDYVLVPTEAWNKLLNWYGC-VEGQQPIVRK----VVEHGLFVKH---------
.:: :: .:: .: : .::: . .:.... . : :: ..
CCDS32 PQLIHGRDYEMVPEPVWRALYHWYGANLALPRPVIKNSKTDIPELELFPRYLLFLRQQPA
560 570 580 590 600 610
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pF1KE3 CKVEVYLLELKLCENSDPTNVLS-------CHFSKADTIATIEKEMRKLFNIPAERETRL
... . ... . .:. :. : ::. .:: :.. . . . : :.. ::
CCDS32 TRTQQSNIWVNMGNVPSPNAPLKRVLAYTGC-FSRMQTIKEIHEYLSQRLRIK-EEDMRL
620 630 640 650 660
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 WNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQNEDGTWPRQ-TLQSNGSGFSASYNC
: : :. :. .. . . : :::: .:.: .::.. .. .: :.. .
CCDS32 WLYNSENYLTLLDDEDHKLEYLKIQDEQHLVIEVRNKDMSWPEEMSFIAN----SSKIDR
670 680 690 700 710 720
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 QEPPSSHIQPGLCGLGNLGNTCFMNSALQCLSNTAPLTDYFLKDEYEAEINRDNPLGMKG
.. :. . : ::.::::::::::..::.::: :::.::.. .. :.:: ::.::::
CCDS32 HKVPT---EKGATGLSNLGNTCFMNSSIQCVSNTQPLTQYFISGRHLYELNRTNPIGMKG
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..:. :..:....::: . .::: .. ....::.:.:.::::::::::::::::::::
CCDS32 HMAKCYGDLVQELWSGTQKNVAPLKLRWTIAKYAPRFNGFQQQDSQELLAFLLDGLHEDL
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CCDS32 NRVHEKPYVELKDSDGRPDWEVAAEAWDNHLRRNRSIVVDLFHGQLRSQVKCKTCGHISV
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.:....:.:.. . : : :.:. : ::.: :. .::
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: : ::. :.. .. ..:. . ... ..: : . ... . ..
CCDS32 ASSPTQTDFSSSPSTNEMFTLTTNGDLPRPIFIPNGMPNTVVPCGTEKNFTNGMVNGHMP
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: : : : . . . . . :.. : . . . :
CCDS32 SLPDSPFTGYIIAVHRKMMRTELYFLSSQKNRPSLFGMPLIVPCTVHTRKKDLYDAVWIQ
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: . . ..: : . ::. .:.. :.. . : :.
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. . . .:.::: . .: :. .. .. ..: :. : .. . . : .:.. ::.
CCDS32 DRAFIGNAYIAVDWDPTALHLRYQTSQERVVDEHESVEQSRRAQAEPINLDSCLRAFTSE
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: :::.. .:: .:: : ::::.::: :: ::..:::::.. : : : . .:.:: .
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... : :. . : . . .. . .. . : .:. :.. : . :
CCDS32 SFDPSAFL--VPRDPALCQHKPLTPQGDELSEPRILAREVKKV--------DAQSSAGEE
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: ...:. : . .. ..:. : :.: .:: :::
CCDS32 DVLLSKSPSSL-----SANIISSPKGSPSSSRKSGTSCPSSKNSSPNSSPRTLGRSKGRL
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pF1KE3 DTFHGLFKSTLVCPECAKVSVTFDPFCYLTLPLPLKKDRVMEVFLVPADPHCRPTQYRVT
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CCDS56 DLFQGQYKSKLVCPVCAKVSITFDPFLYLPVPLP-QKQKVLPVFYFAREPHSKPIKFLVS
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pF1KE3 VPLMGAV-SDLCEALSRLSGIAAENMVVADVYNHRFHKIFQMDEGLNHIMPRDDIFVYEV
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CCDS56 VSKENSTASEVLDSLSQSVHVKPENLRLAEVIKNRFHRVFLPSHSLDTVSPSDTLLCFEL
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CCDS56 TSGISSEMLASGPIEVGSLPAGERVSRPEAAVPGYQHPSEAMN-AHTPQFFIYKIDSSNR
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CCDS56 EQRLEDKGDTPLELGDDCSLALVWRNNERLQEFVLVASKELECAEDPGSAGEAARAGHFT
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CCDS56 RDKINDLVEFPVRNLDLSKF-CIGQKEEQLPSYDLYAVINHYGGMIGGHYTACARLPNDR
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CCDS56 SSQRSDVGWRLFDDSTVTTVDESQVVTRYAYVLFYRRRNSPVERPPRAGHSEHHPDLGPA
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