Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3764
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3764, 630 aa
1>>>pF1KE3764 630 - 630 aa - 630 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3060+/-0.000911; mu= 7.2289+/- 0.055
mean_var=184.7405+/-37.904, 0's: 0 Z-trim(113.1): 56 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.094361
statistics sampled from 13702 (13756) to 13702 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.745), E-opt: 0.2 (0.423), width: 16
Scan time: 4.140
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10130.1 SHC4 gene_id:399694|Hs108|chr15 ( 630) 4298 597.5 1.8e-170
CCDS44233.1 SHC1 gene_id:6464|Hs108|chr1 ( 584) 1548 223.1 8.2e-58
CCDS30881.1 SHC1 gene_id:6464|Hs108|chr1 ( 583) 1540 222.0 1.7e-57
CCDS1076.1 SHC1 gene_id:6464|Hs108|chr1 ( 474) 1457 210.7 3.7e-54
CCDS44234.1 SHC1 gene_id:6464|Hs108|chr1 ( 473) 1449 209.6 7.9e-54
CCDS45891.1 SHC2 gene_id:25759|Hs108|chr19 ( 582) 1196 175.2 2.2e-43
CCDS6681.1 SHC3 gene_id:53358|Hs108|chr9 ( 594) 1002 148.8 2e-35
>>CCDS10130.1 SHC4 gene_id:399694|Hs108|chr15 (630 aa)
initn: 4298 init1: 4298 opt: 4298 Z-score: 3174.2 bits: 597.5 E(32554): 1.8e-170
Smith-Waterman score: 4298; 100.0% identity (100.0% similar) in 630 aa overlap (1-630:1-630)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MRERGQDSLAGLVLYVGLFGHPGMLHRAKYSRFRNESITSLDEGSSGGSVGNKGSPQPPH
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CCDS10 MRERGQDSLAGLVLYVGLFGHPGMLHRAKYSRFRNESITSLDEGSSGGSVGNKGSPQPPH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 PALAPHLPTEDATLPSQESPTPLCTLIPRMASMKLANPATLLSLKNFCLGTKEVPRLKLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PALAPHLPTEDATLPSQESPTPLCTLIPRMASMKLANPATLLSLKNFCLGTKEVPRLKLQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 ESRDPGSSGPSSPETSLSRSGTAPPPQQDLVGHRATALTPDSCPLPGPGEPTLRSRQDRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ESRDPGSSGPSSPETSLSRSGTAPPPQQDLVGHRATALTPDSCPLPGPGEPTLRSRQDRH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 FLQHLLGMGMNYCVRYMGCVEVLQSMRSLDFGMRTQVTREAISRLCEAVPGANGAIKKRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FLQHLLGMGMNYCVRYMGCVEVLQSMRSLDFGMRTQVTREAISRLCEAVPGANGAIKKRK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 PPVKFLSTVLGKSNLQFSGMNIKLTISTCSLTLMNLDNQQIIANHHMQSISFASGGDPDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PPVKFLSTVLGKSNLQFSGMNIKLTISTCSLTLMNLDNQQIIANHHMQSISFASGGDPDT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 TDYVAYVAKDPVNQRACHILECHNGMAQDVISTIGQAFELRFKQYLKNPSLNTSCESEEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TDYVAYVAKDPVNQRACHILECHNGMAQDVISTIGQAFELRFKQYLKNPSLNTSCESEEV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 HIDSHAEEREDHEYYNEIPGKQPPVGGVSDMRIKVQATEQMAYCPIQCEKLCYLPGNSKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HIDSHAEEREDHEYYNEIPGKQPPVGGVSDMRIKVQATEQMAYCPIQCEKLCYLPGNSKC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 SSVYENCLEQSRAIGNVHPRGVQSQRDTSLLKHTCRVDLFDDPCYINTQALQSTPGSAGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SSVYENCLEQSRAIGNVHPRGVQSQRDTSLLKHTCRVDLFDDPCYINTQALQSTPGSAGN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 QRSAQPLGSPWHCGKAPETVQPGATAQPASSHSLPHIKQQLWSEECYHGKLSRKAAESLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QRSAQPLGSPWHCGKAPETVQPGATAQPASSHSLPHIKQQLWSEECYHGKLSRKAAESLL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 VKDGDFLVRESATSPGQYVLSGLQGGQAKHLLLVDPEGKVRTKDHVFDNVGHLIRYHMDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VKDGDFLVRESATSPGQYVLSGLQGGQAKHLLLVDPEGKVRTKDHVFDNVGHLIRYHMDN
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KE3 SLPIISSGSEVSLKQPVRKDNNPALLHSNK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SLPIISSGSEVSLKQPVRKDNNPALLHSNK
610 620 630
>>CCDS44233.1 SHC1 gene_id:6464|Hs108|chr1 (584 aa)
initn: 1722 init1: 862 opt: 1548 Z-score: 1151.4 bits: 223.1 E(32554): 8.2e-58
Smith-Waterman score: 1638; 49.1% identity (69.9% similar) in 611 aa overlap (27-619:7-582)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MRERGQDSLAGLVLYVGLFGHPGMLHRAKYSRFRNESITSLDEGSSGGSVGNKGSPQPPH
. ::. .::::..::.::.:: :. . :.:
CCDS44 MDLLPPKPKYNPLRNESLSSLEEGASG-STPPEELPSPSA
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 PALAPHLPTEDATLPSQESPTPLCTLIPRMASMKLANPATLLSLKNFCLGTKEVPRLKLQ
.:.: :: ::...::: ::...:::....::::: :.: : .
CCDS44 SSLGPILP----PLPGDDSPTTLCSFFPRMSNLRLANPAGGRP------GSKGEPGRAAD
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170
pF1KE3 ESRDPGSSGPSSPETSLSRSGTAPPPQQ--DLVGHRATALTPDSCPLPGPG---EPTLRS
... : : . :. :: : :. : : . .. : : . .. .
CCDS44 DGE--GIVGAAMPD-----SGPLPLLQDMNKLSGGGGRRTRVEGGQLGGEEWTRHGSFVN
90 100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 RQDRHFLQ---HLLGMGMNYCVRYMGCVEVLQSMRSLDFGMRTQVTREAISRLCEAVPGA
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CCDS44 KPTRGWLHPNDKVMGPGVSYLVRYMGCVEVLQSMRALDFNTRTQVTREAISLVCEAVPGA
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 NGAIKKRKPPVKFLSTVLGKSNLQFSGMNIKLTISTCSLTLMNLDNQQIIANHHMQSISF
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CCDS44 KGATRRRKPCSRPLSSILGRSNLKFAGMPITLTVSTSSLNLMAADCKQIIANHHMQSISF
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 ASGGDPDTTDYVAYVAKDPVNQRACHILECHNGMAQDVISTIGQAFELRFKQYLKNPSLN
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CCDS44 ASGGDPDTAEYVAYVAKDPVNQRACHILECPEGLAQDVISTIGQAFELRFKQYLRNPPKL
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400
pF1KE3 TSCESEEVHIDSHA--EERE---DHEYYNEIPGKQPPVGGVSDMRIKVQATEQMAYCPIQ
.. ... . .:. : ::.: ::.:::..:::.::.::: :::.. :. : :
CCDS44 VTPHDRMAGFDGSAWDEEEEEPPDHQYYNDFPGKEPPLGGVVDMRLREGAAPGAAR-PTA
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 CEKLCYLPGNSKCSSVYENCLEQSRAIGNVHPRGVQSQRDTSLLKHTCRVDLFDDPCYIN
: :.. : : .. .:. :. :..: . : .::::: :.:
CCDS44 -------P-NAQTPSHLGATLPVGQPVGG-DPE-VRKQMPPPPPCPAGR-ELFDDPSYVN
390 400 410 420 430
470 480 490 500 510 520
pF1KE3 TQALQSTPGSAGNQRSAQPLGSPWHCGKAPETV---QP--GATAQPASSHSLPHIKQQLW
.: :... ..:. : : .: :.::. . .: : : .:. . .::
CCDS44 VQNLDKARQAVGG---AGP-PNPAINGSAPRDLFDMKPFEDALRVPPPPQSVS-MAEQLR
440 450 460 470 480
530 540 550 560 570 580
pF1KE3 SEECYHGKLSRKAAESLLVKDGDFLVRESATSPGQYVLSGLQGGQAKHLLLVDPEGKVRT
.: .::::::. ::.:: .::::::::.:.::::::.:::.:: :::::::::: :::
CCDS44 GEPWFHGKLSRREAEALLQLNGDFLVRESTTTPGQYVLTGLQSGQPKHLLLVDPEGVVRT
490 500 510 520 530 540
590 600 610 620 630
pF1KE3 KDHVFDNVGHLIRYHMDNSLPIISSGSEVSLKQPVRKDNNPALLHSNK
::: :..:.::: ::::: :::::.:::. :.:::..
CCDS44 KDHRFESVSHLISYHMDNHLPIISAGSELCLQQPVERKL
550 560 570 580
>>CCDS30881.1 SHC1 gene_id:6464|Hs108|chr1 (583 aa)
initn: 1590 init1: 862 opt: 1540 Z-score: 1145.5 bits: 222.0 E(32554): 1.7e-57
Smith-Waterman score: 1635; 49.0% identity (69.6% similar) in 612 aa overlap (27-619:7-581)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MRERGQDSLAGLVLYVGLFGHPGMLHRAKYSRFRNESITSLDEGSSGGSVGNKGSPQPPH
. ::. .::::..::.::.:: :. . :.:
CCDS30 MDLLPPKPKYNPLRNESLSSLEEGASG-STPPEELPSPSA
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 PALAPHLPTEDATLPSQESPTPLCTLIPRMASMKLANPATLLSLKNFCLGTKEVPRLKLQ
.:.: :: ::...::: ::...:::....::::: :.: : .
CCDS30 SSLGPILP----PLPGDDSPTTLCSFFPRMSNLRLANPAGGRP------GSKGEPGRAAD
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170
pF1KE3 ESRDPGSSGPSSPETSLSRSGTAPPPQQ--DLVGHRATALTPDSCPLPGPG---EPTLRS
... : : . :. :: : :. : : . .. : : . .. .
CCDS30 DGE--GIVGAAMPD-----SGPLPLLQDMNKLSGGGGRRTRVEGGQLGGEEWTRHGSFVN
90 100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 RQDRHFLQ---HLLGMGMNYCVRYMGCVEVLQSMRSLDFGMRTQVTREAISRLCEAVPGA
. : .:. ...: :..: ::::::::::::::.:::. :::::::::: .:::::::
CCDS30 KPTRGWLHPNDKVMGPGVSYLVRYMGCVEVLQSMRALDFNTRTQVTREAISLVCEAVPGA
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 NGAIKKRKPPVKFLSTVLGKSNLQFSGMNIKLTISTCSLTLMNLDNQQIIANHHMQSISF
.:: ..::: . ::..::.:::.:.:: : ::.:: ::.:: : .:::::::::::::
CCDS30 KGATRRRKPCSRPLSSILGRSNLKFAGMPITLTVSTSSLNLMAADCKQIIANHHMQSISF
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 ASGGDPDTTDYVAYVAKDPVNQRACHILECHNGMAQDVISTIGQAFELRFKQYLKNPSLN
::::::::..:::::::::::::::::::: .:.::::::::::::::::::::.::
CCDS30 ASGGDPDTAEYVAYVAKDPVNQRACHILECPEGLAQDVISTIGQAFELRFKQYLRNPPKL
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400
pF1KE3 TSCESEEVHIDSHA--EERE---DHEYYNEIPGKQPPVGGVSDMRIKVQATEQMAYCPIQ
.. ... . .:. : ::.: ::.:::..:::.::.::: :::.. :. : :
CCDS30 VTPHDRMAGFDGSAWDEEEEEPPDHQYYNDFPGKEPPLGGVVDMRLREGAAPGAAR-PTA
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 CEKLCYLPGNSKCSSVYENCLEQSRAIGNVHPRGVQSQRDTSLLKHTCR-VDLFDDPCYI
: :.. : : .. .:. :. :..: : .::::: :.
CCDS30 -------P-NAQTPSHLGATLPVGQPVGG-DPE-VRKQMPP---PPPCPGRELFDDPSYV
390 400 410 420
470 480 490 500 510 520
pF1KE3 NTQALQSTPGSAGNQRSAQPLGSPWHCGKAPETV---QP--GATAQPASSHSLPHIKQQL
:.: :... ..:. : : .: :.::. . .: : : .:. . .::
CCDS30 NVQNLDKARQAVGG---AGP-PNPAINGSAPRDLFDMKPFEDALRVPPPPQSVS-MAEQL
430 440 450 460 470 480
530 540 550 560 570 580
pF1KE3 WSEECYHGKLSRKAAESLLVKDGDFLVRESATSPGQYVLSGLQGGQAKHLLLVDPEGKVR
.: .::::::. ::.:: .::::::::.:.::::::.:::.:: :::::::::: ::
CCDS30 RGEPWFHGKLSRREAEALLQLNGDFLVRESTTTPGQYVLTGLQSGQPKHLLLVDPEGVVR
490 500 510 520 530 540
590 600 610 620 630
pF1KE3 TKDHVFDNVGHLIRYHMDNSLPIISSGSEVSLKQPVRKDNNPALLHSNK
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CCDS30 TKDHRFESVSHLISYHMDNHLPIISAGSELCLQQPVERKL
550 560 570 580
>>CCDS1076.1 SHC1 gene_id:6464|Hs108|chr1 (474 aa)
initn: 1512 init1: 862 opt: 1457 Z-score: 1085.7 bits: 210.7 E(32554): 3.7e-54
Smith-Waterman score: 1472; 55.8% identity (75.3% similar) in 450 aa overlap (180-619:40-472)
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 LVGHRATALTPDSCPLPGPGEPTLRSRQDRHFLQHLLGMGMNYCVRYMGCVEVLQSMRSL
: ....: :..: ::::::::::::::.:
CCDS10 RRTRVEGGQLGGEEWTRHGSFVNKPTRGWLHPNDKVMGPGVSYLVRYMGCVEVLQSMRAL
10 20 30 40 50 60
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 DFGMRTQVTREAISRLCEAVPGANGAIKKRKPPVKFLSTVLGKSNLQFSGMNIKLTISTC
::. :::::::::: .:::::::.:: ..::: . ::..::.:::.:.:: : ::.::
CCDS10 DFNTRTQVTREAISLVCEAVPGAKGATRRRKPCSRPLSSILGRSNLKFAGMPITLTVSTS
70 80 90 100 110 120
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 SLTLMNLDNQQIIANHHMQSISFASGGDPDTTDYVAYVAKDPVNQRACHILECHNGMAQD
::.:: : .:::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::: .:.:::
CCDS10 SLNLMAADCKQIIANHHMQSISFASGGDPDTAEYVAYVAKDPVNQRACHILECPEGLAQD
130 140 150 160 170 180
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 VISTIGQAFELRFKQYLKNPSLNTSCESEEVHIDSHA--EERE---DHEYYNEIPGKQPP
:::::::::::::::::.:: .. ... . .:. : ::.: ::.:::..:::.::
CCDS10 VISTIGQAFELRFKQYLRNPPKLVTPHDRMAGFDGSAWDEEEEEPPDHQYYNDFPGKEPP
190 200 210 220 230 240
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 VGGVSDMRIKVQATEQMAYCPIQCEKLCYLPGNSKCSSVYENCLEQSRAIGNVHPRGVQS
.::: :::.. :. : : : :.. : : .. .:. :. :..
CCDS10 LGGVVDMRLREGAAPGAAR-PTA-------P-NAQTPSHLGATLPVGQPVGG-DPE-VRK
250 260 270 280 290
450 460 470 480 490 500
pF1KE3 QRDTSLLKHTCRVDLFDDPCYINTQALQSTPGSAGNQRSAQPLGSPWHCGKAPETV---Q
: . : .::::: :.:.: :... ..:. : : .: :.::. . .
CCDS10 QMPPPPPCPAGR-ELFDDPSYVNVQNLDKARQAVGG---AGP-PNPAINGSAPRDLFDMK
300 310 320 330 340 350
510 520 530 540 550
pF1KE3 P--GATAQPASSHSLPHIKQQLWSEECYHGKLSRKAAESLLVKDGDFLVRESATSPGQYV
: : : .:. . .:: .: .::::::. ::.:: .::::::::.:.:::::
CCDS10 PFEDALRVPPPPQSVS-MAEQLRGEPWFHGKLSRREAEALLQLNGDFLVRESTTTPGQYV
360 370 380 390 400 410
560 570 580 590 600 610
pF1KE3 LSGLQGGQAKHLLLVDPEGKVRTKDHVFDNVGHLIRYHMDNSLPIISSGSEVSLKQPVRK
:.:::.:: :::::::::: :::::: :..:.::: ::::: :::::.:::. :.:::..
CCDS10 LTGLQSGQPKHLLLVDPEGVVRTKDHRFESVSHLISYHMDNHLPIISAGSELCLQQPVER
420 430 440 450 460 470
620 630
pF1KE3 DNNPALLHSNK
CCDS10 KL
>>CCDS44234.1 SHC1 gene_id:6464|Hs108|chr1 (473 aa)
initn: 1380 init1: 862 opt: 1449 Z-score: 1079.8 bits: 209.6 E(32554): 7.9e-54
Smith-Waterman score: 1469; 55.7% identity (74.9% similar) in 451 aa overlap (180-619:40-471)
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 LVGHRATALTPDSCPLPGPGEPTLRSRQDRHFLQHLLGMGMNYCVRYMGCVEVLQSMRSL
: ....: :..: ::::::::::::::.:
CCDS44 RRTRVEGGQLGGEEWTRHGSFVNKPTRGWLHPNDKVMGPGVSYLVRYMGCVEVLQSMRAL
10 20 30 40 50 60
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 DFGMRTQVTREAISRLCEAVPGANGAIKKRKPPVKFLSTVLGKSNLQFSGMNIKLTISTC
::. :::::::::: .:::::::.:: ..::: . ::..::.:::.:.:: : ::.::
CCDS44 DFNTRTQVTREAISLVCEAVPGAKGATRRRKPCSRPLSSILGRSNLKFAGMPITLTVSTS
70 80 90 100 110 120
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 SLTLMNLDNQQIIANHHMQSISFASGGDPDTTDYVAYVAKDPVNQRACHILECHNGMAQD
::.:: : .:::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::: .:.:::
CCDS44 SLNLMAADCKQIIANHHMQSISFASGGDPDTAEYVAYVAKDPVNQRACHILECPEGLAQD
130 140 150 160 170 180
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 VISTIGQAFELRFKQYLKNPSLNTSCESEEVHIDSHA--EERE---DHEYYNEIPGKQPP
:::::::::::::::::.:: .. ... . .:. : ::.: ::.:::..:::.::
CCDS44 VISTIGQAFELRFKQYLRNPPKLVTPHDRMAGFDGSAWDEEEEEPPDHQYYNDFPGKEPP
190 200 210 220 230 240
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 VGGVSDMRIKVQATEQMAYCPIQCEKLCYLPGNSKCSSVYENCLEQSRAIGNVHPRGVQS
.::: :::.. :. : : : :.. : : .. .:. :. :..
CCDS44 LGGVVDMRLREGAAPGAAR-PTA-------P-NAQTPSHLGATLPVGQPVGG-DPE-VRK
250 260 270 280 290
450 460 470 480 490 500
pF1KE3 QRDTSLLKHTCR-VDLFDDPCYINTQALQSTPGSAGNQRSAQPLGSPWHCGKAPETV---
: : .::::: :.:.: :... ..:. : : .: :.::. .
CCDS44 QMPPP---PPCPGRELFDDPSYVNVQNLDKARQAVGG---AGP-PNPAINGSAPRDLFDM
300 310 320 330 340 350
510 520 530 540 550
pF1KE3 QP--GATAQPASSHSLPHIKQQLWSEECYHGKLSRKAAESLLVKDGDFLVRESATSPGQY
.: : : .:. . .:: .: .::::::. ::.:: .::::::::.:.::::
CCDS44 KPFEDALRVPPPPQSVS-MAEQLRGEPWFHGKLSRREAEALLQLNGDFLVRESTTTPGQY
360 370 380 390 400 410
560 570 580 590 600 610
pF1KE3 VLSGLQGGQAKHLLLVDPEGKVRTKDHVFDNVGHLIRYHMDNSLPIISSGSEVSLKQPVR
::.:::.:: :::::::::: :::::: :..:.::: ::::: :::::.:::. :.:::.
CCDS44 VLTGLQSGQPKHLLLVDPEGVVRTKDHRFESVSHLISYHMDNHLPIISAGSELCLQQPVE
420 430 440 450 460 470
620 630
pF1KE3 KDNNPALLHSNK
.
CCDS44 RKL
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30 40 50 60 70 80
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:... : :: : : :.:
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: .:.:.::: . :.: :. .:. . : .: :.:: ..:. .
CCDS45 TTFCALLPRMPQWKFAAPGGFLG---------RGP----AAARAAGASGGADPQPEPAGP
30 40 50 60
150 160 170
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: .: ..: . .: :::: : :. . .. :
CCDS45 GGVPALAAAVLGACEPRCAAP--CPLPALSRCRGAGSRGSRGGRGAAGSGDAAAAAEWIR
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: : .:: :..: ::::::.:::.:::::::. :::::::::.::
CCDS45 KGSFIHKPAHGWLHPDARVLGPGVSYVVRYMGCIEVLRSMRSLDFNTRTQVTREAINRLH
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CCDS45 EAVPGVRGSWKK-KAPNKALASVLGKSNLRFAGMSISIHISTDGLSLSVPATRQVIANHH
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CCDS45 MPSISFASGGDTDMTDYVAYVAKDPINQRACHILECCEGLAQSIISTVGQAFELRFKQYL
250 260 270 280 290 300
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..: .. : .: ..:: :.::: ::::.::.::. : :. . :
CCDS45 HSPPKVALPPERLAGPEESAWGDEEDSLEHNYYNSIPGKEPPLGGLVDSRLALTQPCALT
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. : . : :: . : .. . :. : : : . :..: :. .
CCDS45 ALDQGPSPSLRDACSLPWDVGSTGTAPPGDGYVQADARGPPDHEEHLYVNTQGLDAPEPE
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. . :::: . .. :. .:: . :: . : .: : . : . :. .
CCDS45 DSPKKDLFDMRPFEDALKLHECSVAAGVTAAPLPLEDQW---PSPPTRR--APVAPTEEQ
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..:. : :::..::.::: .: :::::::.:.:.::::::.:...:: ::::
CCDS45 ----LRQEPW----YHGRMSRRAAERMLRADGDFLVRDSVTNPGQYVLTGMHAGQPKHLL
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:::::: ::::: .:....::: .:..:. ::... ::. :. : ..
CCDS45 LVDPEGVVRTKDVLFESISHLIDHHLQNGQPIVAAESELHLRGVVSREP
540 550 560 570 580
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10 20 30 40 50
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CCDS66 MLPRTKYNRFRNDSVTSVDDLLHSLSVSGG--GGKVS
10 20 30
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pF1KE3 PQPPHPALAPHLPTEDATLPS-QESPTPLCTLIPRMASMKLANPATLLSLKNFCLGTKEV
:: ::.: . .: . ...: : :. ... .::.. . :... ...:
CCDS66 AARATPAAAPYLVSGEALRKAPDDGPGSLGHLLHKVSHLKLSSSG----LRGLSSAARER
40 50 60 70 80 90
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.: :: : . . .:.:: . . : : . ::: : :
CCDS66 AGARL--------SGSCSAPSLAAPDGSAPSAPRAPAMSAARKGRPGDEPLPRP--P---
100 110 120 130
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 SRQDRHFLQHLLGMGMNYCVRYMGCVEVLQSMRSLDFGMRTQVTREAISRLCEAVPGANG
: : ...:: :..: :.:.::.:::.:::::::. :::.:::::::.:::::::.:
CCDS66 -RGAPHASDQVLGPGVTYVVKYLGCIEVLRSMRSLDFSTRTQITREAISRVCEAVPGAKG
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240 250 260 270 280 290
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CCDS66 AFKKRKPPSKMLSSILGKSNLQFAGMSISLTISTASLNLRTPDSKQIIANHHMRSISFAS
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300 310 320 330 340 350
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:::::::::::::::::::.:::::::: .:.:::::..:::::::::::::. :. .
CCDS66 GGDPDTTDYVAYVAKDPVNRRACHILECCDGLAQDVIGSIGQAFELRFKQYLQCPTKIPA
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 CESEEVHIDSHAEERE----DHEYYNEIPGKQPPVGGVSDMRIKVQATEQMAYCPIQCEK
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CCDS66 LHDRMQSLDEPWTEEEGDGSDHPYYNSIPSKMPPPGGFLDTRLKPR--------P-----
320 330 340 350 360
420 430 440 450 460
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. : ... .. :. :.: .:.. . :. .. .: . : . : .
CCDS66 --HAPDTAQFAG-KEQTYYQGRHLGDTFGEDWQQTPLRQGSSDIYSTPEGKLHVAPTGEA
370 380 390 400 410 420
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CCDS66 PTYVNTQQIPPQAWPAAVSSAESSPRKDLFDMKPFEDALKNQPLGPVLSKAASVECISPV
430 440 450 460 470 480
510 520 530 540 550 560
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CCDS66 SPRAP-DAKMLEELQAETW----YQGEMSRKEAEGLLEKDGDFLVRKSTTNPGSFVLTGM
490 500 510 520 530
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CCDS66 HNGQAKHLLLVDPEGTIRTKDRVFDSISHLINHHLESSLPIVSAGSELCLQQPVERKQ
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]