Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3763
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3763, 559 aa
1>>>pF1KE3763 559 - 559 aa - 559 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1341+/-0.00126; mu= 9.7895+/- 0.073
mean_var=221.5239+/-52.392, 0's: 0 Z-trim(106.8): 724 B-trim: 108 in 1/53
Lambda= 0.086172
statistics sampled from 8337 (9172) to 8337 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.644), E-opt: 0.2 (0.282), width: 16
Scan time: 2.940
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3932.2 PRKAA1 gene_id:5562|Hs108|chr5 ( 559) 3762 481.8 9.5e-136
CCDS3933.2 PRKAA1 gene_id:5562|Hs108|chr5 ( 574) 3002 387.3 2.7e-107
CCDS605.1 PRKAA2 gene_id:5563|Hs108|chr1 ( 552) 2829 365.8 7.8e-101
CCDS8347.1 SIK2 gene_id:23235|Hs108|chr11 ( 926) 976 135.7 2.4e-31
CCDS33575.1 SIK1 gene_id:150094|Hs108|chr21 ( 783) 956 133.1 1.2e-30
CCDS82645.1 LOC102724428 gene_id:102724428|Hs108|c ( 783) 956 133.1 1.2e-30
CCDS41590.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 668) 933 130.2 7.9e-30
CCDS58106.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 674) 933 130.2 8e-30
CCDS58107.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 736) 933 130.2 8.4e-30
CCDS53651.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 709) 915 128.0 3.9e-29
CCDS53650.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 719) 915 128.0 3.9e-29
CCDS8051.2 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 724) 915 128.0 3.9e-29
CCDS12921.1 BRSK1 gene_id:84446|Hs108|chr19 ( 778) 915 128.0 4.1e-29
CCDS41665.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 745) 911 127.5 5.6e-29
CCDS53649.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 788) 901 126.3 1.4e-28
CCDS60974.1 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1261) 902 126.7 1.7e-28
CCDS58108.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 766) 898 125.9 1.8e-28
CCDS73033.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 796) 895 125.5 2.3e-28
CCDS41993.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 729) 893 125.3 2.6e-28
CCDS45166.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 744) 893 125.3 2.7e-28
CCDS45165.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 753) 893 125.3 2.7e-28
CCDS73034.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 780) 893 125.3 2.7e-28
CCDS31029.2 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 795) 893 125.3 2.8e-28
CCDS8379.2 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1321) 887 124.8 6.3e-28
CCDS55947.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 713) 868 122.1 2.2e-27
CCDS59123.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 610) 861 121.2 3.7e-27
CCDS6606.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 651) 861 121.2 3.9e-27
CCDS12658.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 688) 838 118.4 2.9e-26
CCDS56097.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 752) 838 118.4 3.1e-26
CCDS31892.1 NUAK1 gene_id:9891|Hs108|chr12 ( 661) 822 116.4 1.1e-25
CCDS60696.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 614) 816 115.6 1.8e-25
CCDS1453.2 NUAK2 gene_id:81788|Hs108|chr1 ( 672) 814 115.4 2.3e-25
CCDS59126.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 619) 777 110.7 5.2e-24
CCDS43075.1 SNRK gene_id:54861|Hs108|chr3 ( 765) 758 108.5 3e-23
CCDS3943.1 NIM1K gene_id:167359|Hs108|chr5 ( 436) 714 102.7 9.6e-22
CCDS13610.1 HUNK gene_id:30811|Hs108|chr21 ( 714) 705 101.9 2.8e-21
CCDS59127.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 580) 649 94.8 3.1e-19
CCDS65789.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 758) 643 94.2 6.1e-19
CCDS7092.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 ( 357) 609 89.5 7.2e-18
CCDS7091.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 ( 385) 609 89.6 7.5e-18
CCDS2582.1 CAMK1 gene_id:8536|Hs108|chr3 ( 370) 603 88.8 1.2e-17
CCDS45896.1 STK11 gene_id:6794|Hs108|chr19 ( 433) 599 88.4 1.9e-17
CCDS48189.1 PNCK gene_id:139728|Hs108|chrX ( 360) 594 87.7 2.6e-17
CCDS35503.2 PNCK gene_id:139728|Hs108|chrX ( 426) 594 87.8 2.9e-17
CCDS1486.1 CAMK1G gene_id:57172|Hs108|chr1 ( 476) 584 86.6 7.4e-17
CCDS4103.1 CAMK4 gene_id:814|Hs108|chr5 ( 473) 582 86.3 8.7e-17
CCDS4112.1 TSSK1B gene_id:83942|Hs108|chr5 ( 367) 579 85.8 9.7e-17
CCDS362.1 TSSK3 gene_id:81629|Hs108|chr1 ( 268) 575 85.2 1.1e-16
CCDS13755.1 TSSK2 gene_id:23617|Hs108|chr22 ( 358) 570 84.7 2.1e-16
CCDS12305.1 PRKACA gene_id:5566|Hs108|chr19 ( 343) 563 83.8 3.7e-16
>>CCDS3932.2 PRKAA1 gene_id:5562|Hs108|chr5 (559 aa)
initn: 3762 init1: 3762 opt: 3762 Z-score: 2550.6 bits: 481.8 E(32554): 9.5e-136
Smith-Waterman score: 3762; 100.0% identity (100.0% similar) in 559 aa overlap (1-559:1-559)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MRRLSSWRKMATAEKQKHDGRVKIGHYILGDTLGVGTFGKVKVGKHELTGHKVAVKILNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 MRRLSSWRKMATAEKQKHDGRVKIGHYILGDTLGVGTFGKVKVGKHELTGHKVAVKILNR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 QKIRSLDVVGKIRREIQNLKLFRHPHIIKLYQVISTPSDIFMVMEYVSGGELFDYICKNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 QKIRSLDVVGKIRREIQNLKLFRHPHIIKLYQVISTPSDIFMVMEYVSGGELFDYICKNG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RLDEKESRRLFQQILSGVDYCHRHMVVHRDLKPENVLLDAHMNAKIADFGLSNMMSDGEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 RLDEKESRRLFQQILSGVDYCHRHMVVHRDLKPENVLLDAHMNAKIADFGLSNMMSDGEF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 LRTSCGSPNYAAPEVISGRLYAGPEVDIWSSGVILYALLCGTLPFDDDHVPTLFKKICDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 LRTSCGSPNYAAPEVISGRLYAGPEVDIWSSGVILYALLCGTLPFDDDHVPTLFKKICDG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 IFYTPQYLNPSVISLLKHMLQVDPMKRATIKDIREHEWFKQDLPKYLFPEDPSYSSTMID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 IFYTPQYLNPSVISLLKHMLQVDPMKRATIKDIREHEWFKQDLPKYLFPEDPSYSSTMID
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 DEALKEVCEKFECSEEEVLSCLYNRNHQDPLAVAYHLIIDNRRIMNEAKDFYLATSPPDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 DEALKEVCEKFECSEEEVLSCLYNRNHQDPLAVAYHLIIDNRRIMNEAKDFYLATSPPDS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 FLDDHHLTRPHPERVPFLVAETPRARHTLDELNPQKSKHQGVRKAKWHLGIRSQSRPNDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 FLDDHHLTRPHPERVPFLVAETPRARHTLDELNPQKSKHQGVRKAKWHLGIRSQSRPNDI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 MAEVCRAIKQLDYEWKVVNPYYLRVRRKNPVTSTYSKMSLQLYQVDSRTYLLDFRSIDDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 MAEVCRAIKQLDYEWKVVNPYYLRVRRKNPVTSTYSKMSLQLYQVDSRTYLLDFRSIDDE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 ITEAKSGTATPQRSGSVSNYRSCQRSDSDAEAQGKSSEVSLTSSVTSLDSSPVDLTPRPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 ITEAKSGTATPQRSGSVSNYRSCQRSDSDAEAQGKSSEVSLTSSVTSLDSSPVDLTPRPG
490 500 510 520 530 540
550
pF1KE3 SHTIEFFEMCANLIKILAQ
:::::::::::::::::::
CCDS39 SHTIEFFEMCANLIKILAQ
550
>>CCDS3933.2 PRKAA1 gene_id:5562|Hs108|chr5 (574 aa)
initn: 3748 init1: 2963 opt: 3002 Z-score: 2039.8 bits: 387.3 E(32554): 2.7e-107
Smith-Waterman score: 3722; 97.4% identity (97.4% similar) in 574 aa overlap (1-559:1-574)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MRRLSSWRKMATAEKQKHDGRVKIGHYILGDTLGVGTFGKVKVGKHELTGHKVAVKILNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 MRRLSSWRKMATAEKQKHDGRVKIGHYILGDTLGVGTFGKVKVGKHELTGHKVAVKILNR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 QKIRSLDVVGKIRREIQNLKLFRHPHIIKLYQVISTPSDIFMVMEYVSGGELFDYICKNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 QKIRSLDVVGKIRREIQNLKLFRHPHIIKLYQVISTPSDIFMVMEYVSGGELFDYICKNG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160
pF1KE3 R---------------LDEKESRRLFQQILSGVDYCHRHMVVHRDLKPENVLLDAHMNAK
: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 RKSDVPGVVKTGSTKELDEKESRRLFQQILSGVDYCHRHMVVHRDLKPENVLLDAHMNAK
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 IADFGLSNMMSDGEFLRTSCGSPNYAAPEVISGRLYAGPEVDIWSSGVILYALLCGTLPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 IADFGLSNMMSDGEFLRTSCGSPNYAAPEVISGRLYAGPEVDIWSSGVILYALLCGTLPF
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 DDDHVPTLFKKICDGIFYTPQYLNPSVISLLKHMLQVDPMKRATIKDIREHEWFKQDLPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 DDDHVPTLFKKICDGIFYTPQYLNPSVISLLKHMLQVDPMKRATIKDIREHEWFKQDLPK
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 YLFPEDPSYSSTMIDDEALKEVCEKFECSEEEVLSCLYNRNHQDPLAVAYHLIIDNRRIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 YLFPEDPSYSSTMIDDEALKEVCEKFECSEEEVLSCLYNRNHQDPLAVAYHLIIDNRRIM
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 NEAKDFYLATSPPDSFLDDHHLTRPHPERVPFLVAETPRARHTLDELNPQKSKHQGVRKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 NEAKDFYLATSPPDSFLDDHHLTRPHPERVPFLVAETPRARHTLDELNPQKSKHQGVRKA
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 KWHLGIRSQSRPNDIMAEVCRAIKQLDYEWKVVNPYYLRVRRKNPVTSTYSKMSLQLYQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 KWHLGIRSQSRPNDIMAEVCRAIKQLDYEWKVVNPYYLRVRRKNPVTSTYSKMSLQLYQV
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KE3 DSRTYLLDFRSIDDEITEAKSGTATPQRSGSVSNYRSCQRSDSDAEAQGKSSEVSLTSSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 DSRTYLLDFRSIDDEITEAKSGTATPQRSGSVSNYRSCQRSDSDAEAQGKSSEVSLTSSV
490 500 510 520 530 540
530 540 550
pF1KE3 TSLDSSPVDLTPRPGSHTIEFFEMCANLIKILAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 TSLDSSPVDLTPRPGSHTIEFFEMCANLIKILAQ
550 560 570
>>CCDS605.1 PRKAA2 gene_id:5563|Hs108|chr1 (552 aa)
initn: 2851 init1: 2081 opt: 2829 Z-score: 1923.8 bits: 365.8 E(32554): 7.8e-101
Smith-Waterman score: 2829; 76.1% identity (90.4% similar) in 553 aa overlap (13-559:2-552)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MRRLSSWRKMATAEKQKHDGRVKIGHYILGDTLGVGTFGKVKVGKHELTGHKVAVKILNR
:::::::::::::::.::::::::::::::.:.:.:::::::::::::
CCDS60 MAEKQKHDGRVKIGHYVLGDTLGVGTFGKVKIGEHQLTGHKVAVKILNR
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 QKIRSLDVVGKIRREIQNLKLFRHPHIIKLYQVISTPSDIFMVMEYVSGGELFDYICKNG
::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:.::::::::::::::::::.:
CCDS60 QKIRSLDVVGKIKREIQNLKLFRHPHIIKLYQVISTPTDFFMVMEYVSGGELFDYICKHG
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RLDEKESRRLFQQILSGVDYCHRHMVVHRDLKPENVLLDAHMNAKIADFGLSNMMSDGEF
:..: :.:::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 RVEEMEARRLFQQILSAVDYCHRHMVVHRDLKPENVLLDAHMNAKIADFGLSNMMSDGEF
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 LRTSCGSPNYAAPEVISGRLYAGPEVDIWSSGVILYALLCGTLPFDDDHVPTLFKKICDG
:::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::.::::::::: :
CCDS60 LRTSCGSPNYAAPEVISGRLYAGPEVDIWSCGVILYALLCGTLPFDDEHVPTLFKKIRGG
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 IFYTPQYLNPSVISLLKHMLQVDPMKRATIKDIREHEWFKQDLPKYLFPEDPSYSSTMID
.:: :.::: :: .:: :::::::.:::::::::::::::::::.:::::::::....::
CCDS60 VFYIPEYLNRSVATLLMHMLQVDPLKRATIKDIREHEWFKQDLPSYLFPEDPSYDANVID
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350
pF1KE3 DEALKEVCEKFECSEEEVLSCLYNRNHQDPLAVAYHLIIDNRRIMNEAKDFYLATSPPD-
:::.:::::::::.: ::.. ::. . :: ::::::::::::::::.:..::::.:::.
CCDS60 DEAVKEVCEKFECTESEVMNSLYSGDPQDQLAVAYHLIIDNRRIMNQASEFYLASSPPSG
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 SFLDDH--HLT---RPHPERVPFLVAETPRARHTLDELNPQKSKHQGVRKAKWHLGIRSQ
::.:: :. .:::::.: :.:..:.:: :: :: : : .:.:::::::::::
CCDS60 SFMDDSAMHIPPGLKPHPERMPPLIADSPKARCPLDALNTTKPKSLAVKKAKWHLGIRSQ
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 SRPNDIMAEVCRAIKQLDYEWKVVNPYYLRVRRKNPVTSTYSKMSLQLYQVDSRTYLLDF
:.: :::::: ::.::::.:::::: :.::::::::::..: ::::::: ::.:.:::::
CCDS60 SKPYDIMAEVYRAMKQLDFEWKVVNAYHLRVRRKNPVTGNYVKMSLQLYLVDNRSYLLDF
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE3 RSIDDEITEAKSGTATPQRSGSVSNYRSCQRSDSDAEAQGKSSEVSLTSSVTSLDSSPVD
.:::::..: .::..::::: :... . . : ... :...: :::.:.:. :. .
CCDS60 KSIDDEVVEQRSGSSTPQRSCSAAGLHRPRSSFDSTTAESHSLSGSLTGSLTG--STLSS
470 480 490 500 510 520
540 550
pF1KE3 LTPRPGSHTIEFFEMCANLIKILAQ
..:: ::::..::::::.:: ::.
CCDS60 VSPRLGSHTMDFFEMCASLITTLAR
530 540 550
>>CCDS8347.1 SIK2 gene_id:23235|Hs108|chr11 (926 aa)
initn: 978 init1: 824 opt: 976 Z-score: 676.3 bits: 135.7 E(32554): 2.4e-31
Smith-Waterman score: 977; 40.2% identity (71.9% similar) in 381 aa overlap (10-386:3-367)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MRRLSSWRKMATAEKQKHDGRVKIGHYILGDTLGVGTFGKVKVGKHELTGHKVAVKILNR
:: . .. . : :..: : . ::: :.:. ::.:.:..: .::.::...
CCDS83 MVMADGPRHLQRGPVRVGFYDIEGTLGKGNFAVVKLGRHRITKTEVAIKIIDK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 QKIRSLDVVGKIRREIQNLKLFRHPHIIKLYQVISTPSDIFMVMEYVSGGELFDYICKNG
... .... :: ::.: .:.. ::::::::::. : : ...: ::...::.:::. ..:
CCDS83 SQLDAVNLE-KIYREVQIMKMLDHPHIIKLYQVMETKSMLYLVTEYAKNGEIFDYLANHG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RLDEKESRRLFQQILSGVDYCHRHMVVHRDLKPENVLLDAHMNAKIADFGLSNMMSDGEF
::.:.:.:: : ::::.::::: . .:::::: ::.::: .:: ::::::..:....::.
CCDS83 RLNESEARRKFWQILSAVDYCHGRKIVHRDLKAENLLLDNNMNIKIADFGFGNFFKSGEL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 LRTSCGSPNYAAPEVISGRLYAGPEVDIWSSGVILYALLCGTLPFDDDHVPTLFKKICDG
: : :::: ::::::. :. : ::..:::: ::.::.:.::.:::: .: : ... .:
CCDS83 LATWCGSPPYAAPEVFEGQQYEGPQLDIWSMGVVLYVLVCGALPFDGPTLPILRQRVLEG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE3 IFYTPQYLNPSVISLLKHMLQVDPMKRATIKDIREHEWFKQDLP---KYLFPEDPSYSST
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CCDS53 EKTLYLVMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKFIVHRDLKAENL
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CCDS53 QAGPAIPTSNSYSK-KTQSNNAENKRPE----EDRESGRKASSTAKVPASPLPGLERKKT
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