Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3762
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3762, 567 aa
1>>>pF1KE3762 567 - 567 aa - 567 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5892+/-0.000847; mu= 1.0972+/- 0.051
mean_var=262.0317+/-52.075, 0's: 0 Z-trim(116.5): 30 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.079231
statistics sampled from 17098 (17125) to 17098 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.821), E-opt: 0.2 (0.526), width: 16
Scan time: 4.370
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4777.1 PHF1 gene_id:5252|Hs108|chr6 ( 567) 4045 475.3 8.4e-134
CCDS4778.1 PHF1 gene_id:5252|Hs108|chr6 ( 457) 2543 303.6 3.4e-82
CCDS35116.1 PHF19 gene_id:26147|Hs108|chr9 ( 580) 1409 174.0 4.3e-43
CCDS75889.1 PHF19 gene_id:26147|Hs108|chr9 ( 599) 1409 174.1 4.4e-43
CCDS742.1 MTF2 gene_id:22823|Hs108|chr1 ( 593) 1355 167.9 3.2e-41
CCDS53340.1 MTF2 gene_id:22823|Hs108|chr1 ( 536) 1239 154.6 2.9e-37
CCDS53341.1 MTF2 gene_id:22823|Hs108|chr1 ( 491) 1126 141.6 2.1e-33
CCDS69648.1 PHF19 gene_id:26147|Hs108|chr9 ( 371) 729 96.2 7.7e-20
>>CCDS4777.1 PHF1 gene_id:5252|Hs108|chr6 (567 aa)
initn: 4045 init1: 4045 opt: 4045 Z-score: 2515.6 bits: 475.3 E(32554): 8.4e-134
Smith-Waterman score: 4045; 99.8% identity (100.0% similar) in 567 aa overlap (1-567:1-567)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MAQPPRLSRSGASSLWDPASPAPTSGPRPRLWEGQDVLARWTDGLLYLGTIKKVDSAREV
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CCDS47 MAQPPRLSRSGASSLWDPASPAPTSGPRPRLWEGQDVLARWTDGLLYLGTIKKVDSAREV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 CLVQFEDDSQFLVLWKDISPAALPGEELLCCVCRSETVVPGNRLVSCEKCRHAYHQDCHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 CLVQFEDDSQFLVLWKDISPAALPGEELLCCVCRSETVVPGNRLVSCEKCRHAYHQDCHV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 PRAPAPGEGEGTSWVCRQCVFAIATKRGGALKKGPYARAMLGMKLSLPYGLKGLDWDAGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PRAPAPGEGEGTSWVCRQCVFAIATKRGGALKKGPYARAMLGMKLSLPYGLKGLDWDAGH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 LSNRQQSYCYCGGPGEWNLKMLQCRSCLQWFHEACTQCLSKPLLYGDRFYEFECCVCRGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LSNRQQSYCYCGGPGEWNLKMLQCRSCLQWFHEACTQCLSKPLLYGDRFYEFECCVCRGG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 PEKVRRLQLRWVDVAHLVLYHLSVCCKKKYFDFDREILPFTSENWDSLLLGELSDTPKGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PEKVRRLQLRWVDVAHLVLYHLSVCCKKKYFDFDREILPFTSENWDSLLLGELSDTPKGE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 RSSKLLSALNSHKDRFISGREIKKRKCLFGLHARMPPPVEPPTGDGALTSFPSGQGPGGG
:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RSSRLLSALNSHKDRFISGREIKKRKCLFGLHARMPPPVEPPTGDGALTSFPSGQGPGGG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 VSRPLGKRRRPEPEPLRRRQKGKVEELGPPSAVRNQPEPQEQRERAHLQRALQASVSPPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VSRPLGKRRRPEPEPLRRRQKGKVEELGPPSAVRNQPEPQEQRERAHLQRALQASVSPPS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 PSPNQSYQGSSGYNFRPTDARCLPSSPIRMFASFHPSASTAGTSGDSGPPDRSPLELHIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PSPNQSYQGSSGYNFRPTDARCLPSSPIRMFASFHPSASTAGTSGDSGPPDRSPLELHIG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 FPTDIPKSAPHSMTASSSSVSSPSPGLPRRSAPPSPLCRSLSPGTGGGVRGGVGYLSRGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FPTDIPKSAPHSMTASSSSVSSPSPGLPRRSAPPSPLCRSLSPGTGGGVRGGVGYLSRGD
490 500 510 520 530 540
550 560
pF1KE3 PVRVLARRVRPDGSVQYLVEWGGGGIF
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PVRVLARRVRPDGSVQYLVEWGGGGIF
550 560
>>CCDS4778.1 PHF1 gene_id:5252|Hs108|chr6 (457 aa)
initn: 2521 init1: 2521 opt: 2543 Z-score: 1589.0 bits: 303.6 E(32554): 3.4e-82
Smith-Waterman score: 2543; 94.9% identity (96.3% similar) in 375 aa overlap (1-374:1-375)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MAQPPRLSRSGASSLWDPASPAPTSGPRPRLWEGQDVLARWTDGLLYLGTIKKVDSAREV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MAQPPRLSRSGASSLWDPASPAPTSGPRPRLWEGQDVLARWTDGLLYLGTIKKVDSAREV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 CLVQFEDDSQFLVLWKDISPAALPGEELLCCVCRSETVVPGNRLVSCEKCRHAYHQDCHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 CLVQFEDDSQFLVLWKDISPAALPGEELLCCVCRSETVVPGNRLVSCEKCRHAYHQDCHV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 PRAPAPGEGEGTSWVCRQCVFAIATKRGGALKKGPYARAMLGMKLSLPYGLKGLDWDAGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PRAPAPGEGEGTSWVCRQCVFAIATKRGGALKKGPYARAMLGMKLSLPYGLKGLDWDAGH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 LSNRQQSYCYCGGPGEWNLKMLQCRSCLQWFHEACTQCLSKPLLYGDRFYEFECCVCRGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LSNRQQSYCYCGGPGEWNLKMLQCRSCLQWFHEACTQCLSKPLLYGDRFYEFECCVCRGG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 PEKVRRLQLRWVDVAHLVLYHLSVCCKKKYFDFDREILPFTSENWDSLLLGELSDTPKGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PEKVRRLQLRWVDVAHLVLYHLSVCCKKKYFDFDREILPFTSENWDSLLLGELSDTPKGE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE3 RSSKLLSALNSHKDRFISGREIKKRKCLFGLHARMPPPVEPPTGDGALT-SFPSGQGPGG
:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: . : :.: .
CCDS47 RSSRLLSALNSHKDRFISGREIKKRKCLFGLHARMPPPVEPPTGDGALTRAGPWGRGLTS
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 GVSRPLGKRRRPEPEPLRRRQKGKVEELGPPSAVRNQPEPQEQRERAHLQRALQASVSPP
: . : :: :
CCDS47 PGEAPEAGARAPEEEAEGESGGAGATLSSAQSARAPGAEGAGSSAEGTAAAPSGCLLPST
370 380 390 400 410 420
>>CCDS35116.1 PHF19 gene_id:26147|Hs108|chr9 (580 aa)
initn: 1168 init1: 1073 opt: 1409 Z-score: 887.1 bits: 174.0 E(32554): 4.3e-43
Smith-Waterman score: 1409; 43.6% identity (66.1% similar) in 560 aa overlap (30-563:39-576)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MAQPPRLSRSGASSLWDPASPAPTSGPRPRLWEGQDVLARWTDGLLYLGTIKKVDSARE
.: ::: :: :::::: ::: ::.:.:...
CCDS35 GTRDSYGATSHLPNKGALAKVKNNFKDLMSKLTEGQYVLCRWTDGLYYLGKIKRVSSSKQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 VCLVQFEDDSQFLVLWKDISPAALPGEELLCCVCRSETVVPGNRLVSCEKCRHAYHQDCH
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CCDS35 SCLVTFEDNSKYWVLWKDIQHAGVPGEEPKCNICLGKTSGPLNEILICGKCGLGYHQQCH
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 VPRAPAPGEGEGTSWVCRQCVFAIATKRGGALKKGPYARAMLGMKLSLPYGLKGLDWDAG
.: : . . : : ::.:.::.:...::::::: ::.. ..:. : : . :.::.
CCDS35 IPIAGSADQPLLTPWFCRRCIFALAVRKGGALKKGAIARTLQAVKMVLSYQPEELEWDSP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 HLSNRQQSYCYCGGPGEWNLKMLQCRSCLQWFHEACTQCLSKPLLYGDRFYEFECCVCRG
: .:.:: :::::::::: :.:::: : :::::::::::..:...::::: : : ::
CCDS35 HRTNQQQCYCYCGGPGEWYLRMLQCYRCRQWFHEACTQCLNEPMMFGDRFYLFFCSVCNQ
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 GPEKVRRLQLRWVDVAHLVLYHLSVCCKKKYFDFDREILPFTSENWDSLLLGELSDTPKG
::: ..:: ::::::.::.::.:.: :::::::. ::: :....:. : ::.:..::
CCDS35 GPEYIERLPLRWVDVVHLALYNLGVQSKKKYFDFE-EILAFVNHHWELLQLGKLTSTPVT
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 ERSSKLLSALNSHKDRFISGREIKKRKCLFGLHARMPPPVEPPTGDGALTSFPSGQGPGG
.:. .::.::::.:.::. :.::::.::.: :. :.:: .:: : : :
CCDS35 DRGPHLLNALNSYKSRFLCGKEIKKKKCIFRLRIRVPP--NPP---GKLL-------PDK
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 GVSRPLGKRRRPEPEPLRRRQKGKVEELGPPSAVRNQPEPQEQRERAH--LQRALQASVS
:. : .. : ::.: :.: : : ..: . .:.:.. :. :. .:
CCDS35 GL---LPNENSASSE-LRKRGKSKPGLL--PHEFQQQKRRVYRRKRSKFLLEDAIPSSDF
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460
pF1KE3 PPSPSPNQSYQGSSGYNFRPTDARCLPS-SPIRMFASFHPSASTAGTSG--------DS-
. : : .. .: ..: . . : : : . : : :...:.::: ::
CCDS35 TSAWSTN--HHLASIFDFTLDEIQSLKSASSGQTFFSDVDSTDAASTSGSASTSLSYDSR
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510
pF1KE3 ---GPPDRS-------PLELHIGFPTDIPKSAPHSMTASSSSVSS-PSPGLPRRSAPP-S
: :. ::. . . ... : . .: ..:: :. :. .. :
CCDS35 WTVGSRKRKLAAKAYMPLRAK-RWAAELDGRCPSDSSAEGASVPERPDEGIDSHTFESIS
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560
pF1KE3 PLCRSLS--PGTGGGVRGGVGYLSRGDPVRVLARRVRPDGSVQYLVEWGGGGIF
::: .. . :..: :. :. .:::::: :.:.::::::: :
CCDS35 EDDSSLSHLKSSITNYFGAAGRLACGEKYQVLARRVTPEGKVQYLVEWEGTTPY
530 540 550 560 570 580
>>CCDS75889.1 PHF19 gene_id:26147|Hs108|chr9 (599 aa)
initn: 1168 init1: 1073 opt: 1409 Z-score: 886.9 bits: 174.1 E(32554): 4.4e-43
Smith-Waterman score: 1409; 43.6% identity (66.1% similar) in 560 aa overlap (30-563:58-595)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MAQPPRLSRSGASSLWDPASPAPTSGPRPRLWEGQDVLARWTDGLLYLGTIKKVDSARE
.: ::: :: :::::: ::: ::.:.:...
CCDS75 GTRDSYGATSHLPNKGALAKVKNNFKDLMSKLTEGQYVLCRWTDGLYYLGKIKRVSSSKQ
30 40 50 60 70 80
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 VCLVQFEDDSQFLVLWKDISPAALPGEELLCCVCRSETVVPGNRLVSCEKCRHAYHQDCH
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CCDS75 SCLVTFEDNSKYWVLWKDIQHAGVPGEEPKCNICLGKTSGPLNEILICGKCGLGYHQQCH
90 100 110 120 130 140
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 VPRAPAPGEGEGTSWVCRQCVFAIATKRGGALKKGPYARAMLGMKLSLPYGLKGLDWDAG
.: : . . : : ::.:.::.:...::::::: ::.. ..:. : : . :.::.
CCDS75 IPIAGSADQPLLTPWFCRRCIFALAVRKGGALKKGAIARTLQAVKMVLSYQPEELEWDSP
150 160 170 180 190 200
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 HLSNRQQSYCYCGGPGEWNLKMLQCRSCLQWFHEACTQCLSKPLLYGDRFYEFECCVCRG
: .:.:: :::::::::: :.:::: : :::::::::::..:...::::: : : ::
CCDS75 HRTNQQQCYCYCGGPGEWYLRMLQCYRCRQWFHEACTQCLNEPMMFGDRFYLFFCSVCNQ
210 220 230 240 250 260
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 GPEKVRRLQLRWVDVAHLVLYHLSVCCKKKYFDFDREILPFTSENWDSLLLGELSDTPKG
::: ..:: ::::::.::.::.:.: :::::::. ::: :....:. : ::.:..::
CCDS75 GPEYIERLPLRWVDVVHLALYNLGVQSKKKYFDFE-EILAFVNHHWELLQLGKLTSTPVT
270 280 290 300 310 320
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 ERSSKLLSALNSHKDRFISGREIKKRKCLFGLHARMPPPVEPPTGDGALTSFPSGQGPGG
.:. .::.::::.:.::. :.::::.::.: :. :.:: .:: : : :
CCDS75 DRGPHLLNALNSYKSRFLCGKEIKKKKCIFRLRIRVPP--NPP---GKLL-------PDK
330 340 350 360 370
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 GVSRPLGKRRRPEPEPLRRRQKGKVEELGPPSAVRNQPEPQEQRERAH--LQRALQASVS
:. : .. : ::.: :.: : : ..: . .:.:.. :. :. .:
CCDS75 GL---LPNENSASSE-LRKRGKSKPGLL--PHEFQQQKRRVYRRKRSKFLLEDAIPSSDF
380 390 400 410 420
420 430 440 450 460
pF1KE3 PPSPSPNQSYQGSSGYNFRPTDARCLPS-SPIRMFASFHPSASTAGTSG--------DS-
. : : .. .: ..: . . : : : . : : :...:.::: ::
CCDS75 TSAWSTN--HHLASIFDFTLDEIQSLKSASSGQTFFSDVDSTDAASTSGSASTSLSYDSR
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510
pF1KE3 ---GPPDRS-------PLELHIGFPTDIPKSAPHSMTASSSSVSS-PSPGLPRRSAPP-S
: :. ::. . . ... : . .: ..:: :. :. .. :
CCDS75 WTVGSRKRKLAAKAYMPLRAK-RWAAELDGRCPSDSSAEGASVPERPDEGIDSHTFESIS
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560
pF1KE3 PLCRSLS--PGTGGGVRGGVGYLSRGDPVRVLARRVRPDGSVQYLVEWGGGGIF
::: .. . :..: :. :. .:::::: :.:.::::::: :
CCDS75 EDDSSLSHLKSSITNYFGAAGRLACGEKYQVLARRVTPEGKVQYLVEWEGTTPY
550 560 570 580 590
>>CCDS742.1 MTF2 gene_id:22823|Hs108|chr1 (593 aa)
initn: 1416 init1: 1322 opt: 1355 Z-score: 853.6 bits: 167.9 E(32554): 3.2e-41
Smith-Waterman score: 1426; 41.5% identity (64.9% similar) in 559 aa overlap (27-563:42-589)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MAQPPRLSRSGASSLWDPASPAPTSGPRPRLWEGQDVLARWTDGLLYLGTIKKVDS
: .. :::::::::.:::.:::::::..
CCDS74 VHKRSPLRRNQKTPTSLTKLSLQDGHKAKKPACKFEEGQDVLARWSDGLFYLGTIKKINI
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 AREVCLVQFEDDSQFLVLWKDISPAALPGEELLCCVCRSETVVPGNRLVSCEKCRHAYHQ
.. :.. :::.:. ::::::. .: . :..: .:. : :..: :.:: ..:::
CCDS74 LKQSCFIIFEDSSKSWVLWKDIQTGATGSGEMVCTICQEEYSEAPNEMVICDKCGQGYHQ
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 DCHVPRAPAPGEGEGTSWVCRQCVFAIATKRGGALKKGPYARAMLGMKLSLPYGLKGLDW
::.:. . .:.::::::: .::::::::::: :.:. :: .:::.. :.:
CCDS74 LCHTPHIDSSVIDSDEKWLCRQCVFATTTKRGGALKKGPNAKALQVMKQTLPYSVADLEW
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 DAGHLSNRQQSYCYCGGPGEWNLKMLQCRSCLQWFHEACTQCLSKPLLYGDRFYEFECCV
:::: .: :: ::::::::.: :::::: .: :::::::.:::.::.:.::::: : : :
CCDS74 DAGHKTNVQQCYCYCGGPGDWYLKMLQCCKCKQWFHEACVQCLQKPMLFGDRFYTFICSV
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 CRGGPEKVRRLQLRWVDVAHLVLYHLSVCCKKKYFDFDREILPFTSENWDSLLLGELSDT
: .::: ..:: :.:::.::: ::.::: :::::: . :.. . .:::: : :::.::
CCDS74 CSSGPEYLKRLPLQWVDIAHLCLYNLSVIHKKKYFDSELELMTYINENWDRLHPGELADT
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 PKGERSSKLLSALNSHKDRFISGREIKKRKCLFGLHARMPPPVEPPTGDGALTSFPSGQG
::.:: ..: :::..: :.::.::::.: ::::. :.:: ::. ..: . .
CCDS74 PKSERYEHVLEALNDYKTMFMSGKEIKKKKHLFGLRIRVPP--VPPN-----VAFKAEKE
320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 PGGGVSRPLGKRRRPEPEPLR--RRQKGKVEELGPPSAVRNQPEPQEQRERAHLQRALQA
: : .:. . . : .:. :. .. .:. : ..: : : : .:.. .
CCDS74 PEG-TSHEFKIKGRKASKPISDSREVSNGIEKKGKKKSVGRPPGP---YTRKMIQKTAEP
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 SVSPPSPSPNQSYQGSSGYNFRPTDARCLPSSPIRMF-ASFHPSASTAGTSGDSGPPD-R
.. : : : . . . . :. .: . . :: ..... : : : :
CCDS74 LLDKESISENPTLDLPCSIGRTEGTAHSSNTSDVDFTGASSAKETTSSSISRHYGLSDSR
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520
pF1KE3 SPLELHIGFPTDIPK------SAPH-SMTASSSSVSSPSPGLPRRSAPP--SPLCRSLSP
. . ..:. ::. :. .. ...: . . . : . . . .:.
CCDS74 KRTRTGRSWPAAIPHLRRRRGRLPRRALQTQNSEIVKDDEGKEDYQFDELNTEILNNLAD
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560
pF1KE3 ---------GTGGGVRGGVGYLSRGDPVRVLARRVRPDGSVQYLVEWGGGGIF
.. . :..: .. :. ::::::: ::.::::::: :
CCDS74 QELQLNHLKNSITSYFGAAGRIACGEKYRVLARRVTLDGKVQYLVEWEGATAS
550 560 570 580 590
>>CCDS53340.1 MTF2 gene_id:22823|Hs108|chr1 (536 aa)
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Smith-Waterman score: 1264; 39.9% identity (61.1% similar) in 547 aa overlap (27-563:42-532)
10 20 30 40 50
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: .. :::::::::.:::.:::::::..
CCDS53 VHKRSPLRRNQKTPTSLTKLSLQDGHKAKKPACKFEEGQDVLARWSDGLFYLGTIKKINI
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 AREVCLVQFEDDSQFLVLWKDISPAALPGEELLCCVCRSETVVPGNRLVSCEKCRHAYHQ
.. :.. :::.:. ::::::. .: . :..: .:. : :..: :.:: ..:::
CCDS53 LKQSCFIIFEDSSKSWVLWKDIQTGATGSGEMVCTICQEEYSEAPNEMVICDKCGQGYHQ
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 DCHVPRAPAPGEGEGTSWVCRQCVFAIATKRGGALKKGPYARAMLGMKLSLPYGLKGLDW
::.:. . .:.::::::: .::::::::::: :.:. :: .:::.. :.:
CCDS53 LCHTPHIDSSVIDSDEKWLCRQCVFATTTKRGGALKKGPNAKALQVMKQTLPYSVADLEW
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 DAGHLSNRQQSYCYCGGPGEWNLKMLQCRSCLQWFHEACTQCLSKPLLYGDRFYEFECCV
:::: .: :: ::::::::.: :::::: .: :::::::.:::.::.:.::::: : : :
CCDS53 DAGHKTNVQQCYCYCGGPGDWYLKMLQCCKCKQWFHEACVQCLQKPMLFGDRFYTFICSV
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 CRGGPEKVRRLQLRWVDVAHLVLYHLSVCCKKKYFDFDREILPFTSENWDSLLLGELSDT
: .::: ..:: :.:::.::: ::.::: :::::: . :.. . .:::: : :::.::
CCDS53 CSSGPEYLKRLPLQWVDIAHLCLYNLSVIHKKKYFDSELELMTYINENWDRLHPGELADT
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340
pF1KE3 PKGERSSKLLSALNSHKDRFIS-GREIKKRKCLFGLHARMPPP---------VEPPTGDG
::.:: ..: :::..: .: : : : .: : : : : .::
CCDS53 PKSERYEHVLEALNDYKTMEVSNGIEKKGKKKSVG---RPPGPYTRKMIQKTAEPLLDKE
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350 360 370 380 390 400
pF1KE3 ALTSFPSGQGPGGGVSRPLGKRRRPEPEPLRRRQKGKVEELGPPSAVRNQPEPQEQRERA
... :. . : . ..: : . . . ....: : :. ...:.:.
CCDS53 SISENPTLDLPCS-IGRTEGTAHSSNTSDVDFTGASSAKETTSSSISRHYGL-SDSRKRT
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 HLQRALQASVSPPSPSPNQSYQGSSGYNFRPTDARCLPSSPIRMFASFHPSASTAGTSGD
. : : :. :. .: .: :: .. . .. .. :
CCDS53 RTGR------SWPAAIPH----------LRRRRGR-LPRRALQ-------TQNSEIVKDD
430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KE3 SGPPDRSPLELHIGFPTDIPKSAPHSMTASSSSVSSPSPGLPRRSAPPSPLCRSLSPGTG
: : . ::. . ... . ... ..:..:
CCDS53 EGKEDYQFDELNTEILNNLA-DQELQLNHLKNSITS------------------------
470 480 490
530 540 550 560
pF1KE3 GGVRGGVGYLSRGDPVRVLARRVRPDGSVQYLVEWGGGGIF
:..: .. :. ::::::: ::.::::::: :
CCDS53 --YFGAAGRIACGEKYRVLARRVTLDGKVQYLVEWEGATAS
500 510 520 530
>>CCDS53341.1 MTF2 gene_id:22823|Hs108|chr1 (491 aa)
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..: .:. : :..: :.:: ..:::
CCDS53 MVCTICQEEYSEAPNEMVICDKCGQGYHQL
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 CHVPRAPAPGEGEGTSWVCRQCVFAIATKRGGALKKGPYARAMLGMKLSLPYGLKGLDWD
::.:. . .:.::::::: .::::::::::: :.:. :: .:::.. :.::
CCDS53 CHTPHIDSSVIDSDEKWLCRQCVFATTTKRGGALKKGPNAKALQVMKQTLPYSVADLEWD
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
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::: .: :: ::::::::.: :::::: .: :::::::.:::.::.:.::::: : : ::
CCDS53 AGHKTNVQQCYCYCGGPGDWYLKMLQCCKCKQWFHEACVQCLQKPMLFGDRFYTFICSVC
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240 250 260 270 280 290
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.::: ..:: :.:::.::: ::.::: :::::: . :.. . .:::: : :::.:::
CCDS53 SSGPEYLKRLPLQWVDIAHLCLYNLSVIHKKKYFDSELELMTYINENWDRLHPGELADTP
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
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:.:: ..: :::..: :.::.::::.: ::::. :.:: ::. ..: . . :
CCDS53 KSERYEHVLEALNDYKTMFMSGKEIKKKKHLFGLRIRVPP--VPPN-----VAFKAEKEP
220 230 240 250 260
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: .:. . . : .:. :. .. .:. : ..: : : : .:.. .
CCDS53 EG-TSHEFKIKGRKASKPISDSREVSNGIEKKGKKKSVGRPPGP---YTRKMIQKTAEPL
270 280 290 300 310
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.. : : : . . . . :. .: . . :: ..... : : : :.
CCDS53 LDKESISENPTLDLPCSIGRTEGTAHSSNTSDVDFTGASSAKETTSSSISRHYGLSDSRK
320 330 340 350 360 370
480 490 500 510 520
pF1KE3 PLELHIGFPTDIPK------SAPH-SMTASSSSVSSPSPGLPRRSAPP--SPLCRSLSP-
. ..:. ::. :. .. ...: . . . : . . . .:.
CCDS53 RTRTGRSWPAAIPHLRRRRGRLPRRALQTQNSEIVKDDEGKEDYQFDELNTEILNNLADQ
380 390 400 410 420 430
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pF1KE3 --------GTGGGVRGGVGYLSRGDPVRVLARRVRPDGSVQYLVEWGGGGIF
.. . :..: .. :. ::::::: ::.::::::: :
CCDS53 ELQLNHLKNSITSYFGAAGRIACGEKYRVLARRVTLDGKVQYLVEWEGATAS
440 450 460 470 480 490
>>CCDS69648.1 PHF19 gene_id:26147|Hs108|chr9 (371 aa)
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:::: : :::::::::::..:...:::::
CCDS69 MLQCYRCRQWFHEACTQCLNEPMMFGDRFY
10 20 30
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 EFECCVCRGGPEKVRRLQLRWVDVAHLVLYHLSVCCKKKYFDFDREILPFTSENWDSLLL
: : :: ::: ..:: ::::::.::.::.:.: :::::::. ::: :....:. : :
CCDS69 LFFCSVCNQGPEYIERLPLRWVDVVHLALYNLGVQSKKKYFDFE-EILAFVNHHWELLQL
40 50 60 70 80
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 GELSDTPKGERSSKLLSALNSHKDRFISGREIKKRKCLFGLHARMPPPVEPPTGDGALTS
:.:..:: .:. .::.::::.:.::. :.::::.::.: :. :.:: .:: : :
CCDS69 GKLTSTPVTDRGPHLLNALNSYKSRFLCGKEIKKKKCIFRLRIRVPP--NPP---GKLL-
90 100 110 120 130 140
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: :. : .. : ::.: :.: : : ..: . .:.:.. :
CCDS69 ------PDKGL---LPNENSASSE-LRKRGKSKPGLL--PHEFQQQKRRVYRRKRSKFLL
150 160 170 180 190
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. :. .: . : : .. .: ..: . . : : : .:.. . :::.:..
CCDS69 EDAIPSSDFTSAWSTN--HHLASIFDFTLDEIQSLKSASSGQTFFSDVDSTDAASTSGSA
200 210 220 230 240
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CCDS69 STSLSYDSRWTVGSRKRKLAAKAYMPLRAKRWAAELDGRCPSDSSAEGASVPERPDEGID
250 260 270 280 290 300
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]