Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3761
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3761, 552 aa
1>>>pF1KE3761 552 - 552 aa - 552 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4868+/-0.00119; mu= 2.7158+/- 0.069
mean_var=257.5771+/-59.942, 0's: 0 Z-trim(108.3): 686 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.079914
statistics sampled from 9329 (10139) to 9329 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.673), E-opt: 0.2 (0.311), width: 16
Scan time: 3.050
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS605.1 PRKAA2 gene_id:5563|Hs108|chr1 ( 552) 3703 441.2 1.6e-123
CCDS3932.2 PRKAA1 gene_id:5562|Hs108|chr5 ( 559) 2829 340.4 3.4e-93
CCDS3933.2 PRKAA1 gene_id:5562|Hs108|chr5 ( 574) 2172 264.7 2.2e-70
CCDS8347.1 SIK2 gene_id:23235|Hs108|chr11 ( 926) 977 127.1 9e-29
CCDS33575.1 SIK1 gene_id:150094|Hs108|chr21 ( 783) 970 126.2 1.4e-28
CCDS82645.1 LOC102724428 gene_id:102724428|Hs108|c ( 783) 970 126.2 1.4e-28
CCDS41590.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 668) 909 119.1 1.7e-26
CCDS58106.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 674) 909 119.1 1.7e-26
CCDS58107.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 736) 909 119.2 1.8e-26
CCDS12921.1 BRSK1 gene_id:84446|Hs108|chr19 ( 778) 909 119.2 1.8e-26
CCDS41993.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 729) 902 118.4 3.1e-26
CCDS45166.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 744) 902 118.4 3.1e-26
CCDS45165.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 753) 902 118.4 3.1e-26
CCDS60974.1 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1261) 904 118.8 3.8e-26
CCDS8379.2 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1321) 900 118.4 5.4e-26
CCDS53651.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 709) 886 116.5 1.1e-25
CCDS8051.2 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 724) 886 116.5 1.1e-25
CCDS41665.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 745) 886 116.5 1.1e-25
CCDS73034.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 780) 885 116.4 1.2e-25
CCDS31029.2 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 795) 885 116.4 1.3e-25
CCDS73033.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 796) 885 116.4 1.3e-25
CCDS53650.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 719) 882 116.1 1.5e-25
CCDS53649.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 788) 882 116.1 1.6e-25
CCDS55947.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 713) 877 115.5 2.2e-25
CCDS58108.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 766) 873 115.0 3.2e-25
CCDS12658.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 688) 851 112.5 1.7e-24
CCDS56097.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 752) 851 112.5 1.8e-24
CCDS59123.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 610) 845 111.7 2.6e-24
CCDS6606.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 651) 845 111.7 2.7e-24
CCDS31892.1 NUAK1 gene_id:9891|Hs108|chr12 ( 661) 801 106.7 9.2e-23
CCDS60696.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 614) 790 105.4 2.1e-22
CCDS1453.2 NUAK2 gene_id:81788|Hs108|chr1 ( 672) 784 104.7 3.6e-22
CCDS59126.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 619) 758 101.7 2.7e-21
CCDS43075.1 SNRK gene_id:54861|Hs108|chr3 ( 765) 759 101.9 2.9e-21
CCDS13610.1 HUNK gene_id:30811|Hs108|chr21 ( 714) 715 96.8 9.3e-20
CCDS3943.1 NIM1K gene_id:167359|Hs108|chr5 ( 436) 708 95.8 1.2e-19
CCDS65789.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 758) 636 87.7 5.4e-17
CCDS59127.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 580) 633 87.2 5.7e-17
CCDS7092.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 ( 357) 607 84.0 3.3e-16
CCDS7091.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 ( 385) 607 84.1 3.4e-16
CCDS2582.1 CAMK1 gene_id:8536|Hs108|chr3 ( 370) 603 83.6 4.6e-16
CCDS48189.1 PNCK gene_id:139728|Hs108|chrX ( 360) 595 82.6 8.6e-16
CCDS35503.2 PNCK gene_id:139728|Hs108|chrX ( 426) 595 82.7 9.6e-16
CCDS1486.1 CAMK1G gene_id:57172|Hs108|chr1 ( 476) 585 81.6 2.3e-15
CCDS5489.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 449) 581 81.1 3e-15
CCDS4112.1 TSSK1B gene_id:83942|Hs108|chr5 ( 367) 574 80.2 4.7e-15
CCDS45896.1 STK11 gene_id:6794|Hs108|chr19 ( 433) 574 80.3 5.2e-15
CCDS362.1 TSSK3 gene_id:81629|Hs108|chr1 ( 268) 568 79.4 6.1e-15
CCDS82948.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 512) 569 79.8 8.7e-15
CCDS82949.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 533) 569 79.8 8.9e-15
>>CCDS605.1 PRKAA2 gene_id:5563|Hs108|chr1 (552 aa)
initn: 3703 init1: 3703 opt: 3703 Z-score: 2331.3 bits: 441.2 E(32554): 1.6e-123
Smith-Waterman score: 3703; 100.0% identity (100.0% similar) in 552 aa overlap (1-552:1-552)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MAEKQKHDGRVKIGHYVLGDTLGVGTFGKVKIGEHQLTGHKVAVKILNRQKIRSLDVVGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MAEKQKHDGRVKIGHYVLGDTLGVGTFGKVKIGEHQLTGHKVAVKILNRQKIRSLDVVGK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 IKREIQNLKLFRHPHIIKLYQVISTPTDFFMVMEYVSGGELFDYICKHGRVEEMEARRLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 IKREIQNLKLFRHPHIIKLYQVISTPTDFFMVMEYVSGGELFDYICKHGRVEEMEARRLF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 QQILSAVDYCHRHMVVHRDLKPENVLLDAHMNAKIADFGLSNMMSDGEFLRTSCGSPNYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 QQILSAVDYCHRHMVVHRDLKPENVLLDAHMNAKIADFGLSNMMSDGEFLRTSCGSPNYA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 APEVISGRLYAGPEVDIWSCGVILYALLCGTLPFDDEHVPTLFKKIRGGVFYIPEYLNRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 APEVISGRLYAGPEVDIWSCGVILYALLCGTLPFDDEHVPTLFKKIRGGVFYIPEYLNRS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 VATLLMHMLQVDPLKRATIKDIREHEWFKQDLPSYLFPEDPSYDANVIDDEAVKEVCEKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 VATLLMHMLQVDPLKRATIKDIREHEWFKQDLPSYLFPEDPSYDANVIDDEAVKEVCEKF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 ECTESEVMNSLYSGDPQDQLAVAYHLIIDNRRIMNQASEFYLASSPPSGSFMDDSAMHIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 ECTESEVMNSLYSGDPQDQLAVAYHLIIDNRRIMNQASEFYLASSPPSGSFMDDSAMHIP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 PGLKPHPERMPPLIADSPKARCPLDALNTTKPKSLAVKKAKWHLGIRSQSKPYDIMAEVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PGLKPHPERMPPLIADSPKARCPLDALNTTKPKSLAVKKAKWHLGIRSQSKPYDIMAEVY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 RAMKQLDFEWKVVNAYHLRVRRKNPVTGNYVKMSLQLYLVDNRSYLLDFKSIDDEVVEQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 RAMKQLDFEWKVVNAYHLRVRRKNPVTGNYVKMSLQLYLVDNRSYLLDFKSIDDEVVEQR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 SGSSTPQRSCSAAGLHRPRSSFDSTTAESHSLSGSLTGSLTGSTLSSVSPRLGSHTMDFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SGSSTPQRSCSAAGLHRPRSSFDSTTAESHSLSGSLTGSLTGSTLSSVSPRLGSHTMDFF
490 500 510 520 530 540
550
pF1KE3 EMCASLITTLAR
::::::::::::
CCDS60 EMCASLITTLAR
550
>>CCDS3932.2 PRKAA1 gene_id:5562|Hs108|chr5 (559 aa)
initn: 2851 init1: 2081 opt: 2829 Z-score: 1786.7 bits: 340.4 E(32554): 3.4e-93
Smith-Waterman score: 2829; 76.3% identity (90.1% similar) in 553 aa overlap (2-552:13-559)
10 20 30 40
pF1KE3 MAEKQKHDGRVKIGHYVLGDTLGVGTFGKVKIGEHQLTGHKVAVKILNR
:::::::::::::::.::::::::::::::.:.:.:::::::::::::
CCDS39 MRRLSSWRKMATAEKQKHDGRVKIGHYILGDTLGVGTFGKVKVGKHELTGHKVAVKILNR
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 QKIRSLDVVGKIKREIQNLKLFRHPHIIKLYQVISTPTDFFMVMEYVSGGELFDYICKHG
::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:.::::::::::::::::::.:
CCDS39 QKIRSLDVVGKIRREIQNLKLFRHPHIIKLYQVISTPSDIFMVMEYVSGGELFDYICKNG
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 RVEEMEARRLFQQILSAVDYCHRHMVVHRDLKPENVLLDAHMNAKIADFGLSNMMSDGEF
:..: :.:::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 RLDEKESRRLFQQILSGVDYCHRHMVVHRDLKPENVLLDAHMNAKIADFGLSNMMSDGEF
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 LRTSCGSPNYAAPEVISGRLYAGPEVDIWSCGVILYALLCGTLPFDDEHVPTLFKKIRGG
:::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::.::::::::: :
CCDS39 LRTSCGSPNYAAPEVISGRLYAGPEVDIWSSGVILYALLCGTLPFDDDHVPTLFKKICDG
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 VFYIPEYLNRSVATLLMHMLQVDPLKRATIKDIREHEWFKQDLPSYLFPEDPSYDANVID
.:: :.::: :: .:: :::::::.:::::::::::::::::::.:::::::::....::
CCDS39 IFYTPQYLNPSVISLLKHMLQVDPMKRATIKDIREHEWFKQDLPKYLFPEDPSYSSTMID
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 DEAVKEVCEKFECTESEVMNSLYSGDPQDQLAVAYHLIIDNRRIMNQASEFYLASSPPSG
:::.:::::::::.: ::.. ::. . :: ::::::::::::::::.:..::::.:::.
CCDS39 DEALKEVCEKFECSEEEVLSCLYNRNHQDPLAVAYHLIIDNRRIMNEAKDFYLATSPPD-
310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 SFMDDSAMHIPPGLKPHPERMPPLIADSPKARCPLDALNTTKPKSLAVKKAKWHLGIRSQ
::.:: :. .:::::.: :.:..:.:: :: :: : : .:.:::::::::::
CCDS39 SFLDDH--HL---TRPHPERVPFLVAETPRARHTLDELNPQKSKHQGVRKAKWHLGIRSQ
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 SKPYDIMAEVYRAMKQLDFEWKVVNAYHLRVRRKNPVTGNYVKMSLQLYLVDNRSYLLDF
:.: :::::: ::.::::.:::::: :.::::::::::..: ::::::: ::.:.:::::
CCDS39 SRPNDIMAEVCRAIKQLDYEWKVVNPYYLRVRRKNPVTSTYSKMSLQLYQVDSRTYLLDF
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE3 KSIDDEVVEQRSGSSTPQRSCSAAGLHRPRSSFDSTTAESHSLSGSLTGSLTGSTLSSV-
.:::::..: .::..::::: :... . . : ... :...: :::.:.:. : :
CCDS39 RSIDDEITEAKSGTATPQRSGSVSNYRSCQRSDSDAEAQGKSSEVSLTSSVTSLDSSPVD
480 490 500 510 520 530
530 540 550
pF1KE3 -SPRLGSHTMDFFEMCASLITTLAR
.:: ::::..::::::.:: ::.
CCDS39 LTPRPGSHTIEFFEMCANLIKILAQ
540 550
>>CCDS3933.2 PRKAA1 gene_id:5562|Hs108|chr5 (574 aa)
initn: 2837 init1: 1392 opt: 2172 Z-score: 1377.1 bits: 264.7 E(32554): 2.2e-70
Smith-Waterman score: 2789; 74.3% identity (87.7% similar) in 568 aa overlap (2-552:13-574)
10 20 30 40
pF1KE3 MAEKQKHDGRVKIGHYVLGDTLGVGTFGKVKIGEHQLTGHKVAVKILNR
:::::::::::::::.::::::::::::::.:.:.:::::::::::::
CCDS39 MRRLSSWRKMATAEKQKHDGRVKIGHYILGDTLGVGTFGKVKVGKHELTGHKVAVKILNR
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 QKIRSLDVVGKIKREIQNLKLFRHPHIIKLYQVISTPTDFFMVMEYVSGGELFDYICKHG
::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:.::::::::::::::::::.:
CCDS39 QKIRSLDVVGKIRREIQNLKLFRHPHIIKLYQVISTPSDIFMVMEYVSGGELFDYICKNG
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150
pF1KE3 R---------------VEEMEARRLFQQILSAVDYCHRHMVVHRDLKPENVLLDAHMNAK
: ..: :.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 RKSDVPGVVKTGSTKELDEKESRRLFQQILSGVDYCHRHMVVHRDLKPENVLLDAHMNAK
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 IADFGLSNMMSDGEFLRTSCGSPNYAAPEVISGRLYAGPEVDIWSCGVILYALLCGTLPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS39 IADFGLSNMMSDGEFLRTSCGSPNYAAPEVISGRLYAGPEVDIWSSGVILYALLCGTLPF
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 DDEHVPTLFKKIRGGVFYIPEYLNRSVATLLMHMLQVDPLKRATIKDIREHEWFKQDLPS
::.::::::::: :.:: :.::: :: .:: :::::::.:::::::::::::::::::.
CCDS39 DDDHVPTLFKKICDGIFYTPQYLNPSVISLLKHMLQVDPMKRATIKDIREHEWFKQDLPK
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 YLFPEDPSYDANVIDDEAVKEVCEKFECTESEVMNSLYSGDPQDQLAVAYHLIIDNRRIM
:::::::::....:::::.:::::::::.: ::.. ::. . :: :::::::::::::::
CCDS39 YLFPEDPSYSSTMIDDEALKEVCEKFECSEEEVLSCLYNRNHQDPLAVAYHLIIDNRRIM
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 NQASEFYLASSPPSGSFMDDSAMHIPPGLKPHPERMPPLIADSPKARCPLDALNTTKPKS
:.:..::::.:::. ::.:: :. .:::::.: :.:..:.:: :: :: : :
CCDS39 NEAKDFYLATSPPD-SFLDDH--HL---TRPHPERVPFLVAETPRARHTLDELNPQKSKH
370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 LAVKKAKWHLGIRSQSKPYDIMAEVYRAMKQLDFEWKVVNAYHLRVRRKNPVTGNYVKMS
.:.::::::::::::.: :::::: ::.::::.:::::: :.::::::::::..: :::
CCDS39 QGVRKAKWHLGIRSQSRPNDIMAEVCRAIKQLDYEWKVVNPYYLRVRRKNPVTSTYSKMS
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KE3 LQLYLVDNRSYLLDFKSIDDEVVEQRSGSSTPQRSCSAAGLHRPRSSFDSTTAESHSLSG
:::: ::.:.:::::.:::::..: .::..::::: :... . . : ... :...:
CCDS39 LQLYQVDSRTYLLDFRSIDDEITEAKSGTATPQRSGSVSNYRSCQRSDSDAEAQGKSSEV
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550
pF1KE3 SLTGSLTGSTLSSV--SPRLGSHTMDFFEMCASLITTLAR
:::.:.:. : : .:: ::::..::::::.:: ::.
CCDS39 SLTSSVTSLDSSPVDLTPRPGSHTIEFFEMCANLIKILAQ
540 550 560 570
>>CCDS8347.1 SIK2 gene_id:23235|Hs108|chr11 (926 aa)
initn: 945 init1: 826 opt: 977 Z-score: 630.0 bits: 127.1 E(32554): 9e-29
Smith-Waterman score: 977; 43.4% identity (74.6% similar) in 346 aa overlap (1-340:3-344)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MAEKQKH--DGRVKIGHYVLGDTLGVGTFGKVKIGEHQLTGHKVAVKILNRQKIRSLD
::. .: : :..: : . ::: :.:. ::.:.:..: .::.::...... ...
CCDS83 MVMADGPRHLQRGPVRVGFYDIEGTLGKGNFAVVKLGRHRITKTEVAIKIIDKSQLDAVN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 VVGKIKREIQNLKLFRHPHIIKLYQVISTPTDFFMVMEYVSGGELFDYICKHGRVEEMEA
. :: ::.: .:.. ::::::::::. : . ...: ::...::.:::. .:::..: ::
CCDS83 LE-KIYREVQIMKMLDHPHIIKLYQVMETKSMLYLVTEYAKNGEIFDYLANHGRLNESEA
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 RRLFQQILSAVDYCHRHMVVHRDLKPENVLLDAHMNAKIADFGLSNMMSDGEFLRTSCGS
:: : :::::::::: . .:::::: ::.::: .:: ::::::..:....::.: : :::
CCDS83 RRKFWQILSAVDYCHGRKIVHRDLKAENLLLDNNMNIKIADFGFGNFFKSGELLATWCGS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 PNYAAPEVISGRLYAGPEVDIWSCGVILYALLCGTLPFDDEHVPTLFKKIRGGVFYIPEY
: ::::::. :. : ::..:::: ::.::.:.::.:::: .: : ... : : :: .
CCDS83 PPYAAPEVFEGQQYEGPQLDIWSMGVVLYVLVCGALPFDGPTLPILRQRVLEGRFRIPYF
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CCDS12 RYPSCEDQDL---PPRND-VDPPRKRVDSPMLSRHGKRRPERKSMEVLSITDAGGGGSPV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]