Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3666
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3666, 355 aa
1>>>pF1KE3666 355 - 355 aa - 355 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2388+/-0.00102; mu= 17.2610+/- 0.061
mean_var=75.2859+/-14.799, 0's: 0 Z-trim(104.5): 47 B-trim: 14 in 1/48
Lambda= 0.147815
statistics sampled from 7894 (7938) to 7894 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.619), E-opt: 0.2 (0.244), width: 16
Scan time: 2.530
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6657.1 GNA14 gene_id:9630|Hs108|chr9 ( 355) 2329 506.2 1.7e-143
CCDS6658.1 GNAQ gene_id:2776|Hs108|chr9 ( 359) 1956 426.7 1.5e-119
CCDS12103.1 GNA11 gene_id:2767|Hs108|chr19 ( 359) 1950 425.4 3.6e-119
CCDS12104.1 GNA15 gene_id:2769|Hs108|chr19 ( 374) 1188 262.9 3.1e-70
CCDS10757.1 GNAO1 gene_id:2775|Hs108|chr16 ( 354) 1176 260.4 1.7e-69
CCDS5595.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7 ( 354) 1167 258.4 6.5e-69
CCDS802.1 GNAI3 gene_id:2773|Hs108|chr1 ( 354) 1146 254.0 1.5e-67
CCDS10756.1 GNAO1 gene_id:2775|Hs108|chr16 ( 354) 1142 253.1 2.6e-67
CCDS2813.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 355) 1140 252.7 3.5e-67
CCDS47625.1 GNAT3 gene_id:346562|Hs108|chr7 ( 354) 1114 247.1 1.7e-65
CCDS2812.1 GNAT1 gene_id:2779|Hs108|chr3 ( 350) 1094 242.9 3.1e-64
CCDS803.1 GNAT2 gene_id:2780|Hs108|chr1 ( 354) 1088 241.6 7.7e-64
CCDS13804.1 GNAZ gene_id:2781|Hs108|chr22 ( 355) 1046 232.6 3.8e-61
CCDS54587.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 318) 1035 230.3 1.8e-60
CCDS63642.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 339) 1035 230.3 1.9e-60
CCDS11661.1 GNA13 gene_id:10672|Hs108|chr17 ( 377) 1035 230.3 2e-60
CCDS59061.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7 ( 302) 988 220.2 1.8e-57
CCDS63644.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 303) 967 215.7 4e-56
CCDS5335.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7 ( 381) 948 211.8 7.9e-55
CCDS62302.1 GNA13 gene_id:10672|Hs108|chr17 ( 282) 788 177.5 1.2e-44
CCDS11851.1 GNAL gene_id:2774|Hs108|chr18 ( 458) 783 176.6 3.6e-44
CCDS42892.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 379) 776 175.1 8.7e-44
CCDS46624.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 380) 772 174.2 1.6e-43
CCDS11852.1 GNAL gene_id:2774|Hs108|chr18 ( 381) 770 173.8 2.1e-43
CCDS64584.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7 ( 322) 745 168.4 7.5e-42
CCDS64583.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7 ( 305) 639 145.8 4.6e-35
CCDS13472.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 394) 594 136.3 4.3e-32
CCDS46623.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 395) 590 135.4 7.8e-32
CCDS46622.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 (1037) 594 136.6 9.1e-32
CCDS58614.1 GNAL gene_id:2774|Hs108|chr18 ( 174) 329 79.5 2.4e-15
>>CCDS6657.1 GNA14 gene_id:9630|Hs108|chr9 (355 aa)
initn: 2329 init1: 2329 opt: 2329 Z-score: 2689.8 bits: 506.2 E(32554): 1.7e-143
Smith-Waterman score: 2329; 100.0% identity (100.0% similar) in 355 aa overlap (1-355:1-355)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MAGCCCLSAEEKESQRISAEIERQLRRDKKDARRELKLLLLGTGESGKSTFIKQMRIIHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MAGCCCLSAEEKESQRISAEIERQLRRDKKDARRELKLLLLGTGESGKSTFIKQMRIIHG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 SGYSDEDRKGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMDTLRIQYVCEQNKENAQIIREVEVDKVSML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SGYSDEDRKGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMDTLRIQYVCEQNKENAQIIREVEVDKVSML
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 SREQVEAIKQLWQDPGIQECYDRRREYQLSDSAKYYLTDIDRIATPSFVPTQQDVLRVRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SREQVEAIKQLWQDPGIQECYDRRREYQLSDSAKYYLTDIDRIATPSFVPTQQDVLRVRV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 PTTGIIEYPFDLENIIFRMVDVGGQRSERRKWIHCFESVTSIIFLVALSEYDQVLAECDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 PTTGIIEYPFDLENIIFRMVDVGGQRSERRKWIHCFESVTSIIFLVALSEYDQVLAECDN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 ENRMEESKALFKTIITYPWFLNSSVILFLNKKDLLEEKIMYSHLISYFPEYTGPKQDVRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 ENRMEESKALFKTIITYPWFLNSSVILFLNKKDLLEEKIMYSHLISYFPEYTGPKQDVRA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE3 ARDFILKLYQDQNPDKEKVIYSHFTCATDTDNIRFVFAAVKDTILQLNLREFNLV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 ARDFILKLYQDQNPDKEKVIYSHFTCATDTDNIRFVFAAVKDTILQLNLREFNLV
310 320 330 340 350
>>CCDS6658.1 GNAQ gene_id:2776|Hs108|chr9 (359 aa)
initn: 1956 init1: 1956 opt: 1956 Z-score: 2259.9 bits: 426.7 E(32554): 1.5e-119
Smith-Waterman score: 1956; 81.8% identity (94.9% similar) in 351 aa overlap (5-355:9-359)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MAGCCCLSAEEKESQRISAEIERQLRRDKKDARRELKLLLLGTGESGKSTFIKQMR
:::: : ::..::. ::::::::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MTLESIMACCLSEEAKEARRINDEIERQLRRDKRDARRELKLLLLGTGESGKSTFIKQMR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 IIHGSGYSDEDRKGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMDTLRIQYVCEQNKENAQIIREVEVDK
:::::::::::..::::::::::::::::::::::::.: : :.:: .::..:::.:.:
CCDS66 IIHGSGYSDEDKRGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMDTLKIPYKYEHNKAHAQLVREVDVEK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 VSMLSREQVEAIKQLWQDPGIQECYDRRREYQLSDSAKYYLTDIDRIATPSFVPTQQDVL
:: . :.:::.::.:::::::::::::::::::.::::.:.::.: :...:::::::
CCDS66 VSAFENPYVDAIKSLWNDPGIQECYDRRREYQLSDSTKYYLNDLDRVADPAYLPTQQDVL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 RVRVPTTGIIEYPFDLENIIFRMVDVGGQRSERRKWIHCFESVTSIIFLVALSEYDQVLA
::::::::::::::::...::::::::::::::::::::::.::::.::::::::::::.
CCDS66 RVRVPTTGIIEYPFDLQSVIFRMVDVGGQRSERRKWIHCFENVTSIMFLVALSEYDQVLV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 ECDNENRMEESKALFKTIITYPWFLNSSVILFLNKKDLLEEKIMYSHLISYFPEYTGPKQ
: :::::::::::::.:::::::: :::::::::::::::::::::::..::::: ::..
CCDS66 ESDNENRMEESKALFRTIITYPWFQNSSVILFLNKKDLLEEKIMYSHLVDYFPEYDGPQR
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 DVRAARDFILKLYQDQNPDKEKVIYSHFTCATDTDNIRFVFAAVKDTILQLNLREFNLV
:..:::.::::.. : :::..:.:::::::::::.::::::::::::::::::.:.:::
CCDS66 DAQAAREFILKMFVDLNPDSDKIIYSHFTCATDTENIRFVFAAVKDTILQLNLKEYNLV
310 320 330 340 350
>>CCDS12103.1 GNA11 gene_id:2767|Hs108|chr19 (359 aa)
initn: 1950 init1: 1950 opt: 1950 Z-score: 2253.0 bits: 425.4 E(32554): 3.6e-119
Smith-Waterman score: 1950; 82.3% identity (94.9% similar) in 351 aa overlap (5-355:9-359)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MAGCCCLSAEEKESQRISAEIERQLRRDKKDARRELKLLLLGTGESGKSTFIKQMR
:::: : :::.::.::::.::::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MTLESMMACCLSDEVKESKRINAEIEKQLRRDKRDARRELKLLLLGTGESGKSTFIKQMR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 IIHGSGYSDEDRKGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMDTLRIQYVCEQNKENAQIIREVEVDK
::::.:::.::..:::::::::::::::::::::.::.: : :::: :: .::::.:.:
CCDS12 IIHGAGYSEEDKRGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMETLKILYKYEQNKANALLIREVDVEK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 VSMLSREQVEAIKQLWQDPGIQECYDRRREYQLSDSAKYYLTDIDRIATPSFVPTQQDVL
:. . .. : ::: ::.::::::::::::::::::::::::::.::::: ...:::::::
CCDS12 VTTFEHQYVSAIKTLWEDPGIQECYDRRREYQLSDSAKYYLTDVDRIATLGYLPTQQDVL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 RVRVPTTGIIEYPFDLENIIFRMVDVGGQRSERRKWIHCFESVTSIIFLVALSEYDQVLA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::::::::::::.
CCDS12 RVRVPTTGIIEYPFDLENIIFRMVDVGGQRSERRKWIHCFENVTSIMFLVALSEYDQVLV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 ECDNENRMEESKALFKTIITYPWFLNSSVILFLNKKDLLEEKIMYSHLISYFPEYTGPKQ
: :::::::::::::.:::::::: :::::::::::::::.::.::::..::::. ::..
CCDS12 ESDNENRMEESKALFRTIITYPWFQNSSVILFLNKKDLLEDKILYSHLVDYFPEFDGPQR
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 DVRAARDFILKLYQDQNPDKEKVIYSHFTCATDTDNIRFVFAAVKDTILQLNLREFNLV
:..:::.::::.. : :::..:.:::::::::::.::::::::::::::::::.:.:::
CCDS12 DAQAAREFILKMFVDLNPDSDKIIYSHFTCATDTENIRFVFAAVKDTILQLNLKEYNLV
310 320 330 340 350
>>CCDS12104.1 GNA15 gene_id:2769|Hs108|chr19 (374 aa)
initn: 1290 init1: 1176 opt: 1188 Z-score: 1374.5 bits: 262.9 E(32554): 3.1e-70
Smith-Waterman score: 1289; 54.1% identity (77.9% similar) in 366 aa overlap (4-355:9-374)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MAGCC--CLSAEEKESQRISAEIERQLRRDKKDARRELKLLLLGTGESGKSTFIK
:: ::. .:: . :.. ::.: : ..::. : :::::::: ::::::::::
CCDS12 MARSLTWRCCPWCLTEDEKAAARVDQEINRILLEQKKQDRGELKLLLLGPGESGKSTFIK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 QMRIIHGSGYSDEDRKGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMDTLRIQYVCEQNKENAQIIREVE
:::::::.:::.:.:::: :::::::..:.:::.::. :.: . ..:..:... .
CCDS12 QMRIIHGAGYSEEERKGFRPLVYQNIFVSMRAMIEAMERLQIPFSRPESKHHASLVMSQD
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 VDKVSMLSREQVEAIKQLWQDPGIQECYDRRREYQLSDSAKYYLTDIDRIATPSFVPTQQ
::. . .. . :.. ::.: ::. ::.::::..: ::: :::. ..::. ..::: :
CCDS12 PYKVTTFEKRYAAAMQWLWRDAGIRACYERRREFHLLDSAVYYLSHLERITEEGYVPTAQ
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 DVLRVRVPTTGIIEYPFDLENIIFRMVDVGGQRSERRKWIHCFESVTSIIFLVALSEYDQ
:::: :.::::: :: :.... .:.::::::.:::.:::::::.: ..:.:..::::::
CCDS12 DVLRSRMPTTGINEYCFSVQKTNLRIVDVGGQKSERKKWIHCFENVIALIYLASLSEYDQ
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 VLAECDNENRMEESKALFKTIITYPWFLNSSVILFLNKKDLLEEKIMYSHLISYFPEYTG
: : ..::::.:: ::: ::. ::: ..:::::::: :.::::: ::: .::: . :
CCDS12 CLEENNQENRMKESLALFGTILELPWFKSTSVILFLNKTDILEEKIPTSHLATYFPSFQG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340
pF1KE3 PKQDVRAARDFILKLYQDQ------NPD------KEKVIYSHFTCATDTDNIRFVFAAVK
::::..::. ::: .: . .:. . . ..::.::::::.::: :: :.
CCDS12 PKQDAEAAKRFILDMYTRMYTGCVDGPEGSKKGARSRRLFSHYTCATDTQNIRKVFKDVR
310 320 330 340 350 360
350
pF1KE3 DTILQLNLREFNLV
:..: : :.::.
CCDS12 DSVLARYLDEINLL
370
>>CCDS10757.1 GNAO1 gene_id:2775|Hs108|chr16 (354 aa)
initn: 1146 init1: 719 opt: 1176 Z-score: 1361.0 bits: 260.4 E(32554): 1.7e-69
Smith-Waterman score: 1176; 52.9% identity (77.6% similar) in 348 aa overlap (5-350:3-349)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MAGCCCLSAEEKESQRISAEIERQLRRDKKDARRELKLLLLGTGESGKSTFIKQMRIIHG
: :::::. . . : ::..:..: .: ...::::::.:::::::..:::.:::
CCDS10 MGCTLSAEERAALERSKAIEKNLKEDGISAAKDVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE3 SGYSDEDRKGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMDTLRIQYVCEQNKENAQIIREV--EVDKVS
.:.: :: : . .::.: . .. :..:::::: :.: .. : .:... .: ... .
CCDS10 DGFSGEDVKQYKPVVYSNTIQSLAAIVRAMDTLGIEYGDKERKADAKMVCDVVSRMEDTE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 MLSREQVEAIKQLWQDPGIQECYDRRREYQLSDSAKYYLTDIDRIATPSFVPTQQDVLRV
.: : . :. .:: : :::::..: :::::.::::::: ..:::.. .. ::.::.::.
CCDS10 PFSAELLSAMMRLWGDSGIQECFNRSREYQLNDSAKYYLDSLDRIGAADYQPTEQDILRT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 RVPTTGIIEYPFDLENIIFRMVDVGGQRSERRKWIHCFESVTSIIFLVALSEYDQVLAEC
:: ::::.: : ..:. ::. :::::::::.:::::::.::.::: :::: ::::: :
CCDS10 RVKTTGIVETHFTFKNLHFRLFDVGGQRSERKKWIHCFEDVTAIIFCVALSGYDQVLHED
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 DNENRMEESKALFKTIITYPWFLNSSVILFLNKKDLLEEKIMYSHLISYFPEYTGPKQDV
.. :::.:: :: .: . :: ..:.::::::::..:::: : : :::::::. .
CCDS10 ETTNRMHESLKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDIFEEKIKKSPLTICFPEYTGPSAFT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 RAARDFILKLYQDQNPDKEKVIYSHFTCATDTDNIRFVFAAVKDTILQLNLREFNLV
.:. .: :...: . .: ::.: ::::::.::.::: :: :.:. :::
CCDS10 EAVA-YIQAQYESKNKSAHKEIYTHVTCATDTNNIQFVFDAVTDVIIAKNLRGCGLY
300 310 320 330 340 350
>>CCDS5595.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7 (354 aa)
initn: 1149 init1: 858 opt: 1167 Z-score: 1350.6 bits: 258.4 E(32554): 6.5e-69
Smith-Waterman score: 1167; 52.6% identity (77.0% similar) in 352 aa overlap (5-354:3-353)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MAGCCCLSAEEKESQRISAEIERQLRRDKKDARRELKLLLLGTGESGKSTFIKQMRIIHG
: ::::.: . . : :.:.::.: . : ::.::::::.:::::::..:::.:::
CCDS55 MGCTLSAEDKAAVERSKMIDRNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE3 SGYSDEDRKGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMDTLRIQYVCEQNKENA-QIIREVEVDKVSM
.:::.:. : . .::.: . .. :.:::: :.:.. ..: :.. . . . ..
CCDS55 AGYSEEECKQYKAVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGDSARADDARQLFVLAGAAEEGF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 LSREQVEAIKQLWQDPGIQECYDRRREYQLSDSAKYYLTDIDRIATPSFVPTQQDVLRVR
.. : . .::.::.: :.: :..: :::::.::: :::.:.:::: :...::::::::.:
CCDS55 MTAELAGVIKRLWKDSGVQACFNRSREYQLNDSAAYYLNDLDRIAQPNYIPTQQDVLRTR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 VPTTGIIEYPFDLENIIFRMVDVGGQRSERRKWIHCFESVTSIIFLVALSEYDQVLAECD
: ::::.: : .... :.: :::::::::.:::::::.::.::: ::::.:: :::: .
CCDS55 VKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 NENRMEESKALFKTIITYPWFLNSSVILFLNKKDLLEEKIMYSHLISYFPEYTGPKQDVR
. :::.:: :: .: . :: ..:.:::::::::.:::: : : .:::.: . .
CCDS55 EMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKIKKSPLTICYPEYAGSNTYEE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 AARDFILKLYQDQNPDKE-KVIYSHFTCATDTDNIRFVFAAVKDTILQLNLREFNLV
:: .: ..: : :. : ::.:::::::: :..::: :: :.:.. ::.. .:
CCDS55 AAA-YIQCQFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF
300 310 320 330 340 350
>>CCDS802.1 GNAI3 gene_id:2773|Hs108|chr1 (354 aa)
initn: 1130 init1: 850 opt: 1146 Z-score: 1326.4 bits: 254.0 E(32554): 1.5e-67
Smith-Waterman score: 1146; 52.0% identity (76.7% similar) in 352 aa overlap (5-354:3-353)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MAGCCCLSAEEKESQRISAEIERQLRRDKKDARRELKLLLLGTGESGKSTFIKQMRIIHG
: ::::.: . . : :.:.::.: . : .:.::::::.:::::::..:::.:::
CCDS80 MGCTLSAEDKAAVERSKMIDRNLREDGEKAAKEVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE3 SGYSDEDRKGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMDTLRIQYVCEQNKENA-QIIREVEVDKVSM
.:::... : . .::.: . .. :.:::: :.:.. ..: :.. . . ..
CCDS80 DGYSEDECKQYKVVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGEAARADDARQLFVLAGSAEEGV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 LSREQVEAIKQLWQDPGIQECYDRRREYQLSDSAKYYLTDIDRIATPSFVPTQQDVLRVR
.. : . .::.::.: :.: :..: :::::.:::.:::.:.:::. ...::::::::.:
CCDS80 MTPELAGVIKRLWRDGGVQACFSRSREYQLNDSASYYLNDLDRISQSNYIPTQQDVLRTR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 VPTTGIIEYPFDLENIIFRMVDVGGQRSERRKWIHCFESVTSIIFLVALSEYDQVLAECD
: ::::.: : .... :.: :::::::::.:::::::.::.::: ::::.:: :::: .
CCDS80 VKTTGIVETHFTFKDLYFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 NENRMEESKALFKTIITYPWFLNSSVILFLNKKDLLEEKIMYSHLISYFPEYTGPKQDVR
. :::.:: :: .: . :: ..:.:::::::::.:::: : : .::::: . .
CCDS80 EMNRMHESMKLFDSICNNKWFTETSIILFLNKKDLFEEKIKRSPLTICYPEYTGSNTYEE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 AARDFILKLYQDQNPDKE-KVIYSHFTCATDTDNIRFVFAAVKDTILQLNLREFNLV
:: .: ..: : :. : ::.:::::::: :..::: :: :.:.. ::.: .:
CCDS80 AAA-YIQCQFEDLNRRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKECGLY
300 310 320 330 340 350
>>CCDS10756.1 GNAO1 gene_id:2775|Hs108|chr16 (354 aa)
initn: 1111 init1: 703 opt: 1142 Z-score: 1321.8 bits: 253.1 E(32554): 2.6e-67
Smith-Waterman score: 1142; 52.3% identity (76.4% similar) in 348 aa overlap (5-350:3-349)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MAGCCCLSAEEKESQRISAEIERQLRRDKKDARRELKLLLLGTGESGKSTFIKQMRIIHG
: :::::. . . : ::..:..: .: ...::::::.:::::::..:::.:::
CCDS10 MGCTLSAEERAALERSKAIEKNLKEDGISAAKDVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE3 SGYSDEDRKGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMDTLRIQYVCEQNKENAQIIREV--EVDKVS
.:.: :: : . .::.: . .. :..:::::: :.: .. : .:... .: ... .
CCDS10 DGFSGEDVKQYKPVVYSNTIQSLAAIVRAMDTLGIEYGDKERKADAKMVCDVVSRMEDTE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 MLSREQVEAIKQLWQDPGIQECYDRRREYQLSDSAKYYLTDIDRIATPSFVPTQQDVLRV
.: : . :. .:: : :::::..: :::::.::::::: ..:::.. .. ::.::.::.
CCDS10 PFSAELLSAMMRLWGDSGIQECFNRSREYQLNDSAKYYLDSLDRIGAADYQPTEQDILRT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 RVPTTGIIEYPFDLENIIFRMVDVGGQRSERRKWIHCFESVTSIIFLVALSEYDQVLAEC
:: ::::.: : ..:. ::. :::::::::.:::::::.::.::: :::: ::::: :
CCDS10 RVKTTGIVETHFTFKNLHFRLFDVGGQRSERKKWIHCFEDVTAIIFCVALSGYDQVLHED
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 DNENRMEESKALFKTIITYPWFLNSSVILFLNKKDLLEEKIMYSHLISYFPEYTGPKQDV
.. :::.:: :: .: . .:...:.:::::::::. ::: : : :::::::.
CCDS10 ETTNRMHESLMLFDSICNNKFFIDTSIILFLNKKDLFGEKIKKSPLTICFPEYTGPNTYE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 RAARDFILKLYQDQNPDKEKVIYSHFTCATDTDNIRFVFAAVKDTILQLNLREFNLV
:: .: ....: . .: :: :.::::::.::. :: :: : :. :::
CCDS10 DAAA-YIQAQFESKNRSPNKEIYCHMTCATDTNNIQVVFDAVTDIIIANNLRGCGLY
300 310 320 330 340 350
>>CCDS2813.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 (355 aa)
initn: 1119 init1: 838 opt: 1140 Z-score: 1319.5 bits: 252.7 E(32554): 3.5e-67
Smith-Waterman score: 1140; 50.4% identity (77.3% similar) in 353 aa overlap (5-354:3-354)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MAGCCCLSAEEKESQRISAEIERQLRRDKKDARRELKLLLLGTGESGKSTFIKQMRIIHG
: .:::.: . . : :...::.: . : ::.::::::.:::::::..:::.:::
CCDS28 MGCTVSAEDKAAAERSKMIDKNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE3 SGYSDEDRKGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMDTLRIQYVCEQNKENAQIIREVE--VDKVS
.:::.:. . . .::.: . ...:...:: .:.:... . ..:. . . ... .
CCDS28 DGYSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMGNLQIDFADPSRADDARQLFALSCTAEEQG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 MLSREQVEAIKQLWQDPGIQECYDRRREYQLSDSAKYYLTDIDRIATPSFVPTQQDVLRV
.: . .:..:: : :.: :. : :::::.::: :::.:..::: ...::::::::.
CCDS28 VLPDDLSGVIRRLWADHGVQACFGRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 RVPTTGIIEYPFDLENIIFRMVDVGGQRSERRKWIHCFESVTSIIFLVALSEYDQVLAEC
:: ::::.: : .... :.: :::::::::.:::::::.::.::: :::: :: ::::
CCDS28 RVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAED
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 DNENRMEESKALFKTIITYPWFLNSSVILFLNKKDLLEEKIMYSHLISYFPEYTGPKQDV
.. :::.:: :: .: . :: ..:.:::::::::.:::: .: : :::::: ..
CCDS28 EEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 RAARDFILKLYQDQNPDKE-KVIYSHFTCATDTDNIRFVFAAVKDTILQLNLREFNLV
.:: ..: . ..: : :. : ::.:::::::: :..::: :: :.:.. ::.. .:
CCDS28 EAA-SYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF
300 310 320 330 340 350
>>CCDS47625.1 GNAT3 gene_id:346562|Hs108|chr7 (354 aa)
initn: 1113 init1: 812 opt: 1114 Z-score: 1289.6 bits: 247.1 E(32554): 1.7e-65
Smith-Waterman score: 1114; 50.0% identity (77.7% similar) in 350 aa overlap (7-354:5-353)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MAGCCCLSAEEKESQRISAEIERQLRRDKKDARRELKLLLLGTGESGKSTFIKQMRIIHG
.:.: ::: . : :.:..:..: . : .::::::.:::::::..:::.:::
CCDS47 MGSGISSESKESAKRSKELEKKLQEDAERDARTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE3 SGYSDEDRKGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMDTLRIQYVCEQNKENA-QIIREVEVDKVSM
.:::... : ..:.: . .. :...:: :: :.:: .. :. :. ... . .
CCDS47 NGYSEQECMEFKAVIYSNTLQSILAIVKAMTTLGIDYVNPRSAEDQRQLYAMANTLEDGG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 LSREQVEAIKQLWQDPGIQECYDRRREYQLSDSAKYYLTDIDRIATPSFVPTQQDVLRVR
.. . .:.::.::.::::: :..: ::::.::: :::.:.:::.. ..::..::::. :
CCDS47 MTPQLAEVIKRLWRDPGIQACFERASEYQLNDSAAYYLNDLDRITASGYVPNEQDVLHSR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 VPTTGIIEYPFDLENIIFRMVDVGGQRSERRKWIHCFESVTSIIFLVALSEYDQVLAECD
: :::::: :..... ::: :::::::::.:::::::.:: ::: .::: ::.::.: .
CCDS47 VKTTGIIETQFSFKDLHFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 NENRMEESKALFKTIITYPWFLNSSVILFLNKKDLLEEKIMYSHLISYFPEYTGPKQDVR
. :::.:: ::..: .. .: ..:..:::::::...::. :: :::::::. .
CCDS47 EVNRMHESLHLFNSICNHKYFSTTSIVLFLNKKDIFQEKVTKVHLSICFPEYTGPNT-FE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 AARDFILKLYQDQNPDKE-KVIYSHFTCATDTDNIRFVFAAVKDTILQLNLREFNLV
: ..: . . : : :: : ::::.::::::.:..::: :: : :.. ::.. .:
CCDS47 DAGNYIKNQFLDLNLKKEDKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
300 310 320 330 340 350
355 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 00:25:56 2016 done: Mon Nov 7 00:25:57 2016
Total Scan time: 2.530 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]