FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3641, 503 aa
1>>>pF1KE3641 503 - 503 aa - 503 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8928+/-0.00035; mu= 16.0645+/- 0.022
mean_var=94.5691+/-19.109, 0's: 0 Z-trim(116.4): 10 B-trim: 171 in 1/55
Lambda= 0.131886
statistics sampled from 27551 (27560) to 27551 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.323), width: 16
Scan time: 10.300
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001136027 (OMIM: 615567,615573) aarF domain-con ( 503) 3458 668.3 1.4e-191
NP_079152 (OMIM: 615567,615573) aarF domain-contai ( 544) 2587 502.6 1.1e-141
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XP_011542543 (OMIM: 606980,612016) PREDICTED: atyp ( 647) 1518 299.3 2.2e-80
XP_011542541 (OMIM: 606980,612016) PREDICTED: atyp ( 647) 1518 299.3 2.2e-80
NP_064632 (OMIM: 606980,612016) atypical kinase AD ( 647) 1518 299.3 2.2e-80
XP_011542542 (OMIM: 606980,612016) PREDICTED: atyp ( 647) 1518 299.3 2.2e-80
XP_011542540 (OMIM: 606980,612016) PREDICTED: atyp ( 647) 1518 299.3 2.2e-80
XP_005273258 (OMIM: 606980,612016) PREDICTED: atyp ( 647) 1518 299.3 2.2e-80
>>NP_001136027 (OMIM: 615567,615573) aarF domain-contain (503 aa)
initn: 3458 init1: 3458 opt: 3458 Z-score: 3560.5 bits: 668.3 E(85289): 1.4e-191
Smith-Waterman score: 3458; 100.0% identity (100.0% similar) in 503 aa overlap (1-503:1-503)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MWLKVGGLLRGTGGQLGQTVGWPCGALGPGPHRWGPCGGSWAQKFYQDGPGRGLGEEDIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MWLKVGGLLRGTGGQLGQTVGWPCGALGPGPHRWGPCGGSWAQKFYQDGPGRGLGEEDIR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 RAREARPRKTPRPQLSDRSRERKVPASRISRLANFGGLAVGLGLGVLAEMAKKSMPGGRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RAREARPRKTPRPQLSDRSRERKVPASRISRLANFGGLAVGLGLGVLAEMAKKSMPGGRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 QSDNSFISPQLQHIFERVRQSADFMPRWQMLRVLEEELGRDWQAKVASLEEVPFAAASIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QSDNSFISPQLQHIFERVRQSADFMPRWQMLRVLEEELGRDWQAKVASLEEVPFAAASIG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 QVHQGLLRDGTEVAVKIQYPGIAQSIQSDVQNLLAVLKMSAALPAGLFAEQSLQALQQEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QVHQGLLRDGTEVAVKIQYPGIAQSIQSDVQNLLAVLKMSAALPAGLFAEQSLQALQQEL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 AWECDYRREAACAQNFRQLLANDPFFRVPAVVKELCTTRVLGMELAGGVPLDQCQGLSQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AWECDYRREAACAQNFRQLLANDPFFRVPAVVKELCTTRVLGMELAGGVPLDQCQGLSQD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LRNQICFQLLTLCLRELFEFRFMQTDPNWANFLYDASSHQVTLLDFGASREFGTEFTDHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LRNQICFQLLTLCLRELFEFRFMQTDPNWANFLYDASSHQVTLLDFGASREFGTEFTDHY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 IEVVKAAADGDRDCVLQKSRDLKFLTGFETKAFSDAHVEAVMILGEPFATQGPYDFGSGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IEVVKAAADGDRDCVLQKSRDLKFLTGFETKAFSDAHVEAVMILGEPFATQGPYDFGSGE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 TARRIQDLIPVLLRHRLCPPPEETYALHRKLAGAFLACAHLRAHIACRDLFQDTYHRYWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TARRIQDLIPVLLRHRLCPPPEETYALHRKLAGAFLACAHLRAHIACRDLFQDTYHRYWA
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KE3 SRQPDAATAGSLPTKGDSWVDPS
:::::::::::::::::::::::
NP_001 SRQPDAATAGSLPTKGDSWVDPS
490 500
>>NP_079152 (OMIM: 615567,615573) aarF domain-containing (544 aa)
initn: 2586 init1: 2586 opt: 2587 Z-score: 2664.4 bits: 502.6 E(85289): 1.1e-141
Smith-Waterman score: 3302; 92.3% identity (92.3% similar) in 535 aa overlap (10-503:10-544)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MWLKVGGLLRGTGGQLGQTVGWPCGALGPGPHRWGPCGGSWAQKFYQDGPGRGLGEEDIR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 MWLKVGGLLRGTGGQLGQTVGWPCGALGPGPHRWGPCGGSWAQKFYQDGPGRGLGEEDIR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 RAREARPRKTPRPQLSDRSRERKVPASRISRLANFGGLAVGLGLGVLAEMAKKSMPGGRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 RAREARPRKTPRPQLSDRSRERKVPASRISRLANFGGLAVGLGLGVLAEMAKKSMPGGRL
70 80 90 100 110 120
130
pF1KE3 QS-----------------------------------------DNSFISPQLQHIFERVR
:: :::::::::::::::::
NP_079 QSEGGSGLDSSPFLSEANAERIVQTLCTVRGAALKVGQMLSIQDNSFISPQLQHIFERVR
130 140 150 160 170 180
140 150 160 170 180 190
pF1KE3 QSADFMPRWQMLRVLEEELGRDWQAKVASLEEVPFAAASIGQVHQGLLRDGTEVAVKIQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 QSADFMPRWQMLRVLEEELGRDWQAKVASLEEVPFAAASIGQVHQGLLRDGTEVAVKIQY
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240 250
pF1KE3 PGIAQSIQSDVQNLLAVLKMSAALPAGLFAEQSLQALQQELAWECDYRREAACAQNFRQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 PGIAQSIQSDVQNLLAVLKMSAALPAGLFAEQSLQALQQELAWECDYRREAACAQNFRQL
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 LANDPFFRVPAVVKELCTTRVLGMELAGGVPLDQCQGLSQDLRNQICFQLLTLCLRELFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 LANDPFFRVPAVVKELCTTRVLGMELAGGVPLDQCQGLSQDLRNQICFQLLTLCLRELFE
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KE3 FRFMQTDPNWANFLYDASSHQVTLLDFGASREFGTEFTDHYIEVVKAAADGDRDCVLQKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 FRFMQTDPNWANFLYDASSHQVTLLDFGASREFGTEFTDHYIEVVKAAADGDRDCVLQKS
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420 430
pF1KE3 RDLKFLTGFETKAFSDAHVEAVMILGEPFATQGPYDFGSGETARRIQDLIPVLLRHRLCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 RDLKFLTGFETKAFSDAHVEAVMILGEPFATQGPYDFGSGETARRIQDLIPVLLRHRLCP
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470 480 490
pF1KE3 PPEETYALHRKLAGAFLACAHLRAHIACRDLFQDTYHRYWASRQPDAATAGSLPTKGDSW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 PPEETYALHRKLAGAFLACAHLRAHIACRDLFQDTYHRYWASRQPDAATAGSLPTKGDSW
490 500 510 520 530 540
500
pF1KE3 VDPS
::::
NP_079 VDPS
>>XP_016857341 (OMIM: 606980,612016) PREDICTED: atypical (647 aa)
initn: 1740 init1: 1505 opt: 1518 Z-score: 1564.0 bits: 299.3 E(85289): 2.2e-80
Smith-Waterman score: 1718; 52.3% identity (76.1% similar) in 514 aa overlap (14-483:132-644)
10 20 30 40
pF1KE3 MWLKVGGLLRGTGGQLGQTVGWPCGALGPGPHRWGPCGGSWAQ
:: .. .: : : .:. : .
XP_016 SAPPSLGHAHSEGPAPAYVASGPFREAGFPGQASSPLGRANGRLFANPRDSFSAMGFQRR
110 120 130 140 150 160
50 60 70 80 90
pF1KE3 KFYQD-GPGRGLGEEDIRRAREARPR---KTPRPQLSDRSRERKVPASRISRLANFGGLA
:.:: .: :: :::..::.:. : : . ::...::::::..::.:::::::::
XP_016 FFHQDQSPVGGLTAEDIEKARQAKARPENKQHKQTLSEHARERKVPVTRIGRLANFGGLA
170 180 190 200 210 220
100 110 120
pF1KE3 VGLGLGVLAEMAKKSM----PGGR---LQS------------------------------
::::.:.:::.::::. :.:. : :
XP_016 VGLGFGALAEVAKKSLRSEDPSGKKAVLGSSPFLSEANAERIVRTLCKVRGAALKLGQML
230 240 250 260 270 280
130 140 150 160 170
pF1KE3 ---DNSFISPQLQHIFERVRQSADFMPRWQMLRVLEEELGRDWQAKVASLEEVPFAAASI
:..::.:.: .::::::::::::: ::...:...:: .:. :. .:: :::::::
XP_016 SIQDDAFINPHLAKIFERVRQSADFMPLKQMMKTLNNDLGPNWRDKLEYFEERPFAAASI
290 300 310 320 330 340
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 GQVHQGLLRDGTEVAVKIQYPGIAQSIQSDVQNLLAVLKMSAALPAGLFAEQSLQALQQE
:::: . .. : :::.::::::.::::.:::.::.:::.:: :: ::: :. ...:..:
XP_016 GQVHLARMKGGREVAMKIQYPGVAQSINSDVNNLMAVLNMSNMLPEGLFPEHLIDVLRRE
350 360 370 380 390 400
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 LAWECDYRREAACAQNFRQLLANDPFFRVPAVVKELCTTRVLGMELAGGVPLDQCQGLSQ
:: ::::.::::::..::.:: . ::: :: .: :::. .:: ::..: :::: .::::
XP_016 LALECDYQREAACARKFRDLLKGHPFFYVPEIVDELCSPHVLTTELVSGFPLDQAEGLSQ
410 420 430 440 450 460
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 DLRNQICFQLLTLCLRELFEFRFMQTDPNWANFLYDASSHQVTLLDFGASREFGTEFTDH
..::.::...:.:::::::::.::::::::.::.:: ..:.:.::::::.::. :::
XP_016 EIRNEICYNILVLCLRELFEFHFMQTDPNWSNFFYDPQQHKVALLDFGATREYDRSFTDL
470 480 490 500 510 520
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 YIEVVKAAADGDRDCVLQKSRDLKFLTGFETKAFSDAHVEAVMILGEPFATQGPYDFGSG
::....:::: ::. : :: ..:::::.:.:.. :::..:..:::: ::.. :.:::.
XP_016 YIQIIRAAADRDRETVRAKSIEMKFLTGYEVKVMEDAHLDAILILGEAFASDEPFDFGTQ
530 540 550 560 570 580
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 ETARRIQDLIPVLLRHRLCPPPEETYALHRKLAGAFLACAHLRAHIACRDLFQDTYHRYW
:...:..::::.::::: :::::::.::::..:.:: :..:.:.. :. .:...: :
XP_016 STTEKIHNLIPVMLRHRLVPPPEETYSLHRKMGGSFLICSKLKARFPCKAMFEEAYSNY-
590 600 610 620 630 640
480 490 500
pF1KE3 ASRQPDAATAGSLPTKGDSWVDPS
.::
XP_016 CKRQAQQ
>>XP_011542543 (OMIM: 606980,612016) PREDICTED: atypical (647 aa)
initn: 1740 init1: 1505 opt: 1518 Z-score: 1564.0 bits: 299.3 E(85289): 2.2e-80
Smith-Waterman score: 1718; 52.3% identity (76.1% similar) in 514 aa overlap (14-483:132-644)
10 20 30 40
pF1KE3 MWLKVGGLLRGTGGQLGQTVGWPCGALGPGPHRWGPCGGSWAQ
:: .. .: : : .:. : .
XP_011 SAPPSLGHAHSEGPAPAYVASGPFREAGFPGQASSPLGRANGRLFANPRDSFSAMGFQRR
110 120 130 140 150 160
50 60 70 80 90
pF1KE3 KFYQD-GPGRGLGEEDIRRAREARPR---KTPRPQLSDRSRERKVPASRISRLANFGGLA
:.:: .: :: :::..::.:. : : . ::...::::::..::.:::::::::
XP_011 FFHQDQSPVGGLTAEDIEKARQAKARPENKQHKQTLSEHARERKVPVTRIGRLANFGGLA
170 180 190 200 210 220
100 110 120
pF1KE3 VGLGLGVLAEMAKKSM----PGGR---LQS------------------------------
::::.:.:::.::::. :.:. : :
XP_011 VGLGFGALAEVAKKSLRSEDPSGKKAVLGSSPFLSEANAERIVRTLCKVRGAALKLGQML
230 240 250 260 270 280
130 140 150 160 170
pF1KE3 ---DNSFISPQLQHIFERVRQSADFMPRWQMLRVLEEELGRDWQAKVASLEEVPFAAASI
:..::.:.: .::::::::::::: ::...:...:: .:. :. .:: :::::::
XP_011 SIQDDAFINPHLAKIFERVRQSADFMPLKQMMKTLNNDLGPNWRDKLEYFEERPFAAASI
290 300 310 320 330 340
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 GQVHQGLLRDGTEVAVKIQYPGIAQSIQSDVQNLLAVLKMSAALPAGLFAEQSLQALQQE
:::: . .. : :::.::::::.::::.:::.::.:::.:: :: ::: :. ...:..:
XP_011 GQVHLARMKGGREVAMKIQYPGVAQSINSDVNNLMAVLNMSNMLPEGLFPEHLIDVLRRE
350 360 370 380 390 400
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 LAWECDYRREAACAQNFRQLLANDPFFRVPAVVKELCTTRVLGMELAGGVPLDQCQGLSQ
:: ::::.::::::..::.:: . ::: :: .: :::. .:: ::..: :::: .::::
XP_011 LALECDYQREAACARKFRDLLKGHPFFYVPEIVDELCSPHVLTTELVSGFPLDQAEGLSQ
410 420 430 440 450 460
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pF1KE3 DLRNQICFQLLTLCLRELFEFRFMQTDPNWANFLYDASSHQVTLLDFGASREFGTEFTDH
..::.::...:.:::::::::.::::::::.::.:: ..:.:.::::::.::. :::
XP_011 EIRNEICYNILVLCLRELFEFHFMQTDPNWSNFFYDPQQHKVALLDFGATREYDRSFTDL
470 480 490 500 510 520
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pF1KE3 YIEVVKAAADGDRDCVLQKSRDLKFLTGFETKAFSDAHVEAVMILGEPFATQGPYDFGSG
::....:::: ::. : :: ..:::::.:.:.. :::..:..:::: ::.. :.:::.
XP_011 YIQIIRAAADRDRETVRAKSIEMKFLTGYEVKVMEDAHLDAILILGEAFASDEPFDFGTQ
530 540 550 560 570 580
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pF1KE3 ETARRIQDLIPVLLRHRLCPPPEETYALHRKLAGAFLACAHLRAHIACRDLFQDTYHRYW
:...:..::::.::::: :::::::.::::..:.:: :..:.:.. :. .:...: :
XP_011 STTEKIHNLIPVMLRHRLVPPPEETYSLHRKMGGSFLICSKLKARFPCKAMFEEAYSNY-
590 600 610 620 630 640
480 490 500
pF1KE3 ASRQPDAATAGSLPTKGDSWVDPS
.::
XP_011 CKRQAQQ
>>XP_011542541 (OMIM: 606980,612016) PREDICTED: atypical (647 aa)
initn: 1740 init1: 1505 opt: 1518 Z-score: 1564.0 bits: 299.3 E(85289): 2.2e-80
Smith-Waterman score: 1718; 52.3% identity (76.1% similar) in 514 aa overlap (14-483:132-644)
10 20 30 40
pF1KE3 MWLKVGGLLRGTGGQLGQTVGWPCGALGPGPHRWGPCGGSWAQ
:: .. .: : : .:. : .
XP_011 SAPPSLGHAHSEGPAPAYVASGPFREAGFPGQASSPLGRANGRLFANPRDSFSAMGFQRR
110 120 130 140 150 160
50 60 70 80 90
pF1KE3 KFYQD-GPGRGLGEEDIRRAREARPR---KTPRPQLSDRSRERKVPASRISRLANFGGLA
:.:: .: :: :::..::.:. : : . ::...::::::..::.:::::::::
XP_011 FFHQDQSPVGGLTAEDIEKARQAKARPENKQHKQTLSEHARERKVPVTRIGRLANFGGLA
170 180 190 200 210 220
100 110 120
pF1KE3 VGLGLGVLAEMAKKSM----PGGR---LQS------------------------------
::::.:.:::.::::. :.:. : :
XP_011 VGLGFGALAEVAKKSLRSEDPSGKKAVLGSSPFLSEANAERIVRTLCKVRGAALKLGQML
230 240 250 260 270 280
130 140 150 160 170
pF1KE3 ---DNSFISPQLQHIFERVRQSADFMPRWQMLRVLEEELGRDWQAKVASLEEVPFAAASI
:..::.:.: .::::::::::::: ::...:...:: .:. :. .:: :::::::
XP_011 SIQDDAFINPHLAKIFERVRQSADFMPLKQMMKTLNNDLGPNWRDKLEYFEERPFAAASI
290 300 310 320 330 340
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 GQVHQGLLRDGTEVAVKIQYPGIAQSIQSDVQNLLAVLKMSAALPAGLFAEQSLQALQQE
:::: . .. : :::.::::::.::::.:::.::.:::.:: :: ::: :. ...:..:
XP_011 GQVHLARMKGGREVAMKIQYPGVAQSINSDVNNLMAVLNMSNMLPEGLFPEHLIDVLRRE
350 360 370 380 390 400
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 LAWECDYRREAACAQNFRQLLANDPFFRVPAVVKELCTTRVLGMELAGGVPLDQCQGLSQ
:: ::::.::::::..::.:: . ::: :: .: :::. .:: ::..: :::: .::::
XP_011 LALECDYQREAACARKFRDLLKGHPFFYVPEIVDELCSPHVLTTELVSGFPLDQAEGLSQ
410 420 430 440 450 460
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pF1KE3 DLRNQICFQLLTLCLRELFEFRFMQTDPNWANFLYDASSHQVTLLDFGASREFGTEFTDH
..::.::...:.:::::::::.::::::::.::.:: ..:.:.::::::.::. :::
XP_011 EIRNEICYNILVLCLRELFEFHFMQTDPNWSNFFYDPQQHKVALLDFGATREYDRSFTDL
470 480 490 500 510 520
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pF1KE3 YIEVVKAAADGDRDCVLQKSRDLKFLTGFETKAFSDAHVEAVMILGEPFATQGPYDFGSG
::....:::: ::. : :: ..:::::.:.:.. :::..:..:::: ::.. :.:::.
XP_011 YIQIIRAAADRDRETVRAKSIEMKFLTGYEVKVMEDAHLDAILILGEAFASDEPFDFGTQ
530 540 550 560 570 580
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 ETARRIQDLIPVLLRHRLCPPPEETYALHRKLAGAFLACAHLRAHIACRDLFQDTYHRYW
:...:..::::.::::: :::::::.::::..:.:: :..:.:.. :. .:...: :
XP_011 STTEKIHNLIPVMLRHRLVPPPEETYSLHRKMGGSFLICSKLKARFPCKAMFEEAYSNY-
590 600 610 620 630 640
480 490 500
pF1KE3 ASRQPDAATAGSLPTKGDSWVDPS
.::
XP_011 CKRQAQQ
>>NP_064632 (OMIM: 606980,612016) atypical kinase ADCK3, (647 aa)
initn: 1740 init1: 1505 opt: 1518 Z-score: 1564.0 bits: 299.3 E(85289): 2.2e-80
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10 20 30 40
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60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]