Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3562
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3562, 450 aa
1>>>pF1KE3562 450 - 450 aa - 450 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2288+/-0.00115; mu= 15.0338+/- 0.069
mean_var=169.2565+/-35.685, 0's: 0 Z-trim(107.4): 136 B-trim: 2 in 1/49
Lambda= 0.098583
statistics sampled from 9427 (9572) to 9427 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.664), E-opt: 0.2 (0.294), width: 16
Scan time: 2.700
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS60929.1 TRIM77 gene_id:390231|Hs108|chr11 ( 450) 3135 458.6 6e-129
CCDS2015.1 TRIM43 gene_id:129868|Hs108|chr2 ( 446) 1473 222.2 8.6e-58
CCDS55762.1 TRIM49B gene_id:283116|Hs108|chr11 ( 452) 1234 188.2 1.5e-47
CCDS73287.1 TRIM64C gene_id:646754|Hs108|chr11 ( 450) 1222 186.5 4.8e-47
CCDS53694.1 TRIM49C gene_id:642612|Hs108|chr11 ( 452) 1218 185.9 7.2e-47
CCDS8287.1 TRIM49 gene_id:57093|Hs108|chr11 ( 452) 1218 185.9 7.2e-47
CCDS73363.1 TRIM64 gene_id:120146|Hs108|chr11 ( 449) 1208 184.5 1.9e-46
CCDS53693.1 TRIM64B gene_id:642446|Hs108|chr11 ( 449) 1204 183.9 2.8e-46
CCDS60930.1 TRIM49D1 gene_id:399939|Hs108|chr11 ( 452) 1174 179.7 5.5e-45
CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11 ( 475) 686 110.3 4.4e-24
CCDS3851.1 TRIML1 gene_id:339976|Hs108|chr4 ( 468) 681 109.6 7.2e-24
CCDS1636.1 TRIM58 gene_id:25893|Hs108|chr1 ( 486) 648 104.9 1.9e-22
CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1 ( 468) 622 101.2 2.4e-21
CCDS34378.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 488) 580 95.2 1.6e-19
CCDS4568.1 TRIM38 gene_id:10475|Hs108|chr6 ( 465) 555 91.6 1.8e-18
CCDS3808.1 TRIM60 gene_id:166655|Hs108|chr4 ( 471) 510 85.2 1.5e-16
CCDS7947.2 TRIM48 gene_id:79097|Hs108|chr11 ( 224) 487 81.6 9.3e-16
CCDS31391.1 TRIM34 gene_id:53840|Hs108|chr11 ( 488) 476 80.4 4.4e-15
CCDS31388.1 TRIM34 gene_id:445372|Hs108|chr11 ( 842) 476 80.7 6.2e-15
CCDS5678.1 TRIM4 gene_id:89122|Hs108|chr7 ( 474) 436 74.7 2.2e-13
CCDS78121.1 RPP21 gene_id:202658|Hs108|chr6 ( 503) 406 70.5 4.5e-12
CCDS44327.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 ( 343) 397 69.0 8.6e-12
CCDS1571.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 ( 477) 397 69.2 1.1e-11
CCDS31392.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 326) 394 68.5 1.1e-11
CCDS31394.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 347) 394 68.6 1.2e-11
CCDS31393.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 493) 394 68.8 1.4e-11
CCDS4654.1 TRIM27 gene_id:5987|Hs108|chr6 ( 513) 391 68.4 2e-11
CCDS4678.1 TRIM26 gene_id:7726|Hs108|chr6 ( 539) 383 67.2 4.5e-11
>>CCDS60929.1 TRIM77 gene_id:390231|Hs108|chr11 (450 aa)
initn: 3135 init1: 3135 opt: 3135 Z-score: 2428.4 bits: 458.6 E(32554): 6e-129
Smith-Waterman score: 3135; 100.0% identity (100.0% similar) in 450 aa overlap (1-450:1-450)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MASAITQCSTSELTCSICTDYLTDPVTICCGHRFCSPCLCLLWEDTLTPNCCPVCREISQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MASAITQCSTSELTCSICTDYLTDPVTICCGHRFCSPCLCLLWEDTLTPNCCPVCREISQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 QMYFKRIIFAEKQVIPTRESVPCQLSSSAMLICRRHQEIKNLICETDRSLLCFLCSQSPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 QMYFKRIIFAEKQVIPTRESVPCQLSSSAMLICRRHQEIKNLICETDRSLLCFLCSQSPR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 HATHKHYMTREADEYYRKKLLIQMKSIWKKKQKNQRNLNRETNIIGTWEVFINLRSMMIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 HATHKHYMTREADEYYRKKLLIQMKSIWKKKQKNQRNLNRETNIIGTWEVFINLRSMMIS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 AEYPKVCQYLREEEQKHVESLAREGRIIFQQLKRSQTRMAKMGILLREMYEKLKEMSCKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 AEYPKVCQYLREEEQKHVESLAREGRIIFQQLKRSQTRMAKMGILLREMYEKLKEMSCKA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 DVNLPQDLGDVMKRNEFLRLAMPQPVNPQLSAWTITGVSERLNFFRVYITLDRKICSNHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 DVNLPQDLGDVMKRNEFLRLAMPQPVNPQLSAWTITGVSERLNFFRVYITLDRKICSNHK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LLFEDLRHLQCSLDDTDMSCNPTSTQYTSSWGAQILSSGKHYWEVDVKDSCNWVIGLCRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LLFEDLRHLQCSLDDTDMSCNPTSTQYTSSWGAQILSSGKHYWEVDVKDSCNWVIGLCRE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 AWTKRNDMRLDSEGIFLLLCLKVDDHFSLFSTSPLLPHYIPRPQGWLGVFLDYECGIVSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 AWTKRNDMRLDSEGIFLLLCLKVDDHFSLFSTSPLLPHYIPRPQGWLGVFLDYECGIVSF
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KE3 VNVAQSSLICSFLSRIFYFPLRPFICHGSK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 VNVAQSSLICSFLSRIFYFPLRPFICHGSK
430 440 450
>>CCDS2015.1 TRIM43 gene_id:129868|Hs108|chr2 (446 aa)
initn: 1477 init1: 973 opt: 1473 Z-score: 1151.0 bits: 222.2 E(32554): 8.6e-58
Smith-Waterman score: 1473; 48.1% identity (73.2% similar) in 451 aa overlap (1-450:1-446)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MASAITQCSTSELTCSICTDYLTDPVTICCGHRFCSPCLCLLWEDTLTPNCCPVCREISQ
: : ... .:::: :: .::.::::::::: :: ::::: ::.. .: ::.::: :
CCDS20 MDSDFSHAFQKELTCVICLNYLVDPVTICCGHSFCRPCLCLSWEEAQSPANCPACREPSP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 QMYFKRIIFAEKQVIPTRESVPCQLSSSAMLICRRHQEIKNLICETDRSLLCFLCSQSPR
.: :: :. .. : .:.. :. :: :: :.. :...:. :.::::.:::.: .
CCDS20 KMDFKTNILLKNLVTIARKASLWQFLSSEKQICGTHRQTKKMFCDMDKSLLCLLCSNSQE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 HATHKHYMTREADEYYRKKLLIQMKSIWKKKQKNQRNLNRETNIIGTWEVFINLRSMMIS
:..:::. .:: : .:.::: ::. .::: :.::::: .: :. . ::..::
CCDS20 HGAHKHHPIEEAAEEHREKLLKQMRILWKKIQENQRNLYEEGRTAFLWRGNVVLRAQMIR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 AEYPKVCQYLREEEQKHVESLAREGRIIFQQLKRSQTRMAKMGILLREMYEKLKEMSCKA
:: :. :..::..:.: : .: . :::::.:: ..: . . :.:::..: :: :
CCDS20 NEYRKLHPVLHKEEKQHLERLNKEYQEIFQQLQRSWVKMDQKSKHLKEMYQELMEMCHKP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 DVNLPQDLGDVMKRNEFLRLAMPQPVNPQLSAWTITGVSERLNFFRVYITLDRKICSNHK
::.: :::::.. :.: . : :::::::.:.: :::. ::: ::: :.. .. .::.
CCDS20 DVELLQDLGDIVARSESVLLHMPQPVNPELTAGPITGLVYRLNRFRVEISFHFEV-TNHN
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KE3 L-LFEDLRHLQCSLDDTDMSCNPTSTQYTSSWGAQILSSGKHYWEVDVKDSCNWVIGLCR
. ::::.: . : ..: ..:::...: ::::::.:: .::.:..:.:
CCDS20 IRLFEDVRSWMFRRGPL----NSDRSDYFAAWGARVFSFGKHYWELDVDNSCDWALGVCN
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 EAWTKRNDMRLDSEGIFLLLCLKVDDHFSLFSTSPLLPHYIPRPQGWLGVFLDYECGIVS
..: ..:. ..:: ::::::::::.::.:..:::..:::: .: : .:::::.: : ::
CCDS20 NSWIRKNSTMVNSEDIFLLLCLKVDNHFNLLTTSPVFPHYIEKPLGRVGVFLDFESGSVS
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450
pF1KE3 FVNVAQSSLICSFLSRIFYFPLRPFICHGSK
:.::..:::: :. . . ::.:::. : .
CCDS20 FLNVTKSSLIWSYPAGSLTFPVRPFFYTGHR
420 430 440
>>CCDS55762.1 TRIM49B gene_id:283116|Hs108|chr11 (452 aa)
initn: 1201 init1: 955 opt: 1234 Z-score: 967.2 bits: 188.2 E(32554): 1.5e-47
Smith-Waterman score: 1234; 44.2% identity (68.8% similar) in 448 aa overlap (1-446:1-448)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MASAITQCSTSELTCSICTDYLTDPVTICCGHRFCSPCLCLLWEDTLTPNCCPVCREISQ
: :.: : :: : :: .:. ::::: ::: :: ::. : :.:. : : . .
CCDS55 MNSGILQVFQRELICPICMNYFIDPVTIDCGHSFCRPCFYLNWKDSPFLVQCSECTKSTG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 QMYFKRIIFAEKQVIPTRESVPCQLSSSAMLICRRHQEIKNLICETDRSLLCFLCSQSPR
:. .: : .:.. .:. . :: .: :.: :...::.::::::.:::.: .
CCDS55 QINLKTNIHFKKMASLARKVSLWLFLSSEEQMCGTHRETKKMFCEVDRSLLCLLCSSSQE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 HATHKHYMTREADEYYRKKLLIQMKSIWKKKQKNQRNLNRETNIIGTWEVFINLRSMMIS
: :.: . : : ...::: .:.:.:.: .:.:::: ::. :. ..::: :
CCDS55 HRDHRHCPIESAAEEHQEKLLQKMQSLWEKACENHRNLNVETTRTRCWKDYVNLRLEAIR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 AEYPKVCQYLREEEQKHVESLAREGRIIFQQLKRSQTRMAKMGILLREMYEKLKEMSCKA
::: :. . .:::....: : ..:. ::..:. :...::. .:: :::.:.:: :
CCDS55 AEYQKMPAFHHEEEKHNLEMLKKKGKDIFHRLHLSKAKMAHRREILRGMYEELNEMCHKP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 DVNLPQDLGDVMKRNEFLRLAMPQPVNPQLSAWTITGVSERLNFFRVYITLDRKICSNHK
::.: : .::...:.: . : ::::.::.::: :::. .::: :::.::: .. ..
CCDS55 DVELLQAFGDILHRSESVLLHMPQPLNPELSAGPITGLRDRLNQFRVHITLHHEEANSDI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LLFEDLRHLQCSLDDTDMSCNPTSTQYTSSWGAQILSSGKHYWEVDVKDSCNWVIGLCRE
.: : :: . . : :. .. . .:::: ..:::.:::: : :: ::..:.:
CCDS55 FLCEILRSMCIGCDHQDVPYFTATPRSFLAWGAQTFTSGKYYWEVHVGDSWNWAFGVCNM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE3 AWTKRN-DMRLDSE-GIFLLLCLKVDDHFSLFSTSPLLPHYIPRPQGWLGVFLDYECGIV
: ..: . ..:.: :.::: :.: : . :::.::::: .::::: . .:.::: : :
CCDS55 YWKEKNQNEKIDGEDGLFLLGCVKNDIQRSLFTTSPLLLQYIPRPTSRVGLFLDCEAKTV
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450
pF1KE3 SFVNVAQSSLICSFLSRIFYFPLRPFICHGSK
:::.: ::::: .. . : ::::..:
CCDS55 SFVDVNQSSLIYTIPNCSFSPPLRPIFCCIHF
430 440 450
>>CCDS73287.1 TRIM64C gene_id:646754|Hs108|chr11 (450 aa)
initn: 1215 init1: 1072 opt: 1222 Z-score: 958.0 bits: 186.5 E(32554): 4.8e-47
Smith-Waterman score: 1222; 40.8% identity (69.0% similar) in 449 aa overlap (1-448:1-448)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MASAITQCSTSELTCSICTDYLTDPVTICCGHRFCSPCLCLLWEDTLTPNCCPVCREISQ
: : . .:: : ::..:. :::: : : :: ::::: :. .: ::.::.::.
CCDS73 MDSDTLRVFQNELICCICVNYFIDPVTTDCVHSFCRPCLCLCSEEGRAPMRCPLCRKISE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 QMYFKRIIFAEKQVIPTRESVPCQLSSSAMLICRRHQEIKNLICETDRSLLCFLCSQSPR
. :. . .: . .:.. : ...:: :: :.: :.:.::.:. ::: ::.::.
CCDS73 KPNFNTNVALKKLASLARQTRPQNINSSDN-ICVLHEETKELFCEADKRLLCGPCSESPE
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE3 HATHKHY-MTREADEYYRKKLLIQMKSIWKKKQKNQRNLNRETNIIGTWEVFINLRSMMI
: .:.: . :.: .::. .: .:: .:..: :::.::. . . ...::...:
CCDS73 HMAHSHSPIGWAAEECRVQKLIKEMDYLWKINQETQNNLNQETSKFCSLVDYVSLRKVII
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 SAEYPKVCQYLREEEQKHVESLAREGRIIFQQLKRSQTRMAKMGILLREMYEKLKEMSCK
. .: :. .: ::::.:...: ::.. .::::. ::.::.. ...::..: :
CCDS73 TIQYQKMHIFLDEEEQRHLQALEREAKELFQQLQDSQVRMTQHLEGMKDMYRELWETYHM
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 ADVNLPQDLGDVMKRNEFLRLAMPQPVNPQLSAWTITGVSERLNFFRVYITLDRKICSNH
::.: ::.:.. :... .. ::::::.:..: :::: . :: ::: .:. .. .
CCDS73 PDVELLQDVGNISARTDLAQMPKPQPVNPELTSWCITGVLDMLNNFRVDNALSTEMTPCY
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 KLLFEDLRHLQCSLDDTDMSCNPTSTQYTSSWGAQILSSGKHYWEVDVKDSCNWVIGLCR
: ::.:.. . : . .: ... . : :: ..:::::::::: : ::..:.::
CCDS73 ISLSEDVRRVIFGDDHRSAPMDPQGVESFAVWCAQAFTSGKHYWEVDVTHSSNWILGVCR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 EAWTKRNDMRLDSEGIFLLLCLKVDDHFSLFSTSPLLPHYIPRPQGWLGVFLDYECGIVS
.. : ... .::. :. . :...:.:: ..:: : .:. :: ::.::::::. : ::
CCDS73 DSRTADTNIVIDSDKTFFSISSKTSNHYSLSTNSPPLIQYVQRPLGWVGVFLDYDNGSVS
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450
pF1KE3 FVNVAQSSLICSFLSRIFYFPLRPFICHGSK
: .:...::: .: : :::::.: :
CCDS73 FFDVSKGSLIYGFPPSSFSSPLRPFFCFGCT
420 430 440 450
>>CCDS53694.1 TRIM49C gene_id:642612|Hs108|chr11 (452 aa)
initn: 1223 init1: 960 opt: 1218 Z-score: 954.9 bits: 185.9 E(32554): 7.2e-47
Smith-Waterman score: 1218; 43.3% identity (69.0% similar) in 448 aa overlap (1-446:1-448)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MASAITQCSTSELTCSICTDYLTDPVTICCGHRFCSPCLCLLWEDTLTPNCCPVCREISQ
: :.: : .:: : .: .:. ::::: ::: :: ::. : :.: : : . ..
CCDS53 MNSGILQVFQGELICPLCMNYFIDPVTIDCGHSFCRPCFYLNWQDIPFLVQCSECTKSTE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 QMYFKRIIFAEKQVIPTRESVPCQLSSSAMLICRRHQEIKNLICETDRSLLCFLCSQSPR
:. .: : .:.. .:. . :: .: :.: :...::.::::::.:::.: .
CCDS53 QINLKTNIHLKKMASLARKVSLWLFLSSEEQMCGTHRETKKIFCEVDRSLLCLLCSSSQE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 HATHKHYMTREADEYYRKKLLIQMKSIWKKKQKNQRNLNRETNIIGTWEVFINLRSMMIS
: :.: . : : .:.::: .:.:.:.: .:.:::: ::. :. ..::: :
CCDS53 HRYHRHRPIEWAAEEHREKLLQKMQSLWEKACENHRNLNVETTRTRCWKDYVNLRLEAIR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 AEYPKVCQYLREEEQKHVESLAREGRIIFQQLKRSQTRMAKMGILLREMYEKLKEMSCKA
::: :. . .:::....: : ..:. ::..:. :...::. .:: :::.:.:: :
CCDS53 AEYQKMPAFHHEEEKHNLEMLKKKGKEIFHRLHLSKAKMAHRMEILRGMYEELNEMCHKP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 DVNLPQDLGDVMKRNEFLRLAMPQPVNPQLSAWTITGVSERLNFFRVYITLDRKICSNHK
::.: : .::...:.: . : ::::.::.::: :::. .::: :::.::: .. ..
CCDS53 DVELLQAFGDILHRSESVLLHMPQPLNPELSAGPITGLRDRLNQFRVHITLHHEEANSDI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LLFEDLRHLQCSLDDTDMSCNPTSTQYTSSWGAQILSSGKHYWEVDVKDSCNWVIGLCRE
.:.: :: . . : :. .. . .::.: ..:::.:::: : :: ::..:.:
CCDS53 FLYEILRSMCIGCDHQDVPYFTATPRSFLAWGVQTFTSGKYYWEVHVGDSWNWAFGVCNM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE3 AWTKRN-DMRLDS-EGIFLLLCLKVDDHFSLFSTSPLLPHYIPRPQGWLGVFLDYECGIV
..: . ..:. ::.::: :.: : . :::.::::. .:::.: . .:.::: : :
CCDS53 YRKEKNQNEKIDGKEGLFLLGCIKNDIQCSLFTTSPLMLQYIPKPTSRVGLFLDCEAKTV
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450
pF1KE3 SFVNVAQSSLICSFLSRIFYFPLRPFICHGSK
:::.: ::::: .. . : ::::..:
CCDS53 SFVDVNQSSLIYTIPNCSFSPPLRPIFCCIHF
430 440 450
>>CCDS8287.1 TRIM49 gene_id:57093|Hs108|chr11 (452 aa)
initn: 1212 init1: 966 opt: 1218 Z-score: 954.9 bits: 185.9 E(32554): 7.2e-47
Smith-Waterman score: 1218; 43.3% identity (69.0% similar) in 448 aa overlap (1-446:1-448)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MASAITQCSTSELTCSICTDYLTDPVTICCGHRFCSPCLCLLWEDTLTPNCCPVCREISQ
: :.: : .:: : .: .:. ::::: ::: :: ::. : :.: : : . ..
CCDS82 MNSGILQVFQGELICPLCMNYFIDPVTIDCGHSFCRPCFYLNWQDIPFLVQCSECTKSTE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 QMYFKRIIFAEKQVIPTRESVPCQLSSSAMLICRRHQEIKNLICETDRSLLCFLCSQSPR
:. .: : .:.. .:. . :: .: :.: :...::.::::::.:::.: .
CCDS82 QINLKTNIHLKKMASLARKVSLWLFLSSEEQMCGTHRETKKIFCEVDRSLLCLLCSSSQE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 HATHKHYMTREADEYYRKKLLIQMKSIWKKKQKNQRNLNRETNIIGTWEVFINLRSMMIS
: :.: . : : .:.::: .:.:.:.: .:.:::: ::. :. ..::: :
CCDS82 HRYHRHRPIEWAAEEHREKLLQKMQSLWEKACENHRNLNVETTRTRCWKDYVNLRLEAIR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 AEYPKVCQYLREEEQKHVESLAREGRIIFQQLKRSQTRMAKMGILLREMYEKLKEMSCKA
::: :. . .:::....: : ..:. ::..:. :...::. .:: :::.:.:: :
CCDS82 AEYQKMPAFHHEEEKHNLEMLKKKGKEIFHRLHLSKAKMAHRMEILRGMYEELNEMCHKP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 DVNLPQDLGDVMKRNEFLRLAMPQPVNPQLSAWTITGVSERLNFFRVYITLDRKICSNHK
::.: : .::...:.: . : ::::.::.::: :::. .::: :::.::: .. .:
CCDS82 DVELLQAFGDILHRSESVLLHMPQPLNPELSAGPITGLRDRLNQFRVHITLHHEEANNDI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LLFEDLRHLQCSLDDTDMSCNPTSTQYTSSWGAQILSSGKHYWEVDVKDSCNWVIGLCRE
.:.: :: . . : :. .. . .::.: ..:::.:::: : :: ::..:.:
CCDS82 FLYEILRSMCIGCDHQDVPYFTATPRSFLAWGVQTFTSGKYYWEVHVGDSWNWAFGVCNM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE3 AWTKRN-DMRLDSE-GIFLLLCLKVDDHFSLFSTSPLLPHYIPRPQGWLGVFLDYECGIV
..: . ..:.. :.::: :.: : . :::.::::. .:::.: . .:.::: : :
CCDS82 YRKEKNQNEKIDGKAGLFLLGCVKNDIQCSLFTTSPLMLQYIPKPTSRVGLFLDCEAKTV
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450
pF1KE3 SFVNVAQSSLICSFLSRIFYFPLRPFICHGSK
:::.: ::::: .. . : ::::..:
CCDS82 SFVDVNQSSLIYTIPNCSFSPPLRPIFCCIHF
430 440 450
>>CCDS73363.1 TRIM64 gene_id:120146|Hs108|chr11 (449 aa)
initn: 1205 init1: 962 opt: 1208 Z-score: 947.3 bits: 184.5 E(32554): 1.9e-46
Smith-Waterman score: 1208; 41.2% identity (69.0% similar) in 449 aa overlap (1-448:1-447)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MASAITQCSTSELTCSICTDYLTDPVTICCGHRFCSPCLCLLWEDTLTPNCCPVCREISQ
: : : .:: : ::..:. ::::: ::: :: ::::: :. .: :: ::.::.
CCDS73 MDSDDLQVFQNELICCICVNYFIDPVTIDCGHSFCRPCLCLCSEEGRAPMRCPSCRKISE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 QMYFKRIIFAEKQVIPTRESVPCQLSSSAMLICRRHQEIKNLICETDRSLLCFLCSQSPR
. :. . .: .:.. : ...:: :: :.: :.:.::.:. ::: ::.::.
CCDS73 KPNFNTNVVLKKLSSLARQTRPQNINSSDN-ICVLHEETKELFCEADKRLLCGPCSESPE
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 HATHKHYMTREADEYYRKKLLIQMKSIWKKKQKNQRNLNRETNIIGTWEVFINLRSMMIS
: .:.: : : :.::. .: .:. .:... :::.:: . . . ....:. .:.
CCDS73 HMAHSHSPIGWAAEECREKLIKEMDYLWEINQETRNNLNQETRTFHSLKDYVSVRKRIIT
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 AEYPKVCQYLREEEQKHVESLAREGRIIFQQLKRSQTRMAKMGILLREMYEKLKEMSCKA
.: :. .: ::::.:...: ::.. .::::. ::.::.. ...::..: : .:..
CCDS73 IQYQKMPIFLDEEEQRHLQALEREAEELFQQLQDSQVRMTQHLERMKDMYRELWE-TCHV
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE3 -DVNLPQDLGDVMKRNEFLRLAMPQPVNPQLSAWTITGVSERLNFFRVYITLDRKICSNH
::.: ::. .: :... .. ::::::.:..: :::: . :: ::: .:. .. .
CCDS73 PDVELLQDVRNVSARTDLAQMQKPQPVNPELTSWCITGVLDMLNNFRVDSALSTEMIPCY
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 KLLFEDLRHLQCSLDDTDMSCNPTSTQYTSSWGAQILSSGKHYWEVDVKDSCNWVIGLCR
: ::.:.. . : . .: ... . :::: ..:::::::::: : ::..:.:.
CCDS73 ISLSEDVRYVIFGDDHLSAPTDPQGVDSFAVWGAQAFTSGKHYWEVDVTLSSNWILGVCQ
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 EAWTKRNDMRLDSEGIFLLLCLKVDDHFSLFSTSPLLPHYIPRPQGWLGVFLDYECGIVS
.. : .. .::. :.:. : ..:.:: ..:: : .:. :: : .::::::. : ::
CCDS73 DSRTADANFVIDSDERFFLISSKRSNHYSLSTNSPPLIQYVQRPLGQVGVFLDYDNGSVS
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450
pF1KE3 FVNVAQSSLICSFLSRIFYFPLRPFICHGSK
: .:...::: .: : :::::.: :
CCDS73 FFDVSKGSLIYGFPPSSFSSPLRPFFCFGCT
420 430 440
>>CCDS53693.1 TRIM64B gene_id:642446|Hs108|chr11 (449 aa)
initn: 1201 init1: 966 opt: 1204 Z-score: 944.2 bits: 183.9 E(32554): 2.8e-46
Smith-Waterman score: 1204; 41.1% identity (68.1% similar) in 448 aa overlap (1-448:1-447)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MASAITQCSTSELTCSICTDYLTDPVTICCGHRFCSPCLCLLWEDTLTPNCCPVCREISQ
: : : .:: : ::..:. ::::: ::: :: ::::: :. .: :: ::. :.
CCDS53 MDSDDLQVFQNELICCICVNYFIDPVTIDCGHSFCRPCLCLCSEEGRAPMRCPSCRKTSE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 QMYFKRIIFAEKQVIPTRESVPCQLSSSAMLICRRHQEIKNLICETDRSLLCFLCSQSPR
. :. . .: .:.. : ...:: :: :.: :.:.::.:. ::: ::.::.
CCDS53 KPNFNTNLVLKKLSSLARQTRPQNINSSDN-ICVLHEETKELFCEADKRLLCGPCSESPE
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 HATHKHYMTREADEYYRKKLLIQMKSIWKKKQKNQRNLNRETNIIGTWEVFINLRSMMIS
: .:.: : : :.::. .: .:. .:... :::.::. . . . ....:. .:.
CCDS53 HMAHSHSPIGWAAEECREKLIKEMDYLWEINQETRNNLNQETSTFHSLKDYVSVRKRIIT
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 AEYPKVCQYLREEEQKHVESLAREGRIIFQQLKRSQTRMAKMGILLREMYEKLKEMSCKA
.: :. .: ::::.:...: ::.. .::::. ::.::.. ...::..: :
CCDS53 IQYQKMPIFLDEEEQRHLQALEREAEELFQQLQDSQVRMTQHLERMKDMYRELWETCHMP
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 DVNLPQDLGDVMKRNEFLRLAMPQPVNPQLSAWTITGVSERLNFFRVYITLDRKICSNHK
:: : ::. .: :... .. ::::::.:..: :::: . :: ::: .:. .. .
CCDS53 DVVLLQDVRNVSARTDLAQMQKPQPVNPELTSWCITGVLDMLNNFRVDSALSTEMIPCYI
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LLFEDLRHLQCSLDDTDMSCNPTSTQYTSSWGAQILSSGKHYWEVDVKDSCNWVIGLCRE
: ::.:.. . : . .: ... . :::: ..:::::::::: : ::..:.::.
CCDS53 SLSEDVRYVIFGDDHLSAPTDPQGVDSFAVWGAQAFTSGKHYWEVDVTLSSNWILGVCRD
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 AWTKRNDMRLDSEGIFLLLCLKVDDHFSLFSTSPLLPHYIPRPQGWLGVFLDYECGIVSF
. : .. .::. :.:. : ..:.:: ..:: : .:. :: : .::::::. : :::
CCDS53 SRTADANFVIDSDERFFLISSKRSNHYSLSTNSPPLIQYVQRPLGRVGVFLDYDNGSVSF
360 370 380 390 400 410
430 440 450
pF1KE3 VNVAQSSLICSFLSRIFYFPLRPFICHGSK
.:...::: .: : :::::.: :
CCDS53 FDVSKGSLIYGFPPSSFSSPLRPFFCFGCT
420 430 440
>>CCDS60930.1 TRIM49D1 gene_id:399939|Hs108|chr11 (452 aa)
initn: 1176 init1: 938 opt: 1174 Z-score: 921.1 bits: 179.7 E(32554): 5.5e-45
Smith-Waterman score: 1174; 43.2% identity (67.4% similar) in 451 aa overlap (1-446:1-448)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MASAITQCSTSELTCSICTDYLTDPVTICCGHRFCSPCLCLLWEDTLTPNCCPVCREISQ
: :.:.: :::: :: .:. ::::: ::: :: ::. : :.: . : : . .:
CCDS60 MNSGISQVFQRELTCPICLNYFIDPVTIDCGHSFCRPCFYLNWQDIPILTQCFECLKTTQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 QMYFKRIIFAEKQVIPTRESVPCQLSSSAMLICRRHQEIKNLICETDRSLLCFLCSQSPR
: .: : .:.. .:.. . :: .: :.: :...::.::::::.:::.: .
CCDS60 QRNLKTNIRLKKMASRARKASLWLFLSSEEQMCGTHRETKKIFCEVDRSLLCLLCSSSLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 HATHKHYMTREADEYYRKKLLIQMKSIWKKKQKNQRNLNRETNIIGTWEVFINLRSMMIS
: :.: .. : : .:.::: .:.:.:.: .:::::: ::. :. :. ..:.: :
CCDS60 HRYHRHCPAEWAAEEHREKLLKKMQSLWEKVCENQRNLNVETTRISHWKDYVNVRLEAIR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 AEYPKVCQYLREEEQKHVESLAREGRIIFQQLKRSQTRMAKMGILLREMYEKLKEMSCKA
::: :. . .:::....: : ..:. ::..:. :...::. .:: : .: .: :
CCDS60 AEYQKMPAFHHEEEKHNLEMLKKKGKDIFHRLHLSKAKMAHRREILRGTYAELMKMCHKP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 DVNLPQDLGDVMKRNEFLRLAMPQPVNPQLSAWTITGVSERLNFFRVYITLDRKICSNHK
::.: : .::...:.: . : ::::.: .: : :::. .::: ::: ::: .. ..:
CCDS60 DVELLQAFGDILHRSESVLLHMPQPLNLELRAGPITGLRDRLNQFRVDITLPHNEANSHI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE3 LLFEDLRHLQCSLDDTD---MSCNPTSTQYTSSWGAQILSSGKHYWEVDVKDSCNWVIGL
. ::: . . : . .. .::: .:::: ..:::.:::: : :: ::..:.
CCDS60 FRRGDLRSICIGCDRQNAPHITATPTSFL---AWGAQTFTSGKYYWEVHVGDSWNWAFGV
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 CREAW--TKRNDMRLDSEGIFLLLCLKVDDHFSLFSTSPLLPHYIPRPQGWLGVFLDYEC
: . : :..: ::.: : :.: : . :::.:::: .:.::: . .:.::: :
CCDS60 CNKYWKGTNQNGNIHGEEGLFSLGCVKNDIQCSLFTTSPLTLQYVPRPTNHVGLFLDCEA
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450
pF1KE3 GIVSFVNVAQSSLICSFLSRIFYFPLRPFICHGSK
::::.: ::: : .. . : ::::..:
CCDS60 RTVSFVDVNQSSPIHTIPNCSFSPPLRPIFCCVHL
420 430 440 450
>>CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11 (475 aa)
initn: 536 init1: 197 opt: 686 Z-score: 545.8 bits: 110.3 E(32554): 4.4e-24
Smith-Waterman score: 686; 31.0% identity (59.0% similar) in 461 aa overlap (1-448:1-449)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MASAITQCST-SELTCSICTDYLTDPVTICCGHRFCSPCLCLLWEDTLTPNCCPVCREIS
:::: :.:: :: : ...::.: ::: ::. :. . . . :::::
CCDS44 MASAARLTMMWEEVTCPICLDPFVEPVSIECGHSFCQECISQVGKG--GGSVCPVCR---
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 QQMYFKRIIFAEKQVIPTRESVPCQLSSSAMLI-----CRRHQEIKNLICETDRSLLCFL
: .. . . ..:. ... ..:. : : : : .:.:: : . ::..
CCDS44 -QRFLLKNLRPNRQLANMVNNLK-EISQEAREGTQGERCAVHGERLHLFCEKDGKALCWV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 CSQSPRHATHKHYMTREADEYYRKKLLIQMKSIWKKKQKNQRNLNRETNII-GTWEVFIN
:.:: .: : .:: . :..:: . . . ..::. ..:. : : . :. ..
CCDS44 CAQSRKHRDHAMVPLEEAAQEYQEKLQVALGEL-RRKQELAEKLEVEIAIKRADWKKTVE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 LRSMMISAEYPKVCQYLREEEQKHVESLAREGRIIFQQLKRSQTRMAKMGILLREMYEKL
.. : ::. . ..: ::::.... : .. : .. : ......:... :.:. .:
CCDS44 TQKSRIHAEFVQQKNFLVEEEQRQLQELEKDEREQLRILGEKEAKLAQQSQALQELISEL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 KEMSCKADVNLPQDLGDVMKRNEFLRLAMPQPVNPQL-SAWTITGVSERLNFFRVYITLD
. .. ..: :.. :..:.: : . ..:.: :. . :... : :.::::
CCDS44 DRRCHSSALELLQEVIIVLERSESWNLKDLDITSPELRSVCHVPGLKKMLRTCAVHITLD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KE3 RKICSNHKLLFEDLRHLQCSLDDTDMSCNPTSTQYTSSW----GAQILSSGKHYWEVDVK
. .: :: : : : ::..: : . . .:. ::: . ::::::::::
CCDS44 PDTANPWLILSEDRR--QVRLGDTQQSI-PGNEERFDSYPMVLGAQHFHSGKHYWEVDVT
300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 DSCNWVIGLCREAWTKRNDMRLDSEGIFLLLCLKVDDHFSLFSTSPLLPHYIPRPQGWLG
. : .:.::.. ... . :.:.. : . : ... .: : : .. : .:
CCDS44 GKEAWDLGVCRDSVRRKGHFLLSSKSGFWTIWLWNKQKYEA-GTYPQTPLHLQVPPCQVG
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450
pF1KE3 VFLDYECGIVSFVNVA-QSSLICSFLSRIFYFPLRPFICHGSK
.::::: :.::: :.. ..::: :: : :::::. :
CCDS44 IFLDYEAGMVSFYNITDHGSLIYSFSECAFTGPLRPFFSPGFNDGGKNTAPLTLCPLNIG
410 420 430 440 450 460
CCDS44 SQGSTDY
470
450 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 16:31:21 2016 done: Mon Nov 7 16:31:22 2016
Total Scan time: 2.700 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]