Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3530
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3530, 1240 aa
1>>>pF1KE3530 1240 - 1240 aa - 1240 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9965+/-0.000907; mu= 15.7227+/- 0.055
mean_var=125.9554+/-25.334, 0's: 0 Z-trim(110.0): 97 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.114279
statistics sampled from 11212 (11314) to 11212 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.348), width: 16
Scan time: 5.910
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS30617.1 ARHGEF10L gene_id:55160|Hs108|chr1 (1240) 8335 1386.3 0
CCDS182.1 ARHGEF10L gene_id:55160|Hs108|chr1 (1279) 6945 1157.1 0
CCDS78297.1 ARHGEF10 gene_id:9639|Hs108|chr8 (1306) 2233 380.3 1.8e-104
CCDS34794.1 ARHGEF10 gene_id:9639|Hs108|chr8 (1344) 2126 362.6 3.7e-99
CCDS78296.1 ARHGEF10 gene_id:9639|Hs108|chr8 (1368) 1434 248.6 8.3e-65
CCDS8221.1 ARHGEF17 gene_id:9828|Hs108|chr11 (2063) 556 103.9 4.4e-21
CCDS45379.1 MAPK8IP3 gene_id:23162|Hs108|chr16 (1330) 397 77.6 2.4e-13
CCDS10442.2 MAPK8IP3 gene_id:23162|Hs108|chr16 (1336) 397 77.6 2.4e-13
CCDS81929.1 MAPK8IP3 gene_id:23162|Hs108|chr16 (1337) 397 77.6 2.4e-13
CCDS11577.1 SPAG9 gene_id:9043|Hs108|chr17 (1307) 368 72.8 6.5e-12
CCDS58578.1 SPAG9 gene_id:9043|Hs108|chr17 (1311) 368 72.8 6.5e-12
CCDS45740.1 SPAG9 gene_id:9043|Hs108|chr17 (1321) 368 72.8 6.5e-12
CCDS3220.1 ECT2 gene_id:1894|Hs108|chr3 ( 883) 363 71.9 8.4e-12
CCDS58860.1 ECT2 gene_id:1894|Hs108|chr3 ( 914) 363 71.9 8.6e-12
CCDS58577.1 SPAG9 gene_id:9043|Hs108|chr17 (1177) 361 71.6 1.3e-11
>>CCDS30617.1 ARHGEF10L gene_id:55160|Hs108|chr1 (1240 aa)
initn: 8335 init1: 8335 opt: 8335 Z-score: 7426.5 bits: 1386.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8335; 99.9% identity (100.0% similar) in 1240 aa overlap (1-1240:1-1240)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MASSNPPPQPAIGDQLVPGVPGPSSEAEDDPGEAFEFDDSDDEEDTSAALGVPSLAPERD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MASSNPPPQPAIGDQLVPGVPGPSSEAEDDPGEAFEFDDSDDEEDTSAALGVPSLAPERD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 TDPPLIHLDSIPVTDPDPAAAPPGTGVPAWVSNGDAADAAFSGARHSSWKRKSSRRIDRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 TDPPLIHLDSIPVTDPDPAAAPPGTGVPAWVSNGDAADAAFSGARHSSWKRKSSRRIDRF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 TFPALEEDVIYDDVPCESPDAHQPGAERNLLYEDAHRAGAPRQAEDLGWSSSEFESYSED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 TFPALEEDVIYDDVPCESPDAHQPGAERNLLYEDAHRAGAPRQAEDLGWSSSEFESYSED
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 SGEEAKPEVEVEPAKHRVSFQPKMTQLMKAAKSGTKDGLEKTRMAVMRKVSFLHRKDVLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SGEEAKPEVEVEPAKHRVSFQPKMTQLMKAAKSGTKDGLEKTRMAVMRKVSFLHRKDVLG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 DSEEEDMGLLEVSVSDIKPPAPELGPMPEGLSPQQVVRRHILGSIVQSEGSYVESLKRIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DSEEEDMGLLEVSVSDIKPPAPELGPMPEGLSPQQVVRRHILGSIVQSEGSYVESLKRIL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 QDYRNPLMEMEPKALSARKCQVVFFRVKEILHCHSMFQIALSSRVAEWDSTEKIGDLFVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QDYRNPLMEMEPKALSARKCQVVFFRVKEILHCHSMFQIALSSRVAEWDSTEKIGDLFVA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 SFSKSMVLDVYSDYVNNFTSAMSIIKKACLTKPAFLEFLKRRQVCSPDRVTLYGLMVKPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SFSKSMVLDVYSDYVNNFTSAMSIIKKACLTKPAFLEFLKRRQVCSPDRVTLYGLMVKPI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 QRFPQFILLLQDMLKNTPRGHPDRLSLQLALTELETLAEKLNEQKRLADQVAEIQQLTKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QRFPQFILLLQDMLKNTPRGHPDRLSLQLALTELETLAEKLNEQKRLADQVAEIQQLTKS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 VSDRSSLNKLLTSGQRQLLLCETLTETVYGDRGQLIKSKERRVFLLNDMLVCANINFKPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VSDRSSLNKLLTSGQRQLLLCETLTETVYGDRGQLIKSKERRVFLLNDMLVCANINFKPA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 NHRGQLEISSLVPLGPKYVVKWNTALPQVQVVEVGQDGGTYDKDNVLIQHSGAKKASASG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 NHRGQLEISSLVPLGPKYVVKWNTALPQVQVVEVGQDGGTYDKDNVLIQHSGAKKASASG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 QAQNKVYLGPPRLFQELQDLQKDLAVVEQITLLISTLHGTYQNLNMTVAQDWCLALQRLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QAQNKVYLGPPRLFQELQDLQKDLAVVEQITLLISTLHGTYQNLNMTVAQDWCLALQRLM
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 RVKEEEIHSANKCRLRLLLPGKPDKSGRPISFMVVFITPNPLSKISWVNRLHLAKIGLRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RVKEEEIHSANKCRLRLLLPGKPDKSGRPISFMVVFITPNPLSKISWVNRLHLAKIGLRE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 ENQPGWLCPDEDKKSKAPFWCPILACCIPAFSSRALSLQLGALVHSPVNCPLLGFSAVST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ENQPGWLCPDEDKKSKAPFWCPILACCIPAFSSRALSLQLGALVHSPVNCPLLGFSAVST
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 SLPQGYLWVGGGQEGAGGQVEIFSLNRPSPRTVKSFPLAAPVLCMEYIPELEEEAESRDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SLPQGYLWVGGGQEGAGGQVEIFSLNRPSPRTVKSFPLAAPVLCMEYIPELEEEAESRDE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 SPTVADPSATVHPTICLGLQDGSILLYSSVDTGTQCLVSCRSPGLQPVLCLRHSPFHLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SPTVADPSATVHPTICLGLQDGSILLYSSVDTGTQCLVSCRSPGLQPVLCLRHSPFHLLA
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 GLQDGTLAAYPRTSGGVLWDLESPPVCLTVGPGPVRTLLSLEDAVWASCGPRVTVLEATT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 GLQDGTLAAYPRTSGGVLWDLESPPVCLTVGPGPVRTLLSLEDAVWASCGPRVTVLEATT
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 LQPQQSFEAHQDEAVSVTHMVKAGSGVWMAFSSGTSIRLFHTETLEHLQEINIATRTTFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LQPQQSFEAHQDEAVSVTHMVKAGSGVWMAFSSGTSIRLFHTETLEHLQEINIATRTTFL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 LPGQKHLCVTSLLICQGLLWVGTDQGVIVLLPVPRLEGIPKITGKGMVSLNGHCGPVAFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LPGQKHLCVTSLLICQGLLWVGTDQGVIVLLPVPRLEGIPKITGKGMVSLNGHCGPVAFL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE3 AVATSILAPDILRSDQEEAEGPRAEEDKPDGQAHEPMPDSHVGRELTRKKGILLQYRLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 AVATSILAPDILRSDQEEAEGPRAEEDKPDGQAHEPMPDSHVGRELTRKKGILLQYRLRS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE3 TAHLPGPLLSMREPAPADGAALEHSEEDGSIYEMADDPDVWVRSRPCARDAHRKEICSVA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS30 TAHLPGPLLSMREPAPADGAALEHSEEDGSIYEMADDPDIWVRSRPCARDAHRKEICSVA
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240
pF1KE3 IISGGQGYRNFGSALGSSGRQAPCGETDSTLLIWQVPLML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 IISGGQGYRNFGSALGSSGRQAPCGETDSTLLIWQVPLML
1210 1220 1230 1240
>>CCDS182.1 ARHGEF10L gene_id:55160|Hs108|chr1 (1279 aa)
initn: 6931 init1: 6931 opt: 6945 Z-score: 6187.8 bits: 1157.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8198; 96.9% identity (96.9% similar) in 1272 aa overlap (8-1240:8-1279)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MASSNPPPQPAIGDQLVPGVPGPSSEAEDDPGEAFEFDDSDDEEDTSAALGVPSLAPERD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 MASSNPPPQPAIGDQLVPGVPGPSSEAEDDPGEAFEFDDSDDEEDTSAALGVPSLAPERD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 TDPPLIHLDSIPVTDPDPAAAPPGTGVPAWVSNGDAADAAFSGARHSSWKRKSSRRIDRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 TDPPLIHLDSIPVTDPDPAAAPPGTGVPAWVSNGDAADAAFSGARHSSWKRKSSRRIDRF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 TFPALEEDVIYDDVPCESPDAHQPGAERNLLYEDAHRAGAPRQAEDLGWSSSEFESYSED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 TFPALEEDVIYDDVPCESPDAHQPGAERNLLYEDAHRAGAPRQAEDLGWSSSEFESYSED
130 140 150 160 170 180
190 200
pF1KE3 SGEEAKPEVEVEPAKHRVSFQPK-------------------------------------
:::::::::::::::::::::::
CCDS18 SGEEAKPEVEVEPAKHRVSFQPKLSPDLTRLKERYARTKRDILALRVGGRDMQELKHKYD
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 --MTQLMKAAKSGTKDGLEKTRMAVMRKVSFLHRKDVLGDSEEEDMGLLEVSVSDIKPPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 CKMTQLMKAAKSGTKDGLEKTRMAVMRKVSFLHRKDVLGDSEEEDMGLLEVSVSDIKPPA
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 PELGPMPEGLSPQQVVRRHILGSIVQSEGSYVESLKRILQDYRNPLMEMEPKALSARKCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 PELGPMPEGLSPQQVVRRHILGSIVQSEGSYVESLKRILQDYRNPLMEMEPKALSARKCQ
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 VVFFRVKEILHCHSMFQIALSSRVAEWDSTEKIGDLFVASFSKSMVLDVYSDYVNNFTSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 VVFFRVKEILHCHSMFQIALSSRVAEWDSTEKIGDLFVASFSKSMVLDVYSDYVNNFTSA
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 MSIIKKACLTKPAFLEFLKRRQVCSPDRVTLYGLMVKPIQRFPQFILLLQDMLKNTPRGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 MSIIKKACLTKPAFLEFLKRRQVCSPDRVTLYGLMVKPIQRFPQFILLLQDMLKNTPRGH
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KE3 PDRLSLQLALTELETLAEKLNEQKRLADQVAEIQQLTKSVSDRSSLNKLLTSGQRQLLLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 PDRLSLQLALTELETLAEKLNEQKRLADQVAEIQQLTKSVSDRSSLNKLLTSGQRQLLLC
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KE3 ETLTETVYGDRGQLIKSKERRVFLLNDMLVCANINFKPANHRGQLEISSLVPLGPKYVVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 ETLTETVYGDRGQLIKSKERRVFLLNDMLVCANINFKPANHRGQLEISSLVPLGPKYVVK
550 560 570 580 590 600
570 580 590 600 610 620
pF1KE3 WNTALPQVQVVEVGQDGGTYDKDNVLIQHSGAKKASASGQAQNKVYLGPPRLFQELQDLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 WNTALPQVQVVEVGQDGGTYDKDNVLIQHSGAKKASASGQAQNKVYLGPPRLFQELQDLQ
610 620 630 640 650 660
630 640 650 660 670 680
pF1KE3 KDLAVVEQITLLISTLHGTYQNLNMTVAQDWCLALQRLMRVKEEEIHSANKCRLRLLLPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 KDLAVVEQITLLISTLHGTYQNLNMTVAQDWCLALQRLMRVKEEEIHSANKCRLRLLLPG
670 680 690 700 710 720
690 700 710 720 730 740
pF1KE3 KPDKSGRPISFMVVFITPNPLSKISWVNRLHLAKIGLREENQPGWLCPDEDKKSKAPFWC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 KPDKSGRPISFMVVFITPNPLSKISWVNRLHLAKIGLREENQPGWLCPDEDKKSKAPFWC
730 740 750 760 770 780
750 760 770 780 790 800
pF1KE3 PILACCIPAFSSRALSLQLGALVHSPVNCPLLGFSAVSTSLPQGYLWVGGGQEGAGGQVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 PILACCIPAFSSRALSLQLGALVHSPVNCPLLGFSAVSTSLPQGYLWVGGGQEGAGGQVE
790 800 810 820 830 840
810 820 830 840 850 860
pF1KE3 IFSLNRPSPRTVKSFPLAAPVLCMEYIPELEEEAESRDESPTVADPSATVHPTICLGLQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 IFSLNRPSPRTVKSFPLAAPVLCMEYIPELEEEAESRDESPTVADPSATVHPTICLGLQD
850 860 870 880 890 900
870 880 890 900 910 920
pF1KE3 GSILLYSSVDTGTQCLVSCRSPGLQPVLCLRHSPFHLLAGLQDGTLAAYPRTSGGVLWDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 GSILLYSSVDTGTQCLVSCRSPGLQPVLCLRHSPFHLLAGLQDGTLAAYPRTSGGVLWDL
910 920 930 940 950 960
930 940 950 960 970 980
pF1KE3 ESPPVCLTVGPGPVRTLLSLEDAVWASCGPRVTVLEATTLQPQQSFEAHQDEAVSVTHMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 ESPPVCLTVGPGPVRTLLSLEDAVWASCGPRVTVLEATTLQPQQSFEAHQDEAVSVTHMV
970 980 990 1000 1010 1020
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KE3 KAGSGVWMAFSSGTSIRLFHTETLEHLQEINIATRTTFLLPGQKHLCVTSLLICQGLLWV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 KAGSGVWMAFSSGTSIRLFHTETLEHLQEINIATRTTFLLPGQKHLCVTSLLICQGLLWV
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE3 GTDQGVIVLLPVPRLEGIPKITGKGMVSLNGHCGPVAFLAVATSILAPDILRSDQEEAEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 GTDQGVIVLLPVPRLEGIPKITGKGMVSLNGHCGPVAFLAVATSILAPDILRSDQEEAEG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE3 PRAEEDKPDGQAHEPMPDSHVGRELTRKKGILLQYRLRSTAHLPGPLLSMREPAPADGAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 PRAEEDKPDGQAHEPMPDSHVGRELTRKKGILLQYRLRSTAHLPGPLLSMREPAPADGAA
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KE3 LEHSEEDGSIYEMADDPDVWVRSRPCARDAHRKEICSVAIISGGQGYRNFGSALGSSGRQ
::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 LEHSEEDGSIYEMADDPDIWVRSRPCARDAHRKEICSVAIISGGQGYRNFGSALGSSGRQ
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1230 1240
pF1KE3 APCGETDSTLLIWQVPLML
:::::::::::::::::::
CCDS18 APCGETDSTLLIWQVPLML
1270
>>CCDS78297.1 ARHGEF10 gene_id:9639|Hs108|chr8 (1306 aa)
initn: 2628 init1: 1100 opt: 2233 Z-score: 1989.2 bits: 380.3 E(32554): 1.8e-104
Smith-Waterman score: 3097; 46.1% identity (72.9% similar) in 1129 aa overlap (127-1239:211-1304)
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 ADAAFSGARHSSWKRKSSRRIDRFTFPALEEDVIYDDVPCESPDAHQPGAERNLLYEDAH
:..:::::: :. :. .: ...:.:..
CCDS78 PTSEDQVGREDSALARWAADPANTAWMENPEEAIYDDVPRENSDS-EPD---EMIYDDVE
190 200 210 220 230
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 RAG-APRQAEDLGWSSSEFESYSEDSGEEAKPEVEVEPAKH-RVSFQPKMTQLMKAAKSG
. . .. . :::::::::: :.: : : . : . : . . .: .:.::::.:
CCDS78 NGDEGGNSSLEYGWSSSEFESYEEQSDSECKNGI---PRSFLRSNHKKQMQKLVKAAKDG
240 250 260 270 280 290
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 TKDGLEKTRMAVMRKVSFLHRKDVLGD----SEEEDMGLLEVSVSDIKPPAPELGPMPEG
::::::.:: :: : ::.. :..... : ::...:. ..: : : : : :::::
CCDS78 TKDGLERTRAAVKRGRSFIRTKSLIAQDHRSSLEEEQNLF-IDV-DCKHPEAILTPMPEG
300 310 320 330 340 350
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 LSPQQVVRRHILGSIVQSEGSYVESLKRILQDYRNPLMEMEPKALSARKCQVVFFRVKEI
:: ::::::.::::.:.:: .::..:::::..:..:: :::::.:: :: ..::.:::::
CCDS78 LSQQQVVRRYILGSVVDSEKNYVDALKRILEQYEKPLSEMEPKVLSERKLKTVFYRVKEI
360 370 380 390 400 410
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 LHCHSMFQIALSSRVAEWDSTEKIGDLFVASFSKSMVLDVYSDYVNNFTSAMSIIKKACL
:.:::.:::::.:::.::::.: :::.::::::::::::.::.:::::..:....::.:
CCDS78 LQCHSLFQIALASRVSEWDSVEMIGDVFVASFSKSMVLDAYSEYVNNFSTAVAVLKKTCA
420 430 440 450 460 470
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 TKPAFLEFLKRRQVCSPDRVTLYGLMVKPIQRFPQFILLLQDMLKNTPRGHPDRLSLQLA
::::::::::..: ::::.:::.::.:::::::::::::::::::: .:::::: ::.:
CCDS78 TKPAFLEFLKQEQEASPDRTTLYSLMMKPIQRFPQFILLLQDMLKNTSKGHPDRLPLQMA
480 490 500 510 520 530
460 470 480 490 500 510
pF1KE3 LTELETLAEKLNEQKRLADQVAEIQQLTKSVSDRSSLNKLLTSGQRQLLLCETLTETVYG
:::::::::::::.:: ::: :..:..:....: :::::.::.: :. . . ::::.
CCDS78 LTELETLAEKLNERKRDADQRCEVKQIAKAINERY-LNKLLSSGSRYLIRSDDMIETVYN
540 550 560 570 580 590
520 530 540 550 560 570
pF1KE3 DRGQLIKSKERRVFLLNDMLVCANINFKPANHRGQLEISSLVPLGPKYVVKWNTALPQVQ
:::...:.::::::.:::.:.::... .:. : ... .:: .:..::.. : .:.
CCDS78 DRGEIVKTKERRVFMLNDVLMCATVSSRPS-HDSRV-MSS-----QRYLLKWSVPLGHVD
600 610 620 630 640
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pF1KE3 VVEVGQDGGTYDKDNVLIQHSGAKKASASGQAQNKVYLGPPRLFQELQDLQKDLAVVEQI
..: :...:: ... : : . : ... ::::.:: .:.:.::.: .:: :. ::
CCDS78 AIEYGSSAGTGEHSRHLAVHPPESLAVVANAKPNKVYMGPGQLYQDLQNLLHDLNVIGQI
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pF1KE3 TLLISTLHGTYQNLNMTVAQDWCLALQRLMRVKEEEIHSANKCRLRLLLPGKPDKSGRPI
: ::..:.:.:::::..::.:: .::::. ::.::..:. ::..: :::: ::::::
CCDS78 TQLIGNLKGNYQNLNQSVAHDWTSGLQRLILKKEDEIRAADCCRIQLQLPGKQDKSGRPT
710 720 730 740 750 760
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pF1KE3 SFMVVFITPNPLSKISWVNRLHLAKIGLREENQPGWLCPDEDKKSKAPFWCPILACCIPA
: .:: : .: : :::: :..::..:.:::. ::.: ..: . :.:. .:.
CCDS78 FFTAVFNTFTPAIKESWVNSLQMAKLALEEENHMGWFCVEDDGNHIKKEKHPLLVGHMPV
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. .. ... ...: : :. . : : .:.::.:. . : :. : :..
CCDS78 MVAKQQEFKIECAAYNPE--PYLNNESQPDSFSTAHGFLWIGSCTHQMG-QIAIVSFQNS
830 840 850 860 870 880
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pF1KE3 SPRTVKSFPLAAPVLCMEYIPELEEEAESRDESPTVADPS--ATVHPTICLGLQDGSILL
.:.... : . . .::: :.: .::. . : :. :. ::::.: ..::: .
CCDS78 TPKVIECFNVESRILCMLYVP-VEEKRREPGAPPDPETPAVRASDVPTICVGTEEGSISI
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pF1KE3 YSSVDTGTQC-LVSCRSPGLQPVLCLRHSPFHLLAGLQDGTLAAYPRTSGGVLWDLESPP
:.: . . . : .: . :. : . : ::: .:..:.: :. : :: : :
CCDS78 YKSSQGSKKVRLQHFFTPEKSTVMSLACTSQSLYAGLVNGAVASYARAPDGS-WDSE-PQ
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pF1KE3 VCLTVGPGPVRTLLSLEDAVWASCGPRVTVLEATTLQPQQSFEAHQDEAVSVTHMVKAGS
. .: :::.:: .::..::. : .: .. . : . ..::::.:.. ..::. .:
CCDS78 KVIKLGVLPVRSLLMMEDTLWAASGGQVFIISVETHAVEGQLEAHQEEGMVISHMAVSGV
1000 1010 1020 1030 1040 1050
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pF1KE3 GVWMAFSSGTSIRLFHTETLEHLQEINIATRTTFLLPGQKHLCVTSLLICQGLLWVGTDQ
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CCDS78 GIWIAFTSGSTLRLFHTETLKHLQDINIATPVHNMLPGHQRLSVTSLLVCHGLLMVGTSL
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pF1KE3 GVIVLLPVPRLEGIPKITGKGMVSLNGHCGPVAFLAVATSILAPDILRSDQEEAEGPRAE
::.: ::::::.::::.::.:::: ..: .:: :...::.. : .: . : ::. .
CCDS78 GVLVALPVPRLQGIPKVTGRGMVSYHAHNSPVKFIVLATALHEKDKDKSRDSLAPGPEPQ
1120 1130 1140 1150 1160 1170
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pF1KE3 -EDKPDGQAHEPMPDSHVGRELTR---KKGILLQYRLRSTAHLPGPLLSMREPAPADGAA
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CCDS78 DEDQKDA-----LPSGGAGSSLSQGDPDAAIWLGDSLGSMTQKSDLSSSSGSLSLSHGSS
1180 1190 1200 1210 1220 1230
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pF1KE3 -LEHSEEDGSIYEMADDPDVWVRSRPCARDAHRKEICSVAIISGGQGYRNFGSALGSSGR
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CCDS78 SLEHRSEDSTIYDLLKDP-VSLRSK--ARRAKKAKASSALVVCGGQGHRR----VHRKAR
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1230 1240
pF1KE3 QAPCGETDSTLLIWQVPLML
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CCDS78 QPHQEELAPTVMVWQIPLLNI
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CCDS34 LMMKPIQRFPQFILLLQDMLKNTSKGHPDRLPLQMALTELETLAEKLNERKRDADQRCEV
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540 550 560 570 580 590
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1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KE3 ---KKGILLQYRLRSTAHLPGPLLSMREPAPADGAA-LEHSEEDGSIYEMADDPDVWVRS
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CCDS34 GDPDAAIWLGDSLGSMTQKSDLSSSSGSLSLSHGSSSLEHRSEDSTIYDLLKDP-VSLRS
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pF1KE3 RPCARDAHRKEICSVAIISGGQGYRNFGSALGSSGRQAPCGETDSTLLIWQVPLML
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CCDS34 K--ARRAKKAKASSALVVCGGQGHRR----VHRKARQPHQEELAPTVMVWQIPLLNI
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pF1KE3 RAG-APRQAEDLGWSSSEFESYSEDSGEEAKPEVE-------------------------
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CCDS78 NGDEGGNSSLEYGWSSSEFESYEEQSDSECKNGIPRSFLRSNHKKQLSHDLTRLKEHYEK
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200 210 220 230
pF1KE3 ------------VEPAKHRVSFQPKMTQLMKAAKSGTKDGLEKTRMAVMRKVSFLHRKDV
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CCDS78 KMRDLMASTVGVVEIQQLRQKHELKMQKLVKAAKDGTKDGLERTRAAVKRGRSFIRTKSL
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240 250 260 270 280 290
pF1KE3 LGD----SEEEDMGLLEVSVSDIKPPAPELGPMPEGLSPQQVVRRHILGSIVQSEGSYVE
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CCDS78 IAQDHRSSLEEEQNLF-IDV-DCKHPEAILTPMPEGLSQQQVVRRYILGSVVDSEKNYVD
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300 310 320 330 340 350
pF1KE3 SLKRILQDYRNPLMEMEPKALSARKCQVVFFRVKEILHCHSMFQIALSSRVAEWDSTEKI
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CCDS78 ALKRILEQYEKPLSEMEPKVLSERKLKTVFYRVKEILQCHSLFQIALASRVSEWDSVEMI
440 450 460 470 480 490
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CCDS78 GDVFVASFSKSMVLDAYSEYVNNFSTAVAVLKKTCATKPAFLEFLKEQEA-SPDRTTLYS
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CCDS78 LMMKPIQRFPQFILLLQDMLKNTSKGHPDRLPLQMALTELETLAEKLNERKRDADQRCEV
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CCDS78 KQIAKAINERY-LNKLLSSGSRYLIRSDDMIETVYNDRGEIVKTKERRVFMLNDVLMCAT
620 630 640 650 660 670
540 550 560 570 580 590
pF1KE3 INFKPANHRGQLEISSLVPLGPKYVVKWNTALPQVQVVEVGQDGGTYDKDNVLIQHSGAK
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CCDS78 VSSRPS-HDSRV-MSS-----QRYLLKWSVPLGHVDAIEYGSSAGTGEHSRHLAVHPPES
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CCDS78 LAVVANAKPNKVYMGPGQLYQDLQNLLHDLNVIGQITQLIGNLKGNYQNLNQSVAHDWTS
730 740 750 760 770 780
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CCDS78 GLQRLILKKEDEIRAADCCRIQLQLPGKQDKSGRPTFFTAVFNTFTPAIKESWVNSLQMA
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CCDS78 NESQPDSFSTAHGFLWIGSCTHQMG-QIAIVSFQNSTPKVIECFNVESRILCMLYVP-VE
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CCDS78 EKRREPGAPPDPETPAVRASDVPTICVGTEEGSISIYKSSQGSKKVRLQHFFTPEKSTVM
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CCDS78 SLACTSQSLYAGLVNGAVASYARAPDGS-WDSE-PQKVIKLGVLPVRSLLMMEDTLWAAS
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CCDS78 GGQVFIISVETHAVEGQLEAHQEEGMVISHMAVSGVGIWIAFTSGSTLRLFHTETLKHLQ
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CCDS78 DINIATPVHNMLPGHQRLSVTSLLVCHGLLMVGTSLGVLVALPVPRLQGIPKVTGRGMVS
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pF1KE3 ---KKGILLQYRLRSTAHLPGPLLSMREPAPADGAA-LEHSEEDGSIYEMADDPDVWVRS
.: : : : .. : . . :.. ::: ::..::.. :: : .::
CCDS78 GDPDAAIWLGDSLGSMTQKSDLSSSSGSLSLSHGSSSLEHRSEDSTIYDLLKDP-VSLRS
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. :: :.. . :. .. ::::.: . ..:: : :...::.::.
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..... .:: : . :: : : : . : : :
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.. .: :. :. .:: : . .. :: .:: . .:.: :.
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CCDS81 VLSLVHVKGRVLVALADGTLAIFHRGEDG-QWDLSNYHL-MDLGHPHHSIRCMAVVYDRV
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CCDS11 KCLHSIKLK--DSILSIVHVKGIVLVALADGTLAIFHRGVDG-QWDLSNYHL-LDLGRPH
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CCDS11 HSIRCMTVVHDKVW--CGYRNKIYVVQPKAMKIEKSFDAHPRKESQVRQLAWVGDGVWVS
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CCDS11 IRLDSTLRLYHAHTYQHLQDVDIEPYVSKMLGTGKLGFSFVRITALMVSCNRLWVGTGNG
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CCDS11 VIISIPLTETNKTSGVPGNRPGSVIRVYGDENSDKVTPGTFIPYCSMAHAQLCFHGHRDA
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CCDS11 VKFFVAV---P-GQVISPQSSSS-GTDLTGDKA-------GPSAQEPGSQTPLKSMLVIS
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CCDS11 GGEGYIDFRMGDEGGESELLGEDLPL----EPSVTKAERSHLIVWQVMYGNE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]