Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3515
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3515, 968 aa
1>>>pF1KE3515 968 - 968 aa - 968 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4565+/-0.000859; mu= 13.3183+/- 0.052
mean_var=151.9982+/-30.303, 0's: 0 Z-trim(112.7): 17 B-trim: 180 in 2/49
Lambda= 0.104029
statistics sampled from 13429 (13442) to 13429 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.73), E-opt: 0.2 (0.413), width: 16
Scan time: 4.980
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3627.1 PKD2 gene_id:5311|Hs108|chr4 ( 968) 6466 982.7 0
CCDS7492.1 PKD2L1 gene_id:9033|Hs108|chr10 ( 805) 2496 386.8 9.2e-107
CCDS78062.1 PKD2L2 gene_id:27039|Hs108|chr5 ( 624) 1927 301.3 3.9e-81
CCDS43367.1 PKD2L2 gene_id:27039|Hs108|chr5 ( 613) 1922 300.6 6.4e-81
CCDS58971.1 PKD2L2 gene_id:27039|Hs108|chr5 ( 523) 1231 196.8 9.4e-50
CCDS58972.1 PKD2L2 gene_id:27039|Hs108|chr5 ( 602) 840 138.2 4.8e-32
CCDS14073.1 PKDREJ gene_id:10343|Hs108|chr22 (2253) 390 71.1 2.9e-11
>>CCDS3627.1 PKD2 gene_id:5311|Hs108|chr4 (968 aa)
initn: 6466 init1: 6466 opt: 6466 Z-score: 5249.2 bits: 982.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6466; 100.0% identity (100.0% similar) in 968 aa overlap (1-968:1-968)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MVNSSRVQPQQPGDAKRPPAPRAPDPGRLMAGCAAVGASLAAPGGLCEQRGLEIEMQRIR
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CCDS36 MVNSSRVQPQQPGDAKRPPAPRAPDPGRLMAGCAAVGASLAAPGGLCEQRGLEIEMQRIR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 QAAARDPPAGAAASPSPPLSSCSRQAWSRDNPGFEAEEEEEEVEGEEGGMVVEMDVEWRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 QAAARDPPAGAAASPSPPLSSCSRQAWSRDNPGFEAEEEEEEVEGEEGGMVVEMDVEWRP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 GSRRSAASSAVSSVGARSRGLGGYHGAGHPSGRRRRREDQGPPCPSPVGGGDPLHRHLPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 GSRRSAASSAVSSVGARSRGLGGYHGAGHPSGRRRRREDQGPPCPSPVGGGDPLHRHLPL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 EGQPPRVAWAERLVRGLRGLWGTRLMEESSTNREKYLKSVLRELVTYLLFLIVLCILTYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 EGQPPRVAWAERLVRGLRGLWGTRLMEESSTNREKYLKSVLRELVTYLLFLIVLCILTYG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 MMSSNVYYYTRMMSQLFLDTPVSKTEKTNFKTLSSMEDFWKFTEGSLLDGLYWKMQPSNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 MMSSNVYYYTRMMSQLFLDTPVSKTEKTNFKTLSSMEDFWKFTEGSLLDGLYWKMQPSNQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 TEADNRSFIFYENLLLGVPRIRQLRVRNGSCSIPQDLRDEIKECYDVYSVSSEDRAPFGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 TEADNRSFIFYENLLLGVPRIRQLRVRNGSCSIPQDLRDEIKECYDVYSVSSEDRAPFGP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 RNGTAWIYTSEKDLNGSSHWGIIATYSGAGYYLDLSRTREETAAQVASLKKNVWLDRGTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 RNGTAWIYTSEKDLNGSSHWGIIATYSGAGYYLDLSRTREETAAQVASLKKNVWLDRGTR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 ATFIDFSVYNANINLFCVVRLLVEFPATGGVIPSWQFQPLKLIRYVTTFDFFLAACEIIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 ATFIDFSVYNANINLFCVVRLLVEFPATGGVIPSWQFQPLKLIRYVTTFDFFLAACEIIF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 CFFIFYYVVEEILEIRIHKLHYFRSFWNCLDVVIVVLSVVAIGINIYRTSNVEVLLQFLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 CFFIFYYVVEEILEIRIHKLHYFRSFWNCLDVVIVVLSVVAIGINIYRTSNVEVLLQFLE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 DQNTFPNFEHLAYWQIQFNNIAAVTVFFVWIKLFKFINFNRTMSQLSTTMSRCAKDLFGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 DQNTFPNFEHLAYWQIQFNNIAAVTVFFVWIKLFKFINFNRTMSQLSTTMSRCAKDLFGF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 AIMFFIIFLAYAQLAYLVFGTQVDDFSTFQECIFTQFRIILGDINFAEIEEANRVLGPIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 AIMFFIIFLAYAQLAYLVFGTQVDDFSTFQECIFTQFRIILGDINFAEIEEANRVLGPIY
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 FTTFVFFMFFILLNMFLAIINDTYSEVKSDLAQQKAEMELSDLIRKGYHKALVKLKLKKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 FTTFVFFMFFILLNMFLAIINDTYSEVKSDLAQQKAEMELSDLIRKGYHKALVKLKLKKN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 TVDDISESLRQGGGKLNFDELRQDLKGKGHTDAEIEAIFTKYDQDGDQELTEHEHQQMRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 TVDDISESLRQGGGKLNFDELRQDLKGKGHTDAEIEAIFTKYDQDGDQELTEHEHQQMRD
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 DLEKEREDLDLDHSSLPRPMSSRSFPRSLDDSEEDDDEDSGHSSRRRGSISSGVSYEEFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 DLEKEREDLDLDHSSLPRPMSSRSFPRSLDDSEEDDDEDSGHSSRRRGSISSGVSYEEFQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 VLVRRVDRMEHSIGSIVSKIDAVIVKLEIMERAKLKRREVLGRLLDGVAEDERLGRDSEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 VLVRRVDRMEHSIGSIVSKIDAVIVKLEIMERAKLKRREVLGRLLDGVAEDERLGRDSEI
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 HREQMERLVREELERWESDDAASQISHGLGTPVGLNGQPRPRSSRPSSSQSTEGMEGAGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 HREQMERLVREELERWESDDAASQISHGLGTPVGLNGQPRPRSSRPSSSQSTEGMEGAGG
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 NGSSNVHV
::::::::
CCDS36 NGSSNVHV
>>CCDS7492.1 PKD2L1 gene_id:9033|Hs108|chr10 (805 aa)
initn: 1314 init1: 1054 opt: 2496 Z-score: 2030.2 bits: 386.8 E(32554): 9.2e-107
Smith-Waterman score: 2582; 52.9% identity (80.5% similar) in 733 aa overlap (161-872:27-740)
140 150 160 170 180
pF1KE3 VSSVGARSRGLGGYHGAGHPSGRRRRREDQGPPCP---------SPVGGGDPLHRHLPLE
::: : : .: .: .. : :
CCDS74 MNAVGSPEGQELQKLGSGAWDNPAYSGPPSPHGTLRVCTISSTGPLQPQPKK-P-E
10 20 30 40 50
190 200 210 220 230
pF1KE3 GQPPRVAWAER-------LVRGLRGLWGTRLMEESSTNREKYLKSVLRELVTYLLFLIVL
.: ..:. . . .:.:::::: : :... ::: :.:..::::..:..::. .
CCDS74 DEPQETAYRTQVSSCCLHICQGIRGLWGTTLTENTAENRELYIKTTLRELLVYIVFLVDI
60 70 80 90 100 110
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 CILTYGMMSSNVYYYTRMMSQLFLDTPVSKTEKTNFKTLSSMEDFWKFTEGSLLDGLYWK
:.::::: ::..::::..::.::: :: : : ..:...::: ::: :..: :::.:::
CCDS74 CLLTYGMTSSSAYYYTKVMSELFLHTP-SDT-GVSFQAISSMADFWDFAQGPLLDSLYWT
120 130 140 150 160 170
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 MQPSNQTEAD-NRSFIFYENLLLGVPRIRQLRVRNGSCSIPQDLRDEIKECYDVYSVSSE
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CCDS74 KWYNNQSLGHGSHSFIYYENMLLGVPRLRQLKVRNDSCVVHEDFREDILSCYDVYSPDKE
180 190 200 210 220 230
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 DRAPFGPRNGTAWIYTSEKDLNGSSHWGIIATYSGAGYYLDLSRTREETAAQVASLKKNV
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CCDS74 EQLPFGPFNGTAWTYHSQDELGGFSHWGRLTSYSGGGYYLDLPGSRQGSAEALRALQEGL
240 250 260 270 280 290
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 WLDRGTRATFIDFSVYNANINLFCVVRLLVEFPATGGVIPSWQFQPLKLIRYVTTFDFFL
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CCDS74 WLDRGTRVVFIDFSVYNANINLFCVLRLVVEFPATGGAIPSWQIRTVKLIRYVSNWDFFI
300 310 320 330 340 350
480 490 500 510 520 530
pF1KE3 AACEIIFCFFIFYYVVEEILEIRIHKLHYFRSFWNCLDVVIVVLSVVAIGINIYRTSNVE
..::.::: ::::::::::::..::.:.:. :.:: ::.:...::.::.:..:.:: .:.
CCDS74 VGCEVIFCVFIFYYVVEEILELHIHRLRYLSSIWNILDLVVILLSIVAVGFHIFRTLEVN
360 370 380 390 400 410
540 550 560 570 580 590
pF1KE3 VLL-QFLEDQNTFPNFEHLAYWQIQFNNIAAVTVFFVWIKLFKFINFNRTMSQLSTTMSR
:. ..:.. ::. .:: ::.:: :.::. ::..::.:::.::.:.::.::.:::.:..:
CCDS74 RLMGKLLQQPNTYADFEFLAFWQTQYNNMNAVNLFFAWIKIFKYISFNKTMTQLSSTLAR
420 430 440 450 460 470
600 610 620 630 640 650
pF1KE3 CAKDLFGFAIMFFIIFLAYAQLAYLVFGTQVDDFSTFQECIFTQFRIILGDINFAEIEEA
::::..:::.::::.:.:::::.::.:::::..:::: .::::::::::::... :..:
CCDS74 CAKDILGFAVMFFIVFFAYAQLGYLLFGTQVENFSTFIKCIFTQFRIILGDFDYNAIDNA
480 490 500 510 520 530
660 670 680 690 700 710
pF1KE3 NRVLGPIYFTTFVFFMFFILLNMFLAIINDTYSEVKSDLAQQKAEMELSDLIRKGYHKAL
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CCDS74 NRILGPAYFVTYVFFVFFVLLNMFLAIINDTYSEVKEELAGQKDELQLSDLLKQGYNKTL
540 550 560 570 580 590
720 730 740 750 760
pF1KE3 VKLKLKKNTVDDISESLRQGGGKLNFDELRQDLKGKGHTDAEIE---AIFTKYDQDGDQE
..:.:.:. :.:... :. : ...:... . :. ::.. :: : :::.:.::..
CCDS74 LRLRLRKERVSDVQKVLQGGEQEIQFEDFTNTLRELGHAEHEITELTATFTKFDRDGNRI
600 610 620 630 640 650
770 780 790 800 810 820
pF1KE3 LTEHEHQQMRDDLEKEREDLDLDHSSLPRPMSSRSFPRSLDDSEEDDDEDSGHSSRRRGS
: :.:...::.:::.:: :. . .: : . : :.. :: . : :.
CCDS74 LDEKEQEKMRQDLEEERVALNTEIEKLGRSIVSS--PQG----------KSGPEAARAGG
660 670 680 690 700
830 840 850 860 870 880
pF1KE3 ISSGVSYEEFQVLVRRVDRMEHSIGSIVSKIDAVIVKLEIMERAKLKRREVLGRLLDGVA
:: ::: .:.::: ..: . ..::.:::: ::...::
CCDS74 WVSG---EEFYMLTRRVLQLETVLEGVVSQIDAVGSKLKMLERKGWLAPSPGVKEQAIWK
710 720 730 740 750
890 900 910 920 930 940
pF1KE3 EDERLGRDSEIHREQMERLVREELERWESDDAASQISHGLGTPVGLNGQPRPRSSRPSSS
CCDS74 HPQPAPAVTPDPWGVQGGQESEVPYKREEEALEERRLSRGEIPTLQRS
760 770 780 790 800
>>CCDS78062.1 PKD2L2 gene_id:27039|Hs108|chr5 (624 aa)
initn: 1679 init1: 805 opt: 1927 Z-score: 1570.2 bits: 301.3 E(32554): 3.9e-81
Smith-Waterman score: 1941; 47.7% identity (78.1% similar) in 606 aa overlap (213-802:21-623)
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 QPPRVAWAERLVRGLRGLWGTRLMEESSTNREKYLKSVLRELVTYLLFLIVLCILTYGMM
.: . ..:.::. :..::: :::::.::.
CCDS78 MAEASRWHRGGASKHKLHYRKEVEITTTLQELLLYFIFLINLCILTFGMV
10 20 30 40 50
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 SSNVYYYTRMMSQLFLDTPVSKTEKTNFKTLSSMEDFWKFTEGSLLDGLYWKMQPSNQTE
. ..:: ...::.::::: : :.::::.. :. ::::: :: ::.:::: .::
CCDS78 NPHMYYLNKVMSSLFLDTSVPGEERTNFKSIRSITDFWKFMEGPLLEGLYWDSWYNNQQL
60 70 80 90 100 110
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 AD--NRSFIFYENLLLGVPRIRQLRVRNGSCSIPQDLRDEIKECYDVYSVSSEDRAPFGP
. : : :.:::.::::::.:::.:::..:.. ..... ..::: :. ..:: . ::
CCDS78 YNLKNSSRIYYENILLGVPRVRQLKVRNNTCKVYSSFQSLMSECYGKYTSANEDLSNFGL
120 130 140 150 160 170
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 RNGTAWIYTSEKDLNGSSHWGIIATYSGAGYYLDLSRTREETAAQVASLKKNVWLDRGTR
. .: : :.. .. :. :::....: ..:: . ::... :: . .:. : :. ::::
CCDS78 QINTEWRYST-SNTNSPWHWGFLGVYRNGGYIFTLSKSKSETKNKFIDLRLNSWITRGTR
180 190 200 210 220
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 ATFIDFSVYNANINLFCVVRLLVEFPATGGVIPSWQFQPLKLIRYVTTFDFFLAACEIIF
. :::::.::::.::::..::..:::::::.. :::: .::.:::. .:.:.:.::: :
CCDS78 VIFIDFSLYNANVNLFCIIRLVAEFPATGGILTSWQFYSVKLLRYVSYYDYFIASCEITF
230 240 250 260 270 280
490 500 510 520 530
pF1KE3 CFFIFYYVVEEILEIRIHKLHYFRSFWNCLDVVIVVLSVVAIGINIYRTSNVEVLL-QFL
:.:.: ....:. .:. : ::.:.:: :......: ::...: : . .. .:: :.:
CCDS78 CIFLFVFTTQEVKKIKEFKSAYFKSIWNWLELLLLLLCFVAVSFNTYYNVQIFLLLGQLL
290 300 310 320 330 340
540 550 560 570 580 590
pF1KE3 EDQNTFPNFEHLAYWQIQFNNIAAVTVFFVWIKLFKFINFNRTMSQLSTTMSRCAKDLFG
.. . . .: :: :.: .::: :.:.::.:::.::::.::.::::::.:.:::.::. :
CCDS78 KSTEKYSDFYFLACWHIYYNNIIAITIFFAWIKIFKFISFNKTMSQLSSTLSRCVKDIVG
350 360 370 380 390 400
600 610 620 630 640 650
pF1KE3 FAIMFFIIFLAYAQLAYLVFGTQVDDFSTFQECIFTQFRIILGDINFAEIEEANRVLGPI
:::::::::.:::::..::::.:::::::::. ::.::::.:::.::: :..:: .::::
CCDS78 FAIMFFIIFFAYAQLGFLVFGSQVDDFSTFQNSIFAQFRIVLGDFNFAGIQQANPILGPI
410 420 430 440 450 460
660 670 680 690 700 710
pF1KE3 YFTTFVFFMFFILLNMFLAIINDTYSEVKSDLA-QQKAEMELSDLIRKGYHKALVKLKLK
:: ::.::.::.:::::::::::::::::.: . .. ..::. .:...:...: :..::
CCDS78 YFITFIFFVFFVLLNMFLAIINDTYSEVKADYSIGRRLDFELGKMIKQSYKNVLEKFRLK
470 480 490 500 510 520
720 730 740 750 760
pF1KE3 KNTVDDISESLRQGGGKL-------NFDELR-QDLKGKGHTDAEIEAIFTKYD-QDGDQE
: :. ... .:.: : .::: . :. . . ..: . ... :: :
CCDS78 KAQKDEDKKT--KGSGDLAEQARREGFDENEIQNAEQMKKWKERLEKKYYSMEIQDDYQP
530 540 550 560 570 580
770 780 790 800 810 820
pF1KE3 LTEHEHQQM---RDDLEKEREDLDLDHSSLPRPMSSRSFPRSLDDSEEDDDEDSGHSSRR
.:..: ... .:::: . ..: ... : .:.
CCDS78 VTQEEFRELFLYAVELEKELHYINLKLNQVVRKVSAL
590 600 610 620
830 840 850 860 870 880
pF1KE3 RGSISSGVSYEEFQVLVRRVDRMEHSIGSIVSKIDAVIVKLEIMERAKLKRREVLGRLLD
>>CCDS43367.1 PKD2L2 gene_id:27039|Hs108|chr5 (613 aa)
initn: 1679 init1: 805 opt: 1922 Z-score: 1566.2 bits: 300.6 E(32554): 6.4e-81
Smith-Waterman score: 1922; 49.2% identity (78.8% similar) in 575 aa overlap (213-774:21-592)
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 QPPRVAWAERLVRGLRGLWGTRLMEESSTNREKYLKSVLRELVTYLLFLIVLCILTYGMM
.: . ..:.::. :..::: :::::.::.
CCDS43 MAEASRWHRGGASKHKLHYRKEVEITTTLQELLLYFIFLINLCILTFGMV
10 20 30 40 50
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 SSNVYYYTRMMSQLFLDTPVSKTEKTNFKTLSSMEDFWKFTEGSLLDGLYWKMQPSNQTE
. ..:: ...::.::::: : :.::::.. :. ::::: :: ::.:::: .::
CCDS43 NPHMYYLNKVMSSLFLDTSVPGEERTNFKSIRSITDFWKFMEGPLLEGLYWDSWYNNQQL
60 70 80 90 100 110
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 AD--NRSFIFYENLLLGVPRIRQLRVRNGSCSIPQDLRDEIKECYDVYSVSSEDRAPFGP
. : : :.:::.::::::.:::.:::..:.. ..... ..::: :. ..:: . ::
CCDS43 YNLKNSSRIYYENILLGVPRVRQLKVRNNTCKVYSSFQSLMSECYGKYTSANEDLSNFGL
120 130 140 150 160 170
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 RNGTAWIYTSEKDLNGSSHWGIIATYSGAGYYLDLSRTREETAAQVASLKKNVWLDRGTR
. .: : : : .. :. :::....: ..:: . ::... :: . .:. : :. ::::
CCDS43 QINTEWRY-STSNTNSPWHWGFLGVYRNGGYIFTLSKSKSETKNKFIDLRLNSWITRGTR
180 190 200 210 220
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 ATFIDFSVYNANINLFCVVRLLVEFPATGGVIPSWQFQPLKLIRYVTTFDFFLAACEIIF
. :::::.::::.::::..::..:::::::.. :::: .::.:::. .:.:.:.::: :
CCDS43 VIFIDFSLYNANVNLFCIIRLVAEFPATGGILTSWQFYSVKLLRYVSYYDYFIASCEITF
230 240 250 260 270 280
490 500 510 520 530
pF1KE3 CFFIFYYVVEEILEIRIHKLHYFRSFWNCLDVVIVVLSVVAIGINIYRTSNVEVLL-QFL
:.:.: ....:. .:. : ::.:.:: :......: ::...: : . .. .:: :.:
CCDS43 CIFLFVFTTQEVKKIKEFKSAYFKSIWNWLELLLLLLCFVAVSFNTYYNVQIFLLLGQLL
290 300 310 320 330 340
540 550 560 570 580 590
pF1KE3 EDQNTFPNFEHLAYWQIQFNNIAAVTVFFVWIKLFKFINFNRTMSQLSTTMSRCAKDLFG
.. . . .: :: :.: .::: :.:.::.:::.::::.::.::::::.:.:::.::. :
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pF1KE3 FAIMFFIIFLAYAQLAYLVFGTQVDDFSTFQECIFTQFRIILGDINFAEIEEANRVLGPI
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CCDS43 YFITFIFFVFFVLLNMFLAIINDTYSEVKADYSIGRRLDFELGKMIKQSYKNVLEKFRLK
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CCDS58 VIFIDFSLYNANVNLFCIIRLVAEFPATGGILTSWQFYSVKLLRYVSYYDYFIASCEITF
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CCDS58 KSTEKYSDFYFLACWHIYYNNIIAITIFFAWIKNMFLAIINDTYSEVKADYSIGRRLDFE
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pF1KE3 FAIMFFIIFLAYAQLAYLVFGTQVDDFSTFQECIFTQFRIILGDINFAEIEEANRVLGPI
CCDS58 LGKMIKQSYKNVLEKFRLKKAQKDEDKKTKGSGDLAEQARREGFDENEIQNAEQMKKWKE
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CCDS58 NPHMYYLNKVMSSLFLDTSVPGEERTNFKSIRSITDFWKFMEGPLLEGLYWDSWYNNQQL
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CCDS58 QINTEWRYST-SNTNSPWHWGFLGVYRNGGYIFTLSKSKSETKNKFIDLRLNSWITRGTR
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pF1KE3 ATFIDFSVYNANINLFCVVRLLVEFPATGGVIPSWQFQPLKLIRYVTTFDFFLAACEIIF
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CCDS58 VIFIDFSLYNANVNLFCIIRLVAEFPATGGILTSWQFYSVKLLRYVSYYDYFIASCEITF
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:.:.: ....:. .:. : ::.:.:: :......: :.
CCDS58 CIFLFVFTTQEVKKIKEFKSAYFKSIWNWLELLLLLL---------------------LK
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CCDS58 STEKYSDFYFLACWHIYYNNIIAITIFFAWIKIFKFISFNKTMSQLSSTLSRCVKDIVGF
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CCDS58 AQKDEDKKT--KGSGDLAEQARREGFDENEIQNAEQMKKWKERLEKKYYSMEIQDDYQPV
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CCDS58 TQEEFRELFLYAVELEKELHYINLKLNQVVRKVSAL
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CCDS14 PLTEDEIRIFKRKKRIKRRALLFLSYILTHFIFLALLLILIVLLRHTDCFYYNQFIRDRF
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CCDS14 ---------SMDLATVTKLEDIYRWLNSVLLPLLHNDLNPTFLPESSSK--------ILG
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CCDS14 LPLMRQVRAKSSEKMCLPAEKFVQNSIRREIH-CHPKYGIDPEDTKNYSGFWNEVDKQAI
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CCDS14 DESTNGFTYKPQGTQWLYYSYGLLHTYGSGGYALYFFPEQQRFNSTLRLKELQESNWLDE
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CCDS14 AILIFFL-AYVVDEGCIIMQERASYVRSVYNLLNFALKCIFTVLIVLFLRKHFLATGIIR
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CCDS14 NRILGVLFLSSFMLVMICVLINLFQAVILSAYEEMKQPVYEEPSDEVEAMTYLCRKLRTM
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]