Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3506
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3506, 2620 aa
1>>>pF1KE3506 2620 - 2620 aa - 2620 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6057+/-0.00139; mu= 12.5870+/- 0.085
mean_var=250.5650+/-50.978, 0's: 0 Z-trim(107.8): 81 B-trim: 10 in 1/51
Lambda= 0.081024
statistics sampled from 9764 (9829) to 9764 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.609), E-opt: 0.2 (0.302), width: 16
Scan time: 5.320
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44154.2 USP24 gene_id:23358|Hs108|chr1 (2620) 17232 2030.2 0
CCDS55403.1 USP9X gene_id:8239|Hs108|chrX (2554) 1164 151.9 4e-35
CCDS43930.1 USP9X gene_id:8239|Hs108|chrX (2570) 1164 151.9 4e-35
CCDS14781.1 USP9Y gene_id:8287|Hs108|chrY (2555) 1096 144.0 9.9e-33
CCDS42686.1 USP34 gene_id:9736|Hs108|chr2 (3546) 652 92.2 5.2e-17
>>CCDS44154.2 USP24 gene_id:23358|Hs108|chr1 (2620 aa)
initn: 17232 init1: 17232 opt: 17232 Z-score: 10894.8 bits: 2030.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 17232; 99.9% identity (100.0% similar) in 2620 aa overlap (1-2620:1-2620)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MESEEEQHMTTLLCMGFSDPATIRKALRLAKNDINEAVALLTNERPGLDYGGYEPMDSGG
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CCDS44 MESEEEQHMTTLLCMGFSDPATIRKALRLAKNDINEAVALLTNERPGLDYGGYEPMDSGG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 GPSPGPGGGPRGDGGGDGGGGGPSRGGSTGGGGGFDPPPAYHEVVDAEKNDENGNCSGEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GPSPGPGGGPRGDGGGDGGGGGPSRGGSTGGGGGFDPPPAYHEVVDAEKNDENGNCSGEG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 IEFPTTNLYELESRVLTDHWSIPYKREESLGKCLLASTYLARLGLSESDENCRRFMDRCM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 IEFPTTNLYELESRVLTDHWSIPYKREESLGKCLLASTYLARLGLSESDENCRRFMDRCM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 PEAFKKLLTSSAVHKWGTEIHEGIYNMLMLLIELVAERIKQDPIPIGLLGVLTMAFNPDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS44 PEAFKKLLTSSAVHKWGTEIHEGIYNMLMLLIELVAERIKQDPIPTGLLGVLTMAFNPDN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 EYHFKNRMKVSQRNWAEVFGEGNMFAVSPVSTFQKEPHGWVVDLVNKFGELGGFAAIQAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EYHFKNRMKVSQRNWAEVFGEGNMFAVSPVSTFQKEPHGWVVDLVNKFGELGGFAAIQAK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LHSEDIELGAVSALIQPLGVCAEYLNSSVVQPMLDPVILTTIQDVRSVEEKDLKDKRLVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LHSEDIELGAVSALIQPLGVCAEYLNSSVVQPMLDPVILTTIQDVRSVEEKDLKDKRLVS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 IPELLSAVKLLCMRFQPDLVTIVDDLRLDILLRMLKSPHFSAKMNSLKEVTKLIEDSTLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 IPELLSAVKLLCMRFQPDLVTIVDDLRLDILLRMLKSPHFSAKMNSLKEVTKLIEDSTLS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 KSVKNAIDTDRLLDWLVENSVLSIALEGNIDQAQYCDRIKGIIELLGSKLSLDELTKIWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KSVKNAIDTDRLLDWLVENSVLSIALEGNIDQAQYCDRIKGIIELLGSKLSLDELTKIWK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 IQSGQSSTVIENIHTIIAAAAVKFNSDQLNHLFVLIQKSWETESDRVRQKLLSLIGRIGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 IQSGQSSTVIENIHTIIAAAAVKFNSDQLNHLFVLIQKSWETESDRVRQKLLSLIGRIGR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 EARFETTSGKVLDVLWELAHLPTLPSSLIQQALEEHLTILSDAYAVKEAIKRSYIIKCIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EARFETTSGKVLDVLWELAHLPTLPSSLIQQALEEHLTILSDAYAVKEAIKRSYIIKCIE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 DIKRPGEWSGLEKNKKDGFKSSQLNNPQFVWVVPALRQLHEITRSFIKQTYQKQDKSIIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DIKRPGEWSGLEKNKKDGFKSSQLNNPQFVWVVPALRQLHEITRSFIKQTYQKQDKSIIQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 DLKKNFEIVKLVTGSLIACHRLAAAVAGPGGLSGSTLVDGRYTYREYLEAHLKFLAFFLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DLKKNFEIVKLVTGSLIACHRLAAAVAGPGGLSGSTLVDGRYTYREYLEAHLKFLAFFLQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 EATLYLGWNRAKEIWECLVTGQDVCELDREMCFEWFTKGQHDLESDVQQQLFKEKILKLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EATLYLGWNRAKEIWECLVTGQDVCELDREMCFEWFTKGQHDLESDVQQQLFKEKILKLE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 SYEITMNGFNLFKTFFENVNLCDHRLKRQGAQLYVEKLELIGMDFIWKIAMESPDEEIAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SYEITMNGFNLFKTFFENVNLCDHRLKRQGAQLYVEKLELIGMDFIWKIAMESPDEEIAN
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 EAIQLIINYSYINLNPRLKKDSVSLHKKFIADCYTRLEAASSALGGPTLTHAVTRATKML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EAIQLIINYSYINLNPRLKKDSVSLHKKFIADCYTRLEAASSALGGPTLTHAVTRATKML
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 TATAMPTVATSVQSPYRSTKLVIIERLLLLAERYVITIEDFYSVPRTILPHGASFHGHLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TATAMPTVATSVQSPYRSTKLVIIERLLLLAERYVITIEDFYSVPRTILPHGASFHGHLL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 TLNVTYESTKDTFTVEAHSNETIGSVRWKIAKQLCSPVDNIQIFTNDSLLTVNKDQKLLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TLNVTYESTKDTFTVEAHSNETIGSVRWKIAKQLCSPVDNIQIFTNDSLLTVNKDQKLLH
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 QLGFSDEQILTVKTSGSGTPSGSSADSSTSSSSSSSGVFSSSYAMEQEKSLPGVVMALVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QLGFSDEQILTVKTSGSGTPSGSSADSSTSSSSSSSGVFSSSYAMEQEKSLPGVVMALVC
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE3 NVFDMLYQLANLEEPRITLRVRKLLLLIPTDPAIQEALDQLDSLGRKKTLLSESSSQSSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NVFDMLYQLANLEEPRITLRVRKLLLLIPTDPAIQEALDQLDSLGRKKTLLSESSSQSSK
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE3 SPSLSSKQQHQPSASSILESLFRSFAPGMSTFRVLYNLEVLSSKLMPTADDDMARSCAKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SPSLSSKQQHQPSASSILESLFRSFAPGMSTFRVLYNLEVLSSKLMPTADDDMARSCAKS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE3 FCENFLKAGGLSLVVNVMQRDSIPSEVDYETRQGVYSICLQLARFLLVGQTMPTLLDEDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FCENFLKAGGLSLVVNVMQRDSIPSEVDYETRQGVYSICLQLARFLLVGQTMPTLLDEDL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE3 TKDGIEALSSRPFRNVSRQTSRQMSLCGTPEKSSYRQLSVSDRSSIRVEEIIPAARVAIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TKDGIEALSSRPFRNVSRQTSRQMSLCGTPEKSSYRQLSVSDRSSIRVEEIIPAARVAIQ
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE3 TMEVSDFTSTVACFMRLSWAAAAGRLDLVGSSQPIKESNSLCPAGIRNRLSSSGSNCSSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TMEVSDFTSTVACFMRLSWAAAAGRLDLVGSSQPIKESNSLCPAGIRNRLSSSGSNCSSG
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE3 SEGEPVALHAGICVRQQSVSTKDSLIAGEALSLLVTCLQLRSQQLASFYNLPCVADFIID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SEGEPVALHAGICVRQQSVSTKDSLIAGEALSLLVTCLQLRSQQLASFYNLPCVADFIID
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE3 ILLGSPSAEIRRVACDQLYTLSQTDTSAHPDVQKPNQFLLGVILTAQLPLWSPTSIMRGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ILLGSPSAEIRRVACDQLYTLSQTDTSAHPDVQKPNQFLLGVILTAQLPLWSPTSIMRGV
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE3 NQRLLSQCMEYFDLRCQLLDDLTTSEMEQLRISPATMLEDEITWLDNFEPNRTAECETSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NQRLLSQCMEYFDLRCQLLDDLTTSEMEQLRISPATMLEDEITWLDNFEPNRTAECETSE
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE3 ADNILLAGHLRLIKTLLSLCGAEKEMLGSSLIKPLLDDFLFRASRIILNSHSPAGSAAIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ADNILLAGHLRLIKTLLSLCGAEKEMLGSSLIKPLLDDFLFRASRIILNSHSPAGSAAIS
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE3 QQDFHPKCSTANSRLAAYEVLVMLADSSPSNLQIIIKELLSMHHQPDPALTKEFDYLPPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QQDFHPKCSTANSRLAAYEVLVMLADSSPSNLQIIIKELLSMHHQPDPALTKEFDYLPPV
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE3 DSRSSSGFVGLRNGGATCYMNAVFQQLYMQPGLPESLLSVDDDTDNPDDSVFYQVQSLFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DSRSSSGFVGLRNGGATCYMNAVFQQLYMQPGLPESLLSVDDDTDNPDDSVFYQVQSLFG
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE3 HLMESKLQYYVPENFWKIFKMWNKELYVREQQDAYEFFTSLIDQMDEYLKKMGRDQIFKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HLMESKLQYYVPENFWKIFKMWNKELYVREQQDAYEFFTSLIDQMDEYLKKMGRDQIFKN
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KE3 TFQGIYSDQKICKDCPHRYEREEAFMALNLGVTSCQSLEISLDQFVRGEVLEGSNAYYCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TFQGIYSDQKICKDCPHRYEREEAFMALNLGVTSCQSLEISLDQFVRGEVLEGSNAYYCE
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KE3 KCKEKRITVKRTCIKSLPSVLVIHLMRFGFDWESGRSIKYDEQIRFPWMLNMEPYTVSGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KCKEKRITVKRTCIKSLPSVLVIHLMRFGFDWESGRSIKYDEQIRFPWMLNMEPYTVSGM
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KE3 ARQDSSSEVGENGRSVDQGGGGSPRKKVALTENYELVGVIVHSGQAHAGHYYSFIKDRRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ARQDSSSEVGENGRSVDQGGGGSPRKKVALTENYELVGVIVHSGQAHAGHYYSFIKDRRG
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KE3 CGKGKWYKFNDTVIEEFDLNDETLEYECFGGEYRPKVYDQTNPYTDVRRRYWNAYMLFYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 CGKGKWYKFNDTVIEEFDLNDETLEYECFGGEYRPKVYDQTNPYTDVRRRYWNAYMLFYQ
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KE3 RVSDQNSPVLPKKSRVSVVRQEAEDLSLSAPSSPEISPQSSPRPHRPNNDRLSILTKLVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RVSDQNSPVLPKKSRVSVVRQEAEDLSLSAPSSPEISPQSSPRPHRPNNDRLSILTKLVK
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KE3 KGEKKGLFVEKMPARIYQMVRDENLKFMKNRDVYSSDYFSFVLSLASLNATKLKHPYYPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KGEKKGLFVEKMPARIYQMVRDENLKFMKNRDVYSSDYFSFVLSLASLNATKLKHPYYPC
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KE3 MAKVSLQLAIQFLFQTYLRTKKKLRVDTEEWIATIEALLSKSFDACQWLVEYFISSEGRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MAKVSLQLAIQFLFQTYLRTKKKLRVDTEEWIATIEALLSKSFDACQWLVEYFISSEGRE
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KE3 LIKIFLLECNVREVRVAVATILEKTLDSALFYQDKLKSLHQLLEVLLALLDKDVPENCKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LIKIFLLECNVREVRVAVATILEKTLDSALFYQDKLKSLHQLLEVLLALLDKDVPENCKN
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2290 2300 2310 2320 2330 2340
pF1KE3 CAQYFFLFNTFVQKQGIRAGDLLLRHSALRHMISFLLGASRQNNQIRRWSSAQAREFGNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 CAQYFFLFNTFVQKQGIRAGDLLLRHSALRHMISFLLGASRQNNQIRRWSSAQAREFGNL
2290 2300 2310 2320 2330 2340
2350 2360 2370 2380 2390 2400
pF1KE3 HNTVALLVLHSDVSSQRNVAPGIFKQRPPISIAPSSPLLPLHEEVEALLFMSEGKPYLLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HNTVALLVLHSDVSSQRNVAPGIFKQRPPISIAPSSPLLPLHEEVEALLFMSEGKPYLLE
2350 2360 2370 2380 2390 2400
2410 2420 2430 2440 2450 2460
pF1KE3 VMFALRELTGSLLALIEMVVYCCFCNEHFSFTMLHFIKNQLETAPPHELKNTFQLLHEIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VMFALRELTGSLLALIEMVVYCCFCNEHFSFTMLHFIKNQLETAPPHELKNTFQLLHEIL
2410 2420 2430 2440 2450 2460
2470 2480 2490 2500 2510 2520
pF1KE3 VIEDPIQAERVKFVFETENGLLALMHHSNHVDSSRCYQCVKFLVTLAQKCPAAKEYFKEN
:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VIEDPIQVERVKFVFETENGLLALMHHSNHVDSSRCYQCVKFLVTLAQKCPAAKEYFKEN
2470 2480 2490 2500 2510 2520
2530 2540 2550 2560 2570 2580
pF1KE3 SHHWSWAVQWLQKKMSEHYWTPQSNVSNETSTGKTFQRTISAQDTLAYATALLNEKEQSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SHHWSWAVQWLQKKMSEHYWTPQSNVSNETSTGKTFQRTISAQDTLAYATALLNEKEQSG
2530 2540 2550 2560 2570 2580
2590 2600 2610 2620
pF1KE3 SSNGSESSPANENGDRHLQQGSESPMMIGELRSDLDDVDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SSNGSESSPANENGDRHLQQGSESPMMIGELRSDLDDVDP
2590 2600 2610 2620
>>CCDS55403.1 USP9X gene_id:8239|Hs108|chrX (2554 aa)
initn: 1699 init1: 755 opt: 1164 Z-score: 744.1 bits: 151.9 E(32554): 4e-35
Smith-Waterman score: 3545; 30.6% identity (59.1% similar) in 2705 aa overlap (68-2593:7-2495)
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 VALLTNERPGLDYGGYEPMDSGGGPSPGPGGGPRGDGGGDGGGGGPSRGGSTGG--GGGF
:.: ::.:. : .:. : : .
CCDS55 MTATTRGSPV--GGNDNQGQAPD-GQSQPPLQQNQT
10 20 30
100 110 120 130 140
pF1KE3 DPPPAYHEVVDAEKNDENGNCSG------EGIEFPTTNLYELESRVLTDHWSIPYKREES
. : . .: : ::.:. .. : :: :.: .:.. . .: .: .
CCDS55 SSPDSSNENSPATPPDEQGQGDAPPQLEDEEPAFPHTDLAKLDDMINRPRWVVPVLPKGE
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 LGKCLLASTYLARLGLSESDENCRRFMDRCMPEAFKKLLTSSAVHKWGTEIHEGIYNMLM
: : :. :.. ::. ..: :.::. . .: :.::. :: : :::. : :
CCDS55 LEVLLEAAIDLSKKGLDVKSEACQRFFRDGLTISFTKILTDEAVSGWKFEIHRCIINNTH
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 LLIELVAERIKQDPIPIGLLGVLTMAFNPDNEYHFKNRMKVSQRNWAEV-FGEGNMFAVS
:.:: . ...:: .: :: .:.::.:: ..:. : . . . : . : ..:: :
CCDS55 RLVELCVAKLSQDWFP--LLELLAMALNPHCKFHIYNGTRPCESVSSSVQLPEDELFARS
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 PVSTFQKEPHGWVVDLVNKFGELGGFAAIQAK-LHSEDIELGAVSALIQPLGVCAEYLNS
: . :.::.:::.:::: :.:: .. . ... ... ..:::.:.: : :.:.
CCDS55 PD---PRSPKGWLVDLLNKFGTLNGFQILHDRFINGSALNVQIIAALIKPFGQCYEFLTL
220 230 240 250 260
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 SVVQPMLDPVILTTIQDVRSVEEKDLK-----DKRLVSIPELLSAVKLLCMRF--QPDLV
.:. .. :.: . : .... ...:: . . .. .....: : : : . :
CCDS55 HTVKKYFLPIIEMVPQFLENLTDEELKKEAKNEAKNDALSMIIKSLKNLASRVPGQEETV
270 280 290 300 310 320
390 400 410 420 430
pF1KE3 TIVDDLRLDILLRMLKSPHFSAKMNSLKEVTKLIED-STLSKSVKNA-----IDTDRLLD
.. .:: ..::.:. :..:::.:.::.:.: . : .. : . ..:. .
CCDS55 KNLEIFRLKMILRLLQISSFNGKMNALNEVNKVISSVSYYTHRHGNPEEEEWLTAERMAE
330 340 350 360 370 380
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pF1KE3 WLVENSVLSIALEGNIDQAQYCDRIKGIIELLGSK--LSLDELTKIWKIQSGQSSTVIEN
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