Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3477
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3477, 1604 aa
1>>>pF1KE3477 1604 - 1604 aa - 1604 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4695+/-0.00116; mu= 13.5378+/- 0.069
mean_var=131.9365+/-26.121, 0's: 0 Z-trim(106.2): 112 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.111659
statistics sampled from 8713 (8830) to 8713 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.622), E-opt: 0.2 (0.271), width: 16
Scan time: 5.010
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32697.1 USP32 gene_id:84669|Hs108|chr17 (1604) 10957 1778.0 0
CCDS11069.2 USP6 gene_id:9098|Hs108|chr17 (1406) 5835 952.9 0
CCDS8963.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12 ( 952) 1124 193.9 2.1e-48
CCDS58251.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12 ( 981) 1111 191.8 9.4e-48
CCDS2794.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3 ( 916) 960 167.5 1.9e-40
CCDS14277.1 USP11 gene_id:8237|Hs108|chrX ( 963) 938 163.9 2.3e-39
CCDS2793.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3 ( 963) 872 153.3 3.6e-36
CCDS43090.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3 (1318) 686 123.4 4.9e-27
CCDS56256.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3 (1372) 686 123.4 5e-27
CCDS56255.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3 (1384) 686 123.4 5.1e-27
CCDS56254.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3 (1419) 686 123.4 5.2e-27
CCDS61632.1 USP8 gene_id:9101|Hs108|chr15 (1012) 575 105.5 9.4e-22
CCDS10137.1 USP8 gene_id:9101|Hs108|chr15 (1118) 575 105.5 1e-21
CCDS58189.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 ( 362) 525 97.2 1.1e-19
CCDS8423.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 ( 396) 520 96.4 2e-19
CCDS8422.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 ( 605) 521 96.6 2.6e-19
>>CCDS32697.1 USP32 gene_id:84669|Hs108|chr17 (1604 aa)
initn: 10957 init1: 10957 opt: 10957 Z-score: 9539.5 bits: 1778.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10957; 100.0% identity (100.0% similar) in 1604 aa overlap (1-1604:1-1604)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGAKESRIGFLSYEEALRRVTDVELKRLKDAFKRTCGLSYYMGQHCFIREVLGDGVPPKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MGAKESRIGFLSYEEALRRVTDVELKRLKDAFKRTCGLSYYMGQHCFIREVLGDGVPPKV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 AEVIYCSFGGTSKGLHFNNLIVGLVLLTRGKDEEKAKYIFSLFSSESGNYVIREEMERML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AEVIYCSFGGTSKGLHFNNLIVGLVLLTRGKDEEKAKYIFSLFSSESGNYVIREEMERML
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 HVVDGKVPDTLRKCFSEGEKVNYEKFRNWLFLNKDAFTFSRWLLSGGVYVTLTDDSDTPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HVVDGKVPDTLRKCFSEGEKVNYEKFRNWLFLNKDAFTFSRWLLSGGVYVTLTDDSDTPT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 FYQTLAGVTHLEESDIIDLEKRYWLLKAQSRTGRFDLETFGPLVSPPIRPSLSEGLFNAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FYQTLAGVTHLEESDIIDLEKRYWLLKAQSRTGRFDLETFGPLVSPPIRPSLSEGLFNAF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 DENRDNHIDFKEISCGLSACCRGPLAERQKFCFKVFDVDRDGVLSRVELRDMVVALLEVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DENRDNHIDFKEISCGLSACCRGPLAERQKFCFKVFDVDRDGVLSRVELRDMVVALLEVW
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 KDNRTDDIPELHMDLSDIVEGILNAHDTTKMGHLTLEDYQIWSVKNVLANEFLNLLFQVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KDNRTDDIPELHMDLSDIVEGILNAHDTTKMGHLTLEDYQIWSVKNVLANEFLNLLFQVC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 HIVLGLRPATPEEEGQIIRGWLERESRYGLQAGHNWFIISMQWWQQWKEYVKYDANPVVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HIVLGLRPATPEEEGQIIRGWLERESRYGLQAGHNWFIISMQWWQQWKEYVKYDANPVVI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 EPSSVLNGGKYSFGTAAHPMEQVEDRIGSSLSYVNTTEEKFSDNISTASEASETAGSGFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EPSSVLNGGKYSFGTAAHPMEQVEDRIGSSLSYVNTTEEKFSDNISTASEASETAGSGFL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 YSATPGADVCFARQHNTSDNNNQCLLGANGNILLHLNPQKPGAIDNQPLVTQEPVKATSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YSATPGADVCFARQHNTSDNNNQCLLGANGNILLHLNPQKPGAIDNQPLVTQEPVKATSL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 TLEGGRLKRTPQLIHGRDYEMVPEPVWRALYHWYGANLALPRPVIKNSKTDIPELELFPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TLEGGRLKRTPQLIHGRDYEMVPEPVWRALYHWYGANLALPRPVIKNSKTDIPELELFPR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 YLLFLRQQPATRTQQSNIWVNMGNVPSPNAPLKRVLAYTGCFSRMQTIKEIHEYLSQRLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YLLFLRQQPATRTQQSNIWVNMGNVPSPNAPLKRVLAYTGCFSRMQTIKEIHEYLSQRLR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 IKEEDMRLWLYNSENYLTLLDDEDHKLEYLKIQDEQHLVIEVRNKDMSWPEEMSFIANSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IKEEDMRLWLYNSENYLTLLDDEDHKLEYLKIQDEQHLVIEVRNKDMSWPEEMSFIANSS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 KIDRHKVPTEKGATGLSNLGNTCFMNSSIQCVSNTQPLTQYFISGRHLYELNRTNPIGMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KIDRHKVPTEKGATGLSNLGNTCFMNSSIQCVSNTQPLTQYFISGRHLYELNRTNPIGMK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 GHMAKCYGDLVQELWSGTQKNVAPLKLRWTIAKYAPRFNGFQQQDSQELLAFLLDGLHED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GHMAKCYGDLVQELWSGTQKNVAPLKLRWTIAKYAPRFNGFQQQDSQELLAFLLDGLHED
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 LNRVHEKPYVELKDSDGRPDWEVAAEAWDNHLRRNRSIVVDLFHGQLRSQVKCKTCGHIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LNRVHEKPYVELKDSDGRPDWEVAAEAWDNHLRRNRSIVVDLFHGQLRSQVKCKTCGHIS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 VRFDPFNFLSLPLPMDSYMHLEITVIKLDGTTPVRYGLRLNMDEKYTGLKKQLSDLCGLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VRFDPFNFLSLPLPMDSYMHLEITVIKLDGTTPVRYGLRLNMDEKYTGLKKQLSDLCGLN
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 SEQILLAEVHGSNIKNFPQDNQKVRLSVSGFLCAFEIPVPVSPISASSPTQTDFSSSPST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SEQILLAEVHGSNIKNFPQDNQKVRLSVSGFLCAFEIPVPVSPISASSPTQTDFSSSPST
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 NEMFTLTTNGDLPRPIFIPNGMPNTVVPCGTEKNFTNGMVNGHMPSLPDSPFTGYIIAVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NEMFTLTTNGDLPRPIFIPNGMPNTVVPCGTEKNFTNGMVNGHMPSLPDSPFTGYIIAVH
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE3 RKMMRTELYFLSSQKNRPSLFGMPLIVPCTVHTRKKDLYDAVWIQVSRLASPLPPQEASN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RKMMRTELYFLSSQKNRPSLFGMPLIVPCTVHTRKKDLYDAVWIQVSRLASPLPPQEASN
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE3 HAQDCDDSMGYQYPFTLRVVQKDGNSCAWCPWYRFCRGCKIDCGEDRAFIGNAYIAVDWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HAQDCDDSMGYQYPFTLRVVQKDGNSCAWCPWYRFCRGCKIDCGEDRAFIGNAYIAVDWD
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE3 PTALHLRYQTSQERVVDEHESVEQSRRAQAEPINLDSCLRAFTSEEELGENEMYYCSKCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PTALHLRYQTSQERVVDEHESVEQSRRAQAEPINLDSCLRAFTSEEELGENEMYYCSKCK
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE3 THCLATKKLDLWRLPPILIIHLKRFQFVNGRWIKSQKIVKFPRESFDPSAFLVPRDPALC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 THCLATKKLDLWRLPPILIIHLKRFQFVNGRWIKSQKIVKFPRESFDPSAFLVPRDPALC
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE3 QHKPLTPQGDELSEPRILAREVKKVDAQSSAGEEDVLLSKSPSSLSANIISSPKGSPSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QHKPLTPQGDELSEPRILAREVKKVDAQSSAGEEDVLLSKSPSSLSANIISSPKGSPSSS
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE3 RKSGTSCPSSKNSSPNSSPRTLGRSKGRLRLPQIGSKNKLSSSKENLDASKENGAGQICE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RKSGTSCPSSKNSSPNSSPRTLGRSKGRLRLPQIGSKNKLSSSKENLDASKENGAGQICE
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE3 LADALSRGHVLGGSQPELVTPQDHEVALANGFLYEHEACGNGYSNGQLGNHSEEDSTDDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LADALSRGHVLGGSQPELVTPQDHEVALANGFLYEHEACGNGYSNGQLGNHSEEDSTDDQ
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE3 REDTRIKPIYNLYAISCHSGILGGGHYVTYAKNPNCKWYCYNDSSCKELHPDEIDTDSAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 REDTRIKPIYNLYAISCHSGILGGGHYVTYAKNPNCKWYCYNDSSCKELHPDEIDTDSAY
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600
pF1KE3 ILFYEQQGIDYAQFLPKTDGKKMADTSSMDEDFESDYKKYCVLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ILFYEQQGIDYAQFLPKTDGKKMADTSSMDEDFESDYKKYCVLQ
1570 1580 1590 1600
>>CCDS11069.2 USP6 gene_id:9098|Hs108|chr17 (1406 aa)
initn: 5129 init1: 5069 opt: 5835 Z-score: 5081.2 bits: 952.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5835; 93.9% identity (96.8% similar) in 908 aa overlap (701-1604:499-1406)
680 690 700 710 720 730
pF1KE3 YNSENYLTLLDDEDHKLEYLKIQDEQHLVIEVRNKDMSWPEEMSFIANSSKIDRHKVPTE
::.:::::::::::: ::::::::.:::::
CCDS11 PHYDFEWSCWVRAISQEDQLATCWQAEHCGEVHNKDMSWPEEMSFTANSSKIDRQKVPTE
470 480 490 500 510 520
740 750 760 770 780 790
pF1KE3 KGATGLSNLGNTCFMNSSIQCVSNTQPLTQYFISGRHLYELNRTNPIGMKGHMAKCYGDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KGATGLSNLGNTCFMNSSIQCVSNTQPLTQYFISGRHLYELNRTNPIGMKGHMAKCYGDL
530 540 550 560 570 580
800 810 820 830 840 850
pF1KE3 VQELWSGTQKNVAPLKLRWTIAKYAPRFNGFQQQDSQELLAFLLDGLHEDLNRVHEKPYV
::::::::::.::::::: :::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VQELWSGTQKSVAPLKLRRTIAKYAPKFDGFQQQDSQELLAFLLDGLHEDLNRVHEKPYV
590 600 610 620 630 640
860 870 880 890 900 910
pF1KE3 ELKDSDGRPDWEVAAEAWDNHLRRNRSIVVDLFHGQLRSQVKCKTCGHISVRFDPFNFLS
::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ELKDSDGRPDWEVAAEAWDNHLRRNRSIIVDLFHGQLRSQVKCKTCGHISVRFDPFNFLS
650 660 670 680 690 700
920 930 940 950 960 970
pF1KE3 LPLPMDSYMHLEITVIKLDGTTPVRYGLRLNMDEKYTGLKKQLSDLCGLNSEQILLAEVH
::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::
CCDS11 LPLPMDSYMDLEITVIKLDGTTPVRYGLRLNMDEKYTGLKKQLRDLCGLNSEQILLAEVH
710 720 730 740 750 760
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KE3 GSNIKNFPQDNQKVRLSVSGFLCAFEIPVPVSPISASSPTQTDFSSSPSTNEMFTLTTNG
:::::::::::::.::::::::::::::: :::::::::: ::::::::: ::::::::
CCDS11 DSNIKNFPQDNQKVQLSVSGFLCAFEIPVPSSPISASSPTQIDFSSSPSTNGMFTLTTNG
770 780 790 800 810 820
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KE3 DLPRPIFIPNGMPNTVVPCGTEKNFTNGMVNGHMPSLPDSPFTGYIIAVHRKMMRTELYF
:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DLPKPIFIPNGMPNTVVPCGTEKNFTNGMVNGHMPSLPDSPFTGYIIAVHRKMMRTELYF
830 840 850 860 870 880
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KE3 LSSQKNRPSLFGMPLIVPCTVHTRKKDLYDAVWIQVSRLASPLPPQEASNHAQDCDDSMG
:: :.:::::::::::::::::::::::::::::::: :: :::::::: :::: :. ::
CCDS11 LSPQENRPSLFGMPLIVPCTVHTRKKDLYDAVWIQVSWLARPLPPQEASIHAQDRDNCMG
890 900 910 920 930 940
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KE3 YQYPFTLRVVQKDGNSCAWCPWYRFCRGCKIDCGEDRAFIGNAYIAVDWDPTALHLRYQT
::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS11 YQYPFTLRVVQKDGNSCAWCPQYRFCRGCKIDCGEDRAFIGNAYIAVDWHPTALHLRYQT
950 960 970 980 990 1000
1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KE3 SQERVVDEHESVEQSRRAQAEPINLDSCLRAFTSEEELGENEMYYCSKCKTHCLATKKLD
:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS11 SQERVVDKHESVEQSRRAQAEPINLDSCLRAFTSEEELGESEMYYCSKCKTHCLATKKLD
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1280 1290 1300 1310 1320 1330
pF1KE3 LWRLPPILIIHLKRFQFVNGRWIKSQKIVKFPRESFDPSAFLVPRDPALCQHKPLTPQGD
::::::.:::::::::::: .::::::::.: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LWRLPPFLIIHLKRFQFVNDQWIKSQKIVRFLRESFDPSAFLVPRDPALCQHKPLTPQGD
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1340 1350 1360 1370 1380 1390
pF1KE3 ELSEPRILAREVKKVDAQSSAGEEDVLLSKSPSSLSANIISSPKGSPSSSRKSGTSCPSS
:::.::::::::::::::::::.::.::::::::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS11 ELSKPRILAREVKKVDAQSSAGKEDMLLSKSPSSLSANISSSPKGSPSSSRKSGTSCPSS
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1400 1410 1420 1430 1440 1450
pF1KE3 KNSSPNSSPRTLGRSKGRLRLPQIGSKNKLSSSKENLDASKENGAGQICELADALSRGHV
::::::::::::::::::::::::::::: ::::.::::::::::::::::::::::::.
CCDS11 KNSSPNSSPRTLGRSKGRLRLPQIGSKNKPSSSKKNLDASKENGAGQICELADALSRGHM
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE3 LGGSQPELVTPQDHEVALANGFLYEHEACGNG----YSNGQLGNHSEEDSTDDQREDTRI
::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::.:
CCDS11 RGGSQPELVTPQDHEVALANGFLYEHEACGNGCGDGYSNGQLGNHSEEDSTDDQREDTHI
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE3 KPIYNLYAISCHSGILGGGHYVTYAKNPNCKWYCYNDSSCKELHPDEIDTDSAYILFYEQ
::::::::::::::::.::::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS11 KPIYNLYAISCHSGILSGGHYITYAKNPNCKWYCYNDSSCEELHPDEIDTDSAYILFYEQ
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1570 1580 1590 1600
pF1KE3 QGIDYAQFLPKTDGKKMADTSSMDEDFESDYKKYCVLQ
::::::::::: :::::::::: ::: ::::.:: .::
CCDS11 QGIDYAQFLPKIDGKKMADTSSTDEDSESDYEKYSMLQ
1370 1380 1390 1400
>>CCDS8963.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12 (952 aa)
initn: 1435 init1: 863 opt: 1124 Z-score: 982.3 bits: 193.9 E(32554): 2.1e-48
Smith-Waterman score: 1220; 30.5% identity (57.6% similar) in 824 aa overlap (534-1322:64-846)
510 520 530 540 550 560
pF1KE3 CLLGANGNILLHLNPQKPGAIDNQPLVTQEPVKATSLTLEGGRLKRTPQLIHGRDYEMVP
:. ..: .: . .:: :: ..:
CCDS89 DSRWFKQWKKYVGFDSWDKYQMGDQNVYPGPIDNSGLLKDGDAQSLKEHLIDELDYILLP
40 50 60 70 80 90
570 580 590 600 610 620
pF1KE3 EPVWRALYHWYGANLALPRPVIKNSKTDIPELELFPRYLLFLRQQPATRTQQSNIWVNMG
: : :: . . .:. .. . : .: .. . ... ::.
CCDS89 TEGWNKLVSWY-TLMEGQEPIARK----VVEQGMFVKHCKVEVYLTELKLCENG---NMN
100 110 120 130 140
630 640 650 660 670 680
pF1KE3 NVPSPNAPLKRVLAYTGCFSRMQTIKEIHEYLSQRLRIKEE-DMRLWLYNSENYLTLLDD
:: . .: ::. .:: :.. . . . : .: . ::: : . :.
CCDS89 NVVT-----RR-------FSKADTIDTIEKEIRKIFSIPDEKETRLWNKYMSNTFEPLNK
150 160 170 180 190
690 700 710 720
pF1KE3 EDHKLEYLKIQDEQHLVIEVRNKDMSWPEEMSF--IANSS---------KIDRHKVP---
: .. . . : :::: .:.: .::. : . ::. : .. :
CCDS89 PDSTIQDAGLYQGQVLVIEQKNEDGTWPRGPSTPNVKNSNYCLPSYTAYKNYDYSEPGRN
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pF1KE3 -TEKGATGLSNLGNTCFMNSSIQCVSNTQPLTQYFISGRHLYELNRTNPIGMKGHMAKCY
. : :::::::::::::.:::.::: :::.::.. .. ::: ::.::.:..:: :
CCDS89 NEQPGLCGLSNLGNTCFMNSAIQCLSNTPPLTEYFLNDKYQEELNFDNPLGMRGEIAKSY
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pF1KE3 GDLVQELWSGTQKNVAPLKLRWTIAKYAPRFNGFQQQDSQELLAFLLDGLHEDLNRVHEK
..:....::: . :.: .. ....::.:.:.:::: :::::::::::::::::...:
CCDS89 AELIKQMWSGKFSYVTPRAFKTQVGRFAPQFSGYQQQDCQELLAFLLDGLHEDLNRIRKK
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pF1KE3 PYVELKDSDGRPDWEVAAEAWDNHLRRNRSIVVDLFHGQLRSQVKCKTCGHISVRFDPFN
::..:::.::::: :: :::.:::.:: ::.::.::: ..: . : :..::: ::::
CCDS89 PYIQLKDADGRPDKVVAEEAWENHLKRNDSIIVDIFHGLFKSTLVCPECAKISVTFDPFC
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pF1KE3 FLSLPLPMDSYMHLEITVIKLDGTT-PVRYGLRLNMDEKYTGLKKQLSDLCGLNSEQILL
.:.::::: . ::. ....: : :..: . . . : :: : :. ......
CCDS89 YLTLPLPMKKERTLEVYLVRMDPLTKPMQYKVVVPKIGNILDLCTALSALSGIPADKMIV
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pF1KE3 AEVHGSNI-KNFPQDNQKVRLSVSGFLCAFEIPVP--------VSPISASSPTQTDFSSS
..... . . : .:.. . . .::: . . :. . . .
CCDS89 TDIYNHRFHRIFAMDENLSSIMERDDIYVFEININRTEDTEHVIIPVCLREKFRHSSYTH
500 510 520 530 540 550
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE3 PSTNEMFTLTTNGDLPRPIFIPNGMPNTVV--PCGTEKNFTNGM-VNGHMPSLPDSPFTG
. . .: .:: . . : .. : : :. ..: . :. ..:
CCDS89 HTGSSLFGQPFLMAVPRNN-TEDKLYNLLLLRMCRYVKISTETEETEGSLHCCKDQNING
560 570 580 590 600 610
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE3 Y-IIAVHRKMMRTELYFLSSQKNRPSLFGMPLIVPCTVHTRKKDLYDAVWIQVSRLASPL
..:.. .:. ... . : . : : .. ... :.: . . . :
CCDS89 NGPNGIHEEGSPSEME--TDEPDDESSQDQEL--PSENENSQSE--DSVGGD-NDSENGL
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pF1KE3 PPQEASNHAQDCDDSMGYQYPFTLRVVQKDGNSCAWCPWY-RFC-RGCKIDCGEDRAFIG
... . . . . :. . . : : . :: : ..: .:.:.
CCDS89 CTEDTCKGQLTGHKKRLFTFQFN-NLGNTDINYIKDDTRHIRFDDRQLRLD---ERSFL-
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pF1KE3 NAYIAVDWDPTALHLRYQTSQERVVDEHESVEQSRRAQAEP-INLDSCLRAFTSEEELGE
:.:::: . .. . . ..::::: . .: ..: .:.. ::..:.::
CCDS89 ----ALDWDPDLKKRYFDENAAEDFEKHESVEY--KPPKKPFVKLKDCIELFTTKEKLGA
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pF1KE3 NEMYYCSKCKTHCLATKKLDLWRLPPILIIHLKRFQFVNGRWIKSQ--KIVKFPRESFDP
.. .:: .:: : :::::::: :::.:..:::::.. .:..... .: :: ...:
CCDS89 EDPWYCPNCKEHQQATKKLDLWSLPPVLVVHLKRFSY--SRYMRDKLDTLVDFPINDLDM
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pF1KE3 SAFLVPRDPALCQHKPLTPQGDELSEPRILAREVKKVDAQSSAGEEDVLLSKSPSSLSAN
: ::. . . :..
CCDS89 SEFLINPNAGPCRYNLIAVSNHYGGMGGGHYTAFAKNKDDGKWYYFDDSSVSTASEDQIV
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:. ..: .: . .:: :: ..:
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: : :: . . .:. .. . : .: .. . ... ::.
CCDS58 TEGWNKLVSWY-TLMEGQEPIARK----VVEQGMFVKHCKVEVYLTELKLCENG---NMN
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pF1KE3 NVPSPNAPLKRVLAYTGCFSRMQTIKEIHEYLSQRLRIKEE-DMRLWLYNSENYLTLLDD
:: . .: ::. .:: :.. . . . : .: . ::: : . :.
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pF1KE3 EDHKLEYLKIQDEQHLVIEVRNKDMSWPEEMSF--------------IANSS--------
: .. . . : :::: .:.: .::. : :. ::
CCDS58 PDSTIQDAGLYQGQVLVIEQKNEDGTWPRGPSTPKSPGASNFSTLPKISPSSLSNNYNNM
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: . . .:. . : :::::::::::::.:::.::: ::
CCDS58 NNRNVKNSNYCLPSYTAYKNYDYSEPGRNNEQPGLCGLSNLGNTCFMNSAIQCLSNTPPL
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:.::.. .. ::: ::.::.:..:: :..:....::: . :.: .. ....::.:
CCDS58 TEYFLNDKYQEELNFDNPLGMRGEIAKSYAELIKQMWSGKFSYVTPRAFKTQVGRFAPQF
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.:.:::: :::::::::::::::::...:::..:::.::::: :: :::.:::.:: ::
CCDS58 SGYQQQDCQELLAFLLDGLHEDLNRIRKKPYIQLKDADGRPDKVVAEEAWENHLKRNDSI
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. . . : :: : :. ........... . . : .:.. . . .::
CCDS58 VVVPKIGNILDLCTALSALSGIPADKMIVTDIYNHRFHRIFAMDENLSSIMERDDIYVFE
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: . . :. . . . . . .: .:: . . : ..
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: : :. ..: . :. ..: ..:.. .:. ... . : .
CCDS58 RMCRYVKISTETEETEGSLHCCKDQNINGNGPNGIHEEGSPSEME--TDEPDDESSQDQE
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: : .. ... :.: . . . : ... . . . . :. . . :
CCDS58 L--PSENENSQSE--DSVGGD-NDSENGLCTEDTCKGQLTGHKKRLFTFQFN-NLGNTDI
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: . :: : ..: .:.:. :.:::: . .. . . ..::::
CCDS58 NYIKDDTRHIRFDDRQLRLD---ERSFL-----ALDWDPDLKKRYFDENAAEDFEKHESV
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: . .: ..: .:.. ::..:.:: .. .:: .:: : :::::::: :::.:..:
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pF1KE3 LKRFQFVNGRWIKSQ--KIVKFPRESFDPSAFLVPRDPALCQHKPLTPQGDELSEPRILA
::::.. .:..... .: :: ...: : ::. . . :..
CCDS58 LKRFSY--SRYMRDKLDTLVDFPINDLDMSEFLINPNAGPCRYNLIAVSNHYGGMGGGHY
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pF1KE3 REVKKVDAQSSAGEEDVLLSKSPSSLSANIISSPKGSPSSSRKSGTSCPSSKNSSPNSSP
CCDS58 TAFAKNKDDGKWYYFDDSSVSTASEDQIVSKAAYVLFYQRQDTFSGTGFFPLDRETKGAS
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... . ... . .:. :. : ::. .:: :.. . . . : :.. ::
CCDS27 CKVEVYLLELKLCENSDPTNVLS-------CHFSKADTIATIEKEMRKLFNIPAERETRL
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: : :. :. .. . . : :::: .:.: .::.. .. .: :.. .
CCDS27 WNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQNEDGTWPRQ-TLQSNGSGFSASYNC
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.. :. . : ::.::::::::::..::.::: :::.::.. .. :.:: ::.::::
CCDS27 QEPPSSHIQPGLCGLGNLGNTCFMNSALQCLSNTAPLTDYFLKDEYEAEINRDNPLGMKG
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..:. :..:....::: . .::: .. ....::.:.:.::::::::::::::::::::
CCDS27 EIAEAYAELIKQMWSGRDAHVAPRMFKTQVGRFAPQFSGYQQQDSQELLAFLLDGLHEDL
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pF1KE3 NRVHEKPYVELKDSDGRPDWEVAAEAWDNHLRRNRSIVVDLFHGQLRSQVKCKTCGHISV
:::..:::.::::..:::: :: :::.:: :: :..:: ::: ..: . : :...::
CCDS27 NRVKKKPYLELKDANGRPDAVVAKEAWENHRLRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPECAKVSV
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:::: .:.::::. . .:. .. : :..: . . . . : . :: : :.
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pF1KE3 SEQILLAEVHGSNI-KNF----------PQDNQKVR----LSVSGFLCAFEIPVPVSPIS
.:....:.:.. . : : :.:. : ::.: :. .::
CCDS27 AENMVVADVYNHRFHKIFQMDEGLNHIMPRDDIFVYEVCSTSVDGSECV-TLPVYFRE-R
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pF1KE3 ASSPTQTDFSSSPSTNEMFTLTTNGDLPRPIFIPNGMPNTVVPCGTEKNFTNGMVNGHMP
: : ::. :.. .. ..:. . ... ..: : . ... . ..
CCDS27 KSRP-----SSTSSASALYGQPLLLSVPKHKLTLESLYQAV--CDRISRYVKQPLPDEFG
550 560 570 580 590
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: : : : . . . . . :.. : . . . :
CCDS27 SSPLEP--GACNGSRNSCEGEDEEEMEHQEE-----GKEQLSETEGSGEDEPGND-----
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pF1KE3 VSRLASPLPPQEASNHAQDCDDSMGYQYPFTLRVVQKDGNSCAWCPWYRFCRGCKIDCGE
: . . ..: : . ::. .:.. :.. . : :.
CCDS27 ------PSETTQKKIKGQPCPKRL-----FTFSLVNSYGTADI--------NSLAAD-GK
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pF1KE3 DRAFIGNAYIAVDWDPTALHLRYQTSQERVVDEHESVEQSRRAQAEPINLDSCLRAFTSE
. . . .:.::: . .: :. .. .. ..: :. : .. . . : .:.. ::.
CCDS27 LLKLNSRSTLAMDWDSETRRLYYDEQESEAYEKHVSMLQPQKKKKTTVALRDCIELFTTM
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pF1KE3 EELGENEMYYCSKCKTHCLATKKLDLWRLPPILIIHLKRFQFVNGRWI-KSQKIVKFPRE
: :::.. .:: .:: : ::::.::: :: ::..:::::.. : : : . .:.:: .
CCDS27 ETLGEHDPWYCPNCKKHQQATKKFDLWSLPKILVVHLKRFSY-NRYWRDKLDTVVEFPIR
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pF1KE3 SFDPSAFL--VPRDPALCQHKPLTPQGDELSEPRILAREVKKV--------DAQSSAGEE
... : :. . : . . .. . .. . : .:. :.. : . :
CCDS27 GLNMSEFVCNLSARPYVYDLIAVSNHYGAMGVGHYTAYAKNKLNGKWYYFDDSNVSLASE
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pF1KE3 DVLLSKSPSSL-----SANIISSPKGSPSSSRKSGTSCPSSKNSSPNSSPRTLGRSKGRL
: ...:. : . .. ..:. : :.: .:: :::
CCDS27 DQIVTKAAYVLFYQRRDDEFYKTPSLSSSGSSDGGTR-PSSSQQGFGDDEACSMDTN
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pF1KE3 RLPQIGSKNKLSSSKENLDASKENGAGQICELADALSRGHVLGGSQPELVTPQDHEVALA
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pF1KE3 FARQHNTSDNNNQCLLGANGNILLHLNPQKPGAIDNQPLVTQEPVKATSLTLEGGRLKRT
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CCDS14 AGESWFLVEKHWYKQWEAYVQGGDQDSSTFPGCINNATLF-QDEIN--------WRLKEG
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pF1KE3 PQLIHGRDYEMVPEPVWRALYHWYGANLALPRPVIKNSKTDIPEL---ELFPRYLLFLRQ
:..:.:: ..: .:. : ::: : .: :. . ..:.. :..: ::..:.
CCDS14 --LVEGEDYVLLPAAAWHYLVSWYG--LEHGQPPIERKVIELPNIQKVEVYPVELLLVRH
150 160 170 180 190 200
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pF1KE3 QPATRTQQSNIWVNMGNVPSPNAPLKRVLAYTGCFSRMQTIKEIHEYLSQRLRIK-EEDM
. ..:. ..: ::. ..: . . .:. .. .::
CCDS14 N------------DLGK------------SHTVQFSHTDSIGLVLRTARERFLVEPQEDT
210 220 230 240
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pF1KE3 RLWLYNSENYLTLLDDEDHKLEYLKIQDEQHLVIEVRNKDMSWPE-EMSFIANSSKIDRH
::: :::. : : : . .. : ...:.:.:: .:: .. . :. . . .
CCDS14 RLWAKNSEGSLDRLYDTHITVLDAALETGQLIIMETRKKDGTWPSAQLHVMNNNMSEEDE
250 260 270 280 290 300
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pF1KE3 KVPTEKGATGLSNLGNTCFMNSSIQCVSNTQPLTQYFISGRHLYELNRTNPIGMKGHMAK
. : ::.::::::::::..::.::. ::.::... .: ::: ::.::::..:.
CCDS14 DFKGQPGICGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAE
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pF1KE3 CYGDLVQELWSGTQKNVAPLKLRWTIAKYAPRFNGFQQQDSQELLAFLLDGLHEDLNRVH
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CCDS14 AYADLVKQAWSGHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVK
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pF1KE3 EKPYVELKDSDGRPDWEVAAEAWDNHLRRNRSIVVDLFHGQLRSQVKCKTCGHISVRFDP
.: :::: :. :::: ::: :::.:: ::: :..:: ::: ..: . : ::..:: :::
CCDS14 KKEYVELCDAAGRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDP
430 440 450 460 470 480
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pF1KE3 FNFLSLPLPMDSYMHLEITVIKLDGTT-PVRYGLRLNMDEKYTGLKKQLSDLCGLNSEQI
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CCDS14 FCYLSVPLPISHKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKGKISDLCVALSKHTGISPERM
490 500 510 520 530 540
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pF1KE3 LLAEVHGSNIKNFPQDNQKVRLSVSGFLCAFEIPVPVSPISASSPTQTDFSSSPSTNEMF
..:.: . : ... :.: : . :. ....
CCDS14 MVADVFSHR-----------------FYKLYQLEEPLSSIL----DRDDIFVYEVSGRIE
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.. . :. :... . : .... . :. :: . :.: . :: .
CCDS14 AIEGSREDIVVPVYLRERTPAR----DYNNSYYGLMLFGHPLLVSVPRDRFT------WE
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.. . .: :: ..:. . :: . : : .: : : .:
CCDS14 GLYNVLMYRLSRYVTKPNSDDEDDGDEKEDDEEDKDDVPGPSTGGS-LRDPEPEQAGPSS
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. .. : :. .: :.: :::..:...:.: : ..
CCDS14 GVTNRCPFLLDNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQTVNSNGTS------DRTTSPEEVH----
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.. :::.::.: . :. . . .:. : . . :. :. :.. ::. :
CCDS14 ----AQPYIAIDWEPEMKKRYYDEVEAEGYVKHDCV--GYVMKKAPVRLQECIELFTTVE
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: ... .:: .:: : ::::::::: :: :::::::::.... : . .:.:: ...
CCDS14 TLEKENPWYCPSCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDTLVEFPIRDL
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: : :.:. : ::.: :. .:: : : ::. :
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.. .. ..:. . ... ..: : . ... . .. : : : : .
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. . . . :.. : . . . : : . .
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: . . .. . .. . : .:. :.. : . :: ...:. :
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CCDS56 LSTGSLEAGDSERDPIQPPELQLVTP---MAEGDTGLPRVWAAPDRGPVPSTSGISSEML
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CCDS56 ASGPIEVG-SLPAGERVSRPEAAVPGYQHPSEAMNAHTPQF-FIY--KIDSSNREQRLED
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pF1KE3 -GNAYIAVDWDPTALHLRYQTS---QERVV---DEHESVEQ----SRRAQAEPINLDSCL
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CCDS56 KGDTPLELG-DDCSLALVWRNNERLQEFVLVASKELECAEDPGSAGEAARAGHFTLDQCL
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pF1KE3 RAFTSEEELGENEMYYCSKCKTHCLATKKLDLWRLPPILIIHLKRFQFVNGRWI-KSQKI
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CCDS56 NLFTRPEVLAPEEAWYCPQCKQHREASKQLLLWRLPNVLIVQLKRFSFRSFIWRDKINDL
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pF1KE3 VKFPRESFDPSAFLVPRDPALCQHKPLTPQGDELSEPRILAREVKKVDAQSSAGEEDVLL
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CCDS56 VEFPVRNLDLSKFCIGQKEEQLPSYDLYAVINHYGGMIGGHYTACARLPNDRSSQRSDVG
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pF1KE3 QRLRIKEEDMRLWLYNSENYLTLLDDEDHKLEYLKIQDEQHLVIEVRNKDMSWPEEMSFI
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CCDS56 GQEEARAVEKDKSKARSEDTGLDSVATRTPMEHVTPKPETHLA-SPKPTCMVPPMPHSPV
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CCDS56 SGDS-VEEEEEEEKKVCLPGFTGLVNLGNTCFMNSVIQSLSNTRELRDFFHDRSFEAEIN
580 590 600 610 620 630
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pF1KE3 RTNPIGMKGHMAKCYGDLVQELWSGTQKNVAPLKLRWTIAKYAPRFNGFQQQDSQELLAF
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