Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3449
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3449, 1311 aa
1>>>pF1KE3449 1311 - 1311 aa - 1311 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.1923+/-0.00125; mu= -18.0419+/- 0.074
mean_var=561.2726+/-125.126, 0's: 0 Z-trim(113.9): 64 B-trim: 886 in 1/53
Lambda= 0.054136
statistics sampled from 14461 (14502) to 14461 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.749), E-opt: 0.2 (0.445), width: 16
Scan time: 6.600
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3340.1 GAK gene_id:2580|Hs108|chr4 (1311) 8945 714.8 3.8e-205
CCDS82902.1 GAK gene_id:2580|Hs108|chr4 (1232) 8138 651.7 3.4e-186
CCDS58004.1 DNAJC6 gene_id:9829|Hs108|chr1 ( 970) 1603 141.3 1.2e-32
CCDS58005.1 DNAJC6 gene_id:9829|Hs108|chr1 ( 900) 1589 140.1 2.5e-32
CCDS30739.1 DNAJC6 gene_id:9829|Hs108|chr1 ( 913) 1589 140.1 2.5e-32
>>CCDS3340.1 GAK gene_id:2580|Hs108|chr4 (1311 aa)
initn: 8945 init1: 8945 opt: 8945 Z-score: 3796.6 bits: 714.8 E(32554): 3.8e-205
Smith-Waterman score: 8945; 100.0% identity (100.0% similar) in 1311 aa overlap (1-1311:1-1311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSLLQSALDFLAGPGSLGGASGRDQSDFVGQTVELGELRLRVRRVLAEGGFAFVYEAQDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MSLLQSALDFLAGPGSLGGASGRDQSDFVGQTVELGELRLRVRRVLAEGGFAFVYEAQDV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 GSGREYALKRLLSNEEEKNRAIIQEVCFMKKLSGHPNIVQFCSAASIGKEESDTGQAEFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GSGREYALKRLLSNEEEKNRAIIQEVCFMKKLSGHPNIVQFCSAASIGKEESDTGQAEFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 LLTELCKGQLVEFLKKMESRGPLSCDTVLKIFYQTCRAVQHMHRQKPPIIHRDLKVENLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LLTELCKGQLVEFLKKMESRGPLSCDTVLKIFYQTCRAVQHMHRQKPPIIHRDLKVENLL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 LSNQGTIKLCDFGSATTISHYPDYSWSAQRRALVEEEITRNTTPMYRTPEIIDLYSNFPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LSNQGTIKLCDFGSATTISHYPDYSWSAQRRALVEEEITRNTTPMYRTPEIIDLYSNFPI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 GEKQDIWALGCILYLLCFRQHPFEDGAKLRIVNGKYSIPPHDTQYTVFHSLIRAMLQVNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GEKQDIWALGCILYLLCFRQHPFEDGAKLRIVNGKYSIPPHDTQYTVFHSLIRAMLQVNP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 EERLSIAEVVHQLQEIAAARNVNPKSPITELLEQNGGYGSATLSRGPPPPVGPAGSGYSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EERLSIAEVVHQLQEIAAARNVNPKSPITELLEQNGGYGSATLSRGPPPPVGPAGSGYSG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 GLALAEYDQPYGGFLDILRGGTERLFTNLKDTSSKVIQSVANYAKGDLDISYITSRIAVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GLALAEYDQPYGGFLDILRGGTERLFTNLKDTSSKVIQSVANYAKGDLDISYITSRIAVM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 SFPAEGVESALKNNIEDVRLFLDSKHPGHYAVYNLSPRTYRPSRFHNRVSECGWAARRAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SFPAEGVESALKNNIEDVRLFLDSKHPGHYAVYNLSPRTYRPSRFHNRVSECGWAARRAP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 HLHTLYNICRNMHAWLRQDHKNVCVVHCMDGRAASAVAVCSFLCFCRLFSTAEAAVYMFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 HLHTLYNICRNMHAWLRQDHKNVCVVHCMDGRAASAVAVCSFLCFCRLFSTAEAAVYMFS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 MKRCPPGIWPSHKRYIEYMCDMVAEEPITPHSKPILVRAVVMTPVPLFSKQRSGCRPFCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MKRCPPGIWPSHKRYIEYMCDMVAEEPITPHSKPILVRAVVMTPVPLFSKQRSGCRPFCE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 VYVGDERVASTSQEYDKMRDFKIEDGKAVIPLGVTVQGDVLIVIYHARSTLGGRLQAKMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VYVGDERVASTSQEYDKMRDFKIEDGKAVIPLGVTVQGDVLIVIYHARSTLGGRLQAKMA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 SMKMFQIQFHTGFVPRNATTVKFAKYDLDACDIQEKYPDLFQVNLEVEVEPRDRPSREAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SMKMFQIQFHTGFVPRNATTVKFAKYDLDACDIQEKYPDLFQVNLEVEVEPRDRPSREAP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 PWENSSMRGLNPKILFSSREEQQDILSKFGKPELPRQPGSTAQYDAGAGSPEAEPTDSDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PWENSSMRGLNPKILFSSREEQQDILSKFGKPELPRQPGSTAQYDAGAGSPEAEPTDSDS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 PPSSSADASRFLHTLDWQEEKEAETGAENASSKESESALMEDRDESEVSDEGGSPISSEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PPSSSADASRFLHTLDWQEEKEAETGAENASSKESESALMEDRDESEVSDEGGSPISSEG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 QEPRADPEPPGLAAGLVQQDLVFEVETPAVLPEPVPQEDGVDLLGLHSEVGAGPAVPPQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QEPRADPEPPGLAAGLVQQDLVFEVETPAVLPEPVPQEDGVDLLGLHSEVGAGPAVPPQA
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 CKAPSSNTDLLSCLLGPPEAASQGPPEDLLSEDPLLLASPAPPLSVQSTPRGGPPAAADP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CKAPSSNTDLLSCLLGPPEAASQGPPEDLLSEDPLLLASPAPPLSVQSTPRGGPPAAADP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 FGPLLPSSGNNSQPCSNPDLFGEFLNSDSVTVPPSFPSAHSAPPPSCSADFLHLGDLPGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FGPLLPSSGNNSQPCSNPDLFGEFLNSDSVTVPPSFPSAHSAPPPSCSADFLHLGDLPGE
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 PSKMTASSSNPDLLGGWAAWTETAASAVAPTPATEGPLFSPGGQPAPCGSQASWTKSQNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PSKMTASSSNPDLLGGWAAWTETAASAVAPTPATEGPLFSPGGQPAPCGSQASWTKSQNP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE3 DPFADLGDLSSGLQGSPAGFPPGGFIPKTATTPKGSSSWQTSRPPAQGASWPPQAKPPPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DPFADLGDLSSGLQGSPAGFPPGGFIPKTATTPKGSSSWQTSRPPAQGASWPPQAKPPPK
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE3 ACTQPRPNYASNFSVIGAREERGVRAPSFAQKPKVSENDFEDLLSNQGFSSRSDKKGPKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ACTQPRPNYASNFSVIGAREERGVRAPSFAQKPKVSENDFEDLLSNQGFSSRSDKKGPKT
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE3 IAEMRKQDLAKDTDPLKLKLLDWIEGKERNIRALLSTLHTVLWDGESRWTPVGMADLVAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IAEMRKQDLAKDTDPLKLKLLDWIEGKERNIRALLSTLHTVLWDGESRWTPVGMADLVAP
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310
pF1KE3 EQVKKHYRRAVLAVHPDKAAGQPYEQHAKMIFMELNDAWSEFENQGSRPLF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EQVKKHYRRAVLAVHPDKAAGQPYEQHAKMIFMELNDAWSEFENQGSRPLF
1270 1280 1290 1300 1310
>>CCDS82902.1 GAK gene_id:2580|Hs108|chr4 (1232 aa)
initn: 8133 init1: 8133 opt: 8138 Z-score: 3456.3 bits: 651.7 E(32554): 3.4e-186
Smith-Waterman score: 8262; 94.0% identity (94.0% similar) in 1311 aa overlap (1-1311:1-1232)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSLLQSALDFLAGPGSLGGASGRDQSDFVGQTVELGELRLRVRRVLAEGGFAFVYEAQDV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MSLLQSALDFLAGPGSLGGASGRDQSDFVGQTVELGELRLRVRRVLAEG-----------
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 GSGREYALKRLLSNEEEKNRAIIQEVCFMKKLSGHPNIVQFCSAASIGKEESDTGQAEFL
CCDS82 ------------------------------------------------------------
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 LLTELCKGQLVEFLKKMESRGPLSCDTVLKIFYQTCRAVQHMHRQKPPIIHRDLKVENLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 --------QLVEFLKKMESRGPLSCDTVLKIFYQTCRAVQHMHRQKPPIIHRDLKVENLL
50 60 70 80 90 100
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 LSNQGTIKLCDFGSATTISHYPDYSWSAQRRALVEEEITRNTTPMYRTPEIIDLYSNFPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LSNQGTIKLCDFGSATTISHYPDYSWSAQRRALVEEEITRNTTPMYRTPEIIDLYSNFPI
110 120 130 140 150 160
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 GEKQDIWALGCILYLLCFRQHPFEDGAKLRIVNGKYSIPPHDTQYTVFHSLIRAMLQVNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GEKQDIWALGCILYLLCFRQHPFEDGAKLRIVNGKYSIPPHDTQYTVFHSLIRAMLQVNP
170 180 190 200 210 220
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 EERLSIAEVVHQLQEIAAARNVNPKSPITELLEQNGGYGSATLSRGPPPPVGPAGSGYSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EERLSIAEVVHQLQEIAAARNVNPKSPITELLEQNGGYGSATLSRGPPPPVGPAGSGYSG
230 240 250 260 270 280
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 GLALAEYDQPYGGFLDILRGGTERLFTNLKDTSSKVIQSVANYAKGDLDISYITSRIAVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GLALAEYDQPYGGFLDILRGGTERLFTNLKDTSSKVIQSVANYAKGDLDISYITSRIAVM
290 300 310 320 330 340
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 SFPAEGVESALKNNIEDVRLFLDSKHPGHYAVYNLSPRTYRPSRFHNRVSECGWAARRAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SFPAEGVESALKNNIEDVRLFLDSKHPGHYAVYNLSPRTYRPSRFHNRVSECGWAARRAP
350 360 370 380 390 400
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 HLHTLYNICRNMHAWLRQDHKNVCVVHCMDGRAASAVAVCSFLCFCRLFSTAEAAVYMFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 HLHTLYNICRNMHAWLRQDHKNVCVVHCMDGRAASAVAVCSFLCFCRLFSTAEAAVYMFS
410 420 430 440 450 460
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 MKRCPPGIWPSHKRYIEYMCDMVAEEPITPHSKPILVRAVVMTPVPLFSKQRSGCRPFCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MKRCPPGIWPSHKRYIEYMCDMVAEEPITPHSKPILVRAVVMTPVPLFSKQRSGCRPFCE
470 480 490 500 510 520
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 VYVGDERVASTSQEYDKMRDFKIEDGKAVIPLGVTVQGDVLIVIYHARSTLGGRLQAKMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VYVGDERVASTSQEYDKMRDFKIEDGKAVIPLGVTVQGDVLIVIYHARSTLGGRLQAKMA
530 540 550 560 570 580
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 SMKMFQIQFHTGFVPRNATTVKFAKYDLDACDIQEKYPDLFQVNLEVEVEPRDRPSREAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SMKMFQIQFHTGFVPRNATTVKFAKYDLDACDIQEKYPDLFQVNLEVEVEPRDRPSREAP
590 600 610 620 630 640
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 PWENSSMRGLNPKILFSSREEQQDILSKFGKPELPRQPGSTAQYDAGAGSPEAEPTDSDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PWENSSMRGLNPKILFSSREEQQDILSKFGKPELPRQPGSTAQYDAGAGSPEAEPTDSDS
650 660 670 680 690 700
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 PPSSSADASRFLHTLDWQEEKEAETGAENASSKESESALMEDRDESEVSDEGGSPISSEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PPSSSADASRFLHTLDWQEEKEAETGAENASSKESESALMEDRDESEVSDEGGSPISSEG
710 720 730 740 750 760
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 QEPRADPEPPGLAAGLVQQDLVFEVETPAVLPEPVPQEDGVDLLGLHSEVGAGPAVPPQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QEPRADPEPPGLAAGLVQQDLVFEVETPAVLPEPVPQEDGVDLLGLHSEVGAGPAVPPQA
770 780 790 800 810 820
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 CKAPSSNTDLLSCLLGPPEAASQGPPEDLLSEDPLLLASPAPPLSVQSTPRGGPPAAADP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 CKAPSSNTDLLSCLLGPPEAASQGPPEDLLSEDPLLLASPAPPLSVQSTPRGGPPAAADP
830 840 850 860 870 880
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 FGPLLPSSGNNSQPCSNPDLFGEFLNSDSVTVPPSFPSAHSAPPPSCSADFLHLGDLPGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 FGPLLPSSGNNSQPCSNPDLFGEFLNSDSVTVPPSFPSAHSAPPPSCSADFLHLGDLPGE
890 900 910 920 930 940
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 PSKMTASSSNPDLLGGWAAWTETAASAVAPTPATEGPLFSPGGQPAPCGSQASWTKSQNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PSKMTASSSNPDLLGGWAAWTETAASAVAPTPATEGPLFSPGGQPAPCGSQASWTKSQNP
950 960 970 980 990 1000
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE3 DPFADLGDLSSGLQGSPAGFPPGGFIPKTATTPKGSSSWQTSRPPAQGASWPPQAKPPPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 DPFADLGDLSSGLQGSPAGFPPGGFIPKTATTPKGSSSWQTSRPPAQGASWPPQAKPPPK
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE3 ACTQPRPNYASNFSVIGAREERGVRAPSFAQKPKVSENDFEDLLSNQGFSSRSDKKGPKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ACTQPRPNYASNFSVIGAREERGVRAPSFAQKPKVSENDFEDLLSNQGFSSRSDKKGPKT
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE3 IAEMRKQDLAKDTDPLKLKLLDWIEGKERNIRALLSTLHTVLWDGESRWTPVGMADLVAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 IAEMRKQDLAKDTDPLKLKLLDWIEGKERNIRALLSTLHTVLWDGESRWTPVGMADLVAP
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1270 1280 1290 1300 1310
pF1KE3 EQVKKHYRRAVLAVHPDKAAGQPYEQHAKMIFMELNDAWSEFENQGSRPLF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EQVKKHYRRAVLAVHPDKAAGQPYEQHAKMIFMELNDAWSEFENQGSRPLF
1190 1200 1210 1220 1230
>>CCDS58004.1 DNAJC6 gene_id:9829|Hs108|chr1 (970 aa)
initn: 2476 init1: 1521 opt: 1603 Z-score: 699.3 bits: 141.3 E(32554): 1.2e-32
Smith-Waterman score: 2719; 44.7% identity (70.0% similar) in 1008 aa overlap (335-1311:42-970)
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 SIAEVVHQLQEIAAARNVNPKSPITELLEQNGGYGSATLSRGPPPPVGPAGSGYSGGLAL
:.: .. . .: :: :.. :.: .
CCDS58 SNDGYESLQLVDSNGDLSAGSGGVGGKQRVNAGAAARSPARQPPD---RASTMDSSGASS
20 30 40 50 60
370 380 390 400 410
pF1KE3 AEYDQPYGG-FLDILRGGTERLFTNLKD--------TSSKVIQSVANYAKGDLDISYITS
... ::: ..:...::. :::.:::: :::.:::::..:.:::::..:.::
CCDS58 PDMEPSYGGGLFDMVKGGAGRLFSNLKDNLKDTLKDTSSRVIQSVTSYTKGDLDFTYVTS
70 80 90 100 110 120
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 RIAVMSFPAEGVESALKNNIEDVRLFLDSKHPGHYAVYNLSPRTYRPSRFHNRVSECGWA
:: ::::: ..:. ...:...:.: ::::.: ::.::::::..:: ..::.:::::.:
CCDS58 RIIVMSFPLDNVDIGFRNQVDDIRSFLDSRHLDHYTVYNLSPKSYRTAKFHSRVSECSWP
130 140 150 160 170 180
480 490 500 510 520 530
pF1KE3 ARRAPHLHTLYNICRNMHAWLRQDHKNVCVVHCMDGRAASAVAVCSFLCFCRLFSTAEAA
:.:: ::.:. .::::. :: :. ::::::::.::::::.. : ... :: :.:: :
CCDS58 IRQAPSLHNLFAVCRNMYNWLLQNPKNVCVVHCLDGRAASSILVGAMFIFCNLYSTPGPA
190 200 210 220 230 240
540 550 560 570 580 590
pF1KE3 VYMFSMKRCPPGIWPSHKRYIEYMCDMVAEEPITPHSKPILVRAVVMTPVPLFSKQRSGC
. .. :: :. :::.::. ::::..:..: :: ::. .......:.:.:.:::.::
CCDS58 IRLLYAKRPGIGLSPSHRRYLGYMCDLLADKPYRPHFKPLTIKSITVSPIPFFNKQRNGC
250 260 270 280 290 300
600 610 620 630 640 650
pF1KE3 RPFCEVYVGDERVASTSQEYDKMRDFKIEDGKAVIPLGVTVQGDVLIVIYHARSTLGGRL
::.:.: .:. .. :: ....:......::: :::..::::::.. .:: :::.:.::
CCDS58 RPYCDVLIGETKIYSTCTDFERMKEYRVQDGKIFIPLNITVQGDVVVSMYHLRSTIGSRL
310 320 330 340 350 360
660 670 680 690 700 710
pF1KE3 QAKMASMKMFQIQFHTGFVPRNATTVKFAKYDLDACDIQEKYPDLFQVNLEVEVEPRDRP
:::... ..::.::::::.: ..:..::.: .:::::. ::::.::::.:.::..:.:.
CCDS58 QAKVTNTQIFQLQFHTGFIPLDTTVLKFTKPELDACDVPEKYPQLFQVTLDVELQPHDKV
370 380 390 400 410 420
720 730 740 750 760 770
pF1KE3 SREAPPWENSSMRGLNPKILFSSREEQQDILSKFGKPELPRQPGSTAQYDAGAGSPEAEP
.::::. . .::.:::::..:.:: :. :. . : . .: :.
CCDS58 IDLTPPWEHYCTKDVNPSILFSSHQEHQDTLALGGQAPIDIPPDNPRHY----GQ-----
430 440 450 460 470
780 790 800 810 820 830
pF1KE3 TDSDSPPSSSADASRFLHTLDWQEEKEAETGAENASSKESESALMEDRDESEVSDEGGSP
: :. .: ::..: .:.. .:...::... ::: ::.
CCDS58 -------------SGFFASLCWQDQK-----SEKSFCEEDHAALVNQ--ESEQSDDELLT
480 490 500 510
840 850 860 870 880 890
pF1KE3 ISSEGQEPRADPEPPGLAAGLVQQDLVFEVETPAVLPEPVPQEDGVDLLGLHSEVGAGPA
.:: . .: .: :. .: . ::. : : :: ::::::.. . ..
CCDS58 LSSPHGNANGD-KPHGVKKPSKKQ------QEPAA---PPPPED-VDLLGLEGSAMSNSF
520 530 540 550 560
900 910 920 930 940 950
pF1KE3 VPPQACKAPSSNTDLLSCLLGPPEAASQGPPEDLLS--EDPLLLASPAPPLSVQSTPR-G
:: :: .:..::: :.: :: :: . : :: . :. : :.::::: .
CCDS58 SPP---AAPPTNSELLSDLFGGGGAA--GPTQAGQSGVED---VFHPSGPASTQSTPRRS
570 580 590 600 610 620
960 970 980 990 1000
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. ..:.: : . : :.: :. ::.: :::..:.. : : . .: :.
CCDS58 ATSTSASPTLRVGEGATFDPFGAPSKP-SGQDLLGSFLNTSSASSDP-FLQPTRSPSPT-
630 640 650 660 670
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pF1KE3 SADFLHLGDLPGEPSKMTASSSNPDLLGGWAAWTETAASAVAPTPATEGPLFSPGGQPAP
.: .. : : . .::. ::: .. .. ... :. .: : : :.
CCDS58 ----VHASSTP-------AVNIQPDVSGGWDWHAKPGGFGMGSKSAATSPTGSSHGTPT-
680 690 700 710 720
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pF1KE3 CGSQASWTKSQNPDPFADLGDL-SSGLQGSPA-------GFPPGGFIPKTATTPKGSSSW
.: :. ::::::: : ::.. ..:. :::: . :.. : :.. :
CCDS58 -----HQSKPQTLDPFADLGTLGSSSFASKPTTPTGLGGGFPPLSSPQKASPQPMGGG-W
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pF1KE3 QTSRPPAQGA-SWP-PQAKP-P--PKACTQPRPNYASNFSVI-GAREERGVRAPSFAQKP
: . :: .: :: :: : :.. : :::: .::.. :...::: . .. :
CCDS58 QQG-----GAYNWQQPQPKPQPSMPHSSPQNRPNYNVSFSAMPGGQNERGKGSSNLEGKQ
780 790 800 810 820 830
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pF1KE3 KVSENDFEDLLSNQGFSSRSDKKGPKTIAEMRKQDLAKDTDPLKLKLLDWIEGKERNIRA
:.. :::::::.:::....:::::.:::::::...::. :: :::.:.:::::::::::
CCDS58 KAA--DFEDLLSGQGFNAHKDKKGPRTIAEMRKEEMAKEMDPEKLKILEWIEGKERNIRA
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pF1KE3 ELNDAWSEFENQGSRPLF
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CCDS58 ELNDAWSEFENQGQKPLY
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CCDS58 SRVIQSVTSYTKGDLDFTYVTSRIIVMSFPLDNVDIGFRNQVDDIRSFLDSRHLDHYTVY
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::.. : ... :: :.:: :. .. :: :. :::.::. ::::..:..: :: :
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:. .......:.:.:.:::.::::.:.: .:. .. :: ....:......::: :::.
CCDS58 PLTIKSITVSPIPFFNKQRNGCRPYCDVLIGETKIYSTCTDFERMKEYRVQDGKIFIPLN
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CCDS58 PEKYPQLFQVTLDVELQPHDKVIDLTPPWEHYCTKDVNPSILFSSHQEHQDTLALGGQAP
340 350 360 370 380 390
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pF1KE3 LPRQPGSTAQYDAGAGSPEAEPTDSDSPPSSSADASRFLHTLDWQEEKEAETGAENASSK
. : . .: : :. .: ::..: .:.. .
CCDS58 IDIPPDNPRHYGQ----------------------SGFFASLCWQDQK-----SEKSFCE
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:...::... ::: ::. .:: . .: .: :. .: . ::.
CCDS58 EDHAALVNQ--ESEQSDDELLTLSSPHGNANGD-KPHGVKKPSKKQ------QEPAA---
430 440 450 460 470
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: : :: ::::::.. . .. :: :: .:..::: :.: :: :: . :
CCDS58 PPPPED-VDLLGLEGSAMSNSFSPPA---APPTNSELLSDLFGGGGAA--GPTQAGQSGV
480 490 500 510 520 530
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:: . :. : :.::::: .. ..:.: : . : :.: :. ::.: ::
CCDS58 EDVF---HPSGPASTQSTPRRSATSTSASPTLRVGEGATFDPFGAPSKP-SGQDLLGSFL
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:..:.. : : . .: :. .: .. : : . .::. ::: .. ..
CCDS58 NTSSASSDP-FLQPTRSPSPT-----VHASSTP-------AVNIQPDVSGGWDWHAKPGG
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pF1KE3 SAVAPTPATEGPLFSPGGQPAPCGSQASWTKSQNPDPFADLGDL-SSGLQGSPA------
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CCDS58 FGMGSKSAATSPTGSSHGTPT------HQSKPQTLDPFADLGTLGSSSFASKPTTPTGLG
640 650 660 670 680
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pF1KE3 -GFPPGGFIPKTATTPKGSSSWQTSRPPAQGA-SWP-PQAKP-P--PKACTQPRPNYASN
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CCDS58 GGFPPLSSPQKASPQPMGGG-WQQG-----GAYNWQQPQPKPQPSMPHSSPQNRPNYNVS
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::.. :...::: . .. : :.. :::::::.:::....:::::.:::::::...::
CCDS58 FSAMPGGQNERGKGSSNLEGKQKAA--DFEDLLSGQGFNAHKDKKGPRTIAEMRKEEMAK
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. :: :::.:.:::::::::::::::.::::: ::..: ::::::::.:::::: ::.::
CCDS58 EMDPEKLKILEWIEGKERNIRALLSTMHTVLWAGETKWKPVGMADLVTPEQVKKVYRKAV
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CCDS58 LVVHPDKATGQPYEQYAKMIFMELNDAWSEFENQGQKPLY
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CCDS30 LDSRHLDHYTVYNLSPKSYRTAKFHSRVSECSWPIRQAPSLHNLFAVCRNMYNWLLQNPK
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CCDS30 LLADKPYRPHFKPLTIKSITVSPIPFFNKQRNGCRPYCDVLIGETKIYSTCTDFERMKEY
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...::: :::..::::::.. .:: :::.:.:::::... ..::.::::::.: ..:..
CCDS30 RVQDGKIFIPLNITVQGDVVVSMYHLRSTIGSRLQAKVTNTQIFQLQFHTGFIPLDTTVL
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CCDS30 KFTKPELDACDVPEKYPQLFQVTLDVELQPHDKVIDLTPPWEHYCTKDVNPSILFSSHQE
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.:: :. :. . : . .: : :. .: ::..:
CCDS30 HQDTLALGGQAPIDIPPDNPRHYGQ----------------------SGFFASLCWQDQK
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.:.. .:...::.. .::: ::. .:: . .: .: :. .:
CCDS30 -----SEKSFCEEDHAALVN--QESEQSDDELLTLSSPHGNANGD-KPHGVKKPSKKQ--
440 450 460 470 480
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CCDS30 ----QEPAA---PPPPED-VDLLGLEGSAMSNSFSPP---AAPPTNSELLSDLFGGGGAA
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CCDS30 SGGWDWHAKPGGFGMGSKSAATSPTGSSHGTPT------HQSKPQTLDPFADLGTLGSSS
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CCDS30 FASKPTTPTGLGGGFPPLSSPQKASPQPMGGG-WQQG-----GAYNWQQPQPKPQPSMPH
690 700 710 720 730 740
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CCDS30 TIAEMRKEEMAKEMDPEKLKILEWIEGKERNIRALLSTMHTVLWAGETKWKPVGMADLVT
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CCDS30 PEQVKKVYRKAVLVVHPDKATGQPYEQYAKMIFMELNDAWSEFENQGQKPLY
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1311 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Sun Nov 6 09:55:04 2016 done: Sun Nov 6 09:55:05 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]