FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3442, 1321 aa
1>>>pF1KE3442 1321 - 1321 aa - 1321 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.0425+/-0.00114; mu= -5.9793+/- 0.069
mean_var=404.6475+/-83.701, 0's: 0 Z-trim(115.1): 622 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.063758
statistics sampled from 15026 (15706) to 15026 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.766), E-opt: 0.2 (0.482), width: 16
Scan time: 4.030
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8379.2 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1321) 9002 843.2 0
CCDS60974.1 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1261) 4291 409.9 2.2e-113
CCDS8347.1 SIK2 gene_id:23235|Hs108|chr11 ( 926) 1558 158.4 8.3e-38
CCDS82645.1 LOC102724428 gene_id:102724428|Hs108|c ( 783) 1374 141.4 9e-33
CCDS33575.1 SIK1 gene_id:150094|Hs108|chr21 ( 783) 1374 141.4 9e-33
CCDS55947.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 713) 1267 131.5 7.7e-30
CCDS53651.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 709) 1266 131.5 8.2e-30
CCDS53650.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 719) 1266 131.5 8.3e-30
CCDS8051.2 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 724) 1266 131.5 8.3e-30
CCDS53649.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 788) 1266 131.5 8.9e-30
CCDS41993.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 729) 1265 131.4 8.9e-30
CCDS45166.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 744) 1265 131.4 9.1e-30
CCDS41665.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 745) 1265 131.4 9.1e-30
CCDS45165.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 753) 1265 131.4 9.1e-30
CCDS73034.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 780) 1260 130.9 1.3e-29
CCDS31029.2 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 795) 1260 130.9 1.3e-29
CCDS73033.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 796) 1260 130.9 1.3e-29
CCDS12658.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 688) 1253 130.2 1.8e-29
CCDS56097.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 752) 1253 130.3 2e-29
CCDS12921.1 BRSK1 gene_id:84446|Hs108|chr19 ( 778) 1022 109.0 5e-23
CCDS41590.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 668) 1000 107.0 1.8e-22
CCDS58106.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 674) 1000 107.0 1.8e-22
CCDS58107.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 736) 1000 107.0 2e-22
CCDS58108.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 766) 961 103.4 2.4e-21
CCDS43075.1 SNRK gene_id:54861|Hs108|chr3 ( 765) 921 99.7 3.1e-20
CCDS65789.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 758) 912 98.9 5.5e-20
CCDS605.1 PRKAA2 gene_id:5563|Hs108|chr1 ( 552) 900 97.7 9.2e-20
CCDS31892.1 NUAK1 gene_id:9891|Hs108|chr12 ( 661) 898 97.6 1.2e-19
CCDS3932.2 PRKAA1 gene_id:5562|Hs108|chr5 ( 559) 887 96.5 2.1e-19
CCDS3943.1 NIM1K gene_id:167359|Hs108|chr5 ( 436) 875 95.3 3.8e-19
CCDS60696.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 614) 874 95.3 5.2e-19
CCDS1453.2 NUAK2 gene_id:81788|Hs108|chr1 ( 672) 820 90.4 1.8e-17
CCDS59123.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 610) 784 87.1 1.6e-16
CCDS6606.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 651) 784 87.1 1.7e-16
CCDS13610.1 HUNK gene_id:30811|Hs108|chr21 ( 714) 739 83.0 3.2e-15
CCDS4112.1 TSSK1B gene_id:83942|Hs108|chr5 ( 367) 682 77.5 7.3e-14
CCDS59126.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 619) 674 77.0 1.8e-13
CCDS362.1 TSSK3 gene_id:81629|Hs108|chr1 ( 268) 637 73.3 1e-12
CCDS3933.2 PRKAA1 gene_id:5562|Hs108|chr5 ( 574) 645 74.3 1.1e-12
CCDS4103.1 CAMK4 gene_id:814|Hs108|chr5 ( 473) 636 73.4 1.7e-12
CCDS13755.1 TSSK2 gene_id:23617|Hs108|chr22 ( 358) 629 72.6 2.1e-12
CCDS33128.1 AURKC gene_id:6795|Hs108|chr19 ( 309) 618 71.6 3.8e-12
CCDS46205.1 AURKC gene_id:6795|Hs108|chr19 ( 290) 613 71.1 5e-12
CCDS43064.1 DCLK3 gene_id:85443|Hs108|chr3 ( 648) 622 72.2 5.2e-12
CCDS46206.1 AURKC gene_id:6795|Hs108|chr19 ( 275) 603 70.1 9e-12
CCDS10851.1 PSKH1 gene_id:5681|Hs108|chr16 ( 424) 604 70.4 1.2e-11
CCDS35503.2 PNCK gene_id:139728|Hs108|chrX ( 426) 604 70.4 1.2e-11
CCDS73561.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 ( 422) 595 69.6 2.1e-11
CCDS2582.1 CAMK1 gene_id:8536|Hs108|chr3 ( 370) 591 69.1 2.4e-11
CCDS48189.1 PNCK gene_id:139728|Hs108|chrX ( 360) 590 69.0 2.5e-11
>>CCDS8379.2 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1321 aa)
initn: 9002 init1: 9002 opt: 9002 Z-score: 4490.7 bits: 843.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9002; 100.0% identity (100.0% similar) in 1321 aa overlap (1-1321:1-1321)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MAAAAASGAGGAAGAGTGGAGPAGRLLPPPAPGSPAAPAAVSPAAGQPRPPAPASRGPMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MAAAAASGAGGAAGAGTGGAGPAGRLLPPPAPGSPAAPAAVSPAAGQPRPPAPASRGPMP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 ARIGYYEIDRTIGKGNFAVVKRATHLVTKAKVAIKIIDKTQLDEENLKKIFREVQIMKML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 ARIGYYEIDRTIGKGNFAVVKRATHLVTKAKVAIKIIDKTQLDEENLKKIFREVQIMKML
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 CHPHIIRLYQVMETERMIYLVTEYASGGEIFDHLVAHGRMAEKEARRKFKQIVTAVYFCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 CHPHIIRLYQVMETERMIYLVTEYASGGEIFDHLVAHGRMAEKEARRKFKQIVTAVYFCH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 CRNIVHRDLKAENLLLDANLNIKIADFGFSNLFTPGQLLKTWCGSPPYAAPELFEGKEYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 CRNIVHRDLKAENLLLDANLNIKIADFGFSNLFTPGQLLKTWCGSPPYAAPELFEGKEYD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 GPKVDIWSLGVVLYVLVCGALPFDGSTLQNLRARVLSGKFRIPFFMSTECEHLIRHMLVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 GPKVDIWSLGVVLYVLVCGALPFDGSTLQNLRARVLSGKFRIPFFMSTECEHLIRHMLVL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 DPNKRLSMEQICKHKWMKLGDADPNFDRLIAECQQLKEERQVDPLNEDVLLAMEDMGLDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 DPNKRLSMEQICKHKWMKLGDADPNFDRLIAECQQLKEERQVDPLNEDVLLAMEDMGLDK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 EQTLQSLRSDAYDHYSAIYSLLCDRHKRHKTLRLGALPSMPRALAFQAPVNIQAEQAGTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 EQTLQSLRSDAYDHYSAIYSLLCDRHKRHKTLRLGALPSMPRALAFQAPVNIQAEQAGTA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 MNISVPQVQLINPENQIVEPDGTLNLDSDEGEEPSPEALVRYLSMRRHTVGVADPRTEVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MNISVPQVQLINPENQIVEPDGTLNLDSDEGEEPSPEALVRYLSMRRHTVGVADPRTEVM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 EDLQKLLPGFPGVNPQAPFLQVAPNVNFMHNLLPMQNLQPTGQLEYKEQSLLQPPTLQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 EDLQKLLPGFPGVNPQAPFLQVAPNVNFMHNLLPMQNLQPTGQLEYKEQSLLQPPTLQLL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 NGMGPLGRRASDGGANIQLHAQQLLKRPRGPSPLVTMTPAVPAVTPVDEESSDGEPDQEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 NGMGPLGRRASDGGANIQLHAQQLLKRPRGPSPLVTMTPAVPAVTPVDEESSDGEPDQEA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 VQSSTYKDSNTLHLPTERFSPVRRFSDGAASIQAFKAHLEKMGNNSSIKQLQQECEQLQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 VQSSTYKDSNTLHLPTERFSPVRRFSDGAASIQAFKAHLEKMGNNSSIKQLQQECEQLQK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 MYGGQIDERTLEKTQQQHMLYQQEQHHQILQQQIQDSICPPQPSPPLQAACENQPALLTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MYGGQIDERTLEKTQQQHMLYQQEQHHQILQQQIQDSICPPQPSPPLQAACENQPALLTH
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 QLQRLRIQPSSPPPNHPNNHLFRQPSNSPPPMSSAMIQPHGAASSSQFQGLPSRSAIFQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 QLQRLRIQPSSPPPNHPNNHLFRQPSNSPPPMSSAMIQPHGAASSSQFQGLPSRSAIFQQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 QPENCSSPPNVALTCLGMQQPAQSQQVTIQVQEPVDMLSNMPGTAAGSSGRGISISPSAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 QPENCSSPPNVALTCLGMQQPAQSQQVTIQVQEPVDMLSNMPGTAAGSSGRGISISPSAG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 QMQMQHRTNLMATLSYGHRPLSKQLSADSAEAHSLNVNRFSPANYDQAHLHPHLFSDQSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 QMQMQHRTNLMATLSYGHRPLSKQLSADSAEAHSLNVNRFSPANYDQAHLHPHLFSDQSR
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 GSPSSYSPSTGVGFSPTQALKVPPLDQFPTFPPSAHQQPPHYTTSALQQALLSPTPPDYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 GSPSSYSPSTGVGFSPTQALKVPPLDQFPTFPPSAHQQPPHYTTSALQQALLSPTPPDYT
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 RHQQVPHILQGLLSPRHSLTGHSDIRLPPTEFAQLIKRQQQQRQQQQQQQQQQEYQELFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 RHQQVPHILQGLLSPRHSLTGHSDIRLPPTEFAQLIKRQQQQRQQQQQQQQQQEYQELFR
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 HMNQGDAGSLAPSLGGQSMTERQALSYQNADSYHHHTSPQHLLQIRAQECVSQASSPTPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 HMNQGDAGSLAPSLGGQSMTERQALSYQNADSYHHHTSPQHLLQIRAQECVSQASSPTPP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE3 HGYAHQPALMHSESMEEDCSCEGAKDGFQDSKSSSTLTKGCHDSPLLLSTGGPGDPESLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 HGYAHQPALMHSESMEEDCSCEGAKDGFQDSKSSSTLTKGCHDSPLLLSTGGPGDPESLL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE3 GTVSHAQELGIHPYGHQPTAAFSKNKVPSREPVIGNCMDRSSPGQAVELPDHNGLGYPAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 GTVSHAQELGIHPYGHQPTAAFSKNKVPSREPVIGNCMDRSSPGQAVELPDHNGLGYPAR
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE3 PSVHEHHRPRALQRHHTIQNSDDAYVQLDNLPGMSLVAGKALSSARMSDAVLSQSSLMGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 PSVHEHHRPRALQRHHTIQNSDDAYVQLDNLPGMSLVAGKALSSARMSDAVLSQSSLMGS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE3 QQFQDGENEECGASLGGHEHPDLSDGSQHLNSSCYPSTCITDILLSYKHPEVSFSMEQAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 QQFQDGENEECGASLGGHEHPDLSDGSQHLNSSCYPSTCITDILLSYKHPEVSFSMEQAG
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE3 V
:
CCDS83 V
>>CCDS60974.1 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1261 aa)
initn: 4129 init1: 4051 opt: 4291 Z-score: 2149.1 bits: 409.9 E(32554): 2.2e-113
Smith-Waterman score: 7909; 88.5% identity (88.5% similar) in 1369 aa overlap (1-1321:1-1261)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MAAAAASGAGGAAGAGTGGAGPAGRLLPPPAPGSPAAPAAVSPAAGQPRPPAPASRGPMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MAAAAASGAGGAAGAGTGGAGPAGRLLPPPAPGSPAAPAAVSPAAGQPRPPAPASRGPMP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 ARIGYYEIDRTIGKGNFAVVKRATHLVTKAKVAIKIIDKTQLDEENLKKIFREVQIMKML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 ARIGYYEIDRTIGKGNFAVVKRATHLVTKAKVAIKIIDKTQLDEENLKKIFREVQIMKML
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 CHPHIIRLYQVMETERMIYLVTEYASGGEIFDHLVAHGRMAEKEARRKFKQIVTAVYFCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 CHPHIIRLYQVMETERMIYLVTEYASGGEIFDHLVAHGRMAEKEARRKFKQIVTAVYFCH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 CRNIVHRDLKAENLLLDANLNIKIADFGFSNLFTPGQLLKTWCGSPPYAAPELFEGKEYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 CRNIVHRDLKAENLLLDANLNIKIADFGFSNLFTPGQLLKTWCGSPPYAAPELFEGKEYD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 GPKVDIWSLGVVLYVLVCGALPFDGSTLQNLRARVLSGKFRIPFFMSTECEHLIRHMLVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 GPKVDIWSLGVVLYVLVCGALPFDGSTLQNLRARVLSGKFRIPFFMSTECEHLIRHMLVL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 DPNKRLSMEQICKHKWMKLGDADPNFDRLIAECQQLKEERQVDPLNEDVLLAMEDMGLDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 DPNKRLSMEQICKHKWMKLGDADPNFDRLIAECQQLKEERQVDPLNEDVLLAMEDMGLDK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 EQTLQSLRSDAYDHYSAIYSLLCDRHKRHKTLRLGALPSMPRALAFQAPVNIQAEQAGTA
:::: ::::::::
CCDS60 EQTL------------------------------------------------QAEQAGTA
370
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 MNISVPQVQLINPENQIVEPDGTLNLDSDEGEEPSPEALVRYLSMRRHTVGVADPRTEVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MNISVPQVQLINPENQIVEPDGTLNLDSDEGEEPSPEALVRYLSMRRHTVGVADPRTEVM
380 390 400 410 420 430
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 EDLQKLLPGFPGVNPQAPFLQVAPNVNFMHNLLPMQNLQPTGQLEYKEQSLLQPPTLQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 EDLQKLLPGFPGVNPQAPFLQVAPNVNFMHNLLPMQNLQPTGQLEYKEQSLLQPPTLQLL
440 450 460 470 480 490
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 NGMGPLGRRASDGGANIQLHAQQLLKRPRGPSPLVTMTPAVPAVTPVDEESSDGEPDQEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 NGMGPLGRRASDGGANIQLHAQQLLKRPRGPSPLVTMTPAVPAVTPVDEESSDGEPDQEA
500 510 520 530 540 550
610
pF1KE3 VQS------------------------------------------------STYKDSNTL
:: :::::::::
CCDS60 VQRYLANRSKRHTLAMTNPTAEIPPDLQRQLGQQPFRSRVWPPHLVPDQHRSTYKDSNTL
560 570 580 590 600 610
620 630 640 650 660 670
pF1KE3 HLPTERFSPVRRFSDGAASIQAFKAHLEKMGNNSSIKQLQQECEQLQKMYGGQIDERTLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 HLPTERFSPVRRFSDGAASIQAFKAHLEKMGNNSSIKQLQQECEQLQKMYGGQIDERTLE
620 630 640 650 660 670
680 690 700 710 720 730
pF1KE3 KTQQQHMLYQQEQHHQILQQQIQDSICPPQPSPPLQAACENQPALLTHQLQRLRIQPSSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 KTQQQHMLYQQEQHHQILQQQIQDSICPPQPSPPLQAACENQPALLTHQLQRLRIQPSSP
680 690 700 710 720 730
740 750 760 770 780 790
pF1KE3 PPNHPNNHLFRQPSNSPPPMSSAMIQPHGAASSSQFQGLPSRSAIFQQQPENCSSPPNVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PPNHPNNHLFRQPSNSPPPMSSAMIQPHGAASSSQFQGLPSRSAIFQQQPENCSSPPNVA
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pF1KE3 LTCLGMQQPAQSQQVTIQVQEPVDMLSNMPGTAAGSSGRGISISPSAGQMQMQHRTNLMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LTCLGMQQPAQSQQVTIQVQEPVDMLSNMPGTAAGSSGRGISISPSAGQMQMQHRTNLMA
800 810 820 830 840 850
860 870 880 890 900 910
pF1KE3 TLSYGHRPLSKQLSADSAEAHSLNVNRFSPANYDQAHLHPHLFSDQSRGSPSSYSPSTGV
::::::::::::::::::::::
CCDS60 TLSYGHRPLSKQLSADSAEAHS--------------------------------------
860 870
920 930 940 950 960 970
pF1KE3 GFSPTQALKVPPLDQFPTFPPSAHQQPPHYTTSALQQALLSPTPPDYTRHQQVPHILQGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 ----------------------AHQQPPHYTTSALQQALLSPTPPDYTRHQQVPHILQGL
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pF1KE3 LSPRHSLTGHSDIRLPPTEFAQLIKRQQQQRQQQQQQQQQQEYQELFRHMNQGDAGSLAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LSPRHSLTGHSDIRLPPTEFAQLIKRQQQQRQQQQQQQQQQEYQELFRHMNQGDAGSLAP
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pF1KE3 SLGGQSMTERQALSYQNADSYHHHTSPQHLLQIRAQECVSQASSPTPPHGYAHQPALMHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SLGGQSMTERQALSYQNADSYHHHTSPQHLLQIRAQECVSQASSPTPPHGYAHQPALMHS
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pF1KE3 ESMEEDCSCEGAKDGFQDSKSSSTLTKGCHDSPLLLSTGGPGDPESLLGTVSHAQELGIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 ESMEEDCSCEGAKDGFQDSKSSSTLTKGCHDSPLLLSTGGPGDPESLLGTVSHAQELGIH
1040 1050 1060 1070 1080 1090
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pF1KE3 PYGHQPTAAFSKNKVPSREPVIGNCMDRSSPGQAVELPDHNGLGYPARPSVHEHHRPRAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PYGHQPTAAFSKNKVPSREPVIGNCMDRSSPGQAVELPDHNGLGYPARPSVHEHHRPRAL
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pF1KE3 QRHHTIQNSDDAYVQLDNLPGMSLVAGKALSSARMSDAVLSQSSLMGSQQFQDGENEECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 QRHHTIQNSDDAYVQLDNLPGMSLVAGKALSSARMSDAVLSQSSLMGSQQFQDGENEECG
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 ASLGGHEHPDLSDGSQHLNSSCYPSTCITDILLSYKHPEVSFSMEQAGV
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: .:::. :.:.:.:. :.::::::::
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pF1KE3 KRATHLVTKAKVAIKIIDKTQLDEENLKKIFREVQIMKMLCHPHIIRLYQVMETERMIYL
: . : .::..::::::::.::: ::.::.::::::::: :::::.:::::::. :.::
CCDS83 KLGRHRITKTEVAIKIIDKSQLDAVNLEKIYREVQIMKMLDHPHIIKLYQVMETKSMLYL
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:::::..:::::.:. :::. :.:::::: ::..:: .:: :.:::::::::::::: :.
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:::::::::.:.: :.:: ::::::::::::.:::..:.::..::::.:::::::::::
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::::: :: :: ::: :.::::.::: .::::::.::::::.:::.. :: .:::: .
CCDS83 LPFDGPTLPILRQRVLEGRFRIPYFMSEDCEHLIRRMLVLDPSKRLTIAQIKEHKWMLI-
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. .: . :. ..: .. .::.:: :...:.:...:..::.. .:.:..:::
CCDS83 --EVPVQRPVLYPQEQENEPSIGEFNEQVLRLMHSLGIDQQKTIESLQNKSYNHFAAIYF
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:: .: : :.. :: . : ..: :. . .:. .: ... :...:.
CCDS83 LLVERLKSHRSSFPVEQRLDGRQRRPSTIAEQTVA--KAQTVGLPVTMHSPNMRLLRSAL
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:. . :: : . . .. :: : : .::: ...
CCDS83 LPQASNVEAFSFPASGCQAEAAFMEEECVDTPKVNGCLLDPVPPVLVRKGC---QSLPSN
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.: . : :. : .: : .: . . . :.: . : . : :.
CCDS83 MMETSIDEGLET--EGEAEEDPAHAFEAFQSTRSGQRRHTLSEVTNQLVVMPGAGKIFSM
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pF1KE3 LQPPTLQLLNG---MGPLGRRASDGGANIQLHAQQLLKRP--RGPSPLVTMTPAVPAVTP
. :.:. ... :: . : . : .:. .: ..: : ::.... :. ::.
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.:..:. . : . :. : :: :: . . : ::. ::....
CCDS83 ------------QALSSQKREVHN--RSPVS-FREGRRASDTSLTQGIVAFRQHLQNLAR
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...: .:.. . : .. : . : . : . : .. .... ::: . : : .
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: :. . : :.::. :: . . .:. . :: ..: : .
CCDS83 PQLSPRQSLETQYLQHRLQK----PSLLSKAQNTCQLY---CKEPPRSLEQQLQEHRLQQ
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. : : . .: :.: : . : : :. : .. : :::. : .. . .
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. :: . .. :: .:.: .. : .: : : :: ::. ..
CCDS83 SPVLEPSS-EQMQYSPFLSQYQEMQLQPLPST--SGPRAAPPLPTQLQQQQPPPPPPP--
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: : : :: :. ::. ::. .: : : .: : :
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:. .. : : ::..
CCDS83 PGLQEAPSSYDPLALSELPGLFDCEMLDAVDPQHNGYVLVN
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.:::.:..::.::.:...:...:.:::.:: ::..:: .:: ..:::::::.::::::.:
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..::.:::::.:.. :. :.::::::::::::.::::::.::..:::::::::::::::
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.::::: .: .:: ::: :.:::::::: .:: :::.:::.:: .:... :: .:.::.
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:.: . : .. . .. : .:..: :. .:.:...:..::....:.:..
CCDS82 --AEPCLPG--PACPAFSAHSYTSNLGDYDEQALGIMQTLGVDRQRTVESLQNSSYNHFA
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::: :: .: :.... . : :. .:: . . .... : : . . : :. :
CCDS82 AIYYLLLERLKEYRNAQC-ARPGPARQPRPRSSDLS-GLEVPQEGLSTDPFRPA--LLCP
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. : . ...:. . : : : .. . :: :: .: : ..
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:.: :. .. .. :: .. . : . . : : : . . . ....
CCDS82 ARQGPGLEEEQDT---QESLPSSTGRRHTLAEVSTRLSPLTAPCIVVSPSTTASPAEGTS
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. . . . :. : : : : . . : .:: : : . : .. ...
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pF1KE3 LHLPTERFSPVRRFSDGAAS--IQAFKAHLEK-------MGNNSSIKQL-QQECE-----
. ::. :. :: :: . . ..::. .:.: .: :. :: : .: :.
CCDS82 VLLPVS-FQEGRRASDTSLTQGLKAFRQQLRKTTRTKGFLGLNK-IKGLARQVCQVPASR
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pF1KE3 -------------QLQKMYGGQIDERT----LEKTQQQHMLYQQEQHHQILQQQIQDSIC
: ..:: : ::.. .:. : : ::: ...
CCDS82 ASRGGLSPFHAPAQSPGLHGGAAGSREGWSLLEEVLEQQRLLQL-QHHPAAAPGCSQAP-
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pF1KE3 PPQPSPPLQAACENQPALLTHQLQRLRIQPSSPPPNHPNNHLFRQPSNSPPPMSSAMIQP
: :.: . : :.. : . : ::: . : . :: .. ...
CCDS82 QPAPAPFVIAPCDGPGAAPLPSTLLTSGLPLLPPP-------LLQTGASPVASAAQLLDT
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pF1KE3 HGAASSSQFQGLPSRSAIFQQQPENCSSPPNVALTCLGMQQPAQSQQVTIQVQEPVDMLS
:
CCDS82 HLHIGTGPTALPAVPPPRLARLAPGCEPLGLLQGDCEMEDLMPCSLGTFVLVQ
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pF1KE3 GPAGRLLPPPAPGSPAAPAAVSPAAGQPRPPAPASRGPM-PARIGYYEIDRTIGKGNFAV
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CCDS33 MVIMSEFSADPAGQGQGQQKPLRVGFYDIERTLGKGNFAV
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pF1KE3 VKRATHLVTKAKVAIKIIDKTQLDEENLKKIFREVQIMKMLCHPHIIRLYQVMETERMIY
:: : : :::..:::::::::.:: ::.::.::::.::.: :::::.:::::::. :.:
CCDS33 VKLARHRVTKTQVAIKIIDKTRLDSSNLEKIYREVQLMKLLNHPHIIKLYQVMETKDMLY
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pF1KE3 LVTEYASGGEIFDHLVAHGRMAEKEARRKFKQIVTAVYFCHCRNIVHRDLKAENLLLDAN
.:::.:..::.::.:...:...:.:::.:: ::..:: .:: ..:::::::.::::::.:
CCDS33 IVTEFAKNGEMFDYLTSNGHLSENEARKKFWQILSAVEYCHDHHIVHRDLKTENLLLDGN
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pF1KE3 LNIKIADFGFSNLFTPGQLLKTWCGSPPYAAPELFEGKEYDGPKVDIWSLGVVLYVLVCG
..::.:::::.:.. :. :.::::::::::::.::::::.::..:::::::::::::::
CCDS33 MDIKLADFGFGNFYKSGEPLSTWCGSPPYAAPEVFEGKEYEGPQLDIWSLGVVLYVLVCG
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pF1KE3 ALPFDGSTLQNLRARVLSGKFRIPFFMSTECEHLIRHMLVLDPNKRLSMEQICKHKWMKL
.::::: .: .:: ::: :.:::::::: .:: :::.:::.:: .:... :: .:.::.
CCDS33 SLPFDGPNLPTLRQRVLEGRFRIPFFMSQDCESLIRRMLVVDPARRITIAQIRQHRWMR-
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:.: . : .. . .. : .:..: :. .:.:...:..::....:.:..
CCDS33 --AEPCLPG--PACPAFSAHSYTSNLGDYDEQALGIMQTLGVDRQRTVESLQNSSYNHFA
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pF1KE3 AIYSLLCDRHKRHKTLRLGALPS---MPRALAFQAPVNIQAEQAGTAMNISVPQVQLINP
::: :: .: :.... . : :. .:: . . .... : : . . : :. :
CCDS33 AIYYLLLERLKEYRNAQC-ARPGPARQPRPRSSDLS-GLEVPQEGLSTDPFRPA--LLCP
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. : . ...:. . : : : .. . :: :: .: : ..
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:.: :. .. .. :: .. . : . . : : : . . . ....
CCDS33 ARQGPGLEEEQDT---QESLPSSTGRRHTLAEVSTRLSPLTAPCIVVSPSTTASPAEGTS
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pF1KE3 GGANIQLHAQQLLKRPRGPSPLVTMTPAVPAVTPVDEESS-DGEPDQEAVQSSTYKDSNT
. . . . :. : : : : . . : .:: : : . : .. ...
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. ::. :. :: :: . . ..::. .:.: .: :. :: : .: :.
CCDS33 VLLPVS-FQEGRRASDTSLTQGLKAFRQQLRKTTRTKGFLGLNK-IKGLARQVCQAPASR
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pF1KE3 -------------QLQKMYGGQIDERT----LEKTQQQHMLYQQEQHHQILQQQIQDSIC
: ..:: : ::.. .:. : : ::: ...
CCDS33 ASRGGLSPFHAPAQSPGLHGGAAGSREGWSLLEEVLEQQRLLQL-QHHPAAAPGCSQAP-
620 630 640 650 660 670
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pF1KE3 PPQPSPPLQAACENQPALLTHQLQRLRIQPSSPPPNHPNNHLFRQPSNSPPPMSSAMIQP
: :.: . : :.. : . : ::: . : . :: .. ...
CCDS33 QPAPAPFVIAPCDGPGAAPLPSTLLTSGLPLLPPP-------LLQTGASPVASAAQLLDT
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:
CCDS33 HLHIGTGPTALPAVPPPRLARLAPGCEPLGLLQGDCEMEDLMPCSLGTFVLVQ
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30 40 50 60 70 80
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:: . .:: :.. .:::::::: :: :
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:..: .:::::::::::. .:.:.::::.:::.: ::.:..:..:.:::. .::. :
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80 90 100 110 120 130
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::::::.::.::::::: ::::: ::.:::.:: .:: . :::::::::::::::..:::
CCDS55 YASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARSKFRQIVSAVQYCHQKRIVHRDLKAENLLLDADMNIK
140 150 160 170 180 190
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::..:..:: ::: ::.::::.:::.::.:....:::.: :: ..::: : .:.. : .
CCDS55 DGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLEQIMKDRWINAGHEE
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.. .. ........: : :: ..:. .:: . ::. .: : ::
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. .. . : : .. :... . ...:: : .:.: ..:
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:. :. :. ... : :.
CCDS55 TSTADSDLKEDGISSRKSSGSAVGGKGIAPASPMLGNASNPNKADIPERKKSSTVPSSNT
430 440 450 460 470 480
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: .::..: : :.: . : . . :: .....: : .:. .:: ..
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:.. : : ::
CCDS53 YNEVMATYLLLGYKSSELEGDTITLKPRPSADLTNSSAPSPSHKVQRSVSANPKQRRFSD
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>>CCDS53650.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 (719 aa)
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: ... : :. . .:: :.. .:
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::::::: :: : :..: .::.::::::::. .:.:.::::.:::.: ::.:..:..:
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120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KE3 ENLLLDANLNIKIADFGFSNLFTPGQLLKTWCGSPPYAAPELFEGKEYDGPKVDIWSLGV
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CCDS53 ENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTFGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGV
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260 270 280 290 300 310
pF1KE3 VLYVLVCGALPFDGSTLQNLRARVLSGKFRIPFFMSTECEHLIRHMLVLDPNKRLSMEQI
.::.:: :.:::::..:..:: ::: ::.::::.:::.::.:....:.:.:.:: ..:::
CCDS53 ILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKFLILNPSKRGTLEQI
240 250 260 270 280 290
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: .::..: : :.: . : . . :: .....: : .:. .:: ..
CCDS53 MKDRWMNVGHED---DELKPYVEPLPDYK--DPRRTELMVSM---GYTREEIQDSLVGQR
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pF1KE3 YDHYSAIYSLLCDRHKRHKTLRLGALPSMPRALAFQAPVNIQAEQAGTAMNISVPQVQLI
:.. : : ::
CCDS53 YNEVMATYLLLGYKSSELEGDTITLKPRPSADLTNSSAPSPSHKVQRSVSANPKQRRFSD
360 370 380 390 400 410
>>CCDS8051.2 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 (724 aa)
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20 30 40 50 60 70
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: ... : :. . .:: :.. .:
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:.. : : ::
CCDS80 YNEVMATYLLLGYKSSELEGDTITLKPRPSADLTNSSAPSPSHKVQRSVSANPKQRRFSD
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CCDS53 IGKGNFAKVKLARHILTGKEVAVKIIDKTQLNSSSLQKLFREVRIMKVLNHPNIVKLFEV
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CCDS53 IETEKTLYLVMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKFIVHRDLKA
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CCDS53 ENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTFGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGV
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CCDS53 ILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKFLILNPSKRGTLEQI
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CCDS53 MKDRWMNVGHED---DELKPYVEPLPDYK--DPRRTELMVSM---GYTREEIQDSLVGQR
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CCDS53 YNEVMATYLLL---GYKSSELEGDTITLKPRPSA--DLTNSSAPSPSHKVQRSVSA----
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::... ::.. :. . : : . .. .. . : : .. . .
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: : .:. :. : .. :: . .:.:. : . : .:: .:::
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: :.:: .... : : . . .. . :: :. : . :.....:.. .. .
CCDS53 LGQASIQ-NGKDSLTMPGSRASTASASAAVSAARP--------RQHQKSMSASVHPNKAS
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CCDS53 GLPPTESNCEVPRPSTAPQRVPVASPSAHNISSS-----------------GGAPDRTNF
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CCDS53 PRGVSSRSTFHAGQLRQVRDQQNLPYGVTPASPSGHSQGRRGASGSIFSKFTSKFVRRNL
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CCDS53 SFRFARRNLNEPESKDRVETLRPHVVGSGGNDKEKEEFREAKPRSLRFTWSMKTTSSMEP
650 660 670 680 690 700
1321 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 17:40:37 2016 done: Tue Nov 8 17:40:38 2016
Total Scan time: 4.030 Total Display time: 0.240
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]