FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3437, 963 aa
1>>>pF1KE3437 963 - 963 aa - 963 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4190+/-0.000905; mu= 16.7586+/- 0.055
mean_var=99.5737+/-19.484, 0's: 0 Z-trim(109.2): 90 B-trim: 5 in 1/50
Lambda= 0.128529
statistics sampled from 10650 (10743) to 10650 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.674), E-opt: 0.2 (0.33), width: 16
Scan time: 4.130
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14277.1 USP11 gene_id:8237|Hs108|chrX ( 963) 6624 1239.2 0
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CCDS2793.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3 ( 963) 2241 426.5 1.2e-118
CCDS8963.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12 ( 952) 1461 281.9 4.2e-75
CCDS58251.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12 ( 981) 1461 281.9 4.3e-75
CCDS32697.1 USP32 gene_id:84669|Hs108|chr17 (1604) 938 185.0 1e-45
CCDS43090.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3 (1318) 886 175.3 6.8e-43
CCDS56256.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3 (1372) 886 175.3 7.1e-43
CCDS56255.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3 (1384) 886 175.4 7.1e-43
CCDS56254.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3 (1419) 886 175.4 7.2e-43
CCDS11069.2 USP6 gene_id:9098|Hs108|chr17 (1406) 860 170.5 2e-41
CCDS61632.1 USP8 gene_id:9101|Hs108|chr15 (1012) 645 130.6 1.6e-29
CCDS10137.1 USP8 gene_id:9101|Hs108|chr15 (1118) 645 130.6 1.7e-29
CCDS8423.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 ( 396) 526 108.3 3.1e-23
CCDS58189.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 ( 362) 518 106.8 8.2e-23
CCDS8422.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 ( 605) 519 107.1 1.1e-22
CCDS58250.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12 ( 235) 437 91.6 1.9e-18
CCDS58832.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3 ( 313) 431 90.6 5.2e-18
CCDS58370.1 USP3 gene_id:9960|Hs108|chr15 ( 476) 422 89.0 2.3e-17
CCDS32265.1 USP3 gene_id:9960|Hs108|chr15 ( 520) 422 89.1 2.5e-17
CCDS30920.1 USP21 gene_id:27005|Hs108|chr1 ( 565) 389 83.0 1.9e-15
CCDS679.1 USP33 gene_id:23032|Hs108|chr1 ( 911) 353 76.4 2.8e-13
CCDS678.1 USP33 gene_id:23032|Hs108|chr1 ( 942) 353 76.4 2.9e-13
CCDS680.1 USP33 gene_id:23032|Hs108|chr1 ( 828) 348 75.5 5e-13
CCDS43892.1 USP20 gene_id:10868|Hs108|chr9 ( 914) 344 74.7 9.1e-13
>>CCDS14277.1 USP11 gene_id:8237|Hs108|chrX (963 aa)
initn: 6624 init1: 6624 opt: 6624 Z-score: 6635.8 bits: 1239.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6624; 100.0% identity (100.0% similar) in 963 aa overlap (1-963:1-963)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MAVAPRLFGGLCFRFRDQNPEVAVEGRLPISHSCVGCRRERTAMATVAANPAAAAAAVAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MAVAPRLFGGLCFRFRDQNPEVAVEGRLPISHSCVGCRRERTAMATVAANPAAAAAAVAA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 AAAVTEDREPQHEELPGLDSQWRQIENGESGRERPLRAGESWFLVEKHWYKQWEAYVQGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AAAVTEDREPQHEELPGLDSQWRQIENGESGRERPLRAGESWFLVEKHWYKQWEAYVQGG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 DQDSSTFPGCINNATLFQDEINWRLKEGLVEGEDYVLLPAAAWHYLVSWYGLEHGQPPIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DQDSSTFPGCINNATLFQDEINWRLKEGLVEGEDYVLLPAAAWHYLVSWYGLEHGQPPIE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 RKVIELPNIQKVEVYPVELLLVRHNDLGKSHTVQFSHTDSIGLVLRTARERFLVEPQEDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RKVIELPNIQKVEVYPVELLLVRHNDLGKSHTVQFSHTDSIGLVLRTARERFLVEPQEDT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 RLWAKNSEGSLDRLYDTHITVLDAALETGQLIIMETRKKDGTWPSAQLHVMNNNMSEEDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RLWAKNSEGSLDRLYDTHITVLDAALETGQLIIMETRKKDGTWPSAQLHVMNNNMSEEDE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 DFKGQPGICGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DFKGQPGICGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 AYADLVKQAWSGHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AYADLVKQAWSGHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 KKEYVELCDAAGRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KKEYVELCDAAGRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 FCYLSVPLPISHKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKGKISDLCVALSKHTGISPERM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FCYLSVPLPISHKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKGKISDLCVALSKHTGISPERM
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 MVADVFSHRFYKLYQLEEPLSSILDRDDIFVYEVSGRIEAIEGSREDIVVPVYLRERTPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MVADVFSHRFYKLYQLEEPLSSILDRDDIFVYEVSGRIEAIEGSREDIVVPVYLRERTPA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 RDYNNSYYGLMLFGHPLLVSVPRDRFTWEGLYNVLMYRLSRYVTKPNSDDEDDGDEKEDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RDYNNSYYGLMLFGHPLLVSVPRDRFTWEGLYNVLMYRLSRYVTKPNSDDEDDGDEKEDD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 EEDKDDVPGPSTGGSLRDPEPEQAGPSSGVTNRCPFLLDNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EEDKDDVPGPSTGGSLRDPEPEQAGPSSGVTNRCPFLLDNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 TVNSNGTSDRTTSPEEVHAQPYIAIDWEPEMKKRYYDEVEAEGYVKHDCVGYVMKKAPVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TVNSNGTSDRTTSPEEVHAQPYIAIDWEPEMKKRYYDEVEAEGYVKHDCVGYVMKKAPVR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 LQECIELFTTVETLEKENPWYCPSCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LQECIELFTTVETLEKENPWYCPSCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREK
790 800 810 820 830 840
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pF1KE3 LDTLVEFPIRDLDFSEFVIQPQNESNPELYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LDTLVEFPIRDLDFSEFVIQPQNESNPELYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQ
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pF1KE3 WHYFDDNSVSPVNENQIESKAAYVLFYQRQDVARRLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 WHYFDDNSVSPVNENQIESKAAYVLFYQRQDVARRLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFM
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 DVN
:::
CCDS14 DVN
>>CCDS2794.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3 (916 aa)
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Smith-Waterman score: 2711; 48.1% identity (72.6% similar) in 910 aa overlap (79-952:12-901)
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 ANPAAAAAAVAAAAAVTEDREPQHEELPGLDSQWRQIENGESGRERPLRAGESWFLVEKH
:.. .. : : : :. : .:.:....
CCDS27 MAEGGGCRERPDAETQKSELGPLMRTT-LQRGAQWYLIDSR
10 20 30 40
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 WYKQWEAYVQGGDQ-------DSSTFPGCINNATLFQDEINWRLKEGLVEGEDYVLLPAA
:.:::. :: : :. . . ::: :.:. ::.: . ::: :.. ::::.:.
CCDS27 WFKQWKKYV-GFDSWDMYNVGEHNLFPGPIDNSGLFSDPESQTLKEHLIDELDYVLVPTE
50 60 70 80 90
170 180 190 200 210
pF1KE3 AWHYLVSWYGLEHGQPPIERKVIE---LPNIQKVEVYPVELLLVRHNDLGKSHTVQFSHT
::. :..::: .:: :: :::.: . . ::::: .:: : ...: . . .::..
CCDS27 AWNKLLNWYGCVEGQQPIVRKVVEHGLFVKHCKVEVYLLELKLCENSDPTNVLSCHFSKA
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 DSIGLVLRTARERFLVEPQEDTRLWAKNSEGSLDRLYDTHITVLDAALETGQLIIMETRK
:.:. . . :. : . ...:::: : .. ..: :: ::.: ::....: ..
CCDS27 DTIATIEKEMRKLFNIPAERETRLWNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQN
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 KDGTWPSAQLHVMNNNMS-----EEDEDFKGQPGICGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQL
.::::: :. ....: .: . . :::.::: :::::::::::::::::. :
CCDS27 EDGTWPRQTLQSNGSGFSASYNCQEPPSSHIQPGLCGLGNLGNTCFMNSALQCLSNTAPL
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 TEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYADLVKQAWSGHHRSIVPHVFKNKVGHFASQF
:.:::.. : :.: ::::::::::::::.:.:: :::. ..:..::..::.:: ::
CCDS27 TDYFLKDEYEAEINRDNPLGMKGEIAEAYAELIKQMWSGRDAHVAPRMFKTQVGRFAPQF
280 290 300 310 320 330
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pF1KE3 LGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVKKKEYVELCDAAGRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSV
::::.::::::.:::::::::::::::: :.:: :: :::: ::.:::.::. :::::
CCDS27 SGYQQQDSQELLAFLLDGLHEDLNRVKKKPYLELKDANGRPDAVVAKEAWENHRLRNDSV
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pF1KE3 IVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDPFCYLSVPLPISHKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHR
::::::::::::::::.:..:::::::::::..:::... ::.:::..: ::. .: :.:
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pF1KE3 LVVPKKGKISDLCVALSKHTGISPERMMVADVFSHRFYKLYQLEEPLSSILDRDDIFVYE
..:: : .:::: :::. .::. : :.::::..:::.:..:..: :. :. ::::::::
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pF1KE3 VSGRIEAIEGSREDIVVPVYLRERTPARDYNNSYYGLMLFGHPLLVSVPRDRFTWEGLYN
: . ...:: : ...:::.::: .: ..: . :.:.:::.:::. ..: :.::.
CCDS27 VCS--TSVDGS-ECVTLPVYFRERK-SRPSSTSSAS-ALYGQPLLLSVPKHKLTLESLYQ
520 530 540 550 560 570
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pF1KE3 VLMYRLSRYVTKPNSDDED---------DGDEKEDDEEDKDDVPGPSTGGSLRDPEPEQA
.. :.:::: .: :. .:... . ::.... : .. :
CCDS27 AVCDRISRYVKQPLPDEFGSSPLEPGACNGSRNSCEGEDEEEMEHQEEG---KEQLSETE
580 590 600 610 620 630
690 700 710 720 730
pF1KE3 GPSSGVTNRCPFLLDNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQTVNSNGTSDRTTSPEE-----VHA
: . . : . .: :.: :::.. ::: ::.: .. . ...
CCDS27 GSGEDEPGNDPSETTQKKIKGQPCPKR----LFTFSLVNSYGTADINSLAADGKLLKLNS
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pF1KE3 QPYIAIDWEPEMKKRYYDEVEAEGYVKHDCVGYVM----KKAPVRLQECIELFTTVETLE
. .:.::. : .. :::: :.:.: :: :.... ::. : :..:::::::.:::
CCDS27 RSTLAMDWDSETRRLYYDEQESEAYEKH--VSMLQPQKKKKTTVALRDCIELFTTMETLG
690 700 710 720 730 740
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pF1KE3 KENPWYCPSCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDTLVEFPIRDLDFS
...:::::.::.:: ::::.::: ::.::..:::::::... :.::::.:::::: :..:
CCDS27 EHDPWYCPNCKKHQQATKKFDLWSLPKILVVHLKRFSYNRYWRDKLDTVVEFPIRGLNMS
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pF1KE3 EFVIQPQNESNPELYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHYFDDNSVSPVNEN
::: . . . : : :::::::::::.: ::::..: :: .:.:.::::..:: ..:.
CCDS27 EFVCNLS--ARP--YVYDLIAVSNHYGAMGVGHYTAYAKNKLNGKWYYFDDSNVSLASED
810 820 830 840 850 860
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pF1KE3 QIESKAAYVLFYQRQD---VARRLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFMDVN
:: .::::::::::.: :: .::: . . :. :
CCDS27 QIVTKAAYVLFYQRRDDEFYKTPSLSSSGSSDGGTRPSSSQQGFGDDEACSMDTN
870 880 890 900 910
>>CCDS2793.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3 (963 aa)
initn: 2417 init1: 1343 opt: 2241 Z-score: 2243.4 bits: 426.5 E(32554): 1.2e-118
Smith-Waterman score: 2618; 46.0% identity (69.3% similar) in 957 aa overlap (79-952:12-948)
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 ANPAAAAAAVAAAAAVTEDREPQHEELPGLDSQWRQIENGESGRERPLRAGESWFLVEKH
:.. .. : : : :. : .:.:....
CCDS27 MAEGGGCRERPDAETQKSELGPLMRTT-LQRGAQWYLIDSR
10 20 30 40
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 WYKQWEAYVQGGDQ-------DSSTFPGCINNATLFQDEINWRLKEGLVEGEDYVLLPAA
:.:::. :: : :. . . ::: :.:. ::.: . ::: :.. ::::.:.
CCDS27 WFKQWKKYV-GFDSWDMYNVGEHNLFPGPIDNSGLFSDPESQTLKEHLIDELDYVLVPTE
50 60 70 80 90
170 180 190 200 210
pF1KE3 AWHYLVSWYGLEHGQPPIERKVIE---LPNIQKVEVYPVELLLVRHNDLGKSHTVQFSHT
::. :..::: .:: :: :::.: . . ::::: .:: : ...: . . .::..
CCDS27 AWNKLLNWYGCVEGQQPIVRKVVEHGLFVKHCKVEVYLLELKLCENSDPTNVLSCHFSKA
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 DSIGLVLRTARERFLVEPQEDTRLWAKNSEGSLDRLYDTHITVLDAALETGQLIIMETRK
:.:. . . :. : . ...:::: : .. ..: :: ::.: ::....: ..
CCDS27 DTIATIEKEMRKLFNIPAERETRLWNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQN
160 170 180 190 200 210
280 290
pF1KE3 KDGTWP------------------------------SAQLHVMNNNMS------------
.::::: ::.: . ... :
CCDS27 EDGTWPRQTLQSKSSTAPSRNFTTSPKSSASPYSSVSASLIANGDSTSTCGMHSSGVSRG
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340
pF1KE3 ----------EEDEDFKGQPGICGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEEL
.: . . :::.::: :::::::::::::::::. ::.:::.. : :.
CCDS27 GSGFSASYNCQEPPSSHIQPGLCGLGNLGNTCFMNSALQCLSNTAPLTDYFLKDEYEAEI
280 290 300 310 320 330
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pF1KE3 NFRNPLGMKGEIAEAYADLVKQAWSGHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHDSQELLS
: ::::::::::::::.:.:: :::. ..:..::..::.:: :: ::::.::::::.
CCDS27 NRDNPLGMKGEIAEAYAELIKQMWSGRDAHVAPRMFKTQVGRFAPQFSGYQQQDSQELLA
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 FLLDGLHEDLNRVKKKEYVELCDAAGRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHGLFKSTL
:::::::::::::::: :.:: :: :::: ::.:::.::. ::::::::::::::::::
CCDS27 FLLDGLHEDLNRVKKKPYLELKDANGRPDAVVAKEAWENHRLRNDSVIVDTFHGLFKSTL
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KE3 VCPDCGNVSVTFDPFCYLSVPLPISHKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKGKISDLC
:::.:..:::::::::::..:::... ::.:::..: ::. .: :.:..:: : .::::
CCDS27 VCPECAKVSVTFDPFCYLTLPLPLKKDRVMEVFLVPADPHCRPTQYRVTVPLMGAVSDLC
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KE3 VALSKHTGISPERMMVADVFSHRFYKLYQLEEPLSSILDRDDIFVYEVSGRIEAIEGSRE
:::. .::. : :.::::..:::.:..:..: :. :. ::::::::: . ...:: :
CCDS27 EALSRLSGIAAENMVVADVYNHRFHKIFQMDEGLNHIMPRDDIFVYEVCS--TSVDGS-E
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KE3 DIVVPVYLRERTPARDYNNSYYGLMLFGHPLLVSVPRDRFTWEGLYNVLMYRLSRYVTKP
...:::.::: .: ..: . :.:.:::.:::. ..: :.::... :.:::: .:
CCDS27 CVTLPVYFRERK-SRPSSTSSAS-ALYGQPLLLSVPKHKLTLESLYQAVCDRISRYVKQP
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650 660 670 680 690
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:. .:... . ::.... : .. : : . . :
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. .: :.: :::.. ::: ::.: .. . .... .:.::. : .
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. :::: :.:.: :: :.... ::. : :..:::::::.::: ...:::::.::.:
CCDS27 RLYYDEQESEAYEKH--VSMLQPQKKKKTTVALRDCIELFTTMETLGEHDPWYCPNCKKH
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pF1KE3 QLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDTLVEFPIRDLDFSEFVIQPQNESNPE
: ::::.::: ::.::..:::::::... :.::::.:::::: :..:::: . . . :
CCDS27 QQATKKFDLWSLPKILVVHLKRFSYNRYWRDKLDTVVEFPIRGLNMSEFVCNLS--ARP-
810 820 830 840 850 860
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CCDS27 -YVYDLIAVSNHYGAMGVGHYTAYAKNKLNGKWYYFDDSNVSLASEDQIVTKAAYVLFYQ
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: . ..:.::.:..::::.:: :: . ::. : : : : :.:..:
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:: :::.: . : :::: .:: : ....... : .::..:.: . . :. : .
CCDS58 PIARKVVEQGMFVKHCKVEVYLTELKLCENGNMNNVVTRRFSKADTIDTIEKEIRKIFSI
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CCDS58 KERTLEVYLVRMDPLTKPMQYKVVVPKIGNILDLCTALSALSGIPADKMIVTDIYNHRFH
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CCDS58 RIFAMDENLSSIMERDDIYVFEIN--INRTEDT-EHVIIPVCLREKFRHSSYTH-HTGSS
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CCDS58 IHEEGSPSEMETDEPDDESSQDQELPSENENSQSEDSVGGDNDSENGLCTEDTCKG--QL
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CCDS58 AVSNHYGGMGGGHYTAFAKNKDDGKWYYFDDSSVSTASEDQIVSKAAYVLFYQRQDTFSG
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CCDS58 TGFFPLDRETKGASAATGIPLESDEDSNDNDNDIENENCMHTN
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CCDS32 EKPYVELKDSDGRPDWEVAAEAWDNHLRRNRSIVVDLFHGQLRSQVKCKTCGHISVRFDP
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CCDS32 FNFLSLPLPMDSYMHLEITVIKLDGTT-PVRYGLRLNMDEKYTGLKKQLSDLCGLNSEQI
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pF1KE3 MVADVFSHR-----------------FYKLYQLEEPLSSIL----DRDDIFVYEVSGRIE
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CCDS32 LLAEVHGSNIKNFPQDNQKVRLSVSGFLCAFEIPVPVSPISASSPTQTDFSSSPSTNEMF
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CCDS32 TLT-TNGDLPRPIFIPNGMPNTVVPCGTEKNFTNGMVNGH--MPSLPDSPFTGYIIAVHR
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.. . .: :: ..:. . :: . : : .: : : .:
CCDS32 KMMRTELYFLSSQKNRPSLFGMPLIVPCTVHTRKKDLYDAVWIQVSRLASPLPPQE--AS
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pF1KE3 GVTNRCPFLLDNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQTVNSNGTS------DRTTSPEEVH----
. .. : :. .: :.: :::..:...:.: : ..
CCDS32 NHAQDC----DDSMGY-QYP--------FTLRVVQKDGNSCAWCPWYRFCRGCKIDCGED
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.. :::.::.: . :. . . .:. : . . :. :. :.. ::. :
CCDS32 RAFIGNAYIAVDWDPTALHLRYQTSQERVVDEHESVEQSRRAQAEPINLDSCLRAFTSEE
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CCDS32 ELGENEMYYCSKCKTHCLATKKLDLWRLPPILIIHLKRFQFVNGRWIKSQKIVKFPRESF
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: : :.. :..
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