Result of FASTA (omim) for
pFN21AE3429
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3429, 655 aa
1>>>pF1KE3429 655 - 655 aa - 655 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2932+/-0.000426; mu= 9.5108+/- 0.027
mean_var=311.5128+/-65.139, 0's: 0 Z-trim(119.8): 195 B-trim: 0 in 0/57
Lambda= 0.072667
statistics sampled from 34090 (34321) to 34090 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.726), E-opt: 0.2 (0.402), width: 16
Scan time: 12.120
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003128 (OMIM: 601939) SRSF protein kinase 1 [Ho ( 655) 4386 474.0 7.3e-133
NP_872634 (OMIM: 602980) SRSF protein kinase 2 iso ( 699) 1527 174.3 1.3e-42
XP_005250607 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 730) 1527 174.4 1.3e-42
XP_016868051 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 780) 1527 174.4 1.4e-42
XP_016868052 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 780) 1527 174.4 1.4e-42
XP_005250606 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 811) 1527 174.4 1.4e-42
XP_016868054 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 618) 1522 173.7 1.7e-42
XP_016868055 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 688) 1522 173.8 1.8e-42
NP_001265202 (OMIM: 602980) SRSF protein kinase 2 ( 688) 1522 173.8 1.8e-42
NP_872633 (OMIM: 602980) SRSF protein kinase 2 iso ( 688) 1522 173.8 1.8e-42
XP_016868050 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 688) 1522 173.8 1.8e-42
XP_011514840 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 719) 1522 173.8 1.9e-42
XP_005250608 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 719) 1522 173.8 1.9e-42
XP_006716161 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 719) 1522 173.8 1.9e-42
XP_016868053 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 719) 1522 173.8 1.9e-42
XP_016868049 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 725) 1522 173.8 1.9e-42
XP_011514838 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 730) 1522 173.8 1.9e-42
XP_016875521 (OMIM: 603496) PREDICTED: dual specif ( 528) 350 50.8 1.5e-05
NP_003574 (OMIM: 603496) dual specificity tyrosine ( 528) 350 50.8 1.5e-05
NP_006473 (OMIM: 603496) dual specificity tyrosine ( 601) 350 50.9 1.6e-05
XP_011507449 (OMIM: 602989) PREDICTED: dual specif ( 252) 295 44.6 0.00053
XP_016855732 (OMIM: 602989) PREDICTED: dual specif ( 252) 295 44.6 0.00053
XP_016855731 (OMIM: 602989) PREDICTED: dual specif ( 252) 295 44.6 0.00053
XP_016855730 (OMIM: 602989) PREDICTED: dual specif ( 252) 295 44.6 0.00053
XP_016855733 (OMIM: 602989) PREDICTED: dual specif ( 252) 295 44.6 0.00053
NP_001281268 (OMIM: 602989) dual specificity prote ( 271) 295 44.6 0.00055
XP_005244935 (OMIM: 602989) PREDICTED: dual specif ( 497) 295 45.0 0.00079
NP_003984 (OMIM: 602989) dual specificity protein ( 498) 295 45.0 0.0008
XP_011507445 (OMIM: 602989) PREDICTED: dual specif ( 498) 295 45.0 0.0008
NP_001281267 (OMIM: 602989) dual specificity prote ( 499) 295 45.0 0.0008
NP_003983 (OMIM: 602990) dual specificity protein ( 490) 280 43.4 0.0023
XP_016877398 (OMIM: 602990) PREDICTED: dual specif ( 490) 280 43.4 0.0023
XP_016877399 (OMIM: 602990) PREDICTED: dual specif ( 490) 280 43.4 0.0023
NP_001123500 (OMIM: 602990) dual specificity prote ( 638) 280 43.6 0.0027
XP_005254208 (OMIM: 602990) PREDICTED: dual specif ( 652) 280 43.6 0.0028
XP_016877396 (OMIM: 602990) PREDICTED: dual specif ( 655) 280 43.6 0.0028
XP_016877395 (OMIM: 602990) PREDICTED: dual specif ( 669) 280 43.6 0.0028
NP_003836 (OMIM: 609181) dual specificity tyrosine ( 520) 270 42.4 0.005
NP_004062 (OMIM: 601951) dual specificity protein ( 484) 268 42.1 0.0056
NP_001155879 (OMIM: 601951) dual specificity prote ( 526) 268 42.2 0.0058
XP_011507446 (OMIM: 602989) PREDICTED: dual specif ( 279) 260 41.0 0.0071
NP_065717 (OMIM: 607969) dual specificity protein ( 481) 261 41.4 0.0092
>>NP_003128 (OMIM: 601939) SRSF protein kinase 1 [Homo s (655 aa)
initn: 4386 init1: 4386 opt: 4386 Z-score: 2506.3 bits: 474.0 E(85289): 7.3e-133
Smith-Waterman score: 4386; 100.0% identity (100.0% similar) in 655 aa overlap (1-655:1-655)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MERKVLALQARKKRTKAKKDKAQRKSETQHRGSAPHSESDLPEQEEEILGSDDDEQEDPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MERKVLALQARKKRTKAKKDKAQRKSETQHRGSAPHSESDLPEQEEEILGSDDDEQEDPN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DYCKGGYHLVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLSWDIQGKKFVAMKVVKSAEHYTET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 DYCKGGYHLVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLSWDIQGKKFVAMKVVKSAEHYTET
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 ALDEIRLLKSVRNSDPNDPNREMVVQLLDDFKISGVNGTHICMVFEVLGHHLLKWIIKSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 ALDEIRLLKSVRNSDPNDPNREMVVQLLDDFKISGVNGTHICMVFEVLGHHLLKWIIKSN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 YQGLPLPCVKKIIQQVLQGLDYLHTKCRIIHTDIKPENILLSVNEQYIRRLAAEATEWQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 YQGLPLPCVKKIIQQVLQGLDYLHTKCRIIHTDIKPENILLSVNEQYIRRLAAEATEWQR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 SGAPPPSGSAVSTAPQPKPADKMSKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRMQEIEEMEKESGPGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SGAPPPSGSAVSTAPQPKPADKMSKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRMQEIEEMEKESGPGQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 KRPNKQEESESPVERPLKENPPNKMTQEKLEESSTIGQDQTLMERDTEGGAAEINCNGVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 KRPNKQEESESPVERPLKENPPNKMTQEKLEESSTIGQDQTLMERDTEGGAAEINCNGVI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 EVINYTQNSNNETLRHKEDLHNANDCDVQNLNQESSFLSSQNGDSSTSQETDSCTPITSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 EVINYTQNSNNETLRHKEDLHNANDCDVQNLNQESSFLSSQNGDSSTSQETDSCTPITSE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 VSDTMVCQSSSTVGQSFSEQHISQLQESIRAEIPCEDEQEQEHNGPLDNKGKSTAGNFLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VSDTMVCQSSSTVGQSFSEQHISQLQESIRAEIPCEDEQEQEHNGPLDNKGKSTAGNFLV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 NPLEPKNAEKLKVKIADLGNACWVHKHFTEDIQTRQYRSLEVLIGSGYNTPADIWSTACM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 NPLEPKNAEKLKVKIADLGNACWVHKHFTEDIQTRQYRSLEVLIGSGYNTPADIWSTACM
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 AFELATGDYLFEPHSGEEYTRDEDHIALIIELLGKVPRKLIVAGKYSKEFFTKKGDLKHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 AFELATGDYLFEPHSGEEYTRDEDHIALIIELLGKVPRKLIVAGKYSKEFFTKKGDLKHI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650
pF1KE3 TKLKPWGLFEVLVEKYEWSQEEAAGFTDFLLPMLELIPEKRATAAECLRHPWLNS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TKLKPWGLFEVLVEKYEWSQEEAAGFTDFLLPMLELIPEKRATAAECLRHPWLNS
610 620 630 640 650
>>NP_872634 (OMIM: 602980) SRSF protein kinase 2 isoform (699 aa)
initn: 2620 init1: 1515 opt: 1527 Z-score: 886.1 bits: 174.3 E(85289): 1.3e-42
Smith-Waterman score: 2603; 58.3% identity (76.7% similar) in 709 aa overlap (3-655:4-699)
10 20 30 40
pF1KE3 MERKVLALQARKKRTKAKKDKAQRKSETQHRGS-------------APHSESDLPEQEE
:::::.::::.: :..: .: : :... : . :: ::
NP_872 MSSRKVLAIQARKRRP--KREKHPKKPEPQQKAPLVPPPPPPPPPPPPPLPDPTPPEPEE
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 EILGSDDDEQEDPNDYCKGGYHLVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLSWDIQGKKFV
:::::::.::::: :::::::: ::::::::::::::::::::::::::: ::.:::.::
NP_872 EILGSDDEEQEDPADYCKGGYHPVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFV
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 AMKVVKSAEHYTETALDEIRLLKSVRNSDPNDPNREMVVQLLDDFKISGVNGTHICMVFE
::::::::.::::::::::.::: ::.:::.:::..:::::.:::::::.:: :.:::::
NP_872 AMKVVKSAQHYTETALDEIKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFE
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 VLGHHLLKWIIKSNYQGLPLPCVKKIIQQVLQGLDYLHTKCRIIHTDIKPENILLSVNEQ
:::::::::::::::::::. :::.::.::::::::::.::.::::::::::::. :..
NP_872 VLGHHLLKWIIKSNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDA
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 YIRRLAAEATEWQRSGAPPPSGSAVSTAPQPKPADKMSKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRM
:.::.::::::::..::::::::::::::: :: :.::::::::::::::::::::::.
NP_872 YVRRMAAEATEWQKAGAPPPSGSAVSTAPQQKPIGKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KE3 QEIEEMEKES-------GPGQKRPNKQEESESPVERPLKENPPNKMTQEKLEESSTIGQD
:::::.:.:. . . :......: : :: . .. .. . ... ..:
NP_872 QEIEELEREAERKIIEENITSAAPSNDQDGEYCPEVKLKTTGLEEAAEAETAKDNGEAED
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370
pF1KE3 QTL--------MERDTEGGAAEI-----------NCNGVIEVINYT--QNSNNETLRHKE
: .:.: . :. . :: :: .. :. ..: .:
NP_872 QEEKEDAEKENIEKDEDDVDQELANIDPTWIESPKTNGHIENGPFSLEQQLDDED-DDEE
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420
pF1KE3 DLHNANDCDVQNLNQESSFLSSQ-----NGDSST-------SQETDSCTPITSEVSDTMV
: : .. .... : ::.. :. ::. . :: . : . : . ..
NP_872 DCPNPEEYNLDEPNAESDYTYSSSYEQFNGELPNGRHKIPESQFPEFSTSLFSGSLEPVA
420 430 440 450 460 470
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 CQSSSTVGQSFSEQHISQLQESIRAEIPCEDEQEQ---EHNGPLDNKGKSTAGNFLVNPL
: : . :. ..::. :. : .:... .: : :.:. :...:::::
NP_872 CGSVLSEGSPLTEQEESS---------PSHDRSRTVSASSTGDLP-KAKTRAADLLVNPL
480 490 500 510 520
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 EPKNAEKLKVKIADLGNACWVHKHFTEDIQTRQYRSLEVLIGSGYNTPADIWSTACMAFE
.:.::.:..:::::::::::::::::::::::::::.:::::.::.::::::::::::::
NP_872 DPRNADKIRVKIADLGNACWVHKHFTEDIQTRQYRSIEVLIGAGYSTPADIWSTACMAFE
530 540 550 560 570 580
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 LATGDYLFEPHSGEEYTRDEDHIALIIELLGKVPRKLIVAGKYSKEFFTKKGDLKHITKL
::::::::::::::.:.::::::: ::::::..::.. ..::::.:::...:.:.:::::
NP_872 LATGDYLFEPHSGEDYSRDEDHIAHIIELLGSIPRHFALSGKYSREFFNRRGELRHITKL
590 600 610 620 630 640
610 620 630 640 650
pF1KE3 KPWGLFEVLVEKYEWSQEEAAGFTDFLLPMLELIPEKRATAAECLRHPWLNS
:::.::.:::::: : .:.:: :::::.::::..:::::.:.::::::::::
NP_872 KPWSLFDVLVEKYGWPHEDAAQFTDFLIPMLEMVPEKRASAGECLRHPWLNS
650 660 670 680 690
>>XP_005250607 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protein ki (730 aa)
initn: 2252 init1: 1515 opt: 1527 Z-score: 885.9 bits: 174.4 E(85289): 1.3e-42
Smith-Waterman score: 2365; 55.7% identity (72.4% similar) in 709 aa overlap (3-624:4-699)
10 20 30 40
pF1KE3 MERKVLALQARKKRTKAKKDKAQRKSETQHRGS-------------APHSESDLPEQEE
:::::.::::.: : ..: .: : :... : . :: ::
XP_005 MSSRKVLAIQARKRRPK--REKHPKKPEPQQKAPLVPPPPPPPPPPPPPLPDPTPPEPEE
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 EILGSDDDEQEDPNDYCKGGYHLVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLSWDIQGKKFV
:::::::.::::: :::::::: ::::::::::::::::::::::::::: ::.:::.::
XP_005 EILGSDDEEQEDPADYCKGGYHPVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFV
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 AMKVVKSAEHYTETALDEIRLLKSVRNSDPNDPNREMVVQLLDDFKISGVNGTHICMVFE
::::::::.::::::::::.::: ::.:::.:::..:::::.:::::::.:: :.:::::
XP_005 AMKVVKSAQHYTETALDEIKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFE
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 VLGHHLLKWIIKSNYQGLPLPCVKKIIQQVLQGLDYLHTKCRIIHTDIKPENILLSVNEQ
:::::::::::::::::::. :::.::.::::::::::.::.::::::::::::. :..
XP_005 VLGHHLLKWIIKSNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDA
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 YIRRLAAEATEWQRSGAPPPSGSAVSTAPQPKPADKMSKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRM
:.::.::::::::..::::::::::::::: :: :.::::::::::::::::::::::.
XP_005 YVRRMAAEATEWQKAGAPPPSGSAVSTAPQQKPIGKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KE3 QEIEEMEKES-------GPGQKRPNKQEESESPVERPLKENPPNKMTQEKLEESSTIGQD
:::::.:.:. . . :......: : :: . .. .. . ... ..:
XP_005 QEIEELEREAERKIIEENITSAAPSNDQDGEYCPEVKLKTTGLEEAAEAETAKDNGEAED
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370
pF1KE3 QTL--------MERDTEGGAAEI-----------NCNGVIEVINYT--QNSNNETLRHKE
: .:.: . :. . :: :: .. :. ..: .:
XP_005 QEEKEDAEKENIEKDEDDVDQELANIDPTWIESPKTNGHIENGPFSLEQQLDDED-DDEE
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420
pF1KE3 DLHNANDCDVQNLNQESSFLSSQ-----NGDSST-------SQETDSCTPITSEVSDTMV
: : .. .... : ::.. :. ::. . :: . : . : . ..
XP_005 DCPNPEEYNLDEPNAESDYTYSSSYEQFNGELPNGRHKIPESQFPEFSTSLFSGSLEPVA
420 430 440 450 460 470
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 CQSSSTVGQSFSEQHISQLQESIRAEIPCEDEQEQ---EHNGPLDNKGKSTAGNFLVNPL
: : . :. ..::. :. : .:... .: : :.:. :...:::::
XP_005 CGSVLSEGSPLTEQEESS---------PSHDRSRTVSASSTGDLP-KAKTRAADLLVNPL
480 490 500 510 520
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 EPKNAEKLKVKIADLGNACWVHKHFTEDIQTRQYRSLEVLIGSGYNTPADIWSTACMAFE
.:.::.:..:::::::::::::::::::::::::::.:::::.::.::::::::::::::
XP_005 DPRNADKIRVKIADLGNACWVHKHFTEDIQTRQYRSIEVLIGAGYSTPADIWSTACMAFE
530 540 550 560 570 580
550 560 570
pF1KE3 LATGDYLFEPHSGEEYTRDEDHIA-------------------------------LIIEL
::::::::::::::.:.::::::: :::::
XP_005 LATGDYLFEPHSGEDYSRDEDHIAHIIELLGSIPRHFALSGKYSREFFNRRDHIALIIEL
590 600 610 620 630 640
580 590 600 610 620 630
pF1KE3 LGKVPRKLIVAGKYSKEFFTKKGDLKHITKLKPWGLFEVLVEKYEWSQEEAAGFTDFLLP
::::::: . :::::::::.::.:.::::::::.::.:::::: : .:.::
XP_005 LGKVPRKYAMLGKYSKEFFTRKGELRHITKLKPWSLFDVLVEKYGWPHEDAAQFTDFLIP
650 660 670 680 690 700
640 650
pF1KE3 MLELIPEKRATAAECLRHPWLNS
XP_005 MLEMVPEKRASAGECLRHPWLNS
710 720 730
>>XP_016868051 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protein ki (780 aa)
initn: 2607 init1: 1515 opt: 1527 Z-score: 885.6 bits: 174.4 E(85289): 1.4e-42
Smith-Waterman score: 2593; 58.1% identity (76.7% similar) in 708 aa overlap (4-655:86-780)
10 20 30
pF1KE3 MERKVLALQARKKRTKAKKDKAQRKSETQHRGS
.:::.::::.: : ..: .: : :...
XP_016 EKRPREERWCETRGGAGQGRAHGAAGGATGRVLAIQARKRRPK--REKHPKKPEPQQKAP
60 70 80 90 100 110
40 50 60 70 80
pF1KE3 -------------APHSESDLPEQEEEILGSDDDEQEDPNDYCKGGYHLVKIGDLFNGRY
: . :: :::::::::.::::: :::::::: :::::::::::
XP_016 LVPPPPPPPPPPPPPLPDPTPPEPEEEILGSDDEEQEDPADYCKGGYHPVKIGDLFNGRY
120 130 140 150 160 170
90 100 110 120 130 140
pF1KE3 HVIRKLGWGHFSTVWLSWDIQGKKFVAMKVVKSAEHYTETALDEIRLLKSVRNSDPNDPN
:::::::::::::::: ::.:::.::::::::::.::::::::::.::: ::.:::.:::
XP_016 HVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFVAMKVVKSAQHYTETALDEIKLLKCVRESDPSDPN
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pF1KE3 REMVVQLLDDFKISGVNGTHICMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGLPLPCVKKIIQQVLQGL
..:::::.:::::::.:: :.::::::::::::::::::::::::. :::.::.::::::
XP_016 KDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGL
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210 220 230 240 250 260
pF1KE3 DYLHTKCRIIHTDIKPENILLSVNEQYIRRLAAEATEWQRSGAPPPSGSAVSTAPQPKPA
::::.::.::::::::::::. :.. :.::.::::::::..::::::::::::::: ::
XP_016 DYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAEATEWQKAGAPPPSGSAVSTAPQQKPI
300 310 320 330 340 350
270 280 290 300 310
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:.::::::::::::::::::::::.:::::.:.:. . . :......:
XP_016 GKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRLQEIEELEREAERKIIEENITSAAPSNDQDGEYCP
360 370 380 390 400 410
320 330 340 350
pF1KE3 ERPLKENPPNKMTQEKLEESSTIGQDQTL--------MERDTEGGAAEI-----------
: :: . .. .. . ... ..:: .:.: . :.
XP_016 EVKLKTTGLEEAAEAETAKDNGEAEDQEEKEDAEKENIEKDEDDVDQELANIDPTWIESP
420 430 440 450 460 470
360 370 380 390 400
pF1KE3 NCNGVIEVINYT--QNSNNETLRHKEDLHNANDCDVQNLNQESSFLSSQ-----NGDSST
. :: :: .. :. ..: .:: : .. .... : ::.. :. ::. .
XP_016 KTNGHIENGPFSLEQQLDDED-DDEEDCPNPEEYNLDEPNAESDYTYSSSYEQFNGELPN
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pF1KE3 -------SQETDSCTPITSEVSDTMVCQSSSTVGQSFSEQHISQLQESIRAEIPCEDEQE
:: . : . : . ..: : . :. ..::. :. : .:...
XP_016 GRHKIPESQFPEFSTSLFSGSLEPVACGSVLSEGSPLTEQEESS---------PSHDRSR
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pF1KE3 Q---EHNGPLDNKGKSTAGNFLVNPLEPKNAEKLKVKIADLGNACWVHKHFTEDIQTRQY
.: : :.:. :...:::::.:.::.:..:::::::::::::::::::::::::
XP_016 TVSASSTGDLP-KAKTRAADLLVNPLDPRNADKIRVKIADLGNACWVHKHFTEDIQTRQY
590 600 610 620 630 640
520 530 540 550 560 570
pF1KE3 RSLEVLIGSGYNTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEEYTRDEDHIALIIELLGKVP
::.:::::.::.::::::::::::::::::::::::::::.:.::::::: ::::::..:
XP_016 RSIEVLIGAGYSTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRDEDHIAHIIELLGSIP
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pF1KE3 RKLIVAGKYSKEFFTKKGDLKHITKLKPWGLFEVLVEKYEWSQEEAAGFTDFLLPMLELI
:.. ..::::.:::...:.:.::::::::.::.:::::: : .:.:: :::::.::::..
XP_016 RHFALSGKYSREFFNRRGELRHITKLKPWSLFDVLVEKYGWPHEDAAQFTDFLIPMLEMV
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640 650
pF1KE3 PEKRATAAECLRHPWLNS
:::::.:.::::::::::
XP_016 PEKRASAGECLRHPWLNS
770 780
>>XP_016868052 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protein ki (780 aa)
initn: 2634 init1: 1515 opt: 1527 Z-score: 885.6 bits: 174.4 E(85289): 1.4e-42
Smith-Waterman score: 2620; 59.0% identity (76.6% similar) in 708 aa overlap (4-655:86-780)
10 20 30
pF1KE3 MERKVLALQARKKRTKAKKDKAQRKSETQHRGS
.:::.::::.: : ..: .: : :...
XP_016 EKRPREERWCETRGGAGQGRAHGAAGGATGRVLAIQARKRRPK--REKHPKKPEPQQKAP
60 70 80 90 100 110
40 50 60 70 80
pF1KE3 -------------APHSESDLPEQEEEILGSDDDEQEDPNDYCKGGYHLVKIGDLFNGRY
: . :: :::::::::.::::: :::::::: :::::::::::
XP_016 LVPPPPPPPPPPPPPLPDPTPPEPEEEILGSDDEEQEDPADYCKGGYHPVKIGDLFNGRY
120 130 140 150 160 170
90 100 110 120 130 140
pF1KE3 HVIRKLGWGHFSTVWLSWDIQGKKFVAMKVVKSAEHYTETALDEIRLLKSVRNSDPNDPN
:::::::::::::::: ::.:::.::::::::::.::::::::::.::: ::.:::.:::
XP_016 HVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFVAMKVVKSAQHYTETALDEIKLLKCVRESDPSDPN
180 190 200 210 220 230
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 REMVVQLLDDFKISGVNGTHICMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGLPLPCVKKIIQQVLQGL
..:::::.:::::::.:: :.::::::::::::::::::::::::. :::.::.::::::
XP_016 KDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGL
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210 220 230 240 250 260
pF1KE3 DYLHTKCRIIHTDIKPENILLSVNEQYIRRLAAEATEWQRSGAPPPSGSAVSTAPQPKPA
::::.::.::::::::::::. :.. :.::.::::::::..::::::::::::::: ::
XP_016 DYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAEATEWQKAGAPPPSGSAVSTAPQQKPI
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pF1KE3 DKMSKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRMQEIEEMEKES-------GPGQKRPNKQEESESPV
:.::::::::::::::::::::::.:::::.:.:. . . :......:
XP_016 GKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRLQEIEELEREAERKIIEENITSAAPSNDQDGEYCP
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320 330 340 350
pF1KE3 ERPLKENPPNKMTQEKLEESSTIGQDQTL--------MERDTEGGAAEI-----------
: :: . .. .. . ... ..:: .:.: . :.
XP_016 EVKLKTTGLEEAAEAETAKDNGEAEDQEEKEDAEKENIEKDEDDVDQELANIDPTWIESP
420 430 440 450 460 470
360 370 380 390 400
pF1KE3 NCNGVIEVINYT--QNSNNETLRHKEDLHNANDCDVQNLNQESSFLSSQ-----NGDSST
. :: :: .. :. ..: .:: : .. .... : ::.. :. ::. .
XP_016 KTNGHIENGPFSLEQQLDDED-DDEEDCPNPEEYNLDEPNAESDYTYSSSYEQFNGELPN
480 490 500 510 520 530
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 -------SQETDSCTPITSEVSDTMVCQSSSTVGQSFSEQHISQLQESIRAEIPCEDEQE
:: . : . : . ..: : . :. ..::. :. : .:...
XP_016 GRHKIPESQFPEFSTSLFSGSLEPVACGSVLSEGSPLTEQEESS---------PSHDRSR
540 550 560 570 580
470 480 490 500 510
pF1KE3 Q---EHNGPLDNKGKSTAGNFLVNPLEPKNAEKLKVKIADLGNACWVHKHFTEDIQTRQY
.: : :.:. :...:::::.:.::.:..:::::::::::::::::::::::::
XP_016 TVSASSTGDLP-KAKTRAADLLVNPLDPRNADKIRVKIADLGNACWVHKHFTEDIQTRQY
590 600 610 620 630 640
520 530 540 550 560 570
pF1KE3 RSLEVLIGSGYNTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEEYTRDEDHIALIIELLGKVP
::.:::::.::.::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::::
XP_016 RSIEVLIGAGYSTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRDEDHIALIIELLGKVP
650 660 670 680 690 700
580 590 600 610 620 630
pF1KE3 RKLIVAGKYSKEFFTKKGDLKHITKLKPWGLFEVLVEKYEWSQEEAAGFTDFLLPMLELI
:: . :::::::::.::.:.::::::::.::.:::::: : .:.:: :::::.::::..
XP_016 RKYAMLGKYSKEFFTRKGELRHITKLKPWSLFDVLVEKYGWPHEDAAQFTDFLIPMLEMV
710 720 730 740 750 760
640 650
pF1KE3 PEKRATAAECLRHPWLNS
:::::.:.::::::::::
XP_016 PEKRASAGECLRHPWLNS
770 780
>>XP_005250606 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protein ki (811 aa)
initn: 2239 init1: 1515 opt: 1527 Z-score: 885.4 bits: 174.4 E(85289): 1.4e-42
Smith-Waterman score: 2355; 55.5% identity (72.3% similar) in 708 aa overlap (4-624:86-780)
10 20 30
pF1KE3 MERKVLALQARKKRTKAKKDKAQRKSETQHRGS
.:::.::::.: :..: .: : :...
XP_005 EKRPREERWCETRGGAGQGRAHGAAGGATGRVLAIQARKRRP--KREKHPKKPEPQQKAP
60 70 80 90 100 110
40 50 60 70 80
pF1KE3 -------------APHSESDLPEQEEEILGSDDDEQEDPNDYCKGGYHLVKIGDLFNGRY
: . :: :::::::::.::::: :::::::: :::::::::::
XP_005 LVPPPPPPPPPPPPPLPDPTPPEPEEEILGSDDEEQEDPADYCKGGYHPVKIGDLFNGRY
120 130 140 150 160 170
90 100 110 120 130 140
pF1KE3 HVIRKLGWGHFSTVWLSWDIQGKKFVAMKVVKSAEHYTETALDEIRLLKSVRNSDPNDPN
:::::::::::::::: ::.:::.::::::::::.::::::::::.::: ::.:::.:::
XP_005 HVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFVAMKVVKSAQHYTETALDEIKLLKCVRESDPSDPN
180 190 200 210 220 230
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 REMVVQLLDDFKISGVNGTHICMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGLPLPCVKKIIQQVLQGL
..:::::.:::::::.:: :.::::::::::::::::::::::::. :::.::.::::::
XP_005 KDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGL
240 250 260 270 280 290
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 DYLHTKCRIIHTDIKPENILLSVNEQYIRRLAAEATEWQRSGAPPPSGSAVSTAPQPKPA
::::.::.::::::::::::. :.. :.::.::::::::..::::::::::::::: ::
XP_005 DYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAEATEWQKAGAPPPSGSAVSTAPQQKPI
300 310 320 330 340 350
270 280 290 300 310
pF1KE3 DKMSKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRMQEIEEMEKES-------GPGQKRPNKQEESESPV
:.::::::::::::::::::::::.:::::.:.:. . . :......:
XP_005 GKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRLQEIEELEREAERKIIEENITSAAPSNDQDGEYCP
360 370 380 390 400 410
320 330 340 350
pF1KE3 ERPLKENPPNKMTQEKLEESSTIGQDQTL--------MERDTEGGAAEI-----------
: :: . .. .. . ... ..:: .:.: . :.
XP_005 EVKLKTTGLEEAAEAETAKDNGEAEDQEEKEDAEKENIEKDEDDVDQELANIDPTWIESP
420 430 440 450 460 470
360 370 380 390 400
pF1KE3 NCNGVIEVINYT--QNSNNETLRHKEDLHNANDCDVQNLNQESSFLSSQ-----NGDSST
. :: :: .. :. ..: .:: : .. .... : ::.. :. ::. .
XP_005 KTNGHIENGPFSLEQQLDDED-DDEEDCPNPEEYNLDEPNAESDYTYSSSYEQFNGELPN
480 490 500 510 520 530
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 -------SQETDSCTPITSEVSDTMVCQSSSTVGQSFSEQHISQLQESIRAEIPCEDEQE
:: . : . : . ..: : . :. ..::. :. : .:...
XP_005 GRHKIPESQFPEFSTSLFSGSLEPVACGSVLSEGSPLTEQEESS---------PSHDRSR
540 550 560 570 580
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pF1KE3 Q---EHNGPLDNKGKSTAGNFLVNPLEPKNAEKLKVKIADLGNACWVHKHFTEDIQTRQY
.: : :.:. :...:::::.:.::.:..:::::::::::::::::::::::::
XP_005 TVSASSTGDLP-KAKTRAADLLVNPLDPRNADKIRVKIADLGNACWVHKHFTEDIQTRQY
590 600 610 620 630 640
520 530 540 550 560
pF1KE3 RSLEVLIGSGYNTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEEYTRDEDHIA----------
::.:::::.::.::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::::
XP_005 RSIEVLIGAGYSTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRDEDHIAHIIELLGSIP
650 660 670 680 690 700
570 580 590 600
pF1KE3 ---------------------LIIELLGKVPRKLIVAGKYSKEFFTKKGDLKHITKLKPW
:::::::::::: . :::::::::.::.:.::::::::
XP_005 RHFALSGKYSREFFNRRDHIALIIELLGKVPRKYAMLGKYSKEFFTRKGELRHITKLKPW
710 720 730 740 750 760
610 620 630 640 650
pF1KE3 GLFEVLVEKYEWSQEEAAGFTDFLLPMLELIPEKRATAAECLRHPWLNS
.::.:::::: : .:.::
XP_005 SLFDVLVEKYGWPHEDAAQFTDFLIPMLEMVPEKRASAGECLRHPWLNS
770 780 790 800 810
>>XP_016868054 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protein ki (618 aa)
initn: 1917 init1: 1515 opt: 1522 Z-score: 883.8 bits: 173.7 E(85289): 1.7e-42
Smith-Waterman score: 1911; 56.6% identity (74.9% similar) in 549 aa overlap (35-540:73-610)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 VLALQARKKRTKAKKDKAQRKSETQHRGSAPHSESDLPEQEEEILGSDDDEQEDPNDYCK
: . :: :::::::::.::::: ::::
XP_016 EKSSSSERPEPQQKAPLVPPPPPPPPPPPPPLPDPTPPEPEEEILGSDDEEQEDPADYCK
50 60 70 80 90 100
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 GGYHLVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLSWDIQGKKFVAMKVVKSAEHYTETALDE
:::: ::::::::::::::::::::::::::: ::.:::.::::::::::.:::::::::
XP_016 GGYHPVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFVAMKVVKSAQHYTETALDE
110 120 130 140 150 160
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 IRLLKSVRNSDPNDPNREMVVQLLDDFKISGVNGTHICMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGL
:.::: ::.:::.:::..:::::.:::::::.:: :.:::::::::::::::::::::::
XP_016 IKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGL
170 180 190 200 210 220
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 PLPCVKKIIQQVLQGLDYLHTKCRIIHTDIKPENILLSVNEQYIRRLAAEATEWQRSGAP
:. :::.::.::::::::::.::.::::::::::::. :.. :.::.::::::::..:::
XP_016 PVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAEATEWQKAGAP
230 240 250 260 270 280
250 260 270 280 290
pF1KE3 PPSGSAVSTAPQPKPADKMSKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRMQEIEEMEKES-------G
:::::::::::: :: :.::::::::::::::::::::::.:::::.:.:. .
XP_016 PPSGSAVSTAPQQKPIGKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRLQEIEELEREAERKIIEEN
290 300 310 320 330 340
300 310 320 330 340
pF1KE3 PGQKRPNKQEESESPVERPLKENPPNKMTQEKLEESSTIGQDQTL--------MERDTEG
. :......: : :: . .. .. . ... ..:: .:.: .
XP_016 ITSAAPSNDQDGEYCPEVKLKTTGLEEAAEAETAKDNGEAEDQEEKEDAEKENIEKDEDD
350 360 370 380 390 400
350 360 370 380 390
pF1KE3 GAAEI-----------NCNGVIEVINYT--QNSNNETLRHKEDLHNANDCDVQNLNQESS
:. . :: :: .. :. ..: .:: : .. .... : ::.
XP_016 VDQELANIDPTWIESPKTNGHIENGPFSLEQQLDDED-DDEEDCPNPEEYNLDEPNAESD
410 420 430 440 450 460
400 410 420 430 440
pF1KE3 FLSSQ-----NGDSST-------SQETDSCTPITSEVSDTMVCQSSSTVGQSFSEQHISQ
. :. ::. . :: . : . : . ..: : . :. ..::. :.
XP_016 YTYSSSYEQFNGELPNGRHKIPESQFPEFSTSLFSGSLEPVACGSVLSEGSPLTEQEESS
470 480 490 500 510 520
450 460 470 480 490 500
pF1KE3 LQESIRAEIPCEDEQEQ---EHNGPLDNKGKSTAGNFLVNPLEPKNAEKLKVKIADLGNA
: .:... .: : :.:. :...:::::.:.::.:..:::::::::
XP_016 ---------PSHDRSRTVSASSTGDLP-KAKTRAADLLVNPLDPRNADKIRVKIADLGNA
530 540 550 560 570
510 520 530 540 550 560
pF1KE3 CWVHKHFTEDIQTRQYRSLEVLIGSGYNTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEEYTR
::::::::::::::::::.:::::.::.:::::::::::
XP_016 CWVHKHFTEDIQTRQYRSIEVLIGAGYSTPADIWSTACMENCDTSPS
580 590 600 610
570 580 590 600 610 620
pF1KE3 DEDHIALIIELLGKVPRKLIVAGKYSKEFFTKKGDLKHITKLKPWGLFEVLVEKYEWSQE
>>XP_016868055 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protein ki (688 aa)
initn: 2559 init1: 1515 opt: 1522 Z-score: 883.3 bits: 173.8 E(85289): 1.8e-42
Smith-Waterman score: 2553; 59.9% identity (78.5% similar) in 664 aa overlap (35-655:36-688)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 VLALQARKKRTKAKKDKAQRKSETQHRGSAPHSESDLPEQEEEILGSDDDEQEDPNDYCK
: . :: :::::::::.::::: ::::
XP_016 EKSSSSERPEPQQKAPLVPPPPPPPPPPPPPLPDPTPPEPEEEILGSDDEEQEDPADYCK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 GGYHLVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLSWDIQGKKFVAMKVVKSAEHYTETALDE
:::: ::::::::::::::::::::::::::: ::.:::.::::::::::.:::::::::
XP_016 GGYHPVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFVAMKVVKSAQHYTETALDE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 IRLLKSVRNSDPNDPNREMVVQLLDDFKISGVNGTHICMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGL
:.::: ::.:::.:::..:::::.:::::::.:: :.:::::::::::::::::::::::
XP_016 IKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 PLPCVKKIIQQVLQGLDYLHTKCRIIHTDIKPENILLSVNEQYIRRLAAEATEWQRSGAP
:. :::.::.::::::::::.::.::::::::::::. :.. :.::.::::::::..:::
XP_016 PVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAEATEWQKAGAP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE3 PPSGSAVSTAPQPKPADKMSKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRMQEIEEMEKES-------G
:::::::::::: :: :.::::::::::::::::::::::.:::::.:.:. .
XP_016 PPSGSAVSTAPQQKPIGKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRLQEIEELEREAERKIIEEN
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340
pF1KE3 PGQKRPNKQEESESPVERPLKENPPNKMTQEKLEESSTIGQDQTL--------MERDTEG
. :......: : :: . .. .. . ... ..:: .:.: .
XP_016 ITSAAPSNDQDGEYCPEVKLKTTGLEEAAEAETAKDNGEAEDQEEKEDAEKENIEKDEDD
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390
pF1KE3 GAAEI-----------NCNGVIEVINYT--QNSNNETLRHKEDLHNANDCDVQNLNQESS
:. . :: :: .. :. ..: .:: : .. .... : ::.
XP_016 VDQELANIDPTWIESPKTNGHIENGPFSLEQQLDDED-DDEEDCPNPEEYNLDEPNAESD
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440
pF1KE3 FLSSQ-----NGDSST-------SQETDSCTPITSEVSDTMVCQSSSTVGQSFSEQHISQ
. :. ::. . :: . : . : . ..: : . :. ..::. :.
XP_016 YTYSSSYEQFNGELPNGRHKIPESQFPEFSTSLFSGSLEPVACGSVLSEGSPLTEQEESS
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KE3 LQESIRAEIPCEDEQEQ---EHNGPLDNKGKSTAGNFLVNPLEPKNAEKLKVKIADLGNA
: .:... .: : :.:. :...:::::.:.::.:..:::::::::
XP_016 ---------PSHDRSRTVSASSTGDLP-KAKTRAADLLVNPLDPRNADKIRVKIADLGNA
490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KE3 CWVHKHFTEDIQTRQYRSLEVLIGSGYNTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEEYTR
::::::::::::::::::.:::::.::.::::::::::::::::::::::::::::.:.:
XP_016 CWVHKHFTEDIQTRQYRSIEVLIGAGYSTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSR
540 550 560 570 580 590
570 580 590 600 610 620
pF1KE3 DEDHIALIIELLGKVPRKLIVAGKYSKEFFTKKGDLKHITKLKPWGLFEVLVEKYEWSQE
:::::: ::::::..::.. ..::::.:::...:.:.::::::::.::.:::::: : .:
XP_016 DEDHIAHIIELLGSIPRHFALSGKYSREFFNRRGELRHITKLKPWSLFDVLVEKYGWPHE
600 610 620 630 640 650
630 640 650
pF1KE3 EAAGFTDFLLPMLELIPEKRATAAECLRHPWLNS
.:: :::::.::::..:::::.:.::::::::::
XP_016 DAAQFTDFLIPMLEMVPEKRASAGECLRHPWLNS
660 670 680
>>NP_001265202 (OMIM: 602980) SRSF protein kinase 2 isof (688 aa)
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Smith-Waterman score: 2553; 59.9% identity (78.5% similar) in 664 aa overlap (35-655:36-688)
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pF1KE3 VLALQARKKRTKAKKDKAQRKSETQHRGSAPHSESDLPEQEEEILGSDDDEQEDPNDYCK
: . :: :::::::::.::::: ::::
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:::: ::::::::::::::::::::::::::: ::.:::.::::::::::.:::::::::
NP_001 GGYHPVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFVAMKVVKSAQHYTETALDE
70 80 90 100 110 120
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pF1KE3 IRLLKSVRNSDPNDPNREMVVQLLDDFKISGVNGTHICMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGL
:.::: ::.:::.:::..:::::.:::::::.:: :.:::::::::::::::::::::::
NP_001 IKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGL
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pF1KE3 PLPCVKKIIQQVLQGLDYLHTKCRIIHTDIKPENILLSVNEQYIRRLAAEATEWQRSGAP
:. :::.::.::::::::::.::.::::::::::::. :.. :.::.::::::::..:::
NP_001 PVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAEATEWQKAGAP
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:::::::::::: :: :.::::::::::::::::::::::.:::::.:.:. .
NP_001 PPSGSAVSTAPQQKPIGKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRLQEIEELEREAERKIIEEN
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pF1KE3 PGQKRPNKQEESESPVERPLKENPPNKMTQEKLEESSTIGQDQTL--------MERDTEG
. :......: : :: . .. .. . ... ..:: .:.: .
NP_001 ITSAAPSNDQDGEYCPEVKLKTTGLEEAAEAETAKDNGEAEDQEEKEDAEKENIEKDEDD
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350 360 370 380 390
pF1KE3 GAAEI-----------NCNGVIEVINYT--QNSNNETLRHKEDLHNANDCDVQNLNQESS
:. . :: :: .. :. ..: .:: : .. .... : ::.
NP_001 VDQELANIDPTWIESPKTNGHIENGPFSLEQQLDDED-DDEEDCPNPEEYNLDEPNAESD
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400 410 420 430 440
pF1KE3 FLSSQ-----NGDSST-------SQETDSCTPITSEVSDTMVCQSSSTVGQSFSEQHISQ
. :. ::. . :: . : . : . ..: : . :. ..::. :.
NP_001 YTYSSSYEQFNGELPNGRHKIPESQFPEFSTSLFSGSLEPVACGSVLSEGSPLTEQEESS
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KE3 LQESIRAEIPCEDEQEQ---EHNGPLDNKGKSTAGNFLVNPLEPKNAEKLKVKIADLGNA
: .:... .: : :.:. :...:::::.:.::.:..:::::::::
NP_001 ---------PSHDRSRTVSASSTGDLP-KAKTRAADLLVNPLDPRNADKIRVKIADLGNA
490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KE3 CWVHKHFTEDIQTRQYRSLEVLIGSGYNTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEEYTR
::::::::::::::::::.:::::.::.::::::::::::::::::::::::::::.:.:
NP_001 CWVHKHFTEDIQTRQYRSIEVLIGAGYSTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSR
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570 580 590 600 610 620
pF1KE3 DEDHIALIIELLGKVPRKLIVAGKYSKEFFTKKGDLKHITKLKPWGLFEVLVEKYEWSQE
:::::: ::::::..::.. ..::::.:::...:.:.::::::::.::.:::::: : .:
NP_001 DEDHIAHIIELLGSIPRHFALSGKYSREFFNRRGELRHITKLKPWSLFDVLVEKYGWPHE
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630 640 650
pF1KE3 EAAGFTDFLLPMLELIPEKRATAAECLRHPWLNS
.:: :::::.::::..:::::.:.::::::::::
NP_001 DAAQFTDFLIPMLEMVPEKRASAGECLRHPWLNS
660 670 680
>>NP_872633 (OMIM: 602980) SRSF protein kinase 2 isoform (688 aa)
initn: 2559 init1: 1515 opt: 1522 Z-score: 883.3 bits: 173.8 E(85289): 1.8e-42
Smith-Waterman score: 2553; 59.9% identity (78.5% similar) in 664 aa overlap (35-655:36-688)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 VLALQARKKRTKAKKDKAQRKSETQHRGSAPHSESDLPEQEEEILGSDDDEQEDPNDYCK
: . :: :::::::::.::::: ::::
NP_872 EKSSSSERPEPQQKAPLVPPPPPPPPPPPPPLPDPTPPEPEEEILGSDDEEQEDPADYCK
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:::: ::::::::::::::::::::::::::: ::.:::.::::::::::.:::::::::
NP_872 GGYHPVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFVAMKVVKSAQHYTETALDE
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pF1KE3 IRLLKSVRNSDPNDPNREMVVQLLDDFKISGVNGTHICMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGL
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NP_872 IKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 PLPCVKKIIQQVLQGLDYLHTKCRIIHTDIKPENILLSVNEQYIRRLAAEATEWQRSGAP
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NP_872 PVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAEATEWQKAGAP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE3 PPSGSAVSTAPQPKPADKMSKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRMQEIEEMEKES-------G
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NP_872 PPSGSAVSTAPQQKPIGKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRLQEIEELEREAERKIIEEN
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340
pF1KE3 PGQKRPNKQEESESPVERPLKENPPNKMTQEKLEESSTIGQDQTL--------MERDTEG
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NP_872 ITSAAPSNDQDGEYCPEVKLKTTGLEEAAEAETAKDNGEAEDQEEKEDAEKENIEKDEDD
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390
pF1KE3 GAAEI-----------NCNGVIEVINYT--QNSNNETLRHKEDLHNANDCDVQNLNQESS
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NP_872 VDQELANIDPTWIESPKTNGHIENGPFSLEQQLDDED-DDEEDCPNPEEYNLDEPNAESD
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440
pF1KE3 FLSSQ-----NGDSST-------SQETDSCTPITSEVSDTMVCQSSSTVGQSFSEQHISQ
. :. ::. . :: . : . : . ..: : . :. ..::. :.
NP_872 YTYSSSYEQFNGELPNGRHKIPESQFPEFSTSLFSGSLEPVACGSVLSEGSPLTEQEESS
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KE3 LQESIRAEIPCEDEQEQ---EHNGPLDNKGKSTAGNFLVNPLEPKNAEKLKVKIADLGNA
: .:... .: : :.:. :...:::::.:.::.:..:::::::::
NP_872 ---------PSHDRSRTVSASSTGDLP-KAKTRAADLLVNPLDPRNADKIRVKIADLGNA
490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KE3 CWVHKHFTEDIQTRQYRSLEVLIGSGYNTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEEYTR
::::::::::::::::::.:::::.::.::::::::::::::::::::::::::::.:.:
NP_872 CWVHKHFTEDIQTRQYRSIEVLIGAGYSTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSR
540 550 560 570 580 590
570 580 590 600 610 620
pF1KE3 DEDHIALIIELLGKVPRKLIVAGKYSKEFFTKKGDLKHITKLKPWGLFEVLVEKYEWSQE
:::::: ::::::..::.. ..::::.:::...:.:.::::::::.::.:::::: : .:
NP_872 DEDHIAHIIELLGSIPRHFALSGKYSREFFNRRGELRHITKLKPWSLFDVLVEKYGWPHE
600 610 620 630 640 650
630 640 650
pF1KE3 EAAGFTDFLLPMLELIPEKRATAAECLRHPWLNS
.:: :::::.::::..:::::.:.::::::::::
NP_872 DAAQFTDFLIPMLEMVPEKRASAGECLRHPWLNS
660 670 680
655 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 05:09:46 2016 done: Sun Nov 6 05:09:48 2016
Total Scan time: 12.120 Total Display time: 0.220
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]