Result of FASTA (omim) for
pFN21AE3420
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3420, 483 aa
1>>>pF1KE3420 483 - 483 aa - 483 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9731+/-0.00103; mu= 12.6214+/- 0.064
mean_var=365.7669+/-75.756, 0's: 0 Z-trim(108.0): 2019 B-trim: 69 in 1/49
Lambda= 0.067061
statistics sampled from 13838 (16102) to 13838 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.468), E-opt: 0.2 (0.189), width: 16
Scan time: 6.490
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_056936 (OMIM: 194624) zinc finger protein 117 [ ( 483) 3398 344.4 4.1e-94
NP_001243102 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 ( 531) 2472 254.9 4e-67
NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 is ( 595) 2472 255.0 4.2e-67
NP_001243100 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 ( 625) 2430 251.0 7.2e-66
XP_011526565 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 640) 2430 251.0 7.3e-66
XP_011526566 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 536) 2428 250.7 7.7e-66
XP_016882723 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 518) 2423 250.2 1.1e-65
NP_001269288 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 852) 2410 249.3 3.2e-65
XP_011526007 (OMIM: 603980) PREDICTED: zinc finger ( 531) 2392 247.2 8.6e-65
NP_001092096 (OMIM: 603980) zinc finger protein 98 ( 572) 2392 247.2 8.9e-65
XP_016867773 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 2379 246.2 2.5e-64
XP_016867772 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 2379 246.2 2.5e-64
NP_057304 (OMIM: 603989) zinc finger protein 107 i ( 783) 2379 246.2 2.5e-64
XP_016867775 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 2379 246.2 2.5e-64
XP_016867774 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 2379 246.2 2.5e-64
NP_001013768 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 783) 2379 246.2 2.5e-64
NP_001269289 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 820) 2367 245.1 5.6e-64
NP_112495 (OMIM: 603975) zinc finger protein 93 [H ( 620) 2302 238.6 3.8e-62
NP_001243583 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 2272 235.8 3.1e-61
NP_001243580 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 2272 235.8 3.1e-61
XP_011526559 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2272 235.9 3.2e-61
NP_001243578 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2272 235.9 3.2e-61
XP_016882703 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2272 235.9 3.2e-61
NP_001243579 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2272 235.9 3.2e-61
XP_016882702 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2272 235.9 3.2e-61
XP_016882704 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2272 235.9 3.2e-61
XP_016882705 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2272 235.9 3.2e-61
XP_016882698 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2272 235.9 3.2e-61
XP_016882697 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2272 235.9 3.2e-61
XP_016882699 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2272 235.9 3.2e-61
XP_016882701 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2272 235.9 3.2e-61
XP_016882700 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2272 235.9 3.2e-61
NP_001243577 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2272 235.9 3.2e-61
XP_011526561 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2272 235.9 3.2e-61
XP_016882696 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2272 235.9 3.2e-61
NP_003414 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 is ( 809) 2272 235.9 3.3e-61
NP_001243582 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 818) 2272 235.9 3.3e-61
NP_001303925 (OMIM: 606957) zinc finger protein 25 ( 531) 2260 234.4 6e-61
NP_258429 (OMIM: 606957) zinc finger protein 257 i ( 563) 2260 234.4 6.2e-61
NP_001265593 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 586) 2257 234.2 7.7e-61
XP_016883008 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 586) 2257 234.2 7.7e-61
XP_016883007 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 586) 2257 234.2 7.7e-61
XP_016883003 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2257 234.2 7.9e-61
NP_001265590 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 618) 2257 234.2 7.9e-61
XP_011526745 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2257 234.2 7.9e-61
XP_016883005 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2257 234.2 7.9e-61
NP_001265591 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 618) 2257 234.2 7.9e-61
XP_011526746 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2257 234.2 7.9e-61
NP_001265606 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 618) 2257 234.2 7.9e-61
XP_016883004 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2257 234.2 7.9e-61
>>NP_056936 (OMIM: 194624) zinc finger protein 117 [Homo (483 aa)
initn: 3398 init1: 3398 opt: 3398 Z-score: 1810.6 bits: 344.4 E(85289): 4.1e-94
Smith-Waterman score: 3398; 100.0% identity (100.0% similar) in 483 aa overlap (1-483:1-483)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MKRHEMVAKHLVMFYYFAQHLWPEQNIRDSFQKVTLRRYRKCGYENLQLRKGCKSVVECK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 MKRHEMVAKHLVMFYYFAQHLWPEQNIRDSFQKVTLRRYRKCGYENLQLRKGCKSVVECK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 QHKGDYSGLNQCLKTTLSKIFQCNKYVEVFHKISNSNRHKMRHTENKHFKCKECRKTFCM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 QHKGDYSGLNQCLKTTLSKIFQCNKYVEVFHKISNSNRHKMRHTENKHFKCKECRKTFCM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 LSHLTQHKRIQTRVNFYKCEAYGRAFNWSSTLNKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFNQTSHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LSHLTQHKRIQTRVNFYKCEAYGRAFNWSSTLNKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFNQTSHL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 IRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQSSTLTTHNIIHTGEIPYKCEKCVRAFNQASKLTEHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 IRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQSSTLTTHNIIHTGEIPYKCEKCVRAFNQASKLTEHK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 LIHTGEKRYECEECGKAFNRSSKLTEHKYIHTGEKLYKCEECGKAFNQSSTLTTHKRIHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LIHTGEKRYECEECGKAFNRSSKLTEHKYIHTGEKLYKCEECGKAFNQSSTLTTHKRIHS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 GEKPYKCEECGKAFKQFSNLTDHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQLSNLTRHKVIHTGEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 GEKPYKCEECGKAFKQFSNLTDHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQLSNLTRHKVIHTGEKP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 YKCGECGKAFNQSSALNTHKIIHTGENPHKCRESGKVFHLSSKLSTCKKIHTGEKLYKCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 YKCGECGKAFNQSSALNTHKIIHTGENPHKCRESGKVFHLSSKLSTCKKIHTGEKLYKCE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 ECGKAFNRSSTLIGHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLTTHKIIHTEEKQYKCDECGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 ECGKAFNRSSTLIGHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLTTHKIIHTEEKQYKCDECGK
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 AST
:::
NP_056 AST
>>NP_001243102 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 iso (531 aa)
initn: 2448 init1: 2448 opt: 2472 Z-score: 1326.1 bits: 254.9 E(85289): 4e-67
Smith-Waterman score: 2472; 72.8% identity (87.3% similar) in 482 aa overlap (1-481:1-482)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MKRHE-MVAKHLVMFYYFAQHLWPEQNIRDSFQKVTLRRYRKCGYENLQLRKGCKSVVEC
::::: :::: :: .::: :::::::.::::::::.:: :: .::: :::::.:. ::
NP_001 MKRHEIMVAKPTVMCSHFAQDLWPEQNIKDSFQKVTLKRYGKCRHENLPLRKGCESMDEC
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 KQHKGDYSGLNQCLKTTLSKIFQCNKYVEVFHKISNSNRHKMRHTENKHFKCKECRKTFC
:.::: .:::::: .: ::::::.:::.: ::.::::::..:::..: ::: .: :.:
NP_001 KMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKVAHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKCGKSFG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 MLSHLTQHKRIQTRVNFYKCEAYGRAFNWSSTLNKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFNQTSH
:.: ::.:.::.::::::::: :.::::::::.::::::::::::::.::::::::.:.
NP_001 MISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 LIRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQSSTLTTHNIIHTGEIPYKCEKCVRAFNQASKLTEH
::.::.::: :::::::::::.::. ::::::.:::::: ::::..: .:::..: :: :
NP_001 LIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTH
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 KLIHTGEKRYECEECGKAFNRSSKLTEHKYIHTGEKLYKCEECGKAFNQSSTLTTHKRIH
. :::::: :.::::::::..::.:: :: :::::: :::..::::::::. ::::. ::
NP_001 RKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIH
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 SGEKPYKCEECGKAFKQFSNLTDHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQLSNLTRHKVIHTGEK
.::::::::.:::::..::.:: :: ::::::::::.::::::.. :.::.::.::::::
NP_001 TGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEK
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 PYKCGECGKAFNQSSALNTHKIIHTGENPHKCRESGKVFHLSSKLSTCKKIHTGEKLYKC
:::: :: ::::::: :. :: :::::.:..:.. ::.:. ::.:. :: :: :: :::
NP_001 PYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKC
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 EECGKAFNRSSTLIGHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLTTHKIIHTEEKQYKCDECG
:::::.:. ::: :: ::::::::::::::::::::: :: :: ::: :: : :.:::
NP_001 EECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECG
430 440 450 460 470 480
480
pF1KE3 KAST
::
NP_001 KAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
490 500 510 520 530
>>NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 isofor (595 aa)
initn: 2448 init1: 2448 opt: 2472 Z-score: 1325.7 bits: 255.0 E(85289): 4.2e-67
Smith-Waterman score: 2472; 72.8% identity (87.3% similar) in 482 aa overlap (1-481:65-546)
10 20
pF1KE3 MKRHE-MVAKHLVMFYYFAQHLWPEQNIRD
::::: :::: :: .::: :::::::.:
NP_003 ENYRNLVFLGITVSKPDLITCLEQGKEAWSMKRHEIMVAKPTVMCSHFAQDLWPEQNIKD
40 50 60 70 80 90
30 40 50 60 70 80
pF1KE3 SFQKVTLRRYRKCGYENLQLRKGCKSVVECKQHKGDYSGLNQCLKTTLSKIFQCNKYVEV
:::::::.:: :: .::: :::::.:. :::.::: .:::::: .: ::::::.:::.:
NP_003 SFQKVTLKRYGKCRHENLPLRKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKV
100 110 120 130 140 150
90 100 110 120 130 140
pF1KE3 FHKISNSNRHKMRHTENKHFKCKECRKTFCMLSHLTQHKRIQTRVNFYKCEAYGRAFNWS
::.::::::..:::..: ::: .: :.: :.: ::.:.::.::::::::: :.:::::
NP_003 AHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKCGKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWS
160 170 180 190 200 210
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 STLNKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFNQTSHLIRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQSSTLT
:::.::::::::::::::.::::::::.:.::.::.::: :::::::::::.::. ::::
NP_003 STLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTLT
220 230 240 250 260 270
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 THNIIHTGEIPYKCEKCVRAFNQASKLTEHKLIHTGEKRYECEECGKAFNRSSKLTEHKY
::.:::::: ::::..: .:::..: :: :. :::::: :.::::::::..::.:: ::
NP_003 THKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKI
280 290 300 310 320 330
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 IHTGEKLYKCEECGKAFNQSSTLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQFSNLTDHKKIHTG
:::::: :::..::::::::. ::::. ::.::::::::.:::::..::.:: :: ::::
NP_003 IHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTG
340 350 360 370 380 390
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 EKPYKCEECGKAFNQLSNLTRHKVIHTGEKPYKCGECGKAFNQSSALNTHKIIHTGENPH
::::::.::::::.. :.::.::.:::::::::: :: ::::::: :. :: :::::.:.
NP_003 EKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPY
400 410 420 430 440 450
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 KCRESGKVFHLSSKLSTCKKIHTGEKLYKCEECGKAFNRSSTLIGHKRIHTGEKPYKCEE
.:.. ::.:. ::.:. :: :: :: ::::::::.:. ::: :: ::::::::::::
NP_003 ECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEE
460 470 480 490 500 510
450 460 470 480
pF1KE3 CGKAFNQSSTLTTHKIIHTEEKQYKCDECGKAST
::::::::: :: :: ::: :: : :.:::::
NP_003 CGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKA
520 530 540 550 560 570
NP_003 FKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
580 590
>>NP_001243100 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 iso (625 aa)
initn: 2427 init1: 2427 opt: 2430 Z-score: 1303.5 bits: 251.0 E(85289): 7.2e-66
Smith-Waterman score: 2430; 71.6% identity (86.8% similar) in 479 aa overlap (3-481:98-576)
10 20 30
pF1KE3 MKRHEMVAKHLVMFYYFAQHLWPEQNIRDSFQ
: . :. .: .::: :::::::.::::
NP_001 HEIMVAKPTGCLSKRMSYELLRKVYILMLLRSVLYASVRIMCSHFAQDLWPEQNIKDSFQ
70 80 90 100 110 120
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 KVTLRRYRKCGYENLQLRKGCKSVVECKQHKGDYSGLNQCLKTTLSKIFQCNKYVEVFHK
::::.:: :: .::: :::::.:. :::.::: .:::::: .: ::::::.:::.: ::
NP_001 KVTLKRYGKCRHENLPLRKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKVAHK
130 140 150 160 170 180
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 ISNSNRHKMRHTENKHFKCKECRKTFCMLSHLTQHKRIQTRVNFYKCEAYGRAFNWSSTL
.::::::..:::..: ::: .: :.: :.: ::.:.::.::::::::: :.::::::::
NP_001 FSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKCGKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTL
190 200 210 220 230 240
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 NKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFNQTSHLIRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQSSTLTTHN
.::::::::::::::.::::::::.:.::.::.::: :::::::::::.::. ::::::.
NP_001 TKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTLTTHK
250 260 270 280 290 300
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 IIHTGEIPYKCEKCVRAFNQASKLTEHKLIHTGEKRYECEECGKAFNRSSKLTEHKYIHT
:::::: ::::..: .:::..: :: :. :::::: :.::::::::..::.:: :: :::
NP_001 IIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHT
310 320 330 340 350 360
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 GEKLYKCEECGKAFNQSSTLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQFSNLTDHKKIHTGEKP
::: :::..::::::::. ::::. ::.::::::::.:::::..::.:: :: :::::::
NP_001 GEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKP
370 380 390 400 410 420
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 YKCEECGKAFNQLSNLTRHKVIHTGEKPYKCGECGKAFNQSSALNTHKIIHTGENPHKCR
:::.::::::.. :.::.::.:::::::::: :: ::::::: :. :: :::::.:..:.
NP_001 YKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECE
430 440 450 460 470 480
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 ESGKVFHLSSKLSTCKKIHTGEKLYKCEECGKAFNRSSTLIGHKRIHTGEKPYKCEECGK
. ::.:. ::.:. :: :: :: ::::::::.:. ::: :: :::::::::::::::
NP_001 KCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGK
490 500 510 520 530 540
460 470 480
pF1KE3 AFNQSSTLTTHKIIHTEEKQYKCDECGKAST
:::::: :: :: ::: :: : :.:::::
NP_001 AFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKW
550 560 570 580 590 600
>>XP_011526565 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger pro (640 aa)
initn: 2427 init1: 2427 opt: 2430 Z-score: 1303.4 bits: 251.0 E(85289): 7.3e-66
Smith-Waterman score: 2430; 71.6% identity (86.8% similar) in 479 aa overlap (3-481:113-591)
10 20 30
pF1KE3 MKRHEMVAKHLVMFYYFAQHLWPEQNIRDSFQ
: . :. .: .::: :::::::.::::
XP_011 QADLQLLVSSCLSKRMSYELLRKVYILMLLRSVLYASVRIMCSHFAQDLWPEQNIKDSFQ
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40 50 60 70 80 90
pF1KE3 KVTLRRYRKCGYENLQLRKGCKSVVECKQHKGDYSGLNQCLKTTLSKIFQCNKYVEVFHK
::::.:: :: .::: :::::.:. :::.::: .:::::: .: ::::::.:::.: ::
XP_011 KVTLKRYGKCRHENLPLRKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKVAHK
150 160 170 180 190 200
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 ISNSNRHKMRHTENKHFKCKECRKTFCMLSHLTQHKRIQTRVNFYKCEAYGRAFNWSSTL
.::::::..:::..: ::: .: :.: :.: ::.:.::.::::::::: :.::::::::
XP_011 FSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKCGKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTL
210 220 230 240 250 260
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 NKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFNQTSHLIRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQSSTLTTHN
.::::::::::::::.::::::::.:.::.::.::: :::::::::::.::. ::::::.
XP_011 TKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTLTTHK
270 280 290 300 310 320
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 IIHTGEIPYKCEKCVRAFNQASKLTEHKLIHTGEKRYECEECGKAFNRSSKLTEHKYIHT
:::::: ::::..: .:::..: :: :. :::::: :.::::::::..::.:: :: :::
XP_011 IIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHT
330 340 350 360 370 380
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 GEKLYKCEECGKAFNQSSTLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQFSNLTDHKKIHTGEKP
::: :::..::::::::. ::::. ::.::::::::.:::::..::.:: :: :::::::
XP_011 GEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKP
390 400 410 420 430 440
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 YKCEECGKAFNQLSNLTRHKVIHTGEKPYKCGECGKAFNQSSALNTHKIIHTGENPHKCR
:::.::::::.. :.::.::.:::::::::: :: ::::::: :. :: :::::.:..:.
XP_011 YKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECE
450 460 470 480 490 500
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 ESGKVFHLSSKLSTCKKIHTGEKLYKCEECGKAFNRSSTLIGHKRIHTGEKPYKCEECGK
. ::.:. ::.:. :: :: :: ::::::::.:. ::: :: :::::::::::::::
XP_011 KCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGK
510 520 530 540 550 560
460 470 480
pF1KE3 AFNQSSTLTTHKIIHTEEKQYKCDECGKAST
:::::: :: :: ::: :: : :.:::::
XP_011 AFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKW
570 580 590 600 610 620
>>XP_011526566 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger pro (536 aa)
initn: 2428 init1: 2428 opt: 2428 Z-score: 1303.0 bits: 250.7 E(85289): 7.7e-66
Smith-Waterman score: 2428; 72.8% identity (87.7% similar) in 470 aa overlap (12-481:18-487)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MKRHEMVAKHLVMFYYFAQHLWPEQNIRDSFQKVTLRRYRKCGYENLQLRKGCK
:: .::: :::::::.::::::::.:: :: .::: :::::.
XP_011 MSLSAQPSSSFYKPVSEVMCSHFAQDLWPEQNIKDSFQKVTLKRYGKCRHENLPLRKGCE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 SVVECKQHKGDYSGLNQCLKTTLSKIFQCNKYVEVFHKISNSNRHKMRHTENKHFKCKEC
:. :::.::: .:::::: .: ::::::.:::.: ::.::::::..:::..: ::: .:
XP_011 SMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKVAHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKC
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 RKTFCMLSHLTQHKRIQTRVNFYKCEAYGRAFNWSSTLNKHKRIHTGEKPYKCKECGKAF
:.: :.: ::.:.::.::::::::: :.::::::::.::::::::::::::.::::::
XP_011 GKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 NQTSHLIRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQSSTLTTHNIIHTGEIPYKCEKCVRAFNQAS
::.:.::.::.::: :::::::::::.::. ::::::.:::::: ::::..: .:::..:
XP_011 NQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 KLTEHKLIHTGEKRYECEECGKAFNRSSKLTEHKYIHTGEKLYKCEECGKAFNQSSTLTT
:: :. :::::: :.::::::::..::.:: :: :::::: :::..::::::::. :::
XP_011 TLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTT
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 HKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQFSNLTDHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQLSNLTRHKVI
:. ::.::::::::.:::::..::.:: :: ::::::::::.::::::.. :.::.::.:
XP_011 HEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKII
310 320 330 340 350 360
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pF1KE3 HTGEKPYKCGECGKAFNQSSALNTHKIIHTGENPHKCRESGKVFHLSSKLSTCKKIHTGE
::::::::: :: ::::::: :. :: :::::.:..:.. ::.:. ::.:. :: :: :
XP_011 HTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEE
370 380 390 400 410 420
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pF1KE3 KLYKCEECGKAFNRSSTLIGHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLTTHKIIHTEEKQYK
: ::::::::.:. ::: :: ::::::::::::::::::::: :: :: ::: :: :
XP_011 KPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYT
430 440 450 460 470 480
480
pF1KE3 CDECGKAST
:.:::::
XP_011 CEECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
490 500 510 520 530
>>XP_016882723 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger pro (518 aa)
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Smith-Waterman score: 2423; 72.7% identity (87.6% similar) in 469 aa overlap (13-481:1-469)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MKRHEMVAKHLVMFYYFAQHLWPEQNIRDSFQKVTLRRYRKCGYENLQLRKGCKSVVECK
: .::: :::::::.::::::::.:: :: .::: :::::.:. :::
XP_016 MCSHFAQDLWPEQNIKDSFQKVTLKRYGKCRHENLPLRKGCESMDECK
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 QHKGDYSGLNQCLKTTLSKIFQCNKYVEVFHKISNSNRHKMRHTENKHFKCKECRKTFCM
.::: .:::::: .: ::::::.:::.: ::.::::::..:::..: ::: .: :.: :
XP_016 MHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKVAHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKCGKSFGM
50 60 70 80 90 100
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pF1KE3 LSHLTQHKRIQTRVNFYKCEAYGRAFNWSSTLNKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFNQTSHL
.: ::.:.::.::::::::: :.::::::::.::::::::::::::.::::::::.:.:
XP_016 ISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNL
110 120 130 140 150 160
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pF1KE3 IRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQSSTLTTHNIIHTGEIPYKCEKCVRAFNQASKLTEHK
:.::.::: :::::::::::.::. ::::::.:::::: ::::..: .:::..: :: :.
XP_016 IKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHR
170 180 190 200 210 220
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pF1KE3 LIHTGEKRYECEECGKAFNRSSKLTEHKYIHTGEKLYKCEECGKAFNQSSTLTTHKRIHS
:::::: :.::::::::..::.:: :: :::::: :::..::::::::. ::::. ::.
XP_016 KIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHT
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 GEKPYKCEECGKAFKQFSNLTDHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQLSNLTRHKVIHTGEKP
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XP_016 GEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEKP
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 YKCGECGKAFNQSSALNTHKIIHTGENPHKCRESGKVFHLSSKLSTCKKIHTGEKLYKCE
::: :: ::::::: :. :: :::::.:..:.. ::.:. ::.:. :: :: :: ::::
XP_016 YKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKCE
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 ECGKAFNRSSTLIGHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLTTHKIIHTEEKQYKCDECGK
::::.:. ::: :: ::::::::::::::::::::: :: :: ::: :: : :.::::
XP_016 ECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECGK
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 AST
:
XP_016 AFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
470 480 490 500 510
>>NP_001269288 (OMIM: 603989) zinc finger protein 107 is (852 aa)
initn: 2410 init1: 2410 opt: 2410 Z-score: 1291.9 bits: 249.3 E(85289): 3.2e-65
Smith-Waterman score: 2410; 71.5% identity (86.3% similar) in 481 aa overlap (1-481:65-545)
10 20 30
pF1KE3 MKRHEMVAKHLVMFYYFAQHLWPEQNIRDS
.:::::::: :: ..::: :::::::.::
NP_001 ENYRNLVFLGIAVSKPYLITCLEQKKEPWNIKRHEMVAKPPVMSFHFAQDLWPEQNIKDS
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 FQKVTLRRYRKCGYENLQLRKGCKSVVECKQHKGDYSGLNQCLKTTLSKIFQCNKYVEVF
::::::::: :: ::::::::::: : :: ::: .. .:::: .: ::::::::::.::
NP_001 FQKVTLRRYGKCEYENLQLRKGCKHVDECTGHKGGHNTVNQCLTATPSKIFQCNKYVKVF
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 HKISNSNRHKMRHTENKHFKCKECRKTFCMLSHLTQHKRIQTRVNFYKCEAYGRAFNWSS
:.:::::.: ::: ::::::::: :.::.::.::::.::.:::: :::: :.:::: :
NP_001 DKFSNSNRYKRRHTGNKHFKCKECSKSFCVLSQLTQHRRIHTRVNSYKCEECGKAFNWFS
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 TLNKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFNQTSHLIRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQSSTLTT
::.::::::::::::::.::::::::.:.: ::: ::::::: :::::::::.:.: ::
NP_001 TLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSQLTRHKIIHTEEKPNKCEECGKAFKQASHLTI
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 HNIIHTGEIPYKCEKCVRAFNQASKLTEHKLIHTGEKRYECEECGKAFNRSSKLTEHKYI
:.:::::: ::: :.: ..:.:.:.:: .:..::::. :.:.::::::: :.::.:: :
NP_001 HKIIHTGEKPYKYEECGKVFSQSSHLTTQKILHTGENLYKCKECGKAFNLFSNLTNHKRI
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 HTGEKLYKCEECGKAFNQSSTLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQFSNLTDHKKIHTGE
:.::: :::.:::.::: ::.:. ...::.: : ::::: :::.. .:: :::: :
NP_001 HAGEKPYKCKECGRAFNISSNLNKQEKIHTGGKLNKCEECDKAFNRSLKLTAHKKILMEE
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 KPYKCEECGKAFNQLSNLTRHKVIHTGEKPYKCGECGKAFNQSSALNTHKIIHTGENPHK
::::::::::.:::.:.:::::.:::::::::: :::::::::: :. :: :::.:. .:
NP_001 KPYKCEECGKVFNQFSTLTRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNQSSNLTEHKKIHTAEKSYK
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 CRESGKVFHLSSKLSTCKKIHTGEKLYKCEECGKAFNRSSTLIGHKRIHTGEKPYKCEEC
:.: ::.:. :.: . .::..::: :::::::::::::::: ::.:::::::::::::
NP_001 CEECGKAFNQHSNLINHRKIYSGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTRHKKIHTGEKPYKCEEC
460 470 480 490 500 510
460 470 480
pF1KE3 GKAFNQSSTLTTHKIIHTEEKQYKCDECGKAST
.::.:::.:: :: ::: :: :::.:::::
NP_001 DRAFSQSSNLTEHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNRFSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAF
520 530 540 550 560 570
NP_001 NQSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFGKAFKQSSHRTIHKIIHTGEKPYKCEEHGKVFNQSS
580 590 600 610 620 630
>--
initn: 3970 init1: 1428 opt: 1431 Z-score: 780.0 bits: 154.6 E(85289): 1e-36
Smith-Waterman score: 1431; 69.4% identity (84.7% similar) in 307 aa overlap (174-480:546-851)
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 RAFNWSSTLNKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFNQTSHLIRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFN
::. : : .:::::: ::::::::::::::
NP_001 RAFSQSSNLTEHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNRFSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFN
520 530 540 550 560 570
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 QSSTLTTHNIIHTGEIPYKCEKCVRAFNQASKLTEHKLIHTGEKRYECEECGKAFNRSSK
:: :: :.:.:: : :::. .::.:.:. : ::.:::::: :.::: ::.::.::.
NP_001 QSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFGKAFKQSSHRTIHKIIHTGEKPYKCEEHGKVFNQSSN
580 590 600 610 620 630
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pF1KE3 LTEHKYIHTGEKLYKCEECGKAFNQSSTLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQFSNLTDH
:: .: :::::.::: :: ::::: :..:.:: :..::::.::::::::...::::: :
NP_001 LTTQKIIHTGENLYKFEEHGKAFNLFSNITNHKIIYTGEKPHKCEECGKAYNRFSNLTIH
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pF1KE3 KKIHTGEKPYKCEECGKAFNQLSNLTRHKVIHTGEKPYKCGECGKAFNQSSALNTHKIIH
:.::::::::.: ::::::: :.:.:::.:::::::::: ::::::: ::.:..:: ::
NP_001 KRIHTGEKPYQCAECGKAFNCSSTLNRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNLSSTLTAHKKIH
700 710 720 730 740 750
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pF1KE3 TGENPHKCRESGKVFHLSSKLSTCKKIHTGEKLYKCEECGKAFNRSSTLIGHKRIHTGEK
:::.:.::.: ::.:. ::.:.: :::::.:: ::::::::.::. :.: :: ::::::
NP_001 TGEKPYKCEECGKAFNQSSNLTTHKKIHTSEKPYKCEECGKSFNQFSSLNIHKIIHTGEK
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pF1KE3 PYKCEECGKAFNQSSTLTTHKIIHTEEKQYKCDECGKAST
:::: . :.::: ::.::::: ::: :: ::: : ::
NP_001 PYKCGDYGRAFNLSSNLTTHKKIHTGEKPYKC-EYGKT
820 830 840 850
>>XP_011526007 (OMIM: 603980) PREDICTED: zinc finger pro (531 aa)
initn: 2391 init1: 2391 opt: 2392 Z-score: 1284.2 bits: 247.2 E(85289): 8.6e-65
Smith-Waterman score: 2392; 71.3% identity (85.7% similar) in 481 aa overlap (1-481:33-513)
10 20 30
pF1KE3 MKRHEMVAKHLVMFYYFAQHLWPEQNIRDS
.::::::.. :.. :::: :::.:. ..
XP_011 ENYRNLVFVGIAASKPDLITCLEQGKEPWNVKRHEMVTEPPVVYSYFAQDLWPKQGKKNY
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 FQKVTLRRYRKCGYENLQLRKGCKSVVECKQHKGDYSGLNQCLKTTLSKIFQCNKYVEVF
:::: :: :.::: ::::::: :::. ::: :: :.:::::: :: .:::: .:::.::
XP_011 FQKVILRTYKKCGRENLQLRKYCKSMDECKVHKECYNGLNQCLTTTQNKIFQYDKYVKVF
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 HKISNSNRHKMRHTENKHFKCKECRKTFCMLSHLTQHKRIQTRVNFYKCEAYGRAFNWSS
::.:::::::. :: .: ::::::.:.:::::::.:::::.. . :::. :.:.: .:
XP_011 HKFSNSNRHKIGHTGKKSFKCKECEKSFCMLSHLAQHKRIHSGEKPYKCKECGKAYNEAS
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 TLNKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFNQTSHLIRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQSSTLTT
.:. :::::::.:::::.:::::::. ::: :: ::: .:::::::::::::::..:::
XP_011 NLSTHKRIHTGKKPYKCEECGKAFNRLSHLTTHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNQSANLTT
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220 230 240 250 260 270
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XP_011 HKRIHTGEKPYKCEECGRAFSQSSTLTAHKIIHAGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTTHKII
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XP_011 HTGEKFYKCEECGKAFSRLSHLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTTHKRIHAGE
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340 350 360 370 380 390
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460 470 480
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XP_011 GKAFNNSSILNRHKMIHTGEKLYKPESCNNACDNIAKISKYKRNCAGEK
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10 20 30
pF1KE3 MKRHEMVAKHLVMFYYFAQHLWPEQNIRDS
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NP_001 GKAFNNSSILNRHKMIHTGEKLYKPESCNNACDNIAKISKYKRNCAGEK
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483 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 18:23:50 2016 done: Mon Nov 7 18:23:51 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]