FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3420, 483 aa
1>>>pF1KE3420 483 - 483 aa - 483 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1356+/-0.0023; mu= 10.6178+/- 0.137
mean_var=258.4307+/-53.079, 0's: 0 Z-trim(100.9): 958 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.079781
statistics sampled from 5267 (6287) to 5267 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.473), E-opt: 0.2 (0.193), width: 16
Scan time: 2.320
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43593.1 ZNF117 gene_id:51351|Hs108|chr7 ( 483) 3398 405.9 5.1e-113
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 2472 299.4 7e-81
CCDS75605.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 852) 2410 292.5 1.2e-78
CCDS46032.1 ZNF492 gene_id:57615|Hs108|chr19 ( 531) 2401 291.2 1.9e-78
CCDS46031.1 ZNF98 gene_id:148198|Hs108|chr19 ( 572) 2392 290.2 4e-78
CCDS32981.1 ZNF675 gene_id:171392|Hs108|chr19 ( 568) 2379 288.7 1.1e-77
CCDS5527.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 783) 2379 288.9 1.4e-77
CCDS75606.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 820) 2367 287.5 3.6e-77
CCDS42539.1 ZNF676 gene_id:163223|Hs108|chr19 ( 588) 2305 280.2 4.2e-75
CCDS32979.1 ZNF431 gene_id:170959|Hs108|chr19 ( 576) 2303 279.9 4.9e-75
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CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19 ( 616) 2284 277.8 2.3e-74
CCDS32980.1 ZNF708 gene_id:7562|Hs108|chr19 ( 563) 2282 277.5 2.6e-74
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 2272 276.6 7e-74
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 2272 276.6 7.1e-74
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 2272 276.6 7.1e-74
CCDS54239.1 ZNF714 gene_id:148206|Hs108|chr19 ( 555) 2264 275.4 1.1e-73
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 2265 275.6 1.1e-73
CCDS46030.1 ZNF257 gene_id:113835|Hs108|chr19 ( 563) 2260 275.0 1.5e-73
CCDS74324.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 586) 2257 274.6 1.9e-73
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CCDS32983.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 659) 2257 274.7 2.1e-73
CCDS34646.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 586) 2254 274.3 2.5e-73
CCDS54238.1 ZNF737 gene_id:100129842|Hs108|chr19 ( 536) 2253 274.1 2.5e-73
CCDS12414.2 ZNF681 gene_id:148213|Hs108|chr19 ( 645) 2240 272.7 8e-73
CCDS47596.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 517) 2222 270.5 3e-72
CCDS62623.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 574) 2220 270.4 3.7e-72
CCDS75608.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 554) 2217 270.0 4.6e-72
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 2215 270.2 8.3e-72
CCDS75609.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 510) 2207 268.8 9.7e-72
CCDS5528.2 ZNF273 gene_id:10793|Hs108|chr7 ( 569) 2207 268.9 1e-71
CCDS32978.1 ZNF430 gene_id:80264|Hs108|chr19 ( 570) 2200 268.1 1.8e-71
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 2184 266.7 9.7e-71
CCDS59369.1 ZNF99 gene_id:7652|Hs108|chr19 ( 864) 2169 264.8 2.7e-70
CCDS34644.1 ZNF680 gene_id:340252|Hs108|chr7 ( 530) 2141 261.2 1.9e-69
CCDS46028.1 ZNF90 gene_id:7643|Hs108|chr19 ( 601) 2074 253.6 4.3e-67
CCDS59371.1 ZNF730 gene_id:100129543|Hs108|chr19 ( 503) 2067 252.7 6.8e-67
CCDS42538.1 ZNF100 gene_id:163227|Hs108|chr19 ( 542) 2060 251.9 1.2e-66
CCDS42535.1 ZNF626 gene_id:199777|Hs108|chr19 ( 528) 2037 249.3 7.7e-66
CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 2006 246.2 1.5e-64
CCDS43590.1 ZNF479 gene_id:90827|Hs108|chr7 ( 524) 1994 244.3 2.4e-64
CCDS46991.1 ZNF721 gene_id:170960|Hs108|chr4 ( 923) 1995 244.8 3e-64
CCDS55112.1 ZNF716 gene_id:441234|Hs108|chr7 ( 495) 1881 231.3 1.9e-60
CCDS42532.1 ZNF253 gene_id:56242|Hs108|chr19 ( 499) 1855 228.3 1.5e-59
CCDS75077.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 465) 1853 228.0 1.7e-59
CCDS75076.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 616) 1853 228.2 2e-59
CCDS59368.1 ZNF729 gene_id:100287226|Hs108|chr19 (1252) 1858 229.2 2e-59
CCDS75075.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 648) 1853 228.2 2.1e-59
CCDS12412.1 ZNF493 gene_id:284443|Hs108|chr19 ( 646) 1824 224.9 2.1e-58
CCDS42536.1 ZNF493 gene_id:284443|Hs108|chr19 ( 774) 1824 225.0 2.3e-58
>>CCDS43593.1 ZNF117 gene_id:51351|Hs108|chr7 (483 aa)
initn: 3398 init1: 3398 opt: 3398 Z-score: 2142.5 bits: 405.9 E(32554): 5.1e-113
Smith-Waterman score: 3398; 100.0% identity (100.0% similar) in 483 aa overlap (1-483:1-483)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MKRHEMVAKHLVMFYYFAQHLWPEQNIRDSFQKVTLRRYRKCGYENLQLRKGCKSVVECK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MKRHEMVAKHLVMFYYFAQHLWPEQNIRDSFQKVTLRRYRKCGYENLQLRKGCKSVVECK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 QHKGDYSGLNQCLKTTLSKIFQCNKYVEVFHKISNSNRHKMRHTENKHFKCKECRKTFCM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QHKGDYSGLNQCLKTTLSKIFQCNKYVEVFHKISNSNRHKMRHTENKHFKCKECRKTFCM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 LSHLTQHKRIQTRVNFYKCEAYGRAFNWSSTLNKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFNQTSHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LSHLTQHKRIQTRVNFYKCEAYGRAFNWSSTLNKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFNQTSHL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 IRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQSSTLTTHNIIHTGEIPYKCEKCVRAFNQASKLTEHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQSSTLTTHNIIHTGEIPYKCEKCVRAFNQASKLTEHK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 LIHTGEKRYECEECGKAFNRSSKLTEHKYIHTGEKLYKCEECGKAFNQSSTLTTHKRIHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LIHTGEKRYECEECGKAFNRSSKLTEHKYIHTGEKLYKCEECGKAFNQSSTLTTHKRIHS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 GEKPYKCEECGKAFKQFSNLTDHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQLSNLTRHKVIHTGEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GEKPYKCEECGKAFKQFSNLTDHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQLSNLTRHKVIHTGEKP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 YKCGECGKAFNQSSALNTHKIIHTGENPHKCRESGKVFHLSSKLSTCKKIHTGEKLYKCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YKCGECGKAFNQSSALNTHKIIHTGENPHKCRESGKVFHLSSKLSTCKKIHTGEKLYKCE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 ECGKAFNRSSTLIGHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLTTHKIIHTEEKQYKCDECGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ECGKAFNRSSTLIGHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLTTHKIIHTEEKQYKCDECGK
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 AST
:::
CCDS43 AST
>>CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 (595 aa)
initn: 2448 init1: 2448 opt: 2472 Z-score: 1565.6 bits: 299.4 E(32554): 7e-81
Smith-Waterman score: 2472; 72.8% identity (87.3% similar) in 482 aa overlap (1-481:65-546)
10 20
pF1KE3 MKRHE-MVAKHLVMFYYFAQHLWPEQNIRD
::::: :::: :: .::: :::::::.:
CCDS32 ENYRNLVFLGITVSKPDLITCLEQGKEAWSMKRHEIMVAKPTVMCSHFAQDLWPEQNIKD
40 50 60 70 80 90
30 40 50 60 70 80
pF1KE3 SFQKVTLRRYRKCGYENLQLRKGCKSVVECKQHKGDYSGLNQCLKTTLSKIFQCNKYVEV
:::::::.:: :: .::: :::::.:. :::.::: .:::::: .: ::::::.:::.:
CCDS32 SFQKVTLKRYGKCRHENLPLRKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKV
100 110 120 130 140 150
90 100 110 120 130 140
pF1KE3 FHKISNSNRHKMRHTENKHFKCKECRKTFCMLSHLTQHKRIQTRVNFYKCEAYGRAFNWS
::.::::::..:::..: ::: .: :.: :.: ::.:.::.::::::::: :.:::::
CCDS32 AHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKCGKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWS
160 170 180 190 200 210
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 STLNKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFNQTSHLIRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQSSTLT
:::.::::::::::::::.::::::::.:.::.::.::: :::::::::::.::. ::::
CCDS32 STLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTLT
220 230 240 250 260 270
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 THNIIHTGEIPYKCEKCVRAFNQASKLTEHKLIHTGEKRYECEECGKAFNRSSKLTEHKY
::.:::::: ::::..: .:::..: :: :. :::::: :.::::::::..::.:: ::
CCDS32 THKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKI
280 290 300 310 320 330
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 IHTGEKLYKCEECGKAFNQSSTLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQFSNLTDHKKIHTG
:::::: :::..::::::::. ::::. ::.::::::::.:::::..::.:: :: ::::
CCDS32 IHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTG
340 350 360 370 380 390
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 EKPYKCEECGKAFNQLSNLTRHKVIHTGEKPYKCGECGKAFNQSSALNTHKIIHTGENPH
::::::.::::::.. :.::.::.:::::::::: :: ::::::: :. :: :::::.:.
CCDS32 EKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPY
400 410 420 430 440 450
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 KCRESGKVFHLSSKLSTCKKIHTGEKLYKCEECGKAFNRSSTLIGHKRIHTGEKPYKCEE
.:.. ::.:. ::.:. :: :: :: ::::::::.:. ::: :: ::::::::::::
CCDS32 ECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEE
460 470 480 490 500 510
450 460 470 480
pF1KE3 CGKAFNQSSTLTTHKIIHTEEKQYKCDECGKAST
::::::::: :: :: ::: :: : :.:::::
CCDS32 CGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKA
520 530 540 550 560 570
CCDS32 FKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
580 590
>>CCDS75605.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 (852 aa)
initn: 2410 init1: 2410 opt: 2410 Z-score: 1525.4 bits: 292.5 E(32554): 1.2e-78
Smith-Waterman score: 2410; 71.5% identity (86.3% similar) in 481 aa overlap (1-481:65-545)
10 20 30
pF1KE3 MKRHEMVAKHLVMFYYFAQHLWPEQNIRDS
.:::::::: :: ..::: :::::::.::
CCDS75 ENYRNLVFLGIAVSKPYLITCLEQKKEPWNIKRHEMVAKPPVMSFHFAQDLWPEQNIKDS
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 FQKVTLRRYRKCGYENLQLRKGCKSVVECKQHKGDYSGLNQCLKTTLSKIFQCNKYVEVF
::::::::: :: ::::::::::: : :: ::: .. .:::: .: ::::::::::.::
CCDS75 FQKVTLRRYGKCEYENLQLRKGCKHVDECTGHKGGHNTVNQCLTATPSKIFQCNKYVKVF
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 HKISNSNRHKMRHTENKHFKCKECRKTFCMLSHLTQHKRIQTRVNFYKCEAYGRAFNWSS
:.:::::.: ::: ::::::::: :.::.::.::::.::.:::: :::: :.:::: :
CCDS75 DKFSNSNRYKRRHTGNKHFKCKECSKSFCVLSQLTQHRRIHTRVNSYKCEECGKAFNWFS
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 TLNKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFNQTSHLIRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQSSTLTT
::.::::::::::::::.::::::::.:.: ::: ::::::: :::::::::.:.: ::
CCDS75 TLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSQLTRHKIIHTEEKPNKCEECGKAFKQASHLTI
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 HNIIHTGEIPYKCEKCVRAFNQASKLTEHKLIHTGEKRYECEECGKAFNRSSKLTEHKYI
:.:::::: ::: :.: ..:.:.:.:: .:..::::. :.:.::::::: :.::.:: :
CCDS75 HKIIHTGEKPYKYEECGKVFSQSSHLTTQKILHTGENLYKCKECGKAFNLFSNLTNHKRI
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 HTGEKLYKCEECGKAFNQSSTLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQFSNLTDHKKIHTGE
:.::: :::.:::.::: ::.:. ...::.: : ::::: :::.. .:: :::: :
CCDS75 HAGEKPYKCKECGRAFNISSNLNKQEKIHTGGKLNKCEECDKAFNRSLKLTAHKKILMEE
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 KPYKCEECGKAFNQLSNLTRHKVIHTGEKPYKCGECGKAFNQSSALNTHKIIHTGENPHK
::::::::::.:::.:.:::::.:::::::::: :::::::::: :. :: :::.:. .:
CCDS75 KPYKCEECGKVFNQFSTLTRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNQSSNLTEHKKIHTAEKSYK
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 CRESGKVFHLSSKLSTCKKIHTGEKLYKCEECGKAFNRSSTLIGHKRIHTGEKPYKCEEC
:.: ::.:. :.: . .::..::: :::::::::::::::: ::.:::::::::::::
CCDS75 CEECGKAFNQHSNLINHRKIYSGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTRHKKIHTGEKPYKCEEC
460 470 480 490 500 510
460 470 480
pF1KE3 GKAFNQSSTLTTHKIIHTEEKQYKCDECGKAST
.::.:::.:: :: ::: :: :::.:::::
CCDS75 DRAFSQSSNLTEHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNRFSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAF
520 530 540 550 560 570
CCDS75 NQSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFGKAFKQSSHRTIHKIIHTGEKPYKCEEHGKVFNQSS
580 590 600 610 620 630
>--
initn: 3970 init1: 1428 opt: 1431 Z-score: 916.4 bits: 179.8 E(32554): 1e-44
Smith-Waterman score: 1431; 69.4% identity (84.7% similar) in 307 aa overlap (174-480:546-851)
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 RAFNWSSTLNKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFNQTSHLIRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFN
::. : : .:::::: ::::::::::::::
CCDS75 RAFSQSSNLTEHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNRFSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFN
520 530 540 550 560 570
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 QSSTLTTHNIIHTGEIPYKCEKCVRAFNQASKLTEHKLIHTGEKRYECEECGKAFNRSSK
:: :: :.:.:: : :::. .::.:.:. : ::.:::::: :.::: ::.::.::.
CCDS75 QSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFGKAFKQSSHRTIHKIIHTGEKPYKCEEHGKVFNQSSN
580 590 600 610 620 630
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 LTEHKYIHTGEKLYKCEECGKAFNQSSTLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQFSNLTDH
:: .: :::::.::: :: ::::: :..:.:: :..::::.::::::::...::::: :
CCDS75 LTTQKIIHTGENLYKFEEHGKAFNLFSNITNHKIIYTGEKPHKCEECGKAYNRFSNLTIH
640 650 660 670 680 690
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 KKIHTGEKPYKCEECGKAFNQLSNLTRHKVIHTGEKPYKCGECGKAFNQSSALNTHKIIH
:.::::::::.: ::::::: :.:.:::.:::::::::: ::::::: ::.:..:: ::
CCDS75 KRIHTGEKPYQCAECGKAFNCSSTLNRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNLSSTLTAHKKIH
700 710 720 730 740 750
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 TGENPHKCRESGKVFHLSSKLSTCKKIHTGEKLYKCEECGKAFNRSSTLIGHKRIHTGEK
:::.:.::.: ::.:. ::.:.: :::::.:: ::::::::.::. :.: :: ::::::
CCDS75 TGEKPYKCEECGKAFNQSSNLTTHKKIHTSEKPYKCEECGKSFNQFSSLNIHKIIHTGEK
760 770 780 790 800 810
450 460 470 480
pF1KE3 PYKCEECGKAFNQSSTLTTHKIIHTEEKQYKCDECGKAST
:::: . :.::: ::.::::: ::: :: ::: : ::
CCDS75 PYKCGDYGRAFNLSSNLTTHKKIHTGEKPYKC-EYGKT
820 830 840 850
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10 20 30
pF1KE3 MKRHEMVAKHLVMFYYFAQHLWPEQNIRDS
.:::::::. :. :::. :::.:. ..
CCDS46 ENYRNLVFVGIAASKPDLITCLEQGKEPWNVKRHEMVAEPPVVCSYFARDLWPKQGKKNY
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 FQKVTLRRYRKCGYENLQLRKGCKSVVECKQHKGDYSGLNQCLKTTLSKIFQCNKYVEVF
:::: ::::.::: ::::::: :::. ::: :: :.:::::: :: .:::::.:::.::
CCDS46 FQKVILRRYKKCGCENLQLRKYCKSMDECKVHKECYNGLNQCLTTTQNKIFQCDKYVKVF
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 HKISNSNRHKMRHTENKHFKCKECRKTFCMLSHLTQHKRIQTRVNFYKCEAYGRAFNWSS
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CCDS46 HKFSNSNRHTIRHTGKKSFKCKECEKSFCMLSHLAQHKRIHSGEKPYKCKECGKAYNETS
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 TLNKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFNQTSHLIRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQSSTLTT
.:. :::::::.:::::.:::::::. ::: :: ::: .:::::::::::::::..:::
CCDS46 NLSTHKRIHTGKKPYKCEECGKAFNRLSHLTTHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNQSANLTT
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 HNIIHTGEIPYKCEKCVRAFNQASKLTEHKLIHTGEKRYECEECGKAFNRSSKLTEHKYI
:. ::::: :::::.: :::.:.: :: ::.::.::: :.::::::::..:: :: :: :
CCDS46 HKRIHTGEKPYKCEECGRAFSQSSTLTAHKIIHAGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTTHKII
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 HTGEKLYKCEECGKAFNQSSTLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQFSNLTDHKKIHTGE
:::::.::::::::::.: : ::::::::::::::::::::::::: :.:: ::.::.::
CCDS46 HTGEKFYKCEECGKAFSQLSHLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTTHKRIHAGE
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 KPYKCEECGKAFNQLSNLTRHKVIHTGEKPYKCGECGKAFNQSSALNTHKIIHTGENPHK
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CCDS46 KFYKCEVCSKAFSRFSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNLSSQLTTHKIIHTGEKPYK
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 CRESGKVFHLSSKLSTCKKIHTGEKLYKCEECGKAFNRSSTLIGHKRIHTGEKPYKCEEC
:.: ::.:. :: :: : :::::: :: ::::::::.:: : :: :::::::::::::
CCDS46 CEECGKAFNQSSTLSKHKVIHTGEKPYKYEECGKAFNQSSHLTTHKMIHTGEKPYKCEEC
430 440 450 460 470 480
460 470 480
pF1KE3 GKAFNQSSTLTTHKIIHTEEKQYKCDECGKAST
:::::.:: :. ::.::: :: :: . :..:
CCDS46 GKAFNNSSILNRHKMIHTGEKLYKPESCNNACDNIAKISKYKRNCAGEK
490 500 510 520 530
>>CCDS46031.1 ZNF98 gene_id:148198|Hs108|chr19 (572 aa)
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Smith-Waterman score: 2392; 71.3% identity (85.7% similar) in 481 aa overlap (1-481:74-554)
10 20 30
pF1KE3 MKRHEMVAKHLVMFYYFAQHLWPEQNIRDS
.::::::.. :.. :::: :::.:. ..
CCDS46 ENYRNLVFVGIAASKPDLITCLEQGKEPWNVKRHEMVTEPPVVYSYFAQDLWPKQGKKNY
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 FQKVTLRRYRKCGYENLQLRKGCKSVVECKQHKGDYSGLNQCLKTTLSKIFQCNKYVEVF
:::: :: :.::: ::::::: :::. ::: :: :.:::::: :: .:::: .:::.::
CCDS46 FQKVILRTYKKCGRENLQLRKYCKSMDECKVHKECYNGLNQCLTTTQNKIFQYDKYVKVF
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 HKISNSNRHKMRHTENKHFKCKECRKTFCMLSHLTQHKRIQTRVNFYKCEAYGRAFNWSS
::.:::::::. :: .: ::::::.:.:::::::.:::::.. . :::. :.:.: .:
CCDS46 HKFSNSNRHKIGHTGKKSFKCKECEKSFCMLSHLAQHKRIHSGEKPYKCKECGKAYNEAS
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 TLNKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFNQTSHLIRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQSSTLTT
.:. :::::::.:::::.:::::::. ::: :: ::: .:::::::::::::::..:::
CCDS46 NLSTHKRIHTGKKPYKCEECGKAFNRLSHLTTHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNQSANLTT
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 HNIIHTGEIPYKCEKCVRAFNQASKLTEHKLIHTGEKRYECEECGKAFNRSSKLTEHKYI
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CCDS46 HKRIHTGEKPYKCEECGRAFSQSSTLTAHKIIHAGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTTHKII
290 300 310 320 330 340
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 HTGEKLYKCEECGKAFNQSSTLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQFSNLTDHKKIHTGE
:::::.::::::::::.. : ::::::::::::::::::::::::: :.:: ::.::.::
CCDS46 HTGEKFYKCEECGKAFSRLSHLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTTHKRIHAGE
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340 350 360 370 380 390
pF1KE3 KPYKCEECGKAFNQLSNLTRHKVIHTGEKPYKCGECGKAFNQSSALNTHKIIHTGENPHK
: :::: :.:::...:.:: :: :::::::::: ::::::: :: :.:::::::::.:.:
CCDS46 KFYKCEVCSKAFSRFSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNLSSQLTTHKIIHTGEKPYK
410 420 430 440 450 460
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 CRESGKVFHLSSKLSTCKKIHTGEKLYKCEECGKAFNRSSTLIGHKRIHTGEKPYKCEEC
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CCDS46 CEECGKAFNQSSTLSKHKVIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSHLTTHKMIHTGEKPYKCEEC
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460 470 480
pF1KE3 GKAFNQSSTLTTHKIIHTEEKQYKCDECGKAST
:::::.:: :. ::.::: :: :: . :..:
CCDS46 GKAFNNSSILNRHKMIHTGEKLYKPESCNNACDNIAKISKYKRNCAGEK
530 540 550 560 570
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10 20 30
pF1KE3 MKRHEMVAKHLVMFYYFAQHLWPEQNIRDS
.:::::: . :: .:::..::::::.::
CCDS32 ENYRNLVFLGIAVSKQDLITCLEQEKEPLTVKRHEMVNEPPVMCSHFAQEFWPEQNIKDS
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 FQKVTLRRYRKCGYENLQLRKGCKSVVECKQHKGDYSGLNQCLKTTLSKIFQCNKYVEVF
:.:::::::.::: .:.:: :::::: ::: ::: :.:::::: : ::.:::.:::.::
CCDS32 FEKVTLRRYEKCGNDNFQL-KGCKSVDECKLHKGGYNGLNQCLPTMQSKMFQCDKYVKVF
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 HKISNSNRHKMRHTENKHFKCKECRKTFCMLSHLTQHKRIQTRVNFYKCEAYGRAFNWSS
.:.:.:.:::..: ::: :::::: ..::::::::.:.: :.::: ::: .: : ::
CCDS32 NKFSHSDRHKIKHMENKPFKCKECGRSFCMLSHLTRHERNYTKVNFCKCEECEKAVNQSS
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 TLNKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFNQTSHLIRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQSSTLTT
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CCDS32 KLTKHKRIYTCEKLYKCQECDRTFNQFSNLTEYKKDYAREKPYKCEECGKAFNQSSHLTT
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 HNIIHTGEIPYKCEKCVRAFNQASKLTEHKLIHTGEKRYECEECGKAFNRSSKLTEHKYI
:.:::::: :::::.: .:::: :.:: :: :::::. : ::::::::..:: :: :: :
CCDS32 HKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQFSNLTTHKKIHTGEQPYICEECGKAFTQSSTLTTHKRI
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 HTGEKLYKCEECGKAFNQSSTLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQFSNLTDHKKIHTGE
::::: :::::::::::.:: :: :: ::.::.:::::::::::.. ::::.:.:::: :
CCDS32 HTGEKPYKCEECGKAFNRSSKLTEHKNIHTGEQPYKCEECGKAFNRSSNLTEHRKIHTEE
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340 350 360 370 380 390
pF1KE3 KPYKCEECGKAFNQLSNLTRHKVIHTGEKPYKCGECGKAFNQSSALNTHKIIHTGENPHK
:::::.::::::.. : :: :: :::::::::: :::::::.:: :. :: .:::..:.:
CCDS32 KPYKCKECGKAFKHSSALTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSKLTEHKKLHTGKKPYK
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400 410 420 430 440 450
pF1KE3 CRESGKVFHLSSKLSTCKKIHTGEKLYKCEECGKAFNRSSTLIGHKRIHTGEKPYKCEEC
:.: ::.: ::::. ::::.:: ::::::::::..::.: ::::::::::::::::
CCDS32 CEECGKAFIQSSKLTEHKKIHSGEIPYKCEECGKAFKHSSSLTTHKRIHTGEKPYKCEEC
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460 470 480
pF1KE3 GKAFNQSSTLTTHKIIHTEEKQYKCDECGKAST
::::..:: :: :::::: :: :::..: ::
CCDS32 GKAFSRSSKLTEHKIIHTGEKPYKCERCDKAFNQSANLTKHKKIHTGEKLQNWNV
520 530 540 550 560
>>CCDS5527.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 (783 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MKRHEMVAKHLVMFYYFAQHLWPEQNIRDSFQKVTLRRYRKCGYENLQLRKGCKSVVECK
:::: :: ..::: :::::::.::::::::::: :: ::::::::::: : ::
CCDS55 MVAKPPVMSFHFAQDLWPEQNIKDSFQKVTLRRYGKCEYENLQLRKGCKHVDECT
10 20 30 40 50
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pF1KE3 QHKGDYSGLNQCLKTTLSKIFQCNKYVEVFHKISNSNRHKMRHTENKHFKCKECRKTFCM
::: .. .:::: .: ::::::::::.:: :.:::::.: ::: ::::::::: :.::.
CCDS55 GHKGGHNTVNQCLTATPSKIFQCNKYVKVFDKFSNSNRYKRRHTGNKHFKCKECSKSFCV
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pF1KE3 LSHLTQHKRIQTRVNFYKCEAYGRAFNWSSTLNKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFNQTSHL
::.::::.::.:::: :::: :.:::: :::.::::::::::::::.::::::::.:.:
CCDS55 LSQLTQHRRIHTRVNSYKCEECGKAFNWFSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSQL
120 130 140 150 160 170
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pF1KE3 IRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQSSTLTTHNIIHTGEIPYKCEKCVRAFNQASKLTEHK
::: ::::::: :::::::::.:.: :: :.:::::: ::: :.: ..:.:.:.:: .:
CCDS55 TRHKIIHTEEKPNKCEECGKAFKQASHLTIHKIIHTGEKPYKYEECGKVFSQSSHLTTQK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 LIHTGEKRYECEECGKAFNRSSKLTEHKYIHTGEKLYKCEECGKAFNQSSTLTTHKRIHS
..::::. :.:.::::::: :.::.:: ::.::: :::.:::.::: ::.:. ...::.
CCDS55 ILHTGENLYKCKECGKAFNLFSNLTNHKRIHAGEKPYKCKECGRAFNISSNLNKQEKIHT
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 GEKPYKCEECGKAFKQFSNLTDHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQLSNLTRHKVIHTGEKP
: : ::::: :::.. .:: :::: :::::::::::.:::.:.:::::.:::::::
CCDS55 GGKLNKCEECDKAFNRSLKLTAHKKILMEEKPYKCEECGKVFNQFSTLTRHKIIHTGEKP
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 YKCGECGKAFNQSSALNTHKIIHTGENPHKCRESGKVFHLSSKLSTCKKIHTGEKLYKCE
::: :::::::::: :. :: :::.:. .::.: ::.:. :.: . .::..::: ::::
CCDS55 YKCKECGKAFNQSSNLTEHKKIHTAEKSYKCEECGKAFNQHSNLINHRKIYSGEKPYKCE
360 370 380 390 400 410
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pF1KE3 ECGKAFNRSSTLIGHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLTTHKIIHTEEKQYKCDECGK
:::::::::::: ::.::::::::::::: .::.:::.:: :: ::: :: :::.::::
CCDS55 ECGKAFNRSSTLTRHKKIHTGEKPYKCEECDRAFSQSSNLTEHKKIHTGEKPYKCEECGK
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 AST
:
CCDS55 AFNRFSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFGKAFKQ
480 490 500 510 520 530
>--
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150 160 170 180 190 200
pF1KE3 RAFNWSSTLNKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFNQTSHLIRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFN
::. : : .:::::: ::::::::::::::
CCDS55 RAFSQSSNLTEHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNRFSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFN
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pF1KE3 QSSTLTTHNIIHTGEIPYKCEKCVRAFNQASKLTEHKLIHTGEKRYECEECGKAFNRSSK
:: :: :.:.:: : :::. .::.:.:. : ::.:::::: :.::: ::.::.::.
CCDS55 QSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFGKAFKQSSHRTIHKIIHTGEKPYKCEEHGKVFNQSSN
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pF1KE3 LTEHKYIHTGEKLYKCEECGKAFNQSSTLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQFSNLTDH
:: .: :::::.::: :: ::::: :..:.:: :..::::.::::::::...::::: :
CCDS55 LTTQKIIHTGENLYKFEEHGKAFNLFSNITNHKIIYTGEKPHKCEECGKAYNRFSNLTIH
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pF1KE3 KKIHTGEKPYKCEECGKAFNQLSNLTRHKVIHTGEKPYKCGECGKAFNQSSALNTHKIIH
:.::::::::.: ::::::: :.:.:::.:::::::::: ::::::: ::.:..:: ::
CCDS55 KRIHTGEKPYQCAECGKAFNCSSTLNRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNLSSTLTAHKKIH
630 640 650 660 670 680
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pF1KE3 TGENPHKCRESGKVFHLSSKLSTCKKIHTGEKLYKCEECGKAFNRSSTLIGHKRIHTGEK
:::.:.::.: ::.:. ::.:.: :::::.:: ::::::::.::. :.: :: ::::::
CCDS55 TGEKPYKCEECGKAFNQSSNLTTHKKIHTSEKPYKCEECGKSFNQFSSLNIHKIIHTGEK
690 700 710 720 730 740
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pF1KE3 PYKCEECGKAFNQSSTLTTHKIIHTEEKQYKCDECGKAST
:::: . :.::: ::.::::: ::: :: ::: : ::
CCDS55 PYKCGDYGRAFNLSSNLTTHKKIHTGEKPYKC-EYGKT
750 760 770 780
>>CCDS75606.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 (820 aa)
initn: 2367 init1: 2367 opt: 2367 Z-score: 1498.8 bits: 287.5 E(32554): 3.6e-77
Smith-Waterman score: 2367; 71.5% identity (86.4% similar) in 471 aa overlap (11-481:43-513)
10 20 30 40
pF1KE3 MKRHEMVAKHLVMFYYFAQHLWPEQNIRDSFQKVTLRRYR
::: ..::: :::::::.:::::::::::
CCDS75 FSLEEWQCLDTAQRDLYRNVLLENYRNLVFLVMSFHFAQDLWPEQNIKDSFQKVTLRRYG
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 KCGYENLQLRKGCKSVVECKQHKGDYSGLNQCLKTTLSKIFQCNKYVEVFHKISNSNRHK
:: ::::::::::: : :: ::: .. .:::: .: ::::::::::.:: :.:::::.:
CCDS75 KCEYENLQLRKGCKHVDECTGHKGGHNTVNQCLTATPSKIFQCNKYVKVFDKFSNSNRYK
80 90 100 110 120 130
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pF1KE3 MRHTENKHFKCKECRKTFCMLSHLTQHKRIQTRVNFYKCEAYGRAFNWSSTLNKHKRIHT
::: ::::::::: :.::.::.::::.::.:::: :::: :.:::: :::.:::::::
CCDS75 RRHTGNKHFKCKECSKSFCVLSQLTQHRRIHTRVNSYKCEECGKAFNWFSTLTKHKRIHT
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 GEKPYKCKECGKAFNQTSHLIRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQSSTLTTHNIIHTGEIP
:::::::.::::::::.:.: ::: ::::::: :::::::::.:.: :: :.:::::: :
CCDS75 GEKPYKCEECGKAFNQSSQLTRHKIIHTEEKPNKCEECGKAFKQASHLTIHKIIHTGEKP
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 YKCEKCVRAFNQASKLTEHKLIHTGEKRYECEECGKAFNRSSKLTEHKYIHTGEKLYKCE
:: :.: ..:.:.:.:: .:..::::. :.:.::::::: :.::.:: ::.::: :::.
CCDS75 YKYEECGKVFSQSSHLTTQKILHTGENLYKCKECGKAFNLFSNLTNHKRIHAGEKPYKCK
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 ECGKAFNQSSTLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQFSNLTDHKKIHTGEKPYKCEECGK
:::.::: ::.:. ...::.: : ::::: :::.. .:: :::: :::::::::::
CCDS75 ECGRAFNISSNLNKQEKIHTGGKLNKCEECDKAFNRSLKLTAHKKILMEEKPYKCEECGK
320 330 340 350 360 370
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pF1KE3 AFNQLSNLTRHKVIHTGEKPYKCGECGKAFNQSSALNTHKIIHTGENPHKCRESGKVFHL
.:::.:.:::::.:::::::::: :::::::::: :. :: :::.:. .::.: ::.:.
CCDS75 VFNQFSTLTRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNQSSNLTEHKKIHTAEKSYKCEECGKAFNQ
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410 420 430 440 450 460
pF1KE3 SSKLSTCKKIHTGEKLYKCEECGKAFNRSSTLIGHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTL
:.: . .::..::: :::::::::::::::: ::.::::::::::::: .::.:::.:
CCDS75 HSNLINHRKIYSGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTRHKKIHTGEKPYKCEECDRAFSQSSNL
440 450 460 470 480 490
470 480
pF1KE3 TTHKIIHTEEKQYKCDECGKAST
: :: ::: :: :::.:::::
CCDS75 TEHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNRFSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSYQLTRHK
500 510 520 530 540 550
>--
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::. : : .:::::: ::::::::::::::
CCDS75 RAFSQSSNLTEHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNRFSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFN
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210 220 230 240 250 260
pF1KE3 QSSTLTTHNIIHTGEIPYKCEKCVRAFNQASKLTEHKLIHTGEKRYECEECGKAFNRSSK
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CCDS75 QSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFGKAFKQSSHRTIHKIIHTGEKPYKCEEHGKVFNQSSN
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CCDS75 LTTQKIIHTGENLYKFEEHGKAFNLFSNITNHKIIYTGEKPHKCEECGKAYNRFSNLTIH
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CCDS75 KRIHTGEKPYQCAECGKAFNCSSTLNRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNLSSTLTAHKKIH
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pF1KE3 TGENPHKCRESGKVFHLSSKLSTCKKIHTGEKLYKCEECGKAFNRSSTLIGHKRIHTGEK
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CCDS75 TGEKPYKCEECGKAFNQSSNLTTHKKIHTSEKPYKCEECGKSFNQFSSLNIHKIIHTGEK
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CCDS75 PYKCGDYGRAFNLSSNLTTHKKIHTGEKPYKC-EYGKT
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10 20 30
pF1KE3 MKRHEMVAKHLVMFYYFAQHLWPEQNIRDS
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40 50 60 70 80 90
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100 110 120 130 140 150
pF1KE3 HKISNSNRHKMRHTENKHFKCKECRKTFCMLSHLTQHKRIQTRVNFYKCEAYGRAFNWSS
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CCDS42 HKCSNSNRHKIRHTGEKGLKCKEYVRSFCMLSHLSQHERIYTRENSYKCEENGKAFNWSS
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160 170 180 190 200 210
pF1KE3 TLNKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFNQTSHLIRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQSSTLTT
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CCDS42 TLTYYKSIHTGEKPYKCEECGKAFSKFSILTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSILTK
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220 230 240 250 260 270
pF1KE3 HNIIHTGEIPYKCEKCVRAFNQASKLTEHKLIHTGEKRYECEECGKAFNRSSKLTEHKYI
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CCDS42 HKIIHTGEKPYKCEECGKGFSSVSTLNTHKAIHAEEKPYKCEECGKASNSSSKLMEHKRI
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340 350 360 370 380 390
pF1KE3 KPYKCEECGKAFNQLSNLTRHKVIHTGEKPYKCGECGKAFNQSSALNTHKIIHTGENPHK
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CCDS42 KPYKCEGCGKAFSKVSTLNTHKAIHAEEKPYKCEECGKASNSSSKLMEHKRIHTGEKPYK
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pF1KE3 CRESGKVFHLSSKLSTCKKIHTGEKLYKCEECGKAFNRSSTLIGHKRIHTGEKPYKCEEC
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CCDS42 CEECGKAFSWSSSLTEHKRIHAGEKPYKCEECGKAFTWSSSFTKHKRIHAAEKPYKCEEC
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pF1KE3 GKAFNQSSTLTTHKIIHTEEKQYKCDECGKAST
::.:. : :: :::::: ::.:::.:::::
CCDS42 GKGFSTFSILTKHKIIHTGEKRYKCEECGKAFSWSSILTEHKIIHTGEKPYKCEECGKAF
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CCDS42 SRSSSLTRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFKSSSTVSYHKKIHTGENP
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10 20 30
pF1KE3 MKRHEMVAKHLVMFYYFAQHLWPEQNIRDS
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CCDS32 ENYKNLVFLGVAVSKQDPVTCLEQEKEPWNMKRHEMVDEPPAMCSYFTKDLWPEQDIKDS
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CCDS32 FQQVILRRYGKCEHENLQLRKGSASVDEYKVHKEGYNELNQCLTTTQSKIFPCDKYVKVF
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CCDS32 HKFLNANRHKTRHTGKKPFKCKKCGKSFCMLLHLSQHKRIHIRENSYQCEECGKAFKWFS
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pF1KE3 TLNKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFNQTSHLIRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQSSTLTT
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CCDS32 HKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSTHKFIHAGEKPYKCEECDKAFNRFSYLTKHKII
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]