Result of FASTA (omim) for
pFN21AE3408
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3408, 293 aa
1>>>pF1KE3408 293 - 293 aa - 293 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2993+/-0.000771; mu= 1.8113+/- 0.048
mean_var=387.0298+/-75.735, 0's: 0 Z-trim(112.6): 1876 B-trim: 123 in 1/52
Lambda= 0.065193
statistics sampled from 19447 (21633) to 19447 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.588), E-opt: 0.2 (0.254), width: 16
Scan time: 6.750
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006515 (OMIM: 604080) zinc finger protein 138 i ( 293) 2068 209.1 8.3e-54
NP_001258567 (OMIM: 604080) zinc finger protein 13 ( 287) 2025 205.0 1.4e-52
NP_001258568 (OMIM: 604080) zinc finger protein 13 ( 319) 1787 182.7 7.9e-46
NP_001269289 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 820) 1543 160.4 1.1e-38
NP_001274461 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 ( 554) 1531 159.0 1.9e-38
XP_011514048 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 537) 1463 152.6 1.6e-36
NP_001287880 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 (1159) 1369 144.3 1.1e-33
NP_001269288 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 852) 1311 138.6 4e-32
NP_001243100 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 ( 625) 1308 138.1 4.1e-32
XP_011526565 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 640) 1308 138.1 4.2e-32
XP_016882723 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 518) 1300 137.2 6.3e-32
NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 is ( 595) 1301 137.4 6.3e-32
NP_001243102 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 ( 531) 1300 137.3 6.4e-32
XP_011526566 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 536) 1300 137.3 6.4e-32
XP_016867772 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 1293 136.9 1.2e-31
XP_016867775 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 1293 136.9 1.2e-31
XP_016867774 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 1293 136.9 1.2e-31
NP_001013768 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 783) 1293 136.9 1.2e-31
XP_016867773 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 1293 136.9 1.2e-31
NP_057304 (OMIM: 603989) zinc finger protein 107 i ( 783) 1293 136.9 1.2e-31
NP_689839 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 is ( 586) 1287 136.1 1.6e-31
NP_001274462 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 ( 510) 1268 134.2 5e-31
NP_001274463 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 ( 510) 1268 134.2 5e-31
NP_009070 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 is ( 517) 1268 134.2 5e-31
NP_056936 (OMIM: 194624) zinc finger protein 117 [ ( 483) 1260 133.4 8.2e-31
XP_016881605 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1260 133.5 8.4e-31
NP_001152765 (OMIM: 603984) zinc finger protein 73 ( 536) 1260 133.5 8.7e-31
XP_011525901 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 1260 133.5 8.8e-31
XP_006722660 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 1260 133.5 8.8e-31
XP_011525900 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 1260 133.5 8.8e-31
XP_005259754 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 1260 133.5 8.8e-31
XP_016881606 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 486) 1251 132.6 1.5e-30
NP_775802 (OMIM: 603982) zinc finger protein 100 [ ( 542) 1242 131.8 2.8e-30
NP_001258578 (OMIM: 604080) zinc finger protein 13 ( 172) 1231 130.0 3.1e-30
XP_016867178 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1223 130.0 9.4e-30
XP_016867181 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1223 130.0 9.4e-30
XP_016867186 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1223 130.0 9.4e-30
XP_016867187 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1223 130.0 9.4e-30
XP_016867182 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1223 130.0 9.4e-30
XP_016867183 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1223 130.0 9.4e-30
XP_016867184 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1223 130.0 9.4e-30
XP_016867180 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1223 130.0 9.4e-30
XP_016867185 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1223 130.0 9.4e-30
XP_016867179 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1223 130.0 9.4e-30
XP_016867177 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 569) 1223 130.1 1e-29
NP_066971 (OMIM: 604756) zinc finger protein 273 [ ( 569) 1223 130.1 1e-29
NP_112495 (OMIM: 603975) zinc finger protein 93 [H ( 620) 1219 129.7 1.4e-29
XP_011526007 (OMIM: 603980) PREDICTED: zinc finger ( 531) 1199 127.8 4.6e-29
NP_001092096 (OMIM: 603980) zinc finger protein 98 ( 572) 1199 127.8 4.8e-29
NP_001303925 (OMIM: 606957) zinc finger protein 25 ( 531) 1196 127.5 5.6e-29
>>NP_006515 (OMIM: 604080) zinc finger protein 138 isofo (293 aa)
initn: 2068 init1: 2068 opt: 2068 Z-score: 1087.0 bits: 209.1 E(85289): 8.3e-54
Smith-Waterman score: 2068; 100.0% identity (100.0% similar) in 293 aa overlap (1-293:1-293)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGPLTFMDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNVYRHVMLENYRNLVFLALCSRFAQDLWLEQNIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MGPLTFMDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNVYRHVMLENYRNLVFLALCSRFAQDLWLEQNIK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 DSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 VMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 VMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 STNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 STNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE3 TRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 TRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
250 260 270 280 290
>>NP_001258567 (OMIM: 604080) zinc finger protein 138 is (287 aa)
initn: 2025 init1: 2025 opt: 2025 Z-score: 1065.2 bits: 205.0 E(85289): 1.4e-52
Smith-Waterman score: 2025; 100.0% identity (100.0% similar) in 287 aa overlap (7-293:1-287)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGPLTFMDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNVYRHVMLENYRNLVFLALCSRFAQDLWLEQNIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNVYRHVMLENYRNLVFLALCSRFAQDLWLEQNIK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 VMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNW
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 STNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 STNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE3 TRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
240 250 260 270 280
>>NP_001258568 (OMIM: 604080) zinc finger protein 138 is (319 aa)
initn: 1775 init1: 1775 opt: 1787 Z-score: 943.8 bits: 182.7 E(85289): 7.9e-46
Smith-Waterman score: 2006; 91.8% identity (91.8% similar) in 319 aa overlap (1-293:1-319)
10 20 30 40
pF1KE3 MGPLTFMDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNVYRHVMLENYRNLVFL-----------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MGPLTFMDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNVYRHVMLENYRNLVFLDLITCLEQGKEPWNMKR
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KE3 ---------ALCSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HEMVVAKHSALCSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGH
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 QGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLS
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 RLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTK
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 HKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQII
250 260 270 280 290 300
280 290
pF1KE3 YTGEEPYKCEECGKAFNLS
:::::::::::::::::::
NP_001 YTGEEPYKCEECGKAFNLS
310
>>NP_001269289 (OMIM: 603989) zinc finger protein 107 is (820 aa)
initn: 5115 init1: 1543 opt: 1543 Z-score: 815.8 bits: 160.4 E(85289): 1.1e-38
Smith-Waterman score: 1543; 75.3% identity (88.7% similar) in 292 aa overlap (1-292:1-292)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGPLTFMDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNVYRHVMLENYRNLVFLALCSRFAQDLWLEQNIK
: :::: :::::::::::::::::::..::.:.::::::::::.. .:::::: :::::
NP_001 MEPLTFKDVAIEFSLEEWQCLDTAQRDLYRNVLLENYRNLVFLVMSFHFAQDLWPEQNIK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVK
:::::::: :::: ..::::::::: :::: ::.::.: .:::: : :::::::::::
NP_001 DSFQKVTLRRYGKCEYENLQLRKGCKHVDECTGHKGGHNTVNQCLTATPSKIFQCNKYVK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 VMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNW
:. :::::::.: ::: ::::.::::.::.:.::.::::..:::: : ::::::::.:::
NP_001 VFDKFSNSNRYKRRHTGNKHFKCKECSKSFCVLSQLTQHRRIHTRVNSYKCEECGKAFNW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 STNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHL
..:.: :.::::::::::: :::::.::: ::.::::.: ::: :: .:::::::.:::
NP_001 FSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSQLTRHKIIHTEEKPNKCEECGKAFKQASHL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE3 TRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
: :::::: ::::: :.:::::.:: :: ..:..:::. :::.::::::::
NP_001 TIHKIIHTGEKPYKYEECGKVFSQSSHLTTQKILHTGENLYKCKECGKAFNLFSNLTNHK
250 260 270 280 290 300
NP_001 RIHAGEKPYKCKECGRAFNISSNLNKQEKIHTGGKLNKCEECDKAFNRSLKLTAHKKILM
310 320 330 340 350 360
>--
initn: 3600 init1: 809 opt: 829 Z-score: 452.9 bits: 93.2 E(85289): 1.7e-18
Smith-Waterman score: 829; 55.1% identity (79.1% similar) in 225 aa overlap (76-293:325-545)
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 CSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCL
.:. ... : : ...:. . ..: . :
NP_001 NLTNHKRIHAGEKPYKCKECGRAFNISSNLNKQEKIHTGGK-LNKCEECDKAFN---RSL
300 310 320 330 340 350
110 120 130 140 150
pF1KE3 KITTSKI-------FQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQ
:.:. : ..:.. ::...::. .:::: :: .: ..:::: :.. . : ::.
NP_001 KLTAHKKILMEEKPYKCEECGKVFNQFSTLTRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNQSSNLTE
360 370 380 390 400 410
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 HKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKII
:::::: :. ::::::::.:: .:: . .::..:::::::: :::::..:: ::.:: :
NP_001 HKKIHTAEKSYKCEECGKAFNQHSNLINHRKIYSGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTRHKKI
420 430 440 450 460 470
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 RTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGE
.:::::::: .: .::.:::.::.:: ::: :::::::.:::.:.. :::::. :.:::
NP_001 HTGEKPYKCEECDRAFSQSSNLTEHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNRFSTLTKHKRIHTGE
480 490 500 510 520 530
280 290
pF1KE3 EPYKCEECGKAFNLS
.:::::::::::: :
NP_001 KPYKCEECGKAFNQSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFGKAFKQSSHRTIHKIIHTGEKPYK
540 550 560 570 580 590
>--
initn: 1618 init1: 745 opt: 754 Z-score: 414.7 bits: 86.2 E(85289): 2.3e-16
Smith-Waterman score: 754; 51.3% identity (74.1% similar) in 232 aa overlap (71-293:570-797)
50 60 70 80 90
pF1KE3 VFLALCSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQ--LRKGCKSVDECKGHQGGY
. . .:.... .. : : .:. : :
NP_001 KAFNQSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFGKAFKQSSHRTIHKIIHTGEKPY-KCEEH-GKV
540 550 560 570 580 590
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 NGLNQCLKITTSKI-------FQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLC
.:: ..::.:: .. ... :... ::: . ::: .: .: .:.:: :.
NP_001 --FNQSSNLTTQKIIHTGENLYKFEEHGKAFNLFSNITNHKIIYTGEKPHKCEECGKAYN
600 610 620 630 640 650
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 MLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSI
.: :: ::.::: :. :.: ::::.:: :..:.. : ::::::::::. :::::. ::
NP_001 RFSNLTIHKRIHTGEKPYQCAECGKAFNCSSTLNRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNLSST
660 670 680 690 700 710
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 LTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKH
:: :: :.:::::::: .:::::.:::.:: :: ::: :::::::.::: :.: .:. :
NP_001 LTAHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLTTHKKIHTSEKPYKCEECGKSFNQFSSLNIH
720 730 740 750 760 770
280 290
pF1KE3 QIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
.::.:::.:::: . :.:::::
NP_001 KIIHTGEKPYKCGDYGRAFNLSSNLTTHKKIHTGEKPYKCEYGKT
780 790 800 810 820
>>NP_001274461 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 iso (554 aa)
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Smith-Waterman score: 1531; 75.2% identity (87.9% similar) in 290 aa overlap (1-290:1-290)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGPLTFMDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNVYRHVMLENYRNLVFLALCSRFAQDLWLEQNIK
:::::: :: :::::::::::::::::.:: ::::::::::::..::.::::.: :..::
NP_001 MGPLTFRDVKIEFSLEEWQCLDTAQRNLYRDVMLENYRNLVFLVMCSHFAQDVWPEHSIK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVK
:::::: : ::::::.:::::: :::: :: ..:::::::::: : ::::::.::::
NP_001 DSFQKVILRTYGKYGHENLQLRKDHKSVDACKVYKGGYNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 VMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNW
:.::: : ::.::::: .: :.::. ::.::::.::::::::::: ::::::::.:::
NP_001 VFHKFPNVNRNKIRHTGKKPFKCKNRGKSFCMLSQLTQHKKIHTREYSYKCEECGKAFNW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 STNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHL
:..:.: : ::::::::::: :::::..:: :::::::.:::::::: .:::::..:: :
NP_001 SSTLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE3 TRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
:.:: :::::::::::.:::.:.: :.::. :. ..:::::::::::
NP_001 TKHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQFSILNKHKRIHMEDKPYKCEECGKAFRVFSILKKHK
250 260 270 280 290 300
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310 320 330 340 350 360
>--
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Smith-Waterman score: 788; 65.7% identity (84.6% similar) in 169 aa overlap (125-293:293-461)
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pF1KE3 QGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLS
:: ..::: :: .: ..:.:: :.. ..:
NP_001 NQFSILNKHKRIHMEDKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQFS
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pF1KE3 RLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTK
::.:: ::: :. :::.::::.:: :..:.: :.::::::::::: :::::.::: ::.
NP_001 NLTKHKIIHTGEKPYKCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTE
330 340 350 360 370 380
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pF1KE3 HKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQII
::::.:::::::: .:::::. :: .:.:: : :.::::::.:::.:. :::::.::
NP_001 HKIIHTGEKPYKCEKCGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPYKCEECGKAFSVFSTLTKHKII
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280 290
pF1KE3 YTGEEPYKCEECGKAFNLS
.: :.:::::::::::: :
NP_001 HTREKPYKCEECGKAFNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGNAFNQSSNLTARKIIYTGE
450 460 470 480 490 500
>--
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pF1KE3 WSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSH
::.::::::.: : ::: .::.::.:::.
NP_001 VFSTLTKHKIIHTREKPYKCEECGKAFNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGNAFNQSSN
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pF1KE3 LTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
:: .:::.: ::::: :.: :.:.. :: ::::::::.: : .:::.::: :
NP_001 LTARKIIYTGEKPYKYEECDKAFNKFSTLITHQIIYTGEKPCK-HECGRAFNKSSNYTKE
500 510 520 530 540 550
NP_001 KLQT
>>XP_011514048 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger pro (537 aa)
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10 20 30
pF1KE3 MGPLTFMDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNVYR
:::::: ::::::::::::::::.:.:.::
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40 50 60 70 80 90
pF1KE3 HVMLENYRNLVFLALCSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDE
.:::.::::::::..::.:::::: .:..::::::: : :::::::.::::::::::.::
XP_011 NVMLDNYRNLVFLVVCSHFAQDLWPKQGLKDSFQKVILRRYGKYGHENLQLRKGCKSADE
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100 110 120 130 140 150
pF1KE3 CKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSL
: :. ::::::::: : ::::::.:::::.::::::: :: :.: .: :.:::: ::
XP_011 HKVHKRGYNGLNQCLTTTQSKIFQCDKYVKVLHKFSNSNIHKKRQTGKKPFKCKECGKSC
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160 170 180 190 200 210
pF1KE3 CMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSS
:.::.:::::: :: :::::. :::.:: .::.: : :: .::::: :::::.::
XP_011 CILSQLTQHKKTATRVNFYKCKTCGKAFNQFSNLTKHKIIHPEVNPYKCEECGKAFNQSL
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pF1KE3 ILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTK
::::: :.: :::::: :::.:. : ::.:::::: :::.::.::: :. ::::
XP_011 TLTKHKKIHTEEKPYKCEDCGKVFSVFSVLTKHKIIHTGTKPYNCEECGKGFSIFSTLTK
250 260 270 280 290 300
280 290
pF1KE3 HQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
:.::.:::.::::.::::::: :
XP_011 HKIIHTGEKPYKCNECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLTRHKIV
310 320 330 340 350 360
>--
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Smith-Waterman score: 730; 62.5% identity (81.5% similar) in 168 aa overlap (126-293:327-494)
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 GGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSR
:. ..:: :: .: ..:.:: :.. . :
XP_011 IFSTLTKHKIIHTGEKPYKCNECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSST
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pF1KE3 LTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKH
::.:: .:: :. ::::::::.:. ::.:.: :.:.: ::::::: ::::: : ::::
XP_011 LTRHKIVHTGEKPYKCEECGKAFKRSTTLTKHKRIYTKEKPYKCEECGKAFSVFSTLTKH
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pF1KE3 KIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIY
:::.:: ::::: .::.::. : ::.:: .:: ::::::..:::.:. : :::::. :.
XP_011 KIIHTGAKPYKCEECGSAFRAFSTLTEHKRVHTGEKPYKCNECGKAFNWSSTLTKHKRIH
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280 290
pF1KE3 TGEEPYKCEECGKAFNLS
:::.:::::::::::: :
XP_011 TGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTRHKKIHTGEKPYKPKRCDSAFDNTPNFSRHKRNHMGEK
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>>NP_001287880 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 iso (1159 aa)
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Smith-Waterman score: 1369; 66.9% identity (83.6% similar) in 293 aa overlap (1-293:10-302)
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pF1KE3 MGPLTFMDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNVYRHVMLENYRNLVFLALCSRFAQ
:: ::: ::::::: ::::::::::.:.::.:::::::::.::..: .: :
NP_001 MPGTPGSLEMGLLTFRDVAIEFSPEEWQCLDTAQQNLYRNVMLENYRNLAFLGICPHFPQ
10 20 30 40 50 60
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pF1KE3 DLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSK
:.: ::...:::::: : .: : ::.::::::::::::::: :. ::: ::::: . ::
NP_001 DFWPEQSMEDSFQKVLLRKYEKCGHENLQLRKGCKSVDECKVHKEGYNKLNQCLTTAQSK
70 80 90 100 110 120
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pF1KE3 IFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKC
.:::.::.::..:: ::::: :::: .: :.::.: ::.:. . :::: .. :. ::
NP_001 VFQCGKYLKVFYKFLNSNRHTIRHTGKKCFKCKKCVKSFCIRLHKTQHKCVYITEKSCKC
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pF1KE3 EECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCG
.:: :::.::..:.. :.::: .:::::: :::::.: : :: :::: . :: ::: .::
NP_001 KECEKTFHWSSTLTNHKEIHTEDKPYKCEECGKAFKQLSTLTTHKIICAKEKIYKCEECG
190 200 210 220 230 240
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pF1KE3 KAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFN
::: :: ::::: ::: :::::::.:::.:..: ::.::. :.:::.:::::::::::.
NP_001 KAFLWSSTLTRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSHSSTLAKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFS
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 LS
:
NP_001 RSSTLAKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFSNSSTLANHKITHTEEKPYKCKECDKAFKRLST
310 320 330 340 350 360
>--
initn: 6083 init1: 806 opt: 833 Z-score: 453.4 bits: 93.9 E(85289): 1.6e-18
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pF1KE3 LRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKH
:...:.. :.... :: . ::: ::..:
NP_001 GEKPYKCKECGKAFKHSSALAKHKIIHAGEKLYKCEECGKAFNQSSNLTTHKIIHTKEKP
790 800 810 820 830 840
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pF1KE3 FRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCE
. .::::.. : ::.::.:::::. ::::::::.:. ..:. :..::::::::::
NP_001 SKSEECDKAFIWSSTLTEHKRIHTREKTYKCEECGKAFSQPSHLTTHKRMHTGEKPYKCE
850 860 870 880 890 900
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 VCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGK
::::: ::: :: ::::.:::::::: .:::::..:: ::.:::::: :::::::.:::
NP_001 ECGKAFSQSSTLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFRKSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEECGK
910 920 930 940 950 960
270 280 290
pF1KE3 VFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
.:.:: :::.: ..:::.:::::::::::: :
NP_001 AFSQSSTLTRHTRMHTGEKPYKCEECGKAFNRSSKLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFIS
970 980 990 1000 1010 1020
NP_001 SSTLNGHKRIHTREKPYKCEECGKAFSQSSTLTRHKRLHTGEKPYKCGECGKAFKESSAL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
>--
initn: 4428 init1: 789 opt: 820 Z-score: 446.8 bits: 92.6 E(85289): 3.8e-18
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pF1KE3 CSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCL
:: .. . . .:: . ..: .
NP_001 STHKIIHTGEKSYKCEECGKAFLWSSTLRRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSHSSALAKHK
560 570 580 590 600 610
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pF1KE3 KITTS-KIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHT
.: :. : ..:.. :.. . :. ::: :::.: ..::::::.. :: ::.:: ::.
NP_001 RIHTGEKPYKCKECGKAFSNSSTLANHKITHTEEKPYKCKECDKTFKRLSTLTKHKIIHA
620 630 640 650 660 670
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 RENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKP
:..::::::::.:: :.::. : ::::::::::: :::::. :: ::::: :.: :::
NP_001 GEKLYKCEECGKAFNRSSNLTIHKFIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSSLTKHKRIHTREKP
680 690 700 710 720 730
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pF1KE3 YKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCE
.:: .::::: :: ::::: ::: :::::::.:::.:..: :::::. :.:::.::::.
NP_001 FKCKECGKAFIWSSTLTRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSRSSTLTKHKTIHTGEKPYKCK
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290
pF1KE3 ECGKAFNLS
::::::. :
NP_001 ECGKAFKHSSALAKHKIIHAGEKLYKCEECGKAFNQSSNLTTHKIIHTKEKPSKSEECDK
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>--
initn: 2827 init1: 788 opt: 808 Z-score: 440.7 bits: 91.5 E(85289): 8.3e-18
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pF1KE3 NLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTE
: : ..:.. :.. . :. ::: :::
NP_001 IHTGEKPYKCEECGKAFSRSSTLAKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFSNSSTLANHKITHTE
290 300 310 320 330 340
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pF1KE3 NKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPY
.: ..::::::.. :: ::.:: ::. :..::::::::.:: :.::. : ::::::::
NP_001 EKPYKCKECDKAFKRLSTLTKHKIIHAGEKLYKCEECGKAFNRSSNLTIHKFIHTGEKPY
350 360 370 380 390 400
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pF1KE3 KCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQ
::: :::::. :: ::::: ..: :::.:: .::::: :: ::::: ::: :::::::.
NP_001 KCEECGKAFNWSSSLTKHKRFHTREKPFKCKECGKAFIWSSTLTRHKRIHTGEKPYKCEE
410 420 430 440 450 460
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pF1KE3 CGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
:::.:.:: :::::.::.:::.::: ::::::: :
NP_001 CGKAFRQSSTLTKHKIIHTGEKPYKFEECGKAFRQSLTLNKHKIIHSREKPYKCKECGKA
470 480 490 500 510 520
NP_001 FKQFSTLTTHKIIHAGKKLYKCEECGKAFNHSSSLSTHKIIHTGEKSYKCEECGKAFLWS
530 540 550 560 570 580
>--
initn: 579 init1: 579 opt: 587 Z-score: 328.4 bits: 70.7 E(85289): 1.5e-11
Smith-Waterman score: 587; 69.1% identity (85.4% similar) in 123 aa overlap (154-276:1003-1125)
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 KFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTN
:.:: :: ::: :. ::::::::.: :..
NP_001 QSSTLTRHTRMHTGEKPYKCEECGKAFNRSSKLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFISSST
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pF1KE3 LSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRH
:. :.::: ::::::: ::::: ::: ::.:: ..::::::::..::::::.:: ::.:
NP_001 LNGHKRIHTREKPYKCEECGKAFSQSSTLTRHKRLHTGEKPYKCGECGKAFKESSALTKH
1040 1050 1060 1070 1080 1090
250 260 270 280 290
pF1KE3 KIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
::::: :::::::.:::.:.:: ::.:. :.:
NP_001 KIIHTGEKPYKCEKCGKAFNQSSILTNHKKIHTITPVIPLLWEAEAGGSRGQEMETILAN
1100 1110 1120 1130 1140 1150
NP_001 TVKPLLY
>--
initn: 886 init1: 387 opt: 387 Z-score: 226.7 bits: 51.9 E(85289): 6.9e-06
Smith-Waterman score: 387; 68.4% identity (87.3% similar) in 79 aa overlap (212-290:501-579)
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pF1KE3 TNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLT
:.:::::.. :::::: .::::::: : ::
NP_001 STLTKHKIIHTGEKPYKFEECGKAFRQSLTLNKHKIIHSREKPYKCKECGKAFKQFSTLT
480 490 500 510 520 530
250 260 270 280 290
pF1KE3 RHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
:::::. .: ::::.:::.:..: .:. :.::.:::. ::::::::::
NP_001 THKIIHAGKKLYKCEECGKAFNHSSSLSTHKIIHTGEKSYKCEECGKAFLWSSTLRRHKR
540 550 560 570 580 590
NP_001 IHTGEKPYKCEECGKAFSHSSALAKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFSNSSTLANHKITHTE
600 610 620 630 640 650
>>NP_001269288 (OMIM: 603989) zinc finger protein 107 is (852 aa)
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Smith-Waterman score: 1472; 68.2% identity (80.2% similar) in 324 aa overlap (1-292:1-324)
10 20 30 40
pF1KE3 MGPLTFMDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNVYRHVMLENYRNLVFLAL---------CSR---
: :::: :::::::::::::::::::..::.:.::::::::::.. : .
NP_001 MEPLTFKDVAIEFSLEEWQCLDTAQRDLYRNVLLENYRNLVFLGIAVSKPYLITCLEQKK
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80
pF1KE3 --------------------FAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSV
:::::: ::::::::::::: :::: ..::::::::: :
NP_001 EPWNIKRHEMVAKPPVMSFHFAQDLWPEQNIKDSFQKVTLRRYGKCEYENLQLRKGCKHV
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KE3 DECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDK
::: ::.::.: .:::: : ::::::::::::. :::::::.: ::: ::::.::::.:
NP_001 DECTGHKGGHNTVNQCLTATPSKIFQCNKYVKVFDKFSNSNRYKRRHTGNKHFKCKECSK
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 SLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQ
:.:.::.::::..:::: : ::::::::.::: ..:.: :.::::::::::: :::::.:
NP_001 SFCVLSQLTQHRRIHTRVNSYKCEECGKAFNWFSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQ
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 SSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTL
:: ::.::::.: ::: :: .:::::::.:::: :::::: ::::: :.:::::.:: :
NP_001 SSQLTRHKIIHTEEKPNKCEECGKAFKQASHLTIHKIIHTGEKPYKYEECGKVFSQSSHL
250 260 270 280 290 300
270 280 290
pF1KE3 TKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
: ..:..:::. :::.::::::::
NP_001 TTQKILHTGENLYKCKECGKAFNLFSNLTNHKRIHAGEKPYKCKECGRAFNISSNLNKQE
310 320 330 340 350 360
>--
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50 60 70 80 90 100
pF1KE3 CSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCL
.:. ... : : ...:. . ..: . :
NP_001 NLTNHKRIHAGEKPYKCKECGRAFNISSNLNKQEKIHTGGK-LNKCEECDKAFN---RSL
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:.:. : ..:.. ::...::. .:::: :: .: ..:::: :.. . : ::.
NP_001 KLTAHKKILMEEKPYKCEECGKVFNQFSTLTRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNQSSNLTE
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pF1KE3 HKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKII
:::::: :. ::::::::.:: .:: . .::..:::::::: :::::..:: ::.:: :
NP_001 HKKIHTAEKSYKCEECGKAFNQHSNLINHRKIYSGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTRHKKI
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pF1KE3 RTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGE
.:::::::: .: .::.:::.::.:: ::: :::::::.:::.:.. :::::. :.:::
NP_001 HTGEKPYKCEECDRAFSQSSNLTEHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNRFSTLTKHKRIHTGE
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280 290
pF1KE3 EPYKCEECGKAFNLS
.:::::::::::: :
NP_001 KPYKCEECGKAFNQSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFGKAFKQSSHRTIHKIIHTGEKPYK
570 580 590 600 610 620
>--
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Smith-Waterman score: 754; 51.3% identity (74.1% similar) in 232 aa overlap (71-293:602-829)
50 60 70 80 90
pF1KE3 VFLALCSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQ--LRKGCKSVDECKGHQGGY
. . .:.... .. : : .:. : :
NP_001 KAFNQSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFGKAFKQSSHRTIHKIIHTGEKPY-KCEEH-GKV
580 590 600 610 620
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pF1KE3 NGLNQCLKITTSKI-------FQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLC
.:: ..::.:: .. ... :... ::: . ::: .: .: .:.:: :.
NP_001 --FNQSSNLTTQKIIHTGENLYKFEEHGKAFNLFSNITNHKIIYTGEKPHKCEECGKAYN
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160 170 180 190 200 210
pF1KE3 MLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSI
.: :: ::.::: :. :.: ::::.:: :..:.. : ::::::::::. :::::. ::
NP_001 RFSNLTIHKRIHTGEKPYQCAECGKAFNCSSTLNRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNLSST
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pF1KE3 LTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKH
:: :: :.:::::::: .:::::.:::.:: :: ::: :::::::.::: :.: .:. :
NP_001 LTAHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLTTHKKIHTSEKPYKCEECGKSFNQFSSLNIH
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280 290
pF1KE3 QIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
.::.:::.:::: . :.:::::
NP_001 KIIHTGEKPYKCGDYGRAFNLSSNLTTHKKIHTGEKPYKCEYGKT
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>>NP_001243100 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 iso (625 aa)
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Smith-Waterman score: 1308; 69.0% identity (85.1% similar) in 268 aa overlap (26-293:89-356)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MGPLTFMDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNVYRHVMLENYRNLVFLALCSRFAQDLWL
:.:: ..:.. .::.::::::
NP_001 GKEAWSMKRHEIMVAKPTGCLSKRMSYELLRKVYILMLLRSVLYASVRIMCSHFAQDLWP
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60 70 80 90 100 110
pF1KE3 EQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQC
:::::::::::::.:::: :.:: :::::.:.:::: :.:: ::::::: : ::::::
NP_001 EQNIKDSFQKVTLKRYGKCRHENLPLRKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQC
120 130 140 150 160 170
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 NKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECG
.::::: :::::::::.::::..: :.: .: ::. :.: ::.:..:::: :::::::::
NP_001 DKYVKVAHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKCGKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECG
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180 190 200 210 220 230
pF1KE3 KTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFK
:.::::..:.: :.::::::::::: :::::.::: : ::: :.:::::::: .:::.:.
NP_001 KAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFN
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240 250 260 270 280 290
pF1KE3 QSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
. : :: :::::: ::::::..:::.:..: ::: :. :.:::.:::::::::::. :
NP_001 RFSTLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSN
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>--
initn: 3869 init1: 770 opt: 796 Z-score: 437.2 bits: 90.0 E(85289): 1.3e-17
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pF1KE3 NLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTE
: : ..:.. :.... :. ..::: ::
NP_001 IHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTG
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pF1KE3 NKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPY
.: ..::::.:.. . :.::.:::::: :. :.::.:::.:: :.::.. :: :: ::::
NP_001 EKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPY
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pF1KE3 KCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQ
::: :::.:. : :: ::::.:::::::: .:::::.:::.::.:: ::: :::: ::.
NP_001 KCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEE
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pF1KE3 CGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
:::.:.:: .::::. :.:::.::::::: :::. :
NP_001 CGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
580 590 600 610 620
>--
initn: 329 init1: 329 opt: 329 Z-score: 199.9 bits: 46.0 E(85289): 0.00022
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pF1KE3 MLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSI
.::. : ::::::::::. :::::.::.
NP_001 RSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAH
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:: :..:.:::::::: .:::::.. :::: :::::
NP_001 LTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKH
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pF1KE3 QIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
NP_001 KIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSH
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>>XP_011526565 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger pro (640 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE3 MGPLTFMDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNVYRHVMLENYRNLVFLALCSRFAQDLWL
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XP_011 KPTVSHYVAQADLQLLVSSCLSKRMSYELLRKVYILMLLRSVLYASVRIMCSHFAQDLWP
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:::::::::::::.:::: :.:: :::::.:.:::: :.:: ::::::: : ::::::
XP_011 EQNIKDSFQKVTLKRYGKCRHENLPLRKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQC
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.::::: :::::::::.::::..: :.: .: ::. :.: ::.:..:::: :::::::::
XP_011 DKYVKVAHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKCGKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECG
200 210 220 230 240 250
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pF1KE3 KTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFK
:.::::..:.: :.::::::::::: :::::.::: : ::: :.:::::::: .:::.:.
XP_011 KAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFN
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pF1KE3 QSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
. : :: :::::: ::::::..:::.:..: ::: :. :.:::.:::::::::::. :
XP_011 RFSTLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSN
320 330 340 350 360 370
XP_011 LTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTH
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>--
initn: 3869 init1: 770 opt: 796 Z-score: 437.1 bits: 90.0 E(85289): 1.3e-17
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80 90 100 110 120 130
pF1KE3 NLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTE
: : ..:.. :.... :. ..::: ::
XP_011 IHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTG
410 420 430 440 450 460
140 150 160 170 180 190
pF1KE3 NKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPY
.: ..::::.:.. . :.::.:::::: :. :.::.:::.:: :.::.. :: :: ::::
XP_011 EKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPY
470 480 490 500 510 520
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pF1KE3 KCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQ
::: :::.:. : :: ::::.:::::::: .:::::.:::.::.:: ::: :::: ::.
XP_011 KCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEE
530 540 550 560 570 580
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pF1KE3 CGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
:::.:.:: .::::. :.:::.::::::: :::. :
XP_011 CGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
590 600 610 620 630 640
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initn: 329 init1: 329 opt: 329 Z-score: 199.8 bits: 46.1 E(85289): 0.00022
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160 170 180 190 200 210
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.::. : ::::::::::. :::::.::.
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:: :..:.:::::::: .:::::.. :::: :::::
XP_011 LTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKH
410 420 430 440 450 460
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pF1KE3 QIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
XP_011 KIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSH
470 480 490 500 510 520
293 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]