Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3371
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3371, 1102 aa
1>>>pF1KE3371 1102 - 1102 aa - 1102 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1435+/-0.0011; mu= 16.9484+/- 0.065
mean_var=67.7301+/-13.744, 0's: 0 Z-trim(102.8): 28 B-trim: 446 in 2/49
Lambda= 0.155842
statistics sampled from 7103 (7124) to 7103 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.571), E-opt: 0.2 (0.219), width: 16
Scan time: 2.630
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5739.1 PIK3CG gene_id:5294|Hs108|chr7 (1102) 7421 1678.2 0
CCDS43171.1 PIK3CA gene_id:5290|Hs108|chr3 (1068) 1823 419.6 1.8e-116
CCDS3104.1 PIK3CB gene_id:5291|Hs108|chr3 (1070) 1685 388.6 4e-107
CCDS104.1 PIK3CD gene_id:5293|Hs108|chr1 (1044) 1339 310.8 1e-83
CCDS7824.1 PIK3C2A gene_id:5286|Hs108|chr11 (1686) 923 217.3 2.3e-55
CCDS1446.1 PIK3C2B gene_id:5287|Hs108|chr1 (1634) 900 212.1 8.2e-54
CCDS44839.1 PIK3C2G gene_id:5288|Hs108|chr12 (1445) 852 201.3 1.3e-50
CCDS73452.1 PIK3C2G gene_id:5288|Hs108|chr12 (1486) 852 201.3 1.3e-50
CCDS77180.1 PIK3C3 gene_id:5289|Hs108|chr18 ( 824) 576 139.2 3.6e-32
CCDS11920.1 PIK3C3 gene_id:5289|Hs108|chr18 ( 887) 576 139.2 3.9e-32
CCDS55637.1 PI4KB gene_id:5298|Hs108|chr1 ( 484) 428 105.9 2.2e-22
CCDS55638.1 PI4KB gene_id:5298|Hs108|chr1 ( 801) 428 106.0 3.6e-22
CCDS81376.1 PI4KB gene_id:5298|Hs108|chr1 ( 816) 428 106.0 3.7e-22
CCDS993.1 PI4KB gene_id:5298|Hs108|chr1 ( 828) 428 106.0 3.8e-22
CCDS33603.2 PI4KA gene_id:5297|Hs108|chr22 (2102) 304 78.1 2.3e-13
>>CCDS5739.1 PIK3CG gene_id:5294|Hs108|chr7 (1102 aa)
initn: 7421 init1: 7421 opt: 7421 Z-score: 9006.2 bits: 1678.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7421; 100.0% identity (100.0% similar) in 1102 aa overlap (1-1102:1-1102)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MELENYKQPVVLREDNCRRRRRMKPRSAAASLSSMELIPIEFVLPTSQRKCKSPETALLH
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CCDS57 MELENYKQPVVLREDNCRRRRRMKPRSAAASLSSMELIPIEFVLPTSQRKCKSPETALLH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 VAGHGNVEQMKAQVWLRALETSVAADFYHRLGPHHFLLLYQKKGQWYEIYDKYQVVQTLD
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CCDS57 VAGHGNVEQMKAQVWLRALETSVAADFYHRLGPHHFLLLYQKKGQWYEIYDKYQVVQTLD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 CLRYWKATHRSPGQIHLVQRHPPSEESQAFQRQLTALIGYDVTDVSNVHDDELEFTRRGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 CLRYWKATHRSPGQIHLVQRHPPSEESQAFQRQLTALIGYDVTDVSNVHDDELEFTRRGL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 VTPRMAEVASRDPKLYAMHPWVTSKPLPEYLWKKIANNCIFIVIHRSTTSQTIKVSPDDT
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CCDS57 VTPRMAEVASRDPKLYAMHPWVTSKPLPEYLWKKIANNCIFIVIHRSTTSQTIKVSPDDT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 PGAILQSFFTKMAKKKSLMDIPESQSEQDFVLRVCGRDEYLVGETPIKNFQWVRHCLKNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 PGAILQSFFTKMAKKKSLMDIPESQSEQDFVLRVCGRDEYLVGETPIKNFQWVRHCLKNG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 EEIHVVLDTPPDPALDEVRKEEWPLVDDCTGVTGYHEQLTIHGKDHESVFTVSLWDCDRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 EEIHVVLDTPPDPALDEVRKEEWPLVDDCTGVTGYHEQLTIHGKDHESVFTVSLWDCDRK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 FRVKIRGIDIPVLPRNTDLTVFVEANIQHGQQVLCQRRTSPKPFTEEVLWNVWLEFSIKI
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CCDS57 FRVKIRGIDIPVLPRNTDLTVFVEANIQHGQQVLCQRRTSPKPFTEEVLWNVWLEFSIKI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 KDLPKGALLNLQIYCGKAPALSSKASAESPSSESKGKVQLLYYVNLLLIDHRFLLRRGEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 KDLPKGALLNLQIYCGKAPALSSKASAESPSSESKGKVQLLYYVNLLLIDHRFLLRRGEY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 VLHMWQISGKGEDQGSFNADKLTSATNPDKENSMSISILLDNYCHPIALPKHQPTPDPEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 VLHMWQISGKGEDQGSFNADKLTSATNPDKENSMSISILLDNYCHPIALPKHQPTPDPEG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 DRVRAEMPNQLRKQLEAIIATDPLNPLTAEDKELLWHFRYESLKHPKAYPKLFSSVKWGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 DRVRAEMPNQLRKQLEAIIATDPLNPLTAEDKELLWHFRYESLKHPKAYPKLFSSVKWGQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 QEIVAKTYQLLARREVWDQSALDVGLTMQLLDCNFSDENVRAIAVQKLESLEDDDVLHYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 QEIVAKTYQLLARREVWDQSALDVGLTMQLLDCNFSDENVRAIAVQKLESLEDDDVLHYL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 LQLVQAVKFEPYHDSALARFLLKRGLRNKRIGHFLFWFLRSEIAQSRHYQQRFAVILEAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LQLVQAVKFEPYHDSALARFLLKRGLRNKRIGHFLFWFLRSEIAQSRHYQQRFAVILEAY
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 LRGCGTAMLHDFTQQVQVIEMLQKVTLDIKSLSAEKYDVSSQVISQLKQKLENLQNSQLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LRGCGTAMLHDFTQQVQVIEMLQKVTLDIKSLSAEKYDVSSQVISQLKQKLENLQNSQLP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 ESFRVPYDPGLKAGALAIEKCKVMASKKKPLWLEFKCADPTALSNETIGIIFKHGDDLRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 ESFRVPYDPGLKAGALAIEKCKVMASKKKPLWLEFKCADPTALSNETIGIIFKHGDDLRQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 DMLILQILRIMESIWETESLDLCLLPYGCISTGDKIGMIEIVKDATTIAKIQQSTVGNTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 DMLILQILRIMESIWETESLDLCLLPYGCISTGDKIGMIEIVKDATTIAKIQQSTVGNTG
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 AFKDEVLNHWLKEKSPTEEKFQAAVERFVYSCAGYCVATFVLGIGDRHNDNIMITETGNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 AFKDEVLNHWLKEKSPTEEKFQAAVERFVYSCAGYCVATFVLGIGDRHNDNIMITETGNL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 FHIDFGHILGNYKSFLGINKERVPFVLTPDFLFVMGTSGKKTSPHFQKFQDICVKAYLAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 FHIDFGHILGNYKSFLGINKERVPFVLTPDFLFVMGTSGKKTSPHFQKFQDICVKAYLAL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 RHHTNLLIILFSMMLMTGMPQLTSKEDIEYIRDALTVGKNEEDAKKYFLDQIEVCRDKGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 RHHTNLLIILFSMMLMTGMPQLTSKEDIEYIRDALTVGKNEEDAKKYFLDQIEVCRDKGW
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100
pF1KE3 TVQFNWFLHLVLGIKQGEKHSA
::::::::::::::::::::::
CCDS57 TVQFNWFLHLVLGIKQGEKHSA
1090 1100
>>CCDS43171.1 PIK3CA gene_id:5290|Hs108|chr3 (1068 aa)
initn: 1583 init1: 617 opt: 1823 Z-score: 2204.3 bits: 419.6 E(32554): 1.8e-116
Smith-Waterman score: 1929; 35.9% identity (65.8% similar) in 997 aa overlap (144-1091:107-1062)
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 QVVQTLDCLRYWKATHRSPGQIHLVQRHPPSEESQAFQRQLTALIGYDVTDVSNVHDDEL
..: . ..:.. ::. : . . :.: :.
CCDS43 AEREEFFDETRRLCDLRLFQPFLKVIEPVGNREEKILNREIGFAIGMPVCEFDMVKDPEV
80 90 100 110 120 130
180 190 200 210 220
pF1KE3 EFTRRGLVTPRMAEVASRD---PKLYAMH---PWVTSKP-LPEYLWKKIANNCIFIVI--
. ::.... : :: :. ::. : : :.: ::.....:. .. :..::
CCDS43 QDFRRNILNVCKEAVDLRDLNSPHSRAMYVYPPNVESSPELPKHIYNKLDKGQIIVVIWV
140 150 160 170 180 190
230 240 250 260 270
pF1KE3 ----HRSTTSQTIKVSPDDTPGAILQSFFTKMAKKKSLMDIPES------QSEQDFVLRV
. . . :.:.. : .: .. . : : .:.. :. . . ..:.:
CCDS43 IVSPNNDKQKYTLKINHDCVPEQVIAEAIRK--KTRSMLLSSEQLKLCVLEYQGKYILKV
200 210 220 230 240 250
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 CGRDEYLVGETPIKNFQWVRHCLKNGEEIHVVLDTPPDPALDEVRKEEWPLVDDCTGVTG
:: :::.. . :.......: :. :. ...: : . :. :: . .
CCDS43 CGCDEYFLEKYPLSQYKYIRSCIMLGRMPNLML------MAKESLYSQLPM--DCFTMPS
260 270 280 290 300
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 YHEQLTIHGKDHES-VFTVSLWDCDRKFRVKIR-GIDIPVLPRNTDLTVFVEANIQHGQQ
: .... .. . : ::: . .:.:: . . : :. : ..:...: :: .
CCDS43 YSRRISTATPYMNGETSTKSLWVINSALRIKILCATYVNVNIRDID-KIYVRTGIYHGGE
310 320 330 340 350 360
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 VLCQRRTSPKPFTEEVLWNVWLEFSIKIKDLPKGALLNLQIYCGKAPALSSKASAESPSS
::. .. . . :: ::...: : :::..: : :.: :. . . :.. :
CCDS43 PLCDNVNTQRVPCSNPRWNEWLNYDIYIPDLPRAARLCLSI-CS---VKGRKGAKEEHCP
370 380 390 400 410 420
460 470 480 490 500 510
pF1KE3 ESKGKVQLLYYVNLLLIDHRFLLRRGEYVLHMWQISGKGEDQGSFNADKLTSATNPDKEN
. :...:. :.. :. :...:..: . :: .: .:. .::.::
CCDS43 LAWGNINLFDYTDTLV--------SGKMALNLWPVPHGLEDL--LNPIGVTG-SNPNKE-
430 440 450 460
520 530 540 550
pF1KE3 SMSISILLDNYCHPIALP------KHQP---------TPDPEGDRVRAEMPNQLRK----
. . . .: . . .: .: . . : : :.::.
CCDS43 TPCLELEFDWFSSVVKFPDMSVIEEHANWSVSREAGFSYSHAGLSNRLARDNELRENDKE
470 480 490 500 510 520
560 570 580 590 600 610
pF1KE3 QLEAIIATDPLNPLTAEDKELLWHFRYESLKHPKAYPKLFSSVKWGQQEIVAKTYQLLAR
::.:: . :::. .: ..:..:: :. . :. :::. ::::.... ::. : :
CCDS43 QLKAISTRDPLSEITEQEKDFLWSHRHYCVTIPEILPKLLLSVKWNSRDEVAQMYCL---
530 540 550 560 570 580
620 630 640 650 660 670
pF1KE3 REVWDQSALDVGLTMQLLDCNFSDENVRAIAVQKLES-LEDDDVLHYLLQLVQAVKFEPY
: : . .:.:::::. : ::..::. ::. : :: . .::.::::..:.: :
CCDS43 --VKDWPPIKPEQAMELLDCNYPDPMVRGFAVRCLEKYLTDDKLSQYLIQLVQVLKYEQY
590 600 610 620 630 640
680 690 700 710 720 730
pF1KE3 HDSALARFLLKRGLRNKRIGHFLFWFLRSEIAQSRHYQQRFAVILEAYLRGCGTAMLHDF
:. :.:::::..: :.:::::.:: :.::. ... .:::...::.: :.:: . : .
CCDS43 LDNLLVRFLLKKALTNQRIGHFFFWHLKSEM-HNKTVSQRFGLLLESYCRACGMYLKH-L
650 660 670 680 690 700
740 750 760 770 780
pF1KE3 TQQVQVIEMLQKVTLDIKSLSAEKYDVSSQVISQLKQKLENLQNSQLPES---FRVPYDP
..::...: : ..: :: :. :: : ...: :.: .:... .. .. : : .:
CCDS43 NRQVEAMEKLINLT-DI--LKQEKKDETQKV--QMKFLVEQMRRPDFMDALQGFLSPLNP
710 720 730 740 750
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 GLKAGALAIEKCKVMASKKKPLWLEFKCADP-TALSNETIGIIFKHGDDLRQDMLILQIL
. . : : .:.:..:.: :.::::... : . : .. ::::.::::::::: :::.
CCDS43 AHQLGNLRLEECRIMSSAKRPLWLNWENPDIMSELLFQNNEIIFKNGDDLRQDMLTLQII
760 770 780 790 800 810
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 RIMESIWETESLDLCLLPYGCISTGDKIGMIEIVKDATTIAKIQQSTVGNTGA--FKDEV
::::.::....::: .:::::.: :: .:.::.:... :: .:: . : :: :....
CCDS43 RIMENIWQNQGLDLRMLPYGCLSIGDCVGLIEVVRNSHTIMQIQCKG-GLKGALQFNSHT
820 830 840 850 860 870
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 LNHWLKEKSPTEEKFQAAVERFVYSCAGYCVATFVLGIGDRHNDNIMITETGNLFHIDFG
:..:::.:. : ..::.. :. ::::::::::.::::::::.:::. . :.:::::::
CCDS43 LHQWLKDKNKGE-IYDAAIDLFTRSCAGYCVATFILGIGDRHNSNIMVKDDGQLFHIDFG
880 890 900 910 920 930
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 HILGNYKSFLGINKERVPFVLTPDFLFVMGTSGKKTSP--HFQKFQDICVKAYLALRHHT
:.: . :. .: ..:::::::: :::.:.. .... . .:..::..: :::::.:.:.
CCDS43 HFLDHKKKKFGYKRERVPFVLTQDFLIVISKGAQECTKTREFERFQEMCYKAYLAIRQHA
940 950 960 970 980 990
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 NLLIILFSMMLMTGMPQLTSKEDIEYIRDALTVGKNEEDAKKYFLDQIEVCRDKGWTVQF
::.: :::::: .:::.: : .:: ::: .:.. :.:..: .::. :.. . :::...
CCDS43 NLFINLFSMMLGSGMPELQSFDDIAYIRKTLALDKTEQEALEYFMKQMNDAHHGGWTTKM
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1090 1100
pF1KE3 NWFLHLVLGIKQGEKHSA
.:..: .
CCDS43 DWIFHTIKQHALN
1060
>>CCDS3104.1 PIK3CB gene_id:5291|Hs108|chr3 (1070 aa)
initn: 1528 init1: 626 opt: 1685 Z-score: 2036.6 bits: 388.6 E(32554): 4e-107
Smith-Waterman score: 1819; 33.2% identity (62.3% similar) in 1083 aa overlap (38-1091:30-1064)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 QPVVLREDNCRRRRRMKPRSAAASLSSMELIPIEFVLPTSQRKCKSPETALLHVAGHGNV
::..:.:::. :.: ....
CCDS31 MCFSFIMPPAMADILDIWAVDSQIASDGSIPVDFLLPTGIY-------IQLEVPREATI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 EQMKAQVWLRALETSVAADFYHRLGPHHFLLLYQKKGQWYEIYDKYQVVQTL-DCLRYWK
.: ..: .. : : : ::.. . . .. : . : : :
CCDS31 SYIKQMLWKQV----------HNY-PM-FNLLMDIDSYMFACVNQTAVYEELEDETRRLC
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 ATHRSPGQIHLVQRH-PPSEESQAFQRQLTALIGYDVTDVSNVHDDEL-EFTR--RGLVT
.. ..:: : :.:. .. .. .::: . . ....: :. :: : : .
CCDS31 DVRPFLPVLKLVTRSCDPGEK---LDSKIGVLIGKGLHEFDSLKDPEVNEFRRKMRKFSE
110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KE3 PRMAEVA--SRDPKLYAMHPWVTSKPLPEYLWKKIANNCIFIVIHRSTTSQ--TIKVSPD
.. .. : : .: .:: : :. .. .....: . .. ...:::.
CCDS31 EKILSLVGLSWMDWLKQTYPPEHEPSIPENLEDKLYGGKLIVAVHFENCQDVFSFQVSPN
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 DTPGAILQSFFTKMAKKKSLMDIPESQSEQDFVLRVCGRDEYLVGETPIKNFQWVRHCLK
.: . . . :. .. . : :.::.: :: ::. :. :. .::..:.:.
CCDS31 MNPIKVNE---LAIQKRLTIHGKEDEVSPYDYVLQVSGRVEYVFGDHPLIQFQYIRNCVM
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 NGEEIHVVLDTPPDPALDEVRKE-EWPLVDDCTGVTGYHEQLTIHGKDHESVFTVSLWDC
: : .: ...: : .. .... .: . ... . .:.
CCDS31 NRALPHFIL-----VECCKIKKMYEQEMIAIEAAINRNSSNLPLPLPPKKTRIISHVWEN
280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 DRKFR-VKIRGIDIPVLPRNTDLTVFVEANIQHGQQVLCQRRTSPK-PFTEEVLWNVWLE
. :. : ..: : . . : :.:.. :: ..::. .: . .. .:: ::
CCDS31 NNPFQIVLVKGNK---LNTEETVKVHVRAGLFHGTELLCKTIVSSEVSGKNDHIWNEPLE
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460
pF1KE3 FSIKIKDLPKGALLNLQIYCGKAPALSSKASAE-SPSS----ESKGKVQL-LYYVNLLLI
:.:.: :::. : : . .: . ..:.. .::. .. :::. . .:: ...
CCDS31 FDINICDLPRMARLCFAVYAVLDKVKTKKSTKTINPSKYQTIRKAGKVHYPVAWVNTMVF
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500 510 520
pF1KE3 DHRFLLRRGEYVLHMWQISGKGEDQGSFNADKLTSATNPDKENSMSISILL-DNYCHPIA
: . :: :. .:: :. : : . .: : ::: ::. .. . . .: .:
CCDS31 DFKGQLRTGDIILHSWS-SFPDELEEMLNP-MGTVQTNPYTENATALHVKFPENKKQPYY
450 460 470 480 490 500
530 540 550 560 570 580
pF1KE3 LP-------KHQPTPDPEGDRVRAEMPNQLRKQLEAIIATDPLNPLTAEDKELLWHFRYE
: : . .. : .. ... :. :. :::. : .. .:.: .: .
CCDS31 YPPFDKIIEKAAEIASSDSANVSSRGGKKFLPVLKEILDRDPLSQLCENEMDLIWTLRQD
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::. : :.:::::: :: ... .. ...::.... :. .. :: :.: : .
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.. .. :.. . ... : .: . . : .:::: : :: ::::: . .
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.......:.:::.::::::::: ::.::.:. .:. .::: .:::::..:::. :.::
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.:. . ::: :: .:.:. ..::. ..: .:::: . .. .. :.:.:. ::::::::
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CCDS78 SFFQKNKCRLPLKPSLVAKELNIKSCSFFSSNAVPLKVTMVNADPMG---EEINVMFKVG
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CCDS78 STGHMFHIDFGKFLGHAQMFGSFKRDRAPFVLTSDMAYVIN-GGEKPTIRFQLFVDLCCQ
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CCDS78 AYNLIRKQTNLFLNLLSLMIPSGLPELTSIQDLKYVRDALQPQTTDAEATIFFTRLIESS
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CCDS78 LGSIAT-KFNFFIHNLAQLRFSGLPSNDEPILSFSPKTYSFRQDGRIKEVSVFTYHKKYN
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CCDS14 ILQIDFPTSAFDIKFTSPPGDKFSPRYEFGSLREE--DQ--RKLKDIMQKESLYWLTDAD
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CCDS14 LKLSFQNVDPLG---ENIRVIFKCGDDLRQDMLTLQMIRIMSKIWVQEGLDMRMVIFRCF
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CCDS14 STGRGRGMVEMIPNAETLRKIQVEH-GVTGSFKDRPLADWLQKHNPGEDEYEKAVENFIY
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CCDS14 SCAGCCVATYVLGICDRHNDNIMLKTTGHMFHIDFGRFLGHAQMFGNIKRDRAPFVFTSD
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. .:.. .: : : .:. : :.: .:: .:.::.:.. :...:: :.:.:.. ::..:
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. ::: .: .: :: :: . : ..:.:.: . .:
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CCDS14 THTLKSSGRISDVFLCRHEKIFHPNKGYIYVVKVMRENTHEATYIQRTFEEFQELHNKLR
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.:.:.. ...: :.:.:.. :... : . . : : :. : : :. .:... ..:..
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: . .:: : .. .: .. :..:.. ...... .: : .:.: .. .
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:. ..:. :: . : :.: ...:.:::: :::::::::.::....:..:: :.:
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:. .. : :.::: :....: ::.:.:::.. . : : .:......:..... .
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.. :.. : :::::.::.::.::. ::::::::.:..:..::::::..::. ..: ::..
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.:.::..: .. . . : : :. ::: : ..: .:: .:.:..::. :. :::..:.:
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.:.. .:..:. . : .. .: ..: .:. . . :..: ..:
CCDS44 ELSGIQDLKYVYNNLRPQDTDLEATSHFTKKIKESLEC-FPVKLNNLIHTLAQMSAISPA
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CCDS44 KSTSQTFPQESCLLSTTRSIERATILGFSKKSSNLYLIQVTHSNNETSLTEKSFEQFSKL
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CCDS11 FRYYLTNQEKALTKFLKCVNWDLPQEAKQALELLGK---W--KPMDVEDSLELLSSHYTN
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CCDS11 PTVRRYAVARLRQADDEDLLMYLLQLVQALKYENFDDIKNGLEPTKKDSQSSVSENVSNS
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pF1KE3 ---SA------------------------------------LARFLLKRGLRNKRIGHFL
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CCDS11 GINSAEIDSSQIITSPLPSVSSPPPASKTKEVPDGENLEQDLCTFLISRACKNSTLANYL
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CCDS11 YWYVIVE-CEDQDTQQRDPKTHEMYLNVMRRFSQALLKG-DKSVRVMRSLLAAQQTFVDR
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CCDS11 ETATLFKSALMPAQLFFKTED-----GGKYPVIFKHGDDLRQDQLILQIISLMDKLLRKE
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pF1KE3 SLDLCLLPYGCISTGDKIGMIEIVKDATTIAKIQQSTVGNTGAFKDEVLNHWLKEKSPTE
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CCDS11 NLDLKLTPYKVLATSTKHGFMQFIQ-SVPVAEVLDTE----GSIQNFFRKYAPSENGPNG
670 680 690 700 710
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pF1KE3 EKFQAAVERFVYSCAGYCVATFVLGIGDRHNDNIMITETGNLFHIDFGHILGNYKSFLGI
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CCDS11 ISAEV-MDTYVKSCAGYCVITYILGVGDRHLDNLLLTKTGKLFHIDFGYILGR-------
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CCDS11 DPKPLPPPMKLNKEMVEGMGGTQ-SEQYQEFRKQCYTAFLHLRRYSNLILNLFSLMVDAN
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]