Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3351
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3351, 1042 aa
1>>>pF1KE3351 1042 - 1042 aa - 1042 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0060+/-0.000961; mu= 19.5505+/- 0.059
mean_var=92.8290+/-18.307, 0's: 0 Z-trim(106.9): 91 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.133117
statistics sampled from 9134 (9225) to 9134 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.636), E-opt: 0.2 (0.283), width: 16
Scan time: 3.000
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3758.1 USP38 gene_id:84640|Hs108|chr4 (1042) 6879 1332.0 0
CCDS77964.1 USP38 gene_id:84640|Hs108|chr4 (1004) 6502 1259.6 0
CCDS41693.1 USP35 gene_id:57558|Hs108|chr11 (1018) 1843 364.9 5e-100
>>CCDS3758.1 USP38 gene_id:84640|Hs108|chr4 (1042 aa)
initn: 6879 init1: 6879 opt: 6879 Z-score: 7136.0 bits: 1332.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6879; 100.0% identity (100.0% similar) in 1042 aa overlap (1-1042:1-1042)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MDKILEGLVSSSHPLPLKRVIVRKVVESAEHWLDEAQCEAMFDLTTRLILEGQDPFQRQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 MDKILEGLVSSSHPLPLKRVIVRKVVESAEHWLDEAQCEAMFDLTTRLILEGQDPFQRQV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 GHQVLEAYARYHRPEFESFFNKTFVLGLLHQGYHSLDRKDVAILDYIHNGLKLIMSCPSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 GHQVLEAYARYHRPEFESFFNKTFVLGLLHQGYHSLDRKDVAILDYIHNGLKLIMSCPSV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 LDLFSLLQVEVLRMVCERPEPQLCARLSDLLTDFVQCIPKGKLSITFCQQLVRTIGHFQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 LDLFSLLQVEVLRMVCERPEPQLCARLSDLLTDFVQCIPKGKLSITFCQQLVRTIGHFQC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 VSTQERELREYVSQVTKVSNLLQNIWKAEPATLLPSLQEVFASISSTDASFEPSVALASL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 VSTQERELREYVSQVTKVSNLLQNIWKAEPATLLPSLQEVFASISSTDASFEPSVALASL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 VQHIPLQMITVLIRSLTTDPNVKDASMTQALCRMIDWLSWPLAQHVDTWVIALLKGLAAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 VQHIPLQMITVLIRSLTTDPNVKDASMTQALCRMIDWLSWPLAQHVDTWVIALLKGLAAV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 QKFTILIDVTLLKIELVFNRLWFPLVRPGALAVLSHMLLSFQHSPEAFHLIVPHVVNLVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 QKFTILIDVTLLKIELVFNRLWFPLVRPGALAVLSHMLLSFQHSPEAFHLIVPHVVNLVH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 SFKNDGLPSSTAFLVQLTELIHCMMYHYSGFPDLYEPILEAIKDFPKPSEEKIKLILNQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 SFKNDGLPSSTAFLVQLTELIHCMMYHYSGFPDLYEPILEAIKDFPKPSEEKIKLILNQS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 AWTSQSNSLASCLSRLSGKSETGKTGLINLGNTCYMNSVIQALFMATDFRRQVLSLNLNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 AWTSQSNSLASCLSRLSGKSETGKTGLINLGNTCYMNSVIQALFMATDFRRQVLSLNLNG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 CNSLMKKLQHLFAFLAHTQREAYAPRIFFEASRPPWFTPRSQQDCSEYLRFLLDRLHEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 CNSLMKKLQHLFAFLAHTQREAYAPRIFFEASRPPWFTPRSQQDCSEYLRFLLDRLHEEE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 KILKVQASHKPSEILECSETSLQEVASKAAVLTETPRTSDGEKTLIEKMFGGKLRTHIRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 KILKVQASHKPSEILECSETSLQEVASKAAVLTETPRTSDGEKTLIEKMFGGKLRTHIRC
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 LNCRSTSQKVEAFTDLSLAFCPSSSLENMSVQDPASSPSIQDGGLMQASVPGPSEEPVVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 LNCRSTSQKVEAFTDLSLAFCPSSSLENMSVQDPASSPSIQDGGLMQASVPGPSEEPVVY
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 NPTTAAFICDSLVNEKTIGSPPNEFYCSENTSVPNESNKILVNKDVPQKPGGETTPSVTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 NPTTAAFICDSLVNEKTIGSPPNEFYCSENTSVPNESNKILVNKDVPQKPGGETTPSVTD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 LLNYFLAPEILTGDNQYYCENCASLQNAEKTMQITEEPEYLILTLLRFSYDQKYHVRRKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 LLNYFLAPEILTGDNQYYCENCASLQNAEKTMQITEEPEYLILTLLRFSYDQKYHVRRKI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 LDNVSLPLVLELPVKRITSFSSLSESWSVDVDFTDLSENLAKKLKPSGTDEASCTKLVPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 LDNVSLPLVLELPVKRITSFSSLSESWSVDVDFTDLSENLAKKLKPSGTDEASCTKLVPY
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 LLSSVVVHSGISSESGHYYSYARNITSTDSSYQMYHQSEALALASSQSHLLGRDSPSAVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 LLSSVVVHSGISSESGHYYSYARNITSTDSSYQMYHQSEALALASSQSHLLGRDSPSAVF
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 EQDLENKEMSKEWFLFNDSRVTFTSFQSVQKITSRFPKDTAYVLLYKKQHSTNGLSGNNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 EQDLENKEMSKEWFLFNDSRVTFTSFQSVQKITSRFPKDTAYVLLYKKQHSTNGLSGNNP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 TSGLWINGDPPLQKELMDAITKDNKLYLQEQELNARARALQAASASCSFRPNGFDDNDPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 TSGLWINGDPPLQKELMDAITKDNKLYLQEQELNARARALQAASASCSFRPNGFDDNDPP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040
pF1KE3 GSCGPTGGGGGGGFNTVGRLVF
::::::::::::::::::::::
CCDS37 GSCGPTGGGGGGGFNTVGRLVF
1030 1040
>>CCDS77964.1 USP38 gene_id:84640|Hs108|chr4 (1004 aa)
initn: 6502 init1: 6502 opt: 6502 Z-score: 6744.9 bits: 1259.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6502; 100.0% identity (100.0% similar) in 989 aa overlap (1-989:1-989)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MDKILEGLVSSSHPLPLKRVIVRKVVESAEHWLDEAQCEAMFDLTTRLILEGQDPFQRQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MDKILEGLVSSSHPLPLKRVIVRKVVESAEHWLDEAQCEAMFDLTTRLILEGQDPFQRQV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 GHQVLEAYARYHRPEFESFFNKTFVLGLLHQGYHSLDRKDVAILDYIHNGLKLIMSCPSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 GHQVLEAYARYHRPEFESFFNKTFVLGLLHQGYHSLDRKDVAILDYIHNGLKLIMSCPSV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 LDLFSLLQVEVLRMVCERPEPQLCARLSDLLTDFVQCIPKGKLSITFCQQLVRTIGHFQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LDLFSLLQVEVLRMVCERPEPQLCARLSDLLTDFVQCIPKGKLSITFCQQLVRTIGHFQC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 VSTQERELREYVSQVTKVSNLLQNIWKAEPATLLPSLQEVFASISSTDASFEPSVALASL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VSTQERELREYVSQVTKVSNLLQNIWKAEPATLLPSLQEVFASISSTDASFEPSVALASL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 VQHIPLQMITVLIRSLTTDPNVKDASMTQALCRMIDWLSWPLAQHVDTWVIALLKGLAAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VQHIPLQMITVLIRSLTTDPNVKDASMTQALCRMIDWLSWPLAQHVDTWVIALLKGLAAV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 QKFTILIDVTLLKIELVFNRLWFPLVRPGALAVLSHMLLSFQHSPEAFHLIVPHVVNLVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 QKFTILIDVTLLKIELVFNRLWFPLVRPGALAVLSHMLLSFQHSPEAFHLIVPHVVNLVH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 SFKNDGLPSSTAFLVQLTELIHCMMYHYSGFPDLYEPILEAIKDFPKPSEEKIKLILNQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SFKNDGLPSSTAFLVQLTELIHCMMYHYSGFPDLYEPILEAIKDFPKPSEEKIKLILNQS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 AWTSQSNSLASCLSRLSGKSETGKTGLINLGNTCYMNSVIQALFMATDFRRQVLSLNLNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 AWTSQSNSLASCLSRLSGKSETGKTGLINLGNTCYMNSVIQALFMATDFRRQVLSLNLNG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 CNSLMKKLQHLFAFLAHTQREAYAPRIFFEASRPPWFTPRSQQDCSEYLRFLLDRLHEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 CNSLMKKLQHLFAFLAHTQREAYAPRIFFEASRPPWFTPRSQQDCSEYLRFLLDRLHEEE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 KILKVQASHKPSEILECSETSLQEVASKAAVLTETPRTSDGEKTLIEKMFGGKLRTHIRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 KILKVQASHKPSEILECSETSLQEVASKAAVLTETPRTSDGEKTLIEKMFGGKLRTHIRC
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 LNCRSTSQKVEAFTDLSLAFCPSSSLENMSVQDPASSPSIQDGGLMQASVPGPSEEPVVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LNCRSTSQKVEAFTDLSLAFCPSSSLENMSVQDPASSPSIQDGGLMQASVPGPSEEPVVY
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 NPTTAAFICDSLVNEKTIGSPPNEFYCSENTSVPNESNKILVNKDVPQKPGGETTPSVTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 NPTTAAFICDSLVNEKTIGSPPNEFYCSENTSVPNESNKILVNKDVPQKPGGETTPSVTD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 LLNYFLAPEILTGDNQYYCENCASLQNAEKTMQITEEPEYLILTLLRFSYDQKYHVRRKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LLNYFLAPEILTGDNQYYCENCASLQNAEKTMQITEEPEYLILTLLRFSYDQKYHVRRKI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 LDNVSLPLVLELPVKRITSFSSLSESWSVDVDFTDLSENLAKKLKPSGTDEASCTKLVPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LDNVSLPLVLELPVKRITSFSSLSESWSVDVDFTDLSENLAKKLKPSGTDEASCTKLVPY
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 LLSSVVVHSGISSESGHYYSYARNITSTDSSYQMYHQSEALALASSQSHLLGRDSPSAVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LLSSVVVHSGISSESGHYYSYARNITSTDSSYQMYHQSEALALASSQSHLLGRDSPSAVF
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 EQDLENKEMSKEWFLFNDSRVTFTSFQSVQKITSRFPKDTAYVLLYKKQHSTNGLSGNNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 EQDLENKEMSKEWFLFNDSRVTFTSFQSVQKITSRFPKDTAYVLLYKKQHSTNGLSGNNP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 TSGLWINGDPPLQKELMDAITKDNKLYLQEQELNARARALQAASASCSFRPNGFDDNDPP
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TSGLWINGDPPLQKELMDAITKDNKLYLQVSWKYKLYLLKILNN
970 980 990 1000
>>CCDS41693.1 USP35 gene_id:57558|Hs108|chr11 (1018 aa)
initn: 2747 init1: 1271 opt: 1843 Z-score: 1909.2 bits: 364.9 E(32554): 5e-100
Smith-Waterman score: 2543; 43.1% identity (65.8% similar) in 1112 aa overlap (1-1042:1-1018)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MDKILEGLVSSSHPLPLKRVIVRKVVESAEHWLDEAQCEAMFDLTTRLILEGQDPFQRQV
::::::..:.::.:. .:. .::.:.:.:.. :.. :: :.. : .:: . : . . :.:
CCDS41 MDKILEAVVTSSYPVSVKQGLVRRVLEAARQPLEREQCLALLALGARLYVGGAEELPRRV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 GHQVLEAYARYHRPEFESFFNKTFVLGLLHQGYHSLDRKDVAILDYIHNGLKLIMSCPSV
: :.:.. .:.: : ::. :: ::. : . .: .. ::.:. :..
CCDS41 GCQLLHVAGRHHPDVFAEFFSARRVLRLLQGGAGPPGPRALAC---VQLGLQLLPEGPAA
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 LDLFSLLQVEVLRMVCERPEPQLCARLSDLLTDFVQCIPKGKLSITFCQQLVRTIGHFQC
..:.::. :::: ::::: : ::... ::. .:.: : . ::::::: .:.:.:
CCDS41 DEVFALLRREVLRTVCERPGPAACAQVARLLARHPRCVPDGPHRLLFCQQLVRCLGRFRC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 VSTQERELREYVSQVTKVSNLLQNIWKAEPATLLPSLQEVFASISSTDASFEPSVALASL
. :. :.. :. .::.:: ..:.:.::..:: :.:.:: :: .. :: ::::.
CCDS41 PAEGEEGAVEFLEQAQQVSGLLAQLWRAQPAAILPCLKELFAVISCAEEE-PPSSALASV
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 VQHIPLQMITVLIRSLTTDPNVKDASMTQALCRMIDWLSWPLAQHVDTWVIALLKGLAAV
:::.::... ..:.:..: .: :..: :. :::::.::::....: :.::::::::::
CCDS41 VQHLPLELMDGVVRNLSNDDSVTDSQMLTAISRMIDWVSWPLGKNIDKWIIALLKGLAAV
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 QKFTILIDVTLLKIELVFNRLWFPLVRPGALAVLSHMLLSFQHSPEAFHLIVPHVVNLVH
.::.:::.:.: ::: ::..: .:.:: .::.::..:::.:::: :::::..::. .:
CCDS41 KKFSILIEVSLTKIEKVFSKLLYPIVRGAALSVLKYMLLTFQHSHEAFHLLLPHIPPMVA
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 SFKNDGLPSSTAFLVQLTELIHCMMYHYSGFPDLYEPILEAIKDFPKPSEEKIKLILNQS
:. .. :.:. : ::.::.:::.... ::::::::..:::::. :.:..:: .:.:.
CCDS41 SLVKEDSNSGTSCLEQLAELVHCMVFRFPGFPDLYEPVMEAIKDLHVPNEDRIKQLLGQD
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 AWTSQSNSLASCLSRLSGKSETGKTGLINLGNTCYMNSVIQALFMATDFRRQVLSLNLNG
:::::.. ::. :: .::.::: ::::::::::.::..::::::.:::. :: :. :.
CCDS41 AWTSQKSELAGFYPRLMAKSDTGKIGLINLGNTCYVNSILQALFMASDFRHCVLRLTENN
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 CNSLMKKLQHLFAFLAHTQREAYAPRIFFEASRPPWFTPRSQQDCSEYLRFLLDRLHEEE
. :: ::: ::.:: :.:: : .:. :. :: :::.: .::::::::..:::::::::
CCDS41 SQPLMTKLQWLFGFLEHSQRPAISPENFLSASWTPWFSPGTQQDCSEYLKYLLDRLHEEE
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 KILKVQASHKPSEILECSETSLQEVASKAAVLTETPRTSDGEKTLIEKMFGGKLRTHIRC
: ..: :.. :.. .: . : : :. : .:::::::. :.: :
CCDS41 KT--------GTRI--CQK--LKQSSSPSPP-EEPPAPSS---TSVEKMFGGKIVTRICC
540 550 560 570 580
610 620 630 640 650
pF1KE3 LNCRSTSQKVEAFTDLSLAFCPSSSLENM---SVQDPASSPSIQD-GGLMQASVPG---P
: : ..:.. :::::::::: : . ::. :. . . .. .:. :: :
CCDS41 LCCLNVSSREEAFTDLSLAFPPPERCRRRRLGSVMRPTEDITARELPPPTSAQGPGRVGP
590 600 610 620 630 640
660 670 680
pF1KE3 SEEP---VVYN-PTTAAFI--CDSLV------------------NEKT----IG----SP
.. .. . : :. .: :: .:.: .: :
CCDS41 RRQRKHCITEDTPPTSLYIEGLDSKEAGGQSSQEERIEREEEGKEERTEKEEVGEEEEST
650 660 670 680 690 700
690 700 710
pF1KE3 PNEFYCSENTSVPNESNKIL--VNKDVPQK----------------PGGETT------PS
.: .. : .: .:. ..:.. :. :.:: : :
CCDS41 RGEGEREKEEEVEEEEEKVEKETEKEAEQEKEEDSLGAGTHPDAAIPSGERTCGSEGSRS
710 720 730 740 750 760
720 730 740 750 760 770
pF1KE3 VTDLLNYFLAPEILTGDNQYYCENCASLQNAEKTMQITEEPEYLILTLLRFSYDQKYHVR
: ::.::::.:: ::..:.::::.:::::.:::...... : ::::::::::.: . :
CCDS41 VLDLVNYFLSPEKLTAENRYYCESCASLQDAEKVVELSQGPCYLILTLLRFSFDLRTMRR
770 780 790 800 810 820
780 790 800 810 820 830
pF1KE3 RKILDNVSLPLVLELPVKRITSFSSLSESWSVDVDFTDLSENLAKKLKPSGTDEASCTKL
:::::.::.::.:.::. .: .:
CCDS41 RKILDDVSIPLLLRLPLA-------------------------------GGRGQA-----
830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KE3 VPYLLSSVVVHSGISSESGHYYSYARNITSTDSSYQMYHQSEALALASSQSHLLGR-DSP
: : :::::::.:::::::: ::: .. : :: :: : :
CCDS41 --YDLCSVVVHSGVSSESGHYYCYAR-------------EGAARPAAS-----LGTADRP
850 860 870 880
900 910 920 930 940 950
pF1KE3 SAVFEQDLENKEMSKEWFLFNDSRVTFTSFQSVQKITSRFPKDTAYVLLYKKQHSTNGLS
: ..:.::::.::.:.::.::...:: :::::::::.:. :. .:
CCDS41 -----------EPENQWYLFNDTRVSFSSFESVSNVTSFFPKDTAYVLFYR-QRPREGPE
890 900 910 920 930
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE3 GNNPTSGLWINGDPPLQKELMDAITKDNKLYLQEQELNARARALQAASASCSFR-PNGFD
.. .: . .: :.:.::.::.::: ::::::: .::.:: .. : . :::
CCDS41 AELGSSR--VRTEPTLHKDLMEAISKDNILYLQEQEKEARSRAAYISALPTSPHWGRGFD
940 950 960 970 980 990
1020 1030 1040
pF1KE3 -----DNDPPGSCGPTGGGGGGGFNTVGRLVF
:. ::.:.:.::.:: :. ::::
CCDS41 EDKDEDEGSPGGCNPAGGNGGD-FH---RLVF
1000 1010
1042 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 18:57:18 2016 done: Mon Nov 7 18:57:18 2016
Total Scan time: 3.000 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]