Result of FASTA (omim) for
pFN21AE3347
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3347, 1027 aa
1>>>pF1KE3347 1027 - 1027 aa - 1027 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.2629+/-0.000398; mu= -6.0278+/- 0.025
mean_var=305.0254+/-62.940, 0's: 0 Z-trim(121.0): 95 B-trim: 283 in 1/57
Lambda= 0.073436
statistics sampled from 36895 (36994) to 36895 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.746), E-opt: 0.2 (0.434), width: 16
Scan time: 12.510
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_004632 (OMIM: 602409) protein AF-10 isoform a [ (1027) 6799 734.7 6e-211
NP_001182555 (OMIM: 602409) protein AF-10 isoform (1068) 3950 432.9 4.5e-120
NP_001311226 (OMIM: 602409) protein AF-10 isoform ( 823) 2778 308.7 8.7e-83
NP_005928 (OMIM: 600328) protein AF-17 [Homo sapie (1093) 1540 177.6 3.3e-43
XP_006721974 (OMIM: 600328) PREDICTED: protein AF- (1067) 1481 171.3 2.5e-41
XP_016880139 (OMIM: 600328) PREDICTED: protein AF- ( 652) 1467 169.7 4.6e-41
XP_016880138 (OMIM: 600328) PREDICTED: protein AF- ( 657) 1467 169.7 4.7e-41
XP_016880137 (OMIM: 600328) PREDICTED: protein AF- ( 889) 711 89.7 7.7e-17
NP_001182557 (OMIM: 602409) protein AF-10 isoform ( 179) 609 78.5 3.7e-14
NP_001182559 (OMIM: 602409) protein AF-10 isoform ( 179) 609 78.5 3.7e-14
NP_001311225 (OMIM: 602409) protein AF-10 isoform ( 179) 609 78.5 3.7e-14
NP_001182556 (OMIM: 602409) protein AF-10 isoform ( 126) 594 76.8 8.3e-14
NP_001305978 (OMIM: 602410) peregrin isoform 3 [Ho (1119) 614 79.5 1.2e-13
XP_005265509 (OMIM: 602410) PREDICTED: peregrin is (1125) 614 79.5 1.2e-13
NP_001305979 (OMIM: 602410) peregrin isoform 4 [Ho (1213) 614 79.5 1.2e-13
NP_004625 (OMIM: 602410) peregrin isoform 2 [Homo (1214) 614 79.5 1.2e-13
XP_005265507 (OMIM: 602410) PREDICTED: peregrin is (1219) 614 79.5 1.2e-13
NP_001003694 (OMIM: 602410) peregrin isoform 1 [Ho (1220) 614 79.5 1.2e-13
XP_005265506 (OMIM: 602410) PREDICTED: peregrin is (1247) 614 79.5 1.3e-13
XP_011532403 (OMIM: 602410) PREDICTED: peregrin is (1248) 614 79.5 1.3e-13
XP_011532404 (OMIM: 602410) PREDICTED: peregrin is (1248) 614 79.5 1.3e-13
XP_016884210 (OMIM: 604589) PREDICTED: bromodomain ( 941) 584 76.3 9.1e-13
XP_016884209 (OMIM: 604589) PREDICTED: bromodomain ( 955) 584 76.3 9.2e-13
XP_016884208 (OMIM: 604589) PREDICTED: bromodomain ( 958) 584 76.3 9.2e-13
XP_016884207 (OMIM: 604589) PREDICTED: bromodomain (1023) 584 76.3 9.8e-13
NP_001291738 (OMIM: 604589) bromodomain-containing (1058) 584 76.3 1e-12
XP_016884203 (OMIM: 604589) PREDICTED: bromodomain (1187) 584 76.3 1.1e-12
XP_016884204 (OMIM: 604589) PREDICTED: bromodomain (1189) 584 76.3 1.1e-12
XP_016884206 (OMIM: 604589) PREDICTED: bromodomain (1189) 584 76.3 1.1e-12
XP_016884205 (OMIM: 604589) PREDICTED: bromodomain (1189) 584 76.3 1.1e-12
NP_001291737 (OMIM: 604589) bromodomain-containing (1189) 584 76.3 1.1e-12
XP_011512794 (OMIM: 616856) PREDICTED: bromodomain ( 832) 567 74.4 2.9e-12
XP_016866231 (OMIM: 616856) PREDICTED: bromodomain (1088) 567 74.5 3.6e-12
XP_011512793 (OMIM: 616856) PREDICTED: bromodomain (1131) 567 74.5 3.7e-12
XP_011512792 (OMIM: 616856) PREDICTED: bromodomain (1144) 567 74.5 3.7e-12
XP_011512791 (OMIM: 616856) PREDICTED: bromodomain (1205) 567 74.5 3.9e-12
NP_056510 (OMIM: 616856) bromodomain and PHD finge (1205) 567 74.5 3.9e-12
XP_005249068 (OMIM: 616856) PREDICTED: bromodomain (1205) 567 74.5 3.9e-12
XP_005249067 (OMIM: 616856) PREDICTED: bromodomain (1205) 567 74.5 3.9e-12
NP_001274370 (OMIM: 610514) protein Jade-1 isoform ( 509) 486 65.7 7.3e-10
NP_079176 (OMIM: 610514) protein Jade-1 isoform 2 ( 509) 486 65.7 7.3e-10
XP_016864115 (OMIM: 610514) PREDICTED: protein Jad ( 529) 486 65.7 7.6e-10
XP_016864116 (OMIM: 610514) PREDICTED: protein Jad ( 529) 486 65.7 7.6e-10
NP_001274366 (OMIM: 610514) protein Jade-1 isoform ( 830) 486 65.8 1.1e-09
XP_005263289 (OMIM: 610514) PREDICTED: protein Jad ( 842) 486 65.9 1.1e-09
NP_001274368 (OMIM: 610514) protein Jade-1 isoform ( 842) 486 65.9 1.1e-09
NP_001274369 (OMIM: 610514) protein Jade-1 isoform ( 842) 486 65.9 1.1e-09
NP_001274371 (OMIM: 610514) protein Jade-1 isoform ( 842) 486 65.9 1.1e-09
NP_955352 (OMIM: 610514) protein Jade-1 isoform 1 ( 842) 486 65.9 1.1e-09
NP_001274372 (OMIM: 610514) protein Jade-1 isoform ( 842) 486 65.9 1.1e-09
>>NP_004632 (OMIM: 602409) protein AF-10 isoform a [Homo (1027 aa)
initn: 6799 init1: 6799 opt: 6799 Z-score: 3908.2 bits: 734.7 E(85289): 6e-211
Smith-Waterman score: 6799; 100.0% identity (100.0% similar) in 1027 aa overlap (1-1027:1-1027)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MVSSDRPVSLEDEVSHSMKEMIGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHGCSVAVHQACYGIVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MVSSDRPVSLEDEVSHSMKEMIGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHGCSVAVHQACYGIVQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 VPTGPWFCRKCESQERAARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQFANVSTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VPTGPWFCRKCESQERAARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQFANVSTM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 EPIVLQSVPHDRYNKTCYICDEQGRESKAATGACMTCNKHGCRQAFHVTCAQFAGLLCEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EPIVLQSVPHDRYNKTCYICDEQGRESKAATGACMTCNKHGCRQAFHVTCAQFAGLLCEE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 EGNGADNVQYCGYCKYHFSKLKKSKRGSNRSYDQSLSDSSSHSQDKHHEKEKKKYKEKDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EGNGADNVQYCGYCKYHFSKLKKSKRGSNRSYDQSLSDSSSHSQDKHHEKEKKKYKEKDK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 HKQKHKKQPEPSPALVPSLTVTTEKTYTSTSNNSISGSLKRLEDTTARFTNANFQEVSAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 HKQKHKKQPEPSPALVPSLTVTTEKTYTSTSNNSISGSLKRLEDTTARFTNANFQEVSAH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 TSSGKDVSETRGSEGKGKKSSAHSSGQRGRKPGGGRNPGTTVSAASPFPQGSFSGTPGSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TSSGKDVSETRGSEGKGKKSSAHSSGQRGRKPGGGRNPGTTVSAASPFPQGSFSGTPGSV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 KSSSGSSVQSPQDFLSFTDSDLRNDSYSHSQQSSATKDVHKGESGSQEGGVNSFSTLIGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KSSSGSSVQSPQDFLSFTDSDLRNDSYSHSQQSSATKDVHKGESGSQEGGVNSFSTLIGL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 PSTSAVTSQPKSFENSPGDLGNSSLPTAGYKRAQTSGIEEETVKEKKRKGNKQSKHGPGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PSTSAVTSQPKSFENSPGDLGNSSLPTAGYKRAQTSGIEEETVKEKKRKGNKQSKHGPGR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 PKGNKNQENVSHLSVSSASPTSSVASAAGSITSSSLQKSPTLLRNGSLQSLSVGSSPVGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PKGNKNQENVSHLSVSSASPTSSVASAAGSITSSSLQKSPTLLRNGSLQSLSVGSSPVGS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 EISMQYRHDGACPTTTFSELLNAIHNDRGDSSTLTKQELKFIGIYNSNDVAVSFPNVVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EISMQYRHDGACPTTTFSELLNAIHNDRGDSSTLTKQELKFIGIYNSNDVAVSFPNVVSG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 SGSSTPVSSSHLPQQSSGHLQQVGALSPSAVSSAAPAVATTQANTLSGSSLSQAPSHMYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SGSSTPVSSSHLPQQSSGHLQQVGALSPSAVSSAAPAVATTQANTLSGSSLSQAPSHMYG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 NRSNSSMAALIAQSENNQTDQDLGDNSRNLVGRGSSPRGSLSPRSPVSSLQIRYDQPGNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 NRSNSSMAALIAQSENNQTDQDLGDNSRNLVGRGSSPRGSLSPRSPVSSLQIRYDQPGNS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 SLENLPPVAASIEQLLERQWSEGQQFLLEQGTPSDILGMLKSLHQLQVENRRLEEQIKNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SLENLPPVAASIEQLLERQWSEGQQFLLEQGTPSDILGMLKSLHQLQVENRRLEEQIKNL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 TAKKERLQLLNAQLSVPFPTITANPSPSHQIHTFSAQTAPTTDSLNSSKSPHIGNSFLPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TAKKERLQLLNAQLSVPFPTITANPSPSHQIHTFSAQTAPTTDSLNSSKSPHIGNSFLPD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 NSLPVLNQDLTSSGQSTSSSSALSTPPPAGQSPAQQGSGVSGVQQVNGVTVGALASGMQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 NSLPVLNQDLTSSGQSTSSSSALSTPPPAGQSPAQQGSGVSGVQQVNGVTVGALASGMQP
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 VTSTIPAVSAVGGIIGALPGNQLAINGIVGALNGVMQTPVTMSQNPTPLTHTTVPPNATH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VTSTIPAVSAVGGIIGALPGNQLAINGIVGALNGVMQTPVTMSQNPTPLTHTTVPPNATH
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 PMPATLTNSASGLGLLSDQQRQILIHQQQFQQLLNSQQLTPVHRHPHFTQLPPTHFSPSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PMPATLTNSASGLGLLSDQQRQILIHQQQFQQLLNSQQLTPVHRHPHFTQLPPTHFSPSM
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 EIMQVRK
:::::::
NP_004 EIMQVRK
>>NP_001182555 (OMIM: 602409) protein AF-10 isoform c [H (1068 aa)
initn: 6504 init1: 3824 opt: 3950 Z-score: 2276.7 bits: 432.9 E(85289): 4.5e-120
Smith-Waterman score: 6488; 96.2% identity (97.1% similar) in 1029 aa overlap (1-1025:1-1013)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MVSSDRPVSLEDEVSHSMKEMIGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHGCSVAVHQACYGIVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MVSSDRPVSLEDEVSHSMKEMIGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHGCSVAVHQACYGIVQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 VPTGPWFCRKCESQERAARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQFANVSTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VPTGPWFCRKCESQERAARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQFANVSTM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 EPIVLQSVPHDRYNKTCYICDEQGRESKAATGACMTCNKHGCRQAFHVTCAQFAGLLCEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EPIVLQSVPHDRYNKTCYICDEQGRESKAATGACMTCNKHGCRQAFHVTCAQFAGLLCEE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 EGNGADNVQYCGYCKYHFSKLKKSKRGSNRSYDQSLSDSSSHSQDKHHEKEKKKYKEKDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EGNGADNVQYCGYCKYHFSKLKKSKRGSNRSYDQSLSDSSSHSQDKHHEKEKKKYKEKDK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 HKQKHKKQPEPSPALVPSLTVTTEKTYTSTSNNSISGSLKRLEDTTARFTNANFQEVSAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HKQKHKKQPEPSPALVPSLTVTTEKTYTSTSNNSISGSLKRLEDTTARFTNANFQEVSAH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 TSSGKDVSETRGSEGKGKKSSAHSSGQRGRKPGGGRNPGTTVSAASPFPQGSFSGTPGSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TSSGKDVSETRGSEGKGKKSSAHSSGQRGRKPGGGRNPGTTVSAASPFPQGSFSGTPGSV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 KSSSGSSVQSPQDFLSFTDSDLRNDSYSHSQQSSATKDVHKGESGSQEGGVNSFSTLIGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KSSSGSSVQSPQDFLSFTDSDLRNDSYSHSQQSSATKDVHKGESGSQEGGVNSFSTLIGL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 PSTSAVTSQPKSFENSPGDLGNSSLPTAGYKRAQTSGIEEETVKEKKRKGNKQSKHGPGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSTSAVTSQPKSFENSPGDLGNSSLPTAGYKRAQTSGIEEETVKEKKRKGNKQSKHGPGR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 PKGNKNQENVSHLSVSSASPTSSVASAAGSITSSSLQKSPTLLRNGSLQSLSVGSSPVGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PKGNKNQENVSHLSVSSASPTSSVASAAGSITSSSLQKSPTLLRNGSLQSLSVGSSPVGS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 EISMQYRHDGACPTTTFSELLNAIHNDRGDSSTLTKQELKFIGIYNSNDVAVSFPNVVSG
:::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
NP_001 EISMQYRHDGACPTTTFSELLNAIHN----------------GIYNSNDVAVSFPNVVSG
550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 SGSSTPVSSSHLPQQSSGHLQQVGALSPSAVSSAAPAVATTQANTLSGSSLSQAPSHMYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SGSSTPVSSSHLPQQSSGHLQQVGALSPSAVSSAAPAVATTQANTLSGSSLSQAPSHMYG
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 NRSNSSMAALIAQSENNQTDQDLGDNSRNLVGRGSSPRGSLSPRSPVSSLQIRYDQPGNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NRSNSSMAALIAQSENNQTDQDLGDNSRNLVGRGSSPRGSLSPRSPVSSLQIRYDQPGNS
650 660 670 680 690 700
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 SLENLPPVAASIEQLLERQWSEGQQFLLEQGTPSDILGMLKSLHQLQVENRRLEEQIKNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLENLPPVAASIEQLLERQWSEGQQFLLEQGTPSDILGMLKSLHQLQVENRRLEEQIKNL
710 720 730 740 750 760
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 TAKKERLQLLNAQLSVPFPTITANPSPSHQIHTFSAQTAPTTDSLNSSKSPHIGNSFLPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TAKKERLQLLNAQLSVPFPTITANPSPSHQIHTFSAQTAPTTDSLNSSKSPHIGNSFLPD
770 780 790 800 810 820
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 NSLPVLNQDLTSSGQSTSSSSALSTPPPAGQSPAQQGSGVSGVQQVNGVTVGALASGMQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NSLPVLNQDLTSSGQSTSSSSALSTPPPAGQSPAQQGSGVSGVQQVNGVTVGALASGMQP
830 840 850 860 870 880
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 VTSTIPAVSAVGGIIGALPGNQLAINGIVGALNGVMQTPVTMSQNPTPLTHTTVPPNATH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VTSTIPAVSAVGGIIGALPGNQLAINGIVGALNGVMQTPVTMSQNPTPLTHTTVPPNATH
890 900 910 920 930 940
970 980 990 1000 1010
pF1KE3 PMPATLTNSASGLGLLSDQQRQILIHQQQFQQLLNSQQLTPVHRHPHFTQL----PPTHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ... . :: :
NP_001 PMPATLTNSASGLGLLSDQQRQILIHQQQFQQLLNSQQLTPEQHQAFLYQLMQHHHQQHH
950 960 970 980 990 1000
1020
pF1KE3 SPSMEIMQVRK
.: .. .:.
NP_001 QPELQQLQIPGPTQIPINNLLAGTQAPPLHTATTNPFLTIHGDNASQKVARLSDKTGPVA
1010 1020 1030 1040 1050 1060
>>NP_001311226 (OMIM: 602409) protein AF-10 isoform f [H (823 aa)
initn: 4607 init1: 2694 opt: 2778 Z-score: 1607.3 bits: 308.7 E(85289): 8.7e-83
Smith-Waterman score: 4597; 94.1% identity (95.5% similar) in 775 aa overlap (256-1025:10-768)
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 KHHEKEKKKYKEKDKHKQKHKKQPEPSPALVPSLT-VTTEKTYTSTSNNSISGSLKRLED
.::. : ::::::::::::::::::::
NP_001 MRWGGFQIDLPSMEKVHISKTYTSTSNNSISGSLKRLED
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pF1KE3 TTARFTNANFQEVSAHTSSGKDVSETRGSEGKGKKSSAHSSGQRGRKPGGGRNPGTTVSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TTARFTNANFQEVSAHTSSGKDVSETRGSEGKGKKSSAHSSGQRGRKPGGGRNPGTTVSA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSQEGGVNSFSTLIGLPSTSAVTSQPKSFENSPGDLGNSSLPTAGYKRAQTSGIEEETVK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKKRKGNKQSKHGPGRPKGNKNQENVSHLSVSSASPTSSVASAAGSITSSSLQKSPTLLR
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YNSNDVAVSFPNVVSGSGSSTPVSSSHLPQQSSGHLQQVGALSPSAVSSAAPAVATTQAN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TLSGSSLSQAPSHMYGNRSNSSMAALIAQSENNQTDQDLGDNSRNLVGRGSSPRGSLSPR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QLQVENRRLEEQIKNLTAKKERLQLLNAQLSVPFPTITANPSPSHQIHTFSAQTAPTTDS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LNSSKSPHIGNSFLPDNSLPVLNQDLTSSGQSTSSSSALSTPPPAGQSPAQQGSGVSGVQ
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pF1KE3 QVNGVTVGALASGMQPVTSTIPAVSAVGGIIGALPGNQLAINGIVGALNGVMQTPVTMSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QVNGVTVGALASGMQPVTSTIPAVSAVGGIIGALPGNQLAINGIVGALNGVMQTPVTMSQ
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pF1KE3 NPTPLTHTTVPPNATHPMPATLTNSASGLGLLSDQQRQILIHQQQFQQLLNSQQLTPVHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ..
NP_001 NPTPLTHTTVPPNATHPMPATLTNSASGLGLLSDQQRQILIHQQQFQQLLNSQQLTPEQH
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1010 1020
pF1KE3 HPHFTQL----PPTHFSPSMEIMQVRK
. . :: : .: .. .:.
NP_001 QAFLYQLMQHHHQQHHQPELQQLQIPGPTQIPINNLLAGTQAPPLHTATTNPFLTIHGDN
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>>NP_005928 (OMIM: 600328) protein AF-17 [Homo sapiens] (1093 aa)
initn: 1845 init1: 1337 opt: 1540 Z-score: 896.6 bits: 177.6 E(85289): 3.3e-43
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10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MVSSDRPVSLEDEVSHSMKEMIGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHGCSVAVHQACYGIVQ
::::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
NP_005 VPTGPWFCRKCESQERAARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQFANVLTM
50 60 70 80 90 100
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pF1KE3 EPIVLQSVPHDRYNKTCYICDEQGRESKAATGACMTCNKHGCRQAFHVTCAQFAGLLCEE
:::::: :::::.:::::::.:::::::::.:::::::.:::::::::::::.:::::::
NP_005 EPIVLQYVPHDRFNKTCYICEEQGRESKAASGACMTCNRHGCRQAFHVTCAQMAGLLCEE
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pF1KE3 EGNGADNVQYCGYCKYHFSKLKKSKRGSNR--------------------SYDQSLSDSS
: .:::.:::::::::::.: :...:. : .: : :
NP_005 EVLEVDNVKYCGYCKYHFSKMKTSRHSSGGGGGGAGGGGGSMGGGGSGFISGRRSRSASP
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230 240 250 260 270
pF1KE3 SHSQDKH---HEK-EKKKYKEKDKHKQKHKKQPEPSPA-LVPSLTVTTEKTYTSTSNNSI
: .:.:: ::. .::. :.:.. ::::::.:: :. :.: .. :..:. .:.:..:
NP_005 STQQEKHPTHHERGQKKSRKDKERLKQKHKKRPESPPSILTPPVVPTADKVSSSASSSS-
230 240 250 260 270 280
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pF1KE3 SGSLKRLEDTTARFTNANFQEVSAHTSSGKDVSETRGSEGKGKKSSAHSSGQRGRKPGGG
: .: ...::. . :.::::::.:: ...:.: ..:
NP_005 -----------------------HHEASTQETSES-SRESKGKKSSSHSLSHKGKKLSSG
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.. .. .::.: ..: :.. :. . . ::.:: :: .: . ..:.::.
NP_005 KGVSSFTSASSS--SSSSSSSSGGPFQPAVSSLQSSPDFSAFPKLEQPEEDKYSKPTAPA
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pF1KE3 --SQQSSATKDVHKGESGSQEGGVNSFSTLIGLPSTSAVTSQPKSFENSPGDLGNSSLPT
. : .. . :.. :. ..:. .. . .:.. ... .. :::: . .
NP_005 PSAPPSPSAPEPPKADLFEQKVVFSGFGPIMRFSTTTSSSGRARA--PSPGDYKSPHVTG
380 390 400 410 420 430
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pF1KE3 AG-----YKR----AQTSGIEEET----VKEKKRKGNKQSKHGPGRPKGNKNQENVSHLS
.: .:: . : .:: .::::.:..:.:.::::::::..:.:...
NP_005 SGASAGTHKRMPALSATPVPADETPETGLKEKKHKASKRSRHGPGRPKGSRNKEGTG---
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pF1KE3 VSSASPTSSVASAAGSITSSSLQKSPTLLRNGSLQSLSVGSSPVGSEISMQYRHDGACPT
. :.:. :. :: .... :: . .::: : : .:. : . .:. :.
NP_005 -GPAAPSLPSAQLAGFTATAA---SP--FSGGSLVS-----SGLGGLSSRTFGPSGSLPS
500 510 520 530 540
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pF1KE3 TTF-SELLNAIHNDRGDSSTLTKQELKFIGIYNSNDVAVSFPNVVSGSGSSTPVSSSHLP
.. : ::.: :::.:: .: . . . :::.::: :
NP_005 LSLESPLLGA-------------------GIYTSNKDPISHSGGMLRAVCSTPLSSSLLG
550 560 570 580
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pF1KE3 QQSSGHLQQVGALSP--SAVSSAAPAVATTQANTLSGSSLSQAPSHMYGNRSNSSMAALI
... : ... :: :.. :.. ...:::. .:.::..: .:..:. ... :.
NP_005 PPGTSALPRLSR-SPFTSTLPSSSASISTTQVFSLAGSTFSLPSTHIFGT-PMGAVNPLL
590 600 610 620 630
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pF1KE3 AQSENNQTDQDLGDNSRNLVGRGSSPRGSLSPRSPVSSLQIRYDQ----P-GNSSLENLP
.:.:...:. :: : : . ::.::. ::: ::.::: .:: : :...:.
NP_005 SQAESSHTEPDLEDCS--FRCRGTSPQESLSSMSPISSLPALFDQTASAPCGGGQLDPAA
640 650 660 670 680 690
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pF1KE3 PVAASIEQLLERQWSEGQQFLLEQGTPSDILGMLKSLHQLQVENRRLEEQIKNLTAKKER
: ....:::::.: ..: : :. .:. :::.:: :: ::.::.::: .:::::::
NP_005 PGTTNMEQLLEKQ-GDG-----EAGV--NIVEMLKALHALQKENQRLQEQILSLTAKKER
700 710 720 730 740
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pF1KE3 LQLLNAQLSVPFPTITAN-PSPSHQI---HTFSAQTAPTTDSLNSSKSPHIGNSFLPDNS
::.::.:::::::.. : :. . . . . : : ..:::..:::: .:. :::
NP_005 LQILNVQLSVPFPALPAALPAANGPVPGPYGLPPQ-AGSSDSLSTSKSPPGKSSLGLDNS
750 760 770 780 790 800
850 860 870 880 890
pF1KE3 LPVLNQDLTSSGQSTSSSSALS---TPPPAG---QSPAQQGSGVSGV------QQVNGVT
: . ..: :: . :::.:: :::: :::: .. :. : ::.
NP_005 LSTSSED-PHSGCPSRSSSSLSFHSTPPPLPLLQQSPATLPLALPGAPAPLPPQPQNGL-
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pF1KE3 VGALASGMQPVTSTIPAVSAVGGIIGALPGNQ-LAINGIVGALNGVMQTPVTMSQNPTPL
: : .. . :. . :..:.: :. : .::..:.:::. . ::. :
NP_005 ------GRAPGAAGLGAMPMAEGLLGGLAGSGGLPLNGLLGGLNGAA------APNPASL
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pF1KE3 THTTVPPNATHPMPATLTNSASGLGLLSDQQRQILIHQ----QQFQQLLNSQQLTPVHRH
... : : .:. : :: :..:::..: .: ::.:::: : :::: :.
NP_005 SQAGGAP--TLQLPGCL-NS------LTEQQRHLLQQQEQQLQQLQQLLASPQLTPEHQT
920 930 940 950 960
1010 1020
pF1KE3 PHFTQLPPTHFSPSMEIMQVRK
NP_005 VVYQMIQQIQQKRELQRLQMAGGSQLPMASLLAGSSTPLLSAGTPGLLPTASAPPLLPAG
970 980 990 1000 1010 1020
>>XP_006721974 (OMIM: 600328) PREDICTED: protein AF-17 i (1067 aa)
initn: 1830 init1: 1322 opt: 1481 Z-score: 863.0 bits: 171.3 E(85289): 2.5e-41
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10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MVSSDRPVSLEDEVSHSMKEMIGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHGCSVAVHQACYGIVQ
::::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
XP_006 MKEMVGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHACSVAVHQACYGIVQ
10 20 30 40
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pF1KE3 VPTGPWFCRKCESQERAARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQFANVSTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
XP_006 VPTGPWFCRKCESQERAARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQFANVLTM
50 60 70 80 90 100
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pF1KE3 EPIVLQSVPHDRYNKTCYICDEQGRESKAATGACMTCNKHGCRQAFHVTCAQFAGLLCEE
:::::: :::::.:::::::.:::::::::.:::::::.:::::::::::::.:::::::
XP_006 EPIVLQYVPHDRFNKTCYICEEQGRESKAASGACMTCNRHGCRQAFHVTCAQMAGLLCEE
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220
pF1KE3 EGNGADNVQYCGYCKYHFSKLKKSKRGSNR--------------------SYDQSLSDSS
: .:::.:::::::::::.: :...:. : .: : :
XP_006 EVLEVDNVKYCGYCKYHFSKMKTSRHSSGGGGGGAGGGGGSMGGGGSGFISGRRSRSASP
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230 240 250 260 270
pF1KE3 SHSQDKH---HEK-EKKKYKEKDKHKQKHKKQPEPSPA-LVPSLTVTTEKTYTSTSNNSI
: .:.:: ::. .::. :.:.. ::::::.:: :. :.: .. :..:. .:.:..:
XP_006 STQQEKHPTHHERGQKKSRKDKERLKQKHKKRPESPPSILTPPVVPTADKVSSSASSSS-
230 240 250 260 270 280
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pF1KE3 SGSLKRLEDTTARFTNANFQEVSAHTSSGKDVSETRGSEGKGKKSSAHSSGQRGRKPGGG
: .: ...::. . :.::::::.:: ...:.: ..:
XP_006 -----------------------HHEASTQETSES-SRESKGKKSSSHSLSHKGKKLSSG
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pF1KE3 RNPGTTVSAASPFPQGSFSGTPGSVKSSSGSSVQSPQDFLSFTDSDLRNDSYSHSQQSSA
. ::. . : .::. : ....:.. :. . . . : :
XP_006 K-----VSSLQSSP--DFSAFP---------KLEQPEE-----DKYSKPTAPAPSAPPSP
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pF1KE3 TK-DVHKGESGSQEGGVNSFSTLIGLPSTSAVTSQPKSFENSPGDLGNSSLPTAG-----
. . :.. :. ..:. .. . .:.. ... .. :::: . . .:
XP_006 SAPEPPKADLFEQKVVFSGFGPIMRFSTTTSSSGRARA--PSPGDYKSPHVTGSGASAGT
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pF1KE3 YKR----AQTSGIEEET----VKEKKRKGNKQSKHGPGRPKGNKNQENVSHLSVSSASPT
.:: . : .:: .::::.:..:.:.::::::::..:.:... . :.:.
XP_006 HKRMPALSATPVPADETPETGLKEKKHKASKRSRHGPGRPKGSRNKEGTG----GPAAPS
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pF1KE3 SSVASAAGSITSSSLQKSPTLLRNGSLQSLSVGSSPVGSEISMQYRHDGACPTTTF-SEL
:. :: .... :: . .::: : : .:. : . .:. :. .. : :
XP_006 LPSAQLAGFTATAA---SP--FSGGSLVS-----SGLGGLSSRTFGPSGSLPSLSLESPL
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pF1KE3 LNAIHNDRGDSSTLTKQELKFIGIYNSNDVAVSFPNVVSGSGSSTPVSSSHLPQQSSGHL
:.: :::.:: .: . . . :::.::: : ... :
XP_006 LGA-------------------GIYTSNKDPISHSGGMLRAVCSTPLSSSLLGPPGTSAL
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pF1KE3 QQVGALSP--SAVSSAAPAVATTQANTLSGSSLSQAPSHMYGNRSNSSMAALIAQSENNQ
... :: :.. :.. ...:::. .:.::..: .:..:. ... :..:.:...
XP_006 PRLSR-SPFTSTLPSSSASISTTQVFSLAGSTFSLPSTHIFGT-PMGAVNPLLSQAESSH
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pF1KE3 TDQDLGDNSRNLVGRGSSPRGSLSPRSPVSSLQIRYDQ----P-GNSSLENLPPVAASIE
:. :: : : . ::.::. ::: ::.::: .:: : :...:. : ....:
XP_006 TEPDLEDCS--FRCRGTSPQESLSSMSPISSLPALFDQTASAPCGGGQLDPAAPGTTNME
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pF1KE3 QLLERQWSEGQQFLLEQGTPSDILGMLKSLHQLQVENRRLEEQIKNLTAKKERLQLLNAQ
::::.: ..: : :. .:. :::.:: :: ::.::.::: .:::::::::.::.:
XP_006 QLLEKQ-GDG-----EAGV--NIVEMLKALHALQKENQRLQEQILSLTAKKERLQILNVQ
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pF1KE3 LSVPFPTITAN-PSPSHQI---HTFSAQTAPTTDSLNSSKSPHIGNSFLPDNSLPVLNQD
::::::.. : :. . . . . : : ..:::..:::: .:. :::: . ..:
XP_006 LSVPFPALPAALPAANGPVPGPYGLPPQ-AGSSDSLSTSKSPPGKSSLGLDNSLSTSSED
740 750 760 770 780
850 860 870 880 890
pF1KE3 LTSSGQSTSSSSALS---TPPPAG---QSPAQQGSGVSGV------QQVNGVTVGALASG
:: . :::.:: :::: :::: .. :. : ::. :
XP_006 -PHSGCPSRSSSSLSFHSTPPPLPLLQQSPATLPLALPGAPAPLPPQPQNGL-------G
790 800 810 820 830 840
900 910 920 930 940 950
pF1KE3 MQPVTSTIPAVSAVGGIIGALPGNQ-LAINGIVGALNGVMQTPVTMSQNPTPLTHTTVPP
: .. . :. . :..:.: :. : .::..:.:::. . ::. :... :
XP_006 RAPGAAGLGAMPMAEGLLGGLAGSGGLPLNGLLGGLNGAA------APNPASLSQAGGAP
850 860 870 880 890
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pF1KE3 NATHPMPATLTNSASGLGLLSDQQRQILIHQ----QQFQQLLNSQQLTPVHRHPHFTQLP
: .:. : :: :..:::..: .: ::.:::: : :::: :.
XP_006 --TLQLPGCL-NS------LTEQQRHLLQQQEQQLQQLQQLLASPQLTPEHQTVVYQMIQ
900 910 920 930 940
1020
pF1KE3 PTHFSPSMEIMQVRK
XP_006 QIQQKRELQRLQMAGGSQLPMASLLAGSSTPLLSAGTPGLLPTASAPPLLPAGALVAPSL
950 960 970 980 990 1000
>>XP_016880139 (OMIM: 600328) PREDICTED: protein AF-17 i (652 aa)
initn: 1506 init1: 1337 opt: 1467 Z-score: 858.1 bits: 169.7 E(85289): 4.6e-41
Smith-Waterman score: 1672; 45.7% identity (67.1% similar) in 674 aa overlap (18-642:1-611)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MVSSDRPVSLEDEVSHSMKEMIGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHGCSVAVHQACYGIVQ
::::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
XP_016 MKEMVGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHACSVAVHQACYGIVQ
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 VPTGPWFCRKCESQERAARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQFANVSTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
XP_016 VPTGPWFCRKCESQERAARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQFANVLTM
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 EPIVLQSVPHDRYNKTCYICDEQGRESKAATGACMTCNKHGCRQAFHVTCAQFAGLLCEE
:::::: :::::.:::::::.:::::::::.:::::::.:::::::::::::.:::::::
XP_016 EPIVLQYVPHDRFNKTCYICEEQGRESKAASGACMTCNRHGCRQAFHVTCAQMAGLLCEE
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220
pF1KE3 EGNGADNVQYCGYCKYHFSKLKKSKRGSNR--------------------SYDQSLSDSS
: .:::.:::::::::::.: :...:. : .: : :
XP_016 EVLEVDNVKYCGYCKYHFSKMKTSRHSSGGGGGGAGGGGGSMGGGGSGFISGRRSRSASP
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270
pF1KE3 SHSQDKH---HEK-EKKKYKEKDKHKQKHKKQPEPSPA-LVPSLTVTTEKTYTSTSNNSI
: .:.:: ::. .::. :.:.. ::::::.:: :. :.: .. :..:. .:.:..:
XP_016 STQQEKHPTHHERGQKKSRKDKERLKQKHKKRPESPPSILTPPVVPTADKVSSSASSSS-
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 SGSLKRLEDTTARFTNANFQEVSAHTSSGKDVSETRGSEGKGKKSSAHSSGQRGRKPGGG
: .: ...::. . :.::::::.:: ...:.: ..:
XP_016 -----------------------HHEASTQETSES-SRESKGKKSSSHSLSHKGKKLSSG
290 300 310
340 350 360 370 380
pF1KE3 RNPGTTVSAASPFPQGSFSGTPGSVKSSSGSSVQSPQDFLSFTDSDL-RNDSYSH-----
.. .. .::.: ..: :.. :. . . ::.:: :: .: . ..:.::.
XP_016 KGVSSFTSASS--SSSSSSSSSGGPFQPAVSSLQSSPDFSAFPKLEQPEEDKYSKPTAPA
320 330 340 350 360 370
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 --SQQSSATKDVHKGESGSQEGGVNSFSTLIGLPSTSAVTSQPKSFENSPGDLGNSSLPT
. : .. . :.. :. ..:. .. . .:. .:. .. :::: . .
XP_016 PSAPPSPSAPEPPKADLFEQKVVFSGFGPIMRFSTTT--SSSGRARAPSPGDYKSPHVTG
380 390 400 410 420 430
450 460 470 480 490
pF1KE3 AG-----YKR----AQTSGIEEET----VKEKKRKGNKQSKHGPGRPKGNKNQENVSHLS
.: .:: . : .:: .::::.:..:.:.::::::::..:.:...
XP_016 SGASAGTHKRMPALSATPVPADETPETGLKEKKHKASKRSRHGPGRPKGSRNKEGTG---
440 450 460 470 480 490
500 510 520 530 540 550
pF1KE3 VSSASPTSSVASAAGSITSSSLQKSPTLLRNGSLQSLSVGSSPVGSEISMQYRHDGACPT
. :.:. :. :: .... :: . .::: : : .:. : . .:. :.
XP_016 -GPAAPSLPSAQLAGFTATAA---SP--FSGGSLVS-----SGLGGLSSRTFGPSGSLPS
500 510 520 530 540
560 570 580 590 600 610
pF1KE3 TTF-SELLNAIHNDRGDSSTLTKQELKFIGIYNSNDVAVSFPNVVSGSGSSTPVSSSHLP
.. : ::.: :::.:: .: . . . :::.::: :
XP_016 LSLESPLLGA-------------------GIYTSNKDPISHSGGMLRAVCSTPLSSSLLG
550 560 570 580
620 630 640 650 660 670
pF1KE3 QQSSGHLQQVGALSP--SAVSSAAPAVATTQANTLSGSSLSQAPSHMYGNRSNSSMAALI
... : .. . :: :.. :.. ...:::
XP_016 PPGTSALPRL-SRSPFTSTLPSSSASISTTQVGHPSPACDPRKNGRAFWLPPPSGHCPPC
590 600 610 620 630 640
680 690 700 710 720 730
pF1KE3 AQSENNQTDQDLGDNSRNLVGRGSSPRGSLSPRSPVSSLQIRYDQPGNSSLENLPPVAAS
XP_016 KNKQAGCGGSRL
650
>>XP_016880138 (OMIM: 600328) PREDICTED: protein AF-17 i (657 aa)
initn: 1532 init1: 1337 opt: 1467 Z-score: 858.1 bits: 169.7 E(85289): 4.7e-41
Smith-Waterman score: 1744; 44.7% identity (67.3% similar) in 716 aa overlap (18-684:1-652)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MVSSDRPVSLEDEVSHSMKEMIGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHGCSVAVHQACYGIVQ
::::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
XP_016 MKEMVGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHACSVAVHQACYGIVQ
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 VPTGPWFCRKCESQERAARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQFANVSTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
XP_016 VPTGPWFCRKCESQERAARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQFANVLTM
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 EPIVLQSVPHDRYNKTCYICDEQGRESKAATGACMTCNKHGCRQAFHVTCAQFAGLLCEE
:::::: :::::.:::::::.:::::::::.:::::::.:::::::::::::.:::::::
XP_016 EPIVLQYVPHDRFNKTCYICEEQGRESKAASGACMTCNRHGCRQAFHVTCAQMAGLLCEE
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220
pF1KE3 EGNGADNVQYCGYCKYHFSKLKKSKRGSNR--------------------SYDQSLSDSS
: .:::.:::::::::::.: :...:. : .: : :
XP_016 EVLEVDNVKYCGYCKYHFSKMKTSRHSSGGGGGGAGGGGGSMGGGGSGFISGRRSRSASP
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270
pF1KE3 SHSQDKH---HEK-EKKKYKEKDKHKQKHKKQPEPSPA-LVPSLTVTTEKTYTSTSNNSI
: .:.:: ::. .::. :.:.. ::::::.:: :. :.: .. :..:. .:.:..:
XP_016 STQQEKHPTHHERGQKKSRKDKERLKQKHKKRPESPPSILTPPVVPTADKVSSSASSSS-
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 SGSLKRLEDTTARFTNANFQEVSAHTSSGKDVSETRGSEGKGKKSSAHSSGQRGRKPGGG
: .: ...::. . :.::::::.:: ...:.: ..:
XP_016 -----------------------HHEASTQETSES-SRESKGKKSSSHSLSHKGKKLSSG
290 300 310
340 350 360 370 380
pF1KE3 RNPGTTVSAASPFPQGSFSGTPGSVKSSSGSSVQSPQDFLSFTDSDL-RNDSYSH-----
.. .. .::.: ..: :.. :. . . ::.:: :: .: . ..:.::.
XP_016 KGVSSFTSASSS--SSSSSSSSGGPFQPAVSSLQSSPDFSAFPKLEQPEEDKYSKPTAPA
320 330 340 350 360 370
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 --SQQSSATKDVHKGESGSQEGGVNSFSTLIGLPSTSAVTSQPKSFENSPGDLGNSSLPT
. : .. . :.. :. ..:. .. . .:. .:. .. :::: . .
XP_016 PSAPPSPSAPEPPKADLFEQKVVFSGFGPIMRFSTTT--SSSGRARAPSPGDYKSPHVTG
380 390 400 410 420 430
450 460 470 480 490
pF1KE3 AG-----YKR----AQTSGIEEET----VKEKKRKGNKQSKHGPGRPKGNKNQENVSHLS
.: .:: . : .:: .::::.:..:.:.::::::::..:.:...
XP_016 SGASAGTHKRMPALSATPVPADETPETGLKEKKHKASKRSRHGPGRPKGSRNKEGTG---
440 450 460 470 480 490
500 510 520 530 540 550
pF1KE3 VSSASPTSSVASAAGSITSSSLQKSPTLLRNGSLQSLSVGSSPVGSEISMQYRHDGACPT
. :.:. :. :: .... :: . .::: : : .:. : . .:. :.
XP_016 -GPAAPSLPSAQLAGFTATAA---SP--FSGGSLVS-----SGLGGLSSRTFGPSGSLPS
500 510 520 530 540
560 570 580 590 600 610
pF1KE3 TTF-SELLNAIHNDRGDSSTLTKQELKFIGIYNSNDVAVSFPNVVSGSGSSTPVSSSHLP
.. : ::.: :::.:: .: . . . :::.::: :
XP_016 LSLESPLLGA-------------------GIYTSNKDPISHSGGMLRAVCSTPLSSSLLG
550 560 570 580
620 630 640 650 660 670
pF1KE3 QQSSGHLQQVGALSP--SAVSSAAPAVATTQANTLSGSSLSQAPSHMYGNRSNSSMAALI
... : .. . :: :.. :.. ...:::. .:.::..: .:..:. ... :.
XP_016 PPGTSALPRL-SRSPFTSTLPSSSASISTTQVFSLAGSTFSLPSTHIFGT-PMGAVNPLL
590 600 610 620 630
680 690 700 710 720 730
pF1KE3 AQSENNQTDQDLGDNSRNLVGRGSSPRGSLSPRSPVSSLQIRYDQPGNSSLENLPPVAAS
.:.:...:: :
XP_016 SQAESSHTDPRKGIGRWI
640 650
>>XP_016880137 (OMIM: 600328) PREDICTED: protein AF-17 i (889 aa)
initn: 718 init1: 213 opt: 711 Z-score: 423.3 bits: 89.7 E(85289): 7.7e-17
Smith-Waterman score: 1053; 33.8% identity (60.3% similar) in 846 aa overlap (214-1004:13-760)
190 200 210 220 230
pF1KE3 GADNVQYCGYCKYHFSKLKKSKRGSNRSYDQSLSDSSSHSQDKH---HEK-EKKKYKEKD
.: : : : .:.:: ::. .::. :.:.
XP_016 MGGGGSGFISGRRSRSASPSTQQEKHPTHHERGQKKSRKDKE
10 20 30 40
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 KHKQKHKKQPEPSPA-LVPSLTVTTEKTYTSTSNNSISGSLKRLEDTTARFTNANFQEVS
. ::::::.:: :. :.: .. :..:. .:.:..:
XP_016 RLKQKHKKRPESPPSILTPPVVPTADKVSSSASSSS------------------------
50 60 70
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 AHTSSGKDVSETRGSEGKGKKSSAHSSGQRGRKPGGGRNPGTTVSAASPFPQGSFSGTPG
: .: ...::. . :.::::::.:: ...:.: ..:.. .. .::.: ..: :.. :
XP_016 HHEASTQETSES-SRESKGKKSSSHSLSHKGKKLSSGKGVSSFTSASSS--SSSSSSSSG
80 90 100 110 120 130
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 SVKSSSGSSVQSPQDFLSFTDSDL-RNDSYSH-------SQQSSATKDVHKGESGSQEGG
. . . ::.:: :: .: . ..:.::. . : .. . :.. :.
XP_016 GPFQPAVSSLQSSPDFSAFPKLEQPEEDKYSKPTAPAPSAPPSPSAPEPPKADLFEQKVV
140 150 160 170 180 190
420 430 440 450 460
pF1KE3 VNSFSTLIGLPSTSAVTSQPKSFENSPGDLGNSSLPTAG-----YKR----AQTSGIEEE
..:. .. . .:. .:. .. :::: . . .: .:: . : .:
XP_016 FSGFGPIMRFSTTT--SSSGRARAPSPGDYKSPHVTGSGASAGTHKRMPALSATPVPADE
200 210 220 230 240 250
470 480 490 500 510
pF1KE3 T----VKEKKRKGNKQSKHGPGRPKGNKNQENVSHLSVSSASPTSSVASAAGSITSSSLQ
: .::::.:..:.:.::::::::..:.:... . :.:. :. :: ....
XP_016 TPETGLKEKKHKASKRSRHGPGRPKGSRNKEGTG----GPAAPSLPSAQLAGFTATAA--
260 270 280 290 300
520 530 540 550 560 570
pF1KE3 KSPTLLRNGSLQSLSVGSSPVGSEISMQYRHDGACPTTTF-SELLNAIHNDRGDSSTLTK
:: . .::: : : .:. : . .:. :. .. : ::.:
XP_016 -SP--FSGGSLVS-----SGLGGLSSRTFGPSGSLPSLSLESPLLGA-------------
310 320 330 340
580 590 600 610 620 630
pF1KE3 QELKFIGIYNSNDVAVSFPNVVSGSGSSTPVSSSHLPQQSSGHLQQVGALSP--SAVSSA
:::.:: .: . . . :::.::: : ... : .. . :: :.. :.
XP_016 ------GIYTSNKDPISHSGGMLRAVCSTPLSSSLLGPPGTSALPRL-SRSPFTSTLPSS
350 360 370 380 390
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pF1KE3 APAVATTQANTLSGSSLSQAPSHMYGNRSNSSMAALIAQSENNQTDQDLGDNSRNLVGRG
. ...:::. .:.::..: .:..:. ... :..:.:...:. :: : : . ::
XP_016 SASISTTQVFSLAGSTFSLPSTHIFGT-PMGAVNPLLSQAESSHTEPDLEDCS--FRCRG
400 410 420 430 440 450
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pF1KE3 SSPRGSLSPRSPVSSLQIRYDQ----P-GNSSLENLPPVAASIEQLLERQWSEGQQFLLE
.::. ::: ::.::: .:: : :...:. : ....:::::.: ..: :
XP_016 TSPQESLSSMSPISSLPALFDQTASAPCGGGQLDPAAPGTTNMEQLLEKQ-GDG-----E
460 470 480 490 500 510
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pF1KE3 QGTPSDILGMLKSLHQLQVENRRLEEQIKNLTAKKERLQLLNAQLSVPFPTITAN-PSPS
:. .:. :::.:: :: ::.::.::: .:::::::::.::.:::::::.. : :. .
XP_016 AGV--NIVEMLKALHALQKENQRLQEQILSLTAKKERLQILNVQLSVPFPALPAALPAAN
520 530 540 550 560
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pF1KE3 HQI---HTFSAQTAPTTDSLNSSKSPHIGNSFLPDNSLPVLNQDLTSSGQSTSSSSALS-
. . . : : ..:::..:::: .:. :::: . ..: :: . :::.::
XP_016 GPVPGPYGLPPQ-AGSSDSLSTSKSPPGKSSLGLDNSLSTSSED-PHSGCPSRSSSSLSF
570 580 590 600 610 620
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pF1KE3 --TPPPAG---QSPAQQGSGVSGV------QQVNGVTVGALASGMQPVTSTIPAVSAVGG
:::: :::: .. :. : ::. : : .. . :. . :
XP_016 HSTPPPLPLLQQSPATLPLALPGAPAPLPPQPQNGL-------GRAPGAAGLGAMPMAEG
630 640 650 660 670
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pF1KE3 IIGALPGNQ-LAINGIVGALNGVMQTPVTMSQNPTPLTHTTVPPNATHPMPATLTNSASG
..:.: :. : .::..:.:::. . ::. :... : : .:. : ::
XP_016 LLGGLAGSGGLPLNGLLGGLNGA------AAPNPASLSQAGGAP--TLQLPGCL-NS---
680 690 700 710 720
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pF1KE3 LGLLSDQQRQILIHQ----QQFQQLLNSQQLTPVHRHPHFTQLPPTHFSPSMEIMQVRK
:..:::..: .: ::.:::: : :::: :.
XP_016 ---LTEQQRHLLQQQEQQLQQLQQLLASPQLTPEHQTVVYQMIQQIQQKRELQRLQMAGG
730 740 750 760 770 780
XP_016 SQLPMASLLAGSSTPLLSAGTPGLLPTASAPPLLPAGALVAPSLGNNTSLMAAAAAAAAV
790 800 810 820 830 840
>>NP_001182557 (OMIM: 602409) protein AF-10 isoform e [H (179 aa)
initn: 594 init1: 594 opt: 609 Z-score: 375.2 bits: 78.5 E(85289): 3.7e-14
Smith-Waterman score: 609; 74.6% identity (80.3% similar) in 122 aa overlap (1-117:1-117)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MVSSDRPVSLEDEVSHSMKEMIGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHGCSVAVHQACYGIVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MVSSDRPVSLEDEVSHSMKEMIGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHGCSVAVHQACYGIVQ
10 20 30 40 50 60
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pF1KE3 VPTGPWFCRKCESQERAARVR-CELCPHKDGALKRTDN--GGWA--HVVCALYIPEVQFA
:::::::::::::::::::: :. : : ..: :. : .:: :. .
NP_001 VPTGPWFCRKCESQERAARVMVCNSC-----WLASSENVTPGYIEHHCACASPHPRCLVS
70 80 90 100 110
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pF1KE3 NVSTMEPIVLQSVPHDRYNKTCYICDEQGRESKAATGACMTCNKHGCRQAFHVTCAQFAG
::
NP_001 NVPPVSGALMHCFWACLTTAAFFGPQSFTTCHMSFLVSRDILFYIYGFMPFISVVIWRFK
120 130 140 150 160 170
>>NP_001182559 (OMIM: 602409) protein AF-10 isoform e [H (179 aa)
initn: 594 init1: 594 opt: 609 Z-score: 375.2 bits: 78.5 E(85289): 3.7e-14
Smith-Waterman score: 609; 74.6% identity (80.3% similar) in 122 aa overlap (1-117:1-117)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MVSSDRPVSLEDEVSHSMKEMIGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHGCSVAVHQACYGIVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MVSSDRPVSLEDEVSHSMKEMIGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHGCSVAVHQACYGIVQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE3 VPTGPWFCRKCESQERAARVR-CELCPHKDGALKRTDN--GGWA--HVVCALYIPEVQFA
:::::::::::::::::::: :. : : ..: :. : .:: :. .
NP_001 VPTGPWFCRKCESQERAARVMVCNSC-----WLASSENVTPGYIEHHCACASPHPRCLVS
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 NVSTMEPIVLQSVPHDRYNKTCYICDEQGRESKAATGACMTCNKHGCRQAFHVTCAQFAG
::
NP_001 NVPPVSGALMHCFWACLTTAAFFGPQSFTTCHMSFLVSRDILFYIYGFMPFISVVIWRFK
120 130 140 150 160 170
1027 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]