Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3347
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3347, 1027 aa
1>>>pF1KE3347 1027 - 1027 aa - 1027 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.4219+/-0.000974; mu= -1.3485+/- 0.059
mean_var=245.5183+/-49.414, 0's: 0 Z-trim(113.0): 47 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.081853
statistics sampled from 13675 (13712) to 13675 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.734), E-opt: 0.2 (0.421), width: 16
Scan time: 5.680
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7135.1 MLLT10 gene_id:8028|Hs108|chr10 (1027) 6799 816.6 0
CCDS55708.1 MLLT10 gene_id:8028|Hs108|chr10 (1068) 3950 480.2 1e-134
CCDS11327.1 MLLT6 gene_id:4302|Hs108|chr17 (1093) 1540 195.6 4.9e-49
CCDS55707.1 MLLT10 gene_id:8028|Hs108|chr10 ( 179) 609 85.3 1.3e-16
CCDS55706.1 MLLT10 gene_id:8028|Hs108|chr10 ( 126) 594 83.4 3.3e-16
CCDS82729.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3 (1119) 614 86.2 4.1e-16
CCDS82730.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3 (1213) 614 86.3 4.4e-16
CCDS2575.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3 (1214) 614 86.3 4.4e-16
CCDS33692.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3 (1220) 614 86.3 4.4e-16
CCDS14080.1 BRD1 gene_id:23774|Hs108|chr22 (1058) 584 82.7 4.6e-15
CCDS77686.1 BRD1 gene_id:23774|Hs108|chr22 (1189) 584 82.7 5e-15
CCDS34437.1 BRPF3 gene_id:27154|Hs108|chr6 (1205) 567 80.7 2e-14
CCDS47542.1 PHF14 gene_id:9678|Hs108|chr7 ( 888) 522 75.3 6.3e-13
CCDS47134.1 JADE1 gene_id:79960|Hs108|chr4 ( 509) 486 71.0 7.4e-12
CCDS75191.1 JADE1 gene_id:79960|Hs108|chr4 ( 830) 486 71.1 1.1e-11
CCDS34062.1 JADE1 gene_id:79960|Hs108|chr4 ( 842) 486 71.1 1.1e-11
CCDS4176.1 JADE2 gene_id:23338|Hs108|chr5 ( 790) 484 70.8 1.3e-11
CCDS75305.1 JADE2 gene_id:23338|Hs108|chr5 ( 791) 484 70.8 1.3e-11
CCDS78061.1 JADE2 gene_id:23338|Hs108|chr5 ( 834) 484 70.8 1.3e-11
CCDS14271.1 JADE3 gene_id:9767|Hs108|chrX ( 823) 466 68.7 5.8e-11
>>CCDS7135.1 MLLT10 gene_id:8028|Hs108|chr10 (1027 aa)
initn: 6799 init1: 6799 opt: 6799 Z-score: 4350.6 bits: 816.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6799; 100.0% identity (100.0% similar) in 1027 aa overlap (1-1027:1-1027)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MVSSDRPVSLEDEVSHSMKEMIGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHGCSVAVHQACYGIVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 MVSSDRPVSLEDEVSHSMKEMIGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHGCSVAVHQACYGIVQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 VPTGPWFCRKCESQERAARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQFANVSTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 VPTGPWFCRKCESQERAARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQFANVSTM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 EPIVLQSVPHDRYNKTCYICDEQGRESKAATGACMTCNKHGCRQAFHVTCAQFAGLLCEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 EPIVLQSVPHDRYNKTCYICDEQGRESKAATGACMTCNKHGCRQAFHVTCAQFAGLLCEE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 EGNGADNVQYCGYCKYHFSKLKKSKRGSNRSYDQSLSDSSSHSQDKHHEKEKKKYKEKDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 EGNGADNVQYCGYCKYHFSKLKKSKRGSNRSYDQSLSDSSSHSQDKHHEKEKKKYKEKDK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 HKQKHKKQPEPSPALVPSLTVTTEKTYTSTSNNSISGSLKRLEDTTARFTNANFQEVSAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 HKQKHKKQPEPSPALVPSLTVTTEKTYTSTSNNSISGSLKRLEDTTARFTNANFQEVSAH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 TSSGKDVSETRGSEGKGKKSSAHSSGQRGRKPGGGRNPGTTVSAASPFPQGSFSGTPGSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 TSSGKDVSETRGSEGKGKKSSAHSSGQRGRKPGGGRNPGTTVSAASPFPQGSFSGTPGSV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 KSSSGSSVQSPQDFLSFTDSDLRNDSYSHSQQSSATKDVHKGESGSQEGGVNSFSTLIGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 KSSSGSSVQSPQDFLSFTDSDLRNDSYSHSQQSSATKDVHKGESGSQEGGVNSFSTLIGL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 PSTSAVTSQPKSFENSPGDLGNSSLPTAGYKRAQTSGIEEETVKEKKRKGNKQSKHGPGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 PSTSAVTSQPKSFENSPGDLGNSSLPTAGYKRAQTSGIEEETVKEKKRKGNKQSKHGPGR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 PKGNKNQENVSHLSVSSASPTSSVASAAGSITSSSLQKSPTLLRNGSLQSLSVGSSPVGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 PKGNKNQENVSHLSVSSASPTSSVASAAGSITSSSLQKSPTLLRNGSLQSLSVGSSPVGS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 EISMQYRHDGACPTTTFSELLNAIHNDRGDSSTLTKQELKFIGIYNSNDVAVSFPNVVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 EISMQYRHDGACPTTTFSELLNAIHNDRGDSSTLTKQELKFIGIYNSNDVAVSFPNVVSG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 SGSSTPVSSSHLPQQSSGHLQQVGALSPSAVSSAAPAVATTQANTLSGSSLSQAPSHMYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 SGSSTPVSSSHLPQQSSGHLQQVGALSPSAVSSAAPAVATTQANTLSGSSLSQAPSHMYG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 NRSNSSMAALIAQSENNQTDQDLGDNSRNLVGRGSSPRGSLSPRSPVSSLQIRYDQPGNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 NRSNSSMAALIAQSENNQTDQDLGDNSRNLVGRGSSPRGSLSPRSPVSSLQIRYDQPGNS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 SLENLPPVAASIEQLLERQWSEGQQFLLEQGTPSDILGMLKSLHQLQVENRRLEEQIKNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 SLENLPPVAASIEQLLERQWSEGQQFLLEQGTPSDILGMLKSLHQLQVENRRLEEQIKNL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 TAKKERLQLLNAQLSVPFPTITANPSPSHQIHTFSAQTAPTTDSLNSSKSPHIGNSFLPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 TAKKERLQLLNAQLSVPFPTITANPSPSHQIHTFSAQTAPTTDSLNSSKSPHIGNSFLPD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 NSLPVLNQDLTSSGQSTSSSSALSTPPPAGQSPAQQGSGVSGVQQVNGVTVGALASGMQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 NSLPVLNQDLTSSGQSTSSSSALSTPPPAGQSPAQQGSGVSGVQQVNGVTVGALASGMQP
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 VTSTIPAVSAVGGIIGALPGNQLAINGIVGALNGVMQTPVTMSQNPTPLTHTTVPPNATH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 VTSTIPAVSAVGGIIGALPGNQLAINGIVGALNGVMQTPVTMSQNPTPLTHTTVPPNATH
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 PMPATLTNSASGLGLLSDQQRQILIHQQQFQQLLNSQQLTPVHRHPHFTQLPPTHFSPSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 PMPATLTNSASGLGLLSDQQRQILIHQQQFQQLLNSQQLTPVHRHPHFTQLPPTHFSPSM
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 EIMQVRK
:::::::
CCDS71 EIMQVRK
>>CCDS55708.1 MLLT10 gene_id:8028|Hs108|chr10 (1068 aa)
initn: 6504 init1: 3824 opt: 3950 Z-score: 2532.1 bits: 480.2 E(32554): 1e-134
Smith-Waterman score: 6488; 96.2% identity (97.1% similar) in 1029 aa overlap (1-1025:1-1013)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MVSSDRPVSLEDEVSHSMKEMIGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHGCSVAVHQACYGIVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MVSSDRPVSLEDEVSHSMKEMIGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHGCSVAVHQACYGIVQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 VPTGPWFCRKCESQERAARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQFANVSTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VPTGPWFCRKCESQERAARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQFANVSTM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 EPIVLQSVPHDRYNKTCYICDEQGRESKAATGACMTCNKHGCRQAFHVTCAQFAGLLCEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EPIVLQSVPHDRYNKTCYICDEQGRESKAATGACMTCNKHGCRQAFHVTCAQFAGLLCEE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 EGNGADNVQYCGYCKYHFSKLKKSKRGSNRSYDQSLSDSSSHSQDKHHEKEKKKYKEKDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EGNGADNVQYCGYCKYHFSKLKKSKRGSNRSYDQSLSDSSSHSQDKHHEKEKKKYKEKDK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 HKQKHKKQPEPSPALVPSLTVTTEKTYTSTSNNSISGSLKRLEDTTARFTNANFQEVSAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 HKQKHKKQPEPSPALVPSLTVTTEKTYTSTSNNSISGSLKRLEDTTARFTNANFQEVSAH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 TSSGKDVSETRGSEGKGKKSSAHSSGQRGRKPGGGRNPGTTVSAASPFPQGSFSGTPGSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TSSGKDVSETRGSEGKGKKSSAHSSGQRGRKPGGGRNPGTTVSAASPFPQGSFSGTPGSV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 KSSSGSSVQSPQDFLSFTDSDLRNDSYSHSQQSSATKDVHKGESGSQEGGVNSFSTLIGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KSSSGSSVQSPQDFLSFTDSDLRNDSYSHSQQSSATKDVHKGESGSQEGGVNSFSTLIGL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 PSTSAVTSQPKSFENSPGDLGNSSLPTAGYKRAQTSGIEEETVKEKKRKGNKQSKHGPGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PSTSAVTSQPKSFENSPGDLGNSSLPTAGYKRAQTSGIEEETVKEKKRKGNKQSKHGPGR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 PKGNKNQENVSHLSVSSASPTSSVASAAGSITSSSLQKSPTLLRNGSLQSLSVGSSPVGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PKGNKNQENVSHLSVSSASPTSSVASAAGSITSSSLQKSPTLLRNGSLQSLSVGSSPVGS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 EISMQYRHDGACPTTTFSELLNAIHNDRGDSSTLTKQELKFIGIYNSNDVAVSFPNVVSG
:::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
CCDS55 EISMQYRHDGACPTTTFSELLNAIHN----------------GIYNSNDVAVSFPNVVSG
550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 SGSSTPVSSSHLPQQSSGHLQQVGALSPSAVSSAAPAVATTQANTLSGSSLSQAPSHMYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SGSSTPVSSSHLPQQSSGHLQQVGALSPSAVSSAAPAVATTQANTLSGSSLSQAPSHMYG
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 NRSNSSMAALIAQSENNQTDQDLGDNSRNLVGRGSSPRGSLSPRSPVSSLQIRYDQPGNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NRSNSSMAALIAQSENNQTDQDLGDNSRNLVGRGSSPRGSLSPRSPVSSLQIRYDQPGNS
650 660 670 680 690 700
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 SLENLPPVAASIEQLLERQWSEGQQFLLEQGTPSDILGMLKSLHQLQVENRRLEEQIKNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SLENLPPVAASIEQLLERQWSEGQQFLLEQGTPSDILGMLKSLHQLQVENRRLEEQIKNL
710 720 730 740 750 760
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 TAKKERLQLLNAQLSVPFPTITANPSPSHQIHTFSAQTAPTTDSLNSSKSPHIGNSFLPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TAKKERLQLLNAQLSVPFPTITANPSPSHQIHTFSAQTAPTTDSLNSSKSPHIGNSFLPD
770 780 790 800 810 820
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 NSLPVLNQDLTSSGQSTSSSSALSTPPPAGQSPAQQGSGVSGVQQVNGVTVGALASGMQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NSLPVLNQDLTSSGQSTSSSSALSTPPPAGQSPAQQGSGVSGVQQVNGVTVGALASGMQP
830 840 850 860 870 880
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 VTSTIPAVSAVGGIIGALPGNQLAINGIVGALNGVMQTPVTMSQNPTPLTHTTVPPNATH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VTSTIPAVSAVGGIIGALPGNQLAINGIVGALNGVMQTPVTMSQNPTPLTHTTVPPNATH
890 900 910 920 930 940
970 980 990 1000 1010
pF1KE3 PMPATLTNSASGLGLLSDQQRQILIHQQQFQQLLNSQQLTPVHRHPHFTQL----PPTHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ... . :: :
CCDS55 PMPATLTNSASGLGLLSDQQRQILIHQQQFQQLLNSQQLTPEQHQAFLYQLMQHHHQQHH
950 960 970 980 990 1000
1020
pF1KE3 SPSMEIMQVRK
.: .. .:.
CCDS55 QPELQQLQIPGPTQIPINNLLAGTQAPPLHTATTNPFLTIHGDNASQKVARLSDKTGPVA
1010 1020 1030 1040 1050 1060
>>CCDS11327.1 MLLT6 gene_id:4302|Hs108|chr17 (1093 aa)
initn: 1845 init1: 1337 opt: 1540 Z-score: 993.9 bits: 195.6 E(32554): 4.9e-49
Smith-Waterman score: 2300; 43.1% identity (65.7% similar) in 1062 aa overlap (18-1004:1-964)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MVSSDRPVSLEDEVSHSMKEMIGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHGCSVAVHQACYGIVQ
::::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS11 MKEMVGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHACSVAVHQACYGIVQ
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 VPTGPWFCRKCESQERAARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQFANVSTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS11 VPTGPWFCRKCESQERAARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQFANVLTM
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 EPIVLQSVPHDRYNKTCYICDEQGRESKAATGACMTCNKHGCRQAFHVTCAQFAGLLCEE
:::::: :::::.:::::::.:::::::::.:::::::.:::::::::::::.:::::::
CCDS11 EPIVLQYVPHDRFNKTCYICEEQGRESKAASGACMTCNRHGCRQAFHVTCAQMAGLLCEE
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220
pF1KE3 EGNGADNVQYCGYCKYHFSKLKKSKRGSNR--------------------SYDQSLSDSS
: .:::.:::::::::::.: :...:. : .: : :
CCDS11 EVLEVDNVKYCGYCKYHFSKMKTSRHSSGGGGGGAGGGGGSMGGGGSGFISGRRSRSASP
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270
pF1KE3 SHSQDKH---HEK-EKKKYKEKDKHKQKHKKQPEPSPA-LVPSLTVTTEKTYTSTSNNSI
: .:.:: ::. .::. :.:.. ::::::.:: :. :.: .. :..:. .:.:..:
CCDS11 STQQEKHPTHHERGQKKSRKDKERLKQKHKKRPESPPSILTPPVVPTADKVSSSASSSS-
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 SGSLKRLEDTTARFTNANFQEVSAHTSSGKDVSETRGSEGKGKKSSAHSSGQRGRKPGGG
: .: ...::. . :.::::::.:: ...:.: ..:
CCDS11 -----------------------HHEASTQETSES-SRESKGKKSSSHSLSHKGKKLSSG
290 300 310
340 350 360 370 380
pF1KE3 RNPGTTVSAASPFPQGSFSGTPGSVKSSSGSSVQSPQDFLSFTDSDL-RNDSYSH-----
.. .. .::.: ..: :.. :. . . ::.:: :: .: . ..:.::.
CCDS11 KGVSSFTSASSS--SSSSSSSSGGPFQPAVSSLQSSPDFSAFPKLEQPEEDKYSKPTAPA
320 330 340 350 360 370
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 --SQQSSATKDVHKGESGSQEGGVNSFSTLIGLPSTSAVTSQPKSFENSPGDLGNSSLPT
. : .. . :.. :. ..:. .. . .:.. ... .. :::: . .
CCDS11 PSAPPSPSAPEPPKADLFEQKVVFSGFGPIMRFSTTTSSSGRARA--PSPGDYKSPHVTG
380 390 400 410 420 430
450 460 470 480 490
pF1KE3 AG-----YKR----AQTSGIEEET----VKEKKRKGNKQSKHGPGRPKGNKNQENVSHLS
.: .:: . : .:: .::::.:..:.:.::::::::..:.:...
CCDS11 SGASAGTHKRMPALSATPVPADETPETGLKEKKHKASKRSRHGPGRPKGSRNKEGTG---
440 450 460 470 480 490
500 510 520 530 540 550
pF1KE3 VSSASPTSSVASAAGSITSSSLQKSPTLLRNGSLQSLSVGSSPVGSEISMQYRHDGACPT
. :.:. :. :: .... :: . .::: : : .:. : . .:. :.
CCDS11 -GPAAPSLPSAQLAGFTATAA---SP--FSGGSLVS-----SGLGGLSSRTFGPSGSLPS
500 510 520 530 540
560 570 580 590 600 610
pF1KE3 TTF-SELLNAIHNDRGDSSTLTKQELKFIGIYNSNDVAVSFPNVVSGSGSSTPVSSSHLP
.. : ::.: :::.:: .: . . . :::.::: :
CCDS11 LSLESPLLGA-------------------GIYTSNKDPISHSGGMLRAVCSTPLSSSLLG
550 560 570 580
620 630 640 650 660 670
pF1KE3 QQSSGHLQQVGALSP--SAVSSAAPAVATTQANTLSGSSLSQAPSHMYGNRSNSSMAALI
... : ... :: :.. :.. ...:::. .:.::..: .:..:. ... :.
CCDS11 PPGTSALPRLSR-SPFTSTLPSSSASISTTQVFSLAGSTFSLPSTHIFGT-PMGAVNPLL
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.:.:...:. :: : : . ::.::. ::: ::.::: .:: : :...:.
CCDS11 SQAESSHTEPDLEDCS--FRCRGTSPQESLSSMSPISSLPALFDQTASAPCGGGQLDPAA
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pF1KE3 PVAASIEQLLERQWSEGQQFLLEQGTPSDILGMLKSLHQLQVENRRLEEQIKNLTAKKER
: ....:::::.: ..: : :. .:. :::.:: :: ::.::.::: .:::::::
CCDS11 PGTTNMEQLLEKQ-GDG-----EAGV--NIVEMLKALHALQKENQRLQEQILSLTAKKER
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::.::.:::::::.. : :. . . . . : : ..:::..:::: .:. :::
CCDS11 LQILNVQLSVPFPALPAALPAANGPVPGPYGLPPQ-AGSSDSLSTSKSPPGKSSLGLDNS
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: . ..: :: . :::.:: :::: :::: .. :. : ::.
CCDS11 LSTSSED-PHSGCPSRSSSSLSFHSTPPPLPLLQQSPATLPLALPGAPAPLPPQPQNGL-
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pF1KE3 VGALASGMQPVTSTIPAVSAVGGIIGALPGNQ-LAINGIVGALNGVMQTPVTMSQNPTPL
: : .. . :. . :..:.: :. : .::..:.:::. . ::. :
CCDS11 ------GRAPGAAGLGAMPMAEGLLGGLAGSGGLPLNGLLGGLNGAA------APNPASL
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... : : .:. : :: :..:::..: .: ::.:::: : :::: :.
CCDS11 SQAGGAP--TLQLPGCL-NS------LTEQQRHLLQQQEQQLQQLQQLLASPQLTPEHQT
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1010 1020
pF1KE3 PHFTQLPPTHFSPSMEIMQVRK
CCDS11 VVYQMIQQIQQKRELQRLQMAGGSQLPMASLLAGSSTPLLSAGTPGLLPTASAPPLLPAG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::: :. : : ..: :. : .:: :. .
CCDS55 VPTGPWFCRKCESQERAARVMVCNSC-----WLASSENVTPGYIEHHCACASPHPRCLVS
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::
CCDS55 NVPPVSGALMHCFWACLTTAAFFGPQSFTTCHMSFLVSRDILFYIYGFMPFISVVIWRFK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MVSSDRPVSLEDEVSHSMKEMIGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHGCSVAVHQACYGIVQ
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::::::::::::::::::::
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. . .: : : : . : ::
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10 20 30 40 50
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CCDS82 GKGWSSEKVKKAKAKSRIKMKKARKILAEKRAAAPVVSVPCIPPHRLSKITNRLTIQRKS
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10 20 30 40 50
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CCDS25 EYLMDRLEKESYFESHNKGDPNALVDEDAVCCICNDGECQNSNVILFCDM--CNLAVHQE
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CCDS25 CYGVPYIPEGQWLCRRCLQSPSRA--VDCALCPNKGGAFKQTDDGRWAHVVCALWIPEVC
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pF1KE3 FANVSTMEPI-VLQSVPHDRYNKTCYICDEQGRESKAATGACMTCNKHGCRQAFHVTCAQ
:::. .::: .. .: :.. ::::: ..: .:::. :.: .: ::::::::
CCDS25 FANTVFLEPIDSIEHIPPARWKLTCYICKQRG------SGACIQCHKANCYTAFHVTCAQ
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CCDS25 GKGWSSEKVKKAKAKSRIKMKKARKILAEKRAAAPVVSVPCIPPHRLSKITNRLTIQRKS
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CCDS33 EYLMDRLEKESYFESHNKGDPNALVDEDAVCCICNDGECQNSNVILFCDM--CNLAVHQE
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CCDS33 CYGVPYIPEGQWLCRRCLQSPSRA--VDCALCPNKGGAFKQTDDGRWAHVVCALWIPEVC
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120 130 140 150 160 170
pF1KE3 FANVSTMEPI-VLQSVPHDRYNKTCYICDEQGRESKAATGACMTCNKHGCRQAFHVTCAQ
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CCDS33 FANTVFLEPIDSIEHIPPARWKLTCYICKQRG------SGACIQCHKANCYTAFHVTCAQ
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pF1KE3 FAGLLCEEE------GNGAD-NVQYCGYCKYHFSKLKKSKRGSNRSYDQSLSDSSSHSQD
::: . : .::.. .:. .:: : . ...: :.... : . . ..
CCDS33 QAGLYMKMEPVRETGANGTSFSVRKTAYCDIH-TPPGSARRLPALSHSEGEEDEDEEEDE
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pF1KE3 KHHEKEKKKYKEKDKHKQKHKKQPEPSPALVPSLTVTTEKTYTSTSNNSISGSLKRLEDT
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CCDS33 GKGWSSEKVKKAKAKSRIKMKKARKILAEKRAAAPVVSVPCIPPHRLSKITNRLTIQRKS
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pF1KE3 MVSSDRPVSLEDEVSHSMKEMIGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHGCSVAVHQA
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CCDS14 EFLMDRFEKESHCENQKQGEQQSLIDEDAVCCICMDGECQNSNVILFCD--MCNLAVHQE
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pF1KE3 CYGIVQVPTGPWFCRKCESQERAARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQF
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CCDS14 CYGVPYIPEGQWLCRHCL-QSRARPADCVLCPNKGGAFKKTDDDRWGHVVCALWIPEVGF
250 260 270 280 290 300
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CCDS14 ANTVFIEPIDGVRNIPPARWKLTCYLCKQKG------VGACIQCHKANCYTAFHVTCAQK
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pF1KE3 AGLLCEEE------GNGAD-NVQYCGYCKYHFSKLKKSKRGSNRSYDQSLSDSSSHSQDK
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CCDS14 AGLYMKMEPVKELTGGGTTFSVRKTAYCDVH-TPPGCTRRPLNIYGDVEMKNGVCR-KES
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pF1KE3 HHEKEKKKYKEKDKHKQKHKKQPEPSPALVPSLTVTTEKTYTSTSNNSISGSLKRLEDTT
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CCDS14 SVKTVRSTSKVRKKAKKAKKALAEPC-AVLPTVCAPYIPPQRLNRIANQVAIQRKKQFVE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]