Result of FASTA (omim) for
pFN21AE3340
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3340, 984 aa
1>>>pF1KE3340 984 - 984 aa - 984 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.2337+/-0.000694; mu= -5.5518+/- 0.042
mean_var=1029.2419+/-229.023, 0's: 0 Z-trim(113.1): 1267 B-trim: 0 in 0/57
Lambda= 0.039977
statistics sampled from 20905 (22309) to 20905 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.597), E-opt: 0.2 (0.262), width: 16
Scan time: 13.420
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_004432 (OMIM: 600600) ephrin type-B receptor 1 ( 984) 6599 399.1 5.9e-110
NP_004433 (OMIM: 600997,603688) ephrin type-B rece ( 987) 5068 310.8 2.3e-83
NP_059145 (OMIM: 600997,603688) ephrin type-B rece ( 986) 5057 310.2 3.5e-83
NP_001296122 (OMIM: 600997,603688) ephrin type-B r (1055) 5057 310.2 3.6e-83
XP_006710504 (OMIM: 600997,603688) PREDICTED: ephr ( 980) 5046 309.5 5.4e-83
NP_004434 (OMIM: 601839) ephrin type-B receptor 3 ( 998) 4722 290.9 2.3e-77
NP_001275558 (OMIM: 602190) ephrin type-A receptor ( 993) 3861 241.2 2.1e-62
NP_001268695 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor (1016) 3849 240.5 3.4e-62
NP_004431 (OMIM: 602190) ephrin type-A receptor 7 ( 998) 3847 240.4 3.6e-62
XP_016865854 (OMIM: 602190) PREDICTED: ephrin type ( 989) 3841 240.0 4.6e-62
NP_872272 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor 5 (1015) 3838 239.9 5.2e-62
XP_005248726 (OMIM: 602190) PREDICTED: ephrin type ( 994) 3827 239.2 8e-62
NP_005224 (OMIM: 179611) ephrin type-A receptor 3 ( 983) 3777 236.3 5.9e-61
NP_004435 (OMIM: 600011) ephrin type-B receptor 4 ( 987) 3684 231.0 2.4e-59
XP_016861357 (OMIM: 600600) PREDICTED: ephrin type (1016) 3640 228.5 1.4e-58
XP_016861356 (OMIM: 600600) PREDICTED: ephrin type (1032) 3640 228.5 1.4e-58
XP_016861355 (OMIM: 600600) PREDICTED: ephrin type (1038) 3640 228.5 1.4e-58
XP_005264773 (OMIM: 179611) PREDICTED: ephrin type ( 918) 3631 227.9 2e-58
NP_001291466 (OMIM: 602188) ephrin type-A receptor ( 935) 3486 219.5 6.5e-56
NP_001291465 (OMIM: 602188) ephrin type-A receptor ( 986) 3486 219.6 6.6e-56
NP_004429 (OMIM: 602188) ephrin type-A receptor 4 ( 986) 3486 219.6 6.6e-56
XP_005246431 (OMIM: 602188) PREDICTED: ephrin type ( 949) 3375 213.1 5.5e-54
XP_005264772 (OMIM: 179611) PREDICTED: ephrin type ( 982) 3359 212.2 1.1e-53
NP_001092909 (OMIM: 611123) ephrin type-A receptor (1008) 2830 181.7 1.6e-44
XP_011510844 (OMIM: 600600) PREDICTED: ephrin type ( 394) 2593 167.3 1.4e-40
XP_006710505 (OMIM: 600997,603688) PREDICTED: ephr ( 956) 2600 168.4 1.6e-40
NP_065387 (OMIM: 176945) ephrin type-A receptor 8 (1005) 2524 164.1 3.4e-39
XP_016867305 (OMIM: 600011) PREDICTED: ephrin type (1005) 2470 161.0 2.9e-38
NP_001073917 (OMIM: 600066) ephrin type-A receptor (1130) 2374 155.5 1.4e-36
XP_011539272 (OMIM: 176945) PREDICTED: ephrin type ( 930) 2369 155.1 1.6e-36
XP_011539275 (OMIM: 176945) PREDICTED: ephrin type ( 930) 2369 155.1 1.6e-36
XP_011539271 (OMIM: 176945) PREDICTED: ephrin type ( 930) 2369 155.1 1.6e-36
XP_011539274 (OMIM: 176945) PREDICTED: ephrin type ( 930) 2369 155.1 1.6e-36
NP_005223 (OMIM: 179610) ephrin type-A receptor 1 ( 976) 2331 152.9 7.5e-36
NP_001296121 (OMIM: 600997,603688) ephrin type-B r ( 928) 2289 150.5 3.9e-35
XP_016863369 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 852) 2240 147.6 2.7e-34
XP_016863367 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 904) 2236 147.4 3.2e-34
XP_016863370 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 817) 2109 140.0 4.9e-32
XP_016863368 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 869) 2105 139.8 5.9e-32
XP_016861699 (OMIM: 600066) PREDICTED: ephrin type (1104) 2033 135.9 1.2e-30
XP_005265710 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 874) 1917 129.0 1.1e-28
XP_011530037 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 926) 1917 129.0 1.1e-28
NP_001305690 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor ( 969) 1917 129.1 1.1e-28
NP_004430 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor 5 (1037) 1917 129.1 1.2e-28
NP_001268694 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor (1038) 1917 129.1 1.2e-28
XP_005248728 (OMIM: 602190) PREDICTED: ephrin type ( 610) 1898 127.6 2e-28
XP_011514181 (OMIM: 602757) PREDICTED: ephrin type (1022) 1898 128.0 2.5e-28
XP_006715944 (OMIM: 602757) PREDICTED: ephrin type (1022) 1898 128.0 2.5e-28
NP_004436 (OMIM: 602757) ephrin type-B receptor 6 (1022) 1898 128.0 2.5e-28
XP_011514182 (OMIM: 602757) PREDICTED: ephrin type (1022) 1898 128.0 2.5e-28
>>NP_004432 (OMIM: 600600) ephrin type-B receptor 1 prec (984 aa)
initn: 6599 init1: 6599 opt: 6599 Z-score: 2095.0 bits: 399.1 E(85289): 5.9e-110
Smith-Waterman score: 6599; 100.0% identity (100.0% similar) in 984 aa overlap (1-984:1-984)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MALDYLLLLLLASAVAAMEETLMDTRTATAELGWTANPASGWEEVSGYDENLNTIRTYQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MALDYLLLLLLASAVAAMEETLMDTRTATAELGWTANPASGWEEVSGYDENLNTIRTYQV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 CNVFEPNQNNWLLTTFINRRGAHRIYTEMRFTVRDCSSLPNVPGSCKETFNLYYYETDSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 CNVFEPNQNNWLLTTFINRRGAHRIYTEMRFTVRDCSSLPNVPGSCKETFNLYYYETDSV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 IATKKSAFWSEAPYLKVDTIAADESFSQVDFGGRLMKVNTEVRSFGPLTRNGFYLAFQDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 IATKKSAFWSEAPYLKVDTIAADESFSQVDFGGRLMKVNTEVRSFGPLTRNGFYLAFQDY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 GACMSLLSVRVFFKKCPSIVQNFAVFPETMTGAESTSLVIARGTCIPNAEEVDVPIKLYC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GACMSLLSVRVFFKKCPSIVQNFAVFPETMTGAESTSLVIARGTCIPNAEEVDVPIKLYC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 NGDGEWMVPIGRCTCKPGYEPENSVACKACPAGTFKASQEAEGCSHCPSNSRSPAEASPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 NGDGEWMVPIGRCTCKPGYEPENSVACKACPAGTFKASQEAEGCSHCPSNSRSPAEASPI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 CTCRTGYYRADFDPPEVACTSVPSGPRNVISIVNETSIILEWHPPRETGGRDDVTYNIIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 CTCRTGYYRADFDPPEVACTSVPSGPRNVISIVNETSIILEWHPPRETGGRDDVTYNIIC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 KKCRADRRSCSRCDDNVEFVPRQLGLTECRVSISSLWAHTPYTFDIQAINGVSSKSPFPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KKCRADRRSCSRCDDNVEFVPRQLGLTECRVSISSLWAHTPYTFDIQAINGVSSKSPFPP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 QHVSVNITTNQAAPSTVPIMHQVSATMRSITLSWPQPEQPNGIILDYEIRYYEKEHNEFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 QHVSVNITTNQAAPSTVPIMHQVSATMRSITLSWPQPEQPNGIILDYEIRYYEKEHNEFN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 SSMARSQTNTARIDGLRPGMVYVVQVRARTVAGYGKFSGKMCFQTLTDDDYKSELREQLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SSMARSQTNTARIDGLRPGMVYVVQVRARTVAGYGKFSGKMCFQTLTDDDYKSELREQLP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 LIAGSAAAGVVFVVSLVAISIVCSRKRAYSKEAVYSDKLQHYSTGRGSPGMKIYIDPFTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LIAGSAAAGVVFVVSLVAISIVCSRKRAYSKEAVYSDKLQHYSTGRGSPGMKIYIDPFTY
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 EDPNEAVREFAKEIDVSFVKIEEVIGAGEFGEVYKGRLKLPGKREIYVAIKTLKAGYSEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EDPNEAVREFAKEIDVSFVKIEEVIGAGEFGEVYKGRLKLPGKREIYVAIKTLKAGYSEK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 QRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSRPVMIITEFMENGALDSFLRQNDGQFTVIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 QRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSRPVMIITEFMENGALDSFLRQNDGQFTVIQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 LVGMLRGIAAGMKYLAEMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRYLQDDTSDPTYTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LVGMLRGIAAGMKYLAEMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRYLQDDTSDPTYTS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 SLGGKIPVRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSFGERPYWDMSNQDVINAIEQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SLGGKIPVRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSFGERPYWDMSNQDVINAIEQD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 YRLPPPMDCPAALHQLMLDCWQKDRNSRPRFAEIVNTLDKMIRNPASLKTVATITAVPSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 YRLPPPMDCPAALHQLMLDCWQKDRNSRPRFAEIVNTLDKMIRNPASLKTVATITAVPSQ
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 PLLDRSIPDFTAFTTVDDWLSAIKMVQYRDSFLTAGFTSLQLVTQMTSEDLLRIGITLAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PLLDRSIPDFTAFTTVDDWLSAIKMVQYRDSFLTAGFTSLQLVTQMTSEDLLRIGITLAG
910 920 930 940 950 960
970 980
pF1KE3 HQKKILNSIHSMRVQISQSPTAMA
::::::::::::::::::::::::
NP_004 HQKKILNSIHSMRVQISQSPTAMA
970 980
>>NP_004433 (OMIM: 600997,603688) ephrin type-B receptor (987 aa)
initn: 5081 init1: 2345 opt: 5068 Z-score: 1617.8 bits: 310.8 E(85289): 2.3e-83
Smith-Waterman score: 5068; 73.5% identity (90.8% similar) in 981 aa overlap (1-978:1-981)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MALDYL-LLLLLASAVAAMEETLMDTRTATAELGWTANPASGWEEVSGYDENLNTIRTYQ
::: : ::: .::.::::::. :::::::: ..: ::::::::::::.:::::::
NP_004 MALRRLGAALLLLPLLAAVEETLMDSTTATAELGWMVHPPSGWEEVSGYDENMNTIRTYQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 VCNVFEPNQNNWLLTTFINRRGAHRIYTEMRFTVRDCSSLPNVPGSCKETFNLYYYETDS
:::::: .::::: : :: :::::::..::.:.::::::.:.:::::::::::::::.:
NP_004 VCNVFESSQNNWLRTKFIRRRGAHRIHVEMKFSVRDCSSIPSVPGSCKETFNLYYYEADF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 VIATKKSAFWSEAPYLKVDTIAADESFSQVDFGGRLMKVNTEVRSFGPLTRNGFYLAFQD
::: : : :..:::::::::::::::.:::.::.:::::::::..:.::::::::
NP_004 DSATKTFPNWMENPWVKVDTIAADESFSQVDLGGRVMKINTEVRSFGPVSRSGFYLAFQD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 YGACMSLLSVRVFFKKCPSIVQNFAVFPETMTGAESTSLVIARGTCIPNAEEVDVPIKLY
::.::::..::::..::: :.:: :.: ::..:::::::: :::.:: ::::::::::::
NP_004 YGGCMSLIAVRVFYRKCPRIIQNGAIFQETLSGAESTSLVAARGSCIANAEEVDVPIKLY
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 CNGDGEWMVPIGRCTCKPGYEP-ENSVACKACPAGTFKASQEAEGCSHCPSNSRSPAEAS
:::::::.:::::: :: :.: ::...:..::.:::::.: :.:.::: :::. .:..
NP_004 CNGDGEWLVPIGRCMCKAGFEAVENGTVCRGCPSGTFKANQGDEACTHCPINSRTTSEGA
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 PICTCRTGYYRADFDPPEVACTSVPSGPRNVISIVNETSIILEWHPPRETGGRDDVTYNI
:.::.::::::.:: .. ::..::.:. ::: :::::..::: :::..:::.:..:::
NP_004 TNCVCRNGYYRADLDPLDMPCTTIPSAPQAVISSVNETSLMLEWTPPRDSGGREDLVYNI
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 ICKKCRADRRSCSRCDDNVEFVPRQLGLTECRVSISSLWAHTPYTFDIQAINGVSSKSPF
:::.: . : .:.:: :::...:::::::: :. ::.: ::: :::.:::.:::...:::
NP_004 ICKSCGSGRGACTRCGDNVQYAPRQLGLTEPRIYISDLLAHTQYTFEIQAVNGVTDQSPF
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 PPQHVSVNITTNQAAPSTVPIMHQVSATMRSITLSWPQPEQPNGIILDYEIRYYEKEHNE
:: .::::::::::::.: :::::: :. :::::: ::.::::.:::::..::::: .:
NP_004 SPQFASVNITTNQAAPSAVSIMHQVSRTVDSITLSWSQPDQPNGVILDYELQYYEKELSE
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE3 FNSSMARSQTNTARIDGLRPGMVYVVQVRARTVAGYGKFSGKMCFQTLTDDDYKSELREQ
.:.. .: :::. ..::. : .:: :::::::::::..:::: :::.:. .:.. ..:.
NP_004 YNATAIKSPTNTVTVQGLKAGAIYVFQVRARTVAGYGRYSGKMYFQTMTEAEYQTSIQEK
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE3 LPLIAGSAAAGVVFVVSLVAISIVCSRKRAYSK-EAVYSDKLQHYSTGRGSPGMKIYIDP
:::: ::.:::.::....:.:.:::.:.:.. . .. :.::::::..:. .:::::::::
NP_004 LPLIIGSSAAGLVFLIAVVVIAIVCNRRRGFERADSEYTDKLQHYTSGHMTPGMKIYIDP
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KE3 FTYEDPNEAVREFAKEIDVSFVKIEEVIGAGEFGEVYKGRLKLPGKREIYVAIKTLKAGY
::::::::::::::::::.: ::::.:::::::::: .:.:::::::::.:::::::.::
NP_004 FTYEDPNEAVREFAKEIDISCVKIEQVIGAGEFGEVCSGHLKLPGKREIFVAIKTLKSGY
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KE3 SEKQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSRPVMIITEFMENGALDSFLRQNDGQFT
.:::::::::::::::::::::.:.:::::::: ::::::::::::.:::::::::::::
NP_004 TEKQRRDFLSEASIMGQFDHPNVIHLEGVVTKSTPVMIITEFMENGSLDSFLRQNDGQFT
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KE3 VIQLVGMLRGIAAGMKYLAEMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRYLQDDTSDPT
:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::::
NP_004 VIQLVGMLRGIAAGMKYLADMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRFLEDDTSDPT
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KE3 YTSSLGGKIPVRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSFGERPYWDMSNQDVINAI
:::.::::::.:::::::: ::::::::::::::::::::::.::::::::.::::::::
NP_004 YTSALGGKIPIRWTAPEAIQYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMTNQDVINAI
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KE3 EQDYRLPPPMDCPAALHQLMLDCWQKDRNSRPRFAEIVNTLDKMIRNPASLKTVATITAV
:::::::::::::.::::::::::::::: ::.:..:::::::::::: :::..: ...
NP_004 EQDYRLPPPMDCPSALHQLMLDCWQKDRNHRPKFGQIVNTLDKMIRNPNSLKAMAPLSSG
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940 950
pF1KE3 PSQPLLDRSIPDFTAFTTVDDWLSAIKMVQYRDSFLTAGFTSLQLVTQMTSEDLLRIGIT
. :::::.:::.:.:.:::.:: :::: ::..:: .:::::...:.:: ::.::.:.:
NP_004 INLPLLDRTIPDYTSFNTVDEWLEAIKMGQYKESFANAGFTSFDVVSQMMMEDILRVGVT
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XP_006 QDYRLPPPMDCPSALHQLMLDCWQKDRNHRPKFGQIVNTLDKMIRNPNSLKAMAPLSSGI
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10 20 30 40
pF1KE3 MALDYLLLLLLASAVAAMEETLMDTRTATAELGWTANPAS
: :::: .. :.:::::::. .:.::.::..: :
NP_004 MARARPPPPPSPPPGLLPLLPPLLLLPLLLLPAGCRALEETLMDTKWVTSELAWTSHPES
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 GWEEVSGYDENLNTIRTYQVCNVFEPNQNNWLLTTFINRRGAHRIYTEMRFTVRDCSSLP
:::::::::: .: ::::::::: : .::::: : :: :: ..:.:.:..::::::.:.:
NP_004 GWEEVSGYDEAMNPIRTYQVCNVRESSQNNWLRTGFIWRRDVQRVYVELKFTVRDCNSIP
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 NVPGSCKETFNLYYYETDSVIATKKSAFWSEAPYLKVDTIAADESFSQVDFGGRLMKVNT
:.::::::::::.:::.:: .:. .: :: : ::.:::::: :::::..: : .:::
NP_004 NIPGSCKETFNLFYYEADSDVASASSPFWMENPYVKVDTIAPDESFSRLDAG----RVNT
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 EVRSFGPLTRNGFYLAFQDYGACMSLLSVRVFFKKCPSIVQNFAVFPETMTGAESTSLVI
.:::::::.. :::::::: ::::::.:::.:.::: : . .::.::::.:::: :::::
NP_004 KVRSFGPLSKAGFYLAFQDQGACMSLISVRAFYKKCASTTAGFALFPETLTGAEPTSLVI
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KE3 ARGTCIPNAEEVDVPIKLYCNGDGEWMVPIGRCTCKPGYEPENSVA-CKACPAGTFKASQ
: ::::::: ::.::.:::::::::::::.: ::: :.:: . . :. :: :..::.:
NP_004 APGTCIPNAVEVSVPLKLYCNGDGEWMVPVGACTCATGHEPAAKESQCRPCPPGSYKAKQ
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 EAEGCSHCPSNSRSPAEASPICTCRTGYYRADFDPPEVACTSVPSGPRNVISIVNETSII
: :: :::. . :. ::::....:::: : . :::.::: ::.::: :::::.:
NP_004 GEGPCLPCPPNSRTTSPAASICTCHNNFYRADSDSADSACTTVPSPPRGVISNVNETSLI
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 LEWHPPRETGGRDDVTYNIICKKCRA--DRRSCSRCDDNVEFVPRQLGLTECRVSISSLW
::: ::. :::::. ::.:::::.. .::::::::::::::::::: :: :: :
NP_004 LEWSEPRDLGGRDDLLYNVICKKCHGAGGASACSRCDDNVEFVPRQLGLTERRVHISHLL
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 AHTPYTFDIQAINGVSSKSPFPPQHVSVNITTNQAAPSTVPIMHQVSATMRSITLSWPQP
::: :::..::.::::.:::.::....::::::::::: :: .. :.. :.:::: :
NP_004 AHTRYTFEVQAVNGVSGKSPLPPRYAAVNITTNQAAPSEVPTLRLHSSSGSSLTLSWAPP
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KE3 EQPNGIILDYEIRYYEKEHNEFNSSMARSQTNTARIDGLRPGMVYVVQVRARTVAGYGKF
:.:::.:::::..:.:: .: .: . :: :....::::: ::::::::::::::..
NP_004 ERPNGVILDYEMKYFEK--SEGIASTVTSQMNSVQLDGLRPDARYVVQVRARTVAGYGQY
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KE3 SGKMCFQTLTD-DDYKSELREQLPLIAGSAAAGVVFVVSLVAISIVCSRKRAYSKEAVYS
: :.: .. . ..:.::::::.:::.::.::::..:.:.::: ::. ..... :.
NP_004 SRPAEFETTSERGSGAQQLQEQLPLIVGSATAGLVFVVAVVVIAIVCLRKQRHGSDSEYT
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KE3 DKLQHYSTGRGSPGMKIYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDVSFVKIEEVIGAGEFGEVYKG
.:::.: .::::.:::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::: .:
NP_004 EKLQQYI----APGMKVYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDVSCVKIEEVIGAGEFGEVCRG
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KE3 RLKLPGKREIYVAIKTLKAGYSEKQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSRPVMII
::: ::.::..:::::::.::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.
NP_004 RLKQPGRREVFVAIKTLKVGYTERQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSRPVMIL
660 670 680 690 700 710
700 710 720 730 740 750
pF1KE3 TEFMENGALDSFLRQNDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMKYLAEMNYVHRDLAARNILVNSNL
:::::: ::::::: ::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
NP_004 TEFMENCALDSFLRLNDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMKYLSEMNYVHRDLAARNILVNSNL
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760 770 780 790 800 810
pF1KE3 VCKVSDFGLSRYLQDDTSDPTYTSSLGGKIPVRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWE
:::::::::::.:.:: ::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VCKVSDFGLSRFLEDDPSDPTYTSSLGGKIPIRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWE
780 790 800 810 820 830
820 830 840 850 860 870
pF1KE3 VMSFGERPYWDMSNQDVINAIEQDYRLPPPMDCPAALHQLMLDCWQKDRNSRPRFAEIVN
:::.::::::::::::::::.:::::::::::::.:::::::::: .::: ::.:..:::
NP_004 VMSYGERPYWDMSNQDVINAVEQDYRLPPPMDCPTALHQLMLDCWVRDRNLRPKFSQIVN
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880 890 900 910 920 930
pF1KE3 TLDKMIRNPASLKTVATITAVPSQPLLDRSIPDFTAFTTVDDWLSAIKMVQYRDSFLTAG
::::.::: ::::..:. . :::::::..::.:.:::: :::.:::: .:..::..::
NP_004 TLDKLIRNAASLKVIASAQSGMSQPLLDRTVPDYTTFTTVGDWLDAIKMGRYKESFVSAG
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940 950 960 970 980
pF1KE3 FTSLQLVTQMTSEDLLRIGITLAGHQKKILNSIHSMRVQISQSPTAMA
:.:..::.:::.:::::::.::::::::::.::..::.:..:.
NP_004 FASFDLVAQMTAEDLLRIGVTLAGHQKKILSSIQDMRLQMNQTLPVQV
960 970 980 990
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10 20 30 40
pF1KE3 MALDYLLLLLLAS---AVAAMEETLMDTRTATAELGWTANPASGWEEVSG
. : :. :: .: : :: : :.:... .:: : ..: .::::.::
NP_001 MVFQTRYPSWIILCYIWLLRFAHTGEAQAAKEVLLLDSKAQQTELEWISSPPNGWEEISG
10 20 30 40 50 60
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pF1KE3 YDENLNTIRTYQVCNVFEPNQNNWLLTTFINRRGAHRIYTEMRFTVRDCSSLPNVPGSCK
::: . :::::::.:.:::::::: :..:.. .:.::..:..::.:::.:::.: :.::
NP_001 LDENYTPIRTYQVCQVMEPNQNNWLRTNWISKGNAQRIFVELKFTLRDCNSLPGVLGTCK
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 ETFNLYYYETDSVIATKKSAFWSEAPYLKVDTIAADESFSQVDFGGRLMKVNTEVRSFGP
::::::::::: : .. : :.:.:::::::::.: :.: : ::.::::: .::
NP_001 ETFNLYYYETD--YDTGRNI--RENLYVKIDTIAADESFTQGDLGERKMKLNTEVREIGP
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pF1KE3 LTRNGFYLAFQDYGACMSLLSVRVFFKKCPSIVQNFAVFPETMTGAESTSLVIARGTCIP
:...:::::::: :::..:.::.:..::: ::..:.:.::.:.::.: .::: .::::.
NP_001 LSKKGFYLAFQDVGACIALVSVKVYYKKCWSIIENLAIFPDTVTGSEFSSLVEVRGTCVS
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pF1KE3 NAEEV--DVPIKLYCNGDGEWMVPIGRCTCKPGYEPENSVACKACPAGTFKASQEAEGCS
.::: ..: ...:...:::.::::.: :: ::. .... :. : : .:.:.. ::
NP_001 SAEEEAENAP-RMHCSAEGEWLVPIGKCICKAGYQQKGDT-CEPCGRGFYKSSSQDLQCS
240 250 260 270 280 290
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pF1KE3 HCPSNSRSPAEASPICTCRTGYYRADFDPPEVACTSVPSGPRNVISIVNETSIILEWHPP
.::..: : :.: : :. ::::: ::: :::: ::.:.:.: .:.:.. ::: ::
NP_001 RCPTHSFSDKEGSSRCECEDGYYRAPSDPPYVACTRPPSAPQNLIFNINQTTVSLEWSPP
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 RETGGRDDVTYNIICKKCRADRRSCSRCDDNVEFVPRQLGLTECRVSISSLWAHTPYTFD
..:::.:::: :.::.: .. : : .:. ..:.: :: . :.. .: ::. :::.
NP_001 ADNGGRNDVTYRILCKRCSWEQGECVPCGSNIGYMPQQTGLEDNYVTVMDLLAHANYTFE
360 370 380 390 400 410
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pF1KE3 IQAINGVSSKSPFPPQHVSVNITTNQAAPSTVPIMHQVSATMRSITLSWPQPEQPNGIIL
..:.::::. : ..:.:::.::::: : . . . .::. ::: .::.:::.:
NP_001 VEAVNGVSDLSRSQRLFAAVSITTGQAAPSQVSGVMKERVLQRSVELSWQEPEHPNGVIT
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE3 DYEIRYYEKEHNEFNSSMARSQTNTARIDGLRPGMVYVVQVRARTVAGYGKFSGKMCFQT
.:::.::::.. : . : .......: :..:.:: ::: :.:: :.::::..: .. :
NP_001 EYEIKYYEKDQRERTYSTVKTKSTSASINNLKPGTVYVFQIRAFTAAGYGNYSPRLDVAT
480 490 500 510 520 530
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pF1KE3 LTDDDYKSELREQLP--LIAGSAAAGVVFVVSLVAISIVCSRKRAYSKEAVYSDKLQHYS
: . . :: : .:: :.::....: .: :. :. .::: .:. ..
NP_001 LEEATATAVSSEQNPVIIIAVVAVAGTIILVFMVFGFIIGRRHCGYSKADQEGDEELYFH
540 550 560 570 580 590
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pF1KE3 TGRGSPGMKIYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDVSFVKIEEVIGAGEFGEVYKGRLKLPGK
:: : :::: ::::::.::..::::.:.: .:::.:::::::::: .::::::::
NP_001 FKF--PGTKTYIDPETYEDPNRAVHQFAKELDASCIKIERVIGAGEFGEVCSGRLKLPGK
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KE3 REIYVAIKTLKAGYSEKQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSRPVMIITEFMENG
:.. :::::::.::.:::::::: ::::::::::::...::::::...::::. ::::::
NP_001 RDVAVAIKTLKVGYTEKQRRDFLCEASIMGQFDHPNVVHLEGVVTRGKPVMIVIEFMENG
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pF1KE3 ALDSFLRQNDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMKYLAEMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDF
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NP_001 ALDAFLRKHDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMRYLADMGYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDF
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770 780 790 800 810 820
pF1KE3 GLSRYLQDDTSDPTYTSSLGGKIPVRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSFGER
:::: ..:: . .::.. :::::::::::::: ::::::::::::::::::::::.:::
NP_001 GLSRVIEDDP-EAVYTTT-GGKIPVRWTAPEAIQYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGER
780 790 800 810 820 830
830 840 850 860 870 880
pF1KE3 PYWDMSNQDVINAIEQDYRLPPPMDCPAALHQLMLDCWQKDRNSRPRFAEIVNTLDKMIR
:::::::::::.:::. :::: ::::::.:::::::::::.: ::.: .::. ::::::
NP_001 PYWDMSNQDVIKAIEEGYRLPAPMDCPAGLHQLMLDCWQKERAERPKFEQIVGILDKMIR
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pF1KE3 NPASLKTVATITAVPSQPLLDRSIPDFTAFTTVDDWLSAIKMVQYRDSFLTAGFTSLQLV
:: :::: . : .::::.. ::::.: .: .::.:::: .:.:.: .::..::. :
NP_001 NPNSLKTPLGTCSRPISPLLDQNTPDFTTFCSVGEWLQAIKMERYKDNFTAAGYNSLESV
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950 960 970 980
pF1KE3 TQMTSEDLLRIGITLAGHQKKILNSIHSMRVQISQSPTAMA
..:: ::.. .::::.::::::..::..::.:.
NP_001 ARMTIEDVMSLGITLVGHQKKIMSSIQTMRAQMLHLHGTGIQV
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>>NP_001268695 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor 5 i (1016 aa)
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10 20 30
pF1KE3 MALDYLLLLLLASAVAAMEETLMDTRTATAELGWTA
: :::: . : .:.:.::. ..::: :
NP_001 DTPITPASLAGCYSAPRRAPLWTCLLLCAALRTLLAS--PSNEVNLLDSRTVMGDLGWIA
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40 50 60 70 80 90
pF1KE3 NPASGWEEVSGYDENLNTIRTYQVCNVFEPNQNNWLLTTFINRRGAHRIYTEMRFTVRDC
: .::::.. ::: :.:::::.:.: ::::::::..:. .:: ::. :..::.:::
NP_001 FPKNGWEEIGEVDENYAPIHTYQVCKVMEQNQNNWLLTSWISNEGASRIFIELKFTLRDC
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100 110 120 130 140 150
pF1KE3 SSLPNVPGSCKETFNLYYYETDSVIATKKSAFWSEAPYLKVDTIAADESFSQVDFGGRLM
.:::. :.::::::.::.:.:. ... .: :.:.:::::::::...:.: :.:
NP_001 NSLPGGLGTCKETFNMYYFESDD----QNGRNIKENQYIKIDTIAADESFTELDLGDRVM
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 KVNTEVRSFGPLTRNGFYLAFQDYGACMSLLSVRVFFKKCPSIVQNFAVFPETMTGAEST
:.:::::. :::...:::::::: :::..:.::::..:::::.:...::::.:.:::.:.
NP_001 KLNTEVRDVGPLSKKGFYLAFQDVGACIALVSVRVYYKKCPSVVRHLAVFPDTITGADSS
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 SLVIARGTCIPNAEEVDVPIKLYCNGDGEWMVPIGRCTCKPGYEPENSVACKACPAGTFK
.:. . :.:. : .: : :..:...:::.::::.: :: ::: .:.. :..: : ::
NP_001 QLLEVSGSCV-NHSVTDEPPKMHCSAEGEWLVPIGKCMCKAGYEEKNGT-CQVCRPGFFK
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 ASQEAEGCSHCPSNSRSPAEASPICTCRTGYYRADFDPPEVACTSVPSGPRNVISIVNET
:: . ..:..:: .: . ::: :.:. :.: . ::: .::: ::.:::.:: ::::
NP_001 ASPHIQSCGKCPPHSYTHEEASTSCVCEKDYFRRESDPPTMACTRPPSAPRNAISNVNET
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 SIILEWHPPRETGGRDDVTYNIICKKCRADRRSCSRCDDNVEFVPRQLGLTECRVSISSL
:..::: :: .:::: ::.: : :::: . : .: .:...::: :: . : . .:
NP_001 SVFLEWIPPADTGGRKDVSYYIACKKCNSHAGVCEECGGHVRYLPRQSGLKNTSVMMVDL
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 WAHTPYTFDIQAINGVSSKSPFPPQHVSVNITTNQAAPSTVPIMHQVSATMRSITLSWPQ
::: :::.:.:.::::. :: :.::::.:::::::: : ... . . ::.::: .
NP_001 LAHTNYTFEIEAVNGVSDLSPGARQYVSVNVTTNQAAPSPVTNVKKGKIAKNSISLSWQE
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460 470 480 490 500 510
pF1KE3 PEQPNGIILDYEIRYYEKEHNEFNSSMARSQTNTARIDGLRPGMVYVVQVRARTVAGYGK
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NP_001 PDRPNGIILEYEIKYFEKDQ-ETSYTIIKSKETTITAEGLKPASVYVFQIRARTAAGYGV
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pF1KE3 FSGKMCFQTLTDDDYKSELREQLPLIAGSAAAGVVFVVSLVAISIVCSRKRAYSKEAVYS
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NP_001 FSRRFEFETTPVSVAASSDQSQIPVIAVSVTVGVILLAVVIGV-LLSGRRCGYSKAKQDP
560 570 580 590 600
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pF1KE3 DKLQ-HYSTGRGS-PGMKIYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDVSFVKIEEVIGAGEFGEVY
.. . :. .:. . ::.. :::: ::::::.::.::::::..: . ::.::::::::::
NP_001 EEEKMHFHNGHIKLPGVRTYIDPHTYEDPNQAVHEFAKEIEASCITIERVIGAGEFGEVC
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KE3 KGRLKLPGKREIYVAIKTLKAGYSEKQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSRPVM
.::::::::::. :::::::.::.::::::::.::::::::::::::.::::::::.:::
NP_001 SGRLKLPGKRELPVAIKTLKVGYTEKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTKSKPVM
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
pF1KE3 IITEFMENGALDSFLRQNDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMKYLAEMNYVHRDLAARNILVNS
:.::.::::.::.::..:::::::::::::::::.::::::..:.::::::::::::.::
NP_001 IVTEYMENGSLDTFLKKNDGQFTVIQLVGMLRGISAGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINS
730 740 750 760 770 780
760 770 780 790 800 810
pF1KE3 NLVCKVSDFGLSRYLQDDTSDPTYTSSLGGKIPVRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVM
::::::::::::: :.:: . .::. :::::.:::::::::.::::::::::::::::
NP_001 NLVCKVSDFGLSRVLEDDP-EAAYTTR-GGKIPIRWTAPEAIAFRKFTSASDVWSYGIVM
790 800 810 820 830 840
820 830 840 850 860 870
pF1KE3 WEVMSFGERPYWDMSNQDVINAIEQDYRLPPPMDCPAALHQLMLDCWQKDRNSRPRFAEI
:::.:.::::::.:.:::::.:.:. :::: ::::::::.:::::::::.:::::.: ::
NP_001 WEVVSYGERPYWEMTNQDVIKAVEEGYRLPSPMDCPAALYQLMLDCWQKERNSRPKFDEI
850 860 870 880 890 900
880 890 900 910 920 930
pF1KE3 VNTLDKMIRNPASLKTVATITAVPSQPLLDRSIPDFTAFTTVDDWLSAIKMVQYRDSFLT
:: :::.::::.::::... . :. : ..: :. .: .:: :::: .: . :.
NP_001 VNMLDKLIRNPSSLKTLVNASCRVSNLLAEHSPLGSGAYRSVGEWLEAIKMGRYTEIFME
910 920 930 940 950 960
940 950 960 970 980
pF1KE3 AGFTSLQLVTQMTSEDLLRIGITLAGHQKKILNSIHSMRVQISQSPTAMA
:..:.. :.:.: ::: :.:.::.::::::.::.. :.::.
NP_001 NGYSSMDAVAQVTLEDLRRLGVTLVGHQKKIMNSLQEMKVQLVNGMVPL
970 980 990 1000 1010
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Smith-Waterman score: 3847; 57.7% identity (80.6% similar) in 988 aa overlap (1-976:11-988)
10 20 30 40
pF1KE3 MALDYLLLLLLAS---AVAAMEETLMDTRTATAELGWTANPASGWEEVSG
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NP_004 MVFQTRYPSWIILCYIWLLRFAHTGEAQAAKEVLLLDSKAQQTELEWISSPPNGWEEISG
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 YDENLNTIRTYQVCNVFEPNQNNWLLTTFINRRGAHRIYTEMRFTVRDCSSLPNVPGSCK
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NP_004 LDENYTPIRTYQVCQVMEPNQNNWLRTNWISKGNAQRIFVELKFTLRDCNSLPGVLGTCK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]