Result of FASTA (omim) for
pFN21AE3339
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3339, 976 aa
1>>>pF1KE3339 976 - 976 aa - 976 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3497+/-0.000537; mu= 4.6486+/- 0.033
mean_var=695.0674+/-157.221, 0's: 0 Z-trim(118.5): 1206 B-trim: 1741 in 1/56
Lambda= 0.048648
statistics sampled from 29907 (31607) to 29907 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.706), E-opt: 0.2 (0.371), width: 16
Scan time: 15.910
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005223 (OMIM: 179610) ephrin type-A receptor 1 ( 976) 6767 492.2 5.5e-138
XP_006715943 (OMIM: 179610) PREDICTED: ephrin type ( 861) 3612 270.7 2.3e-71
NP_001316019 (OMIM: 116600,176946) ephrin type-A r ( 922) 2938 223.4 4.2e-57
XP_016856024 (OMIM: 116600,176946) PREDICTED: ephr ( 965) 2938 223.5 4.3e-57
XP_016856023 (OMIM: 116600,176946) PREDICTED: ephr ( 973) 2938 223.5 4.3e-57
NP_004422 (OMIM: 116600,176946) ephrin type-A rece ( 976) 2938 223.5 4.3e-57
XP_016865854 (OMIM: 602190) PREDICTED: ephrin type ( 989) 2822 215.4 1.2e-54
NP_001291465 (OMIM: 602188) ephrin type-A receptor ( 986) 2765 211.3 2e-53
NP_004429 (OMIM: 602188) ephrin type-A receptor 4 ( 986) 2765 211.3 2e-53
NP_872272 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor 5 (1015) 2748 210.2 4.5e-53
XP_005264772 (OMIM: 179611) PREDICTED: ephrin type ( 982) 2704 207.1 3.8e-52
XP_005246431 (OMIM: 602188) PREDICTED: ephrin type ( 949) 2690 206.1 7.4e-52
NP_005224 (OMIM: 179611) ephrin type-A receptor 3 ( 983) 2684 205.7 1e-51
NP_001291466 (OMIM: 602188) ephrin type-A receptor ( 935) 2664 204.2 2.6e-51
NP_001275558 (OMIM: 602190) ephrin type-A receptor ( 993) 2603 200.0 5.2e-50
NP_004434 (OMIM: 601839) ephrin type-B receptor 3 ( 998) 2600 199.8 6e-50
XP_005264773 (OMIM: 179611) PREDICTED: ephrin type ( 918) 2594 199.3 7.8e-50
NP_001268695 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor (1016) 2581 198.5 1.5e-49
XP_005248726 (OMIM: 602190) PREDICTED: ephrin type ( 994) 2565 197.3 3.3e-49
NP_004435 (OMIM: 600011) ephrin type-B receptor 4 ( 987) 2487 191.8 1.5e-47
NP_004432 (OMIM: 600600) ephrin type-B receptor 1 ( 984) 2335 181.2 2.4e-44
NP_059145 (OMIM: 600997,603688) ephrin type-B rece ( 986) 2193 171.2 2.4e-41
NP_001296122 (OMIM: 600997,603688) ephrin type-B r (1055) 2193 171.3 2.5e-41
NP_004433 (OMIM: 600997,603688) ephrin type-B rece ( 987) 1680 135.2 1.6e-30
XP_006710504 (OMIM: 600997,603688) PREDICTED: ephr ( 980) 1675 134.8 2.1e-30
NP_004431 (OMIM: 602190) ephrin type-A receptor 7 ( 998) 1594 129.2 1.1e-28
XP_016856026 (OMIM: 116600,176946) PREDICTED: ephr ( 577) 1582 127.9 1.5e-28
XP_016863367 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 904) 1525 124.3 3e-27
XP_016867305 (OMIM: 600011) PREDICTED: ephrin type (1005) 1521 124.1 3.8e-27
XP_016863369 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 852) 1510 123.2 6e-27
XP_016863368 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 869) 1490 121.8 1.6e-26
XP_016863370 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 817) 1459 119.5 7e-26
XP_016861357 (OMIM: 600600) PREDICTED: ephrin type (1016) 1453 119.3 1e-25
XP_016861356 (OMIM: 600600) PREDICTED: ephrin type (1032) 1453 119.3 1e-25
XP_016861355 (OMIM: 600600) PREDICTED: ephrin type (1038) 1453 119.3 1e-25
XP_016861699 (OMIM: 600066) PREDICTED: ephrin type (1104) 1447 118.9 1.4e-25
XP_005248728 (OMIM: 602190) PREDICTED: ephrin type ( 610) 1432 117.4 2.3e-25
XP_005265710 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 874) 1429 117.5 3.1e-25
XP_011530037 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 926) 1429 117.5 3.2e-25
NP_001305690 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor ( 969) 1429 117.6 3.3e-25
NP_004430 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor 5 (1037) 1429 117.6 3.4e-25
NP_001268694 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor (1038) 1429 117.6 3.4e-25
XP_011510844 (OMIM: 600600) PREDICTED: ephrin type ( 394) 1412 115.7 5e-25
XP_006710505 (OMIM: 600997,603688) PREDICTED: ephr ( 956) 1396 115.2 1.6e-24
NP_001296121 (OMIM: 600997,603688) ephrin type-B r ( 928) 1389 114.7 2.2e-24
XP_016865855 (OMIM: 602190) PREDICTED: ephrin type ( 442) 1332 110.1 2.6e-23
NP_001268696 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor (1004) 1337 111.1 2.9e-23
XP_011514183 (OMIM: 602757) PREDICTED: ephrin type (1021) 1334 110.9 3.4e-23
NP_872585 (OMIM: 179611) ephrin type-A receptor 3 ( 539) 1321 109.5 4.8e-23
XP_011539277 (OMIM: 176945) PREDICTED: ephrin type ( 600) 1311 108.9 8.2e-23
>>NP_005223 (OMIM: 179610) ephrin type-A receptor 1 prec (976 aa)
initn: 6767 init1: 6767 opt: 6767 Z-score: 2598.3 bits: 492.2 E(85289): 5.5e-138
Smith-Waterman score: 6767; 99.8% identity (100.0% similar) in 976 aa overlap (1-976:1-976)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MERRWPLGLGLVLLLCAPLPPGARAKEVTLMDTSKAQGELGWLLDPPKDGWSEQQQILNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MERRWPLGLGLVLLLCAPLPPGARAKEVTLMDTSKAQGELGWLLDPPKDGWSEQQQILNG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 TPLYMYQDCPMQGRRDTDHWLRSNWIYRGEEASRVHVELQFTVRDCKSFPGGAGPLGCKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TPLYMYQDCPMQGRRDTDHWLRSNWIYRGEEASRVHVELQFTVRDCKSFPGGAGPLGCKE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 TFNLLYMESDQDVGIQLRRPLFQKVTTVAADQSFTIRDLASGSVKLNVERCSLGRLTRRG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
NP_005 TFNLLYMESDQDVGIQLRRPLFQKVTTVAADQSFTIRDLVSGSVKLNVERCSLGRLTRRG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 LYLAFHNPGACVALVSVRVFYQRCPETLNGLAQFPDTLPGPAGLVEVAGTCLPHARASPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LYLAFHNPGACVALVSVRVFYQRCPETLNGLAQFPDTLPGPAGLVEVAGTCLPHARASPR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 PSGAPRMHCSPDGEWLVPVGRCHCEPGYEEGGSGEACVACPSGSYRMDMDTPHCLTCPQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PSGAPRMHCSPDGEWLVPVGRCHCEPGYEEGGSGEACVACPSGSYRMDMDTPHCLTCPQQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 STAESEGATICTCESGHYRAPGEGPQVACTGPPSAPRNLSFSASGTQLSLRWEPPADTGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 STAESEGATICTCESGHYRAPGEGPQVACTGPPSAPRNLSFSASGTQLSLRWEPPADTGG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 RQDVRYSVRCSQCQGTAQDGGPCQPCGVGVHFSPGARGLTTPAVHVNGLEPYANYTFNVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RQDVRYSVRCSQCQGTAQDGGPCQPCGVGVHFSPGARGLTTPAVHVNGLEPYANYTFNVE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 AQNGVSGLGSSGHASTSVSISMGHAESLSGLSLRLVKKEPRQLELTWAGSRPRSPGANLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 AQNGVSGLGSSGHASTSVSISMGHAESLSGLSLRLVKKEPRQLELTWAGSRPRSPGANLT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 YELHVLNQDEERYQMVLEPRVLLTELQPDTTYIVRVRMLTPLGPGPFSPDHEFRTSPPVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 YELHVLNQDEERYQMVLEPRVLLTELQPDTTYIVRVRMLTPLGPGPFSPDHEFRTSPPVS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 RGLTGGEIVAVIFGLLLGAALLLGILVFRSRRAQRQRQQRQRDRATDVDREDKLWLKPYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RGLTGGEIVAVIFGLLLGAALLLGILVFRSRRAQRQRQQRQRDRATDVDREDKLWLKPYV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 DLQAYEDPAQGALDFTRELDPAWLMVDTVIGEGEFGEVYRGTLRLPSQDCKTVAIKTLKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DLQAYEDPAQGALDFTRELDPAWLMVDTVIGEGEFGEVYRGTLRLPSQDCKTVAIKTLKD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 TSPGGQWWNFLREATIMGQFSHPHILHLEGVVTKRKPIMIITEFMENGALDAFLREREDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TSPGGQWWNFLREATIMGQFSHPHILHLEGVVTKRKPIMIITEFMENGALDAFLREREDQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 LVPGQLVAMLQGIASGMNYLSNHNYVHRDLAARNILVNQNLCCKVSDFGLTRLLDDFDGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LVPGQLVAMLQGIASGMNYLSNHNYVHRDLAARNILVNQNLCCKVSDFGLTRLLDDFDGT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 YETQGGKIPIRWTAPEAIAHRIFTTASDVWSFGIVMWEVLSFGDKPYGEMSNQEVMKSIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 YETQGGKIPIRWTAPEAIAHRIFTTASDVWSFGIVMWEVLSFGDKPYGEMSNQEVMKSIE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 DGYRLPPPVDCPAPLYELMKNCWAYDRARRPHFQKLQAHLEQLLANPHSLRTIANFDPRV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
NP_005 DGYRLPPPVDCPAPLYELMKNCWAYDRARRPHFQKLQAHLEQLLANPHSLRTIANFDPRM
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 TLRLPSLSGSDGIPYRTVSEWLESIRMKRYILHFHSAGLDTMECVLELTAEDLTQMGITL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TLRLPSLSGSDGIPYRTVSEWLESIRMKRYILHFHSAGLDTMECVLELTAEDLTQMGITL
910 920 930 940 950 960
970
pF1KE3 PGHQKRILCSIQGFKD
::::::::::::::::
NP_005 PGHQKRILCSIQGFKD
970
>>XP_006715943 (OMIM: 179610) PREDICTED: ephrin type-A r (861 aa)
initn: 3598 init1: 3598 opt: 3612 Z-score: 1402.1 bits: 270.7 E(85289): 2.3e-71
Smith-Waterman score: 5721; 88.0% identity (88.2% similar) in 976 aa overlap (1-976:1-861)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MERRWPLGLGLVLLLCAPLPPGARAKEVTLMDTSKAQGELGWLLDPPKDGWSEQQQILNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MERRWPLGLGLVLLLCAPLPPGARAKEVTLMDTSKAQGELGWLLDPPKDGWSEQQQILNG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 TPLYMYQDCPMQGRRDTDHWLRSNWIYRGEEASRVHVELQFTVRDCKSFPGGAGPLGCKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TPLYMYQDCPMQGRRDTDHWLRSNWIYRGEEASRVHVELQFTVRDCKSFPGGAGPLGCKE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 TFNLLYMESDQDVGIQLRRPLFQKVTTVAADQSFTIRDLASGSVKLNVERCSLGRLTRRG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
XP_006 TFNLLYMESDQDVGIQLRRPLFQKVTTVAADQSFTIRDLVSGSVKLNVERCSLGRLTRRG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 LYLAFHNPGACVALVSVRVFYQRCPETLNGLAQFPDTLPGPAGLVEVAGTCLPHARASPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LYLAFHNPGACVALVSVRVFYQRCPETLNGLAQFPDTLPGPAGLVEVAGTCLPHARASPR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 PSGAPRMHCSPDGEWLVPVGRCHCEPGYEEGGSGEACVACPSGSYRMDMDTPHCLTCPQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PSGAPRMHCSPDGEWLVPVGRCHCEPGYEEGGSGEACVACPSGSYRMDMDTPHCLTCPQQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 STAESEGATICTCESGHYRAPGEGPQVACTGPPSAPRNLSFSASGTQLSLRWEPPADTGG
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 STAESEGATICTCESGHYRAPGEGPQVACT------------------------------
310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 RQDVRYSVRCSQCQGTAQDGGPCQPCGVGVHFSPGARGLTTPAVHVNGLEPYANYTFNVE
XP_006 ------------------------------------------------------------
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 AQNGVSGLGSSGHASTSVSISMGHAESLSGLSLRLVKKEPRQLELTWAGSRPRSPGANLT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 -------------------------ESLSGLSLRLVKKEPRQLELTWAGSRPRSPGANLT
340 350 360
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 YELHVLNQDEERYQMVLEPRVLLTELQPDTTYIVRVRMLTPLGPGPFSPDHEFRTSPPVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 YELHVLNQDEERYQMVLEPRVLLTELQPDTTYIVRVRMLTPLGPGPFSPDHEFRTSPPVS
370 380 390 400 410 420
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 RGLTGGEIVAVIFGLLLGAALLLGILVFRSRRAQRQRQQRQRDRATDVDREDKLWLKPYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RGLTGGEIVAVIFGLLLGAALLLGILVFRSRRAQRQRQQRQRDRATDVDREDKLWLKPYV
430 440 450 460 470 480
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 DLQAYEDPAQGALDFTRELDPAWLMVDTVIGEGEFGEVYRGTLRLPSQDCKTVAIKTLKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 DLQAYEDPAQGALDFTRELDPAWLMVDTVIGEGEFGEVYRGTLRLPSQDCKTVAIKTLKD
490 500 510 520 530 540
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 TSPGGQWWNFLREATIMGQFSHPHILHLEGVVTKRKPIMIITEFMENGALDAFLREREDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TSPGGQWWNFLREATIMGQFSHPHILHLEGVVTKRKPIMIITEFMENGALDAFLREREDQ
550 560 570 580 590 600
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 LVPGQLVAMLQGIASGMNYLSNHNYVHRDLAARNILVNQNLCCKVSDFGLTRLLDDFDGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LVPGQLVAMLQGIASGMNYLSNHNYVHRDLAARNILVNQNLCCKVSDFGLTRLLDDFDGT
610 620 630 640 650 660
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 YETQGGKIPIRWTAPEAIAHRIFTTASDVWSFGIVMWEVLSFGDKPYGEMSNQEVMKSIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 YETQGGKIPIRWTAPEAIAHRIFTTASDVWSFGIVMWEVLSFGDKPYGEMSNQEVMKSIE
670 680 690 700 710 720
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 DGYRLPPPVDCPAPLYELMKNCWAYDRARRPHFQKLQAHLEQLLANPHSLRTIANFDPRV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
XP_006 DGYRLPPPVDCPAPLYELMKNCWAYDRARRPHFQKLQAHLEQLLANPHSLRTIANFDPRM
730 740 750 760 770 780
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 TLRLPSLSGSDGIPYRTVSEWLESIRMKRYILHFHSAGLDTMECVLELTAEDLTQMGITL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TLRLPSLSGSDGIPYRTVSEWLESIRMKRYILHFHSAGLDTMECVLELTAEDLTQMGITL
790 800 810 820 830 840
970
pF1KE3 PGHQKRILCSIQGFKD
::::::::::::::::
XP_006 PGHQKRILCSIQGFKD
850 860
>>NP_001316019 (OMIM: 116600,176946) ephrin type-A recep (922 aa)
initn: 2241 init1: 916 opt: 2938 Z-score: 1146.2 bits: 223.4 E(85289): 4.2e-57
Smith-Waterman score: 3069; 51.0% identity (73.7% similar) in 937 aa overlap (55-976:2-913)
30 40 50 60 70 80
pF1KE3 AKEVTLMDTSKAQGELGWLLDPPKDGWSEQQQILNGTPLYMYQDCP-MQGRRDTDHWLRS
:.:.: :.:::. : :.: : :.:::.
NP_001 MQNIMNDMPIYMYSVCNVMSG--DQDNWLRT
10 20
90 100 110 120 130 140
pF1KE3 NWIYRGEEASRVHVELQFTVRDCKSFPGGAGPLGCKETFNLLYMESDQDVGIQLRRPLFQ
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NP_001 NWVYRGE-AERIFIELKFTVRDCNSFPGGAS--SCKETFNLYYAESDLDYGTNFQKRLFT
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pF1KE3 KVTTVAADQSFTIRDLASGSVKLNVERCSLGRLTRRGLYLAFHNPGACVALVSVRVFYQR
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NP_001 KIDTIAPDEITVSSDFEARHVKLNVEERSVGPLTRKGFYLAFQDIGACVALLSVRVYYKK
90 100 110 120 130 140
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pF1KE3 CPETLNGLAQFPDTLPGP--AGLVEVAGTCLPHARASPRPSGA-PRMHCSPDGEWLVPVG
::: :.:::.::.:. : .:. :::::. :: . : :.: :::::. :::::::.:
NP_001 CPELLQGLAHFPETIAGSDAPSLATVAGTCVDHA-VVP-PGGEEPRMHCAVDGEWLVPIG
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pF1KE3 RCHCEPGYEEGGSGEACVACPSGSYRMDMDTPHCLTCPQQSTAESEGATICTCESGHYRA
.: :. :::. .:: :: : .... . :: ::... :::: : :: : .::
NP_001 QCLCQAGYEK--VEDACQACSPGFFKFEASESPCLECPEHTLPSPEGATSCECEEGFFRA
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: . .. :: :::::. :. . :... ::: :: :.:::.:. ::: : :: ..
NP_001 PQDPASMPCTRPPSAPHYLTAVGMGAKVELRWTPPQDSGGREDIVYSVTCEQCW---PES
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pF1KE3 GPCQPCGVGVHFSPGARGLTTPAVHVNGLEPYANYTFNVEAQNGVSGLGSSGHASTSVSI
: : :: ..:..: .::: .: :. :::. ::::.:::.:::::: .: .. ..:.
NP_001 GECGPCEASVRYSEPPHGLTRTSVTVSDLEPHMNYTFTVEARNGVSGLVTS-RSFRTASV
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:....: . .:: . .: ..:. :.. . ::. .. : . :..
NP_001 SINQTEPPK---VRLEGRSTTSLSVSWSIPPPQQSRV-WKYEVTYRKKGDSNSYNVRRTE
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pF1KE3 --RVLLTELQPDTTYIVRVRMLTPLGPGPFSPDHEFRTSPPVSRG---LTGGEIVAVIFG
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NP_001 GFSVTLDDLAPDTTYLVQVQALTQEGQGAGSKVHEFQTLSPEGSGNLAVIGGVAVGVVLL
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:.:.. .:... : :. :: ::. . :: . ::: ::: ..:::: :.
NP_001 LVLAG---VGFFIHRRRKNQRARQSPE-----DVYFSKSEQLKPLKTYVDPHTYEDPNQA
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pF1KE3 ALDFTRELDPAWLMVDTVIGEGEFGEVYRGTLRLPSQDCKT-VAIKTLKDTSPGGQWWNF
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NP_001 VLKFTTEIHPSCVTRQKVIGAGEFGEVYKGMLKTSSGKKEVPVAIKTLKAGYTEKQRVDF
550 560 570 580 590 600
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pF1KE3 LREATIMGQFSHPHILHLEGVVTKRKPIMIITEFMENGALDAFLREREDQLVPGQLVAML
: :: ::::::: .:..::::..: ::.:::::.::::::: ::::.. .. :::.::
NP_001 LGEAGIMGQFSHHNIIRLEGVISKYKPMMIITEYMENGALDKFLREKDGEFSVLQLVGML
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pF1KE3 QGIASGMNYLSNHNYVHRDLAARNILVNQNLCCKVSDFGLTRLL-DDFDGTYETQGGKIP
.:::.::.::.: :::::::::::::::.:: ::::::::.:.: :: ..:: :.:::::
NP_001 RGIAAGMKYLANMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEATYTTSGGKIP
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pF1KE3 IRWTAPEAIAHRIFTTASDVWSFGIVMWEVLSFGDKPYGEMSNQEVMKSIEDGYRLPPPV
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pF1KE3 DCPAPLYELMKNCWAYDRARRPHFQKLQAHLEQLLANPHSLRTIANFDPRVTLRLPSLSG
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pF1KE3 SDGIPYRTVSEWLESIRMKRYILHFHSAGLDTMECVLELTAEDLTQMGITLPGHQKRILC
:.:.:.::::::::::.:..: :: .:: ..: :...: .:. ..:. ::::::::
NP_001 SEGVPFRTVSEWLESIKMQQYTEHFMAAGYTAIEKVVQMTNDDIKRIGVRLPGHQKRIAY
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970
pF1KE3 SIQGFKD
:. :.::
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:...:: :.:.: . : :::::: : ::. .:.:.:
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. ::. .. : . :.. : : .: :::::.:.:. :: : : : ::
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: .. ::::::: : .:: :: ::::::: .:..::::..: ::.:::::.:
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:::::.:.: :: ..:: :.::::::::::::::..: ::.::::::::::::::...:.
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pF1KE3 ANPHSLRTIANFDPRVTLRLPSLSGSDGIPYRTVSEWLESIRMKRYILHFHSAGLDTMEC
: ::.:.:.:::::..:::: :::.:.:.::::::::::.:..: :: .:: ..:
XP_016 RAPDSLKTLADFDPRVSIRLPSTSGSEGVPFRTVSEWLESIKMQQYTEHFMAAGYTAIEK
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pF1KE3 VLELTAEDLTQMGITLPGHQKRILCSIQGFKD
:...: .:. ..:. :::::::: :. :.::
XP_016 VVQMTNDDIKRIGVRLPGHQKRIAYSLLGLKDQVNTVGIPI
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pF1KE3 MERRWPLGLGLVLLLCAPLPPGARAKEVTLMDTSKAQGELGWLLDPPKDGWSEQQQILNG
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XP_016 MPIYMYSVCNVMSG--DQDNWLRTNWVYRGE-AERIFIELKFTVRDCNSFPGGAS--SCK
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pF1KE3 ETFNLLYMESDQDVGIQLRRPLFQKVTTVAADQSFTIRDLASGSVKLNVERCSLGRLTRR
::::: : ::: : : .... :: :. :.: :. . :. . ::::::. :.: :::.
XP_016 ETFNLYYAESDLDYGTNFQKRLFTKIDTIAPDEITVSSDFEARHVKLNVEERSVGPLTRK
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pF1KE3 GLYLAFHNPGACVALVSVRVFYQRCPETLNGLAQFPDTLPGP--AGLVEVAGTCLPHARA
:.::::.. ::::::.::::.:..::: :.:::.::.:. : .:. :::::. :: .
XP_016 GFYLAFQDIGACVALLSVRVYYKKCPELLQGLAHFPETIAGSDAPSLATVAGTCVDHA-V
180 190 200 210 220 230
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pF1KE3 SPRPSGA-PRMHCSPDGEWLVPVGRCHCEPGYEEGGSGEACVACPSGSYRMDMDTPHCLT
: :.: :::::. :::::::.:.: :. :::. .:: :: : .... . ::
XP_016 VP-PGGEEPRMHCAVDGEWLVPIGQCLCQAGYEK--VEDACQACSPGFFKFEASESPCLE
240 250 260 270 280
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::... :::: : :: : .::: . .. :: :::::. :. . :... ::: ::
XP_016 CPEHTLPSPEGATSCECEEGFFRAPQDPASMPCTRPPSAPHYLTAVGMGAKVELRWTPPQ
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XP_016 DSGGREDIVYSVTCEQCW---PESGECGPCEASVRYSEPPHGLTRTSVTVSDLEPHMNYT
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. ::: ::: ..:::: :..: :: :. :. . . ::: :::::::.: :. :
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XP_016 GKKEVPVAIKTLKAGYTEKQRVDFLGEAGIMGQFSHHNIIRLEGVISKYKPMMIITEYME
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pF1KE3 NGALDAFLREREDQLVPGQLVAMLQGIASGMNYLSNHNYVHRDLAARNILVNQNLCCKVS
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XP_016 NGALDKFLREKDGEFSVLQLVGMLRGIAAGMKYLANMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVS
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pF1KE3 DFGLTRLL-DDFDGTYETQGGKIPIRWTAPEAIAHRIFTTASDVWSFGIVMWEVLSFGDK
::::.:.: :: ..:: :.::::::::::::::..: ::.::::::::::::::...:..
XP_016 DFGLSRVLEDDPEATYTTSGGKIPIRWTAPEAISYRKFTSASDVWSFGIVMWEVMTYGER
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pF1KE3 PYGEMSNQEVMKSIEDGYRLPPPVDCPAPLYELMKNCWAYDRARRPHFQKLQAHLEQLLA
:: :.::.::::.:.::.::: :.:::. .:.:: .:: .:::::.: . . :..:.
XP_016 PYWELSNHEVMKAINDGFRLPTPMDCPSAIYQLMMQCWQQERARRPKFADIVSILDKLIR
820 830 840 850 860 870
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pF1KE3 NPHSLRTIANFDPRVTLRLPSLSGSDGIPYRTVSEWLESIRMKRYILHFHSAGLDTMECV
: ::.:.:.:::::..:::: :::.:.:.::::::::::.:..: :: .:: ..: :
XP_016 APDSLKTLADFDPRVSIRLPSTSGSEGVPFRTVSEWLESIKMQQYTEHFMAAGYTAIEKV
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pF1KE3 LELTAEDLTQMGITLPGHQKRILCSIQGFKD
...: .:. ..:. :::::::: :. :.::
XP_016 VQMTNDDIKRIGVRLPGHQKRIAYSLLGLKDQVNTVGIPI
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>>NP_004422 (OMIM: 116600,176946) ephrin type-A receptor (976 aa)
initn: 2394 init1: 916 opt: 2938 Z-score: 1146.0 bits: 223.5 E(85289): 4.3e-57
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10 20 30 40 50
pF1KE3 MERRWPLGLGLVLLLCA-PLPPGARAKEVTLMDTSKAQGELGWLLDPPKDGWSEQQQILN
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NP_004 MELQAARACFALLWGCALAAAAAAQGKEVVLLDFAAAGGELGWLTHPYGKGWDLMQNIMN
10 20 30 40 50 60
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pF1KE3 GTPLYMYQDCP-MQGRRDTDHWLRSNWIYRGEEASRVHVELQFTVRDCKSFPGGAGPLGC
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NP_004 DMPIYMYSVCNVMSG--DQDNWLRTNWVYRGE-AERIFIELKFTVRDCNSFPGGAS--SC
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pF1KE3 KETFNLLYMESDQDVGIQLRRPLFQKVTTVAADQSFTIRDLASGSVKLNVERCSLGRLTR
:::::: : ::: : : .... :: :. :.: :. . :. . ::::::. :.: :::
NP_004 KETFNLYYAESDLDYGTNFQKRLFTKIDTIAPDEITVSSDFEARHVKLNVEERSVGPLTR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 RGLYLAFHNPGACVALVSVRVFYQRCPETLNGLAQFPDTLPGP--AGLVEVAGTCLPHAR
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::... :::: : :: : .::: . .. :: :::::. :. . :... ::: ::
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. ::. .. : . :.. : : .: :::::.:.:. :: : : : ::
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:.: : . : . :: :.:.. :.:.. .:... : :. :: ::. . ::
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: .. ::::::: : .:: :: ::::::: .:..::::..: ::.:::::.:
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NP_001 FGMSRVLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERP
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NP_001 YWDMSNQDVIKAIEEGYRLPPPMDCPIALHQLMLDCWQKERSDRPKFGQIVNMLDKLIRN
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>>NP_004429 (OMIM: 602188) ephrin type-A receptor 4 isof (986 aa)
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NP_004 LSKKGFYLAFQDVGACIALVSVRVFYKKCPLTVRNLAQFPDTITGADTSSLVEVRGSCVN
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