Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3321
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3321, 904 aa
1>>>pF1KE3321 904 - 904 aa - 904 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4300+/-0.00153; mu= 15.2987+/- 0.092
mean_var=122.0922+/-25.762, 0's: 0 Z-trim(100.7): 199 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.116073
statistics sampled from 5982 (6202) to 5982 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.518), E-opt: 0.2 (0.191), width: 16
Scan time: 3.520
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3846.1 TLR3 gene_id:7098|Hs108|chr4 ( 904) 5981 1014.5 0
CCDS14152.1 TLR8 gene_id:51311|Hs108|chrX (1041) 638 119.9 2.5e-26
CCDS14153.1 TLR8 gene_id:51311|Hs108|chrX (1059) 638 119.9 2.6e-26
CCDS31449.1 LGR4 gene_id:55366|Hs108|chr11 ( 951) 417 82.8 3.3e-15
CCDS3445.1 TLR10 gene_id:81793|Hs108|chr4 ( 811) 410 81.6 6.5e-15
CCDS3784.1 TLR2 gene_id:7097|Hs108|chr4 ( 784) 404 80.6 1.3e-14
CCDS33973.1 TLR1 gene_id:7096|Hs108|chr4 ( 786) 402 80.2 1.6e-14
CCDS55602.1 PODN gene_id:127435|Hs108|chr1 ( 642) 351 71.6 5.2e-12
CCDS573.1 PODN gene_id:127435|Hs108|chr1 ( 661) 351 71.6 5.3e-12
CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1523) 347 71.3 1.6e-11
CCDS64311.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1530) 347 71.3 1.6e-11
CCDS10446.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16 ( 605) 338 69.4 2.2e-11
CCDS53982.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16 ( 643) 338 69.5 2.3e-11
CCDS45905.1 LINGO3 gene_id:645191|Hs108|chr19 ( 592) 335 68.9 3.1e-11
>>CCDS3846.1 TLR3 gene_id:7098|Hs108|chr4 (904 aa)
initn: 5981 init1: 5981 opt: 5981 Z-score: 5422.4 bits: 1014.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5981; 100.0% identity (100.0% similar) in 904 aa overlap (1-904:1-904)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MRQTLPCIYFWGGLLPFGMLCASSTTKCTVSHEVADCSHLKLTQVPDDLPTNITVLNLTH
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CCDS38 MRQTLPCIYFWGGLLPFGMLCASSTTKCTVSHEVADCSHLKLTQVPDDLPTNITVLNLTH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 NQLRRLPAANFTRYSQLTSLDVGFNTISKLEPELCQKLPMLKVLNLQHNELSQLSDKTFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 NQLRRLPAANFTRYSQLTSLDVGFNTISKLEPELCQKLPMLKVLNLQHNELSQLSDKTFA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 FCTNLTELHLMSNSIQKIKNNPFVKQKNLITLDLSHNGLSSTKLGTQVQLENLQELLLSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 FCTNLTELHLMSNSIQKIKNNPFVKQKNLITLDLSHNGLSSTKLGTQVQLENLQELLLSN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 NKIQALKSEELDIFANSSLKKLELSSNQIKEFSPGCFHAIGRLFGLFLNNVQLGPSLTEK
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CCDS38 NKIQALKSEELDIFANSSLKKLELSSNQIKEFSPGCFHAIGRLFGLFLNNVQLGPSLTEK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 LCLELANTSIRNLSLSNSQLSTTSNTTFLGLKWTNLTMLDLSYNNLNVVGNDSFAWLPQL
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CCDS38 LCLELANTSIRNLSLSNSQLSTTSNTTFLGLKWTNLTMLDLSYNNLNVVGNDSFAWLPQL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 EYFFLEYNNIQHLFSHSLHGLFNVRYLNLKRSFTKQSISLASLPKIDDFSFQWLKCLEHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 EYFFLEYNNIQHLFSHSLHGLFNVRYLNLKRSFTKQSISLASLPKIDDFSFQWLKCLEHL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 NMEDNDIPGIKSNMFTGLINLKYLSLSNSFTSLRTLTNETFVSLAHSPLHILNLTKNKIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 NMEDNDIPGIKSNMFTGLINLKYLSLSNSFTSLRTLTNETFVSLAHSPLHILNLTKNKIS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 KIESDAFSWLGHLEVLDLGLNEIGQELTGQEWRGLENIFEIYLSYNKYLQLTRNSFALVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 KIESDAFSWLGHLEVLDLGLNEIGQELTGQEWRGLENIFEIYLSYNKYLQLTRNSFALVP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 SLQRLMLRRVALKNVDSSPSPFQPLRNLTILDLSNNNIANINDDMLEGLEKLEILDLQHN
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CCDS38 SLQRLMLRRVALKNVDSSPSPFQPLRNLTILDLSNNNIANINDDMLEGLEKLEILDLQHN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 NLARLWKHANPGGPIYFLKGLSHLHILNLESNGFDEIPVEVFKDLFELKIIDLGLNNLNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 NLARLWKHANPGGPIYFLKGLSHLHILNLESNGFDEIPVEVFKDLFELKIIDLGLNNLNT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 LPASVFNNQVSLKSLNLQKNLITSVEKKVFGPAFRNLTELDMRFNPFDCTCESIAWFVNW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 LPASVFNNQVSLKSLNLQKNLITSVEKKVFGPAFRNLTELDMRFNPFDCTCESIAWFVNW
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 INETHTNIPELSSHYLCNTPPHYHGFPVRLFDTSSCKDSAPFELFFMINTSILLIFIFIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 INETHTNIPELSSHYLCNTPPHYHGFPVRLFDTSSCKDSAPFELFFMINTSILLIFIFIV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 LLIHFEGWRISFYWNVSVHRVLGFKEIDRQTEQFEYAAYIIHAYKDKDWVWEHFSSMEKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 LLIHFEGWRISFYWNVSVHRVLGFKEIDRQTEQFEYAAYIIHAYKDKDWVWEHFSSMEKE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 DQSLKFCLEERDFEAGVFELEAIVNSIKRSRKIIFVITHHLLKDPLCKRFKVHHAVQQAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 DQSLKFCLEERDFEAGVFELEAIVNSIKRSRKIIFVITHHLLKDPLCKRFKVHHAVQQAI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 EQNLDSIILVFLEEIPDYKLNHALCLRRGMFKSHCILNWPVQKERIGAFRHKLQVALGSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 EQNLDSIILVFLEEIPDYKLNHALCLRRGMFKSHCILNWPVQKERIGAFRHKLQVALGSK
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 NSVH
::::
CCDS38 NSVH
>>CCDS14152.1 TLR8 gene_id:51311|Hs108|chrX (1041 aa)
initn: 340 init1: 106 opt: 638 Z-score: 586.1 bits: 119.9 E(32554): 2.5e-26
Smith-Waterman score: 764; 26.3% identity (57.6% similar) in 919 aa overlap (41-901:136-1026)
20 30 40 50 60 70
pF1KE3 WGGLLPFGMLCASSTTKCTVSHEVADCSHLKLTQVPDDLPTNITVLNLTHNQLRRLPAAN
.: :.:. :: ..: :.: .:.. . .
CCDS14 NPGIQSNGLNITDGAFLNLKNLRELLLEDNQLPQIPSGLPESLTELSLIQNNIYNITKEG
110 120 130 140 150 160
80 90 100 110 120
pF1KE3 FTRYSQLTSLDVG----FNTI---SKLEPELCQKLPMLKVLNLQHNELSQLSDKTFAFCT
..: .: .: .. :: . ...: . . : :..:.:. : ::.. : . .
CCDS14 ISRLINLKNLYLAWNCYFNKVCEKTNIEDGVFETLTNLELLSLSFNSLSHVPPK---LPS
170 180 190 200 210 220
130 140 150 160
pF1KE3 NLTELHLMSNSIQKIKNNPFVKQKNLITLDLSHN---------------GLSSTKLGTQV
.: .: : ...:. :... : :: :::: : : .: .. .
CCDS14 SLRKLFLSNTQIKYISEEDFKGLINLTLLDLSGNCPRCFNAPFPCVPCDGGASINID-RF
230 240 250 260 270 280
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 QLENLQELLLSNNKIQALKSEELDIFAN-SSLKKLELSSNQ-IKEFSPGCFHAI-GRLFG
..:: .: : . .:.. . : : :: :.: : . :.. : : .. ::
CCDS14 AFQNLTQLRYLNLSSTSLRKINAAWFKNMPHLKVLDLEFNYLVGEIASGAFLTMLPRLEI
290 300 310 320 330 340
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 LFLNNVQLGPSLTEKLCLELANT---SIRNLSLSNSQLSTTSNTTFLGL-KWTNLTMLDL
: :. . : ... . . :.: : : . .. . : : . ::. ..:
CCDS14 LDLSFNYIKGSYPQHINISRNFSKLLSLRALHLRGYVFQELREDDFQPLMQLPNLSTINL
350 360 370 380 390 400
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 SYNNLNVVGNDSFAWLPQLEYFFLEYNNIQHLFSHSLHGLFNVRYLNLKRSFTKQ-SISL
. : .. . : . .:: ..: : :. : . . .. : ...: . :. : ..
CCDS14 GINFIKQIDFKLFQNFSNLEIIYLSENRISPLVKDTRQSYANSS--SFQRHIRKRRSTDF
410 420 430 440 450
350 360 370 380 390
pF1KE3 ASLPKIDDFSFQ--WLK--CLEH---LNMEDNDIPGIKSNMFTGLINLKYLSLSNSFTSL
:. . . : .: : . :.. :.: : :.: .: .. :.:: . ..
CCDS14 EFDPHSNFYHFTRPLIKPQCAAYGKALDLSLNSIFFIGPNQFENLPDIACLNLSAN-SNA
460 470 480 490 500 510
400 410 420 430 440
pF1KE3 RTLTNETFVSLAHSPLHILNLTKNKISKIESDAFSWLGHLEVLDLGLNEIGQELTG----
..:.. : .. : .. :.::.:... ...:.. :. ::::::. : ...:
CCDS14 QVLSGTEFSAIPH--VKYLDLTNNRLDFDNASALTELSDLEVLDLSYNSHYFRIAGVTHH
520 530 540 550 560 570
450 460 470 480 490 500
pF1KE3 -QEWRGLENIFEIYLSYNKYLQLTRNSFALVPSLQRLML---RRVALKNVDSSP--SPFQ
. ... :. . ::.:. :: . :: .:.. : : : :.. : :.
CCDS14 LEFIQNFTNLKVLNLSHNNIYTLTDKYNLESKSLVELVFSGNRLDILWNDDDNRYISIFK
580 590 600 610 620 630
510 520 530 540 550 560
pF1KE3 PLRNLTILDLSNNNIANINDDMLEGLE-KLEILDLQHNNLARL-WKHANPGGPIYFLKGL
:.::: :::: : . .: .. . .: .: : .. : : . : .:. .
CCDS14 GLKNLTRLDLSLNRLKHIPNEAFLNLPASLTELHINDNMLKFFNWT---------LLQQF
640 650 660 670 680
570 580 590 600 610 620
pF1KE3 SHLHILNLESNGFDEIPVEVFKDLFE-LKIIDLGLNNLNTLPASVFNNQVSLKSLNLQKN
.:..:.:..: . . .. ..:. :. . :. : .. ::.. ... ::: :.:..:
CCDS14 PRLELLDLRGNKLLFL-TDSLSDFTSSLRTLLLSHNRISHLPSGFLSEVSSLKHLDLSSN
690 700 710 720 730 740
630 640 650 660 670
pF1KE3 LITSVEKKVF-GPAFRNLTELDMRFNPFDCTCESIAWFVNWINETHTN--IPELSSHYLC
:. ...:... . .:. :... :::.:::. :. : :..: : : ::.: . .:
CCDS14 LLKTINKSALETKTTTKLSMLELHGNPFECTCD-IGDFRRWMDE-HLNVKIPRLVD-VIC
750 760 770 780 790 800
680 690 700 710 720 730
pF1KE3 NTPPHYHGFPVRLFDTSSCKDSAPFELFFMINTSILLIFIFIVLLIHFEGWRISFYWNVS
.: .: . .. ..: ... ..:... : . .. .: :. : . : .::
CCDS14 ASPGDQRGKSIVSLELTTCVSDVTAVILFFFTFFITTMVMLAALAHHLFYWDVWFIYNVC
810 820 830 840 850 860
740 750 760 770 780 790
pF1KE3 VHRVLGFKEIDRQTEQFEYAAYIIHAYKDK---DWVWEH--FSSMEKEDQSLKFCLEERD
. .: :.. .. : : : ::: . :: ::: .. . :..:... .::::::
CCDS14 LAKVKGYRSLS--TSQTFYDAYISYDTKDASVTDWVINELRYHLEESRDKNVLLCLEERD
870 880 890 900 910 920
800 810 820 830 840 850
pF1KE3 FEAGVFELEAIVNSIKRSRKIIFVITHHLLKDPLCKRFKVHHAVQQAIEQNLDSIILVFL
.. :. .. ...::..:.: .::.:.. :. : . :.:. ...:.: ::...:
CCDS14 WDPGLAIIDNLMQSINQSKKTVFVLTKKYAKSWNFKT-AFYLALQRLMDENMDVIIFILL
930 940 950 960 970 980
860 870 880 890 900
pF1KE3 EEIPDYKLNHALCLRRGMFKSHCILNWPVQKERIGAFRHKLQVALGSKNSVH
: : . .. : ::. . :: ::.:: . . : : . :. .. ..:
CCDS14 E--PVLQHSQYLRLRQRICKSS-ILQWPDNPKAEGLFWQTLRNVVLTENDSRYNNMYVDS
990 1000 1010 1020 1030
CCDS14 IKQY
1040
>>CCDS14153.1 TLR8 gene_id:51311|Hs108|chrX (1059 aa)
initn: 340 init1: 106 opt: 638 Z-score: 586.0 bits: 119.9 E(32554): 2.6e-26
Smith-Waterman score: 764; 26.3% identity (57.6% similar) in 919 aa overlap (41-901:154-1044)
20 30 40 50 60 70
pF1KE3 WGGLLPFGMLCASSTTKCTVSHEVADCSHLKLTQVPDDLPTNITVLNLTHNQLRRLPAAN
.: :.:. :: ..: :.: .:.. . .
CCDS14 NPGIQSNGLNITDGAFLNLKNLRELLLEDNQLPQIPSGLPESLTELSLIQNNIYNITKEG
130 140 150 160 170 180
80 90 100 110 120
pF1KE3 FTRYSQLTSLDVG----FNTI---SKLEPELCQKLPMLKVLNLQHNELSQLSDKTFAFCT
..: .: .: .. :: . ...: . . : :..:.:. : ::.. : . .
CCDS14 ISRLINLKNLYLAWNCYFNKVCEKTNIEDGVFETLTNLELLSLSFNSLSHVPPK---LPS
190 200 210 220 230 240
130 140 150 160
pF1KE3 NLTELHLMSNSIQKIKNNPFVKQKNLITLDLSHN---------------GLSSTKLGTQV
.: .: : ...:. :... : :: :::: : : .: .. .
CCDS14 SLRKLFLSNTQIKYISEEDFKGLINLTLLDLSGNCPRCFNAPFPCVPCDGGASINID-RF
250 260 270 280 290
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 QLENLQELLLSNNKIQALKSEELDIFAN-SSLKKLELSSNQ-IKEFSPGCFHAI-GRLFG
..:: .: : . .:.. . : : :: :.: : . :.. : : .. ::
CCDS14 AFQNLTQLRYLNLSSTSLRKINAAWFKNMPHLKVLDLEFNYLVGEIASGAFLTMLPRLEI
300 310 320 330 340 350
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 LFLNNVQLGPSLTEKLCLELANT---SIRNLSLSNSQLSTTSNTTFLGL-KWTNLTMLDL
: :. . : ... . . :.: : : . .. . : : . ::. ..:
CCDS14 LDLSFNYIKGSYPQHINISRNFSKLLSLRALHLRGYVFQELREDDFQPLMQLPNLSTINL
360 370 380 390 400 410
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 SYNNLNVVGNDSFAWLPQLEYFFLEYNNIQHLFSHSLHGLFNVRYLNLKRSFTKQ-SISL
. : .. . : . .:: ..: : :. : . . .. : ...: . :. : ..
CCDS14 GINFIKQIDFKLFQNFSNLEIIYLSENRISPLVKDTRQSYANSS--SFQRHIRKRRSTDF
420 430 440 450 460 470
350 360 370 380 390
pF1KE3 ASLPKIDDFSFQ--WLK--CLEH---LNMEDNDIPGIKSNMFTGLINLKYLSLSNSFTSL
:. . . : .: : . :.. :.: : :.: .: .. :.:: . ..
CCDS14 EFDPHSNFYHFTRPLIKPQCAAYGKALDLSLNSIFFIGPNQFENLPDIACLNLSAN-SNA
480 490 500 510 520 530
400 410 420 430 440
pF1KE3 RTLTNETFVSLAHSPLHILNLTKNKISKIESDAFSWLGHLEVLDLGLNEIGQELTG----
..:.. : .. : .. :.::.:... ...:.. :. ::::::. : ...:
CCDS14 QVLSGTEFSAIPH--VKYLDLTNNRLDFDNASALTELSDLEVLDLSYNSHYFRIAGVTHH
540 550 560 570 580 590
450 460 470 480 490 500
pF1KE3 -QEWRGLENIFEIYLSYNKYLQLTRNSFALVPSLQRLML---RRVALKNVDSSP--SPFQ
. ... :. . ::.:. :: . :: .:.. : : : :.. : :.
CCDS14 LEFIQNFTNLKVLNLSHNNIYTLTDKYNLESKSLVELVFSGNRLDILWNDDDNRYISIFK
600 610 620 630 640 650
510 520 530 540 550 560
pF1KE3 PLRNLTILDLSNNNIANINDDMLEGLE-KLEILDLQHNNLARL-WKHANPGGPIYFLKGL
:.::: :::: : . .: .. . .: .: : .. : : . : .:. .
CCDS14 GLKNLTRLDLSLNRLKHIPNEAFLNLPASLTELHINDNMLKFFNWT---------LLQQF
660 670 680 690 700
570 580 590 600 610 620
pF1KE3 SHLHILNLESNGFDEIPVEVFKDLFE-LKIIDLGLNNLNTLPASVFNNQVSLKSLNLQKN
.:..:.:..: . . .. ..:. :. . :. : .. ::.. ... ::: :.:..:
CCDS14 PRLELLDLRGNKLLFL-TDSLSDFTSSLRTLLLSHNRISHLPSGFLSEVSSLKHLDLSSN
710 720 730 740 750 760
630 640 650 660 670
pF1KE3 LITSVEKKVF-GPAFRNLTELDMRFNPFDCTCESIAWFVNWINETHTN--IPELSSHYLC
:. ...:... . .:. :... :::.:::. :. : :..: : : ::.: . .:
CCDS14 LLKTINKSALETKTTTKLSMLELHGNPFECTCD-IGDFRRWMDE-HLNVKIPRLVD-VIC
770 780 790 800 810 820
680 690 700 710 720 730
pF1KE3 NTPPHYHGFPVRLFDTSSCKDSAPFELFFMINTSILLIFIFIVLLIHFEGWRISFYWNVS
.: .: . .. ..: ... ..:... : . .. .: :. : . : .::
CCDS14 ASPGDQRGKSIVSLELTTCVSDVTAVILFFFTFFITTMVMLAALAHHLFYWDVWFIYNVC
830 840 850 860 870 880
740 750 760 770 780 790
pF1KE3 VHRVLGFKEIDRQTEQFEYAAYIIHAYKDK---DWVWEH--FSSMEKEDQSLKFCLEERD
. .: :.. .. : : : ::: . :: ::: .. . :..:... .::::::
CCDS14 LAKVKGYRSLS--TSQTFYDAYISYDTKDASVTDWVINELRYHLEESRDKNVLLCLEERD
890 900 910 920 930
800 810 820 830 840 850
pF1KE3 FEAGVFELEAIVNSIKRSRKIIFVITHHLLKDPLCKRFKVHHAVQQAIEQNLDSIILVFL
.. :. .. ...::..:.: .::.:.. :. : . :.:. ...:.: ::...:
CCDS14 WDPGLAIIDNLMQSINQSKKTVFVLTKKYAKSWNFKT-AFYLALQRLMDENMDVIIFILL
940 950 960 970 980 990
860 870 880 890 900
pF1KE3 EEIPDYKLNHALCLRRGMFKSHCILNWPVQKERIGAFRHKLQVALGSKNSVH
: : . .. : ::. . :: ::.:: . . : : . :. .. ..:
CCDS14 E--PVLQHSQYLRLRQRICKSS-ILQWPDNPKAEGLFWQTLRNVVLTENDSRYNNMYVDS
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CCDS14 IKQY
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.:... :.. .:: : . : :... : .: ..:. . : ::::.::.:.:.
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. .... . : :.: .: : .. .. : .: : :. :.:. . . .: .
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:: : :. :::... . :.: ::: :.: .:.:. .: :: .. : : ::
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.:: :. . : :...:.. ....:. . .: : : . : : :. :
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::..: : .:. . .. .. . : . : : ... :.: : .:: :.: ...
CCDS31 GNSAFHNLSDLHSLVIRGASMVQQFPN-LTGTVHLESLTL----TGTKIS--SIP--NNL
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.::.:..: : .:.: ::. :: . ::...: :::. .::... .. : :
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:. :. ..:. . ::
CCDS31 LKEALAAKDFVNLRSLSVPYAYQCCAFWGCDSYANLNTEDNSLQDHSVAQEKGTADAANV
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. .. : . : .:. . : .: : .: : .. :.::..... .. :
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CCDS34 TVFLGFRTLPHYEEGSLPILNTTKLHIVLPMDTNFWV--LLRDGIKTSKILEMTNIDGKS
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: .. . :. . . :. : :.: : : :. . : ..: . :.. : :
CCDS34 QFVSYEMQRNLSLENAKTSVLLLNKVDLLWDDLFLILQFVWHTSVEHFQ---IRNVTFGG
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CCDS34 KAYLDHNSFDYSNTVMRT------IKLEHVHFRVFYIQQDKI-------YLLLTKMDIEN
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: ... .. . . . . :. ::.. :. : .: . .. : : :. :.: :..
CCDS34 LTISN--AQMPHMLFPNYPTKFQ-YLNFANNILTDELFKRTIQL-PHLKTLILNGNKLET
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::.. :.: : . : . ... :. ::: :::: . :.. . ... . :.
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: :. : . .: .:: :. . : :... . :.:.. . : . .::. : .
CCDS34 YTCEYPLNLRG--TRLKDVHLHELSCNTALLIVTIVVIMLVLGLAVAFCCLHFDLPWYLR
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. . . ::: : ..: .. .. :.: .. .:. :: : . ..:::: :. .:
CCDS34 MLGQCTQTWHRV--RKTTQEQLKRNVRFHAFISYSEHDSLWVKNELIPNLEKEDGSILIC
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CCDS34 LYESYFDPGKSISENIVSFIEKSYKSIFVLSPNFVQNEWCH-YEFYFAHHNLFHENSDHI
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::..:: :: : . ....... :.:: .... : : .:..:.
CCDS34 ILILLEPIPFYCIPTRYHKLKALLEKKAYLEWPKDRRKCGLFWANLRAAINVNVLATREM
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CCDS34 YELQTFTELNEESRGSTISLMRTDCL
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CCDS37 TEAVKSLDLSNNRITYISNSDLQRCVN--LQALVLTSNGINTIEEDSFSSLGSLEHLDLS
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CCDS37 YNYLS-NLSSSWFKPLSSLTFLNL-LGNPYKTLGETSLFSHL--TKLQILRVGNMDTFTK
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. .:: : :: . .. ...: .::... :: .: :. . :. . :.
CCDS37 IQRKDFAGLTFLEELEIDASDLQSYEPKSLKSIQNVSHLILHMKQHILLLEIFVDVTSSV
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CCDS37 ECLELRDTDLDTFHFSELSTGETNSLIKKFTFRNVKITDESLFQVMKLLNQISGLLELEF
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. . :. ..:. :. .. : .. .:: .. . : :. : : ...
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..... . :.::: .:.:.:.. .. . . ::.. :.:. . . :. :
CCDS37 ASLEKTGETLLTLKNLTNIDISKNSFHSM-PETCQWPEKMKYLNLSSTRI-----HSVTG
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:: ...: ::. :. . .:..: :. : : :.:: .. :.. . . .
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CCDS37 WPANYLCDSPSHVRGQQVQDVRLSVSECHRTA--LVSGMCCALFLLILLTGVLCHRFHGL
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: ....: ....: : .... : :.. .. .: :: . . .:. . .:
CCDS37 WYMKMMWAWLQAKR----KPRKAPSRNICYDAFVSYSERDAYWVENLMVQELENFNPPFK
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.::..::: : . .. :..::..:.: .::......:. :: ... . . ...: :
CCDS37 LCLHKRDFIPGKWIIDNIIDSIEKSHKTVFVLSENFVKSEWCK-YELDFSHFRLFDENND
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pF1KE3 SIILVFLEEIPDYKLNHALCLRRGMFKSHCILNWPVQKERIGAFRHKLQVALGSKNSVH
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CCDS37 AAILILLEPIEKKAIPQRFCKLRKIMNTKTYLEWPMDEAQREGFWVNLRAAIKS
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CCDS33 LILQIRIQLSEESEFLVDRSKNGLIHVPKDLSQKTTI-LNISQNYISELWTSDILSLSKL
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CCDS33 RILIISHNRIQYL---DISVFKFNQELEYLDLSHNKLVKIS--CHPTVNLKHLDLSFNAF
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CCDS33 DALP-----ICKEFGNMSQLKFLGLSTTHLEKSSV----------LPIAHLNISKVLLVL
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CCDS33 GETYGEKEDPE-------GLQDFNTESLHIVFPT---NKEFHF----ILDVSVKTVANLE
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.. .::. .::: . : . : :. :.:.: :. .. . . . :.
CCDS33 LSNIKCV----LEDNKCSYFLSILAKLQTNPKLSNLTLNNIETTWNSFI-RILQLVWHTT
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pF1KE3 LHILNLTKNKIS-KIESDAFSWLGHLEVLDLGLNEIGQELTGQEWRGLENIFEIYLSYNK
. ..... :.. ... :.. : . :..... ... : . .:: . :
CCDS33 VWYFSISNVKLQGQLDFRDFDYSG-TSLKALSIHQVVSDVFGFPQSYIYEIFSNMNIKNF
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.. :: : :: .:. . ..: . . :. .:: :. :. :.. ...
CCDS33 TVSGTRMVHMLCPSKISPFLH-LDFSNNLLTDTVFENCGHLTELETLILQMNQLKELSKI
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pF1KE3 -DMLEGLEKLEILDLQHNNLAR-------LWKHA----NPGGPIY---FLKGLS-HLHIL
.: ...:. ::...:... : .. : .. : ... : ....:
CCDS33 AEMTTQMKSLQQLDISQNSVSYDEKKGDCSWTKSLLSLNMSSNILTDTIFRCLPPRIKVL
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pF1KE3 NLESNGFDEIPVEVFKDLFELKIIDLGLNNLNTLPASVFNNQVSLKSLNLQKNLITSVEK
.:.:: . :: .: : : :. .....:.:. ::. .. ::. : ...: ..
CCDS33 DLHSNKIKSIPKQVVK-LEALQELNVAFNSLTDLPGC--GSFSSLSVLIIDHNSVSHPSA
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pF1KE3 KVFGPAFRNLTELDMRFNPFDCTCESIAWFVNWINETHTNIPE-LSSHYLCNTPPHYHGF
: . ... . :::.:::: .. ::. :... ... : . : :. : :.:
CCDS33 DFF-QSCQKMRSIKAGDNPFQCTCE-LGEFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGT
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pF1KE3 PVRLFDTS--SCKDSAPFELFFMINTSILLIFIFIVLLIHFEG--W--RISFYWNVSVHR
.. : : ::. . :. : ...:.. . .. : . : :. :. . .:
CCDS33 LLKDFHMSELSCNITL---LIVTIVATMLVLAVTVTSLCSYLDLPWYLRMVCQWTQTRRR
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pF1KE3 V--LGFKEIDRQTEQFEYAAYIIHAYKDKDWVW-EHFSSMEKEDQSLKFCLEERDFEAGV
. . ..:..:. ... :.: .. .:. :: : . ..::: ....::.::.: :
CCDS33 ARNIPLEELQRN---LQFHAFISYSGHDSFWVKNELLPNLEKE--GMQICLHERNFVPGK
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pF1KE3 FELEAIVNSIKRSRKIIFVITHHLLKDPLCKRFKVHHAVQQAIEQNLDSIILVFLEEIPD
.: :.. :..: : :::.. ..... :. .... : .. .... .:.::..:: ::.
CCDS33 SIVENIITCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCH-YELYFAHHNLFHEGSNSLILILLEPIPQ
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pF1KE3 YKLNHALCLRRGMFKSHCILNWPVQKERIGAFRHKLQVALGSKNSVH
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CCDS33 YSIPSSYHKLKSLMARRTYLEWPKEKSKRGLFWANLRAAINIKLTEQAKK
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10 20 30 40
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::: . . :.: .:::. :. :: ..: :..:::
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. : :.: .: .. :: .:.:.: :.:. :. . : :: : ..: .:::
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: ..:: :: :. ... .: . . :.. . .: . : :..:. . :
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10 20 30 40
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: .: :. :.: :.::. . : . :
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CCDS43 IVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQISDIAPDAFQGLKSLTSLVLYGNKIT
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CCDS43 EIVKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYDNKLQTISKGLFAPLQS
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CCDS43 IQTLHLAQNPF--VCDCHLKWLADY------LQDNPIETSGARC-SSPRRLANKRISQIK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]