Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3308
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3308, 803 aa
1>>>pF1KE3308 803 - 803 aa - 803 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5373+/-0.00109; mu= 15.4576+/- 0.065
mean_var=138.6639+/-28.539, 0's: 0 Z-trim(108.2): 97 B-trim: 504 in 1/51
Lambda= 0.108916
statistics sampled from 9925 (10029) to 9925 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.678), E-opt: 0.2 (0.308), width: 16
Scan time: 2.970
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47547.1 DGKB gene_id:1607|Hs108|chr7 ( 804) 5547 884.1 0
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CCDS3274.1 DGKG gene_id:1608|Hs108|chr3 ( 791) 2218 361.0 4.3e-99
CCDS43181.1 DGKG gene_id:1608|Hs108|chr3 ( 752) 2061 336.4 1.1e-91
CCDS8896.1 DGKA gene_id:1606|Hs108|chr12 ( 735) 1777 291.7 2.9e-78
CCDS43182.1 DGKG gene_id:1608|Hs108|chr3 ( 766) 1744 286.6 1.1e-76
CCDS5845.1 DGKI gene_id:9162|Hs108|chr7 (1065) 941 160.5 1.3e-38
CCDS55759.1 DGKZ gene_id:8525|Hs108|chr11 ( 928) 852 146.5 2e-34
CCDS7918.1 DGKZ gene_id:8525|Hs108|chr11 ( 945) 852 146.5 2e-34
CCDS41640.1 DGKZ gene_id:8525|Hs108|chr11 (1117) 852 146.5 2.2e-34
CCDS44580.1 DGKZ gene_id:8525|Hs108|chr11 ( 929) 848 145.8 3e-34
CCDS44579.2 DGKZ gene_id:8525|Hs108|chr11 ( 933) 848 145.8 3.1e-34
CCDS55757.1 DGKZ gene_id:8525|Hs108|chr11 ( 934) 848 145.8 3.1e-34
CCDS83227.1 DGKI gene_id:9162|Hs108|chr7 ( 734) 811 139.9 1.4e-32
CCDS55758.1 DGKZ gene_id:8525|Hs108|chr11 ( 906) 769 133.4 1.6e-30
CCDS11590.1 DGKE gene_id:8526|Hs108|chr17 ( 567) 652 114.8 4e-25
CCDS3342.1 DGKQ gene_id:1609|Hs108|chr4 ( 942) 584 104.4 9.4e-22
CCDS55899.1 DGKH gene_id:160851|Hs108|chr13 (1084) 477 87.6 1.2e-16
CCDS55898.1 DGKH gene_id:160851|Hs108|chr13 (1100) 477 87.6 1.2e-16
CCDS9382.1 DGKH gene_id:160851|Hs108|chr13 (1164) 477 87.6 1.3e-16
CCDS9381.1 DGKH gene_id:160851|Hs108|chr13 (1220) 477 87.7 1.3e-16
CCDS46546.1 DGKD gene_id:8527|Hs108|chr2 (1170) 463 85.4 5.8e-16
CCDS2504.1 DGKD gene_id:8527|Hs108|chr2 (1214) 463 85.5 6e-16
CCDS75980.1 DGKK gene_id:139189|Hs108|chrX (1271) 403 76.0 4.3e-13
>>CCDS47547.1 DGKB gene_id:1607|Hs108|chr7 (804 aa)
initn: 2895 init1: 2895 opt: 5547 Z-score: 4719.5 bits: 884.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5547; 99.9% identity (99.9% similar) in 804 aa overlap (1-803:1-804)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MTNQEKWAHLSPSEFSQLQKYAEYSTKKLKDVLEEFHGNGVLAKYNPEGKQDILNQTIDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MTNQEKWAHLSPSEFSQLQKYAEYSTKKLKDVLEEFHGNGVLAKYNPEGKQDILNQTIDF
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pF1KE3 EGFKLFMKTFLEAELPDDFTAHLFMSFSNKFPHSSPMVKSKPALLSGGLRMNKGAITPPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EGFKLFMKTFLEAELPDDFTAHLFMSFSNKFPHSSPMVKSKPALLSGGLRMNKGAITPPR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 TTSPANTCSPEVIHLKDIVCYLSLLERGRPEDKLEFMFRLYDTDGNGFLDSSELENIISQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TTSPANTCSPEVIHLKDIVCYLSLLERGRPEDKLEFMFRLYDTDGNGFLDSSELENIISQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 MMHVAEYLEWDVTELNPILHEMMEEIDYDHDGTVSLEEWIQGGMTTIPLLVLLGLENNVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MMHVAEYLEWDVTELNPILHEMMEEIDYDHDGTVSLEEWIQGGMTTIPLLVLLGLENNVK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 DDGQHVWRLKHFNKPAYCNLCLNMLIGVGKQGLCCSFCKYTVHERCVARAPPSCIKTYVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DDGQHVWRLKHFNKPAYCNLCLNMLIGVGKQGLCCSFCKYTVHERCVARAPPSCIKTYVK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 SKRNTDVMHHYWVEGNCPTKCDKCHKTVKCYQGLTGLHCVWCQITLHNKCASHLKPECDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SKRNTDVMHHYWVEGNCPTKCDKCHKTVKCYQGLTGLHCVWCQITLHNKCASHLKPECDC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE3 GPLKDHILPPTTICPVVL-TLPTSGVSVPEERQSTVKKEKSGSQQPNKVIDKNKMQRANS
:::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GPLKDHILPPTTICPVVLQTLPTSGVSVPEERQSTVKKEKSGSQQPNKVIDKNKMQRANS
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 VTVDGQGLQVTPVPGTHPLLVFVNPKSGGKQGERIYRKFQYLLNPRQVYSLSGNGPMPGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VTVDGQGLQVTPVPGTHPLLVFVNPKSGGKQGERIYRKFQYLLNPRQVYSLSGNGPMPGL
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE3 NFFRDVPDFRVLACGGDGTVGWVLDCIEKANVGKHPPVAILPLGTGNDLARCLRWGGGYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NFFRDVPDFRVLACGGDGTVGWVLDCIEKANVGKHPPVAILPLGTGNDLARCLRWGGGYE
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE3 GENLMKILKDIENSTEIMLDRWKFEVIPNDKDEKGDPVPYSIINNYFSIGVDASIAHRFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GENLMKILKDIENSTEIMLDRWKFEVIPNDKDEKGDPVPYSIINNYFSIGVDASIAHRFH
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KE3 IMREKHPEKFNSRMKNKFWYFEFGTSETFSATCKKLHESVEIECDGVQIDLINISLEGIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IMREKHPEKFNSRMKNKFWYFEFGTSETFSATCKKLHESVEIECDGVQIDLINISLEGIA
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KE3 ILNIPSMHGGSNLWGESKKRRSHRRIEKKGSDKRTTVTDAKELKFASQDLSDQLLEVVGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ILNIPSMHGGSNLWGESKKRRSHRRIEKKGSDKRTTVTDAKELKFASQDLSDQLLEVVGL
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KE3 EGAMEMGQIYTGLKSAGRRLAQCSCVVIRTSKSLPMQIDGEPWMQTPCTIKITHKNQAPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EGAMEMGQIYTGLKSAGRRLAQCSCVVIRTSKSLPMQIDGEPWMQTPCTIKITHKNQAPM
730 740 750 760 770 780
780 790 800
pF1KE3 LMGPPPKTGLFCSLVKRTRNRSKE
::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LMGPPPKTGLFCSLVKRTRNRSKE
790 800
>>CCDS47548.1 DGKB gene_id:1607|Hs108|chr7 (773 aa)
initn: 5314 init1: 2672 opt: 5312 Z-score: 4520.2 bits: 847.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5312; 99.7% identity (99.9% similar) in 770 aa overlap (1-769:1-770)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MTNQEKWAHLSPSEFSQLQKYAEYSTKKLKDVLEEFHGNGVLAKYNPEGKQDILNQTIDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MTNQEKWAHLSPSEFSQLQKYAEYSTKKLKDVLEEFHGNGVLAKYNPEGKQDILNQTIDF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 EGFKLFMKTFLEAELPDDFTAHLFMSFSNKFPHSSPMVKSKPALLSGGLRMNKGAITPPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EGFKLFMKTFLEAELPDDFTAHLFMSFSNKFPHSSPMVKSKPALLSGGLRMNKGAITPPR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 TTSPANTCSPEVIHLKDIVCYLSLLERGRPEDKLEFMFRLYDTDGNGFLDSSELENIISQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TTSPANTCSPEVIHLKDIVCYLSLLERGRPEDKLEFMFRLYDTDGNGFLDSSELENIISQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 MMHVAEYLEWDVTELNPILHEMMEEIDYDHDGTVSLEEWIQGGMTTIPLLVLLGLENNVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MMHVAEYLEWDVTELNPILHEMMEEIDYDHDGTVSLEEWIQGGMTTIPLLVLLGLENNVK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 DDGQHVWRLKHFNKPAYCNLCLNMLIGVGKQGLCCSFCKYTVHERCVARAPPSCIKTYVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DDGQHVWRLKHFNKPAYCNLCLNMLIGVGKQGLCCSFCKYTVHERCVARAPPSCIKTYVK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 SKRNTDVMHHYWVEGNCPTKCDKCHKTVKCYQGLTGLHCVWCQITLHNKCASHLKPECDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SKRNTDVMHHYWVEGNCPTKCDKCHKTVKCYQGLTGLHCVWCQITLHNKCASHLKPECDC
310 320 330 340 350 360
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pF1KE3 GPLKDHILPPTTICPVVL-TLPTSGVSVPEERQSTVKKEKSGSQQPNKVIDKNKMQRANS
:::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GPLKDHILPPTTICPVVLQTLPTSGVSVPEERQSTVKKEKSGSQQPNKVIDKNKMQRANS
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 VTVDGQGLQVTPVPGTHPLLVFVNPKSGGKQGERIYRKFQYLLNPRQVYSLSGNGPMPGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VTVDGQGLQVTPVPGTHPLLVFVNPKSGGKQGERIYRKFQYLLNPRQVYSLSGNGPMPGL
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE3 NFFRDVPDFRVLACGGDGTVGWVLDCIEKANVGKHPPVAILPLGTGNDLARCLRWGGGYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NFFRDVPDFRVLACGGDGTVGWVLDCIEKANVGKHPPVAILPLGTGNDLARCLRWGGGYE
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE3 GENLMKILKDIENSTEIMLDRWKFEVIPNDKDEKGDPVPYSIINNYFSIGVDASIAHRFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GENLMKILKDIENSTEIMLDRWKFEVIPNDKDEKGDPVPYSIINNYFSIGVDASIAHRFH
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pF1KE3 IMREKHPEKFNSRMKNKFWYFEFGTSETFSATCKKLHESVEIECDGVQIDLINISLEGIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IMREKHPEKFNSRMKNKFWYFEFGTSETFSATCKKLHESVEIECDGVQIDLINISLEGIA
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660 670 680 690 700 710
pF1KE3 ILNIPSMHGGSNLWGESKKRRSHRRIEKKGSDKRTTVTDAKELKFASQDLSDQLLEVVGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ILNIPSMHGGSNLWGESKKRRSHRRIEKKGSDKRTTVTDAKELKFASQDLSDQLLEVVGL
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pF1KE3 EGAMEMGQIYTGLKSAGRRLAQCSCVVIRTSKSLPMQIDGEPWMQTPCTIKITHKNQAPM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS47 EGAMEMGQIYTGLKSAGRRLAQCSCVVIRTSKSLPMQIDGEPWMQTPCTVSTE
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pF1KE3 LMGPPPKTGLFCSLVKRTRNRSKE
>>CCDS3274.1 DGKG gene_id:1608|Hs108|chr3 (791 aa)
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Smith-Waterman score: 3404; 59.8% identity (79.5% similar) in 833 aa overlap (4-800:3-790)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MTNQEKWAHLSPSEFSQLQKYAEYSTKKLKDVLEEFHGNGVLAKYNPEGKQDILNQTIDF
.:.:. :.: ::.:::::.:::.::.::.: ::. .: : .:.: .. :..
CCDS32 MGEERWVSLTPEEFDQLQKYSEYSSKKIKDALTEFNEGGSLKQYDP-------HEPISY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE3 EGFKLFMKTFLEAELPDDFTAHLFMSFSNKFPH----------SSPMVKSKPALLSGGLR
. :::::...::..::. ...:::..::.: : :. ..: . ....
CCDS32 DVFKLFMRAYLEVDLPQPLSTHLFLAFSQKPRHETSDHPTEGASNSEANSADTNIQNADN
60 70 80 90 100 110
120 130 140
pF1KE3 MNKG-----------------------AITP--PRTTSPANTCSPEVIHLKDIVCYLSLL
.:. : :: : . ... :: :..:::.:::::::
CCDS32 ATKADEACAPDTESNMAEKQAPAEDQVAATPLEPPVPRSSSSESP-VVYLKDVVCYLSLL
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 ERGRPEDKLEFMFRLYDTDGNGFLDSSELENIISQMMHVAEYLEWDVTELNPILHEMMEE
: :::.:::::::::::.: ::.::..:.. :..::.:.:.::::: ::: :::.::..
CCDS32 ETGRPQDKLEFMFRLYDSDENGLLDQAEMDCIVNQMLHIAQYLEWDPTELRPILKEMLQG
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 IDYDHDGTVSLEEWIQGGMTTIPLLVLLGLENN-VKDDGQHVWRLKHFNKPAYCNLCLNM
.:::.:: :::.::..:::::::::::::.... : ::.:.: .:::.::.:::.: :
CCDS32 MDYDRDGFVSLQEWVHGGMTTIPLLVLLGMDDSGSKGDGRHAWTMKHFKKPTYCNFCHIM
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 LIGVGKQGLCCSFCKYTVHERCVARAPPSCIKTYVKSKRNTDVMHHYWVEGNCPTKCDKC
:.:: ::::::..::::::::::.: :.:.::: :.::. .::.: ::::: .:::.:
CCDS32 LMGVRKQGLCCTYCKYTVHERCVSRNIPGCVKTYSKAKRSGEVMQHAWVEGNSSVKCDRC
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 HKTVKCYQGLTGLHCVWCQITLHNKCASHLKPECDCGPLKDHILPPTTICPVVLTLPTSG
::..::::..:. :::::..:.: :: .:. :: : :.:::: ::.:::..
CCDS32 HKSIKCYQSVTARHCVWCRMTFHRKC--ELSTLCDGGELRDHILLPTSICPIT-------
360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 VSVPEERQSTVKKEKSGSQQPNKVIDKNKMQRANSVTVDGQGLQVTPVPGTHPLLVFVNP
... : .. . : :... . .. :.::::::::.:::
CCDS32 ------------RDRPGEKSDGCVSAKGELV---------MQYKIIPTPGTHPLLVLVNP
410 420 430 440
450 460 470 480 490 500
pF1KE3 KSGGKQGERIYRKFQYLLNPRQVYSLSGNGPMPGLNFFRDVPDFRVLACGGDGTVGWVLD
::::.::::: :::.:::::.::..:...:: ::::::::.::::::::::::::::.::
CCDS32 KSGGRQGERILRKFHYLLNPKQVFNLDNGGPTPGLNFFRDTPDFRVLACGGDGTVGWILD
450 460 470 480 490 500
510 520 530 540 550 560
pF1KE3 CIEKANVGKHPPVAILPLGTGNDLARCLRWGGGYEGENLMKILKDIENSTEIMLDRWKFE
::.::: .::::::.::::::::::::::::::::: .: :::::::.: .:::::..:
CCDS32 CIDKANFAKHPPVAVLPLGTGNDLARCLRWGGGYEGGSLTKILKDIEQSPLVMLDRWHLE
510 520 530 540 550 560
570 580 590 600 610 620
pF1KE3 VIPNDKDEKGDPVPYSIINNYFSIGVDASIAHRFHIMREKHPEKFNSRMKNKFWYFEFGT
::: .. :.:: :::::.:::::::::::::::::.::::::::::::::::.:::::::
CCDS32 VIPREEVENGDQVPYSIMNNYFSIGVDASIAHRFHVMREKHPEKFNSRMKNKLWYFEFGT
570 580 590 600 610 620
630 640 650 660 670 680
pF1KE3 SETFSATCKKLHESVEIECDGVQIDLINISLEGIAILNIPSMHGGSNLWGESKKRRSHRR
::::.:::::::. .:.::::: .:: :: ::::::::::::.::.:::::.:: :. :
CCDS32 SETFAATCKKLHDHIELECDGVGVDLSNIFLEGIAILNIPSMYGGTNLWGENKKNRAVIR
630 640 650 660 670 680
690 700 710 720 730 740
pF1KE3 IEKKGSDKRTTVTDAKELKFASQDLSDQLLEVVGLEGAMEMGQIYTGLKSAGRRLAQCSC
.:: ::: ::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS32 ESRKG------VTDPKELKFCVQDLSDQLLEVVGLEGAMEMGQIYTGLKSAGRRLAQCAS
690 700 710 720 730
750 760 770 780 790 800
pF1KE3 VVIRTSKSLPMQIDGEPWMQTPCTIKITHKNQAPMLMGPPPKTGLFCSLVKRTRNRSKE
:.:::.: ::::.::::::: :::::::::::::.:::: :...: :: ...:..
CCDS32 VTIRTNKLLPMQVDGEPWMQPCCTIKITHKNQAPMMMGPPQKSSFF-SLRRKSRSKD
740 750 760 770 780 790
>>CCDS43181.1 DGKG gene_id:1608|Hs108|chr3 (752 aa)
initn: 2835 init1: 1482 opt: 2061 Z-score: 1759.5 bits: 336.4 E(32554): 1.1e-91
Smith-Waterman score: 3090; 56.8% identity (75.3% similar) in 833 aa overlap (4-800:3-751)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MTNQEKWAHLSPSEFSQLQKYAEYSTKKLKDVLEEFHGNGVLAKYNPEGKQDILNQTIDF
.:.:. :.: ::.:::::.:::.::.::.: ::. .: : .:.: .. :..
CCDS43 MGEERWVSLTPEEFDQLQKYSEYSSKKIKDALTEFNEGGSLKQYDP-------HEPISY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE3 EGFKLFMKTFLEAELPDDFTAHLFMSFSNKFPH----------SSPMVKSKPALLSGGLR
. :::::...::..::. ...:::..::.: : :. ..: . ....
CCDS43 DVFKLFMRAYLEVDLPQPLSTHLFLAFSQKPRHETSDHPTEGASNSEANSADTNIQNADN
60 70 80 90 100 110
120 130 140
pF1KE3 MNKG-----------------------AITP--PRTTSPANTCSPEVIHLKDIVCYLSLL
.:. : :: : . ... :: :..:::.:::::::
CCDS43 ATKADEACAPDTESNMAEKQAPAEDQVAATPLEPPVPRSSSSESP-VVYLKDVVCYLSLL
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 ERGRPEDKLEFMFRLYDTDGNGFLDSSELENIISQMMHVAEYLEWDVTELNPILHEMMEE
: :::.:::::::::::.: ::.::..:.. :..::.:.:.::::: ::: :::.::..
CCDS43 ETGRPQDKLEFMFRLYDSDENGLLDQAEMDCIVNQMLHIAQYLEWDPTELRPILKEMLQG
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 IDYDHDGTVSLEEWIQGGMTTIPLLVLLGLENN-VKDDGQHVWRLKHFNKPAYCNLCLNM
.:::.:: :::.::..:::::::::::::.... : ::.:.: .:::.::.:::.: :
CCDS43 MDYDRDGFVSLQEWVHGGMTTIPLLVLLGMDDSGSKGDGRHAWTMKHFKKPTYCNFCHIM
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 LIGVGKQGLCCSFCKYTVHERCVARAPPSCIKTYVKSKRNTDVMHHYWVEGNCPTKCDKC
:.:: ::::::..::::::::::.: :.:.::: :.::. .
CCDS43 LMGVRKQGLCCTYCKYTVHERCVSRNIPGCVKTYSKAKRSGE------------------
300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 HKTVKCYQGLTGLHCVWCQITLHNKCASHLKPECDCGPLKDHILPPTTICPVVLTLPTSG
.: :: .:. :: : :.:::: ::.:::..
CCDS43 ---------------------FHRKC--ELSTLCDGGELRDHILLPTSICPIT-------
340 350 360
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 VSVPEERQSTVKKEKSGSQQPNKVIDKNKMQRANSVTVDGQGLQVTPVPGTHPLLVFVNP
... : .. . : :... . .. :.::::::::.:::
CCDS43 ------------RDRPGEKSDGCVSAKGELV---------MQYKIIPTPGTHPLLVLVNP
370 380 390 400
450 460 470 480 490 500
pF1KE3 KSGGKQGERIYRKFQYLLNPRQVYSLSGNGPMPGLNFFRDVPDFRVLACGGDGTVGWVLD
::::.::::: :::.:::::.::..:...:: ::::::::.::::::::::::::::.::
CCDS43 KSGGRQGERILRKFHYLLNPKQVFNLDNGGPTPGLNFFRDTPDFRVLACGGDGTVGWILD
410 420 430 440 450 460
510 520 530 540 550 560
pF1KE3 CIEKANVGKHPPVAILPLGTGNDLARCLRWGGGYEGENLMKILKDIENSTEIMLDRWKFE
::.::: .::::::.::::::::::::::::::::: .: :::::::.: .:::::..:
CCDS43 CIDKANFAKHPPVAVLPLGTGNDLARCLRWGGGYEGGSLTKILKDIEQSPLVMLDRWHLE
470 480 490 500 510 520
570 580 590 600 610 620
pF1KE3 VIPNDKDEKGDPVPYSIINNYFSIGVDASIAHRFHIMREKHPEKFNSRMKNKFWYFEFGT
::: .. :.:: :::::.:::::::::::::::::.::::::::::::::::.:::::::
CCDS43 VIPREEVENGDQVPYSIMNNYFSIGVDASIAHRFHVMREKHPEKFNSRMKNKLWYFEFGT
530 540 550 560 570 580
630 640 650 660 670 680
pF1KE3 SETFSATCKKLHESVEIECDGVQIDLINISLEGIAILNIPSMHGGSNLWGESKKRRSHRR
::::.:::::::. .:.::::: .:: :: ::::::::::::.::.:::::.:: :. :
CCDS43 SETFAATCKKLHDHIELECDGVGVDLSNIFLEGIAILNIPSMYGGTNLWGENKKNRAVIR
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pF1KE3 IEKKGSDKRTTVTDAKELKFASQDLSDQLLEVVGLEGAMEMGQIYTGLKSAGRRLAQCSC
.:: ::: ::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS43 ESRKG------VTDPKELKFCVQDLSDQLLEVVGLEGAMEMGQIYTGLKSAGRRLAQCAS
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pF1KE3 VVIRTSKSLPMQIDGEPWMQTPCTIKITHKNQAPMLMGPPPKTGLFCSLVKRTRNRSKE
:.:::.: ::::.::::::: :::::::::::::.:::: :...: :: ...:..
CCDS43 VTIRTNKLLPMQVDGEPWMQPCCTIKITHKNQAPMMMGPPQKSSFF-SLRRKSRSKD
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.:::.:.::::: ::::::..:::. :. .: .::: . ...: .
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:::. :.: .::.. .: .. ::.:: . : .:. .:
CCDS88 EGFQQFLKIYLEVDNVPRHLSLALFQSFET------------------GHCLNETNVTK-
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120 130 140 150 160 170
pF1KE3 RTTSPANTCSPEVIHLKDIVCYLSLLERGRPEDKLEFMFRLYDTDGNGFLDSSELENIIS
.:. :.:. ::.:::: ::::::::: :.::::: ::.:::::...::
CCDS88 -----------DVVCLNDVSCYFSLLEGGRPEDKLEFTFKLYDTDRNGILDSSEVDKIIL
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:::.:::::.:::.:: :::.:::.::::: .:.:: ::...: ::.::::::::: ..
CCDS88 QMMRVAEYLDWDVSELRPILQEMMKEIDYDGSGSVSQAEWVRAGATTVPLLVLLGLEMTL
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pF1KE3 KDDGQHVWRLKHFNKPAYCNLCLNMLIGVGKQGLCCSFCKYTVHERCVARAPPSCIKTYV
::::::.:: :.: .:.::::: . ::.::::: :..::::::..:. .: : ..::.
CCDS88 KDDGQHMWRPKRFPRPVYCNLCESS-IGLGKQGLSCNLCKYTVHDQCAMKALPCEVSTYA
210 220 230 240 250
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pF1KE3 KSKRNTDVMHHYWVEGNCPT-KCDKCHKTVKCYQGLTGLHCVWCQITLHNKCASHLKPEC
::... :. : ::.:.: . .::.:.: .. :..:::::::::.. .:. : . . ::
CCDS88 KSRKDIGVQSHVWVRGGCESGRCDRCQKKIRIYHSLTGLHCVWCHLEIHDDCLQAVGHEC
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::: :.::::::..: : ::. :: :. .:... :: :..: ... ..
CCDS88 DCGLLRDHILPPSSIYPSVLA---SG---PD------RKNSKTSQ---KTMDDLNLSTSE
320 330 340 350 360
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pF1KE3 SVTVDGQGLQVTPVPGTHPLLVFVNPKSGGKQGERIYRKFQYLLNPRQVYSLSGNGPMPG
.. .: :::.:::::::::::::::::.:. ::::.::::::..: .:: :
CCDS88 ALRID-------PVPNTHPLLVFVNPKSGGKQGQRVLWKFQYILNPRQVFNLLKDGPEIG
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: .:.:::: :.:.:::::::::.:. :.:::. ::::.:::::::::::::::::::
CCDS88 LRLFKDVPDSRILVCGGDGTVGWILETIDKANLPVLPPVAVLPLGTGNDLARCLRWGGGY
420 430 440 450 460 470
540 550 560 570 580 590
pF1KE3 EGENLMKILKDIENSTEIMLDRWKFEVIPNDKDEKGDPVPYSIINNYFSIGVDASIAHRF
::.:: :::::.: : . .:::. ::::.. .::.::::..::::::::::::::::::
CCDS88 EGQNLAKILKDLEMSKVVHMDRWSVEVIPQQTEEKSDPVPFQIINNYFSIGVDASIAHRF
480 490 500 510 520 530
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pF1KE3 HIMREKHPEKFNSRMKNKFWYFEFGTSETFSATCKKLHESVEIECDGVQIDLINISLEGI
::::::.:::::::::::.:::::.:::.. .:::::.::. .: : .:: :.:::::
CCDS88 HIMREKYPEKFNSRMKNKLWYFEFATSESIFSTCKKLEESLTVEICGKPLDLSNLSLEGI
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pF1KE3 AILNIPSMHGGSNLWGESKKRRSHRRI----EKKGSDKRTTVTDAKELKFASQDLSDQLL
:.::::::::::::::.. :: : : . :. .. .:: :: ::::. :
CCDS88 AVLNIPSMHGGSNLWGDT--RRPHGDIYGINQALGATAKV-ITDPDILKTCVPDLSDKRL
600 610 620 630 640 650
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pF1KE3 EVVGLEGAMEMGQIYTGLKSAGRRLAQCSCVVIRTSKSLPMQIDGEPWMQTPCTIKITHK
::::::::.::::::: ::.::::::.:: ....:.:.::::::::::::::::::::::
CCDS88 EVVGLEGAIEMGQIYTKLKNAGRRLAKCSEITFHTTKTLPMQIDGEPWMQTPCTIKITHK
660 670 680 690 700 710
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pF1KE3 NQAPMLMGPPPKTGLFCSLVKRTRNRSKE
:: ::::::::.. :
CCDS88 NQMPMLMGPPPRSTNFFGFLS
720 730
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pF1KE3 MTNQEKWAHLSPSEFSQLQKYAEYSTKKLKDVLEEFHGNGVLAKYNPEGKQDILNQTIDF
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CCDS43 MGEERWVSLTPEEFDQLQKYSEYSSKKIKDALTEFNEGGSLKQYDP-------HEPISY
10 20 30 40 50
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pF1KE3 EGFKLFMKTFLEAELPDDFTAHLFMSFSNKFPH----------SSPMVKSKPALLSGGLR
. :::::...::..::. ...:::..::.: : :. ..: . ....
CCDS43 DVFKLFMRAYLEVDLPQPLSTHLFLAFSQKPRHETSDHPTEGASNSEANSADTNIQNADN
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pF1KE3 MNKG-----------------------AITP--PRTTSPANTCSPEVIHLKDIVCYLSLL
.:. : :: : . ... :: :..:::.:::::::
CCDS43 ATKADEACAPDTESNMAEKQAPAEDQVAATPLEPPVPRSSSSESP-VVYLKDVVCYLSLL
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 ERGRPEDKLEFMFRLYDTDGNGFLDSSELENIISQMMHVAEYLEWDVTELNPILHEMMEE
: :::.:::::::::::.: ::.::..:.. :..::.:.:.::::: ::: :::.::..
CCDS43 ETGRPQDKLEFMFRLYDSDENGLLDQAEMDCIVNQMLHIAQYLEWDPTELRPILKEMLQG
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 IDYDHDGTVSLEEWIQGGMTTIPLLVLLGLENN-VKDDGQHVWRLKHFNKPAYCNLCLNM
.:::.:: :::.::..:::::::::::::.... : ::.:.: .:::.::.:::.: :
CCDS43 MDYDRDGFVSLQEWVHGGMTTIPLLVLLGMDDSGSKGDGRHAWTMKHFKKPTYCNFCHIM
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 LIGVGKQGLCCSFCKYTVHERCVARAPPSCIKTYVKSKRNTDVMHHYWVEGNCPTKCDKC
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CCDS43 LMGVRKQGLCCTYCKYTVHERCVSRNIPGCVKTYSKAKRSGEVMQHAWVEGNSSVKCDRC
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330 340 350 360 370 380
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::..::::..:. :::::..:.: :: .:. :: : :.:::: ::.:::..
CCDS43 HKSIKCYQSVTARHCVWCRMTFHRKC--ELSTLCDGGELRDHILLPTSICPIT-------
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... : .. . : :... . .. :.::::::::.:::
CCDS43 ------------RDRPGEKSDGCVSAKGELV---------MQYKIIPTPGTHPLLVLVNP
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CCDS43 KSGGRQGER-------------------------LNFFRDTPDFRVLACGGDGTVGWILD
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::.::: .::::::.::::::::::::::::::::: .: :::::::.: .:::::..:
CCDS43 CIDKANFAKHPPVAVLPLGTGNDLARCLRWGGGYEGGSLTKILKDIEQSPLVMLDRWHLE
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::: .. :.:: :::::.:::::::::::::::::.::::::::::::::::.:::::::
CCDS43 VIPREEVENGDQVPYSIMNNYFSIGVDASIAHRFHVMREKHPEKFNSRMKNKLWYFEFGT
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pF1KE3 SETFSATCKKLHESVEIECDGVQIDLINISLEGIAILNIPSMHGGSNLWGESKKRRSHRR
::::.:::::::. .:.::::: .:: :: ::::::::::::.::.:::::.:: :. :
CCDS43 SETFAATCKKLHDHIELECDGVGVDLSNIFLEGIAILNIPSMYGGTNLWGENKKNRAVIR
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pF1KE3 IEKKGSDKRTTVTDAKELKFASQDLSDQLLEVVGLEGAMEMGQIYTGLKSAGRRLAQCSC
.:: ::: ::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS43 ESRKG------VTDPKELKFCVQDLSDQLLEVVGLEGAMEMGQIYTGLKSAGRRLAQCAS
660 670 680 690 700 710
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pF1KE3 VVIRTSKSLPMQIDGEPWMQTPCTIKITHKNQAPMLMGPPPKTGLFCSLVKRTRNRSKE
:.:::.: ::::.::::::: :::::::::::::.:::: :...: :: ...:..
CCDS43 VTIRTNKLLPMQVDGEPWMQPCCTIKITHKNQAPMMMGPPQKSSFF-SLRRKSRSKD
720 730 740 750 760
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pF1KE3 WDVTELNPILHEMMEEIDYDHDGTVSLEEWIQGGMTTIPLLVLLGLENNVKDDGQHVWRL
. .: . : .: :: : .:.:.: :
CCDS58 LTFRKQVSYRKAISRAGLQHLAPAHPLSLPVANGPAKEPRATLDWSENAV--NGEHLW-L
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pF1KE3 KHFNKPAYCNLCL-NMLIGVGKQGL--CCSFCKYTVHERCVA-------RAPPSCIKTYV
. . : : : . .:..: :. :: .:: :. : :. .
CCDS58 ETNVSGDLCYLGEENCQVRFAKSALRRKCAVCKIVVHTACIEQLEKINFRCKPTFREGGS
190 200 210 220 230 240
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pF1KE3 KSKRNTDVMHHYWV-----EGNCPTKCDKCHKTVKCYQG--LTGLHCVWCQITLHNK--C
.: :.. : :: :: ::.: .: : . ... .... : ::. ..::: :
CCDS58 RSPRENFVRHH-WVHRRRQEGKCK-QCGKGFQQKFSFHSKEIVAISCSWCKQAFHNKVTC
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pF1KE3 --ASHLKPECDCGPLKDHILPPTTICPVVLTLPTSGVSVPEERQSTVKKE--KSGSQQPN
:.. :. : :.::: : : . .: ...... :.. : : .: :
CCDS58 FMLHHIEEPCSLGAHAAVIVPPTWIIKVKKPQNSLKASNRKKKRTSFKRKASKRGMEQEN
300 310 320 330 340 350
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pF1KE3 KVIDKNKMQRANSVTVDGQGLQVTPV--PGTHPLLVFVNPKSGGKQGERIYRKFQYLLNP
: :. . . :. : .::::::::::::.:: .. . :.. :::
CCDS58 K----------------GRPFVIKPISSPLMKPLLVFVNPKSGGNQGTKVLQMFMWYLNP
360 370 380 390 400
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pF1KE3 RQVYSLSGNGPMPGLNFFRDVPDFRVLACGGDGTVGWVLDCIEKANVGKHPPVAILPLGT
:::..:: .:: .:...: ::..:.:::::::::::.:. ... ... .:::..:::::
CCDS58 RQVFDLSQEGPKDALELYRKVPNLRILACGGDGTVGWILSILDELQLSPQPPVGVLPLGT
410 420 430 440 450 460
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pF1KE3 GNDLARCLRWGGGYEGENLMKILKDIENSTEIMLDRWKFEV-----IPNDKDEKGD-PVP
:::::: : ::::: : . ::: ..:..: ..::::...: .: .. : : .:
CCDS58 GNDLARTLNWGGGYTDEPVSKILCQVEDGTVVQLDRWNLHVERNPDLPPEELEDGVCKLP
470 480 490 500 510 520
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pF1KE3 YSIINNYFSIGVDASIAHRFHIMREKHPEKFNSRMKNKFWYFEFGTSETFSATCKKLHES
...:::::.: :: .. .:: :: .:::::::..::..: . :. .. . . : .
CCDS58 LNVFNNYFSLGFDAHVTLEFHESREANPEKFNSRFRNKMFYAGAAFSDFLQRSSRDLSKH
530 540 550 560 570 580
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pF1KE3 VEIECDGVQID--LINISLEGIAILNIPSMHGGSNLWGESKKRRSHRRIEKKGSDKRTTV
:.. :::... . ..... :..:::: . .:. ::. .:. .: . :
CCDS58 VKVVCDGTDLTPKIQELKFQCIVFLNIPRYCAGTMPWGNPG---DHHDFEPQRHD-----
590 600 610 620 630
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pF1KE3 TDAKELKFASQDLSDQLLEVVGLEGAMEMGQIYTGLKSAGRRLAQCSCVVIRTSKSLPMQ
: .::.:. : .. . .: . :.:: :: :.. : ::.:::
CCDS58 --------------DGYIEVIGFTMA-SLAALQVG--GHGERLHQCREVMLLTYKSIPMQ
640 650 660 670
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pF1KE3 IDGEPWMQTPCTIKITHKNQAPMLMGPPPKTGLFCSLVKRTRNRSKE
.:::: .: :.:. .::: :.. .:..
CCDS58 VDGEPCRLAPAMIRISLRNQANMVQKSKRRTSMPLLNDPQSVPDRLRIRVNKISLQDYEG
680 690 700 710 720 730
CCDS58 FHYDKEKLREASISDWLRTIAGELVQSFGAIPLGILVVRGDCDLETCRMYIDRLQEDLQS
740 750 760 770 780 790
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pF1KE3 TVSLEEWIQGGMTTIPLLVLLGLENNVKDDGQHVWRLKHFNKPAYCNL----CLN-MLIG
:.:.: . . .: . :. :: .
CCDS55 APPPPTPGAPCSESERQIRSTVDWSESATYGEHIWFETNVSGD-FCYVGEQYCVARMLKS
70 80 90 100 110 120
270 280 290 300 310
pF1KE3 VGKQGLCCSFCKYTVHERCVA-------RAPPSCIKTYVKSKRNTDVMHHYWV-----EG
:... :. :: .:: :. : :: .. .. :. ..:.:: .:
CCDS55 VSRRK--CAACKIVVHTPCIEQLEKINFRCKPSFRESGSRNVREPTFVRHHWVHRRRQDG
130 140 150 160 170 180
320 330 340 350 360
pF1KE3 NCPTKCDKCHKTVKCYQG--LTGLHCVWCQITLHNK--C--ASHLKPECDCGPLKDHILP
.: .: : . ... .... : ::. . :.: : .... :. : ..:
CCDS55 KC-RHCGKGFQQKFTFHSKEIVAISCSWCKQAYHSKVSCFMLQQIEEPCSLGVHAAVVIP
190 200 210 220 230 240
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 PTTICPVVLTLPTSGVSVPEERQSTVKKEKSGSQQPNKVIDKNKMQRANSVTVDGQGLQV
:: : . : . ... .... . :.::... :.. : . .
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