Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3294
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3294, 766 aa
1>>>pF1KE3294 766 - 766 aa - 766 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9782+/-0.00111; mu= 16.0592+/- 0.066
mean_var=66.9478+/-13.284, 0's: 0 Z-trim(102.0): 46 B-trim: 2 in 1/50
Lambda= 0.156750
statistics sampled from 6731 (6755) to 6731 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.552), E-opt: 0.2 (0.208), width: 16
Scan time: 3.670
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6910.1 ZER1 gene_id:10444|Hs108|chr9 ( 766) 5079 1158.2 0
CCDS30717.1 ZYG11B gene_id:79699|Hs108|chr1 ( 744) 816 194.2 6.5e-49
CCDS44148.1 ZYG11A gene_id:440590|Hs108|chr1 ( 759) 639 154.2 7.4e-37
CCDS76166.1 ZYG11A gene_id:440590|Hs108|chr1 ( 417) 595 144.2 4.2e-34
>>CCDS6910.1 ZER1 gene_id:10444|Hs108|chr9 (766 aa)
initn: 5079 init1: 5079 opt: 5079 Z-score: 6201.5 bits: 1158.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5079; 100.0% identity (100.0% similar) in 766 aa overlap (1-766:1-766)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MASDTPESLMALCTDFCLRNLDGTLGYLLDKETLRLHPDIFLPSEICDRLVNEYVELVNA
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CCDS69 MASDTPESLMALCTDFCLRNLDGTLGYLLDKETLRLHPDIFLPSEICDRLVNEYVELVNA
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 ACNFEPHESFFSLFSDPRSTRLTRIHLREDLVQDQDLEAIRKQDLVELYLTNCEKLSAKS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 LQTLRSFSHTLVSLSLFGCTNIFYEEENPGGCEDEYLVNPTCQVLVKDFTFEGFSRLRFL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 NLGRMIDWVPVESLLRPLNSLAALDLSGIQTSDAAFLTQWKDSLVSLVLYNMDLSDDHIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 NLGRMIDWVPVESLLRPLNSLAALDLSGIQTSDAAFLTQWKDSLVSLVLYNMDLSDDHIR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 VIVQLHKLRHLDISRDRLSSYYKFKLTREVLSLFVQKLGNLMSLDISGHMILENCSISKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 VIVQLHKLRHLDISRDRLSSYYKFKLTREVLSLFVQKLGNLMSLDISGHMILENCSISKM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 EEEAGQTSIEPSKSSIIPFRALKRPLQFLGLFENSLCRLTHIPAYKVSGDKNEEQVLNAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 EEEAGQTSIEPSKSSIIPFRALKRPLQFLGLFENSLCRLTHIPAYKVSGDKNEEQVLNAI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 EAYTEHRPEITSRAINLLFDIARIERCNQLLRALKLVITALKCHKYDRNIQVTGSAALFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 EAYTEHRPEITSRAINLLFDIARIERCNQLLRALKLVITALKCHKYDRNIQVTGSAALFY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 LTNSEYRSEQSVKLRRQVIQVVLNGMESYQEVTVQRNCCLTLCNFSIPEELEFQYRRVNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 LTNSEYRSEQSVKLRRQVIQVVLNGMESYQEVTVQRNCCLTLCNFSIPEELEFQYRRVNE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 LLLSILNPTRQDESIQRIAVHLCNALVCQVDNDHKEAVGKMGFVVTMLKLIQKKLLDKTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 LLLSILNPTRQDESIQRIAVHLCNALVCQVDNDHKEAVGKMGFVVTMLKLIQKKLLDKTC
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 DQVMEFSWSALWNITDETPDNCEMFLNFNGMKLFLDCLKEFPEKQELHRNMLGLLGNVAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 DQVMEFSWSALWNITDETPDNCEMFLNFNGMKLFLDCLKEFPEKQELHRNMLGLLGNVAE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 VKELRPQLMTSQFISVFSNLLESKADGIEVSYNACGVLSHIMFDGPEAWGVCEPQREEVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 VKELRPQLMTSQFISVFSNLLESKADGIEVSYNACGVLSHIMFDGPEAWGVCEPQREEVE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 ERMWAAIQSWDINSRRNINYRSFEPILRLLPQGISPVSQHWATWALYNLVSVYPDKYCPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 ERMWAAIQSWDINSRRNINYRSFEPILRLLPQGISPVSQHWATWALYNLVSVYPDKYCPL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760
pF1KE3 LIKEGGMPLLRDIIKMATARQETKEMARKVIEHCSNFKEENMDTSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 LIKEGGMPLLRDIIKMATARQETKEMARKVIEHCSNFKEENMDTSR
730 740 750 760
>>CCDS30717.1 ZYG11B gene_id:79699|Hs108|chr1 (744 aa)
initn: 732 init1: 269 opt: 816 Z-score: 991.6 bits: 194.2 E(32554): 6.5e-49
Smith-Waterman score: 931; 28.4% identity (60.2% similar) in 772 aa overlap (1-752:10-720)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MASDTPESLMALCTDFCLRNLDGTLGYLLDKETLRLHPDIFLPSEICDRLV
: .: ::. .: .: .:. . : .: .: :.:. :::
CCDS30 MPEDQAGAAMEEASPYSLLDICLNFLTTHLEKFCSARQDGTLCLQEPGVF-PQEVADRL-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 NEYVELVNAACNFEPHESFFSLFSDPRSTRLTRIHLREDLVQDQDL-EAIRKQDLVELYL
: . : . ... ..: . :: : .:. .. . .:. .. ::::
CCDS30 -----LRTMAFHGLLNDGTVGIFRG-NQMRLKRACIRKAKISAVAFRKAFCHHKLVELDA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KE3 T--NCEKLSAKSLQTLRSFSHTLVSLSLFGCTNIFYEEENPGGCEDEYLVNPTCQVLVKD
: : . . .. : : . .:. . ... :.: :
CCDS30 TGVNADITITDIISGLGSNKWIQQNLQCLVLNSLTLSLEDP---------YERC------
120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 FTFEGFSRLRFLNLGRMI----DWVPVESLLRPLNSLAALDLSGIQTSDAAFLTQWKDSL
: .: :: :.. .. : . : :: : : .::.:. . .: . : :: :
CCDS30 --FSRLSGLRALSITNVLFYNEDLAEVASLPR----LESLDISNTSITDITALLACKDRL
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270
pF1KE3 VSLVLYNMD---LSDDHI-RVIVQLHKLRHLDISRDRLSSYYKFKLTREV-LSLFVQK--
::..... .. .: :. .:..: ::::: :. ..: .. : :. ::
CCDS30 KSLTMHHLKCLKMTTTQILDVVRELKHLNHLDISDDK-------QFTSDIALRLLEQKDI
220 230 240 250 260
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 LGNLMSLDISGHMILENCSISKMEEEAGQTSIEPSKSSIIPFRALKRP-LQFLGLFENSL
: ::.:::.::. ... ..: .. :. .:: .::.::. ..
CCDS30 LPNLVSLDVSGR--------KHVTDKAVEAFIQ------------QRPSMQFVGLLATDA
270 280 290 300
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 CR---LTHIPAYKVSGDKNEEQVLNAIEAYTEHRPEITSRAINLLFDIARIERCNQLLRA
:: ::::. :: :. .:.. :.: : .. .:. ::..... . .. .
CCDS30 GYSEFLTGEGHLKVSGEANETQIAEALKRYSE-RAFFVREALFHLFSLTHVMEKTKP-EI
310 320 330 340 350 360
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 LKLVITALKCHKYDRNIQVTGSAALFYLTNSEYRSEQSVKLRRQVIQVVLNGMESY-QEV
::::.:... : .. .:...:: .: ::... . . :.: .: ...:..:: . ..
CCDS30 LKLVVTGMRNHPMNLPVQLAASACVFNLTKQDLAAGMPVRLLADVTHLLLKAMEHFPNHQ
370 380 390 400 410 420
460 470 480 490 500 510
pF1KE3 TVQRNCCLTLCNFSIPEELEFQYRRVNELLLSILNPTRQDESIQRIAVHLCNALVCQVDN
.:.:: :.::. : ... :. .. .:... : ...:...::.:: . . :. ....
CCDS30 QLQKNCLLSLCSDRILQDVPFNRFEAAKLVMQWLC-NHEDQNMQRMAVAIISILAAKLST
430 440 450 460 470 480
520 530 540 550 560 570
pF1KE3 DHKEAVGKMGFVVT-MLKLIQKKLLDKTCDQVMEFSWSALWNITDETPDNCEMFLNFNGM
.. .: :.: .:.....: ... : ...:. :::::.:::.: .:. :.. .:.
CCDS30 EQTAQLGTELFIVRQLLQIVKQKTNQNSVDTTLKFTLSALWNLTDESPTTCRHFIENQGL
490 500 510 520 530 540
580 590 600 610 620 630
pF1KE3 KLFLDCLKEFPEKQELHRNMLGLLGNVAEVKELRPQLMTSQFISVFSNLLESKADGIEVS
.::. :. :: .. .....::::.:.:::.::. .:: ..::. .:.::.: .:::
CCDS30 ELFMRVLESFPTESSIQQKVLGLLNNIAEVQELHSELMWKDFIDHISSLLHSVE--VEVS
550 560 570 580 590
640 650 660 670 680 690
pF1KE3 YNACGVLSHIMFDGPEAWGVCEPQREEVEERMWAAIQSWDINSRRNINYRSFEPILRLLP
: : :...:.. : .:: . . ::. . . . .:: .: . . ::::.:.. ::
CCDS30 YFAAGIIAHLISRGEQAWTLSRSQRNSLLDDLHSAILKWPTPECEMVAYRSFNPFFPLLG
600 610 620 630 640 650
700 710 720 730 740 750
pF1KE3 QGISPVSQHWATWALYNLVSVYPDKYCPLLIKEGGMPLLRDIIKMATARQETKEMARKVI
.: : ::.::. .. : :..:: .::.:::. : .: . .....: ..
CCDS30 CFTTPGVQLWAVWAMQHVCSKNPSRYCSMLIEEGGLQHLYNIKDHEHTDPHVQQIAVAIL
660 670 680 690 700 710
760
pF1KE3 EHCSNFKEENMDTSR
.
CCDS30 DSLEKHIVRHGRPPPCKKQPQARLN
720 730 740
>>CCDS44148.1 ZYG11A gene_id:440590|Hs108|chr1 (759 aa)
initn: 372 init1: 190 opt: 639 Z-score: 775.1 bits: 154.2 E(32554): 7.4e-37
Smith-Waterman score: 735; 26.7% identity (59.0% similar) in 719 aa overlap (74-766:70-751)
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 SEICDRLVNEYVELVNAACNFEPHESFFSLFSDPRSTRLTRIHLREDLVQDQDLEAIRKQ
: . . :. :. . . :. .: .
CCDS44 NICLNVLIANLEKLCSERPDGTLCLPEHWSFPQEVAERFLRVMTWQGKLTDRTASIFRGN
40 50 60 70 80 90
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 DLVELYLTNCEKLSAKSLQTLRSFS-HTLVSLSLFGC-TNIFYEEENPGGCEDEYLVNPT
.. .: :.: .: . .. ...: : :. :. . ... . : : ... .. .
CCDS44 QM-KLKLVNIQKAKISTAAFIKAFCRHKLIELNATAVHADLPVPDIISGLCSNRW-IQQN
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210
pF1KE3 CQVLVKDFT-FEGFSRLRFLN--LG-RMIDWVPV----ESL--LRPLNSLAALDLSGIQT
: :. : : . ::: :.. : :... : :.: . : : .::.:. .
CCDS44 LQCLLLDSTSIPQNSRLLFFSQLTGLRILSVFNVCFHTEDLANVSQLPRLESLDISNTLV
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260
pF1KE3 SDAAFLTQWKDSLVSLVLYNMD---LSDDHIRVIV-QLHKLRHLDISRDR-LSSYYKFKL
.: . : :: : ::... . .. ..: ... .:. : ::::: : :.: :.:
CCDS44 TDISALLTCKDRLKSLTMHYLKCLAMTKSQILAVIRELKCLLHLDISDHRQLKSDLAFHL
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 TREVLSLFVQKLGNLMSLDISGHMILENCSISKMEEEAGQTSIEPSKSSIIPFRALKRPL
.. . : :..:::::: :: . .:: . :. :. .
CCDS44 LQQK-----DILPNVVSLDISGG----NC----ITDEAVELFIR-----------LRPAM
280 290 300 310
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 QFLGLFEN---SLCRLTHIPAYKVSGDKNEEQVLNAIEAYTEHRPEITSRAINLLF-DIA
::.::. . : .: . .:.: . :. .:. : ..: ....:.. :: .
CCDS44 QFVGLLATDAGSSDFFTTKQGLRVAGGASMSQISEALSRY-RNRSCFVKEALHRLFTETF
320 330 340 350 360 370
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 RIERCNQLLRALKLVITALKCHKYDRNIQVTGSAALFYLTNSEYRSEQSVKLRRQVIQVV
.: . :::: ... : : .: :.:: . :: . . . :.: .: ..
CCDS44 SMEVTMPAI--LKLVAIGMRNHPLDLRVQFTASACALNLTRQGLAKGMPVRLLSEVTCLL
380 390 400 410 420 430
450 460 470 480 490 500
pF1KE3 LNGMESYQEVT-VQRNCCLTLCNFSIPEELEFQYRRVNELLLSILNPTRQDESIQRIAVH
....... . .:.:: :.: : : .. :. . .... : ... ..: .::
CCDS44 FKALKNFPHYQQLQKNCLLSLTNSRILVDVPFDRFDAAKFVMRWLCK-HENPKMQTMAVS
440 450 460 470 480
510 520 530 540 550 560
pF1KE3 LCNALVCQVDNDHKEAVGKMGFVVT-MLKLIQKKLLDKTCDQVMEFSWSALWNITDETPD
. . :. :.. .. . .. ..: .: ....: .. : .. :. .::::.:: .:
CCDS44 VTSILALQLSPEQTAQLEELFMAVKELLAIVKQKTTENLDDVTFLFTLKALWNLTDGSPA
490 500 510 520 530 540
570 580 590 600 610 620
pF1KE3 NCEMFLNFNGMKLFLDCLKEFPEKQELHRNMLGLLGNVAEVKELRPQLMTSQFISVFSNL
:. :.. .:...:.. :. : :. .. ..::::.:.:::.:: .:.: . .. ...:
CCDS44 ACKHFIENQGLQIFIQVLETFSESA-IQSKVLGLLNNIAEVRELSSKLVTEDVLKHINSL
550 560 570 580 590 600
630 640 650 660 670
pF1KE3 LESKADGIEVSYNACGVLSHIMFDGPEAWGVCEPQREEVEERMWAAIQSWDINSRRN---
: :. .:::: : :...:. : . : . ::. . . . :.::.: .: .
CCDS44 LCSRE--MEVSYFAAGIIAHLTSDR-QLWISRDFQRRTLLQDLHATIQNWPSSSCKMTAL
610 620 630 640 650 660
680 690 700 710 720 730
pF1KE3 INYRSFEPILRLLPQGISPVSQHWATWALYNLVSVYPDKYCPLLIKEGGMPLLRDIIKMA
..::::. .. :: . .: : :: ::.:.. : :.::: .:..: :. :: :: . .
CCDS44 VTYRSFKTFFPLLGNFSQPEVQLWALWAMYHVCSKNPSKYCKMLVEEEGLQLLCDIQEHS
670 680 690 700 710 720
740 750 760
pF1KE3 TARQETKEMARKVIEHCSNFKEENMDTSR
: .....: .... .:. . :. .:
CCDS44 EATPKAQQIAASILD---DFRMHFMNYQRPTLCQMPF
730 740 750
>>CCDS76166.1 ZYG11A gene_id:440590|Hs108|chr1 (417 aa)
initn: 411 init1: 190 opt: 595 Z-score: 725.7 bits: 144.2 E(32554): 4.2e-34
Smith-Waterman score: 595; 28.0% identity (63.9% similar) in 418 aa overlap (355-766:3-409)
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 PLQFLGLFENSLCRLTHIPAYKVSGDKNEEQVLNAIEAYTEHRPEITSRAINLLF-DIAR
:. .:. : ..: ....:.. :: .
CCDS76 MSQISEALSRY-RNRSCFVKEALHRLFTETFS
10 20 30
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 IERCNQLLRALKLVITALKCHKYDRNIQVTGSAALFYLTNSEYRSEQSVKLRRQVIQVVL
.: . :::: ... : : .: :.:: . :: . . . :.: .: ...
CCDS76 MEVTMPAI--LKLVAIGMRNHPLDLRVQFTASACALNLTRQGLAKGMPVRLLSEVTCLLF
40 50 60 70 80
450 460 470 480 490 500
pF1KE3 NGMESYQEVT-VQRNCCLTLCNFSIPEELEFQYRRVNELLLSILNPTRQDESIQRIAVHL
...... . .:.:: :.: : : .. :. . .... : ... ..: .:: .
CCDS76 KALKNFPHYQQLQKNCLLSLTNSRILVDVPFDRFDAAKFVMRWLCK-HENPKMQTMAVSV
90 100 110 120 130 140
510 520 530 540 550 560
pF1KE3 CNALVCQVDNDHKEAVGKMGFVVT-MLKLIQKKLLDKTCDQVMEFSWSALWNITDETPDN
. :. :.. .. . .. ..: .: ....: .. : .. :. .::::.:: .:
CCDS76 TSILALQLSPEQTAQLEELFMAVKELLAIVKQKTTENLDDVTFLFTLKALWNLTDGSPAA
150 160 170 180 190 200
570 580 590 600 610 620
pF1KE3 CEMFLNFNGMKLFLDCLKEFPEKQELHRNMLGLLGNVAEVKELRPQLMTSQFISVFSNLL
:. :.. .:...:.. :. : :. .. ..::::.:.:::.:: .:.: . .. ...::
CCDS76 CKHFIENQGLQIFIQVLETFSESA-IQSKVLGLLNNIAEVRELSSKLVTEDVLKHINSLL
210 220 230 240 250 260
630 640 650 660 670
pF1KE3 ESKADGIEVSYNACGVLSHIMFDGPEAWGVCEPQREEVEERMWAAIQSWDINSRRN---I
:. .:::: : :...:. : . : . ::. . . . :.::.: .: . .
CCDS76 CSRE--MEVSYFAAGIIAHLTSDR-QLWISRDFQRRTLLQDLHATIQNWPSSSCKMTALV
270 280 290 300 310 320
680 690 700 710 720 730
pF1KE3 NYRSFEPILRLLPQGISPVSQHWATWALYNLVSVYPDKYCPLLIKEGGMPLLRDIIKMAT
.::::. .. :: . .: : :: ::.:.. : :.::: .:..: :. :: :: . .
CCDS76 TYRSFKTFFPLLGNFSQPEVQLWALWAMYHVCSKNPSKYCKMLVEEEGLQLLCDIQEHSE
330 340 350 360 370 380
740 750 760
pF1KE3 ARQETKEMARKVIEHCSNFKEENMDTSR
: .....: .... .:. . :. .:
CCDS76 ATPKAQQIAASILD---DFRMHFMNYQRPTLCQMPF
390 400 410
766 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 18:08:56 2016 done: Mon Nov 7 18:08:57 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]