Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3267
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3267, 662 aa
1>>>pF1KE3267 662 - 662 aa - 662 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0493+/- 0.001; mu= 15.2676+/- 0.060
mean_var=67.4365+/-13.868, 0's: 0 Z-trim(103.7): 24 B-trim: 130 in 2/48
Lambda= 0.156180
statistics sampled from 7511 (7522) to 7511 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.596), E-opt: 0.2 (0.231), width: 16
Scan time: 2.560
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3873.1 FASTKD3 gene_id:79072|Hs108|chr5 ( 662) 4393 999.2 0
CCDS13048.1 FASTKD5 gene_id:60493|Hs108|chr20 ( 764) 298 76.6 1.5e-13
CCDS33318.1 FASTKD1 gene_id:79675|Hs108|chr2 ( 847) 257 67.3 9.9e-11
>>CCDS3873.1 FASTKD3 gene_id:79072|Hs108|chr5 (662 aa)
initn: 4393 init1: 4393 opt: 4393 Z-score: 5344.5 bits: 999.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4393; 99.8% identity (100.0% similar) in 662 aa overlap (1-662:1-662)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MALITLRKNLYRLSDFQMHRALAALKNKPLNHVHKVVKERLCPWLCSRQPEPFGVRFHHA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS38 MALITLRKNLYRLSDFQMHRALAALKNKPLNHVHKVVKERLCPWLCSRQPEPFGVKFHHA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 HCKKFHSKNGNDLHPLGGPVFSQVSDCDRLEQNVKNEESQMFYRRLSNLTSSEEVLSFIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 HCKKFHSKNGNDLHPLGGPVFSQVSDCDRLEQNVKNEESQMFYRRLSNLTSSEEVLSFIS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 TMETLPDTMAAGALQRICEVEKKDGDQGLPKEILENSIFQALCFQFEKEPSQLSNTSLVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 TMETLPDTMAAGALQRICEVEKKDGDQGLPKEILENSIFQALCFQFEKEPSQLSNTSLVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 ALQALILLHVDPQSSLLLNLVAECQNRLRKGGMEVRNLCILGESLITLHSSGCVTLELII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 ALQALILLHVDPQSSLLLNLVAECQNRLRKGGMEVRNLCILGESLITLHSSGCVTLELII
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 NQLQGEKLETFTPEDIVALYRILQACTEKVDEHQTFLNKINNFSLSIVSNLSPKLISQML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 NQLQGEKLETFTPEDIVALYRILQACTEKVDEHQTFLNKINNFSLSIVSNLSPKLISQML
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 TALVVLDQSQAFPLIIKLGKYVVRHVPHFTNEELRRVLEAFIYFGHHDTFFTKALEHRVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 TALVVLDQSQAFPLIIKLGKYVVRHVPHFTNEELRRVLEAFIYFGHHDTFFTKALEHRVA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 AVCLTLDPEVVCRVMEYCSRELILSKPILNAVAETFVCQTEKFSPRQISALMEPFGKLNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 AVCLTLDPEVVCRVMEYCSRELILSKPILNAVAETFVCQTEKFSPRQISALMEPFGKLNY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 LPPNASALFRKLENVLFTHFNYFPPKSLLKLLHSCSLNECHPVNFLAKIFKPLFLQRLQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 LPPNASALFRKLENVLFTHFNYFPPKSLLKLLHSCSLNECHPVNFLAKIFKPLFLQRLQG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 KESHLDTLSRAQLTQLFLASVLECPFYKGPKLLPKYQVKSFLTPCCSLETPVDSQLYRYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 KESHLDTLSRAQLTQLFLASVLECPFYKGPKLLPKYQVKSFLTPCCSLETPVDSQLYRYV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 KIGLTNLLGARLYFAPKVLTPYCYTIDVEIKLDEEGFVLPSTANEDIHKRIALCIDGPKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 KIGLTNLLGARLYFAPKVLTPYCYTIDVEIKLDEEGFVLPSTANEDIHKRIALCIDGPKR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 FCSNSKHLLGKEAIKQRHLQLLGYQVVQIPYHEIGMLKSRRELVEYLQRKLFSQNTVHWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 FCSNSKHLLGKEAIKQRHLQLLGYQVVQIPYHEIGMLKSRRELVEYLQRKLFSQNTVHWL
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 QE
::
CCDS38 QE
>>CCDS13048.1 FASTKD5 gene_id:60493|Hs108|chr20 (764 aa)
initn: 219 init1: 122 opt: 298 Z-score: 356.8 bits: 76.6 E(32554): 1.5e-13
Smith-Waterman score: 301; 21.2% identity (56.1% similar) in 524 aa overlap (80-589:117-615)
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 PEPFGVRFHHAHCKKFHSKNGNDLHPLGGPVFSQVSDCDRLEQNVKNEESQMFYRRLSNL
:: :. :... .: ::.. ..
CCDS13 KASTLQLGSPRATGVDEEDVEVFDSFENMRVFLQLRPEYRVHSYNASETSQLL-----SV
90 100 110 120 130 140
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 TSSEEVLSFISTMETLPDTMAAGALQRICEVEKKDGDQGLPKEILENSIFQALCFQFEKE
. .: .: . . .. . .: .. .:.. . ..: : .: .. : :: :. .
CCDS13 SEGELILHKVRVNQN--NLQAQVIVDYLCKLSSLPAEQH-PV-LLGSTSFALLC-QLSVK
150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 PSQLSNTS-LVTALQALILLHVDPQSSLLLNLV-AECQNRLRKGGMEVRNLCILGESLIT
:: .:. :...:.:...: . :.: .:.. ..: ... . .:. .: ....
CCDS13 KIQLFDTQDLINVLKAFVILGI-PHSHSMLDVYETKCCHQVWEMNMD--QLLLVADLWRY
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 LHSSGCVTLELIINQLQGEKLETFTPEDIVALYRILQACTEKVDEHQTFLNKINNFSLSI
: . :... . :. . . .. ..: : .. :. . : ...:.... :.
CCDS13 LGRKVPRFLNIFSSYLN-LHWKDLSLSQLVHLIYVI---GENRQVSQDLMQKLESLILKY
260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 VSNLSPKLISQMLTALVVLDQSQAFPLIIKLGKYVVRHVPHFTNEELRRVLEAFIYFGHH
.. .. . .. . .. . . . .. :.: . .. :.... : ... : : :
CCDS13 IDLINLEEVGTICLGFFKSSTNLSEFVMRKIGDLACANIQHLSSRSLVNIVKMF-RFTHV
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 DTF-FTKALEHRVAAVCLTLDPEVVCRVMEYCSRELILSKPILNAVAETFVCQTEKFSPR
: . : : . . . .: . : .. ::: .:.. ..:::: .. .. . .
CCDS13 DHINFMKQIGEIAPQRIPSLGVQGVMHLTLYCSALRFLNEGVMNAVAASLPPRVAHCRSK
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 QISALMEPFGKLNYLPPNASALFRKLENVL---FTHFNYFP---PKSLLKLLHSCSLNEC
... .. :: ::: :::: .. .: . . . .:: .: : :: : .. :
CCDS13 DVAKILWSFGTLNYKPPNAEEFYSSLISEIHRKMPEFNQYPEHLPTCLLGL----AFLEY
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KE3 HPVNFLAKIFKPLFLQRLQGKESHLDTLSRAQLTQLFLASVLECPFYKGPKLLPKYQVKS
::... ..: :. :: .....: :. .: : . .::: :.: .: . : ..
CCDS13 FPVELIDFALSPGFV-RLAQERTKFDLLK--ELYTLDGTVGIECPDYRGNRLSTHLQQEG
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570
pF1KE3 FLTPCCSLETPVDSQ-LYRYVKIGLTNLLGARLYFAPKVLTPYCYTIDVEIKLDEEGFVL
: ..:. . . . : ..::. : ... :. . :.:..:: . :
CCDS13 SELLWYLAEKDMNSKPEFLETVFLLETMLGGPQYVKHHMILPHTRSSDLEVQLDVNLKPL
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KE3 P----STANEDIHKRIALCIDGPKRFCSNSKHLLGKEAIKQRHLQLLGYQVVQIPYHEIG
: .: :.. :
CCDS13 PFNREATPAENVAKLRLEHVGVSLTDDLMNKLLKGKARGHFQGKTESEPGQQPMELENKA
610 620 630 640 650 660
>>CCDS33318.1 FASTKD1 gene_id:79675|Hs108|chr2 (847 aa)
initn: 395 init1: 149 opt: 257 Z-score: 306.1 bits: 67.3 E(32554): 9.9e-11
Smith-Waterman score: 360; 26.1% identity (53.4% similar) in 509 aa overlap (211-654:349-842)
190 200 210 220 230
pF1KE3 ALQALILLHVDPQSSLLLNLVAECQNRLRKGGMEVRNLCILGE--SLITLHSSGCVTLEL
: :: :: :.. . :.. : .: :::
CCDS33 PEEKKQLKSTMLLMSEDLTGEQALAVLGAMGDMESRNSCLIKRVTSVLHKHLDGYKPLEL
320 330 340 350 360 370
240 250 260 270
pF1KE3 I-INQ----LQGEKLE---------------TFTPEDIVALYRILQAC-TEKVDEHQTFL
. :.: :. .. : .: : .. .: : .. . ..:: . .
CCDS33 LKITQELTFLHFQRKEFFAKLRELLLSYLKNSFIPTEVSVLVRAISLLPSPHLDE--VGI
380 390 400 410 420 430
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 NKINNF----SLSIVSNLSPKLISQMLTALVVLDQSQA--FPLIIKLGKYVVRHVPHFTN
..:. .:. .:... ... . . ::. : . :. :: .: ... : ..
CCDS33 SRIEAVLPQCDLNNLSSFATSVLRWIQHDHMYLDNMTAKQLKLLQKLDHYGRQRLQHSNS
440 450 460 470 480 490
340 350 360 370 380
pF1KE3 EEL-RRVLEAFIYFGHHDTFFTKALEHRVAAVCLTLDPEVVCRVME---YCSRELILSKP
.: :. :... . .:: . ::. .:.. .: : : . : ::
CCDS33 LDLLRKELKSL----KGNTFPESLLEEMIATLQHFMDDINYINVGEIASFISSTDYLSTL
500 510 520 530 540 550
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 ILNAVAETFVCQTEKFSPRQISALMEPFGKLNYLPPNASALFRKLENVLFTHFNYFPPKS
.:. .: . : : ::. : : :...::. ::: ::. . .. . : .... . :
CCDS33 LLDRIASVAVQQIEKIHPFTIPAIIRPFSVLNYDPPQRDEFLGTCVQHLNSYLGILDPFI
560 570 580 590 600 610
450 460 470 480 490 500
pF1KE3 LLKLLHSCSLNECHPVNFLAKIFKPLFLQRLQGKESHLDTLS-----RAQ--LTQLFLAS
:. : : . : : ..: ::. :: :: .:.:. :: :.: : .: .
CCDS33 LVFLGFSLATLEYFPEDLLKAIFNIKFLARL---DSQLEILSPSRSARVQFHLMELNRSV
620 630 640 650 660
510 520 530 540 550 560
pF1KE3 VLECPFYKGPKLLPKYQVKSFLTPCCSLETPVDSQLYRYVKIGLTNLLGARLYFAPKVLT
:::: .. : . .. ... ... ...:.... :...::. .:::
CCDS33 CLECPEFQIPWFHDRF-CQQYNKGIGGMDG-TQQQIFKM----LAEVLGGINCVKASVLT
670 680 690 700 710 720
570 580 590
pF1KE3 PYCYTIDVEIKLDEEGFVLPS---------------TANEDI--------HKRIALCIDG
:: . .: : ::.. :: .: .: .:::: .
CCDS33 PYYHKVDFECILDKRKKPLPYGSHNIALGQLPEMPWESNIEIVGSRLPPGAERIALEFLD
730 740 750 760 770 780
600 610 620 630 640 650
pF1KE3 PKRFCSNSKHLLGKEAIKQRHLQLLGYQVVQIPYHEIG--MLKSRRELVEYLQRKLFSQN
: .: : :. :: :.:.:::..:::.:.:: : . :... ..::.. .:..
CCDS33 SKALCRNIPHMKGKSAMKKRHLEILGYRVIQISQFEWNSMALSTKDARMDYLRECIFGEV
790 800 810 820 830 840
660
pF1KE3 TVHWLQE
CCDS33 KSCL
662 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 19:19:31 2016 done: Mon Nov 7 19:19:31 2016
Total Scan time: 2.560 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]