Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3242
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3242, 565 aa
1>>>pF1KE3242 565 - 565 aa - 565 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8074+/-0.000864; mu= 3.6020+/- 0.052
mean_var=207.3993+/-41.814, 0's: 0 Z-trim(114.5): 83 B-trim: 161 in 1/51
Lambda= 0.089058
statistics sampled from 14958 (15042) to 14958 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.787), E-opt: 0.2 (0.462), width: 16
Scan time: 3.580
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS30920.1 USP21 gene_id:27005|Hs108|chr1 ( 565) 3900 513.7 2.4e-145
CCDS81392.1 USP21 gene_id:27005|Hs108|chr1 ( 551) 3438 454.3 1.8e-127
CCDS58189.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 ( 362) 789 113.8 3.6e-25
CCDS8423.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 ( 396) 789 113.9 3.9e-25
CCDS8422.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 ( 605) 789 114.0 5.4e-25
CCDS61632.1 USP8 gene_id:9101|Hs108|chr15 (1012) 495 76.4 1.9e-13
CCDS10137.1 USP8 gene_id:9101|Hs108|chr15 (1118) 495 76.4 2.1e-13
CCDS58370.1 USP3 gene_id:9960|Hs108|chr15 ( 476) 452 70.6 4.8e-12
CCDS32265.1 USP3 gene_id:9960|Hs108|chr15 ( 520) 452 70.6 5.2e-12
>>CCDS30920.1 USP21 gene_id:27005|Hs108|chr1 (565 aa)
initn: 3900 init1: 3900 opt: 3900 Z-score: 2722.8 bits: 513.7 E(32554): 2.4e-145
Smith-Waterman score: 3900; 100.0% identity (100.0% similar) in 565 aa overlap (1-565:1-565)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MPQASEHRLGRTREPPVNIQPRVGSKLPFAPRARSKERRNPASGPNPMLRPLPPRPGLPD
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CCDS30 MPQASEHRLGRTREPPVNIQPRVGSKLPFAPRARSKERRNPASGPNPMLRPLPPRPGLPD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 ERLKKLELGRGRTSGPRPRGPLRADHGVPLPGSPPPTVALPLPSRTNLARSKSVSSGDLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ERLKKLELGRGRTSGPRPRGPLRADHGVPLPGSPPPTVALPLPSRTNLARSKSVSSGDLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 PMGIALGGHRGTGELGAALSRLALRPEPPTLRRSTSLRRLGGFPGPPTLFSIRTEPPASH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PMGIALGGHRGTGELGAALSRLALRPEPPTLRRSTSLRRLGGFPGPPTLFSIRTEPPASH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 GSFHMISARSSEPFYSDDKMAHHTLLLGSGHVGLRNLGNTCFLNAVLQCLSSTRPLRDFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 GSFHMISARSSEPFYSDDKMAHHTLLLGSGHVGLRNLGNTCFLNAVLQCLSSTRPLRDFC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 LRRDFRQEVPGGGRAQELTEAFADVIGALWHPDSCEAVNPTRFRAVFQKYVPSFSGYSQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LRRDFRQEVPGGGRAQELTEAFADVIGALWHPDSCEAVNPTRFRAVFQKYVPSFSGYSQQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 DAQEFLKLLMERLHLEINRRGRRAPPILANGPVPSPPRRGGALLEEPELSDDDRANLMWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DAQEFLKLLMERLHLEINRRGRRAPPILANGPVPSPPRRGGALLEEPELSDDDRANLMWK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 RYLEREDSKIVDLFVGQLKSCLKCQACGYRSTTFEVFCDLSLPIPKKGFAGGKVSLRDCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RYLEREDSKIVDLFVGQLKSCLKCQACGYRSTTFEVFCDLSLPIPKKGFAGGKVSLRDCF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 NLFTKEEELESENAPVCDRCRQKTRSTKKLTVQRFPRILVLHLNRFSASRGSIKKSSVGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 NLFTKEEELESENAPVCDRCRQKTRSTKKLTVQRFPRILVLHLNRFSASRGSIKKSSVGV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 DFPLQRLSLGDFASDKAGSPVYQLYALCNHSGSVHYGHYTALCRCQTGWHVYNDSRVSPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DFPLQRLSLGDFASDKAGSPVYQLYALCNHSGSVHYGHYTALCRCQTGWHVYNDSRVSPV
490 500 510 520 530 540
550 560
pF1KE3 SENQVASSEGYVLFYQLMQEPPRCL
:::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SENQVASSEGYVLFYQLMQEPPRCL
550 560
>>CCDS81392.1 USP21 gene_id:27005|Hs108|chr1 (551 aa)
initn: 3422 init1: 3422 opt: 3438 Z-score: 2402.2 bits: 454.3 E(32554): 1.8e-127
Smith-Waterman score: 3761; 97.5% identity (97.5% similar) in 565 aa overlap (1-565:1-551)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MPQASEHRLGRTREPPVNIQPRVGSKLPFAPRARSKERRNPASGPNPMLRPLPPRPGLPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MPQASEHRLGRTREPPVNIQPRVGSKLPFAPRARSKERRNPASGPNPMLRPLPPRPGLPD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 ERLKKLELGRGRTSGPRPRGPLRADHGVPLPGSPPPTVALPLPSRTNLARSKSVSSGDLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ERLKKLELGRGRTSGPRPRGPLRADHGVPLPGSPPPTVALPLPSRTNLARSKSVSSGDLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 PMGIALGGHRGTGELGAALSRLALRPEPPTLRRSTSLRRLGGFPGPPTLFSIRTEPPASH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PMGIALGGHRGTGELGAALSRLALRPEPPTLRRSTSLRRLGGFPGPPTLFSIRTEPPASH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 GSFHMISARSSEPFYSDDKMAHHTLLLGSGHVGLRNLGNTCFLNAVLQCLSSTRPLRDFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GSFHMISARSSEPFYSDDKMAHHTLLLGSGHVGLRNLGNTCFLNAVLQCLSSTRPLRDFC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 LRRDFRQEVPGGGRAQELTEAFADVIGALWHPDSCEAVNPTRFRAVFQKYVPSFSGYSQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LRRDFRQEVPGGGRAQELTEAFADVIGALWHPDSCEAVNPTRFRAVFQKYVPSFSGYSQQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 DAQEFLKLLMERLHLEINRRGRRAPPILANGPVPSPPRRGGALLEEPELSDDDRANLMWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DAQEFLKLLMERLHLEINRRGRRAPPILANGPVPSPPRRGGALLEEPELSDDDRANLMWK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 RYLEREDSKIVDLFVGQLKSCLKCQACGYRSTTFEVFCDLSLPIPKKGFAGGKVSLRDCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RYLEREDSKIVDLFVGQLKSCLKCQACGYRSTTFEVFCDLSLPIPKKGFAGGKVSLRDCF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 NLFTKEEELESENAPVCDRCRQKTRSTKKLTVQRFPRILVLHLNRFSASRGSIKKSSVGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NLFTKEEELESENAPVCDRCRQKTRSTKKLTVQRFPRILVLHLNRFSASRGSIKKSSVGV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 DFPLQRLSLGDFASDKAGSPVYQLYALCNHSGSVHYGHYTALCRCQTGWHVYNDSRVSPV
::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DFPLQRLSLGDFASDKA--------------GSVHYGHYTALCRCQTGWHVYNDSRVSPV
490 500 510 520
550 560
pF1KE3 SENQVASSEGYVLFYQLMQEPPRCL
:::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SENQVASSEGYVLFYQLMQEPPRCL
530 540 550
>>CCDS58189.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 (362 aa)
initn: 1007 init1: 404 opt: 789 Z-score: 565.4 bits: 113.8 E(32554): 3.6e-25
Smith-Waterman score: 1158; 47.9% identity (73.3% similar) in 382 aa overlap (185-563:1-361)
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 TSLRRLGGFPGPPTLFSIRTEPPASHGSFHMISARSSEPFYSDDKMAHHTLLLGSGHVGL
:. :..: :: .. .. ..: .::
CCDS58 MLVPGSTRP-YSKKRQNSKS---AQGLAGL
10 20
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 RNLGNTCFLNAVLQCLSSTRPLRDFCLRRDFRQEVPGGGRAQE-LTEAFADVIGALWHPD
::::::::.:..:::::.:: :::.::.: . ... :. :. :.: :: .: ..: .
CCDS58 RNLGNTCFMNSILQCLSNTRELRDYCLQRLYMRDLHHGSNAHTALVEEFAKLIQTIWTSS
30 40 50 60 70 80
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 SCEAVNPTRFRAVFQKYVPSFSGYSQQDAQEFLKLLMERLHLEINRRGRRAPPILANGPV
..:.:..:.. .:.:.: : ::.::::::::..:.. :: :.:: : :
CCDS58 PNDVVSPSEFKTQIQRYAPRFVGYNQQDAQEFLRFLLDGLHNEVNRVTLR--------PK
90 100 110 120 130
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 PSPPRRGGALLEEPELSDDDRANLMWKRYLEREDSKIVDLFVGQLKSCLKCQACGYRSTT
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CCDS58 SNPEN-----LDH--LPDDEKGRQMWRKYLEREDSRIGDLFVGQLKSSLTCTDCGYCSTV
140 150 160 170 180 190
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 FEVFCDLSLPIPKKGFAGGKVSLRDCFNLFTKEEELESENAPVCDRCRQKTRSTKKLTVQ
:. : :::::: :.:. .:.: ::. :::::. :.... :.: ::: . : ::...:
CCDS58 FDPFWDLSLPIAKRGYP--EVTLMDCMRLFTKEDVLDGDEKPTCCRCRGRKRCIKKFSIQ
200 210 220 230 240
460 470 480 490 500 510
pF1KE3 RFPRILVLHLNRFSASRGSIKKSSVGVDFPLQRLSLGDFASDKAGSPVYQLYALCNHSGS
:::.::::::.::: :: .: .. :.:::. :.: .:::.... ::.:::. ::::.
CCDS58 RFPKILVLHLKRFSESRIRTSKLTTFVNFPLRDLDLREFASENTNHAVYNLYAVSNHSGT
250 260 270 280 290 300
520 530 540 550 560
pF1KE3 VHYGHYTALCRCQ-TG-WHVYNDSRVSPVSENQVASSEGYVLFYQLMQEPPRCL
. ::::: :: :: ::..::: :.:.: .:: .:..:.:::.: . : :
CCDS58 TMGGHYTAYCRSPGTGEWHTFNDSSVTPMSSSQVRTSDAYLLFYELASPPSRM
310 320 330 340 350 360
>>CCDS8423.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 (396 aa)
initn: 1039 init1: 404 opt: 789 Z-score: 564.8 bits: 113.9 E(32554): 3.9e-25
Smith-Waterman score: 1152; 49.6% identity (74.5% similar) in 357 aa overlap (210-563:56-395)
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 HGSFHMISARSSEPFYSDDKMAHHTLLLGSGHVGLRNLGNTCFLNAVLQCLSSTRPLRDF
: .::::::::::.:..:::::.:: :::.
CCDS84 RPRSPLSPSLLLSTFVGLLLNKAKNSKSAQGLAGLRNLGNTCFMNSILQCLSNTRELRDY
30 40 50 60 70 80
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 CLRRDFRQEVPGGGRAQE-LTEAFADVIGALWHPDSCEAVNPTRFRAVFQKYVPSFSGYS
::.: . ... :. :. :.: :: .: ..: . ..:.:..:.. .:.:.: : ::.
CCDS84 CLQRLYMRDLHHGSNAHTALVEEFAKLIQTIWTSSPNDVVSPSEFKTQIQRYAPRFVGYN
90 100 110 120 130 140
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 QQDAQEFLKLLMERLHLEINRRGRRAPPILANGPVPSPPRRGGALLEEPELSDDDRANLM
::::::::..:.. :: :.:: : :. . :.. : ::... :
CCDS84 QQDAQEFLRFLLDGLHNEVNRVTLR-------------PKSNPENLDH--LPDDEKGRQM
150 160 170 180 190
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 WKRYLEREDSKIVDLFVGQLKSCLKCQACGYRSTTFEVFCDLSLPIPKKGFAGGKVSLRD
:..:::::::.: ::::::::: : : ::: ::.:. : :::::: :.:. .:.: :
CCDS84 WRKYLEREDSRIGDLFVGQLKSSLTCTDCGYCSTVFDPFWDLSLPIAKRGYP--EVTLMD
200 210 220 230 240
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 CFNLFTKEEELESENAPVCDRCRQKTRSTKKLTVQRFPRILVLHLNRFSASRGSIKKSSV
:. :::::. :.... :.: ::: . : ::...::::.::::::.::: :: .: ..
CCDS84 CMRLFTKEDVLDGDEKPTCCRCRGRKRCIKKFSIQRFPKILVLHLKRFSESRIRTSKLTT
250 260 270 280 290 300
480 490 500 510 520 530
pF1KE3 GVDFPLQRLSLGDFASDKAGSPVYQLYALCNHSGSVHYGHYTALCRCQ-TG-WHVYNDSR
:.:::. :.: .:::.... ::.:::. ::::.. ::::: :: :: ::..:::
CCDS84 FVNFPLRDLDLREFASENTNHAVYNLYAVSNHSGTTMGGHYTAYCRSPGTGEWHTFNDSS
310 320 330 340 350 360
540 550 560
pF1KE3 VSPVSENQVASSEGYVLFYQLMQEPPRCL
:.:.: .:: .:..:.:::.: . : :
CCDS84 VTPMSSSQVRTSDAYLLFYELASPPSRM
370 380 390
>>CCDS8422.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 (605 aa)
initn: 1007 init1: 404 opt: 789 Z-score: 562.2 bits: 114.0 E(32554): 5.4e-25
Smith-Waterman score: 1160; 48.3% identity (73.4% similar) in 379 aa overlap (188-563:248-604)
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 RRLGGFPGPPTLFSIRTEPPASHGSFHMISARSSEPFYSDDKMAHHTLLLGSGHVGLRNL
.::: : . : : .. ..: .:::::
CCDS84 SRVPEIISPTYRPIGRYTLWETGKGQAPGPSRSSSP--GRDGMNSKS---AQGLAGLRNL
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 GNTCFLNAVLQCLSSTRPLRDFCLRRDFRQEVPGGGRAQE-LTEAFADVIGALWHPDSCE
:::::.:..:::::.:: :::.::.: . ... :. :. :.: :: .: ..: . .
CCDS84 GNTCFMNSILQCLSNTRELRDYCLQRLYMRDLHHGSNAHTALVEEFAKLIQTIWTSSPND
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 AVNPTRFRAVFQKYVPSFSGYSQQDAQEFLKLLMERLHLEINRRGRRAPPILANGPVPSP
.:.:..:.. .:.:.: : ::.::::::::..:.. :: :.:: :
CCDS84 VVSPSEFKTQIQRYAPRFVGYNQQDAQEFLRFLLDGLHNEVNRVTLR-------------
340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 PRRGGALLEEPELSDDDRANLMWKRYLEREDSKIVDLFVGQLKSCLKCQACGYRSTTFEV
:. . :.. : ::... ::..:::::::.: ::::::::: : : ::: ::.:.
CCDS84 PKSNPENLDH--LPDDEKGRQMWRKYLEREDSRIGDLFVGQLKSSLTCTDCGYCSTVFDP
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 FCDLSLPIPKKGFAGGKVSLRDCFNLFTKEEELESENAPVCDRCRQKTRSTKKLTVQRFP
: :::::: :.:. .:.: ::. :::::. :.... :.: ::: . : ::...::::
CCDS84 FWDLSLPIAKRGYP--EVTLMDCMRLFTKEDVLDGDEKPTCCRCRGRKRCIKKFSIQRFP
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KE3 RILVLHLNRFSASRGSIKKSSVGVDFPLQRLSLGDFASDKAGSPVYQLYALCNHSGSVHY
.::::::.::: :: .: .. :.:::. :.: .:::.... ::.:::. ::::..
CCDS84 KILVLHLKRFSESRIRTSKLTTFVNFPLRDLDLREFASENTNHAVYNLYAVSNHSGTTMG
500 510 520 530 540 550
520 530 540 550 560
pF1KE3 GHYTALCRCQ-TG-WHVYNDSRVSPVSENQVASSEGYVLFYQLMQEPPRCL
::::: :: :: ::..::: :.:.: .:: .:..:.:::.: . : :
CCDS84 GHYTAYCRSPGTGEWHTFNDSSVTPMSSSQVRTSDAYLLFYELASPPSRM
560 570 580 590 600
>>CCDS61632.1 USP8 gene_id:9101|Hs108|chr15 (1012 aa)
initn: 718 init1: 222 opt: 495 Z-score: 354.9 bits: 76.4 E(32554): 1.9e-13
Smith-Waterman score: 729; 29.9% identity (56.6% similar) in 558 aa overlap (13-555:497-1000)
10 20 30
pF1KE3 MPQASEHRLGRTREPPVNIQPRVGSKLPFAP----RARSKER
: : .:: . . .: . . .: .
CCDS61 RGKEITGVKRQSKSEHETSDAKKSVEDRGKRCPTPEIQKKSTGDVPHTSVTGDSGSGKAQ
470 480 490 500 510 520
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 RNPASGP--NPMLRPLPPRPGLPDERLKKLELGRGRTSGPRPRGPLRADHGVP---LPGS
:.: . . : : .: :::. : :. : ..: . : : :.:
CCDS61 REPLTRARSEEMGRIVP---GLPSGWAKFLDPITGTFR--YYHSPTNTVHMYPPEMAPSS
530 540 550 560 570 580
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 PPPTVALPLPSRTNLARSKSVSSGDLRPMGIALGGHRGTGELGAALSRLALRPEPPTLRR
::.. : : :. :. . . : .: : .. .. :... : ::.
CCDS61 APPST--P-P--THKAKPQIPAERDREPS--KLKRSYSSPDITQAIQEEEKR--KPTV--
590 600 610 620 630
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 STSLRRLGGFPGPPTLFSIRTEPPASHGSFHMISARSSEPFYSDDKMAHHTLLLGSGHVG
. .. : . :: . : : . . . :. .: .. . : . .:
CCDS61 TPTVNR----ENKPTCY-----PKAEISRLSASQIRNLNPVFGGS---------GPALTG
640 650 660 670
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 LRNLGNTCFLNAVLQCLSSTRPLRDFCLRRDFRQEVPGG---GRAQELTEAFADVIGALW
::::::::..:..:::: .. : :. : ..... . :. :..: :. .. :::
CCDS61 LRNLGNTCYMNSILQCLCNAPHLADYFNRNCYQDDINRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALW
680 690 700 710 720 730
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 HPDSCEAVNPTRFRAVFQKYVPSFSGYSQQDAQEFLKLLMERLHLEINRRGRRAPPILAN
. . ..: :. .. : .:.::::::.::.: .::. :: ..:. : :
CCDS61 -TGQYRYISPKDFKITIGKINDQFAGYSQQDSQELLLFLMDGLHEDLNKADNRKRYKEEN
740 750 760 770 780 790
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 GPVPSPPRRGGALLEEPELSDDDRANLMWKRYLEREDSKIVDLFVGQLKSCLKCQACGYR
. .:.: :. :... . ..: :: :: ::.:: ..: .: .
CCDS61 ND---------------HLDDFKAAEHAWQKHKQLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCHKK
800 810 820 830
400 410 420 430 440 450
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: :::.: ::::. . .: .:.::. ::.:::.: ..: :..:: . : ::.
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. ..: .:..::.::: . .: ...:::::. :.:.... . : . :.:... :
CCDS61 EIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQKLQTSVDFPLENLDLSQYVIGPKNNLKKYNLFSVSN
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: :.. ::::: :. . : ..: .:: .: ..: :: .:.:::
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::::.: : : .: :::. : :. : ..: . : :
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. .:::::::::..:..:::: .. : :. : ..... . :. :..: :. .
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CCDS10 TCHKKSRTFEAFMYLSLPLAST----SKCTLQDCLRLFSKEEKLTDNNRFYCSHCRARRD
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... :: :.. ::::: :. . : ..: .:: .: ..: :: .:.:::
CCDS10 FSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRWFKFDDHEVSDISVSSVKSSAAYILFYTSLGPRV
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CCDS32 FKELPAVELRNGKTAGRRTYHTRSQGDNNVS-LVEEFRKTLCALWQ-GSQTAFSPESLFY
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CCDS32 VVWKIMPNFRGYQQQDAHEFMRYLLDHLHLEL-QGGF-------NGV-----SRSAILQE
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pF1KE3 EPELSDDDRANLMWKRYLEREDSKIVDLFVGQLKSCLKCQACGYRSTTFEVFCDLSLPIP
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CCDS32 NSTLSASNKCCI------NGASTVVTAIFGGILQNEVNCLICGTESRKFDPFLDLSLDIP
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