Result of FASTA (omim) for
pFN21AE3220
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3220, 496 aa
1>>>pF1KE3220 496 - 496 aa - 496 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8573+/-0.000599; mu= 0.4774+/- 0.037
mean_var=220.5068+/-45.922, 0's: 0 Z-trim(111.4): 109 B-trim: 252 in 1/53
Lambda= 0.086370
statistics sampled from 19937 (20035) to 19937 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.578), E-opt: 0.2 (0.235), width: 16
Scan time: 6.560
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001138 (OMIM: 601922) angiopoietin-2 isoform a ( 496) 3294 424.4 3.7e-118
NP_001112359 (OMIM: 601922) angiopoietin-2 isoform ( 495) 3277 422.3 1.6e-117
NP_001112360 (OMIM: 601922) angiopoietin-2 isoform ( 444) 2339 305.3 2.3e-82
XP_016868807 (OMIM: 601922) PREDICTED: angiopoieti ( 443) 2322 303.2 9.9e-82
NP_001186788 (OMIM: 601667) angiopoietin-1 isoform ( 497) 2018 265.4 2.7e-70
NP_001137 (OMIM: 601667) angiopoietin-1 isoform 1 ( 498) 2017 265.3 3e-70
NP_057069 (OMIM: 603705) angiopoietin-4 isoform 1 ( 503) 1531 204.7 5.1e-52
NP_001300980 (OMIM: 601667) angiopoietin-1 isoform ( 298) 1279 173.1 9.7e-43
XP_011527541 (OMIM: 603705) PREDICTED: angiopoieti ( 451) 1186 161.7 4.1e-39
NP_001309738 (OMIM: 603705) angiopoietin-4 isoform ( 410) 1127 154.3 6.2e-37
NP_036230 (OMIM: 605001) angiopoietin-related prot ( 493) 706 101.9 4.4e-21
XP_005245634 (OMIM: 603874) PREDICTED: angiopoieti ( 491) 665 96.8 1.5e-19
NP_004664 (OMIM: 603874) angiopoietin-related prot ( 491) 665 96.8 1.5e-19
NP_006673 (OMIM: 605351) fibroleukin precursor [Ho ( 439) 626 91.9 4.1e-18
XP_011526649 (OMIM: 609336) PREDICTED: angiopoieti ( 470) 611 90.0 1.6e-17
NP_114123 (OMIM: 609336) angiopoietin-related prot ( 470) 611 90.0 1.6e-17
XP_011526652 (OMIM: 609336) PREDICTED: angiopoieti ( 470) 611 90.0 1.6e-17
NP_001308340 (OMIM: 609336) angiopoietin-related p ( 470) 611 90.0 1.6e-17
XP_016882836 (OMIM: 609336) PREDICTED: angiopoieti ( 470) 611 90.0 1.6e-17
XP_011526651 (OMIM: 609336) PREDICTED: angiopoieti ( 537) 611 90.1 1.7e-17
XP_011526650 (OMIM: 609336) PREDICTED: angiopoieti ( 537) 611 90.1 1.7e-17
XP_005260148 (OMIM: 609336) PREDICTED: angiopoieti ( 551) 611 90.1 1.8e-17
NP_647475 (OMIM: 605910,615881) angiopoietin-relat ( 406) 606 89.4 2.2e-17
NP_001138578 (OMIM: 613357) fibrinogen C domain-co ( 461) 599 88.5 4.3e-17
NP_116232 (OMIM: 613357) fibrinogen C domain-conta ( 461) 599 88.5 4.3e-17
NP_001994 (OMIM: 601252) ficolin-1 precursor [Homo ( 326) 587 86.9 9.4e-17
NP_055310 (OMIM: 604774,605019) angiopoietin-relat ( 460) 589 87.3 1e-16
NP_003656 (OMIM: 604973,613860) ficolin-3 isoform ( 299) 583 86.4 1.2e-16
NP_775628 (OMIM: 604973,613860) ficolin-3 isoform ( 288) 575 85.4 2.4e-16
NP_115859 (OMIM: 600985,606408,615963) tenascin-X ( 673) 580 86.3 3e-16
XP_006717078 (OMIM: 601624) PREDICTED: ficolin-2 i ( 264) 569 84.6 3.8e-16
NP_056652 (OMIM: 601624) ficolin-2 isoform b precu ( 275) 569 84.6 3.9e-16
XP_011516694 (OMIM: 601624) PREDICTED: ficolin-2 i ( 302) 569 84.7 4.2e-16
NP_004099 (OMIM: 601624) ficolin-2 isoform a precu ( 313) 569 84.7 4.3e-16
NP_001315564 (OMIM: 601995) tenascin-R isoform 2 [ (1025) 579 86.3 4.5e-16
XP_011508251 (OMIM: 601995) PREDICTED: tenascin-R (1199) 579 86.4 5.1e-16
NP_003276 (OMIM: 601995) tenascin-R isoform 1 prec (1358) 579 86.4 5.6e-16
XP_016857708 (OMIM: 601995) PREDICTED: tenascin-R (1358) 579 86.4 5.6e-16
XP_016857707 (OMIM: 601995) PREDICTED: tenascin-R (1358) 579 86.4 5.6e-16
NP_002395 (OMIM: 600596) microfibril-associated gl ( 255) 557 83.1 1e-15
NP_001185624 (OMIM: 600596) microfibril-associated ( 279) 557 83.1 1.1e-15
NP_061978 (OMIM: 600985,606408,615963) tenascin-X (4242) 580 86.9 1.2e-15
XP_005252032 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1564) 543 82.0 1.4e-14
XP_005252031 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1655) 543 82.0 1.5e-14
XP_006717164 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1655) 543 82.0 1.5e-14
XP_011516931 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1746) 543 82.0 1.5e-14
XP_011516930 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1746) 543 82.0 1.5e-14
XP_005252030 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1837) 543 82.0 1.6e-14
XP_011516928 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1929) 543 82.0 1.6e-14
XP_006717161 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (2019) 543 82.1 1.7e-14
>>NP_001138 (OMIM: 601922) angiopoietin-2 isoform a prec (496 aa)
initn: 3294 init1: 3294 opt: 3294 Z-score: 2242.2 bits: 424.4 E(85289): 3.7e-118
Smith-Waterman score: 3294; 100.0% identity (100.0% similar) in 496 aa overlap (1-496:1-496)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MWQIVFFTLSCDLVLAAAYNNFRKSMDSIGKKQYQVQHGSCSYTFLLPEMDNCRSSSSPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MWQIVFFTLSCDLVLAAAYNNFRKSMDSIGKKQYQVQHGSCSYTFLLPEMDNCRSSSSPY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 VSNAVQRDAPLEYDDSVQRLQVLENIMENNTQWLMKLENYIQDNMKKEMVEIQQNAVQNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSNAVQRDAPLEYDDSVQRLQVLENIMENNTQWLMKLENYIQDNMKKEMVEIQQNAVQNQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 TAVMIEIGTNLLNQTAEQTRKLTDVEAQVLNQTTRLELQLLEHSLSTNKLEKQILDQTSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TAVMIEIGTNLLNQTAEQTRKLTDVEAQVLNQTTRLELQLLEHSLSTNKLEKQILDQTSE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 INKLQDKNSFLEKKVLAMEDKHIIQLQSIKEEKDQLQVLVSKQNSIIEELEKKIVTATVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 INKLQDKNSFLEKKVLAMEDKHIIQLQSIKEEKDQLQVLVSKQNSIIEELEKKIVTATVN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 NSVLQKQQHDLMETVNNLLTMMSTSNSAKDPTVAKEEQISFRDCAEVFKSGHTTNGIYTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NSVLQKQQHDLMETVNNLLTMMSTSNSAKDPTVAKEEQISFRDCAEVFKSGHTTNGIYTL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 TFPNSTEEIKAYCDMEAGGGGWTIIQRREDGSVDFQRTWKEYKVGFGNPSGEYWLGNEFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TFPNSTEEIKAYCDMEAGGGGWTIIQRREDGSVDFQRTWKEYKVGFGNPSGEYWLGNEFV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 SQLTNQQRYVLKIHLKDWEGNEAYSLYEHFYLSSEELNYRIHLKGLTGTAGKISSISQPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SQLTNQQRYVLKIHLKDWEGNEAYSLYEHFYLSSEELNYRIHLKGLTGTAGKISSISQPG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 NDFSTKDGDNDKCICKCSQMLTGGWWFDACGPSNLNGMYYPQRQNTNKFNGIKWYYWKGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NDFSTKDGDNDKCICKCSQMLTGGWWFDACGPSNLNGMYYPQRQNTNKFNGIKWYYWKGS
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE3 GYSLKATTMMIRPADF
::::::::::::::::
NP_001 GYSLKATTMMIRPADF
490
>>NP_001112359 (OMIM: 601922) angiopoietin-2 isoform b p (495 aa)
initn: 1681 init1: 1681 opt: 3277 Z-score: 2230.8 bits: 422.3 E(85289): 1.6e-117
Smith-Waterman score: 3277; 99.8% identity (99.8% similar) in 496 aa overlap (1-496:1-495)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MWQIVFFTLSCDLVLAAAYNNFRKSMDSIGKKQYQVQHGSCSYTFLLPEMDNCRSSSSPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MWQIVFFTLSCDLVLAAAYNNFRKSMDSIGKKQYQVQHGSCSYTFLLPEMDNCRSSSSPY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 VSNAVQRDAPLEYDDSVQRLQVLENIMENNTQWLMKLENYIQDNMKKEMVEIQQNAVQNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSNAVQRDAPLEYDDSVQRLQVLENIMENNTQWLMKLENYIQDNMKKEMVEIQQNAVQNQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 TAVMIEIGTNLLNQTAEQTRKLTDVEAQVLNQTTRLELQLLEHSLSTNKLEKQILDQTSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TAVMIEIGTNLLNQTAEQTRKLTDVEAQVLNQTTRLELQLLEHSLSTNKLEKQILDQTSE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 INKLQDKNSFLEKKVLAMEDKHIIQLQSIKEEKDQLQVLVSKQNSIIEELEKKIVTATVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 INKLQDKNSFLEKKVLAMEDKHIIQLQSIKEEKDQLQVLVSKQNSIIEELEKKIVTATVN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 NSVLQKQQHDLMETVNNLLTMMSTSNSAKDPTVAKEEQISFRDCAEVFKSGHTTNGIYTL
::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NSVLQKQQHDLMETVNNLLTMMSTSNS-KDPTVAKEEQISFRDCAEVFKSGHTTNGIYTL
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 TFPNSTEEIKAYCDMEAGGGGWTIIQRREDGSVDFQRTWKEYKVGFGNPSGEYWLGNEFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TFPNSTEEIKAYCDMEAGGGGWTIIQRREDGSVDFQRTWKEYKVGFGNPSGEYWLGNEFV
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 SQLTNQQRYVLKIHLKDWEGNEAYSLYEHFYLSSEELNYRIHLKGLTGTAGKISSISQPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SQLTNQQRYVLKIHLKDWEGNEAYSLYEHFYLSSEELNYRIHLKGLTGTAGKISSISQPG
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 NDFSTKDGDNDKCICKCSQMLTGGWWFDACGPSNLNGMYYPQRQNTNKFNGIKWYYWKGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NDFSTKDGDNDKCICKCSQMLTGGWWFDACGPSNLNGMYYPQRQNTNKFNGIKWYYWKGS
420 430 440 450 460 470
490
pF1KE3 GYSLKATTMMIRPADF
::::::::::::::::
NP_001 GYSLKATTMMIRPADF
480 490
>>NP_001112360 (OMIM: 601922) angiopoietin-2 isoform c p (444 aa)
initn: 2339 init1: 2339 opt: 2339 Z-score: 1599.8 bits: 305.3 E(85289): 2.3e-82
Smith-Waterman score: 2863; 89.5% identity (89.5% similar) in 496 aa overlap (1-496:1-444)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MWQIVFFTLSCDLVLAAAYNNFRKSMDSIGKKQYQVQHGSCSYTFLLPEMDNCRSSSSPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MWQIVFFTLSCDLVLAAAYNNFRKSMDSIGKKQYQVQHGSCSYTFLLPEMDNCRSSSSPY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 VSNAVQRDAPLEYDDSVQRLQVLENIMENNTQWLMKLENYIQDNMKKEMVEIQQNAVQNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSNAVQRDAPLEYDDSVQRLQVLENIMENNTQWLMK------------------------
70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 TAVMIEIGTNLLNQTAEQTRKLTDVEAQVLNQTTRLELQLLEHSLSTNKLEKQILDQTSE
::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ----------------------------VLNQTTRLELQLLEHSLSTNKLEKQILDQTSE
100 110 120
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 INKLQDKNSFLEKKVLAMEDKHIIQLQSIKEEKDQLQVLVSKQNSIIEELEKKIVTATVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 INKLQDKNSFLEKKVLAMEDKHIIQLQSIKEEKDQLQVLVSKQNSIIEELEKKIVTATVN
130 140 150 160 170 180
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 NSVLQKQQHDLMETVNNLLTMMSTSNSAKDPTVAKEEQISFRDCAEVFKSGHTTNGIYTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NSVLQKQQHDLMETVNNLLTMMSTSNSAKDPTVAKEEQISFRDCAEVFKSGHTTNGIYTL
190 200 210 220 230 240
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 TFPNSTEEIKAYCDMEAGGGGWTIIQRREDGSVDFQRTWKEYKVGFGNPSGEYWLGNEFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TFPNSTEEIKAYCDMEAGGGGWTIIQRREDGSVDFQRTWKEYKVGFGNPSGEYWLGNEFV
250 260 270 280 290 300
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 SQLTNQQRYVLKIHLKDWEGNEAYSLYEHFYLSSEELNYRIHLKGLTGTAGKISSISQPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SQLTNQQRYVLKIHLKDWEGNEAYSLYEHFYLSSEELNYRIHLKGLTGTAGKISSISQPG
310 320 330 340 350 360
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 NDFSTKDGDNDKCICKCSQMLTGGWWFDACGPSNLNGMYYPQRQNTNKFNGIKWYYWKGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NDFSTKDGDNDKCICKCSQMLTGGWWFDACGPSNLNGMYYPQRQNTNKFNGIKWYYWKGS
370 380 390 400 410 420
490
pF1KE3 GYSLKATTMMIRPADF
::::::::::::::::
NP_001 GYSLKATTMMIRPADF
430 440
>>XP_016868807 (OMIM: 601922) PREDICTED: angiopoietin-2 (443 aa)
initn: 1630 init1: 1630 opt: 2322 Z-score: 1588.3 bits: 303.2 E(85289): 9.9e-82
Smith-Waterman score: 2846; 89.3% identity (89.3% similar) in 496 aa overlap (1-496:1-443)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MWQIVFFTLSCDLVLAAAYNNFRKSMDSIGKKQYQVQHGSCSYTFLLPEMDNCRSSSSPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MWQIVFFTLSCDLVLAAAYNNFRKSMDSIGKKQYQVQHGSCSYTFLLPEMDNCRSSSSPY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 VSNAVQRDAPLEYDDSVQRLQVLENIMENNTQWLMKLENYIQDNMKKEMVEIQQNAVQNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VSNAVQRDAPLEYDDSVQRLQVLENIMENNTQWLMK------------------------
70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 TAVMIEIGTNLLNQTAEQTRKLTDVEAQVLNQTTRLELQLLEHSLSTNKLEKQILDQTSE
::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ----------------------------VLNQTTRLELQLLEHSLSTNKLEKQILDQTSE
100 110 120
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 INKLQDKNSFLEKKVLAMEDKHIIQLQSIKEEKDQLQVLVSKQNSIIEELEKKIVTATVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 INKLQDKNSFLEKKVLAMEDKHIIQLQSIKEEKDQLQVLVSKQNSIIEELEKKIVTATVN
130 140 150 160 170 180
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 NSVLQKQQHDLMETVNNLLTMMSTSNSAKDPTVAKEEQISFRDCAEVFKSGHTTNGIYTL
::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NSVLQKQQHDLMETVNNLLTMMSTSNS-KDPTVAKEEQISFRDCAEVFKSGHTTNGIYTL
190 200 210 220 230 240
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 TFPNSTEEIKAYCDMEAGGGGWTIIQRREDGSVDFQRTWKEYKVGFGNPSGEYWLGNEFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TFPNSTEEIKAYCDMEAGGGGWTIIQRREDGSVDFQRTWKEYKVGFGNPSGEYWLGNEFV
250 260 270 280 290 300
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 SQLTNQQRYVLKIHLKDWEGNEAYSLYEHFYLSSEELNYRIHLKGLTGTAGKISSISQPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SQLTNQQRYVLKIHLKDWEGNEAYSLYEHFYLSSEELNYRIHLKGLTGTAGKISSISQPG
310 320 330 340 350 360
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 NDFSTKDGDNDKCICKCSQMLTGGWWFDACGPSNLNGMYYPQRQNTNKFNGIKWYYWKGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NDFSTKDGDNDKCICKCSQMLTGGWWFDACGPSNLNGMYYPQRQNTNKFNGIKWYYWKGS
370 380 390 400 410 420
490
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480 490
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NP_001 KGPSYSLRSTTMMIRPLDF
480 490
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XP_011 SGASASGVYTIQVSNATKPRKVFCDLQSSGGRWTLIQRRENGTVNFQRNWKDYKQGFGDP
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NP_001 ENQLLLQRQKLQQLQGQNSALEKRLQALETKQQEELASILSKKAKLLNTLSRQSAALTNI
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pF1KE3 EKKIVTATVNNSVLQKQQHDLMETVNNLLTMMSTSNSAKDPT-VAKEEQISFRDCAEVFK
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NP_001 ERGLRGVRHNSSLLQDQQHSLRQLLVLLRHLVQERANASAPAFIMAGEQV-FQDCAEIQR
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pF1KE3 SGHTTNGIYTLTFPNSTEEIKAYCDMEAGGGGWTIIQRREDGSVDFQRTWKEYKVGFGNP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]