Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3202
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3202, 471 aa
1>>>pF1KE3202 471 - 471 aa - 471 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5948+/-0.00107; mu= 16.2332+/- 0.064
mean_var=68.1647+/-13.564, 0's: 0 Z-trim(102.8): 23 B-trim: 3 in 1/51
Lambda= 0.155344
statistics sampled from 7099 (7112) to 7099 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.586), E-opt: 0.2 (0.218), width: 16
Scan time: 2.370
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14364.1 PFKFB1 gene_id:5207|Hs108|chrX ( 471) 3150 715.4 3.2e-206
CCDS65273.1 PFKFB1 gene_id:5207|Hs108|chrX ( 406) 2664 606.4 1.7e-173
CCDS2771.1 PFKFB4 gene_id:5210|Hs108|chr3 ( 469) 2398 546.9 1.7e-155
CCDS82770.1 PFKFB4 gene_id:5210|Hs108|chr3 ( 462) 2338 533.4 1.9e-151
CCDS81439.1 PFKFB3 gene_id:5209|Hs108|chr10 ( 514) 2226 508.3 7.5e-144
CCDS7078.1 PFKFB3 gene_id:5209|Hs108|chr10 ( 520) 2226 508.3 7.6e-144
CCDS44353.1 PFKFB3 gene_id:5209|Hs108|chr10 ( 500) 2165 494.6 9.6e-140
CCDS60479.1 PFKFB3 gene_id:5209|Hs108|chr10 ( 534) 2164 494.4 1.2e-139
CCDS31003.1 PFKFB2 gene_id:5208|Hs108|chr1 ( 471) 2159 493.3 2.3e-139
CCDS31004.1 PFKFB2 gene_id:5208|Hs108|chr1 ( 505) 2156 492.6 3.9e-139
CCDS82769.1 PFKFB4 gene_id:5210|Hs108|chr3 ( 434) 1547 356.1 4.2e-98
>>CCDS14364.1 PFKFB1 gene_id:5207|Hs108|chrX (471 aa)
initn: 3150 init1: 3150 opt: 3150 Z-score: 3815.8 bits: 715.4 E(32554): 3.2e-206
Smith-Waterman score: 3150; 100.0% identity (100.0% similar) in 471 aa overlap (1-471:1-471)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSPEMGELTQTRLQKIWIPHSSGSSRLQRRRGSSIPQFTNSPTMVIMVGLPARGKTYIST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MSPEMGELTQTRLQKIWIPHSSGSSRLQRRRGSSIPQFTNSPTMVIMVGLPARGKTYIST
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 KLTRYLNWIGTPTKVFNLGQYRREAVSYKNYEFFLPDNMEALQIRKQCALAALKDVHNYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KLTRYLNWIGTPTKVFNLGQYRREAVSYKNYEFFLPDNMEALQIRKQCALAALKDVHNYL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 SHEEGHVAVFDATNTTRERRSLILQFAKEHGYKVFFIESICNDPGIIAENIRQVKLGSPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SHEEGHVAVFDATNTTRERRSLILQFAKEHGYKVFFIESICNDPGIIAENIRQVKLGSPD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 YIDCDREKVLEDFLKRIECYEVNYQPLDEELDSHLSYIKIFDVGTRYMVNRVQDHIQSRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 YIDCDREKVLEDFLKRIECYEVNYQPLDEELDSHLSYIKIFDVGTRYMVNRVQDHIQSRT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 VYYLMNIHVTPRSIYLCRHGESELNIRGRIGGDSGLSVRGKQYAYALANFIQSQGISSLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VYYLMNIHVTPRSIYLCRHGESELNIRGRIGGDSGLSVRGKQYAYALANFIQSQGISSLK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 VWTSHMKRTIQTAEALGVPYEQWKALNEIDAGVCEEMTYEEIQEHYPEEFALRDQDKYRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VWTSHMKRTIQTAEALGVPYEQWKALNEIDAGVCEEMTYEEIQEHYPEEFALRDQDKYRY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 RYPKGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAYFLDKSSDELPYLKCPLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RYPKGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAYFLDKSSDELPYLKCPLH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE3 TVLKLTPVAYGCKVESIYLNVEAVNTHREKPENVDITREPEEALDTVPAHY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TVLKLTPVAYGCKVESIYLNVEAVNTHREKPENVDITREPEEALDTVPAHY
430 440 450 460 470
>>CCDS65273.1 PFKFB1 gene_id:5207|Hs108|chrX (406 aa)
initn: 2664 init1: 2664 opt: 2664 Z-score: 3228.2 bits: 606.4 E(32554): 1.7e-173
Smith-Waterman score: 2664; 100.0% identity (100.0% similar) in 398 aa overlap (74-471:9-406)
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 MVIMVGLPARGKTYISTKLTRYLNWIGTPTKVFNLGQYRREAVSYKNYEFFLPDNMEALQ
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 MEEKTSRIKVFNLGQYRREAVSYKNYEFFLPDNMEALQ
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 IRKQCALAALKDVHNYLSHEEGHVAVFDATNTTRERRSLILQFAKEHGYKVFFIESICND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 IRKQCALAALKDVHNYLSHEEGHVAVFDATNTTRERRSLILQFAKEHGYKVFFIESICND
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 PGIIAENIRQVKLGSPDYIDCDREKVLEDFLKRIECYEVNYQPLDEELDSHLSYIKIFDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 PGIIAENIRQVKLGSPDYIDCDREKVLEDFLKRIECYEVNYQPLDEELDSHLSYIKIFDV
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 GTRYMVNRVQDHIQSRTVYYLMNIHVTPRSIYLCRHGESELNIRGRIGGDSGLSVRGKQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 GTRYMVNRVQDHIQSRTVYYLMNIHVTPRSIYLCRHGESELNIRGRIGGDSGLSVRGKQY
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 AYALANFIQSQGISSLKVWTSHMKRTIQTAEALGVPYEQWKALNEIDAGVCEEMTYEEIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 AYALANFIQSQGISSLKVWTSHMKRTIQTAEALGVPYEQWKALNEIDAGVCEEMTYEEIQ
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 EHYPEEFALRDQDKYRYRYPKGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 EHYPEEFALRDQDKYRYRYPKGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAY
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 FLDKSSDELPYLKCPLHTVLKLTPVAYGCKVESIYLNVEAVNTHREKPENVDITREPEEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 FLDKSSDELPYLKCPLHTVLKLTPVAYGCKVESIYLNVEAVNTHREKPENVDITREPEEA
340 350 360 370 380 390
470
pF1KE3 LDTVPAHY
::::::::
CCDS65 LDTVPAHY
400
>>CCDS2771.1 PFKFB4 gene_id:5210|Hs108|chr3 (469 aa)
initn: 2396 init1: 2075 opt: 2398 Z-score: 2905.0 bits: 546.9 E(32554): 1.7e-155
Smith-Waterman score: 2398; 75.4% identity (90.9% similar) in 471 aa overlap (2-470:3-468)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MSPEMGELTQTRLQKIWIPHSSGSSRLQR-RRGSSIPQFTNSPTMVIMVGLPARGKTYI
::. ::::. :.:::.:.:.: :. .:: . :: ::...::::::::::::
CCDS27 MASPR--ELTQNPLKKIWMPYSNGRPALHACQRGVCM---TNCPTLIVMVGLPARGKTYI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 STKLTRYLNWIGTPTKVFNLGQYRREAV-SYKNYEFFLPDNMEALQIRKQCALAALKDVH
: ::::::::::.::. ::.:::::..: .::..::::::: :.:.::::::::::.::.
CCDS27 SKKLTRYLNWIGVPTREFNVGQYRRDVVKTYKSFEFFLPDNEEGLKIRKQCALAALRDVR
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 NYLSHEEGHVAVFDATNTTRERRSLILQFAKEHGYKVFFIESICNDPGIIAENIRQVKLG
.::.: ::::::::::::::::. :..:....:::.::.:::: :: .:: :: :::::
CCDS27 RFLSEEGGHVAVFDATNTTRERRATIFNFGEQNGYKTFFVESICVDPEVIAANIVQVKLG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 SPDYIDCDREKVLEDFLKRIECYEVNYQPLDEELDSHLSYIKIFDVGTRYMVNRVQDHIQ
::::.. : ... :::..:::::: .:. :::.:: ::::::.::: :.:::: ::::
CCDS27 SPDYVNRDSDEATEDFMRRIECYENSYESLDEDLDRDLSYIKIMDVGQSYVVNRVADHIQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 SRTVYYLMNIHVTPRSIYLCRHGESELNIRGRIGGDSGLSVRGKQYAYALANFIQSQGIS
:: :::::::::::::::::::::::::..:::::: ::: ::...: .::.::..:.:.
CCDS27 SRIVYYLMNIHVTPRSIYLCRHGESELNLKGRIGGDPGLSPRGREFAKSLAQFISDQNIK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 SLKVWTSHMKRTIQTAEALGVPYEQWKALNEIDAGVCEEMTYEEIQEHYPEEFALRDQDK
.::::::.:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::..:: :::::::::
CCDS27 DLKVWTSQMKRTIQTAEALGVPYEQWKVLNEIDAGVCEEMTYEEIQDNYPLEFALRDQDK
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 YRYRYPKGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAYFLDKSSDELPYLKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::....::::::
CCDS27 YRYRYPKGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAYFLDKAAEQLPYLKC
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 PLHTVLKLTPVAYGCKVESIYLNVEAVNTHREKPENVDITREPEEALDTVPAHY
::::::::::::::::::::.::: ::::::..:.::::.: ::::: :::::
CCDS27 PLHTVLKLTPVAYGCKVESIFLNVAAVNTHRDRPQNVDISRPPEEALVTVPAHQ
420 430 440 450 460
>>CCDS82770.1 PFKFB4 gene_id:5210|Hs108|chr3 (462 aa)
initn: 1510 init1: 1189 opt: 2338 Z-score: 2832.4 bits: 533.4 E(32554): 1.9e-151
Smith-Waterman score: 2338; 74.1% identity (89.4% similar) in 471 aa overlap (2-470:3-461)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MSPEMGELTQTRLQKIWIPHSSGSSRLQR-RRGSSIPQFTNSPTMVIMVGLPARGKTYI
::. ::::. :.:::.:.:.: :. .:: . :: ::...::::::::::::
CCDS82 MASPR--ELTQNPLKKIWMPYSNGRPALHACQRGVCM---TNCPTLIVMVGLPARGKTYI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 STKLTRYLNWIGTPTKVFNLGQYRREAV-SYKNYEFFLPDNMEALQIRKQCALAALKDVH
: ::::::::::.::. ::.:::::..: .::..::::::: :.:.::::::::::.::.
CCDS82 SKKLTRYLNWIGVPTREFNVGQYRRDVVKTYKSFEFFLPDNEEGLKIRKQCALAALRDVR
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 NYLSHEEGHVAVFDATNTTRERRSLILQFAKEHGYKVFFIESICNDPGIIAENIRQVKLG
.::.: ::::::::::::::::. :..:....:::.::.:::: :: .:: :: :::::
CCDS82 RFLSEEGGHVAVFDATNTTRERRATIFNFGEQNGYKTFFVESICVDPEVIAANIVQVKLG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 SPDYIDCDREKVLEDFLKRIECYEVNYQPLDEELDSHLSYIKIFDVGTRYMVNRVQDHIQ
::::.. : ... :::..:::::: .:. :::.:: ::::::.::: :.:::: ::::
CCDS82 SPDYVNRDSDEATEDFMRRIECYENSYESLDEDLDRDLSYIKIMDVGQSYVVNRVADHIQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 SRTVYYLMNIHVTPRSIYLCRHGESELNIRGRIGGDSGLSVRGKQYAYALANFIQSQGIS
:: :::::::::::::::::::::::::..:::::: ::: ::...: .::.::..:.:.
CCDS82 SRIVYYLMNIHVTPRSIYLCRHGESELNLKGRIGGDPGLSPRGREFAKSLAQFISDQNIK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 SLKVWTSHMKRTIQTAEALGVPYEQWKALNEIDAGVCEEMTYEEIQEHYPEEFALRDQDK
.::::::.::::::::::::::::::: ::::::::::::..:: :::::::::
CCDS82 DLKVWTSQMKRTIQTAEALGVPYEQWK-------GVCEEMTYEEIQDNYPLEFALRDQDK
300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 YRYRYPKGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAYFLDKSSDELPYLKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::....::::::
CCDS82 YRYRYPKGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAYFLDKAAEQLPYLKC
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 PLHTVLKLTPVAYGCKVESIYLNVEAVNTHREKPENVDITREPEEALDTVPAHY
::::::::::::::::::::.::: ::::::..:.::::.: ::::: :::::
CCDS82 PLHTVLKLTPVAYGCKVESIFLNVAAVNTHRDRPQNVDISRPPEEALVTVPAHQ
410 420 430 440 450 460
>>CCDS81439.1 PFKFB3 gene_id:5209|Hs108|chr10 (514 aa)
initn: 2203 init1: 1315 opt: 2226 Z-score: 2696.1 bits: 508.3 E(32554): 7.5e-144
Smith-Waterman score: 2226; 70.6% identity (89.5% similar) in 456 aa overlap (7-460:4-455)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSPEMGELTQTRLQKIWIPHSSGSSRLQRRRGSSIPQFTNSPTMVIMVGLPARGKTYIST
::::.:.::::.: . : : : : :..:::::...:::::::::::::
CCDS81 MPLELTQSRVQKIWVPVDHRPS-LPRSCG---PKLTNSPTVIVMVGLPARGKTYISK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE3 KLTRYLNWIGTPTKVFNLGQYRREAVS-YKNYEFFLPDNMEALQIRKQCALAALKDVHNY
::::::::::.::::::.:.::::::. :..:.:: ::: ::...:::::::::.::..:
CCDS81 KLTRYLNWIGVPTKVFNVGEYRREAVKQYSSYNFFRPDNEEAMKVRKQCALAALRDVKSY
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 LSHEEGHVAVFDATNTTRERRSLILQFAKEHGYKVFFIESICNDPGIIAENIRQVKLGSP
:..: :..::::::::::::: .::.::::. .:.:::::.:.:: ..: :: .::..::
CCDS81 LAKEGGQIAVFDATNTTRERRHMILHFAKENDFKAFFIESVCDDPTVVASNIMEVKISSP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 DYIDCDREKVLEDFLKRIECYEVNYQPLD-EELDSHLSYIKIFDVGTRYMVNRVQDHIQS
:: ::. ....::.::: :::..::::: .. : :: ::..::: :..::::::::::
CCDS81 DYKDCNSAEAMDDFMKRISCYEASYQPLDPDKCDRDLSLIKVIDVGRRFLVNRVQDHIQS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 RTVYYLMNIHVTPRSIYLCRHGESELNIRGRIGGDSGLSVRGKQYAYALANFIQSQGISS
: ::::::::: ::.::::::::.: :..:::::::::: :::..: ::..:.. :....
CCDS81 RIVYYLMNIHVQPRTIYLCRHGENEHNLQGRIGGDSGLSSRGKKFASALSKFVEEQNLKD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 LKVWTSHMKRTIQTAEALGVPYEQWKALNEIDAGVCEEMTYEEIQEHYPEEFALRDQDKY
:.::::..: :::::::: .::::::::::::::::::.:::::.. ::::.:::.::::
CCDS81 LRVWTSQLKSTIQTAEALRLPYEQWKALNEIDAGVCEELTYEEIRDTYPEEYALREQDKY
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 RYRYPKGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAYFLDKSSDELPYLKCP
:::: ::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::..:.::::::
CCDS81 YYRYPTGESYQDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVLRCLLAYFLDKSAEEMPYLKCP
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 LHTVLKLTPVAYGCKVESIYLNVEAVNTHREKPENVDITREPEEALDTVPAHY
::::::::::::::.:::::::::.: ::::. :.. .:
CCDS81 LHTVLKLTPVAYGCRVESIYLNVESVCTHRERSEDAKKGPNPLMRRNSVTPLASPEPTKK
420 430 440 450 460 470
CCDS81 PRINSFEEHVASTSAALPSCLPPEVPTQLPGQPLLGQACLT
480 490 500 510
>>CCDS7078.1 PFKFB3 gene_id:5209|Hs108|chr10 (520 aa)
initn: 2203 init1: 1315 opt: 2226 Z-score: 2696.0 bits: 508.3 E(32554): 7.6e-144
Smith-Waterman score: 2226; 70.6% identity (89.5% similar) in 456 aa overlap (7-460:4-455)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSPEMGELTQTRLQKIWIPHSSGSSRLQRRRGSSIPQFTNSPTMVIMVGLPARGKTYIST
::::.:.::::.: . : : : : :..:::::...:::::::::::::
CCDS70 MPLELTQSRVQKIWVPVDHRPS-LPRSCG---PKLTNSPTVIVMVGLPARGKTYISK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE3 KLTRYLNWIGTPTKVFNLGQYRREAVS-YKNYEFFLPDNMEALQIRKQCALAALKDVHNY
::::::::::.::::::.:.::::::. :..:.:: ::: ::...:::::::::.::..:
CCDS70 KLTRYLNWIGVPTKVFNVGEYRREAVKQYSSYNFFRPDNEEAMKVRKQCALAALRDVKSY
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 LSHEEGHVAVFDATNTTRERRSLILQFAKEHGYKVFFIESICNDPGIIAENIRQVKLGSP
:..: :..::::::::::::: .::.::::. .:.:::::.:.:: ..: :: .::..::
CCDS70 LAKEGGQIAVFDATNTTRERRHMILHFAKENDFKAFFIESVCDDPTVVASNIMEVKISSP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 DYIDCDREKVLEDFLKRIECYEVNYQPLD-EELDSHLSYIKIFDVGTRYMVNRVQDHIQS
:: ::. ....::.::: :::..::::: .. : :: ::..::: :..::::::::::
CCDS70 DYKDCNSAEAMDDFMKRISCYEASYQPLDPDKCDRDLSLIKVIDVGRRFLVNRVQDHIQS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 RTVYYLMNIHVTPRSIYLCRHGESELNIRGRIGGDSGLSVRGKQYAYALANFIQSQGISS
: ::::::::: ::.::::::::.: :..:::::::::: :::..: ::..:.. :....
CCDS70 RIVYYLMNIHVQPRTIYLCRHGENEHNLQGRIGGDSGLSSRGKKFASALSKFVEEQNLKD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 LKVWTSHMKRTIQTAEALGVPYEQWKALNEIDAGVCEEMTYEEIQEHYPEEFALRDQDKY
:.::::..: :::::::: .::::::::::::::::::.:::::.. ::::.:::.::::
CCDS70 LRVWTSQLKSTIQTAEALRLPYEQWKALNEIDAGVCEELTYEEIRDTYPEEYALREQDKY
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 RYRYPKGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAYFLDKSSDELPYLKCP
:::: ::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::..:.::::::
CCDS70 YYRYPTGESYQDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVLRCLLAYFLDKSAEEMPYLKCP
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 LHTVLKLTPVAYGCKVESIYLNVEAVNTHREKPENVDITREPEEALDTVPAHY
::::::::::::::.:::::::::.: ::::. :.. .:
CCDS70 LHTVLKLTPVAYGCRVESIYLNVESVCTHRERSEDAKKGPNPLMRRNSVTPLASPEPTKK
420 430 440 450 460 470
CCDS70 PRINSFEEHVASTSAALPSCLPPEVPTQLPGQNMKGSRSSADSSRKH
480 490 500 510 520
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Smith-Waterman score: 2165; 71.5% identity (90.7% similar) in 432 aa overlap (31-460:4-435)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSPEMGELTQTRLQKIWIPHSSGSSRLQRRRGSSIPQFTNSPTMVIMVGLPARGKTYIST
: . :..:::::...:::::::::::::
CCDS44 MPFRKACGPKLTNSPTVIVMVGLPARGKTYISK
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KE3 KLTRYLNWIGTPTKVFNLGQYRREAVS-YKNYEFFLPDNMEALQIRKQCALAALKDVHNY
::::::::::.::::::.:.::::::. :..:.:: ::: ::...:::::::::.::..:
CCDS44 KLTRYLNWIGVPTKVFNVGEYRREAVKQYSSYNFFRPDNEEAMKVRKQCALAALRDVKSY
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 LSHEEGHVAVFDATNTTRERRSLILQFAKEHGYKVFFIESICNDPGIIAENIRQVKLGSP
:..: :..::::::::::::: .::.::::. .:.:::::.:.:: ..: :: .::..::
CCDS44 LAKEGGQIAVFDATNTTRERRHMILHFAKENDFKAFFIESVCDDPTVVASNIMEVKISSP
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 DYIDCDREKVLEDFLKRIECYEVNYQPLD-EELDSHLSYIKIFDVGTRYMVNRVQDHIQS
:: ::. ....::.::: :::..::::: .. : :: ::..::: :..::::::::::
CCDS44 DYKDCNSAEAMDDFMKRISCYEASYQPLDPDKCDRDLSLIKVIDVGRRFLVNRVQDHIQS
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 RTVYYLMNIHVTPRSIYLCRHGESELNIRGRIGGDSGLSVRGKQYAYALANFIQSQGISS
: ::::::::: ::.::::::::.: :..:::::::::: :::..: ::..:.. :....
CCDS44 RIVYYLMNIHVQPRTIYLCRHGENEHNLQGRIGGDSGLSSRGKKFASALSKFVEEQNLKD
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 LKVWTSHMKRTIQTAEALGVPYEQWKALNEIDAGVCEEMTYEEIQEHYPEEFALRDQDKY
:.::::..: :::::::: .::::::::::::::::::.:::::.. ::::.:::.::::
CCDS44 LRVWTSQLKSTIQTAEALRLPYEQWKALNEIDAGVCEELTYEEIRDTYPEEYALREQDKY
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 RYRYPKGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAYFLDKSSDELPYLKCP
:::: ::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::..:.::::::
CCDS44 YYRYPTGESYQDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVLRCLLAYFLDKSAEEMPYLKCP
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 LHTVLKLTPVAYGCKVESIYLNVEAVNTHREKPENVDITREPEEALDTVPAHY
::::::::::::::.:::::::::.: ::::. :.. .:
CCDS44 LHTVLKLTPVAYGCRVESIYLNVESVCTHRERSEDAKKGPNPLMRRNSVTPLASPEPTKK
400 410 420 430 440 450
CCDS44 PRINSFEEHVASTSAALPSCLPPEVPTQLPGQNMKGSRSSADSSRKH
460 470 480 490 500
>>CCDS60479.1 PFKFB3 gene_id:5209|Hs108|chr10 (534 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE3 GELTQTRLQKIWIPHSSGSSRLQRRRGSSIPQFTNSPTMVIMVGLPARGKTYISTKLTRY
:..:::::...::::::::::::: :::::
CCDS60 QAGALPLLCQLDTFSPKATVFGVSINPACGPKLTNSPTVIVMVGLPARGKTYISKKLTRY
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 LNWIGTPTKVFNLGQYRREAVS-YKNYEFFLPDNMEALQIRKQCALAALKDVHNYLSHEE
:::::.::::::.:.::::::. :..:.:: ::: ::...:::::::::.::..::..:
CCDS60 LNWIGVPTKVFNVGEYRREAVKQYSSYNFFRPDNEEAMKVRKQCALAALRDVKSYLAKEG
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 GHVAVFDATNTTRERRSLILQFAKEHGYKVFFIESICNDPGIIAENIRQVKLGSPDYIDC
:..::::::::::::: .::.::::. .:.:::::.:.:: ..: :: .::..:::: ::
CCDS60 GQIAVFDATNTTRERRHMILHFAKENDFKAFFIESVCDDPTVVASNIMEVKISSPDYKDC
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 DREKVLEDFLKRIECYEVNYQPLD-EELDSHLSYIKIFDVGTRYMVNRVQDHIQSRTVYY
. ....::.::: :::..::::: .. : :: ::..::: :..::::::::::: :::
CCDS60 NSAEAMDDFMKRISCYEASYQPLDPDKCDRDLSLIKVIDVGRRFLVNRVQDHIQSRIVYY
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 LMNIHVTPRSIYLCRHGESELNIRGRIGGDSGLSVRGKQYAYALANFIQSQGISSLKVWT
:::::: ::.::::::::.: :..:::::::::: :::..: ::..:.. :....:.:::
CCDS60 LMNIHVQPRTIYLCRHGENEHNLQGRIGGDSGLSSRGKKFASALSKFVEEQNLKDLRVWT
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 SHMKRTIQTAEALGVPYEQWKALNEIDAGVCEEMTYEEIQEHYPEEFALRDQDKYRYRYP
:..: :::::::: .::::::::::::::::::.:::::.. ::::.:::.:::: ::::
CCDS60 SQLKSTIQTAEALRLPYEQWKALNEIDAGVCEELTYEEIRDTYPEEYALREQDKYYYRYP
320 330 340 350 360 370
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 KGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAYFLDKSSDELPYLKCPLHTVL
::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::..:.:::::::::::
CCDS60 TGESYQDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVLRCLLAYFLDKSAEEMPYLKCPLHTVL
380 390 400 410 420 430
430 440 450 460 470
pF1KE3 KLTPVAYGCKVESIYLNVEAVNTHREKPENVDITREPEEALDTVPAHY
:::::::::.:::::::::.: ::::. :.. .:
CCDS60 KLTPVAYGCRVESIYLNVESVCTHRERSEDAKKGPNPLMRRNSVTPLASPEPTKKPRINS
440 450 460 470 480 490
CCDS60 FEEHVASTSAALPSCLPPEVPTQLPGQNMKGSRSSADSSRKH
500 510 520 530
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10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSPEMGELTQTRLQKIWIPHSSGSSRLQRRRGSSIPQFTNSPTMVIMVGLPARGKTYIST
:..... : .:::::...:.:::::::::.:
CCDS31 MSGASSSEQNNNSYETKTPNLRMSEKKCSWASYMTNSPTLIVMIGLPARGKTYVSK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE3 KLTRYLNWIGTPTKVFNLGQYRREAV-SYKNYEFFLPDNMEALQIRKQCALAALKDVHNY
::::::::::.:::::::: :::::: :::.:.:: :: ::..:::::::.::.::. :
CCDS31 KLTRYLNWIGVPTKVFNLGVYRREAVKSYKSYDFFRHDNEEAMKIRKQCALVALEDVKAY
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 LSHEEGHVAVFDATNTTRERRSLILQFAKEHGYKVFFIESICNDPGIIAENIRQVKLGSP
:..:.:..:::::::::::::..::.::.....::::.::.:.:: .:: :: .::..::
CCDS31 LTEENGQIAVFDATNTTRERRDMILNFAEQNSFKVFFVESVCDDPDVIAANILEVKVSSP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 DYIDCDREKVLEDFLKRIECYEVNYQPLD-EELDSHLSYIKIFDVGTRYMVNRVQDHIQS
:: . .::.:.::::::::::.:.:.::: .. :. ::.::...:: :..::::::.:::
CCDS31 DYPERNRENVMEDFLKRIECYKVTYRPLDPDNYDKDLSFIKVINVGQRFLVNRVQDYIQS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 RTVYYLMNIHVTPRSIYLCRHGESELNIRGRIGGDSGLSVRGKQYAYALANFIQSQGISS
. ::::::::: ::.::::::::::.:. :.:::::::::::::.: :: .:.. : :..
CCDS31 KIVYYLMNIHVQPRTIYLCRHGESEFNLLGKIGGDSGLSVRGKQFAQALRKFLEEQEITD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 LKVWTSHMKRTIQTAEALGVPYEQWKALNEIDAGVCEEMTYEEIQEHYPEEFALRDQDKY
::::::..::::::::.::::::::: :::::::::::::: ::...::::::::::.::
CCDS31 LKVWTSQLKRTIQTAESLGVPYEQWKILNEIDAGVCEEMTYAEIEKRYPEEFALRDQEKY
300 310 320 330 340 350
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pF1KE3 RYRYPKGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAYFLDKSSDELPYLKCP
:::: ::::.:::::::::::::::: ::::: :::::::::::::::..::::::.::
CCDS31 LYRYPGGESYQDLVQRLEPVIMELERQGNVLVISHQAVMRCLLAYFLDKGADELPYLRCP
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 LHTVLKLTPVAYGCKVESIYLNVEAVNTHREKPENVDIT----REPEEALDTVPAHY
:::..::::::::::::.: ::::::::::.:: .. : :.: : .:
CCDS31 LHTIFKLTPVAYGCKVETIKLNVEAVNTHRDKPTAAETTLAVRRRPSAASLMLPC
420 430 440 450 460 470
>>CCDS31004.1 PFKFB2 gene_id:5208|Hs108|chr1 (505 aa)
initn: 2134 init1: 1315 opt: 2156 Z-score: 2611.4 bits: 492.6 E(32554): 3.9e-139
Smith-Waterman score: 2156; 72.6% identity (91.6% similar) in 430 aa overlap (26-453:22-451)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSPEMGELTQTRLQKIWIPHSSGSSRLQRRRGSSIPQFTNSPTMVIMVGLPARGKTYIST
:..... : .:::::...:.:::::::::.:
CCDS31 MSGASSSEQNNNSYETKTPNLRMSEKKCSWASYMTNSPTLIVMIGLPARGKTYVSK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE3 KLTRYLNWIGTPTKVFNLGQYRREAV-SYKNYEFFLPDNMEALQIRKQCALAALKDVHNY
::::::::::.:::::::: :::::: :::.:.:: :: ::..:::::::.::.::. :
CCDS31 KLTRYLNWIGVPTKVFNLGVYRREAVKSYKSYDFFRHDNEEAMKIRKQCALVALEDVKAY
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 LSHEEGHVAVFDATNTTRERRSLILQFAKEHGYKVFFIESICNDPGIIAENIRQVKLGSP
:..:.:..:::::::::::::..::.::.....::::.::.:.:: .:: :: .::..::
CCDS31 LTEENGQIAVFDATNTTRERRDMILNFAEQNSFKVFFVESVCDDPDVIAANILEVKVSSP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 DYIDCDREKVLEDFLKRIECYEVNYQPLD-EELDSHLSYIKIFDVGTRYMVNRVQDHIQS
:: . .::.:.::::::::::.:.:.::: .. :. ::.::...:: :..::::::.:::
CCDS31 DYPERNRENVMEDFLKRIECYKVTYRPLDPDNYDKDLSFIKVINVGQRFLVNRVQDYIQS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 RTVYYLMNIHVTPRSIYLCRHGESELNIRGRIGGDSGLSVRGKQYAYALANFIQSQGISS
. ::::::::: ::.::::::::::.:. :.:::::::::::::.: :: .:.. : :..
CCDS31 KIVYYLMNIHVQPRTIYLCRHGESEFNLLGKIGGDSGLSVRGKQFAQALRKFLEEQEITD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 LKVWTSHMKRTIQTAEALGVPYEQWKALNEIDAGVCEEMTYEEIQEHYPEEFALRDQDKY
::::::..::::::::.::::::::: :::::::::::::: ::...::::::::::.::
CCDS31 LKVWTSQLKRTIQTAESLGVPYEQWKILNEIDAGVCEEMTYAEIEKRYPEEFALRDQEKY
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 RYRYPKGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAYFLDKSSDELPYLKCP
:::: ::::.:::::::::::::::: ::::: :::::::::::::::..::::::.::
CCDS31 LYRYPGGESYQDLVQRLEPVIMELERQGNVLVISHQAVMRCLLAYFLDKGADELPYLRCP
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 LHTVLKLTPVAYGCKVESIYLNVEAVNTHREKPENVDITREPEEALDTVPAHY
:::..::::::::::::.: ::::::::::.:: :
CCDS31 LHTIFKLTPVAYGCKVETIKLNVEAVNTHRDKPTNNFPKNQTPVRMRRNSFTPLSSSNTI
420 430 440 450 460 470
CCDS31 RRPRNYSVGSRPLKPLSPLRAQDMQEGAD
480 490 500
471 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 17:32:50 2016 done: Mon Nov 7 17:32:50 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]