Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3187
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3187, 428 aa
1>>>pF1KE3187 428 - 428 aa - 428 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4895+/-0.000828; mu= 17.0023+/- 0.050
mean_var=92.1917+/-18.049, 0's: 0 Z-trim(109.8): 88 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.133576
statistics sampled from 11040 (11138) to 11040 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.708), E-opt: 0.2 (0.342), width: 16
Scan time: 2.770
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14521.1 RNF128 gene_id:79589|Hs108|chrX ( 428) 2913 571.5 5.3e-163
CCDS14520.1 RNF128 gene_id:79589|Hs108|chrX ( 402) 1910 378.2 7.8e-105
CCDS5784.1 RNF133 gene_id:168433|Hs108|chr7 ( 376) 991 201.1 1.5e-51
CCDS2051.1 RNF149 gene_id:284996|Hs108|chr2 ( 400) 874 178.6 9.7e-45
CCDS34065.1 RNF150 gene_id:57484|Hs108|chr4 ( 438) 867 177.3 2.7e-44
CCDS64340.1 RNF130 gene_id:55819|Hs108|chr5 ( 384) 837 171.4 1.3e-42
CCDS4451.1 RNF130 gene_id:55819|Hs108|chr5 ( 419) 837 171.5 1.4e-42
CCDS47692.1 RNF148 gene_id:378925|Hs108|chr7 ( 305) 830 170.0 2.8e-42
CCDS11607.1 RNF43 gene_id:54894|Hs108|chr17 ( 783) 329 73.8 6.6e-13
CCDS82172.1 RNF43 gene_id:54894|Hs108|chr17 ( 656) 298 67.8 3.6e-11
>>CCDS14521.1 RNF128 gene_id:79589|Hs108|chrX (428 aa)
initn: 2913 init1: 2913 opt: 2913 Z-score: 3039.9 bits: 571.5 E(32554): 5.3e-163
Smith-Waterman score: 2913; 100.0% identity (100.0% similar) in 428 aa overlap (1-428:1-428)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGPPPGAGVSCRGGCGFSRLLAWCFLLALSPQAPGSRGAEAVWTAYLNVSWRVPHTGVNR
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CCDS14 MGPPPGAGVSCRGGCGFSRLLAWCFLLALSPQAPGSRGAEAVWTAYLNVSWRVPHTGVNR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 TVWELSEEGVYGQDSPLEPVAGVLVPPDGPGALNACNPHTNFTVPTVWGSTVQVSWLALI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TVWELSEEGVYGQDSPLEPVAGVLVPPDGPGALNACNPHTNFTVPTVWGSTVQVSWLALI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 QRGGGCTFADKIHLAYERGASGAVIFNFPGTRNEVIPMSHPGAVDIVAIMIGNLKGTKIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QRGGGCTFADKIHLAYERGASGAVIFNFPGTRNEVIPMSHPGAVDIVAIMIGNLKGTKIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 QSIQRGIQVTMVIEVGKKHGPWVNHYSIFFVSVSFFIITAATVGYFIFYSARRLRNARAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QSIQRGIQVTMVIEVGKKHGPWVNHYSIFFVSVSFFIITAATVGYFIFYSARRLRNARAQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 SRKQRQLKADAKKAIGRLQLRTLKQGDKEIGPDGDSCAVCIELYKPNDLVRILTCNHIFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SRKQRQLKADAKKAIGRLQLRTLKQGDKEIGPDGDSCAVCIELYKPNDLVRILTCNHIFH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 KTCVDPWLLEHRTCPMCKCDILKALGIEVDVEDGSVSLQVPVSNEISNSASSHEEDNRSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KTCVDPWLLEHRTCPMCKCDILKALGIEVDVEDGSVSLQVPVSNEISNSASSHEEDNRSE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 TASSGYASVQGTDEPPLEEHVQSTNESLQLVNHEANSVAVDVIPHVDNPTFEEDETPNQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TASSGYASVQGTDEPPLEEHVQSTNESLQLVNHEANSVAVDVIPHVDNPTFEEDETPNQE
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 TAVREIKS
::::::::
CCDS14 TAVREIKS
>>CCDS14520.1 RNF128 gene_id:79589|Hs108|chrX (402 aa)
initn: 1903 init1: 1866 opt: 1910 Z-score: 1995.6 bits: 378.2 E(32554): 7.8e-105
Smith-Waterman score: 1966; 80.5% identity (89.6% similar) in 385 aa overlap (44-428:29-402)
20 30 40 50 60 70
pF1KE3 GCGFSRLLAWCFLLALSPQAPGSRGAEAVWTAYLNVSWRVPHTGVNRTVWELSEEGVYGQ
.::..:.. . : :. : : ::::
CCDS14 MNQENRSSFFWLLVIFTFLLKITASFSMSAYVTVTYY--NETSNYTAIETCECGVYGL
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KE3 DSPLEPVAGVLVPPDGPGALNACNPHTNFTVPTVWGSTVQVSWLALIQRGGGCTFADKIH
::. . ::. : . . .::. .:.: :... :.:::.::. :::..::.
CCDS14 ASPVANAMGVVGIPKN-NNYQACDHNTEF-------SNTKKPWIALIERGN-CTFSEKIQ
60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KE3 LAYERGASGAVIFNFPGTRNEVIPMSHPGAVDIVAIMIGNLKGTKILQSIQRGIQVTMVI
: .:.:...::.: : : :..: :.. ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TAGRRNADAVVIYNAPETGNQTIQMANFGAVDIVAIMIGNLKGTKILQSIQRGIQVTMVI
110 120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KE3 EVGKKHGPWVNHYSIFFVSVSFFIITAATVGYFIFYSARRLRNARAQSRKQRQLKADAKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EVGKKHGPWVNHYSIFFVSVSFFIITAATVGYFIFYSARRLRNARAQSRKQRQLKADAKK
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 AIGRLQLRTLKQGDKEIGPDGDSCAVCIELYKPNDLVRILTCNHIFHKTCVDPWLLEHRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AIGRLQLRTLKQGDKEIGPDGDSCAVCIELYKPNDLVRILTCNHIFHKTCVDPWLLEHRT
230 240 250 260 270 280
320 330 340 350 360 370
pF1KE3 CPMCKCDILKALGIEVDVEDGSVSLQVPVSNEISNSASSHEEDNRSETASSGYASVQGTD
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CCDS14 CPMCKCDILKALGIEVDVEDGSVSLQVPVSNEISNSASSHEEDNRSETASSGYASVQGTD
290 300 310 320 330 340
380 390 400 410 420
pF1KE3 EPPLEEHVQSTNESLQLVNHEANSVAVDVIPHVDNPTFEEDETPNQETAVREIKS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EPPLEEHVQSTNESLQLVNHEANSVAVDVIPHVDNPTFEEDETPNQETAVREIKS
350 360 370 380 390 400
>>CCDS5784.1 RNF133 gene_id:168433|Hs108|chr7 (376 aa)
initn: 1204 init1: 628 opt: 991 Z-score: 1038.9 bits: 201.1 E(32554): 1.5e-51
Smith-Waterman score: 1170; 50.1% identity (76.8% similar) in 367 aa overlap (39-404:34-374)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 VSCRGGCGFSRLLAWCFLLALSPQAPGSRGAEAVWTAYLNVSWRVPHTGVNRTVWELSEE
: .:: ::.:.:. :.: :... ::.:
CCDS57 LKVGTWRNNTASSWLMKFSVLWLVSQNCCRASVVWMAYMNISF---HVG-NHVLSELGET
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 GVYGQDSPLEPVAGVLVPPDGPGALNACNPHTNFTVPTVWGSTVQVSWLALIQRGGGCTF
::.:..: :. ::::.:::.: :::::.: :. : . .:::::.::: :::
CCDS57 GVFGRSSTLKRVAGVIVPPEGK-IQNACNPNTIFSR-----SKYSETWLALIERGG-CTF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 ADKIHLAYERGASGAVIFNFPGTRNEVIPMSHPGAVDIVAIMIGNLKGTKILQSIQRGIQ
..::..: :.::::..:.: ::: :.:.:: : . :.:..::::::::.:.. :..:.
CCDS57 TQKIKVATEKGASGVIIYNVPGTGNQVFPMFHQAFEDVVVVMIGNLKGTEIFHLIKKGVL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 VTMVIEVGKKHGPWVNHYSIFFVSVSFFIITAATVGYFIFYSARRLRNARAQSRKQRQLK
.: :.:::.:: :.::: ::: :.:.::..::::: .:: :: :.:. ..:
CCDS57 ITAVVEVGRKHIIWMNHYL-----VSFVIVTTATLAYFIFYHIHRLCLARIQNRRWQRLT
180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 ADAKKAIGRLQLRTLKQGDKEIGPDGDSCAVCIELYKPNDLVRILTCNHIFHKTCVDPWL
.: ....:.::::..:.::.::.:.::::..:.: :::::.::::::.:.:::.:.:::.
CCDS57 TDLQNTFGQLQLRVVKEGDEEINPNGDSCVICFERYKPNDIVRILTCKHFFHKNCIDPWI
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LEHRTCPMCKCDILKALGIEVDVEDGSVSLQVPVSNEISNSASSHEEDNRSETASSGYAS
: : :::.:::::::.:::.: ::.:. ::: .:::. .. : ::.. .:.. .: ..
CCDS57 LPHGTCPICKCDILKVLGIQVVVENGTEPLQVLMSNELPETLSPSEEETNNEVSPAGTSD
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 -VQGTDEPPLEEHVQSTNESLQLVNHEANSVAVDVIPHVDNPTFEEDETPNQETAVREIK
: ..: : : :...: .::. :: :
CCDS57 KVIHVEENP-----TSQNNDIQ-----PHSVVEDVHPSP
350 360 370
pF1KE3 S
>>CCDS2051.1 RNF149 gene_id:284996|Hs108|chr2 (400 aa)
initn: 561 init1: 561 opt: 874 Z-score: 916.7 bits: 178.6 E(32554): 9.7e-45
Smith-Waterman score: 874; 41.3% identity (68.8% similar) in 356 aa overlap (26-375:20-369)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MGPPPGAGVSCRGGCGFSRLLAWCFLLALSPQAPGSRGAEAVW-TAYLNVSWRVPHTGVN
::::. .::.:: : .: .:. . :.: :
CCDS20 MAWRRREASVGARGVLALALLALALCVPGARGRALEWFSAVVNIEYVDPQT--N
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 RTVWELSEEGVYGQDSPLEPVAGVLVPPDGPGA-LNACNPHTNFTVPTVWGSTVQVSWLA
::: .:: : .:..:: : . :.. : .::. :..: : : : :: : . . :.:
CCDS20 LTVWSVSESGRFGDSSPKEGAHGLVGVPWAPGGDLEGCAPDTRFFVPEPGGRGA-APWVA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 LIQRGGGCTFADKIHLAYERGASGAVIFNFPGTRNEVIPMSHPGAVDIVAIMIGNLKGTK
:. ::: ::: ::. .: .:.::..:..: : ..:::: :. .::.:::. :: .
CCDS20 LVARGG-CTFKDKVLVAARRNASAVVLYNEERYGNITLPMSHAGTGNIVVIMISYPKGRE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 ILQSIQRGIQVTMVIEVGKKH-GPWVNHYSIFFVSVSFFIITAATVGYFIFYSARRLRNA
::. .:.:: :::.: :: .: ... :. ::...:. . .....::: .:. .
CCDS20 ILELVQKGIPVTMTIGVGTRHVQEFISGQSVVFVAIAFITMMIISLAWLIFYYIQRFLYT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 RAQSRKQRQLKADAKKAIGRLQLRTLKQGDKEIGPDGDSCAVCIELYKPNDLVRILTCNH
.: .: . : ..::.::.: :.:.:.:.: : :...:::::: .: .:..::: :.:
CCDS20 GSQIGSQSHRK-ETKKVIGQLLLHTVKHGEKGIDVDAENCAVCIENFKVKDIIRILPCKH
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 IFHKTCVDPWLLEHRTCPMCKCDILKALGI---EVDVEDGSVSLQVPVSNEISNSASSHE
:::. :.:::::.:::::::: :..:::: ::.. . . : . .: . .
CCDS20 IFHRICIDPWLLDHRTCPMCKLDVIKALGYWGEPGDVQEMPAPESPPGRDPAANLSLALP
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 EDNRSETASSGYASVQGTDEPPLEEHVQSTNESLQLVNHEANSVAVDVIPHVDNPTFEED
.:. :. .: :: . .::
CCDS20 DDDGSDDSSPPSAS-PAESEPQCDPSFKGDAGENTALLEAGRSDSRHGGPIS
350 360 370 380 390 400
>>CCDS34065.1 RNF150 gene_id:57484|Hs108|chr4 (438 aa)
initn: 872 init1: 549 opt: 867 Z-score: 908.9 bits: 177.3 E(32554): 2.7e-44
Smith-Waterman score: 880; 41.6% identity (66.0% similar) in 394 aa overlap (20-389:18-402)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MGPPPGAGVSCRGGCGFSRLLAWCFLLALSPQAPGSRGAEAVW-TAYLNVSWRVPHT---
::..::. : . .. : : ::..:... :
CCDS34 MAMSLIQACCSLALSTWLLSFCFVHLLCLDFTVAEKEE--WYTAFVNITYAEPAPDPG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 ------GVNRTVWELSEEGVYGQDSPLEPVAGVLVPPDGPGALNACNPHTNFTVPTVWGS
: . : .: : ::. :: . . : .: .. ::.:.:.:..:: :.
CCDS34 AGAAGGGGAELHTEKTECGRYGEHSPKQDARGEVVMASSAHDRLACDPNTKFAAPTR-GK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 TVQVSWLALIQRGGGCTFADKIHLAYERGASGAVIFNFPGTRNEVIPMSHPGAVDIVAIM
.:.::: .:. ::. :::. :. ..::..:::: .. ::.: : : :. ::::::
CCDS34 ----NWIALIPKGN-CTYRDKIRNAFLQNASAVVIFNVGSNTNETITMPHAGVEDIVAIM
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE3 IGNLKGTKILQSIQRGIQVTMVIEVGKKH-GPWVNHYSIFFVSVSFFIITAATVGYFIFY
: . :: .:.. ..:.: ::: : .: .. .:.. :. :::.::... ......::
CCDS34 IPEPKGKEIVSLLERNITVTMYITIGTRNLQKYVSRTSVVFVSISFIVLMIISLAWLVFY
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 SARRLRNARAQSRKQRQLKADAKKAIGRLQLRTLKQGDKEIGPDGDSCAVCIELYKPNDL
.:.: : :..:.::.: :::::..::.::.:.:::: : :.:::::: :::::.
CCDS34 YIQRFRYANARDRNQRRLGDAAKKAISKLQIRTIKKGDKETESDFDNCAVCIEGYKPNDV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 VRILTCNHIFHKTCVDPWLLEHRTCPMCKCDILKALGIEVDVE-------DGSVSLQVPV
:::: : :.:::.:::::::.:::::::: .::::::: ... : :: :
CCDS34 VRILPCRHLFHKSCVDPWLLDHRTCPMCKMNILKALGIPPNADCMDDLPTDFEGSLGGPP
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390
pF1KE3 SNEISNSASSHEEDNRSETASSGYASV------QGTDEPPLEEHVQSTNESLQLVNHEAN
.:.:.. ::. .. : : . . .: : :: : : : :..: :
CCDS34 TNQITG-ASDTTVNESSVTLDPAVRTVGALQVVQDTDPIPQEGDVIFTTNSEQEPAVSSD
360 370 380 390 400
400 410 420
pF1KE3 SVAVDVIPHVDNPTFEEDETPNQETAVREIKS
CCDS34 SDISLIMAMEVGLSDVELSTDQDCEEVKS
410 420 430
>>CCDS64340.1 RNF130 gene_id:55819|Hs108|chr5 (384 aa)
initn: 760 init1: 507 opt: 837 Z-score: 878.4 bits: 171.4 E(32554): 1.3e-42
Smith-Waterman score: 837; 44.0% identity (68.7% similar) in 323 aa overlap (9-327:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGPPPGAGVSCRGGCGFSRLLAWCFLLALSPQAPGSRGAEAVWTAYLNVSWRVPHTGVNR
.:: : : .:: : .: : .. ... .:: .::. . : :.
CCDS64 MSCAGRAGPARLAALALLTCSLWPARADNASQEYYTALINVTVQEPGRGAPL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE3 TVWELSEEGVYGQDSPLEPVAG-VLVPPDGPGALN--ACNPHTNFTVPTVWGSTVQVSWL
: ..: :: ::: : : ::.: :. . .:.:.: : :: ... .:.
CCDS64 TF--RIDRGRYGLDSPKAEVRGQVLAPLPLHGVADHLGCDPQTRFFVPP----NIK-QWI
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 ALIQRGGGCTFADKIHLAYERGASGAVIFNFPGTRNEVIPMSHPGAVDIVAIMIGNLKGT
::.:::. ::: .:: : ..: ..::.: ...: . :.:::. ::.:.:: .:.:
CCDS64 ALLQRGN-CTFKEKISRAAFHNAVAVVIYN-NKSKEEPVTMTHPGTGDIIAVMITELRGK
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 KILQSIQRGIQVTMVIEVGKKHGPW-VNHYSIFFVSVSFFIITAATVGYFIFYSARRLRN
::. ....:.: :.: :: . : .. :. :::.::... . ...::: ...:
CCDS64 DILSYLEKNISVQMTIAVGTRMPPKNFSRGSLVFVSISFIVLMIISSAWLIFYFIQKIRY
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 ARAQSRKQRQLKADAKKAIGRLQLRTLKQGDKEIGPDGDSCAVCIELYKPNDLVRILTCN
. :..:.::.: :::::..: ::.:.:::: :: : :::::: :: ::.:::: :.
CCDS64 TNARDRNQRRLGDAAKKAISKLTTRTVKKGDKETDPDFDHCAVCIESYKQNDVVRILPCK
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 HIFHKTCVDPWLLEHRTCPMCKCDILKALGIEVDVEDGSVSLQVPVSNEISNSASSHEED
:.:::.:::::: :: :::::: .:::::::
CCDS64 HVFHKSCVDPWLSEHCTCPMCKLNILKALGIVPNLPCTDNVAFDMERLTRTQAVNRRSAL
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 NRSETASSGYASVQGTDEPPLEEHVQSTNESLQLVNHEANSVAVDVIPHVDNPTFEEDET
CCDS64 GDLAGDNSLGLEPLRTSGISPLPQDGELTPRTGEINIAVTR
350 360 370 380
>>CCDS4451.1 RNF130 gene_id:55819|Hs108|chr5 (419 aa)
initn: 760 init1: 507 opt: 837 Z-score: 877.9 bits: 171.5 E(32554): 1.4e-42
Smith-Waterman score: 837; 44.0% identity (68.7% similar) in 323 aa overlap (9-327:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGPPPGAGVSCRGGCGFSRLLAWCFLLALSPQAPGSRGAEAVWTAYLNVSWRVPHTGVNR
.:: : : .:: : .: : .. ... .:: .::. . : :.
CCDS44 MSCAGRAGPARLAALALLTCSLWPARADNASQEYYTALINVTVQEPGRGAPL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE3 TVWELSEEGVYGQDSPLEPVAG-VLVPPDGPGALN--ACNPHTNFTVPTVWGSTVQVSWL
: ..: :: ::: : : ::.: :. . .:.:.: : :: ... .:.
CCDS44 TF--RIDRGRYGLDSPKAEVRGQVLAPLPLHGVADHLGCDPQTRFFVPP----NIK-QWI
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 ALIQRGGGCTFADKIHLAYERGASGAVIFNFPGTRNEVIPMSHPGAVDIVAIMIGNLKGT
::.:::. ::: .:: : ..: ..::.: ...: . :.:::. ::.:.:: .:.:
CCDS44 ALLQRGN-CTFKEKISRAAFHNAVAVVIYN-NKSKEEPVTMTHPGTGDIIAVMITELRGK
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 KILQSIQRGIQVTMVIEVGKKHGPW-VNHYSIFFVSVSFFIITAATVGYFIFYSARRLRN
::. ....:.: :.: :: . : .. :. :::.::... . ...::: ...:
CCDS44 DILSYLEKNISVQMTIAVGTRMPPKNFSRGSLVFVSISFIVLMIISSAWLIFYFIQKIRY
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 ARAQSRKQRQLKADAKKAIGRLQLRTLKQGDKEIGPDGDSCAVCIELYKPNDLVRILTCN
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CCDS44 TNARDRNQRRLGDAAKKAISKLTTRTVKKGDKETDPDFDHCAVCIESYKQNDVVRILPCK
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 HIFHKTCVDPWLLEHRTCPMCKCDILKALGIEVDVEDGSVSLQVPVSNEISNSASSHEED
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CCDS44 HVFHKSCVDPWLSEHCTCPMCKLNILKALGIVPNLPCTDNVAFDMERLTRTQAVNRRSAL
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 NRSETASSGYASVQGTDEPPLEEHVQSTNESLQLVNHEANSVAVDVIPHVDNPTFEEDET
CCDS44 GDLAGDNSLGLEPLRTSGISPLPQDGELTPRTGEINIAVTKEWFIIASFGLLSALTLCYM
350 360 370 380 390 400
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10 20 30 40 50
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CCDS47 ITSELGESGVFGNHSPLERVSGVVALPEGWNQ-NACHPLTNFSRPK------QADSWLAL
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CCDS47 FFHKACIDPWLLAHRTCPMCKCDILKT
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CCDS11 AAAVESERSAEQKAIIRVIPLKMDPTGKLNLTLEGVFAGVAEITPAEGKLMQSH-P--LY
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:: . .. . : :.. : : ..:.: ..: ::::: ::.:.. :
CCDS11 LCNASDDDNLEPGFISIVKLESPRRAPR--PCLSLASKARMAGERGAS-AVLFDITEDRA
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. ...: .. ...: . . :... . .. .. . ::. :. : .. ....:
CCDS11 AAEQLQQPLGLTWPVVLIWGNDAEKLMEFVYKNQKAHVRIEL-KEPPAWPDYDVWILMTV
150 160 170 180 190 200
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CCDS11 VGTIFVIILASV----LRIRCRPRHSRPDPLQQRTAWAISQLATRRYQA-SCRQARGEWP
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.:.:: :.:.: .. .. .:...: : ::..:::::: .:::::.: .:
CCDS11 DSGSSCSSAPVCAICLEEFSEGQELRVISCLHEFHRNCVDPWLHQHRTCPLCMFNITEGD
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CCDS11 SFSQSLGPSRSYQEPGRRLHLIRQHPGHAHYHLPAAYLLGPSRSAVARPPRPGPFLPSQE
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CCDS82 MAGERGAS-AVLFDITEDRAAAEQLQQPLG
10 20
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 VDIVAIMIGNLKGTKILQSIQRGIQVTMVIEVGKKHGPWVNHYSIFFVSV--SFFIITAA
. ...: . . :... . .. .. . ::. :. : .. ....: ..:.: :
CCDS82 LTWPVVLIWGNDAEKLMEFVYKNQKAHVRIEL-KEPPAWPDYDVWILMTVVGTIFVIILA
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90 100 110 120 130 140
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]