Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3158
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3158, 376 aa
1>>>pF1KE3158 376 - 376 aa - 376 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3587+/-0.000954; mu= 10.8866+/- 0.057
mean_var=90.7962+/-17.986, 0's: 0 Z-trim(105.4): 90 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.134599
statistics sampled from 8330 (8426) to 8330 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.628), E-opt: 0.2 (0.259), width: 16
Scan time: 2.100
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5784.1 RNF133 gene_id:168433|Hs108|chr7 ( 376) 2559 507.4 8.5e-144
CCDS47692.1 RNF148 gene_id:378925|Hs108|chr7 ( 305) 1191 241.7 6.6e-64
CCDS14520.1 RNF128 gene_id:79589|Hs108|chrX ( 402) 1068 217.9 1.3e-56
CCDS14521.1 RNF128 gene_id:79589|Hs108|chrX ( 428) 991 202.9 4.3e-52
CCDS34065.1 RNF150 gene_id:57484|Hs108|chr4 ( 438) 707 147.8 1.8e-35
CCDS2051.1 RNF149 gene_id:284996|Hs108|chr2 ( 400) 624 131.6 1.2e-30
CCDS64340.1 RNF130 gene_id:55819|Hs108|chr5 ( 384) 589 124.8 1.2e-28
CCDS4451.1 RNF130 gene_id:55819|Hs108|chr5 ( 419) 589 124.9 1.3e-28
>>CCDS5784.1 RNF133 gene_id:168433|Hs108|chr7 (376 aa)
initn: 2559 init1: 2559 opt: 2559 Z-score: 2695.1 bits: 507.4 E(32554): 8.5e-144
Smith-Waterman score: 2559; 100.0% identity (100.0% similar) in 376 aa overlap (1-376:1-376)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MHLLKVGTWRNNTASSWLMKFSVLWLVSQNCCRASVVWMAYMNISFHVGNHVLSELGETG
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CCDS57 MHLLKVGTWRNNTASSWLMKFSVLWLVSQNCCRASVVWMAYMNISFHVGNHVLSELGETG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 VFGRSSTLKRVAGVIVPPEGKIQNACNPNTIFSRSKYSETWLALIERGGCTFTQKIKVAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 VFGRSSTLKRVAGVIVPPEGKIQNACNPNTIFSRSKYSETWLALIERGGCTFTQKIKVAT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 EKGASGVIIYNVPGTGNQVFPMFHQAFEDVVVVMIGNLKGTEIFHLIKKGVLITAVVEVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 EKGASGVIIYNVPGTGNQVFPMFHQAFEDVVVVMIGNLKGTEIFHLIKKGVLITAVVEVG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 RKHIIWMNHYLVSFVIVTTATLAYFIFYHIHRLCLARIQNRRWQRLTTDLQNTFGQLQLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 RKHIIWMNHYLVSFVIVTTATLAYFIFYHIHRLCLARIQNRRWQRLTTDLQNTFGQLQLR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 VVKEGDEEINPNGDSCVICFERYKPNDIVRILTCKHFFHKNCIDPWILPHGTCPICKCDI
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CCDS57 VVKEGDEEINPNGDSCVICFERYKPNDIVRILTCKHFFHKNCIDPWILPHGTCPICKCDI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LKVLGIQVVVENGTEPLQVLMSNELPETLSPSEEETNNEVSPAGTSDKVIHVEENPTSQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LKVLGIQVVVENGTEPLQVLMSNELPETLSPSEEETNNEVSPAGTSDKVIHVEENPTSQN
310 320 330 340 350 360
370
pF1KE3 NDIQPHSVVEDVHPSP
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CCDS57 NDIQPHSVVEDVHPSP
370
>>CCDS47692.1 RNF148 gene_id:378925|Hs108|chr7 (305 aa)
initn: 1149 init1: 728 opt: 1191 Z-score: 1260.8 bits: 241.7 E(32554): 6.6e-64
Smith-Waterman score: 1191; 55.4% identity (81.0% similar) in 305 aa overlap (1-302:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MHLLKVGTWRNNTASSWLMKFSVLWLVSQNCCRASVVWMAYMNISFHVGNHVLSELGETG
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CCDS47 MSFLRITPSTHSSVSSGLLRLSIFLLLSFPDSNGKAIWTAHLNITFQVGNEITSELGESG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 VFGRSSTLKRVAGVIVPPEGKIQNACNPNTIFSRSKYSETWLALIERGGCTFTQKIKVAT
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CCDS47 VFGNHSPLERVSGVVALPEGWNQNACHPLTNFSRPKQADSWLALIERGGCTFTHKINVAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 EKGASGVIIYNVPGTGNQVFPMFHQAFEDVVVVMIGNLKGTEIFHLIKKGVLITAVVEVG
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CCDS47 EKGANGVIIYNYQGTGSKVFPMSHQGTENIVAVMISNLKGMEILHSIQKGVYVTVIIEVG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE3 RKHIIWMNHYLVSFVIVTTATLAYFIFYHIHRLCLARIQN---RRWQRLTTDLQNTFGQL
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CCDS47 RMHMQWVSHYIMYLFTFLAATIAYFYLDCVWRLT-PRVPNSFTRRRSQIKTDVKKAIDQL
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 QLRVVKEGDEEINPNGDSCVICFERYKPNDIVRILTCKHFFHKNCIDPWILPHGTCPICK
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CCDS47 QLRVLKEGDEELDLNEDNCVVCFDTYKPQDVVRILTCKHFFHKACIDPWLLAHRTCPMCK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 CDILKVLGIQVVVENGTEPLQVLMSNELPETLSPSEEETNNEVSPAGTSDKVIHVEENPT
:::::
CCDS47 CDILKT
300
>>CCDS14520.1 RNF128 gene_id:79589|Hs108|chrX (402 aa)
initn: 1036 init1: 628 opt: 1068 Z-score: 1129.9 bits: 217.9 E(32554): 1.3e-56
Smith-Waterman score: 1072; 44.7% identity (74.5% similar) in 380 aa overlap (11-374:5-378)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MHLLKVGTWRNNTASSWLMK-FSVLWLVSQNCCRASVVWMAYMNISFHVGNHVLSELGET
: .. ::. :. : .. . .. : ..:.: ...:.. : :
CCDS14 MNQENRSSFFWLLVIFTFLLKITASFSMSAYVTVTYYN---ETSNYTAIETCEC
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 GVFGRSSTLKRVAGVIVPPEGKIQNACNPNTIFSRSKYSETWLALIERGGCTFTQKIKVA
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CCDS14 GVYGLASPVANAMGVVGIPKNNNYQACDHNTEFSNTK--KPWIALIERGNCTFSEKIQTA
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 TEKGASGVIIYNVPGTGNQVFPMFHQAFEDVVVVMIGNLKGTEIFHLIKKGVLITAVVEV
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CCDS14 GRRNADAVVIYNAPETGNQTIQMANFGAVDIVAIMIGNLKGTKILQSIQRGIQVTMVIEV
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 GRKHIIWMNHYL-----VSFVIVTTATLAYFIFYHIHRLCLARIQNRRWQRLTTDLQNTF
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CCDS14 GKKHGPWVNHYSIFFVSVSFFIITAATVGYFIFYSARRLRNARAQSRKQRQLKADAKKAI
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 GQLQLRVVKEGDEEINPNGDSCVICFERYKPNDIVRILTCKHFFHKNCIDPWILPHGTCP
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CCDS14 GRLQLRTLKQGDKEIGPDGDSCAVCIELYKPNDLVRILTCNHIFHKTCVDPWLLEHRTCP
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 ICKCDILKVLGIQVVVENGTEPLQVLMSNELPETLSPSEEETNNEVSPAGTSDKVIHVEE
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CCDS14 MCKCDILKALGIEVDVEDGSVSLQVPVSNEISNSASSHEEDNRSETASSGYAS-VQGTDE
290 300 310 320 330 340
360 370
pF1KE3 NPT-----SQNNDIQ-----PHSVVEDVHPSP
: : :...: .::. :: :
CCDS14 PPLEEHVQSTNESLQLVNHEANSVAVDVIPHVDNPTFEEDETPNQETAVREIKS
350 360 370 380 390 400
>>CCDS14521.1 RNF128 gene_id:79589|Hs108|chrX (428 aa)
initn: 1204 init1: 628 opt: 991 Z-score: 1048.7 bits: 202.9 E(32554): 4.3e-52
Smith-Waterman score: 1170; 50.1% identity (76.8% similar) in 367 aa overlap (34-374:39-404)
10 20 30 40 50
pF1KE3 LKVGTWRNNTASSWLMKFSVLWLVSQNCCRASVVWMAYMNISF---HVG-NHVLSELGET
: .:: ::.:.:. :.: :... ::.:
CCDS14 VSCRGGCGFSRLLAWCFLLALSPQAPGSRGAEAVWTAYLNVSWRVPHTGVNRTVWELSEE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 GVFGRSSTLKRVAGVIVPPEGK-IQNACNPNTIFSR-----SKYSETWLALIERGG-CTF
::.:..: :. ::::.:::.: :::::.: :. : . .:::::.::: :::
CCDS14 GVYGQDSPLEPVAGVLVPPDGPGALNACNPHTNFTVPTVWGSTVQVSWLALIQRGGGCTF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 TQKIKVATEKGASGVIIYNVPGTGNQVFPMFHQAFEDVVVVMIGNLKGTEIFHLIKKGVL
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CCDS14 ADKIHLAYERGASGAVIFNFPGTRNEVIPMSHPGAVDIVAIMIGNLKGTKILQSIQRGIQ
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KE3 ITAVVEVGRKHIIWMNHYL-----VSFVIVTTATLAYFIFYHIHRLCLARIQNRRWQRLT
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CCDS14 VTMVIEVGKKHGPWVNHYSIFFVSVSFFIITAATVGYFIFYSARRLRNARAQSRKQRQLK
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 TDLQNTFGQLQLRVVKEGDEEINPNGDSCVICFERYKPNDIVRILTCKHFFHKNCIDPWI
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CCDS14 ADAKKAIGRLQLRTLKQGDKEIGPDGDSCAVCIELYKPNDLVRILTCNHIFHKTCVDPWL
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 LPHGTCPICKCDILKVLGIQVVVENGTEPLQVLMSNELPETLSPSEEETNNEVSPAGTSD
: : :::.:::::::.:::.: ::.:. ::: .:::. .. : ::.. .:.. .: ..
CCDS14 LEHRTCPMCKCDILKALGIEVDVEDGSVSLQVPVSNEISNSASSHEEDNRSETASSGYAS
310 320 330 340 350 360
350 360 370
pF1KE3 KVIHVEENPT-----SQNNDIQ-----PHSVVEDVHPSP
: ..: : : :...: .::. :: :
CCDS14 -VQGTDEPPLEEHVQSTNESLQLVNHEANSVAVDVIPHVDNPTFEEDETPNQETAVREIK
370 380 390 400 410 420
CCDS14 S
>>CCDS34065.1 RNF150 gene_id:57484|Hs108|chr4 (438 aa)
initn: 730 init1: 445 opt: 707 Z-score: 750.5 bits: 147.8 E(32554): 1.8e-35
Smith-Waterman score: 729; 32.5% identity (64.2% similar) in 388 aa overlap (15-376:15-389)
10 20 30 40
pF1KE3 MHLLKVGTWRNNTASSWLMKFSVLWLVSQNCCRA-SVVWM-AYMNISFHV----------
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CCDS34 MAMSLIQACCSLALSTWLLSFCFVHLLCLDFTVAEKEEWYTAFVNITYAEPAPDPGAGAA
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 ---GNHVLSELGETGVFGRSSTLKRVAG-VIVPPEGKIQNACNPNTIFSRSKYSETWLAL
: .. .: : : .:. : . . : :.. .. . ::.::: :. ...:.::
CCDS34 GGGGAELHTEKTECGRYGEHSPKQDARGEVVMASSAHDRLACDPNTKFAAPTRGKNWIAL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 IERGGCTFTQKIKVATEKGASGVIIYNVPGTGNQVFPMFHQAFEDVVVVMIGNLKGTEIF
: .:.::. .::. : ..::.:.:.:: .. :... : : . ::.:..:: . :: ::
CCDS34 IPKGNCTYRDKIRNAFLQNASAVVIFNVGSNTNETITMPHAGVEDIVAIMIPEPKGKEIV
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210
pF1KE3 HLIKKGVLITAVVEVG----RKHIIWMNHYLVS--FVIVTTATLAYFIFYHIHRLCLARI
:..... .: . .: .:.. . .:: :... .::...::.:.:. :
CCDS34 SLLERNITVTMYITIGTRNLQKYVSRTSVVFVSISFIVLMIISLAWLVFYYIQRFRYANA
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 QNRRWQRLTTDLQNTFGQLQLRVVKEGDEEINPNGDSCVICFERYKPNDIVRILTCKHFF
..: .:: ......::.:..:.::.: . . :.:..:.: :::::.:::: :.:.:
CCDS34 RDRNQRRLGDAAKKAISKLQIRTIKKGDKETESDFDNCAVCIEGYKPNDVVRILPCRHLF
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 HKNCIDPWILPHGTCPICKCDILKVLGIQVVVENGTEPLQVLMSNELPETLSPSEE-ETN
::.:.:::.: : :::.:: .:::.::: : .. ..:: . : .
CCDS34 HKSCVDPWLLDHRTCPMCKMNILKALGI---------PPNADCMDDLPTDFEGSLGGPPT
310 320 330 340 350
340 350 360 370
pF1KE3 NEVSPAGTSDKVIH---VEENPTSQNNDIQPHSVVEDVHPSP
:... :.:: ... : .:. .. . .::.:. : :
CCDS34 NQIT--GASDTTVNESSVTLDPAVRT--VGALQVVQDTDPIPQEGDVIFTTNSEQEPAVS
360 370 380 390 400
CCDS34 SDSDISLIMAMEVGLSDVELSTDQDCEEVKS
410 420 430
>>CCDS2051.1 RNF149 gene_id:284996|Hs108|chr2 (400 aa)
initn: 635 init1: 320 opt: 624 Z-score: 664.0 bits: 131.6 E(32554): 1.2e-30
Smith-Waterman score: 675; 34.0% identity (62.0% similar) in 379 aa overlap (9-366:3-370)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MHLLKVGTWRNNTASSWLMKFSVLWLVSQNCC----RASVV-WM-AYMNISF--HVGNHV
:: :: .: :.. : :. .. :. : .:: . : .
CCDS20 MAWRRREASVGARGVLALALLALALCVPGARGRALEWFSAVVNIEYVDPQTNLT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KE3 LSELGETGVFGRSSTLKRVAGVI-VP--PEGKIQNACNPNTIF----SRSKYSETWLALI
. ..:.: :: :: . . :.. :: : : ... : :.: : .. . :.::.
CCDS20 VWSVSESGRFGDSSPKEGAHGLVGVPWAPGGDLEG-CAPDTRFFVPEPGGRGAAPWVALV
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 ERGGCTFTQKIKVATEKGASGVIIYNVPGTGNQVFPMFHQAFEDVVVVMIGNLKGTEIFH
:::::: .:. ::....::.:..:: :: ..:: : . ..::.::. :: ::..
CCDS20 ARGGCTFKDKVLVAARRNASAVVLYNEERYGNITLPMSHAGTGNIVVIMISYPKGREILE
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KE3 LIKKGVLITAVVEVGRKHII-WMNHYLVSFVIVTTAT-----LAYFIFYHIHRLCLARIQ
:..::. .: .. :: .:. ... : :: .. : ::..:::.:.:. . :
CCDS20 LVQKGIPVTMTIGVGTRHVQEFISGQSVVFVAIAFITMMIISLAWLIFYYIQRFLYTGSQ
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 NRRWQRLTTDLQNTFGQLQLRVVKEGDEEINPNGDSCVICFERYKPNDIVRILTCKHFFH
: . ....::: :..::.:.. :. ....:..:.: .: .::.::: :::.::
CCDS20 IGS-QSHRKETKKVIGQLLLHTVKHGEKGIDVDAENCAVCIENFKVKDIIRILPCKHIFH
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 KNCIDPWILPHGTCPICKCDILKVLGIQVVVENGTEPLQVLMSNELPETLSPSEEETNNE
. :::::.: : :::.:: :..:.:: : :: .: .:.: :: .. .
CCDS20 RICIDPWLLDHRTCPMCKLDVIKALGYW-----G-EPGDV---QEMPAPESPPGRDPAAN
300 310 320 330 340
340 350 360 370
pF1KE3 VSPAGTSDKVIHVEENPTSQNNDIQPHSVVEDVHPSP
.: : .: :... . .:.
CCDS20 LSLALPDDDGSDDSSPPSASPAESEPQCDPSFKGDAGENTALLEAGRSDSRHGGPIS
350 360 370 380 390 400
>>CCDS64340.1 RNF130 gene_id:55819|Hs108|chr5 (384 aa)
initn: 513 init1: 412 opt: 589 Z-score: 627.5 bits: 124.8 E(32554): 1.2e-28
Smith-Waterman score: 603; 35.5% identity (66.4% similar) in 262 aa overlap (58-306:57-314)
30 40 50 60 70 80
pF1KE3 SQNCCRASVVWMAYMNISFHVGNHVLSELGETGVFGRSSTLKRVAGVIVPP---EGKIQN
. : .: .: .: : .. : .: ..
CCDS64 ADNASQEYYTALINVTVQEPGRGAPLTFRIDRGRYGLDSPKAEVRGQVLAPLPLHGVADH
30 40 50 60 70 80
90 100 110 120 130 140
pF1KE3 -ACNPNTIFSRSKYSETWLALIERGGCTFTQKIKVATEKGASGVIIYNVPGTGNQVFPMF
.:.:.: : . :.::..::.::: .::. :. ..: .:.::: . . : :
CCDS64 LGCDPQTRFFVPPNIKQWIALLQRGNCTFKEKISRAAFHNAVAVVIYNNKSKEEPV-TMT
90 100 110 120 130 140
150 160 170 180 190
pF1KE3 HQAFEDVVVVMIGNLKGTEIFHLIKKGVLITAVVEVG---------RKHIIWMNHYLVSF
: . :...::: .:.: .:. ..:.. . .. :: : ..... .::
CCDS64 HPGTGDIIAVMITELRGKDILSYLEKNISVQMTIAVGTRMPPKNFSRGSLVFVS---ISF
150 160 170 180 190 200
200 210 220 230 240 250
pF1KE3 VIVTTATLAYFIFYHIHRLCLARIQNRRWQRLTTDLQNTFGQLQLRVVKEGDEEINPNGD
... . :..::: :... . ..: .:: ......: :.::.::.: .:. :
CCDS64 IVLMIISSAWLIFYFIQKIRYTNARDRNQRRLGDAAKKAISKLTTRTVKKGDKETDPDFD
210 220 230 240 250 260
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 SCVICFERYKPNDIVRILTCKHFFHKNCIDPWILPHGTCPICKCDILKVLGIQVVVENGT
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CCDS64 HCAVCIESYKQNDVVRILPCKHVFHKSCVDPWLSEHCTCPMCKLNILKALGIVPNLPCTD
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