Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3112
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3112, 284 aa
1>>>pF1KE3112 284 - 284 aa - 284 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1294+/-0.00103; mu= 15.9011+/- 0.062
mean_var=64.7184+/-13.791, 0's: 0 Z-trim(103.4): 31 B-trim: 430 in 1/48
Lambda= 0.159426
statistics sampled from 7352 (7377) to 7352 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.595), E-opt: 0.2 (0.227), width: 16
Scan time: 2.280
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34159.1 PLPP1 gene_id:8611|Hs108|chr5 ( 284) 1905 447.1 6.7e-126
CCDS34160.1 PLPP1 gene_id:8611|Hs108|chr5 ( 285) 1687 397.0 8.3e-111
CCDS12023.1 PLPP2 gene_id:8612|Hs108|chr19 ( 288) 1084 258.3 4.7e-69
CCDS12024.1 PLPP2 gene_id:8612|Hs108|chr19 ( 309) 1032 246.3 2e-65
CCDS604.1 PLPP3 gene_id:8613|Hs108|chr1 ( 311) 939 224.9 5.5e-59
CCDS45889.1 PLPP2 gene_id:8612|Hs108|chr19 ( 232) 866 208.1 4.9e-54
CCDS30779.1 PLPPR5 gene_id:163404|Hs108|chr1 ( 316) 358 91.3 9.4e-19
CCDS30778.1 PLPPR5 gene_id:163404|Hs108|chr1 ( 321) 354 90.4 1.8e-18
CCDS757.1 PLPPR4 gene_id:9890|Hs108|chr1 ( 763) 350 89.7 7e-18
CCDS6751.1 PLPPR1 gene_id:54886|Hs108|chr9 ( 325) 343 87.9 1.1e-17
CCDS58636.1 PLPPR3 gene_id:79948|Hs108|chr19 ( 718) 285 74.7 2.1e-13
CCDS47841.1 PLPP5 gene_id:84513|Hs108|chr8 ( 264) 247 65.7 4e-11
>>CCDS34159.1 PLPP1 gene_id:8611|Hs108|chr5 (284 aa)
initn: 1905 init1: 1905 opt: 1905 Z-score: 2373.8 bits: 447.1 E(32554): 6.7e-126
Smith-Waterman score: 1905; 100.0% identity (100.0% similar) in 284 aa overlap (1-284:1-284)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MFDKTRLPYVALDVLCVLLAGLPFAILTSRHTPFQRGVFCNDESIKYPYKEDTIPYALLG
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CCDS34 MFDKTRLPYVALDVLCVLLAGLPFAILTSRHTPFQRGVFCNDESIKYPYKEDTIPYALLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 GIIIPFSIIVIILGETLSVYCNLLHSNSFIRNNYIATIYKAIGTFLFGAAASQSLTDIAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GIIIPFSIIVIILGETLSVYCNLLHSNSFIRNNYIATIYKAIGTFLFGAAASQSLTDIAK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 YSIGRLRPHFLDVCDPDWSKINCSDGYIEYYICRGNAERVKEGRLSFYSGHSSFSMYCML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YSIGRLRPHFLDVCDPDWSKINCSDGYIEYYICRGNAERVKEGRLSFYSGHSSFSMYCML
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 FVALYLQARMKGDWARLLRPTLQFGLVAVSIYVGLSRVSDYKHHWSDVLTGLIQGALVAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FVALYLQARMKGDWARLLRPTLQFGLVAVSIYVGLSRVSDYKHHWSDVLTGLIQGALVAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280
pF1KE3 LVAVYVSDFFKERTSFKERKEEDSHTTLHETPTTGNHYPSNHQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LVAVYVSDFFKERTSFKERKEEDSHTTLHETPTTGNHYPSNHQP
250 260 270 280
>>CCDS34160.1 PLPP1 gene_id:8611|Hs108|chr5 (285 aa)
initn: 1691 init1: 1548 opt: 1687 Z-score: 2102.8 bits: 397.0 E(32554): 8.3e-111
Smith-Waterman score: 1687; 88.8% identity (95.1% similar) in 285 aa overlap (1-284:1-285)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MFDKTRLPYVALDVLCVLLAGLPFAILT-SRHTPFQRGVFCNDESIKYPYKEDTIPYALL
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CCDS34 MFDKTRLPYVALDVLCVLLASMPMAVLKLGQIYPFQRGFFCKDNSINYPYHDSTVTSTVL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 GGIIIPFSIIVIILGETLSVYCNLLHSNSFIRNNYIATIYKAIGTFLFGAAASQSLTDIA
. . . : :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ILVGVGLPISSIILGETLSVYCNLLHSNSFIRNNYIATIYKAIGTFLFGAAASQSLTDIA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 KYSIGRLRPHFLDVCDPDWSKINCSDGYIEYYICRGNAERVKEGRLSFYSGHSSFSMYCM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KYSIGRLRPHFLDVCDPDWSKINCSDGYIEYYICRGNAERVKEGRLSFYSGHSSFSMYCM
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 LFVALYLQARMKGDWARLLRPTLQFGLVAVSIYVGLSRVSDYKHHWSDVLTGLIQGALVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LFVALYLQARMKGDWARLLRPTLQFGLVAVSIYVGLSRVSDYKHHWSDVLTGLIQGALVA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280
pF1KE3 ILVAVYVSDFFKERTSFKERKEEDSHTTLHETPTTGNHYPSNHQP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ILVAVYVSDFFKERTSFKERKEEDSHTTLHETPTTGNHYPSNHQP
250 260 270 280
>>CCDS12023.1 PLPP2 gene_id:8612|Hs108|chr19 (288 aa)
initn: 1074 init1: 808 opt: 1084 Z-score: 1353.2 bits: 258.3 E(32554): 4.7e-69
Smith-Waterman score: 1084; 58.0% identity (78.7% similar) in 286 aa overlap (4-282:2-285)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MFDKTRLPYVALDVLCVLLAGLPFAILTSRHTPFQRGVFCNDESIKYPYKEDTIPYALLG
. : .: :::::.:.:.::::::: ..:..:: .:.:.::.:::. ::: ..:..
CCDS12 MQRRWVFVLLDVLCLLVASLPFAILTLVNAPYKRGFYCGDDSIRYPYRPDTITHGLMA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 GIIIPFSIIVIILGETLSVYCNLLHSNSFIRNNYIATIYKAIGTFLFGAAASQSLTDIAK
:. : ..:.. ::. :: . :.: : . :::.:..::..::::::::.::::::.::
CCDS12 GVTITATVILVSAGEAYLVYTDRLYSRSDF-NNYVAAVYKVLGTFLFGAAVSQSLTDLAK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE3 YSIGRLRPHFLDVCDPDWSKINCSDGYIEYY-ICRGNAERVKEGRLSFYSGHSSFSMYCM
: ::::::.:: :::::::..::: :.. .:::: : :.:::::::::::.::::
CCDS12 YMIGRLRPNFLAVCDPDWSRVNCSV-YVQLEKVCRGNPADVTEARLSFYSGHSSFGMYCM
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 LFVALYLQARMKGDWARLLRPTLQFGLVAVSIYVGLSRVSDYKHHWSDVLTGLIQGALVA
.:.:::.:::. ::::::::.:: ::: ..::: .:::::::::::::.::.::::::
CCDS12 VFLALYVQARLCWKWARLLRPTVQFFLVAFALYVGYTRVSDYKHHWSDVLVGLLQGALVA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE3 ILVAVYVSDFFKERTSFKERKEED--SHTTLHETPTTG----NHYPSNHQP
:.. :.::::: : . :::. . .: : : : ::: :
CCDS12 ALTVCYISDFFKARPPQHCLKEEELERKPSLSLTLTLGEADHNHYGYPHSSS
240 250 260 270 280
>>CCDS12024.1 PLPP2 gene_id:8612|Hs108|chr19 (309 aa)
initn: 1025 init1: 808 opt: 1032 Z-score: 1288.1 bits: 246.3 E(32554): 2e-65
Smith-Waterman score: 1032; 58.5% identity (78.7% similar) in 272 aa overlap (18-282:37-306)
10 20 30 40
pF1KE3 MFDKTRLPYVALDVLCVLLAGLPFAILTSRHTPFQRGVFCNDESIKY
: :.::::::: ..:..:: .:.:.::.:
CCDS12 PGSRGQHPPPRQQEVCAEGPRARLHPAPPGLGASLPFAILTLVNAPYKRGFYCGDDSIRY
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 PYKEDTIPYALLGGIIIPFSIIVIILGETLSVYCNLLHSNSFIRNNYIATIYKAIGTFLF
::. ::: ..:..:. : ..:.. ::. :: . :.: : . :::.:..::..:::::
CCDS12 PYRPDTITHGLMAGVTITATVILVSAGEAYLVYTDRLYSRSDF-NNYVAAVYKVLGTFLF
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 GAAASQSLTDIAKYSIGRLRPHFLDVCDPDWSKINCSDGYIEYY-ICRGNAERVKEGRLS
:::.::::::.::: ::::::.:: :::::::..::: :.. .:::: : :.:::
CCDS12 GAAVSQSLTDLAKYMIGRLRPNFLAVCDPDWSRVNCSV-YVQLEKVCRGNPADVTEARLS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 FYSGHSSFSMYCMLFVALYLQARMKGDWARLLRPTLQFGLVAVSIYVGLSRVSDYKHHWS
::::::::.::::.:.:::.:::. ::::::::.:: ::: ..::: .::::::::::
CCDS12 FYSGHSSFGMYCMVFLALYVQARLCWKWARLLRPTVQFFLVAFALYVGYTRVSDYKHHWS
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 DVLTGLIQGALVAILVAVYVSDFFKERTSFKERKEED--SHTTLHETPTTG----NHYPS
:::.::.:::::: :.. :.::::: : . :::. . .: : : : :::
CCDS12 DVLVGLLQGALVAALTVCYISDFFKARPPQHCLKEEELERKPSLSLTLTLGEADHNHYGY
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 NHQP
:
CCDS12 PHSSS
>>CCDS604.1 PLPP3 gene_id:8613|Hs108|chr1 (311 aa)
initn: 911 init1: 810 opt: 939 Z-score: 1172.4 bits: 224.9 E(32554): 5.5e-59
Smith-Waterman score: 939; 56.9% identity (79.8% similar) in 253 aa overlap (6-256:33-284)
10 20 30
pF1KE3 MFDKTRLPYVALDVLCVLLAGLPFAIL-TSRHTPF
:. . ::..:...::::: :. :: :.
CCDS60 NYKYDKAIVPESKNGGSPALNNNPRRSGSKRVLLICLDLFCLFMAGLPFLIIETSTIKPY
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 QRGVFCNDESIKYPYKE-DTIPYALLGGIIIPFSIIVIILGETLSVYCNLLHSNSFIRNN
.:: .::::::::: : .:: :.: .. : ..:..:: :: .: : .: : :.:
CCDS60 HRGFYCNDESIKYPLKTGETINDAVLCAVGIVIAILAIITGEFYRIY-YLKKSRSTIQNP
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 YIATIYKAIGTFLFGAAASQSLTDIAKYSIGRLRPHFLDVCDPDWSKINCSDGYIEYYIC
:.:..:: .: :::: : :::.::::: ::::::::::.::.::.:.::::.:::. : :
CCDS60 YVAALYKQVGCFLFGCAISQSFTDIAKVSIGRLRPHFLSVCNPDFSQINCSEGYIQNYRC
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 RGNAERVKEGRLSFYSGHSSFSMYCMLFVALYLQARMKGDWARLLRPTLQFGLVAVSIYV
::. .:.:.: ::.:::.::::: ::...::::::. :::::: ::: :. ...:.
CCDS60 RGDDSKVQEARKSFFSGHASFSMYTMLYLVLYLQARFTWRGARLLRPLLQFTLIMMAFYT
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 GLSRVSDYKHHWSDVLTGLIQGALVAILVAVYVSDFFKERTSFKERKEEDSHTTLHETPT
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CCDS60 GLSRVSDHKHHPSDVLAGFAQGALVACCIVFFVSDLFKTKTTLSLPAPAIRKEILSPVDI
250 260 270 280 290 300
280
pF1KE3 TGNHYPSNHQP
CCDS60 IDRNNHHNMM
310
>>CCDS45889.1 PLPP2 gene_id:8612|Hs108|chr19 (232 aa)
initn: 849 init1: 808 opt: 866 Z-score: 1083.6 bits: 208.1 E(32554): 4.9e-54
Smith-Waterman score: 866; 58.9% identity (77.5% similar) in 231 aa overlap (59-282:1-229)
30 40 50 60 70 80
pF1KE3 SRHTPFQRGVFCNDESIKYPYKEDTIPYALLGGIIIPFSIIVIILGETLSVYCNLLHSNS
..:. : ..:.. ::. :: . :.: :
CCDS45 MAGVTITATVILVSAGEAYLVYTDRLYSRS
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE3 FIRNNYIATIYKAIGTFLFGAAASQSLTDIAKYSIGRLRPHFLDVCDPDWSKINCSDGYI
. :::.:..::..::::::::.::::::.::: ::::::.:: :::::::..::: :.
CCDS45 DF-NNYVAAVYKVLGTFLFGAAVSQSLTDLAKYMIGRLRPNFLAVCDPDWSRVNCSV-YV
40 50 60 70 80
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 EYY-ICRGNAERVKEGRLSFYSGHSSFSMYCMLFVALYLQARMKGDWARLLRPTLQFGLV
. .:::: : :.:::::::::::.::::.:.:::.:::. ::::::::.:: ::
CCDS45 QLEKVCRGNPADVTEARLSFYSGHSSFGMYCMVFLALYVQARLCWKWARLLRPTVQFFLV
90 100 110 120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 AVSIYVGLSRVSDYKHHWSDVLTGLIQGALVAILVAVYVSDFFKERTSFKERKEED--SH
: ..::: .:::::::::::::.::.:::::: :.. :.::::: : . :::. .
CCDS45 AFALYVGYTRVSDYKHHWSDVLVGLLQGALVAALTVCYISDFFKARPPQHCLKEEELERK
150 160 170 180 190 200
270 280
pF1KE3 TTLHETPTTG----NHYPSNHQP
.: : : : ::: :
CCDS45 PSLSLTLTLGEADHNHYGYPHSSS
210 220 230
>>CCDS30779.1 PLPPR5 gene_id:163404|Hs108|chr1 (316 aa)
initn: 309 init1: 177 opt: 358 Z-score: 450.1 bits: 91.3 E(32554): 9.4e-19
Smith-Waterman score: 432; 28.5% identity (61.5% similar) in 270 aa overlap (36-277:41-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 RLPYVALDVLCVLLAGLPFAILTSRHTPFQRGVFCNDESIKYPYK--EDT--IPYALLGG
.: ::.: . . :: ::. .: .:: .
CCDS30 SMLYFQMVIMAGTVMLAYYFEYTDTFTVNVQGFFCHDSAYRKPYPGPEDSSAVPPVLLYS
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100
pF1KE3 IIIPFSIIVIILGETLSVYCNLLHSNSFIRNN---------YIATIYKA----IGTFLFG
. ..:::.::: .:.: : . .: .. :: . . .: . ::
CCDS30 LAAGVPVLVIIVGET-AVFCLQLATRDFENQEKTILTGDCCYINPLVRRTVRFLGIYTFG
80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 AAASQSLTDIAKYSIGRLRPHFLDVCDPDWSKINCSDGYIEYY----ICRGNAERVKEGR
:.. ... .. : : :::: .: :... ..:.. : .. : :: . . ..:
CCDS30 LFATDIFVNAGQVVTGNLAPHFLALCKPNYTALGCQQ-YTQFISGEEACTGNPDLIMRAR
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 LSFYSGHSSFSMYCMLFVALYLQARMKGDWARLLRPTLQFGLVAVSIYVGLSRVSDYKHH
.: : ....:.: .....:. .:. .:: .:.: .::. ... .::.::..:..:
CCDS30 KTFPSKEAALSVYAAMYLTMYITNTIKAKGTRLAKPVLCLGLMCLAFLTGLNRVAEYRNH
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270
pF1KE3 WSDVLTGLIQGALVAILVAVYVSDFFKERTSFKERKEEDSHTTLH-------ETPTTGNH
::::..:.. : .:....: : . :: : . .:. . :. . . :.: ::
CCDS30 WSDVIAGFLVGISIAVFLVVCVVNNFKGRQAENEHIHMDNLAQMPMISIPRVESPLEKNH
250 260 270 280 290 300
280
pF1KE3 YPSNHQP
CCDS30 ITAFAEVT
310
>>CCDS30778.1 PLPPR5 gene_id:163404|Hs108|chr1 (321 aa)
initn: 309 init1: 177 opt: 354 Z-score: 445.0 bits: 90.4 E(32554): 1.8e-18
Smith-Waterman score: 428; 29.2% identity (63.6% similar) in 250 aa overlap (36-264:41-288)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 RLPYVALDVLCVLLAGLPFAILTSRHTPFQRGVFCNDESIKYPYK--EDT--IPYALLGG
.: ::.: . . :: ::. .: .:: .
CCDS30 SMLYFQMVIMAGTVMLAYYFEYTDTFTVNVQGFFCHDSAYRKPYPGPEDSSAVPPVLLYS
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100
pF1KE3 IIIPFSIIVIILGETLSVYCNLLHSNSFIRNN---------YIATIYKA----IGTFLFG
. ..:::.::: .:.: : . .: .. :: . . .: . ::
CCDS30 LAAGVPVLVIIVGET-AVFCLQLATRDFENQEKTILTGDCCYINPLVRRTVRFLGIYTFG
80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 AAASQSLTDIAKYSIGRLRPHFLDVCDPDWSKINCSDGYIEYY----ICRGNAERVKEGR
:.. ... .. : : :::: .: :... ..:.. : .. : :: . . ..:
CCDS30 LFATDIFVNAGQVVTGNLAPHFLALCKPNYTALGCQQ-YTQFISGEEACTGNPDLIMRAR
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 LSFYSGHSSFSMYCMLFVALYLQARMKGDWARLLRPTLQFGLVAVSIYVGLSRVSDYKHH
.: : ....:.: .....:. .:. .:: .:.: .::. ... .::.::..:..:
CCDS30 KTFPSKEAALSVYAAMYLTMYITNTIKAKGTRLAKPVLCLGLMCLAFLTGLNRVAEYRNH
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 WSDVLTGLIQGALVAILVAVYVSDFFKERTSFKERKEEDSHTTLHETPTTGNHYPSNHQP
::::..:.. : .:....: : . :: : . .:. . :.
CCDS30 WSDVIAGFLVGISIAVFLVVCVVNNFKGRQAENEHIHMDNLAQMPMISIPRVESPLEKVT
250 260 270 280 290 300
CCDS30 SVQNHITAFAEVT
310 320
>>CCDS757.1 PLPPR4 gene_id:9890|Hs108|chr1 (763 aa)
initn: 229 init1: 134 opt: 350 Z-score: 434.6 bits: 89.7 E(32554): 7e-18
Smith-Waterman score: 439; 29.8% identity (60.6% similar) in 292 aa overlap (5-272:65-354)
10 20 30
pF1KE3 MFDKTRLP---YVALDVLCVLLAGLPFAILTSRH
: :: .: : .: ...: : ::.
CCDS75 TSPGGGRRPGQAAGMSAKERPKGKVIKDSVTLLPCFYFVELPILASSVVSLYFLELTDVF
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80
pF1KE3 TPFQRGVFCNDESIKYPYKEDT---IPYALLGGIIIPFSIIVIILGETLSVYCNL-----
: . : : :.:...:: : : ::. .: .. . :.:..:: . .:: :
CCDS75 KPVHSGFSCYDRSLSMPYIEPTQEAIPFLMLLSLAFAGPAITIMVGEGI-LYCCLSKRRN
100 110 120 130 140 150
90 100 110 120 130
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..... :... . .:. .:: .. .::: . : : :.:: :: :
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