Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3098
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3098, 435 aa
1>>>pF1KE3098 435 - 435 aa - 435 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7740+/-0.00096; mu= 3.4917+/- 0.058
mean_var=210.5389+/-43.443, 0's: 0 Z-trim(112.4): 13 B-trim: 284 in 1/51
Lambda= 0.088391
statistics sampled from 13178 (13188) to 13178 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.745), E-opt: 0.2 (0.405), width: 16
Scan time: 2.860
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47414.1 TEAD3 gene_id:7005|Hs108|chr6 ( 435) 2890 381.0 1.3e-105
CCDS59406.1 TEAD2 gene_id:8463|Hs108|chr19 ( 451) 1826 245.3 9.2e-65
CCDS7810.2 TEAD1 gene_id:7003|Hs108|chr11 ( 426) 1513 205.4 9.2e-53
CCDS31729.1 TEAD4 gene_id:7004|Hs108|chr12 ( 434) 1462 198.9 8.4e-51
CCDS41737.1 TEAD4 gene_id:7004|Hs108|chr12 ( 305) 1396 190.3 2.2e-48
CCDS31730.1 TEAD4 gene_id:7004|Hs108|chr12 ( 391) 1352 184.8 1.3e-46
CCDS12761.1 TEAD2 gene_id:8463|Hs108|chr19 ( 447) 1302 178.5 1.2e-44
CCDS58671.1 TEAD2 gene_id:8463|Hs108|chr19 ( 450) 1189 164.1 2.6e-40
CCDS58670.1 TEAD2 gene_id:8463|Hs108|chr19 ( 319) 706 102.4 7e-22
>>CCDS47414.1 TEAD3 gene_id:7005|Hs108|chr6 (435 aa)
initn: 2890 init1: 2890 opt: 2890 Z-score: 2009.6 bits: 381.0 E(32554): 1.3e-105
Smith-Waterman score: 2890; 100.0% identity (100.0% similar) in 435 aa overlap (1-435:1-435)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MASNSWNASSSPGEAREDGPEGLDKGLDNDAEGVWSPDIEQSFQEALAIYPPCGRRKIIL
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CCDS47 MASNSWNASSSPGEAREDGPEGLDKGLDNDAEGVWSPDIEQSFQEALAIYPPCGRRKIIL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 SDEGKMYGRNELIARYIKLRTGKTRTRKQVSSHIQVLARKKVREYQVGIKAMNLDQVSKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SDEGKMYGRNELIARYIKLRTGKTRTRKQVSSHIQVLARKKVREYQVGIKAMNLDQVSKD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 KALQSMASMSSAQIVSASVLQNKFSPPSPLPQAVFSTSSRFWSSPPLLGQQPGPSQDIKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KALQSMASMSSAQIVSASVLQNKFSPPSPLPQAVFSTSSRFWSSPPLLGQQPGPSQDIKP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 FAQPAYPIQPPLPPTLSSYEPLAPLPSAAASVPVWQDRTIASSRLRLLEYSAFMEVQRDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FAQPAYPIQPPLPPTLSSYEPLAPLPSAAASVPVWQDRTIASSRLRLLEYSAFMEVQRDP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 DTYSKHLFVHIGQTNPAFSDPPLEAVDVRQIYDKFPEKKGGLKELYEKGPPNAFFLVKFW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DTYSKHLFVHIGQTNPAFSDPPLEAVDVRQIYDKFPEKKGGLKELYEKGPPNAFFLVKFW
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 ADLNSTIQEGPGAFYGVSSQYSSADSMTISVSTKVCSFGKQVVEKVETEYARLENGRFVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ADLNSTIQEGPGAFYGVSSQYSSADSMTISVSTKVCSFGKQVVEKVETEYARLENGRFVY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 RIHRSPMCEYMINFIHKLKHLPEKYMMNSVLENFTILQVVTSRDSQETLLVIAFVFEVST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RIHRSPMCEYMINFIHKLKHLPEKYMMNSVLENFTILQVVTSRDSQETLLVIAFVFEVST
370 380 390 400 410 420
430
pF1KE3 SEHGAQHHVYKLVKD
:::::::::::::::
CCDS47 SEHGAQHHVYKLVKD
430
>>CCDS59406.1 TEAD2 gene_id:8463|Hs108|chr19 (451 aa)
initn: 1761 init1: 674 opt: 1826 Z-score: 1276.1 bits: 245.3 E(32554): 9.2e-65
Smith-Waterman score: 1826; 63.8% identity (80.0% similar) in 445 aa overlap (4-435:14-451)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MASNSWNASSSPGEAREDGPEGLDKGLDNDAEGVWSPDIEQSFQEALAIY
..:..: .: : :: :::::::::::::::::::::
CCDS59 MGEPRAGAALDDGSGWTGSEEGSEEGTGGSEGAGGDGGPDAEGVWSPDIEQSFQEALAIY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 PPCGRRKIILSDEGKMYGRNELIARYIKLRTGKTRTRKQVSSHIQVLARKKVREYQVGIK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: :: : .:
CCDS59 PPCGRRKIILSDEGKMYGRNELIARYIKLRTGKTRTRKQVSSHIQVLARRKSREIQSKLK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 AMNLDQVSKDKALQSMASMSSAQIVSASVLQNKFSPPSPLPQAVFSTSSRFWSSPPLLGQ
:.:.::::::::.:.::.:::::..:: :: :..: .: . .: .:::. .
CCDS59 ALNVDQVSKDKAFQTMATMSSAQLISAPSLQAKLGPTGPQASELF----QFWSGG---SG
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE3 QPGPSQDIKPFAQPAYPIQPPLPPT-LSSYEP---LAPLPSAAASVPVWQDRTIASSRLR
: :.:::.: . .. : : : .::: :.::: . : :.:: : ....::.
CCDS59 PPWNVPDVKPFSQTPFTLSLTPPSTDLPGYEPPQALSPLPPPTPSPPAWQARGLGTARLQ
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 LLEYSAFMEVQRDPDTYSKHLFVHIGQTNPAFSDPPLEAVDVRQIYDKFPEKKGGLKELY
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CCDS59 LVEFSAFVEPPDAVDSYQRHLFVHISQHCPSPGAPPLESVDVRQIYDKFPEKKGGLRELY
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KE3 EKGPPNAFFLVKFWADLN---STIQEGPGA------FYGVSSQYSSADSMTISVSTKVCS
..:::.:::::::::::: : . : :. :::::::: : . ::.. :.::::
CCDS59 DRGPPHAFFLVKFWADLNWGPSGEEAGAGGSISSGGFYGVSSQYESLEHMTLTCSSKVCS
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 FGKQVVEKVETEYARLENGRFVYRIHRSPMCEYMINFIHKLKHLPEKYMMNSVLENFTIL
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CCDS59 FGKQVVEKVETERAQLEDGRFVYRLLRSPMCEYLVNFLHKLRQLPERYMMNSVLENFTIL
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430
pF1KE3 QVVTSRDSQETLLVIAFVFEVSTSEHGAQHHVYKLVKD
::::.::.:: :: :.::::::::.:::::.:.::.:
CCDS59 QVVTNRDTQELLLCTAYVFEVSTSERGAQHHIYRLVRD
420 430 440 450
>>CCDS7810.2 TEAD1 gene_id:7003|Hs108|chr11 (426 aa)
initn: 1918 init1: 1242 opt: 1513 Z-score: 1060.8 bits: 205.4 E(32554): 9.2e-53
Smith-Waterman score: 2060; 71.1% identity (86.5% similar) in 436 aa overlap (1-435:1-426)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MASNSWNASSSPGEAREDGPEGLDKGLDNDAEGVWSPDIEQSFQEALAIYPPCGRRKIIL
: .::..: ::.: : .. :: .:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MEPSSWSGSESPAENMERMSDSADKPIDNDAEGVWSPDIEQSFQEALAIYPPCGRRKIIL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 SDEGKMYGRNELIARYIKLRTGKTRTRKQVSSHIQVLARKKVREYQVGIKAMNLDQVSKD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: :... .: ::..::
CCDS78 SDEGKMYGRNELIARYIKLRTGKTRTRKQVSSHIQVLARRKSRDFHSKLK----DQTAKD
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 KALQSMASMSSAQIVSASVLQNKFSPPSPLPQAVFSTSSRFWSSPPLLGQQPGPSQDIKP
:::: ::.:::::::::....::.. :. .:. .: . :: . :: :: :::.::
CCDS78 KALQHMAAMSSAQIVSATAIHNKLGLPG-IPRPTFPGAPGFWPGMIQTGQ-PGSSQDVKP
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE3 FAQPAYPIQPPLPPTLSSYEPL-APLPSAAASVPVWQDRTIASSRLRLLEYSAFMEVQRD
:.: :::::: . . ..:: :: : :::.:: :.:....:::.:.:::.: :::
CCDS78 FVQQAYPIQPAVTAPIPGFEPASAPAP----SVPAWQGRSIGTTKLRLVEFSAFLEQQRD
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 PDTYSKHLFVHIGQTNPAFSDPPLEAVDVRQIYDKFPEKKGGLKELYEKGPPNAFFLVKF
::.:.::::::::..: ..::: ::.::.:::::::::::::::::. ::: ::::::::
CCDS78 PDSYNKHLFVHIGHANHSYSDPLLESVDIRQIYDKFPEKKGGLKELFGKGPQNAFFLVKF
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 WADLNSTIQEGPGAFYGVSSQYSSADSMTISVSTKVCSFGKQVVEKVETEYARLENGRFV
::::: .::. ::::::.::: :...::.. :::::::::::::::::::::.::::::
CCDS78 WADLNCNIQDDAGAFYGVTSQYESSENMTVTCSTKVCSFGKQVVEKVETEYARFENGRFV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 YRIHRSPMCEYMINFIHKLKHLPEKYMMNSVLENFTILQVVTSRDSQETLLVIAFVFEVS
:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.::.::::: .: :::::
CCDS78 YRINRSPMCEYMINFIHKLKHLPEKYMMNSVLENFTILLVVTNRDTQETLLCMACVFEVS
360 370 380 390 400 410
420 430
pF1KE3 TSEHGAQHHVYKLVKD
.::::::::.:.::::
CCDS78 NSEHGAQHHIYRLVKD
420
>>CCDS31729.1 TEAD4 gene_id:7004|Hs108|chr12 (434 aa)
initn: 1999 init1: 1305 opt: 1462 Z-score: 1025.5 bits: 198.9 E(32554): 8.4e-51
Smith-Waterman score: 2012; 69.9% identity (86.6% similar) in 439 aa overlap (1-435:8-434)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MASNSWNASSSP-GEAREDGPEGLDKGLDNDAEGVWSPDIEQSFQEALAIYPP
..:: :.. .:: : . : ..::: .:::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MEGTAGTITSNEWSSPTSPEGSTASGGSQALDKPIDNDAEGVWSPDIEQSFQEALAIYPP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 CGRRKIILSDEGKMYGRNELIARYIKLRTGKTRTRKQVSSHIQVLARKKVREYQVGIKAM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:: :. .:
CCDS31 CGRRKIILSDEGKMYGRNELIARYIKLRTGKTRTRKQVSSHIQVLARRKAREIQAKLK--
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 NLDQVSKDKALQSMASMSSAQIVSASVLQNKFS-PPSPLPQAVFSTSSRFWSSPPLLGQQ
::..:::::::::.::::::.::........ .: :: : ::.. : :
CCDS31 --DQAAKDKALQSMAAMSSAQIISATAFHSSMALARGPGRPAV----SGFWQGA--LPGQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE3 PGPSQDIKPFAQPAYPIQPPLPPTLSSYE-PLAPLPSAAAS-VPVWQDRTIASSRLRLLE
: :.:.:::.: .: .::::: : ..: : .: :: .: .: :: :..:::.: .::
CCDS31 AGTSHDVKPFSQQTYAVQPPLP--LPGFESPAGPAPSPSAPPAPPWQGRSVASSKLWMLE
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 YSAFMEVQRDPDTYSKHLFVHIGQTNPAFSDPPLEAVDVRQIYDKFPEKKGGLKELYEKG
.:::.: :.:::::.:::::::::..:..::: :::::.:::::::::::::::.:.:.:
CCDS31 FSAFLEQQQDPDTYNKHLFVHIGQSSPSYSDPYLEAVDIRQIYDKFPEKKGGLKDLFERG
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 PPNAFFLVKFWADLNSTIQEGPGAFYGVSSQYSSADSMTISVSTKVCSFGKQVVEKVETE
: :::::::::::::..:.. ..:::::::: : ..: :. ::::::::::::::::::
CCDS31 PSNAFFLVKFWADLNTNIEDEGSSFYGVSSQYESPENMIITCSTKVCSFGKQVVEKVETE
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 YARLENGRFVYRIHRSPMCEYMINFIHKLKHLPEKYMMNSVLENFTILQVVTSRDSQETL
::: :::.. :::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.::::
CCDS31 YARYENGHYSYRIHRSPLCEYMINFIHKLKHLPEKYMMNSVLENFTILQVVTNRDTQETL
350 360 370 380 390 400
410 420 430
pF1KE3 LVIAFVFEVSTSEHGAQHHVYKLVKD
: ::.:::::.::::::::.:.:::.
CCDS31 LCIAYVFEVSASEHGAQHHIYRLVKE
410 420 430
>>CCDS41737.1 TEAD4 gene_id:7004|Hs108|chr12 (305 aa)
initn: 1384 init1: 1273 opt: 1396 Z-score: 982.1 bits: 190.3 E(32554): 2.2e-48
Smith-Waterman score: 1396; 67.4% identity (85.9% similar) in 313 aa overlap (126-435:1-305)
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 VLARKKVREYQVGIKAMNLDQVSKDKALQSMASMSSAQIVSASVLQNKFS-PPSPLPQAV
::.::::::.::........ .: ::
CCDS41 MAAMSSAQIISATAFHSSMALARGPGRPAV
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 FSTSSRFWSSPPLLGQQPGPSQDIKPFAQPAYPIQPPLPPTLSSYE-PLAPLPSAAAS-V
: ::.. : : : :.:.:::.: .: .::::: : ..: : .: :: .: .
CCDS41 ----SGFWQGA--LPGQAGTSHDVKPFSQQTYAVQPPLP--LPGFESPAGPAPSPSAPPA
40 50 60 70 80
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 PVWQDRTIASSRLRLLEYSAFMEVQRDPDTYSKHLFVHIGQTNPAFSDPPLEAVDVRQIY
: :: :..:::.: .::.:::.: :.:::::.:::::::::..:..::: :::::.::::
CCDS41 PPWQGRSVASSKLWMLEFSAFLEQQQDPDTYNKHLFVHIGQSSPSYSDPYLEAVDIRQIY
90 100 110 120 130 140
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 DKFPEKKGGLKELYEKGPPNAFFLVKFWADLNSTIQEGPGAFYGVSSQYSSADSMTISVS
:::::::::::.:.:.:: :::::::::::::..:.. ..:::::::: : ..: :. :
CCDS41 DKFPEKKGGLKDLFERGPSNAFFLVKFWADLNTNIEDEGSSFYGVSSQYESPENMIITCS
150 160 170 180 190 200
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 TKVCSFGKQVVEKVETEYARLENGRFVYRIHRSPMCEYMINFIHKLKHLPEKYMMNSVLE
:::::::::::::::::::: :::.. :::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TKVCSFGKQVVEKVETEYARYENGHYSYRIHRSPLCEYMINFIHKLKHLPEKYMMNSVLE
210 220 230 240 250 260
400 410 420 430
pF1KE3 NFTILQVVTSRDSQETLLVIAFVFEVSTSEHGAQHHVYKLVKD
:::::::::.::.::::: ::.:::::.::::::::.:.:::.
CCDS41 NFTILQVVTNRDTQETLLCIAYVFEVSASEHGAQHHIYRLVKE
270 280 290 300
>>CCDS31730.1 TEAD4 gene_id:7004|Hs108|chr12 (391 aa)
initn: 1847 init1: 1273 opt: 1352 Z-score: 950.3 bits: 184.8 E(32554): 1.3e-46
Smith-Waterman score: 1815; 64.8% identity (78.5% similar) in 438 aa overlap (1-435:8-391)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MASNSWNASSSP-GEAREDGPEGLDKGLDNDAEGVWSPDIEQSFQEALAIYPP
..:: :.. .:: : . : ..::: .:::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MEGTAGTITSNEWSSPTSPEGSTASGGSQALDKPIDNDAEGVWSPDIEQSFQEALAIYPP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 CGRRKIILSDEGKMYGRNELIARYIKLRTGKTRTRKQVSSHIQVLARKKVREYQVGIKAM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:: :. .:
CCDS31 CGRRKIILSDEGKMYGRNELIARYIKLRTGKTRTRKQVSSHIQVLARRKAREIQAKLK--
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 NLDQVSKDKALQSMASMSSAQIVSASVLQNKFSPPSPLPQAVFSTSSRFWSSPPLLGQQP
::.. : :
CCDS31 ------------------------------------------------FWQGA--LPGQA
120
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 GPSQDIKPFAQPAYPIQPPLPPTLSSYE-PLAPLPSAAAS-VPVWQDRTIASSRLRLLEY
: :.:.:::.: .: .::::: : ..: : .: :: .: .: :: :..:::.: .::.
CCDS31 GTSHDVKPFSQQTYAVQPPLP--LPGFESPAGPAPSPSAPPAPPWQGRSVASSKLWMLEF
130 140 150 160 170 180
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 SAFMEVQRDPDTYSKHLFVHIGQTNPAFSDPPLEAVDVRQIYDKFPEKKGGLKELYEKGP
:::.: :.:::::.:::::::::..:..::: :::::.:::::::::::::::.:.:.::
CCDS31 SAFLEQQQDPDTYNKHLFVHIGQSSPSYSDPYLEAVDIRQIYDKFPEKKGGLKDLFERGP
190 200 210 220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 PNAFFLVKFWADLNSTIQEGPGAFYGVSSQYSSADSMTISVSTKVCSFGKQVVEKVETEY
:::::::::::::..:.. ..:::::::: : ..: :. :::::::::::::::::::
CCDS31 SNAFFLVKFWADLNTNIEDEGSSFYGVSSQYESPENMIITCSTKVCSFGKQVVEKVETEY
250 260 270 280 290 300
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 ARLENGRFVYRIHRSPMCEYMINFIHKLKHLPEKYMMNSVLENFTILQVVTSRDSQETLL
:: :::.. :::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::
CCDS31 ARYENGHYSYRIHRSPLCEYMINFIHKLKHLPEKYMMNSVLENFTILQVVTNRDTQETLL
310 320 330 340 350 360
420 430
pF1KE3 VIAFVFEVSTSEHGAQHHVYKLVKD
::.:::::.::::::::.:.:::.
CCDS31 CIAYVFEVSASEHGAQHHIYRLVKE
370 380 390
>>CCDS12761.1 TEAD2 gene_id:8463|Hs108|chr19 (447 aa)
initn: 1731 init1: 640 opt: 1302 Z-score: 915.1 bits: 178.5 E(32554): 1.2e-44
Smith-Waterman score: 1792; 63.4% identity (79.1% similar) in 445 aa overlap (4-435:14-447)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MASNSWNASSSPGEAREDGPEGLDKGLDNDAEGVWSPDIEQSFQEALAIY
..:..: .: : :: :::::::::::::::::::::
CCDS12 MGEPRAGAALDDGSGWTGSEEGSEEGTGGSEGAGGDGGPDAEGVWSPDIEQSFQEALAIY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 PPCGRRKIILSDEGKMYGRNELIARYIKLRTGKTRTRKQVSSHIQVLARKKVREYQVGIK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: :: : .:
CCDS12 PPCGRRKIILSDEGKMYGRNELIARYIKLRTGKTRTRKQVSSHIQVLARRKSREIQSKLK
70 80 90 100 110 120
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]