Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2778
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2778, 781 aa
1>>>pF1KE2778 781 - 781 aa - 781 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4729+/-0.00124; mu= 19.3493+/- 0.074
mean_var=67.1812+/-13.451, 0's: 0 Z-trim(100.3): 37 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.156477
statistics sampled from 6136 (6151) to 6136 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.53), E-opt: 0.2 (0.184), width: 16
Scan time: 1.610
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS53864.1 POSTN gene_id:10631|Hs109|chr13 ( 781) 5050 1149.9 0
CCDS66531.1 POSTN gene_id:10631|Hs109|chr13 ( 809) 4887 1113.1 0
CCDS45034.1 POSTN gene_id:10631|Hs109|chr13 ( 779) 4584 1044.7 0
CCDS81764.1 POSTN gene_id:10631|Hs109|chr13 ( 808) 4395 1002.1 0
CCDS9364.1 POSTN gene_id:10631|Hs109|chr13 ( 836) 4395 1002.1 0
CCDS66530.1 POSTN gene_id:10631|Hs109|chr13 ( 749) 4385 999.8 0
CCDS47266.1 TGFBI gene_id:7045|Hs109|chr5 ( 683) 2000 461.4 2.3e-129
>>CCDS53864.1 POSTN gene_id:10631|Hs109|chr13 (781 aa)
initn: 5050 init1: 5050 opt: 5050 Z-score: 6156.3 bits: 1149.9 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 5050; 100.0% identity (100.0% similar) in 781 aa overlap (1-781:1-781)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MIPFLPMFSLLLLLIVNPINANNHYDKILAHSRIRGRDQGPNVCALQQILGTKKKYFSTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MIPFLPMFSLLLLLIVNPINANNHYDKILAHSRIRGRDQGPNVCALQQILGTKKKYFSTC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KNWYKKSICGQKTTVLYECCPGYMRMEGMKGCPAVLPIDHVYGTLGIVGATTTQRYSDAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KNWYKKSICGQKTTVLYECCPGYMRMEGMKGCPAVLPIDHVYGTLGIVGATTTQRYSDAS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 KLREEIEGKGSFTYFAPSNEAWDNLDSDIRRGLESNVNVELLNALHSHMINKRMLTKDLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KLREEIEGKGSFTYFAPSNEAWDNLDSDIRRGLESNVNVELLNALHSHMINKRMLTKDLK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 NGMIIPSMYNNLGLFINHYPNGVVTVNCARIIHGNQIATNGVVHVIDRVLTQIGTSIQDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NGMIIPSMYNNLGLFINHYPNGVVTVNCARIIHGNQIATNGVVHVIDRVLTQIGTSIQDF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 IEAEDDLSSFRAAAITSDILEALGRDGHFTLFAPTNEAFEKLPRGVLERIMGDKVASEAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IEAEDDLSSFRAAAITSDILEALGRDGHFTLFAPTNEAFEKLPRGVLERIMGDKVASEAL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 MKYHILNTLQCSESIMGGAVFETLEGNTIEIGCDGDSITVNGIKMVNKKDIVTNNGVIHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MKYHILNTLQCSESIMGGAVFETLEGNTIEIGCDGDSITVNGIKMVNKKDIVTNNGVIHL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 IDQVLIPDSAKQVIELAGKQQTTFTDLVAQLGLASALRPDGEYTLLAPVNNAFSDDTLSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IDQVLIPDSAKQVIELAGKQQTTFTDLVAQLGLASALRPDGEYTLLAPVNNAFSDDTLSM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 DQRLLKLILQNHILKVKVGLNELYNGQILETIGGKQLRVFVYRTAVCIENSCMEKGSKQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DQRLLKLILQNHILKVKVGLNELYNGQILETIGGKQLRVFVYRTAVCIENSCMEKGSKQG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 RNGAIHIFREIIKPAEKSLHEKLKQDKRFSTFLSLLEAADLKELLTQPGDWTLFVPTNDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RNGAIHIFREIIKPAEKSLHEKLKQDKRFSTFLSLLEAADLKELLTQPGDWTLFVPTNDA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 FKGMTSEEKEILIRDKNALQNIILYHLTPGVFIGKGFEPGVTNILKTTQGSKIFLKEVND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FKGMTSEEKEILIRDKNALQNIILYHLTPGVFIGKGFEPGVTNILKTTQGSKIFLKEVND
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 TLLVNELKSKESDIMTTNGVIHVVDKLLYPADTPVGNDQLLEILNKLIKYIQIKFVRGST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TLLVNELKSKESDIMTTNGVIHVVDKLLYPADTPVGNDQLLEILNKLIKYIQIKFVRGST
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 FKEIPVTVYRPTLTKVKIEGEPEFRLIKEGETITEVIHGEPIIKKYTKIIDGVPVEITEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FKEIPVTVYRPTLTKVKIEGEPEFRLIKEGETITEVIHGEPIIKKYTKIIDGVPVEITEK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 ETREERIITGPEIKYTRISTGGGETEETLKKLLQEDTPVRKLQANKKVQGSRRRLREGRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ETREERIITGPEIKYTRISTGGGETEETLKKLLQEDTPVRKLQANKKVQGSRRRLREGRS
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 Q
:
CCDS53 Q
>>CCDS66531.1 POSTN gene_id:10631|Hs109|chr13 (809 aa)
initn: 5147 init1: 4884 opt: 4887 Z-score: 5957.2 bits: 1113.1 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 4984; 96.5% identity (96.5% similar) in 809 aa overlap (1-781:1-809)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MIPFLPMFSLLLLLIVNPINANNHYDKILAHSRIRGRDQGPNVCALQQILGTKKKYFSTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MIPFLPMFSLLLLLIVNPINANNHYDKILAHSRIRGRDQGPNVCALQQILGTKKKYFSTC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KNWYKKSICGQKTTVLYECCPGYMRMEGMKGCPAVLPIDHVYGTLGIVGATTTQRYSDAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 KNWYKKSICGQKTTVLYECCPGYMRMEGMKGCPAVLPIDHVYGTLGIVGATTTQRYSDAS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 KLREEIEGKGSFTYFAPSNEAWDNLDSDIRRGLESNVNVELLNALHSHMINKRMLTKDLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 KLREEIEGKGSFTYFAPSNEAWDNLDSDIRRGLESNVNVELLNALHSHMINKRMLTKDLK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 NGMIIPSMYNNLGLFINHYPNGVVTVNCARIIHGNQIATNGVVHVIDRVLTQIGTSIQDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 NGMIIPSMYNNLGLFINHYPNGVVTVNCARIIHGNQIATNGVVHVIDRVLTQIGTSIQDF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 IEAEDDLSSFRAAAITSDILEALGRDGHFTLFAPTNEAFEKLPRGVLERIMGDKVASEAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 IEAEDDLSSFRAAAITSDILEALGRDGHFTLFAPTNEAFEKLPRGVLERIMGDKVASEAL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 MKYHILNTLQCSESIMGGAVFETLEGNTIEIGCDGDSITVNGIKMVNKKDIVTNNGVIHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MKYHILNTLQCSESIMGGAVFETLEGNTIEIGCDGDSITVNGIKMVNKKDIVTNNGVIHL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 IDQVLIPDSAKQVIELAGKQQTTFTDLVAQLGLASALRPDGEYTLLAPVNNAFSDDTLSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 IDQVLIPDSAKQVIELAGKQQTTFTDLVAQLGLASALRPDGEYTLLAPVNNAFSDDTLSM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 DQRLLKLILQNHILKVKVGLNELYNGQILETIGGKQLRVFVYRTAVCIENSCMEKGSKQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 DQRLLKLILQNHILKVKVGLNELYNGQILETIGGKQLRVFVYRTAVCIENSCMEKGSKQG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 RNGAIHIFREIIKPAEKSLHEKLKQDKRFSTFLSLLEAADLKELLTQPGDWTLFVPTNDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 RNGAIHIFREIIKPAEKSLHEKLKQDKRFSTFLSLLEAADLKELLTQPGDWTLFVPTNDA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 FKGMTSEEKEILIRDKNALQNIILYHLTPGVFIGKGFEPGVTNILKTTQGSKIFLKEVND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 FKGMTSEEKEILIRDKNALQNIILYHLTPGVFIGKGFEPGVTNILKTTQGSKIFLKEVND
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 TLLVNELKSKESDIMTTNGVIHVVDKLLYPADTPVGNDQLLEILNKLIKYIQIKFVRGST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 TLLVNELKSKESDIMTTNGVIHVVDKLLYPADTPVGNDQLLEILNKLIKYIQIKFVRGST
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 FKEIPVTVYRPTLTKVKIEGEPEFRLIKEGETITEVIHGEPIIKKYTKIIDGVPVEITEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 FKEIPVTVYRPTLTKVKIEGEPEFRLIKEGETITEVIHGEPIIKKYTKIIDGVPVEITEK
670 680 690 700 710 720
730 740 750
pF1KE2 ETREERIITGPEIKYTRISTGGGETEETLKKLLQE-------------------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 ETREERIITGPEIKYTRISTGGGETEETLKKLLQEEVTKVTKFIEGGDGHLFEDEEIKRL
730 740 750 760 770 780
760 770 780
pF1KE2 ---DTPVRKLQANKKVQGSRRRLREGRSQ
::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LQGDTPVRKLQANKKVQGSRRRLREGRSQ
790 800
>>CCDS45034.1 POSTN gene_id:10631|Hs109|chr13 (779 aa)
initn: 4697 init1: 4370 opt: 4584 Z-score: 5587.8 bits: 1044.7 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 4721; 92.7% identity (92.8% similar) in 809 aa overlap (1-781:1-779)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MIPFLPMFSLLLLLIVNPINANNHYDKILAHSRIRGRDQGPNVCALQQILGTKKKYFSTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MIPFLPMFSLLLLLIVNPINANNHYDKILAHSRIRGRDQGPNVCALQQILGTKKKYFSTC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KNWYKKSICGQKTTVLYECCPGYMRMEGMKGCPAVLPIDHVYGTLGIVGATTTQRYSDAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KNWYKKSICGQKTTVLYECCPGYMRMEGMKGCPAVLPIDHVYGTLGIVGATTTQRYSDAS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 KLREEIEGKGSFTYFAPSNEAWDNLDSDIRRGLESNVNVELLNALHSHMINKRMLTKDLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KLREEIEGKGSFTYFAPSNEAWDNLDSDIRRGLESNVNVELLNALHSHMINKRMLTKDLK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 NGMIIPSMYNNLGLFINHYPNGVVTVNCARIIHGNQIATNGVVHVIDRVLTQIGTSIQDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NGMIIPSMYNNLGLFINHYPNGVVTVNCARIIHGNQIATNGVVHVIDRVLTQIGTSIQDF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 IEAEDDLSSFRAAAITSDILEALGRDGHFTLFAPTNEAFEKLPRGVLERIMGDKVASEAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IEAEDDLSSFRAAAITSDILEALGRDGHFTLFAPTNEAFEKLPRGVLERIMGDKVASEAL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 MKYHILNTLQCSESIMGGAVFETLEGNTIEIGCDGDSITVNGIKMVNKKDIVTNNGVIHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MKYHILNTLQCSESIMGGAVFETLEGNTIEIGCDGDSITVNGIKMVNKKDIVTNNGVIHL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 IDQVLIPDSAKQVIELAGKQQTTFTDLVAQLGLASALRPDGEYTLLAPVNNAFSDDTLSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IDQVLIPDSAKQVIELAGKQQTTFTDLVAQLGLASALRPDGEYTLLAPVNNAFSDDTLSM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 DQRLLKLILQNHILKVKVGLNELYNGQILETIGGKQLRVFVYRTAVCIENSCMEKGSKQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DQRLLKLILQNHILKVKVGLNELYNGQILETIGGKQLRVFVYRTAVCIENSCMEKGSKQG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 RNGAIHIFREIIKPAEKSLHEKLKQDKRFSTFLSLLEAADLKELLTQPGDWTLFVPTNDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RNGAIHIFREIIKPAEKSLHEKLKQDKRFSTFLSLLEAADLKELLTQPGDWTLFVPTNDA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 FKGMTSEEKEILIRDKNALQNIILYHLTPGVFIGKGFEPGVTNILKTTQGSKIFLKEVND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FKGMTSEEKEILIRDKNALQNIILYHLTPGVFIGKGFEPGVTNILKTTQGSKIFLKEVND
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 TLLVNELKSKESDIMTTNGVIHVVDKLLYPADTPVGNDQLLEILNKLIKYIQIKFVRGST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TLLVNELKSKESDIMTTNGVIHVVDKLLYPADTPVGNDQLLEILNKLIKYIQIKFVRGST
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 FKEIPVTVYRPTLTKVKIEGEPEFRLIKEGETITEVIHGEPIIKKYTKIIDGVPVEITEK
:::::::::.: :::::::::::::::::::
CCDS45 FKEIPVTVYKP------------------------------IIKKYTKIIDGVPVEITEK
670 680 690
730 740 750
pF1KE2 ETREERIITGPEIKYTRISTGGGETEETLKKLLQE-------------------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ETREERIITGPEIKYTRISTGGGETEETLKKLLQEEVTKVTKFIEGGDGHLFEDEEIKRL
700 710 720 730 740 750
760 770 780
pF1KE2 ---DTPVRKLQANKKVQGSRRRLREGRSQ
::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LQGDTPVRKLQANKKVQGSRRRLREGRSQ
760 770
>>CCDS81764.1 POSTN gene_id:10631|Hs109|chr13 (808 aa)
initn: 4348 init1: 4348 opt: 4395 Z-score: 5357.0 bits: 1002.1 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 4978; 96.5% identity (96.5% similar) in 808 aa overlap (1-781:1-808)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MIPFLPMFSLLLLLIVNPINANNHYDKILAHSRIRGRDQGPNVCALQQILGTKKKYFSTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MIPFLPMFSLLLLLIVNPINANNHYDKILAHSRIRGRDQGPNVCALQQILGTKKKYFSTC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KNWYKKSICGQKTTVLYECCPGYMRMEGMKGCPAVLPIDHVYGTLGIVGATTTQRYSDAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KNWYKKSICGQKTTVLYECCPGYMRMEGMKGCPAVLPIDHVYGTLGIVGATTTQRYSDAS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 KLREEIEGKGSFTYFAPSNEAWDNLDSDIRRGLESNVNVELLNALHSHMINKRMLTKDLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KLREEIEGKGSFTYFAPSNEAWDNLDSDIRRGLESNVNVELLNALHSHMINKRMLTKDLK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 NGMIIPSMYNNLGLFINHYPNGVVTVNCARIIHGNQIATNGVVHVIDRVLTQIGTSIQDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NGMIIPSMYNNLGLFINHYPNGVVTVNCARIIHGNQIATNGVVHVIDRVLTQIGTSIQDF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 IEAEDDLSSFRAAAITSDILEALGRDGHFTLFAPTNEAFEKLPRGVLERIMGDKVASEAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 IEAEDDLSSFRAAAITSDILEALGRDGHFTLFAPTNEAFEKLPRGVLERIMGDKVASEAL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 MKYHILNTLQCSESIMGGAVFETLEGNTIEIGCDGDSITVNGIKMVNKKDIVTNNGVIHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MKYHILNTLQCSESIMGGAVFETLEGNTIEIGCDGDSITVNGIKMVNKKDIVTNNGVIHL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 IDQVLIPDSAKQVIELAGKQQTTFTDLVAQLGLASALRPDGEYTLLAPVNNAFSDDTLSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 IDQVLIPDSAKQVIELAGKQQTTFTDLVAQLGLASALRPDGEYTLLAPVNNAFSDDTLSM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 DQRLLKLILQNHILKVKVGLNELYNGQILETIGGKQLRVFVYRTAVCIENSCMEKGSKQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DQRLLKLILQNHILKVKVGLNELYNGQILETIGGKQLRVFVYRTAVCIENSCMEKGSKQG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 RNGAIHIFREIIKPAEKSLHEKLKQDKRFSTFLSLLEAADLKELLTQPGDWTLFVPTNDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RNGAIHIFREIIKPAEKSLHEKLKQDKRFSTFLSLLEAADLKELLTQPGDWTLFVPTNDA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 FKGMTSEEKEILIRDKNALQNIILYHLTPGVFIGKGFEPGVTNILKTTQGSKIFLKEVND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 FKGMTSEEKEILIRDKNALQNIILYHLTPGVFIGKGFEPGVTNILKTTQGSKIFLKEVND
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 TLLVNELKSKESDIMTTNGVIHVVDKLLYPADTPVGNDQLLEILNKLIKYIQIKFVRGST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TLLVNELKSKESDIMTTNGVIHVVDKLLYPADTPVGNDQLLEILNKLIKYIQIKFVRGST
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KE2 FKEIPVTVYR---------------------------PTLTKVKIEGEPEFRLIKEGETI
::::::::: :::::::::::::::::::::::
CCDS81 FKEIPVTVYTTKIITKVVEPKIKVIEGSLQPIIKTEGPTLTKVKIEGEPEFRLIKEGETI
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
pF1KE2 TEVIHGEPIIKKYTKIIDGVPVEITEKETREERIITGPEIKYTRISTGGGETEETLKKLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TEVIHGEPIIKKYTKIIDGVPVEITEKETREERIITGPEIKYTRISTGGGETEETLKKLL
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760 770 780
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CCDS81 QEDTPVRKLQANKKVQGSRRRLREGRSQ
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CCDS93 MKYHILNTLQCSESIMGGAVFETLEGNTIEIGCDGDSITVNGIKMVNKKDIVTNNGVIHL
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CCDS93 RNGAIHIFREIIKPAEKSLHEKLKQDKRFSTFLSLLEAADLKELLTQPGDWTLFVPTNDA
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CCDS93 FKGMTSEEKEILIRDKNALQNIILYHLTPGVFIGKGFEPGVTNILKTTQGSKIFLKEVND
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CCDS93 TEVIHGEPIIKKYTKIIDGVPVEITEKETREERIITGPEIKYTRISTGGGETEETLKKLL
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760 770 780
pF1KE2 QED-TPVRKLQANKKVQGSRRRLREGRSQ
::. : : :.
CCDS93 QEEVTKVTKFIEGGDGHLFEDEEIKRLLQGDTPVRKLQANKKVQGSRRRLREGRSQ
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CCDS66 KNWYKKSICGQKTTVLYECCPGYMRMEGMKGCPAVLPIDHVYGTLGIVGATTTQRYSDAS
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CCDS66 TLLVNELKSKESDIMTTNGVIHVVDKLLYPADTPVGNDQLLEILNKLIKYIQIKFVRGST
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pF1KE2 FKEIPVTVYRPTLTKVKIE---GEPEFRLIKEGETITEVIHGEPIIKKYTKIIDGVPVEI
::::::::: : . ..: :: : ::. .... : . : ::.:.: ..
CCDS66 FKEIPVTVYSPEIKYTRISTGGGETE-------ETLKKLLQEE--VTKVTKFIEGGDGHL
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pF1KE2 TEKETREERIITGPEIKYTRISTGGGETEETLKKLLQEDTPVRKLQANKKVQGSRRRLRE
: .: .:.::: ::::::::::::::::::::::
CCDS66 FE--------------------------DEEIKRLLQGDTPVRKLQANKKVQGSRRRLRE
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780
pF1KE2 GRSQ
::::
CCDS66 GRSQ
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10 20 30 40 50
pF1KE2 MIPFLPMFSLLLLLIVNPIN-----ANNHYDKILAHSRIRGRDQGPNVCALQQILGTKKK
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CCDS47 MALFVRLLALALALALGPAATLAGPAKSPYQLVLQHSRLRGRQHGPNVCAVQKVIGTNRK
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::..::.::...:::..:.. ::::::: .. : :::::.::....: :::.::.::::
CCDS47 YFTNCKQWYQRKICGKSTVISYECCPGYEKVPGEKGCPAALPLSNLYETLGVVGSTTTQL
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:.: . ::: :.:: :::: :::::::: .: ... .: ::::.::::::. ::...:.
CCDS47 YTDRTEKLRPEMEGPGSFTIFAPSNEAWASLPAEVLDSLVSNVNIELLNALRYHMVGRRV
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pF1KE2 LTKDLKNGMIIPSMYNNLGLFINHYPNGVVTVNCARIIHGNQIATNGVVHVIDRVLTQIG
:: .::.:: . :::.: .. :.:::::.:::::::...... :::::::.::.:.. :
CCDS47 LTDELKHGMTLTSMYQNSNIQIHHYPNGIVTVNCARLLKADHHATNGVVHLIDKVISTIT
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pF1KE2 TSIQDFIEAEDDLSSFRAAAITSDILEALGRDGHFTLFAPTNEAFEKLPRGVLERIMGDK
..::..:: :: . ..:::. .: . : .:..::.:::::::::.: .:.::.::
CCDS47 NNIQQIIEIEDTFETLRAAVAASGLNTMLEGNGQYTLLAPTNEAFEKIPSETLNRILGDP
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300 310 320 330 340 350
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: . :.. :::.. .:.:.:..: :::::.:.:.::.:: .:.:: ....:::...
CCDS47 EALRDLLNNHILKSAMCAEAIVAGLSVETLEGTTLEVGCSGDMLTINGKAIISNKDILAT
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pF1KE2 NGVIHLIDQVLIPDSAKQVIELAGKQQ-TTFTDLVAQLGLASALRPDGEYTLLAPVNNAF
::::: ::..::::::: ..:::.... .: :: : ::.. : . . :::::.:..:
CCDS47 NGVIHYIDELLIPDSAKTLFELAAESDVSTAIDLFRQAGLGNHLSGSERLTLLAPLNSVF
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pF1KE2 SDDTLSMDQRLLKLILQNHILKVKVGLNELYNGQILETIGGKQLRVFVYRTAVCIENSCM
.: : .: . .: :.:::.: ... . ::.:: :::.:::.:::::::...::::::.
CCDS47 KDGTPPIDAHTRNL-LRNHIIKDQLASKYLYHGQTLETLGGKKLRVFVYRNSLCIENSCI
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.:.:: :.. . ... : .. . :: :.::: ... ...: : : :.. : .:.
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:.:::.::... .:. :. : . : ::. ::. .... :. :. ::. ::.:.
CCDS47 FAPTNEAFRALPPRERSRLLGDAKELANILKYHIGDEILVSGGI--GALVRLKSLQGDKL
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660 670 680
781 residues in 1 query sequences
18921897 residues in 33420 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]