FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2775, 628 aa
1>>>pF1KE2775 628 - 628 aa - 628 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1054+/-0.00121; mu= 16.5972+/- 0.073
mean_var=145.7905+/-27.274, 0's: 0 Z-trim(107.6): 78 B-trim: 38 in 1/49
Lambda= 0.106221
statistics sampled from 9712 (9780) to 9712 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.65), E-opt: 0.2 (0.293), width: 16
Scan time: 1.570
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS5516.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7 ( 628) 4448 694.3 1.3e-199
CCDS5515.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7 ( 705) 4443 693.5 2.5e-199
CCDS5514.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7 (1210) 4443 693.8 3.5e-199
CCDS87507.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7 (1091) 3242 509.7 8.3e-144
CCDS87506.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7 (1165) 3242 509.8 8.6e-144
CCDS47587.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7 ( 405) 2815 443.8 2.2e-124
CCDS42811.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs109|chr2 (1292) 2195 349.4 1.8e-95
CCDS2394.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs109|chr2 (1308) 2195 349.4 1.9e-95
CCDS31833.1 ERBB3 gene_id:2065|Hs109|chr12 (1342) 2085 332.5 2.2e-90
CCDS77017.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs109|chr17 ( 603) 1721 276.3 8.3e-74
CCDS77016.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs109|chr17 (1055) 1721 276.6 1.2e-73
CCDS45667.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs109|chr17 (1225) 1721 276.7 1.3e-73
CCDS74052.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs109|chr17 (1240) 1721 276.7 1.3e-73
CCDS32642.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs109|chr17 (1255) 1721 276.7 1.3e-73
>>CCDS5516.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7 (628 aa)
initn: 4448 init1: 4448 opt: 4448 Z-score: 3697.1 bits: 694.3 E(33420): 1.3e-199
Smith-Waterman score: 4448; 99.8% identity (100.0% similar) in 628 aa overlap (1-628:1-628)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPKDCVSCRNVSRGRECVDKCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS55 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPRDCVSCRNVSRGRECVDKCN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KE2 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGS
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGS
610 620
>>CCDS5515.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7 (705 aa)
initn: 4443 init1: 4443 opt: 4443 Z-score: 3692.4 bits: 693.5 E(33420): 2.5e-199
Smith-Waterman score: 4443; 99.8% identity (100.0% similar) in 627 aa overlap (1-627:1-627)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPKDCVSCRNVSRGRECVDKCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS55 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPRDCVSCRNVSRGRECVDKCN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KE2 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGS
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGPGNESLKAMLFCLFKLSSCNQSNDGSVSHQSGS
610 620 630 640 650 660
>>CCDS5514.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7 (1210 aa)
initn: 4443 init1: 4443 opt: 4443 Z-score: 3689.6 bits: 693.8 E(33420): 3.5e-199
Smith-Waterman score: 4443; 99.8% identity (100.0% similar) in 627 aa overlap (1-627:1-627)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPKDCVSCRNVSRGRECVDKCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS55 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPRDCVSCRNVSRGRECVDKCN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KE2 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGS
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGCTGPGLEGCPTNGPKIPSIATGMVGALLLLLVV
610 620 630 640 650 660
>>CCDS87507.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7 (1091 aa)
initn: 4110 init1: 3228 opt: 3242 Z-score: 2695.5 bits: 509.7 E(33420): 8.3e-144
Smith-Waterman score: 4022; 92.7% identity (92.8% similar) in 627 aa overlap (1-627:1-582)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
::::::::::::::::::::: :
CCDS87 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQ----G----------------------------------
130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 -------QKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
320 330 340 350 360 370
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
380 390 400 410 420 430
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPKDCVSCRNVSRGRECVDKCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS87 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPRDCVSCRNVSRGRECVDKCN
440 450 460 470 480 490
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
500 510 520 530 540 550
610 620
pF1KE2 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGS
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGCTGPGLEGCPTNGPKIPSIATGMVGALLLLLVV
560 570 580 590 600 610
>>CCDS87506.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7 (1165 aa)
initn: 4110 init1: 3228 opt: 3242 Z-score: 2695.2 bits: 509.8 E(33420): 8.6e-144
Smith-Waterman score: 4022; 92.7% identity (92.8% similar) in 627 aa overlap (1-627:1-582)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
::::::::::::::::::::: :
CCDS87 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQ----G----------------------------------
130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 -------QKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
320 330 340 350 360 370
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
380 390 400 410 420 430
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPKDCVSCRNVSRGRECVDKCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS87 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPRDCVSCRNVSRGRECVDKCN
440 450 460 470 480 490
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
500 510 520 530 540 550
610 620
pF1KE2 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGS
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGCTGPGLEGCPTNGPKIPSIATGMVGALLLLLVV
560 570 580 590 600 610
>>CCDS47587.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7 (405 aa)
initn: 2904 init1: 2815 opt: 2815 Z-score: 2346.9 bits: 443.8 E(33420): 2.2e-124
Smith-Waterman score: 2815; 99.8% identity (100.0% similar) in 404 aa overlap (1-404:1-404)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS47 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGLS
370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
>>CCDS42811.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs109|chr2 (1292 aa)
initn: 1728 init1: 967 opt: 2195 Z-score: 1827.5 bits: 349.4 E(33420): 1.8e-95
Smith-Waterman score: 2195; 47.4% identity (76.1% similar) in 631 aa overlap (1-627:1-624)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
:.:. :. . ..::.: . . . ..:: :: :::..:. .:... .:.....::::
CCDS42 MKPA-TGLWVWVSLLVA-AGTVQPSDSQSVCAGTENKLSSLSDLEQQYRALRKYYENCEV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
:.:::::: ...: :::::....::.::::.::: . .:::::.::::. ::. ::::
CCDS42 VMGNLEITSIEHNRDLSFLRSVREVTGYVLVALNQFRYLPLENLRIIRGTKLYEDRYALA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE2 VLSNY--DANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSM
.. :: :.: ::.:: ..:: :::.:.: ..: :: ...:.:.::: . . ::...
CCDS42 IFLNYRKDGN-FGLQELGLKNLTEILNGGVYVDQNKFLCYADTIHWQDIVRNPWPSNLTL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 DFQNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAA
: ..: .: :: .: ::: :..:: ::. .::.::.::: : ::::: .::.
CCDS42 VSTNGSSGCGRCHKSC-TGRCWGPTENHCQTLTRTVCAEQCDGRCYGPYVSDCCHRECAG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 GCTGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRN
::.::...::..: .: : ..: :: ..:::::.:.. : ..::..:: ::::::.:
CCDS42 GCSGPKDTDCFACMNFNDSGACVTQCPQTFVYNPTTFQLEHNFNAKYTYGAFCVKKCPHN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 YVVTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKH
.:: : .:::::: ....:.::.:.. :: : : :.:.::: : . .. .....:: .
CCDS42 FVV-DSSSCVRACPSSKMEVEENGIKMCKPCTDICPKACDGIGTGSLMSAQTVDSSNIDK
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 FKNCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLH
: :::.:.:.: .: ....:: .. .::..:....::.:::::: ::.:: : ::.
CCDS42 FINCTKINGNLIFLVTGIHGDPYNAIEAIDPEKLNVFRTVREITGFLNIQSWPPNMTDFS
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 AFENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWK
.: :: : ::. : : . . .:::: ..:::::: :.. :. :.:::: .::::
CCDS42 VFSNLVTIGGRVLYSGLSLLILKQQGITSLQFQSLKEISAGNIYITDNSNLCYYHTINWT
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 KLFGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPKDCVSCRNVSRGRECVDK
::.: .:. : .:: ..: : :.::. ::: .::::: : .:.::: :::: :...
CCDS42 TLFSTINQRIVIRDNRKAENCTAEGMVCNHLCSSDGCWGPGPDQCLSCRRFSRGRICIES
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 CNLLEGEPREFVENSECIQCHPEC--LPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCP
::: .:: ::: ..: :..: :.: . ... .:: : ::::: .:.:. :::.::. ::
CCDS42 CNLYDGEFREFENGSICVECDPQCEKMEDGL-LTCHGPGPDNCTKCSHFKDGPNCVEKCP
540 550 560 570 580 590
600 610 620
pF1KE2 AGVMGENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGS
:..: : ....:::: . :: :::::: :
CCDS42 DGLQGAN-SFIFKYADPDRECHPCHPNCTQGCNGPTSHDCIYYPWTGHSTLPQHARTPLI
600 610 620 630 640 650
CCDS42 AAGVIGGLFILVIVGLTFAVYVRRKSIKKKRALRRFLETELVEPLTPSGTAPNQAQLRIL
660 670 680 690 700 710
>>CCDS2394.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs109|chr2 (1308 aa)
initn: 1728 init1: 967 opt: 2195 Z-score: 1827.4 bits: 349.4 E(33420): 1.9e-95
Smith-Waterman score: 2195; 47.4% identity (76.1% similar) in 631 aa overlap (1-627:1-624)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
:.:. :. . ..::.: . . . ..:: :: :::..:. .:... .:.....::::
CCDS23 MKPA-TGLWVWVSLLVA-AGTVQPSDSQSVCAGTENKLSSLSDLEQQYRALRKYYENCEV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
:.:::::: ...: :::::....::.::::.::: . .:::::.::::. ::. ::::
CCDS23 VMGNLEITSIEHNRDLSFLRSVREVTGYVLVALNQFRYLPLENLRIIRGTKLYEDRYALA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE2 VLSNY--DANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSM
.. :: :.: ::.:: ..:: :::.:.: ..: :: ...:.:.::: . . ::...
CCDS23 IFLNYRKDGN-FGLQELGLKNLTEILNGGVYVDQNKFLCYADTIHWQDIVRNPWPSNLTL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 DFQNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAA
: ..: .: :: .: ::: :..:: ::. .::.::.::: : ::::: .::.
CCDS23 VSTNGSSGCGRCHKSC-TGRCWGPTENHCQTLTRTVCAEQCDGRCYGPYVSDCCHRECAG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 GCTGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRN
::.::...::..: .: : ..: :: ..:::::.:.. : ..::..:: ::::::.:
CCDS23 GCSGPKDTDCFACMNFNDSGACVTQCPQTFVYNPTTFQLEHNFNAKYTYGAFCVKKCPHN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 YVVTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKH
.:: : .:::::: ....:.::.:.. :: : : :.:.::: : . .. .....:: .
CCDS23 FVV-DSSSCVRACPSSKMEVEENGIKMCKPCTDICPKACDGIGTGSLMSAQTVDSSNIDK
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 FKNCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLH
: :::.:.:.: .: ....:: .. .::..:....::.:::::: ::.:: : ::.
CCDS23 FINCTKINGNLIFLVTGIHGDPYNAIEAIDPEKLNVFRTVREITGFLNIQSWPPNMTDFS
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 AFENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWK
.: :: : ::. : : . . .:::: ..:::::: :.. :. :.:::: .::::
CCDS23 VFSNLVTIGGRVLYSGLSLLILKQQGITSLQFQSLKEISAGNIYITDNSNLCYYHTINWT
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 KLFGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPKDCVSCRNVSRGRECVDK
::.: .:. : .:: ..: : :.::. ::: .::::: : .:.::: :::: :...
CCDS23 TLFSTINQRIVIRDNRKAENCTAEGMVCNHLCSSDGCWGPGPDQCLSCRRFSRGRICIES
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 CNLLEGEPREFVENSECIQCHPEC--LPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCP
::: .:: ::: ..: :..: :.: . ... .:: : ::::: .:.:. :::.::. ::
CCDS23 CNLYDGEFREFENGSICVECDPQCEKMEDGL-LTCHGPGPDNCTKCSHFKDGPNCVEKCP
540 550 560 570 580 590
600 610 620
pF1KE2 AGVMGENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGS
:..: : ....:::: . :: :::::: :
CCDS23 DGLQGAN-SFIFKYADPDRECHPCHPNCTQGCNGPTSHDCIYYPWTGHSTLPQHARTPLI
600 610 620 630 640 650
CCDS23 AAGVIGGLFILVIVGLTFAVYVRRKSIKKKRALRRFLETELVEPLTPSGTAPNQAQLRIL
660 670 680 690 700 710
>>CCDS31833.1 ERBB3 gene_id:2065|Hs109|chr12 (1342 aa)
initn: 1670 init1: 539 opt: 2085 Z-score: 1736.2 bits: 332.5 E(33420): 2.2e-90
Smith-Waterman score: 2085; 45.2% identity (74.4% similar) in 621 aa overlap (11-627:9-620)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
.:.:: .: .:.. . . :: :: : :. : :... .: .... :::
CCDS31 MRANDALQVLGLLFSLARGSEVGNSQAVCPGTLNGLSVTGDAENQYQTLYKLYERCEV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
:.:::::. . .: :::::. :.::.::::.:.: .:: ::...::.. :....:.
CCDS31 VMGNLEIVLTGHNADLSFLQWIREVTGYVLVAMNEFSTLPLPNLRVVRGTQVYDGKFAIF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE2 VLSNYDANKT-GLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMD
:. ::..:.. .:..: . .: ::: :.: . .: ::....:.::::: . . .
CCDS31 VMLNYNTNSSHALRQLRLTQLTEILSGGVYIEKNDKLCHMDTIDWRDIVRD---RDAEIV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 FQNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAG
... :: : : .: ::: : :.:: ::: ::: ::.:.: : .:..:::..::.:
CCDS31 VKDNGRSCPPCHEVC-KGRCWGPGSEDCQTLTKTICAPQCNGHCFGPNPNQCCHDECAGG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 CTGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNY
:.::...::..::.: : ..: :: ..:: :.:.. ::. ::..:..:: .::.:.
CCDS31 CSGPQDTDCFACRHFNDSGACVPRCPQPLVYNKLTFQLEPNPHTKYQYGGVCVASCPHNF
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 VVTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIG-EFKDSLSINATNIKH
:: :. :::::: :..:....:.. :. : : : :.:.: : : .:. .....::
CCDS31 VV-DQTSCVRACPPDKMEVDKNGLKMCEPCGGLCPKACEGTGSGSRFQ---TVDSSNIDG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 FKNCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLH
: :::.: :.: .: ... :: . . : :::..:....::.::::.: ::.:: . ..
CCDS31 FVNCTKILGNLDFLITGLNGDPWHKIPALDPEKLNVFRTVREITGYLNIQSWPPHMHNFS
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 AFENLEIIRGRTKQHGQFSLAVV-SLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINW
.: :: : ::. . ::: .. .::.::::.::::::: : . ::.:..::: ...::
CCDS31 VFSNLTTIGGRSLYNRGFSLLIMKNLNVTSLGFRSLKEISAGRIYISANRQLCYHHSLNW
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 KKLF-GTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPKDCVSCRNVSRGRECV
:.. : . .. : :: . .: : :.:: ::: ::::: : .:.:::: ::: ::
CCDS31 TKVLRGPTEERLDIKHNRPRRDCVAEGKVCDPLCSSGGCWGPGPGQCLSCRNYSRGGVCV
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 DKCNLLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCP
.::.:.::::::....::..::::: :. . ::.: : :.: ::::. ::::::..::
CCDS31 THCNFLNGEPREFAHEAECFSCHPECQPMEGTATCNGSGSDTCAQCAHFRDGPHCVSSCP
540 550 560 570 580 590
600 610 620
pF1KE2 AGVMGENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGS
::.: .. ..:: :. . :. :: ::: :
CCDS31 HGVLGAKGP-IYKYPDVQNECRPCHENCTQGCKGPELQDCLGQTLVLIGKTHLTMALTVI
600 610 620 630 640
CCDS31 AGLVVIFMMLGGTFLYWRGRRIQNKRAMRRYLERGESIEPLDPSEKANKVLARIFKETEL
650 660 670 680 690 700
>>CCDS77017.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs109|chr17 (603 aa)
initn: 1414 init1: 1137 opt: 1721 Z-score: 1438.8 bits: 276.3 E(33420): 8.3e-74
Smith-Waterman score: 1982; 44.0% identity (71.8% similar) in 602 aa overlap (37-626:2-602)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 AGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEVVLGNLE
:: .. : :. :......:.:: ::::
CCDS77 MKLRLPASPETHLDMLRHLYQGCQVVQGNLE
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 ITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALAVLSNYD
.::. : .::::. :::: :::::: : :...::. :.:.::.. .:..::::::.: :
CCDS77 LTYLPTNASLSFLQDIQEVQGYVLIAHNQVRQVPLQRLRIVRGTQLFEDNYALAVLDNGD
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170
pF1KE2 ----------ANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNM
:. ::.:: .:.: :::.:.: .. :: :: ..: :.:: .. .
CCDS77 PLNNTTPVTGASPGGLRELQLRSLTEILKGGVLIQRNPQLCYQDTILWKDIFHKNNQLAL
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 SMDFQNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQC
.. :. .:. :.: : .. ::: . :.::.::. .:: :. ::.: :.::::.::
CCDS77 TLIDTNRSRACHPCSPMCKGSRCWGESSEDCQSLTRTVCAGGCA-RCKGPLPTDCCHEQC
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 AAGCTGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCP
:::::::..::::.: .: . :. :: :. :: :.. ::::.:.:::.:: ::
CCDS77 AAGCTGPKHSDCLACLHFNHSGICELHCPALVTYNTDTFESMPNPEGRYTFGASCVTACP
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 RNYVVTDHGSCVRACGADSYEME-EDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATN
::. :: :::. .: . :. :::...:.:: :: .:: :.:. .... .....:
CCDS77 YNYLSTDVGSCTLVCPLHNQEVTAEDGTQRCEKCSKPCARVCYGLGMEHLREVRAVTSAN
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 IKHFKNCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRT
:..: .: .: :.: .:: .: :: ..: ::.:..:....:..::::.: :.:::..
CCDS77 IQEFAGCKKIFGSLAFLPESFDGDPASNTAPLQPEQLQVFETLEEITGYLYISAWPDSLP
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 DLHAFENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTI
:: .:.::..:::: ..: .::.. .:.:. ::::::.:...: ..: : .::...:.
CCDS77 DLSVFQNLQVIRGRILHNGAYSLTLQGLGISWLGLRSLRELGSGLALIHHNTHLCFVHTV
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 NWKKLFGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPKDCVSCRNVSRGREC
: .:: . : .:: :. : . : .:: ::. :::: : .::.: . ::.::
CCDS77 PWDQLFRNPHQALLHTANRPEDECVGEGLACHQLCARGHCWGPGPTQCVNCSQFLRGQEC
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 VDKCNLLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTC
:..: .:.: :::.:. .:. ::::: :: ..:: : :.:. :::: : : :: :
CCDS77 VEECRVLQGLPREYVNARHCLPCHPECQPQNGSVTCFGPEADQCVACAHYKDPPFCVARC
520 530 540 550 560 570
600 610 620
pF1KE2 PAGVMGENNTL-VWKYADAGHVCHLCHPNCTYGS
:.:: . . . .::. : .:. : :::.
CCDS77 PSGVKPDLSYMPIWKFPDEEGACQPCPINCTHS
580 590 600
628 residues in 1 query sequences
18921897 residues in 33420 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Feb 19 20:37:45 2021 done: Fri Feb 19 20:37:45 2021
Total Scan time: 1.570 Total Display time: 0.180
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]