Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2759
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2759, 782 aa
1>>>pF1KE2759 782 - 782 aa - 782 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
64322969 residues in 92188 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5858+/-0.000371; mu= 24.2712+/- 0.023
mean_var=59.2260+/-11.663, 0's: 0 Z-trim(112.4): 96 B-trim: 94 in 1/49
Lambda= 0.166655
statistics sampled from 22074 (22170) to 22074 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.592), E-opt: 0.2 (0.24), width: 16
Scan time: 5.300
The best scores are: opt bits E(92188)
XP_011518584 (OMIM: 610110,615034) anoctamin-3 iso ( 515) 1180 292.5 3.3e-78
XP_024304609 (OMIM: 610111) anoctamin-4 isoform X9 ( 784) 1074 267.2 2.1e-70
XP_016874304 (OMIM: 610111) anoctamin-4 isoform X9 ( 784) 1074 267.2 2.1e-70
XP_016874306 (OMIM: 610111) anoctamin-4 isoform X9 ( 784) 1074 267.2 2.1e-70
XP_024304610 (OMIM: 610111) anoctamin-4 isoform X9 ( 784) 1074 267.2 2.1e-70
XP_016874303 (OMIM: 610111) anoctamin-4 isoform X9 ( 784) 1074 267.2 2.1e-70
XP_016874302 (OMIM: 610111) anoctamin-4 isoform X8 ( 861) 1074 267.2 2.3e-70
XP_016874301 (OMIM: 610111) anoctamin-4 isoform X7 ( 896) 1074 267.2 2.4e-70
XP_016874300 (OMIM: 610111) anoctamin-4 isoform X6 ( 905) 1074 267.2 2.4e-70
XP_016874297 (OMIM: 610111) anoctamin-4 isoform X3 ( 920) 1074 267.2 2.4e-70
XP_011536216 (OMIM: 610111) anoctamin-4 isoform X3 ( 920) 1074 267.2 2.4e-70
XP_016874299 (OMIM: 610111) anoctamin-4 isoform X3 ( 920) 1074 267.2 2.4e-70
NP_849148 (OMIM: 610111) anoctamin-4 isoform 2 [Ho ( 920) 1074 267.2 2.4e-70
NP_001273544 (OMIM: 610111) anoctamin-4 isoform 1 ( 955) 1074 267.2 2.5e-70
NP_001273545 (OMIM: 610111) anoctamin-4 isoform 1 ( 955) 1074 267.2 2.5e-70
XP_011536218 (OMIM: 610111) anoctamin-4 isoform X5 (1005) 1074 267.2 2.6e-70
XP_011536217 (OMIM: 610111) anoctamin-4 isoform X4 (1062) 1074 267.3 2.7e-70
XP_011536215 (OMIM: 610111) anoctamin-4 isoform X2 (1106) 1074 267.3 2.8e-70
XP_011536213 (OMIM: 610111) anoctamin-4 isoform X1 (1121) 1074 267.3 2.8e-70
XP_011536214 (OMIM: 610111) anoctamin-4 isoform X1 (1121) 1074 267.3 2.8e-70
XP_005268764 (OMIM: 262890,608663) anoctamin-6 iso ( 877) 1038 258.5 9.4e-68
NP_001136150 (OMIM: 262890,608663) anoctamin-6 iso ( 892) 1038 258.5 9.5e-68
XP_005268763 (OMIM: 262890,608663) anoctamin-6 iso ( 899) 1038 258.5 9.6e-68
NP_001020527 (OMIM: 262890,608663) anoctamin-6 iso ( 910) 1038 258.6 9.7e-68
NP_001191732 (OMIM: 262890,608663) anoctamin-6 iso ( 931) 1038 258.6 9.8e-68
XP_011518251 (OMIM: 166260,608662,611307,613319) a ( 882) 979 244.4 1.8e-63
XP_005252879 (OMIM: 166260,608662,611307,613319) a ( 887) 979 244.4 1.8e-63
XP_005252878 (OMIM: 166260,608662,611307,613319) a ( 898) 979 244.4 1.8e-63
XP_005252877 (OMIM: 166260,608662,611307,613319) a ( 899) 979 244.4 1.8e-63
NP_001136121 (OMIM: 166260,608662,611307,613319) a ( 912) 979 244.4 1.8e-63
NP_998764 (OMIM: 166260,608662,611307,613319) anoc ( 913) 979 244.4 1.8e-63
XP_006718668 (OMIM: 610108) anoctamin-1 isoform X1 ( 840) 971 242.4 6.4e-63
XP_006718667 (OMIM: 610108) anoctamin-1 isoform X1 ( 892) 971 242.4 6.7e-63
NP_001136151 (OMIM: 262890,608663) anoctamin-6 iso ( 929) 971 242.4 6.9e-63
XP_011543430 (OMIM: 610108) anoctamin-1 isoform X9 ( 956) 971 242.5 7.1e-63
XP_011543429 (OMIM: 610108) anoctamin-1 isoform X8 ( 960) 971 242.5 7.1e-63
XP_011543428 (OMIM: 610108) anoctamin-1 isoform X7 ( 978) 971 242.5 7.2e-63
XP_011543431 (OMIM: 610108) anoctamin-1 isoform X1 ( 979) 971 242.5 7.2e-63
XP_006718665 (OMIM: 610108) anoctamin-1 isoform X1 ( 980) 971 242.5 7.2e-63
XP_011543427 (OMIM: 610108) anoctamin-1 isoform X5 ( 982) 971 242.5 7.2e-63
XP_016873446 (OMIM: 610108) anoctamin-1 isoform X6 ( 982) 971 242.5 7.2e-63
XP_016873445 (OMIM: 610108) anoctamin-1 isoform X4 ( 985) 971 242.5 7.3e-63
NP_060513 (OMIM: 610108) anoctamin-1 [Homo sapiens ( 986) 971 242.5 7.3e-63
XP_011543426 (OMIM: 610108) anoctamin-1 isoform X3 (1004) 971 242.5 7.4e-63
XP_011543425 (OMIM: 610108) anoctamin-1 isoform X2 (1007) 971 242.5 7.4e-63
XP_011543423 (OMIM: 610108) anoctamin-1 isoform X1 (1008) 971 242.5 7.4e-63
XP_024304849 (OMIM: 610109) anoctamin-2 isoform X1 ( 546) 957 238.9 4.8e-62
XP_024304848 (OMIM: 610109) anoctamin-2 isoform X1 ( 546) 957 238.9 4.8e-62
XP_024304850 (OMIM: 610109) anoctamin-2 isoform X1 ( 546) 957 238.9 4.8e-62
XP_024304847 (OMIM: 610109) anoctamin-2 isoform X1 ( 553) 957 238.9 4.8e-62
>>XP_011518584 (OMIM: 610110,615034) anoctamin-3 isoform (515 aa)
initn: 1292 init1: 559 opt: 1180 Z-score: 1525.7 bits: 292.5 E(92188): 3.3e-78
Smith-Waterman score: 1276; 41.9% identity (70.5% similar) in 492 aa overlap (278-748:17-492)
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 RLSETCTFAKLTHLFDNDGTVVFAIFMALWATVFLEIWKRQRARVVLHWDLYVWDEEQEE
::::::.:::.:. .. ::: :.::.:
XP_011 MECKESAQLIGPRKEQATVFLEFWKRRRSILTYTWDLIEWEEEEET
10 20 30 40
310 320 330 340 350
pF1KE2 M---------ALQLINCPDYKLRPYQHSYLRSTVILVLT---LLMICLMIGMAHVLVVYR
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XP_011 LRPQFEAKYYKMEIVNPITGKPEPHQPSSDKVTRLLVSVSGIFFMISLVITAVFGVVVYR
50 60 70 80 90 100
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 VLASALFSSSAVPFLEEQVTTAVVVTGALVHYVTIIIMTKINRCVALKLCDFEMPRTFSE
... :.: :... :. .... .... :.... . .: : ..:.::: ::
XP_011 LVVMEQFASFKWNFIKQYWQFATSAAAVCINFIIIMLLNLAYEKIAYLLTNLEYPRTESE
110 120 130 140 150 160
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 RESRFTIRFFTLQFFTHFSSLIYIAFILGRINGHPGKSTRLAGLWKLEECHASGCMMDLF
:. :....: .:: . ::..::::.:::. ::::: ..: :.::::: :::..::
XP_011 WENSFALKMFLFQFVNLNSSIFYIAFFLGRFVGHPGKYNKLFDRWRLEECHPSGCLIDLC
170 180 190 200 210 220
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 VQMAIIMGLKQTLSNCVEYLVP-----WVTHKCRSLRASESGHLPRDPELRDWRRNYLLN
.::..:: ::: .: .: : : :: . :. ... .:. :. .. :.
XP_011 LQMGVIMFLKQIWNNFMELGYPLIQNWWSRHKIK--RGIHDASIPQ------WENDWNLQ
230 240 250 260 270
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 PVNTFSLFDEFMEMMIQYGFTTIFVAAFPLAPLLALFSNLVEIRLDAIKMVWLQRRLVPR
:.: .:.::..::..:.::::::::::::::::::..:..:::::: :.: :: .:
XP_011 PMNLHGLMDEYLEMVLQFGFTTIFVAAFPLAPLLALLNNIIEIRLDAYKFVTQWRRPLPA
280 290 300 310 320 330
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 KAKDIGTWLQVLETIGVLAVIANGMVIAFTSEFIPRVVYKYRYSPCLKEGNSTVDCLKGY
.: ::: :: .:: ::.::::.:..:::.::..::: ::.:.:.:: .. . . .:::::
XP_011 RATDIGIWLGILEGIGILAVITNAFVIAITSDYIPRFVYEYKYGPCANHVEPSENCLKGY
340 350 360 370 380 390
660 670 680 690 700
pF1KE2 VNHSLSVFHTKDFQDPDGIEGSENVTLCRYRDYRNPP----DYNFSEQFWFLLAIRLAFV
::.::: : ... : . :::::::.:: :.:. :.: .:: ::::.
XP_011 VNNSLSFFDLSEL-------GMGKSGYCRYRDYRGPPWSSKPYEFTLQYWHILAARLAFI
400 410 420 430 440 450
710 720 730 740 750 760
pF1KE2 ILFEHVALCIKLIAAWFVPDIPQSVKNKVLEVKYQRLREKMWHGRQRLGGVGAGSRPPMP
:.:::... :: . :...::.:....... . :: ..: :.
XP_011 IVFEHLVFGIKSFIAYLIPDVPKGLHDRIRREKYL-VQEMMYEAELEHLQQQRRKSGQPV
460 470 480 490 500 510
770 780
pF1KE2 AHPTPASIFSARSTDV
XP_011 HHEWP
>>XP_024304609 (OMIM: 610111) anoctamin-4 isoform X9 [Ho (784 aa)
initn: 1922 init1: 998 opt: 1074 Z-score: 1385.4 bits: 267.2 E(92188): 2.1e-70
Smith-Waterman score: 1920; 44.3% identity (72.3% similar) in 679 aa overlap (119-754:89-765)
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 LYRTLLLEPEGPAPHAELAAPTTIPVTTSLRIRIVNFVVMNNKTSAGET---FEDLMKDG
: :::. ... : :.. .. :. .:
XP_024 ENDCYTAPFSQQRIHHFIIHNKETFFNNATRSRIVHHILQRIKYEEGKNKIGLNRLLTNG
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180
pF1KE2 VFEARFPLHKGEGRLKKT----------------WARWRHMFREQPVDEIRNYFGEKVAL
.:: ::::.: : :.. :: : .. ::.: .: :::::..:
XP_024 SYEAAFPLHEGSYRSKNSIRTHGAENHRHLLYECWASWGVWYKYQPLDLVRRYFGEKIGL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 YFVWLGWYTYMLVPAALTGLLVFLSGFSLFEASQISKEICEAHDILMCPLGDHSRRYQRL
::.:::::: :: :::. ::.::: : . .. ::.:::.:.: ::.:::. :. ..::
XP_024 YFAWLGWYTGMLFPAAFIGLFVFLYGVTTLDHSQVSKEVCQATDIIMCPVCDKYCPFMRL
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250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SETCTFAKLTHLFDNDGTVVFAIFMALWATVFLEIWKRQRARVVLHWDLYVWDEEQEEMA
:..:..::.:::::: .:: ::.:::.:::::::.:::.:: .. ::: :.::.::.
XP_024 SDSCVYAKVTHLFDNGATVFFAVFMAVWATVFLEFWKRRRAVIAYDWDLIDWEEEEEEIR
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KE2 LQL---------INCPDYKLRPYQHSYLRSTVILVLT---LLMICLMIGMAHVLVVYRVL
:. .: . : .::: . . ..: . ..:::..:. . .:.:::.
XP_024 PQFEAKYSKKERMNPISGKPEPYQAFTDKCSRLIVSASGIFFMICVVIAAVFGIVIYRVV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 ASALFSSSAVPFLEEQVTTAVVVTGALVHYVTIIIMTKINRCVALKLCDFEMPRTFSERE
. . :.. ..... .:.. :.. ... :.... . . ::: : ..:.::: :: :
XP_024 TVSTFAAFKWALIRNNSQVATTGTAVCINFCIIMLLNVLYEKVALLLTNLEQPRTESEWE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 SRFTIRFFTLQFFTHFSSLIYIAFILGRINGHPGKSTRLAGLWKLEECHASGCMMDLFVQ
. ::...: .:: . :: .::::.:::..:::: :: . :.::::: :::..:: .:
XP_024 NSFTLKMFLFQFVNLNSSTFYIAFFLGRFTGHPGAYLRLINRWRLEECHPSGCLIDLCMQ
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 MAIIMGLKQTLSNCVEYLVPWVTHKCRSLRASESGHLP-RDPELRDWRRNYLLNPVNTFS
:.::: :::: .: .: : . . . : .. : : : . .:...: :.:.:...
XP_024 MGIIMVLKQTWNNFMELGYPLIQNW-WTRRKVRQEHGPERKISFPQWEKDYNLQPMNAYG
480 490 500 510 520 530
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pF1KE2 LFDEFMEMMIQYGFTTIFVAAFPLAPLLALFSNLVEIRLDAIKMVWLQRRLVPRKAKDIG
::::..::..:.::::::::::::::::::..:..:::::: :.: :: . .:::::
XP_024 LFDEYLEMILQFGFTTIFVAAFPLAPLLALLNNIIEIRLDAYKFVTQWRRPLASRAKDIG
540 550 560 570 580 590
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pF1KE2 TWLQVLETIGVLAVIANGMVIAFTSEFIPRVVYKYRYSPCLKEGNSTVDCLKGYVNHSLS
: .:: ::.:.::.:..:::.::.::::.:: :.:.:: .:.. :. :::: :::
XP_024 IWYGILEGIGILSVITNAFVIAITSDFIPRLVYAYKYGPCAGQGEAGQKCMVGYVNASLS
600 610 620 630 640 650
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pF1KE2 VFHTKDFQD---P--DGIEGSEN-VTLCRYRDYRNPPD----YNFSEQFWFLLAIRLAFV
::. .::.. : :: : : . . :::::::.:: :... ::: .:: ::::.
XP_024 VFRISDFENRSEPESDGSEFSGTPLKYCRYRDYRDPPHSLVPYGYTLQFWHVLAARLAFI
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KE2 ILFEHVALCIKLIAAWFVPDIPQSVKNKVLEVKYQRLREKMWHGR-QRLGGVGAGSRPPM
:.:::...::: . ....::.:....... . :: ..: :.... .::
XP_024 IVFEHLVFCIKHLISYLIPDLPKDLRDRMRREKYL-IQEMMYEAELERLQKERKERKKNG
720 730 740 750 760 770
770 780
pF1KE2 PAHPTPASIFSARSTDV
XP_024 KAHHNEWP
780
>>XP_016874304 (OMIM: 610111) anoctamin-4 isoform X9 [Ho (784 aa)
initn: 1922 init1: 998 opt: 1074 Z-score: 1385.4 bits: 267.2 E(92188): 2.1e-70
Smith-Waterman score: 1920; 44.3% identity (72.3% similar) in 679 aa overlap (119-754:89-765)
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 LYRTLLLEPEGPAPHAELAAPTTIPVTTSLRIRIVNFVVMNNKTSAGET---FEDLMKDG
: :::. ... : :.. .. :. .:
XP_016 ENDCYTAPFSQQRIHHFIIHNKETFFNNATRSRIVHHILQRIKYEEGKNKIGLNRLLTNG
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180
pF1KE2 VFEARFPLHKGEGRLKKT----------------WARWRHMFREQPVDEIRNYFGEKVAL
.:: ::::.: : :.. :: : .. ::.: .: :::::..:
XP_016 SYEAAFPLHEGSYRSKNSIRTHGAENHRHLLYECWASWGVWYKYQPLDLVRRYFGEKIGL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 YFVWLGWYTYMLVPAALTGLLVFLSGFSLFEASQISKEICEAHDILMCPLGDHSRRYQRL
::.:::::: :: :::. ::.::: : . .. ::.:::.:.: ::.:::. :. ..::
XP_016 YFAWLGWYTGMLFPAAFIGLFVFLYGVTTLDHSQVSKEVCQATDIIMCPVCDKYCPFMRL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SETCTFAKLTHLFDNDGTVVFAIFMALWATVFLEIWKRQRARVVLHWDLYVWDEEQEEMA
:..:..::.:::::: .:: ::.:::.:::::::.:::.:: .. ::: :.::.::.
XP_016 SDSCVYAKVTHLFDNGATVFFAVFMAVWATVFLEFWKRRRAVIAYDWDLIDWEEEEEEIR
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:. .: . : .::: . . ..: . ..:::..:. . .:.:::.
XP_016 PQFEAKYSKKERMNPISGKPEPYQAFTDKCSRLIVSASGIFFMICVVIAAVFGIVIYRVV
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pF1KE2 ASALFSSSAVPFLEEQVTTAVVVTGALVHYVTIIIMTKINRCVALKLCDFEMPRTFSERE
. . :.. ..... .:.. :.. ... :.... . . ::: : ..:.::: :: :
XP_016 TVSTFAAFKWALIRNNSQVATTGTAVCINFCIIMLLNVLYEKVALLLTNLEQPRTESEWE
360 370 380 390 400 410
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pF1KE2 SRFTIRFFTLQFFTHFSSLIYIAFILGRINGHPGKSTRLAGLWKLEECHASGCMMDLFVQ
. ::...: .:: . :: .::::.:::..:::: :: . :.::::: :::..:: .:
XP_016 NSFTLKMFLFQFVNLNSSTFYIAFFLGRFTGHPGAYLRLINRWRLEECHPSGCLIDLCMQ
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 MAIIMGLKQTLSNCVEYLVPWVTHKCRSLRASESGHLP-RDPELRDWRRNYLLNPVNTFS
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pF1KE2 PAHPTPASIFSARSTDV
XP_016 KAHHNEWP
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782 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]