Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2738
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2738, 1192 aa
1>>>pF1KE2738 1192 - 1192 aa - 1192 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
65279912 residues in 92274 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.0915+/-0.000439; mu= -10.5879+/- 0.028
mean_var=617.3936+/-123.617, 0's: 0 Z-trim(125.3): 181 B-trim: 0 in 0/59
Lambda= 0.051617
statistics sampled from 50436 (50634) to 50436 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.798), E-opt: 0.2 (0.549), width: 16
Scan time: 10.050
The best scores are: opt bits E(92274)
NP_001116244 (OMIM: 605476) arf-GAP with GTPase, A (1192) 7921 605.9 5.4e-172
XP_016874261 (OMIM: 605476) arf-GAP with GTPase, A (1192) 7921 605.9 5.4e-172
XP_005268682 (OMIM: 605476) arf-GAP with GTPase, A (1172) 5679 438.9 9.6e-122
XP_005268683 (OMIM: 605476) arf-GAP with GTPase, A ( 856) 5253 407.0 2.8e-112
NP_055585 (OMIM: 605476) arf-GAP with GTPase, ANK ( 836) 3011 240.1 4.9e-62
XP_016858771 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, A (1106) 1974 163.0 1.1e-38
XP_011514082 (OMIM: 616813) arf-GAP with GTPase, A ( 683) 1914 158.3 1.7e-37
NP_114152 (OMIM: 616813) arf-GAP with GTPase, ANK ( 911) 1914 158.4 2e-37
NP_001032208 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, A ( 857) 1875 155.5 1.5e-36
XP_011508849 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, A (1126) 1875 155.6 1.8e-36
NP_001337032 (OMIM: 616813) arf-GAP with GTPase, A ( 565) 1719 143.7 3.5e-33
XP_011508850 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, A (1098) 1486 126.6 9.1e-28
XP_024308440 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, A (1094) 1484 126.5 1e-27
XP_006712298 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, A ( 882) 1428 122.2 1.6e-26
XP_006712297 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, A ( 886) 1428 122.2 1.6e-26
XP_006712300 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, A (1147) 1428 122.3 1.9e-26
XP_006712302 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, A (1151) 1428 122.3 1.9e-26
NP_055729 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, ANK ( 804) 1305 113.0 8.4e-24
XP_005246116 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, A ( 808) 1305 113.0 8.5e-24
XP_011508851 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, A (1073) 1305 113.2 1e-23
XP_024308446 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, A ( 730) 1284 111.4 2.3e-23
XP_024308444 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, A ( 865) 1280 111.2 3.2e-23
XP_024308447 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, A ( 725) 1275 110.7 3.7e-23
XP_016867224 (OMIM: 616813) arf-GAP with GTPase, A ( 462) 1252 108.8 8.9e-23
NP_001337033 (OMIM: 616813) arf-GAP with GTPase, A ( 462) 1252 108.8 8.9e-23
NP_001268229 (OMIM: 616813) arf-GAP with GTPase, A ( 580) 1252 108.9 1e-22
NP_001337031 (OMIM: 616813) arf-GAP with GTPase, A ( 808) 1252 109.1 1.3e-22
NP_001231817 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, A ( 405) 1085 96.3 4.5e-19
NP_001295234 (OMIM: 616813) arf-GAP with GTPase, A ( 576) 1009 90.8 2.9e-17
NP_001036000 (OMIM: 616813) arf-GAP with GTPase, A ( 396) 988 89.1 6.7e-17
NP_001295233 (OMIM: 616813) arf-GAP with GTPase, A ( 343) 841 78.1 1.2e-13
XP_016857178 (OMIM: 616594) arf-GAP with SH3 domai ( 774) 423 47.3 0.00049
XP_016857177 (OMIM: 616594) arf-GAP with SH3 domai ( 793) 423 47.3 0.00049
XP_016857176 (OMIM: 616594) arf-GAP with SH3 domai ( 883) 423 47.4 0.00053
NP_001137250 (OMIM: 616594) arf-GAP with SH3 domai ( 894) 423 47.4 0.00054
NP_060177 (OMIM: 616594) arf-GAP with SH3 domain, ( 903) 423 47.4 0.00054
XP_016857175 (OMIM: 616594) arf-GAP with SH3 domai ( 905) 423 47.4 0.00054
XP_016857174 (OMIM: 616594) arf-GAP with SH3 domai ( 924) 423 47.4 0.00055
XP_011540057 (OMIM: 616594) arf-GAP with SH3 domai ( 926) 423 47.4 0.00055
NP_001349855 (OMIM: 605953) arf-GAP with SH3 domai (1072) 406 46.2 0.0015
XP_016868957 (OMIM: 605953) arf-GAP with SH3 domai (1073) 406 46.2 0.0015
NP_001349854 (OMIM: 605953) arf-GAP with SH3 domai (1075) 406 46.2 0.0015
XP_006716628 (OMIM: 605953) arf-GAP with SH3 domai (1076) 406 46.2 0.0015
XP_016868956 (OMIM: 605953) arf-GAP with SH3 domai (1087) 406 46.2 0.0015
NP_001234925 (OMIM: 605953) arf-GAP with SH3 domai (1122) 406 46.2 0.0015
XP_006716627 (OMIM: 605953) arf-GAP with SH3 domai (1125) 406 46.2 0.0015
XP_011515355 (OMIM: 605953) arf-GAP with SH3 domai (1125) 406 46.2 0.0015
NP_060952 (OMIM: 605953) arf-GAP with SH3 domain, (1129) 406 46.2 0.0015
XP_006716626 (OMIM: 605953) arf-GAP with SH3 domai (1132) 406 46.2 0.0015
NP_001349853 (OMIM: 605953) arf-GAP with SH3 domai (1132) 406 46.2 0.0015
>>NP_001116244 (OMIM: 605476) arf-GAP with GTPase, ANK r (1192 aa)
initn: 7921 init1: 7921 opt: 7921 Z-score: 3209.5 bits: 605.9 E(92274): 5.4e-172
Smith-Waterman score: 7921; 100.0% identity (100.0% similar) in 1192 aa overlap (1-1192:1-1192)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSRGAGALQRRTTTYLISLTLVKLESVPPPPPSPSAAAAGAAGARGSETGDPGSPRGAEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSRGAGALQRRTTTYLISLTLVKLESVPPPPPSPSAAAAGAAGARGSETGDPGSPRGAEE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 PGKKRHERLFHRQDALWISTSSAGTGGAEPPALSPAPASPARPVSPAPGRRLSLWAVPPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PGKKRHERLFHRQDALWISTSSAGTGGAEPPALSPAPASPARPVSPAPGRRLSLWAVPPG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 PPLSGGLSPDPKPGGAPTSSRRPLLSSPSWGGPEPEGRAGGGIPGSSSPHPGTGSRRLKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PPLSGGLSPDPKPGGAPTSSRRPLLSSPSWGGPEPEGRAGGGIPGSSSPHPGTGSRRLKV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 APPPPAPKPCKTVTTSGAKAGGGKGAGSRLSWPESEGKPRVKGSKSSAGTGASVSAAATA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 APPPPAPKPCKTVTTSGAKAGGGKGAGSRLSWPESEGKPRVKGSKSSAGTGASVSAAATA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 AAAGGGGSTASTSGGVGAGAGARGKLSPRKGKSKTLDNSDLHPGPPAGSPPPLTLPPTPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AAAGGGGSTASTSGGVGAGAGARGKLSPRKGKSKTLDNSDLHPGPPAGSPPPLTLPPTPS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 PATAVTAASAQPPGPAPPITLEPPAPGLKRGREGGRASTRDRKMLKFISGIFTKSTGGPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PATAVTAASAQPPGPAPPITLEPPAPGLKRGREGGRASTRDRKMLKFISGIFTKSTGGPP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 GSGPLPGPPSLSSGSGSRELLGAELRASPKAVINSQEWTLSRSIPELRLGVLGDARSGKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSGPLPGPPSLSSGSGSRELLGAELRASPKAVINSQEWTLSRSIPELRLGVLGDARSGKS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 SLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVLIREEAGAPDAKFSGWADAVIFVFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVLIREEAGAPDAKFSGWADAVIFVFS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 LEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQDRISASSPRVVGDARARALCADMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQDRISASSPRVVGDARARALCADMK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 RCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLLAACKSLPSSPSHSAASTPVAGQAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLLAACKSLPSSPSHSAASTPVAGQAS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 NGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFANRRGSDSEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFANRRGSDSEK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 RSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 THGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSASINGLVKDMSTVQMGEGLEATTPMPSPSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 THGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSASINGLVKDMSTVQMGEGLEATTPMPSPSP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 SPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMVKKQRRKKLTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMVKKQRRKKLTT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 PSKTEGSAGQAEAKRKMWKLKSFGSLRNIYKAEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSKTEGSAGQAEAKRKMWKLKSFGSLRNIYKAEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDA
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 WVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTWASLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTWASLN
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 LGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWESDTRGRAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWESDTRGRAK
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 PSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLLLLAHARHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLLLLAHARHG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 PLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYARQAGSQLCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYARQAGSQLCA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE2 DILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
1150 1160 1170 1180 1190
>>XP_016874261 (OMIM: 605476) arf-GAP with GTPase, ANK r (1192 aa)
initn: 7921 init1: 7921 opt: 7921 Z-score: 3209.5 bits: 605.9 E(92274): 5.4e-172
Smith-Waterman score: 7921; 100.0% identity (100.0% similar) in 1192 aa overlap (1-1192:1-1192)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSRGAGALQRRTTTYLISLTLVKLESVPPPPPSPSAAAAGAAGARGSETGDPGSPRGAEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MSRGAGALQRRTTTYLISLTLVKLESVPPPPPSPSAAAAGAAGARGSETGDPGSPRGAEE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 PGKKRHERLFHRQDALWISTSSAGTGGAEPPALSPAPASPARPVSPAPGRRLSLWAVPPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PGKKRHERLFHRQDALWISTSSAGTGGAEPPALSPAPASPARPVSPAPGRRLSLWAVPPG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 PPLSGGLSPDPKPGGAPTSSRRPLLSSPSWGGPEPEGRAGGGIPGSSSPHPGTGSRRLKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PPLSGGLSPDPKPGGAPTSSRRPLLSSPSWGGPEPEGRAGGGIPGSSSPHPGTGSRRLKV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 APPPPAPKPCKTVTTSGAKAGGGKGAGSRLSWPESEGKPRVKGSKSSAGTGASVSAAATA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 APPPPAPKPCKTVTTSGAKAGGGKGAGSRLSWPESEGKPRVKGSKSSAGTGASVSAAATA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 AAAGGGGSTASTSGGVGAGAGARGKLSPRKGKSKTLDNSDLHPGPPAGSPPPLTLPPTPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AAAGGGGSTASTSGGVGAGAGARGKLSPRKGKSKTLDNSDLHPGPPAGSPPPLTLPPTPS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 PATAVTAASAQPPGPAPPITLEPPAPGLKRGREGGRASTRDRKMLKFISGIFTKSTGGPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PATAVTAASAQPPGPAPPITLEPPAPGLKRGREGGRASTRDRKMLKFISGIFTKSTGGPP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 GSGPLPGPPSLSSGSGSRELLGAELRASPKAVINSQEWTLSRSIPELRLGVLGDARSGKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GSGPLPGPPSLSSGSGSRELLGAELRASPKAVINSQEWTLSRSIPELRLGVLGDARSGKS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 SLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVLIREEAGAPDAKFSGWADAVIFVFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVLIREEAGAPDAKFSGWADAVIFVFS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 LEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQDRISASSPRVVGDARARALCADMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQDRISASSPRVVGDARARALCADMK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 RCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLLAACKSLPSSPSHSAASTPVAGQAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLLAACKSLPSSPSHSAASTPVAGQAS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 NGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFANRRGSDSEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFANRRGSDSEK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 RSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 THGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSASINGLVKDMSTVQMGEGLEATTPMPSPSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 THGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSASINGLVKDMSTVQMGEGLEATTPMPSPSP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 SPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMVKKQRRKKLTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMVKKQRRKKLTT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 PSKTEGSAGQAEAKRKMWKLKSFGSLRNIYKAEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PSKTEGSAGQAEAKRKMWKLKSFGSLRNIYKAEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDA
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 WVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTWASLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTWASLN
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 LGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWESDTRGRAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWESDTRGRAK
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 PSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLLLLAHARHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLLLLAHARHG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 PLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYARQAGSQLCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYARQAGSQLCA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE2 DILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
1150 1160 1170 1180 1190
>>XP_005268682 (OMIM: 605476) arf-GAP with GTPase, ANK r (1172 aa)
initn: 7775 init1: 5679 opt: 5679 Z-score: 2307.3 bits: 438.9 E(92274): 9.6e-122
Smith-Waterman score: 7739; 98.3% identity (98.3% similar) in 1192 aa overlap (1-1192:1-1172)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSRGAGALQRRTTTYLISLTLVKLESVPPPPPSPSAAAAGAAGARGSETGDPGSPRGAEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MSRGAGALQRRTTTYLISLTLVKLESVPPPPPSPSAAAAGAAGARGSETGDPGSPRGAEE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 PGKKRHERLFHRQDALWISTSSAGTGGAEPPALSPAPASPARPVSPAPGRRLSLWAVPPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PGKKRHERLFHRQDALWISTSSAGTGGAEPPALSPAPASPARPVSPAPGRRLSLWAVPPG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 PPLSGGLSPDPKPGGAPTSSRRPLLSSPSWGGPEPEGRAGGGIPGSSSPHPGTGSRRLKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PPLSGGLSPDPKPGGAPTSSRRPLLSSPSWGGPEPEGRAGGGIPGSSSPHPGTGSRRLKV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 APPPPAPKPCKTVTTSGAKAGGGKGAGSRLSWPESEGKPRVKGSKSSAGTGASVSAAATA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 APPPPAPKPCKTVTTSGAKAGGGKGAGSRLSWPESEGKPRVKGSKSSAGTGASVSAAATA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 AAAGGGGSTASTSGGVGAGAGARGKLSPRKGKSKTLDNSDLHPGPPAGSPPPLTLPPTPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AAAGGGGSTASTSGGVGAGAGARGKLSPRKGKSKTLDNSDLHPGPPAGSPPPLTLPPTPS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 PATAVTAASAQPPGPAPPITLEPPAPGLKRGREGGRASTRDRKMLKFISGIFTKSTGGPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PATAVTAASAQPPGPAPPITLEPPAPGLKRGREGGRASTRDRKMLKFISGIFTKSTGGPP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 GSGPLPGPPSLSSGSGSRELLGAELRASPKAVINSQEWTLSRSIPELRLGVLGDARSGKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GSGPLPGPPSLSSGSGSRELLGAELRASPKAVINSQEWTLSRSIPELRLGVLGDARSGKS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 SLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVLIREEAGAPDAKFSGWADAVIFVFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVLIREEAGAPDAKFSGWADAVIFVFS
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pF1KE2 LEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQDRISASSPRVVGDARARALCADMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQDRISASSPRVVGDARARALCADMK
490 500 510 520 530 540
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pF1KE2 RCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLLAACKSLPSSPSHSAASTPVAGQAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLLAACKSLPSSPSHSAASTPVAGQAS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 NGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFANRRGSDSEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFANRRGSDSEK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 RSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 THGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSASINGLVKDMSTVQMGEGLEATTPMPSPSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 THGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSASINGLVKDMSTVQMGEGLEATTPMPSPSP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 SPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMVKKQRRKKLTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMVKKQRRKKLTT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 PSKTEGSAGQAEAKRKMWKLKSFGSLRNIYKAEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDA
:::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PSKTEGSAGQAE--------------------EENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDA
850 860 870 880
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 WVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTWASLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 WVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTWASLN
890 900 910 920 930 940
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 LGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWESDTRGRAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWESDTRGRAK
950 960 970 980 990 1000
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 PSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLLLLAHARHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLLLLAHARHG
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 PLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYARQAGSQLCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYARQAGSQLCA
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE2 DILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
1130 1140 1150 1160 1170
>>XP_005268683 (OMIM: 605476) arf-GAP with GTPase, ANK r (856 aa)
initn: 5251 init1: 5251 opt: 5253 Z-score: 2137.5 bits: 407.0 E(92274): 2.8e-112
Smith-Waterman score: 5253; 99.3% identity (99.5% similar) in 810 aa overlap (383-1192:47-856)
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 TKSTGGPPGSGPLPGPPSLSSGSGSRELLGAELRASPKAVINSQEWTLSRSIPELRLGVL
: : . .::::::::::::::::::::::
XP_005 RRHEVAKQALNRLRKLAERVDDPELQDSIQASLDSIREAVINSQEWTLSRSIPELRLGVL
20 30 40 50 60 70
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 GDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVLIREEAGAPDAKFSGWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVLIREEAGAPDAKFSGWA
80 90 100 110 120 130
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 DAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQDRISASSPRVVGDARA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQDRISASSPRVVGDARA
140 150 160 170 180 190
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 RALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLLAACKSLPSSPSHSAAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLLAACKSLPSSPSHSAAS
200 210 220 230 240 250
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 TPVAGQASNGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TPVAGQASNGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFAN
260 270 280 290 300 310
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 RRGSDSEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RRGSDSEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHP
320 330 340 350 360 370
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 SINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSASINGLVKDMSTVQMGEGLEAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSASINGLVKDMSTVQMGEGLEAT
380 390 400 410 420 430
780 790 800 810 820 830
pF1KE2 TPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMVKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMVKK
440 450 460 470 480 490
840 850 860 870 880 890
pF1KE2 QRRKKLTTPSKTEGSAGQAEAKRKMWKLKSFGSLRNIYKAEENFEFLIVSSTGQTWHFEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QRRKKLTTPSKTEGSAGQAEAKRKMWKLKSFGSLRNIYKAEENFEFLIVSSTGQTWHFEA
500 510 520 530 540 550
900 910 920 930 940 950
pF1KE2 ASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAP
560 570 580 590 600 610
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE2 NPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWE
620 630 640 650 660 670
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE2 SDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLL
680 690 700 710 720 730
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE2 LLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYAR
740 750 760 770 780 790
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE2 QAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
800 810 820 830 840 850
>>NP_055585 (OMIM: 605476) arf-GAP with GTPase, ANK repe (836 aa)
initn: 5105 init1: 3009 opt: 3011 Z-score: 1235.3 bits: 240.1 E(92274): 4.9e-62
Smith-Waterman score: 5071; 96.8% identity (97.0% similar) in 810 aa overlap (383-1192:47-836)
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 TKSTGGPPGSGPLPGPPSLSSGSGSRELLGAELRASPKAVINSQEWTLSRSIPELRLGVL
: : . .::::::::::::::::::::::
NP_055 RRHEVAKQALNRLRKLAERVDDPELQDSIQASLDSIREAVINSQEWTLSRSIPELRLGVL
20 30 40 50 60 70
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 GDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVLIREEAGAPDAKFSGWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVLIREEAGAPDAKFSGWA
80 90 100 110 120 130
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 DAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQDRISASSPRVVGDARA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQDRISASSPRVVGDARA
140 150 160 170 180 190
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 RALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLLAACKSLPSSPSHSAAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLLAACKSLPSSPSHSAAS
200 210 220 230 240 250
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 TPVAGQASNGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 TPVAGQASNGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFAN
260 270 280 290 300 310
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 RRGSDSEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RRGSDSEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHP
320 330 340 350 360 370
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 SINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSASINGLVKDMSTVQMGEGLEAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSASINGLVKDMSTVQMGEGLEAT
380 390 400 410 420 430
780 790 800 810 820 830
pF1KE2 TPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMVKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 TPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMVKK
440 450 460 470 480 490
840 850 860 870 880 890
pF1KE2 QRRKKLTTPSKTEGSAGQAEAKRKMWKLKSFGSLRNIYKAEENFEFLIVSSTGQTWHFEA
:::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
NP_055 QRRKKLTTPSKTEGSAGQAE--------------------EENFEFLIVSSTGQTWHFEA
500 510 520 530
900 910 920 930 940 950
pF1KE2 ASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAP
540 550 560 570 580 590
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE2 NPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 NPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWE
600 610 620 630 640 650
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE2 SDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLL
660 670 680 690 700 710
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE2 LLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYAR
720 730 740 750 760 770
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE2 QAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
780 790 800 810 820 830
>>XP_016858771 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, ANK r (1106 aa)
initn: 2482 init1: 1260 opt: 1974 Z-score: 816.5 bits: 163.0 E(92274): 1.1e-38
Smith-Waterman score: 2693; 44.9% identity (66.4% similar) in 1153 aa overlap (87-1160:6-1087)
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 GAEEPGKKRHERLFHRQDALWISTSSAGTGGAEPPALSPAPASPARPVSPAPG-RRLSLW
:. :: :: : : : . : :.:.
XP_016 MYLLDGSGEPASPPADAMP-RGTPPRKTVYRISVT
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 AVPP---GPPLSGGLSPDPKPGGAPTSSRRPLLSSPSWGGPEPEGRAGGGIPGSSSPHPG
: . : ::: :::.: : .: : ..: : : :.. . : .:.:
XP_016 MVRKEQLAAPGSGG--PDPRPVRRPRPARSP--DAP--GRLEEEAEEAEGAEEPEGPRPR
40 50 60 70 80
180 190 200 210 220
pF1KE2 TGSRR---------LKVAPPPPAPKPCKTVTTSGAKAGGGKGAGSRLSWPESEGKPRVKG
. . : :... : . . . .:. . .: :: : : :.: :.:
XP_016 AWDFRTFRTRSTGQLELGRLRPCARGLEPADLAGSAPAEEEGRGS----PAS-GSPDVEG
90 100 110 120 130 140
230 240 250 260 270
pF1KE2 SKSSAGTGASVSA---AATAAAAG---GGGSTASTSGGVGAGAGARGKLSPRKGKSKTLD
... : :.: .. : : ::: :.::... . . . . ::.
XP_016 ARA-APLRRSLSFRHWSGPEAPQGRTLGGGRRHSSSGSLAWAP------CDEAAAGTTLE
150 160 170 180 190
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 NSDLHPGPPAGSPPPLTLPPTPSPATAVTAASAQPPGPAPPITLE-PPAPGLKRGREG-G
. : . . : . . : :.. . . ::. :.:.: . :
XP_016 PATA-TQPASEKRNTLDVGEVLSKNDALSDLERWERSKSKNRTLDNSDLQRLERARAAAG
200 210 220 230 240 250
340 350 360 370 380
pF1KE2 RASTRDRKMLKFISGIFTKSTGGPPGSGPLP--------GPPSLSSGSGSRELLGAE-LR
... ....:.:.::::.. ::: :.:: : : :: . . . .:: .
XP_016 AGAASEHRLLRFFSGIFARRDGGP-GGGPSPRSGASRPRGYFSLRRAPAEAHSSSAESID
260 270 280 290 300 310
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 ASPK--AVINSQEWTLSRSIPELRLGVLGDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESE----
.::. : .::::::::::.:::..:..:. ::::.:.::.:::.: :. :.
XP_016 GSPRRDAFVNSQEWTLSRSVPELKVGIVGNLASGKSALVHRYLTGTYVQEESPEDMDAGG
320 330 340 350 360 370
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 QYKKEMLVDGQTHLVLIREEAGAPDAKFSGWADAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSL
..:::..::::..:.:::.:.: :.:.:. :.:::::::::::: :::.: . ......
XP_016 RFKKEIVVDGQSYLLLIRDEGGPPEAQFAMWVDAVIFVFSLEDEISFQTVYHYYSRMANY
380 390 400 410 420 430
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 RGEGRGGLALALVGTQDRISASSPRVVGDARARALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQ
:. .. . :.:::::
XP_016 RNTSE--IPLVLVGTQ--------------------------------------------
440
570 580 590 600 610
pF1KE2 EVAQKVVTLRKQQQL-LAACKSLPSSPSHSAA-STPVAG----QASNGGHT-SDYSSSLP
::::.:. ::.::: .. :::::.:::::.. :. :.. :.:::: . ::::::.:
XP_016 -VAQKIVATRKKQQLSIGPCKSLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGGSLSDYSSSVP
450 460 470 480 490 500
620 630 640 650 660 670
pF1KE2 SSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFANRRGSD--SEKRSLDSRGETTG
:.:.....::: .. .: .:: ... .:::..::..:.::: .::..:.::... :
XP_016 STPSTSQKELRIDVPPTA--NTPTPVRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGLESRADSIG
510 520 530 540 550 560
680 690 700 710 720 730
pF1KE2 SGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHSTHGKEMDLLRT
:::::::::..::::::.::::::::::::: .:: : ::::..::....::::.:::::
XP_016 SGRAIPIKQGMLLKRSGKSLNKEWKKKYVTLCDNGVLTYHPSLHDYMQNVHGKEIDLLRT
570 580 590 600 610 620
740 750 760 770 780
pF1KE2 TVKVPGKRPPRAISAFGP--SASINGLVKDMSTVQM----GEGLEATTPMPSPSPSPSSL
:::::::::::: :: .: : . ::: ::::.... :. :. . . . : :.
XP_016 TVKVPGKRPPRATSACAPISSPKTNGLSKDMSSLHISPNSGNVTSASGSQMASGISLVSF
630 640 650 660 670 680
790 800 810 820
pF1KE2 QPPPD---QTSKHLLKPDR-----NLAR-ALSTD-------CT-PS--GDLSPLSREPPP
. :: : : . . :. .: :.:.: :. :: . :: . .:::
XP_016 NSRPDGMHQRSYSVSSADQWSEATVIANSAISSDTGLGDSVCSSPSISSTTSP-KLDPPP
690 700 710 720 730 740
830 840 850 860 870
pF1KE2 SPMV--KKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAEAKRKMWKLKSFGSLRNIYKA-------EENFE
:: . ::.:::: :. :..: .: :::::: :::. :::::::.. :::::
XP_016 SPHANRKKHRRKKSTSNFKADGLSGTAEAKRKAWKLNRVGSLRNIYSSSTNTEEQEENFE
750 760 770 780 790 800
880 890 900 910 920 930
pF1KE2 FLIVSSTGQTWHFEAASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAI
:.::: :::::::::...::::::::::::::::::: ::::: : : :::::.:.:.:
XP_016 FIIVSLTGQTWHFEATTYEERDAWVQAIESQILASLQSCESSKNKSRLTSQSEAMALQSI
810 820 830 840 850 860
940 950 960 970 980 990
pF1KE2 RNAKGNSICVDCGAPNPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTL
:: .::: :::: . ::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::: ::
XP_016 RNMRGNSHCVDCETQNPNWASLNLGALMCIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPVELIK
870 880 890 900 910 920
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE2 VLTAIGNDTANRVWESDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQ
:...:::. :: ::: ...::.::: ::.:::.: :::::::: :::::: .: ::..
XP_016 VMSSIGNELANSVWEESSQGRTKPSVDSTREEKERWIRAKYEQKLFLAPLPCTELSLGQH
930 940 950 960 970 980
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE2 LWAAVQAQDVATVLLLLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADV
: :. .:. :..:::::. . .. . . . :. :::: . ..::..:::.:::.::
XP_016 LLRATADEDLRTAILLLAHGSRDEVNETCGEGDGRTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDV
990 1000 1010 1020 1030 1040
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE2 AARDAQGRTALFYARQAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRS
.::::.: ::: :::::.:: : :.:::.::: : .::.
XP_016 TARDAHGNTALAYARQASSQECIDVLLQYGCPDERFVLMATPNLSRRNNNRNNSSGRVPT
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1180 1190
pF1KE2 SAASVGRADAPVALV
XP_016 II
>>XP_011514082 (OMIM: 616813) arf-GAP with GTPase, ANK r (683 aa)
initn: 2114 init1: 1237 opt: 1914 Z-score: 794.9 bits: 158.3 E(92274): 1.7e-37
Smith-Waterman score: 2291; 53.4% identity (73.7% similar) in 700 aa overlap (510-1173:1-680)
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 SLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQDRISASSPRVVGDARARALCADM
..:::::: :::..:::. :.::: : .:.
XP_011 MVLVGTQDAISAANPRVIDDSRARKLSTDL
10 20 30
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 KRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQL-LAACKSLPSSPSHSA---ASTPV
:::.::::::::::::.::::.::::::.:::.::: .. :::::.:::::: :: :.
XP_011 KRCTYYETCATYGLNVERVFQDVAQKVVALRKKQQLAIGPCKSLPNSPSHSAVSAASIPA
40 50 60 70 80 90
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 A--GQASNGGHT--SDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFA
. .::.::: . ::::::.::.:....:::: :. .:. ::: ... .:::...:.
XP_011 VHINQATNGGGSAFSDYSSSVPSTPSISQRELRIET--IAASSTPTPIRKQSKRRSNIFT
100 110 120 130 140
660 670 680 690 700
pF1KE2 NRRGSD--SEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLL
.:.:.: ::.. . . .. ::::::::::..::::::.::::::::::::: .::.:
XP_011 SRKGADLDREKKAAECKVDSIGSGRAIPIKQGILLKRSGKSLNKEWKKKYVTLCDNGLLT
150 160 170 180 190 200
710 720 730 740 750 760
pF1KE2 YHPSINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSAS--INGLVKDMSTVQMGE
::::..::... ::::.::::::::::::: ::: : .:..: ::: . :..:.:
XP_011 YHPSLHDYMQNIHGKEIDLLRTTVKVPGKRLPRATPATAPGTSPRANGLSVERSNTQLGG
210 220 230 240 250 260
770 780 790 800 810 820
pF1KE2 GLEA-----TTPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALS--TDCTPSGDLSPL
: : .. . : : :: : . : . . . : : : : : :
XP_011 GTGAPHSASSASLHSERPLSSSAWAGPRPEGLHQRSCSVSSADQWSEATTSLPPGMQHPA
270 280 290 300 310 320
830 840 850 860
pF1KE2 SR-----------EPPPSPMV--KKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAEAKRKMWKLKSFGSLR
: .::::: ::.:::: : . .: .. .:
XP_011 SGPAEVLSSSPKLDPPPSPHSNRKKHRRKKSTGTPRPDGPSSATE---------------
330 340 350 360 370
870 880 890 900 910 920
pF1KE2 NIYKAEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDS
.:::.:::..:: :::::::::.. :::. :::....::::::: :.:.: : : .
XP_011 ---EAEESFEFVVVSLTGQTWHFEASTAEERELWVQSVQAQILASLQGCRSAKDKTRLGN
380 390 400 410 420 430
930 940 950 960 970 980
pF1KE2 QSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLD
:. :.:.::.:...:::.:.:: :::: :::::::::.:::::::::.::.:::::::::
XP_011 QNAALAVQAVRTVRGNSFCIDCDAPNPDWASLNLGALMCIECSGIHRHLGAHLSRVRSLD
440 450 460 470 480 490
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KE2 LDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWESDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPL
::::: :: :.::.:: :: :::. : .::. :. :::.: :::::::: ::::::
XP_011 LDDWPPELLAVMTAMGNALANSVWEGALGGYSKPGPDACREEKERWIRAKYEQKLFLAPL
500 510 520 530 540 550
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE2 STSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLLLLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVIT
.:. :::.:: :: .:. ...::::. . .. . : . :. :::.. .:.::.:
XP_011 PSSDVPLGQQLLRAVVEDDLRLLVMLLAHGSKEEVNETYGDGDGRTALHLSSAMANVVFT
560 570 580 590 600 610
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE2 QLLLWYGADVAARDAQGRTALFYARQAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPS----AAT
:::.:::.:: .:::.: : : :::.:::: :::::.:::::::: . : ::. .:
XP_011 QLLIWYGVDVRSRDARGLTPLAYARRAGSQECADILIQHGCPGEGCGLAPTPNREPANGT
620 630 640 650 660 670
1170 1180 1190
pF1KE2 TPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
.:: ::
XP_011 NPSAELHRSPSLL
680
>>NP_114152 (OMIM: 616813) arf-GAP with GTPase, ANK repe (911 aa)
initn: 2317 init1: 1237 opt: 1914 Z-score: 793.3 bits: 158.4 E(92274): 2e-37
Smith-Waterman score: 2714; 53.4% identity (75.0% similar) in 817 aa overlap (393-1173:114-908)
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 GPLPGPPSLSSGSGSRELLGAELRASPKAVINSQEWTLSRSIPELRLGVLGDARSGKSSL
.::::::::::.:::..:..:. ::::.:
NP_114 YAIYDLIERIEDLALQNQIREHVISIEDSFVNSQEWTLSRSVPELKVGIVGNLSSGKSAL
90 100 110 120 130 140
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 IHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVLIREEAGAPDAKFSGWADAVIFVFSLE
.::.:::.: :. :. ..:::..::::..:.:::.:.: :. .:..:.:::.::::::
NP_114 VHRYLTGTYVQEESPEGGRFKKEIVVDGQSYLLLIRDEGGPPELQFAAWVDAVVFVFSLE
150 160 170 180 190 200
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 DENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQDRISASSPRVVGDARARALCADMKRC
:: :::.: .: :.:. .. . ..:::::: :::..:::. :.::: : .:.:::
NP_114 DEISFQTVYNYFLRLCSFRNASE--VPMVLVGTQDAISAANPRVIDDSRARKLSTDLKRC
210 220 230 240 250 260
550 560 570 580 590
pF1KE2 SYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQL-LAACKSLPSSPSHSA---ASTPVA--
.::::::::::::.::::.::::::.:::.::: .. :::::.:::::: :: :..
NP_114 TYYETCATYGLNVERVFQDVAQKVVALRKKQQLAIGPCKSLPNSPSHSAVSAASIPAVHI
270 280 290 300 310 320
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 GQASNGGHT--SDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFANRR
.::.::: . ::::::.::.:....:::: :. .:. ::: ... .:::...:..:.
NP_114 NQATNGGGSAFSDYSSSVPSTPSISQRELRIET--IAASSTPTPIRKQSKRRSNIFTSRK
330 340 350 360 370
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 GSD--SEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHP
:.: ::.. . . .. ::::::::::..::::::.::::::::::::: .::.: :::
NP_114 GADLDREKKAAECKVDSIGSGRAIPIKQGILLKRSGKSLNKEWKKKYVTLCDNGLLTYHP
380 390 400 410 420 430
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 SINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSAS--INGLVKDMSTVQMGEGLE
:..::... ::::.::::::::::::: ::: : .:..: ::: . :..:.: :
NP_114 SLHDYMQNIHGKEIDLLRTTVKVPGKRLPRATPATAPGTSPRANGLSVERSNTQLGGGTG
440 450 460 470 480 490
780 790 800 810 820
pF1KE2 A-----TTPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALS--TDCTPSGDLSPLSR-
: .. . : : :: : . : . . . : : : : : : :
NP_114 APHSASSASLHSERPLSSSAWAGPRPEGLHQRSCSVSSADQWSEATTSLPPGMQHPASGP
500 510 520 530 540 550
830 840 850 860 870
pF1KE2 ----------EPPPSPMV--KKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAEAKRKMWKLKSFGSLRNIY
.::::: ::.:::: : . .: .. .:
NP_114 AEVLSSSPKLDPPPSPHSNRKKHRRKKSTGTPRPDGPSSATE------------------
560 570 580 590 600
880 890 900 910 920 930
pF1KE2 KAEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSE
.:::.:::..:: :::::::::.. :::. :::....::::::: :.:.: : : .:.
NP_114 EAEESFEFVVVSLTGQTWHFEASTAEERELWVQSVQAQILASLQGCRSAKDKTRLGNQNA
610 620 630 640 650 660
940 950 960 970 980 990
pF1KE2 AVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDD
:.:.::.:...:::.:.:: :::: :::::::::.:::::::::.::.::::::::::::
NP_114 ALAVQAVRTVRGNSFCIDCDAPNPDWASLNLGALMCIECSGIHRHLGAHLSRVRSLDLDD
670 680 690 700 710 720
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE2 WPRELTLVLTAIGNDTANRVWESDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTS
:: :: :.::.:: :: :::. : .::. :. :::.: :::::::: :::::: .:
NP_114 WPPELLAVMTAMGNALANSVWEGALGGYSKPGPDACREEKERWIRAKYEQKLFLAPLPSS
730 740 750 760 770 780
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE2 EEPLGRQLWAAVQAQDVATVLLLLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLL
. :::.:: :: .:. ...::::. . .. . : . :. :::.. .:.::.::::
NP_114 DVPLGQQLLRAVVEDDLRLLVMLLAHGSKEEVNETYGDGDGRTALHLSSAMANVVFTQLL
790 800 810 820 830 840
1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE2 LWYGADVAARDAQGRTALFYARQAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPS----AATTPS
.:::.:: .:::.: : : :::.:::: :::::.:::::::: . : ::. .:.::
NP_114 IWYGVDVRSRDARGLTPLAYARRAGSQECADILIQHGCPGEGCGLAPTPNREPANGTNPS
850 860 870 880 890 900
1170 1180 1190
pF1KE2 ITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
::
NP_114 AELHRSPSLL
910
>>NP_001032208 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, ANK r (857 aa)
initn: 2363 init1: 1288 opt: 1875 Z-score: 778.0 bits: 155.5 E(92274): 1.5e-36
Smith-Waterman score: 2767; 55.8% identity (78.0% similar) in 806 aa overlap (391-1160:56-838)
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 GSGPLPGPPSLSSGSGSRELLGAELRASPKAVINSQEWTLSRSIPELRLGVLGDARSGKS
: .::::::::::.:::..:..:. ::::
NP_001 NIYSIYELLERVEEPVLQNQIREHVIAIEDAFVNSQEWTLSRSVPELKVGIVGNLASGKS
30 40 50 60 70 80
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 SLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVLIREEAGAPDAKFSGWADAVIFVFS
.:.::.:::.: :. :. ..:::..::::..:.:::.:.: :.:.:. :.::::::::
NP_001 ALVHRYLTGTYVQEESPEGGRFKKEIVVDGQSYLLLIRDEGGPPEAQFAMWVDAVIFVFS
90 100 110 120 130 140
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 LEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQDRISASSPRVVGDARARALCADMK
:::: :::.: . ...... :. .. . :.:::::: ::...:::. ::::: : :.:
NP_001 LEDEISFQTVYHYYSRMANYRNTSE--IPLVLVGTQDAISSANPRVIDDARARKLSNDLK
150 160 170 180 190 200
550 560 570 580 590
pF1KE2 RCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQL-LAACKSLPSSPSHSAA-STPVAG-
::.::::::::::::.::::.::::.:. ::.::: .. :::::.:::::.. :. :..
NP_001 RCTYYETCATYGLNVERVFQDVAQKIVATRKKQQLSIGPCKSLPNSPSHSSVCSAQVSAV
210 220 230 240 250 260
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 ---QASNGGHT-SDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFANR
:.:::: . ::::::.::.:.....::: .. .:. :: ... .:::..::..:
NP_001 HISQTSNGGGSLSDYSSSVPSTPSTSQKELRIDVPPTANTPTP--VRKQSKRRSNLFTSR
270 280 290 300 310 320
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 RGSD--SEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYH
.::: .::..:.::... ::::::::::..::::::.::::::::::::: .:: : ::
NP_001 KGSDPDKEKKGLESRADSIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKSLNKEWKKKYVTLCDNGVLTYH
330 340 350 360 370 380
720 730 740 750 760
pF1KE2 PSINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGP--SASINGLVKDMSTVQM----
::..::....::::.::::::::::::::::: :: .: : . ::: ::::....
NP_001 PSLHDYMQNVHGKEIDLLRTTVKVPGKRPPRATSACAPISSPKTNGLSKDMSSLHISPNS
390 400 410 420 430 440
770 780 790 800 810
pF1KE2 GEGLEATTPMPSPSPSPSSLQPPPD---QTSKHLLKPDR-----NLAR-ALSTD------
:. :. . . . : :.. :: : : . . :. .: :.:.:
NP_001 GNVTSASGSQMASGISLVSFNSRPDGMHQRSYSVSSADQWSEATVIANSAISSDTGLGDS
450 460 470 480 490 500
820 830 840 850 860
pF1KE2 -CT-PS--GDLSPLSREPPPSPMV--KKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAEAKRKMWKLKSFG
:. :: . :: . .::::: . ::.:::: :. :..: .: :: .
NP_001 VCSSPSISSTTSP-KLDPPPSPHANRKKHRRKKSTSNFKADGLSGTAEEQ----------
510 520 530 540 550
870 880 890 900 910 920
pF1KE2 SLRNIYKAEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLR
::::::.::: :::::::::...::::::::::::::::::: ::::: : :
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:::::.:.:.::: .::: :::: . ::.:::::::::.:::::::::::::::::::
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:::::::: :: :...:::. :: ::: ...::.::: ::.:::.: :::::::: :::
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::: .: ::..: :. .:. :..:::::. . .. . . . :. :::: . ..:
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: . : ::: :::.: : .: : ..: : : :.. . : .:.:
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. . : :... : . . . .:. . .: :: : : :.: :.:
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... : :.: .. : : ::: :.::... . . . . ::.
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... ....:.:.::::.. ::: :.:: : : :: . . . .:: .
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]