Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2737
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2737, 281 aa
1>>>pF1KE2737 281 - 281 aa - 281 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9036+/-0.000895; mu= 17.5364+/- 0.053
mean_var=66.0908+/-13.294, 0's: 0 Z-trim(105.7): 52 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.157762
statistics sampled from 8612 (8664) to 8612 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.632), E-opt: 0.2 (0.259), width: 16
Scan time: 1.080
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS12760.1 CD37 gene_id:951|Hs109|chr19 ( 281) 1896 440.3 7.5e-124
CCDS46139.1 CD37 gene_id:951|Hs109|chr19 ( 213) 1449 338.5 2.6e-93
CCDS7909.1 CD82 gene_id:3732|Hs109|chr11 ( 267) 503 123.2 2e-28
CCDS7721.1 TSPAN4 gene_id:7106|Hs109|chr11 ( 238) 378 94.7 6.7e-20
CCDS7910.1 TSPAN18 gene_id:90139|Hs109|chr11 ( 248) 342 86.6 2e-17
CCDS829.1 CD53 gene_id:963|Hs109|chr1 ( 219) 334 84.7 6.5e-17
CCDS7719.1 CD151 gene_id:977|Hs109|chr11 ( 253) 329 83.6 1.6e-16
CCDS44949.1 TSPAN19 gene_id:144448|Hs109|chr12 ( 248) 314 80.2 1.7e-15
CCDS8520.1 TSPAN9 gene_id:10867|Hs109|chr12 ( 239) 313 80.0 1.9e-15
CCDS31765.1 TSPAN11 gene_id:441631|Hs109|chr12 ( 253) 311 79.5 2.7e-15
CCDS31469.1 CD82 gene_id:3732|Hs109|chr11 ( 242) 298 76.5 2.1e-14
CCDS530.1 TSPAN1 gene_id:10103|Hs109|chr1 ( 241) 286 73.8 1.4e-13
CCDS10292.1 TSPAN3 gene_id:10099|Hs109|chr15 ( 253) 285 73.6 1.7e-13
CCDS7734.1 CD81 gene_id:975|Hs109|chr11 ( 236) 275 71.3 7.6e-13
CCDS8999.1 TSPAN8 gene_id:7103|Hs109|chr12 ( 237) 273 70.8 1e-12
CCDS77130.1 TSPAN10 gene_id:83882|Hs109|chr17 ( 393) 269 70.1 2.9e-12
CCDS8540.1 CD9 gene_id:928|Hs109|chr12 ( 228) 266 69.2 3.1e-12
CCDS7369.1 TSPAN14 gene_id:81619|Hs109|chr10 ( 270) 262 68.4 6.6e-12
CCDS3646.1 TSPAN5 gene_id:10098|Hs109|chr4 ( 268) 251 65.9 3.7e-11
CCDS41589.1 TSPAN4 gene_id:7106|Hs109|chr11 ( 174) 247 64.8 5e-11
>>CCDS12760.1 CD37 gene_id:951|Hs109|chr19 (281 aa)
initn: 1896 init1: 1896 opt: 1896 Z-score: 2337.2 bits: 440.3 E(33420): 7.5e-124
Smith-Waterman score: 1896; 100.0% identity (100.0% similar) in 281 aa overlap (1-281:1-281)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSAQESCLSLIKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKTSFVSFVGLAFVPLQIWSKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MSAQESCLSLIKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKTSFVSFVGLAFVPLQIWSKV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LAISGIFTMGIALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRAQLERSLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LAISGIFTMGIALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRAQLERSLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 DVVEKTIQKYGTNPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWHYPQDWFQVLILRGNGSEAHRVPCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DVVEKTIQKYGTNPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWHYPQDWFQVLILRGNGSEAHRVPCS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 CYNLSATNDSTILDKVILPQLSRLGHLARSRHSADICAVPAESHIYREGCAQGLQKWLHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CYNLSATNDSTILDKVILPQLSRLGHLARSRHSADICAVPAESHIYREGCAQGLQKWLHN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280
pF1KE2 NLISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNLDHVYNRLARYR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NLISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNLDHVYNRLARYR
250 260 270 280
>>CCDS46139.1 CD37 gene_id:951|Hs109|chr19 (213 aa)
initn: 1449 init1: 1449 opt: 1449 Z-score: 1789.0 bits: 338.5 E(33420): 2.6e-93
Smith-Waterman score: 1449; 100.0% identity (100.0% similar) in 213 aa overlap (69-281:1-213)
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 DKTSFVSFVGLAFVPLQIWSKVLAISGIFTMGIALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLF
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MGIALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLF
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 ATQITLGILISTQRAQLERSLRDVVEKTIQKYGTNPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWHYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ATQITLGILISTQRAQLERSLRDVVEKTIQKYGTNPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWHYP
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 QDWFQVLILRGNGSEAHRVPCSCYNLSATNDSTILDKVILPQLSRLGHLARSRHSADICA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QDWFQVLILRGNGSEAHRVPCSCYNLSATNDSTILDKVILPQLSRLGHLARSRHSADICA
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 VPAESHIYREGCAQGLQKWLHNNLISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNLDHVYNRLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VPAESHIYREGCAQGLQKWLHNNLISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNLDHVYNRLA
160 170 180 190 200 210
280
pF1KE2 RYR
:::
CCDS46 RYR
>>CCDS7909.1 CD82 gene_id:3732|Hs109|chr11 (267 aa)
initn: 640 init1: 341 opt: 503 Z-score: 624.0 bits: 123.2 E(33420): 2e-28
Smith-Waterman score: 630; 36.6% identity (68.5% similar) in 276 aa overlap (6-280:4-267)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSAQESCLSLIKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKTSFVSFVGLAFVPLQIWSKV
.:... :::::.:::.::.::..:. ::.::: ::.::.: . . :.. . :
CCDS79 MGSACIKVTKYFLFLFNLIFFILGAVILGFGVWILADKSSFISVLQTSSSSLRMGAYV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LAISGIFTMGIALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRAQLERSLR
. : :: ...:::.::..:.::::::::..:::.. .:.: : :. . ..:.. .
CCDS79 FIGVGAVTMLMGFLGCIGAVNEVRCLLGLYFAFLLLILIAQVTAGALFYFNMGKLKQEMG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 DVVEKTIQKYGTNPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWHYPQDWFQVLILRGNGSEAHRVPCS
.: . :. :... :.. ...::::: :..:::: .: . : : :. :::
CCDS79 GIVTELIRDYNSSREDSL-QDAWDYVQAQVKCCGWVSFYNWTDNAELM-NRPEV-TYPCS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 CYNLSATNDSTILDKVILPQLSRLGHLARSRHSADICAVPAESHIYREGCAQGLQKWLHN
: .... .:... : : . .. : . .:.::: . .: ::..
CCDS79 C-EVKGEEDNSLS--------VRKGFCEAPGNRTQSGNHPEDWPVYQEGCMEKVQAWLQE
180 190 200 210 220
250 260 270 280
pF1KE2 NLISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNL-DHVYNRLARYR
:: :.:. .::...:: :.::: :::.. .. :... .:
CCDS79 NLGIILGVGVGVAIIELLGMVLSICLCRHVHSEDYSKVPKY
230 240 250 260
>>CCDS7721.1 TSPAN4 gene_id:7106|Hs109|chr11 (238 aa)
initn: 395 init1: 184 opt: 378 Z-score: 470.9 bits: 94.7 E(33420): 6.7e-20
Smith-Waterman score: 387; 29.5% identity (59.8% similar) in 261 aa overlap (6-262:4-226)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSAQESCLSLIKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKTSFVSFVGLAFVPLQIWSKV
.::. .::..:.:::.:.. : .. :::. . ::... . .: :. ...
CCDS77 MARACLQAVKYLMFAFNLLFWLGGCGVLGVGIWLAATQGSFATLSS-SFPSLSA-ANL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LAISGIFTMGIALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRAQLERSLR
: :.: :.:.:...::.::.:: .::: .: .:::.: . :..::. . ...: .
CCDS77 LIITGAFVMAIGFVGCLGAIKENKCLLLTFFLLLLLVFLLEATIAILFFAYTDKIDRYAQ
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 DVVEKTIQKYGTNPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWHYPQDWFQVLILRGNGSEAHRVPCS
. ..: .. :::. . .. ..:. .: ..:::: :::.: .: ::: :
CCDS77 QDLKKGLHLYGTQGN-VGLTNAWSIIQTDFRCCGVSNYTDWFEVY-------NATRVPDS
120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 CYNLSATNDSTILDKVILPQLSRLGHLARSRHSADICAVPAESHIYREGCAQGLQKWLHN
: . .. :.. : . .. : . .. ::..
CCDS77 C----------------------------CLEFSESCGLHAPGTWWKAPCYETVKVWLQE
170 180 190 200
250 260 270 280
pF1KE2 NL--ISIVGICLG-VGLLELGF-MTLSIFLCRNLDHVYNRLARYR
:: ..: :.: . : .: : : ::.
CCDS77 NLLAVGIFGLCTALVQILGLTFAMTMYCQVVKADTYCA
210 220 230
>>CCDS7910.1 TSPAN18 gene_id:90139|Hs109|chr11 (248 aa)
initn: 234 init1: 159 opt: 342 Z-score: 426.4 bits: 86.6 E(33420): 2e-17
Smith-Waterman score: 346; 27.1% identity (59.0% similar) in 266 aa overlap (7-270:5-247)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MSAQESCLSLIKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKTSFVSFVGLAFVPLQIWSK-
::: .::..::::.:.:. :. .. .:::...: :.: .: : :: . .
CCDS79 MEGDCLSCMKYLMFVFNFFIFLGGACLLAIGIWVMVDPTGFREIV--AANPLLLTGAY
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 -VLAISGIFTMGIALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRAQLERS
.::..:.. . ...::: ::..: .::: ..: ..:..: .... .:: : .: :
CCDS79 ILLAMGGLLFL-LGFLGCCGAVRENKCLLLFFFLFILIIFLAELSAAILAFIFRENLTRE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 LRDVVEKTIQKYGTNPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWHYPQDWFQVLILRGNGSEAHRVP
. ... ..: : . . .:. :.. . ::: . :.:. . ..: ....::
CCDS79 F--FTKELTKHYQGNNDTDVFSATWNSVMITFGCCGVNGPEDFKFASVFRLLTLDSEEVP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 CSCYNLSATNDSTILDKVILPQLSRLGHLARSRHSADICAVPAESHIYREGCAQGLQKWL
.: :: :: : : : . : . . ..:: . . .
CCDS79 EACCRRE-------------PQ-SRDGVLL----SREECLLGRSLFLNKQGCYTVILNTF
180 190 200 210
240 250 260 270 280
pF1KE2 HNNLISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNLDHVYNRLARYR
.. . .. .:: .:: : ... : :..
CCDS79 ETYVYLAGALAIGVLAIELFAMIFAMCLFRGIQ
220 230 240
>>CCDS829.1 CD53 gene_id:963|Hs109|chr1 (219 aa)
initn: 247 init1: 141 opt: 334 Z-score: 417.3 bits: 84.7 E(33420): 6.5e-17
Smith-Waterman score: 334; 36.5% identity (67.3% similar) in 156 aa overlap (6-161:4-153)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSAQESCLSLIKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKTSFVSFVGLAFVPLQIWSKV
: :.:.:: :: :::.:.. : :. :::..:: .. : : .: : ..:
CCDS82 MGMSSLKLLKYVLFFFNLLFWICGCCILGFGIYLLIHNNFGVLFHNL---PSLTLGNV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LAISGIFTMGIALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRAQLERSLR
..: : . : .:.:::.:..:: .::: .: .::... ...::.::. . . .:.. .
CCDS82 FVIVGSIIMVVAFLGCMGSIKENKCLLMSFFILLLIILLAEVTLAILLFVYEQKLNEYVA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 DVVEKTIQKYGTNPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWHYPQDWFQVLILRGNGSEAHRVPCS
. .:..: .. :: :: .: :.::: . .::
CCDS82 KGLTDSIHRYHSDNSTKAA---WDSIQSFLQCCGINGTSDWTSGPPASCPSDRKVEGCYA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 CYNLSATNDSTILDKVILPQLSRLGHLARSRHSADICAVPAESHIYREGCAQGLQKWLHN
CCDS82 KARLWFHSNFLYIGIITICVCVIEVLGMSFALTLNCQIDKTSQTIGL
180 190 200 210
>>CCDS7719.1 CD151 gene_id:977|Hs109|chr11 (253 aa)
initn: 338 init1: 225 opt: 329 Z-score: 410.3 bits: 83.6 E(33420): 1.6e-16
Smith-Waterman score: 329; 31.8% identity (62.6% similar) in 179 aa overlap (4-181:8-184)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MSAQESCLSL-IKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKTSFVSFVGLAFVPLQ
. .: .. .::.::..: :.. : .. ::: : :....:. ::
CCDS77 MGEFNEKKTTCGTVCLKYLLFTYNCCFWLAGLAVMAVGIWTLALKSDYISL--LASGTYL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 IWSKVLAISGIFTMGIALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRAQL
. .:...: .: ..::: ...:: : :: ::: .::..: .: ::: . ::
CCDS77 ATAYILVVAGTVVMVTGVLGCCATFKERRNLLRLYFILLLIIFLLEIIAGILAYAYYQQL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 ERSLRDVVEKTIQKYGTNPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWHYPQDWFQVLILRGNGSEAH
. :.. .. :. : .: . :. . : .: ...::: . ::: . .:.. . ..
CCDS77 NTELKENLKDTMTKRYHQPGHEAVTSAVDQLQQEFHCCGSNNSQDWRDSEWIRSQEAGGR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 RVPCSCYNLSATNDSTILDKVILPQLSRLGHLARSRHSADICAVPAESHIYREGCAQGLQ
:: ::
CCDS77 VVPDSCCKTVVALCGQRDHASNIYKVEGGCITKLETFIQEHLRVIGAVGIGIACVQVFGM
180 190 200 210 220 230
>>CCDS44949.1 TSPAN19 gene_id:144448|Hs109|chr12 (248 aa)
initn: 377 init1: 215 opt: 314 Z-score: 391.9 bits: 80.2 E(33420): 1.7e-15
Smith-Waterman score: 352; 27.5% identity (56.5% similar) in 269 aa overlap (10-273:9-243)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MSAQESCLSLIKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKTSFVSFVGLA---FVPLQIW
.::::: ..: :.::: :.. :: :.:.:...:.. .::.
CCDS44 MLRNNKTIIIKYFLNLINGAFLVLGLLFMGFGAWLLLDRNNFLTAFDENNHFIVPI---
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 SKVLAISGIFTMGIALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRAQLER
:..: : :. . ::: .: .:.: :: .: .. ::.:..:. .: :.. ....
CCDS44 SQILIGMGSSTVLFCLLGYIGIHNEIRWLLIVYAVLITWTFAVQVVLSAFIITKKEEVQQ
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 SLRDVVEKTIQKYGTN--PEETAAEESWDYVQFQLRCCGWHYPQDWFQVLILRGNGSEAH
.: .. .:..::.. ::. . . .: :.::: : :: : : ..
CCDS44 LWHDKIDFVISEYGSKDKPEDITKWTILNALQKTLQCCGQHNYTDW----IKNKNKENSG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 RVPCSCYNLSATNDSTILDKVILPQLSRLGHLARSRHSADICAVPAESHIYREGCAQGLQ
.::::: ..: .: : .. : ::: . ..
CCDS44 QVPCSC--------------------------TKSTLRKWFCDEPLNA-TYLEGCENKIS
180 190 200
240 250 260 270 280
pF1KE2 KWLHNNLISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNLDHVYNRLARYR
: . :.....:: .:. :. ..:.. . .:. ..
CCDS44 AWYNVNVLTLIGINFGLLTSEVFQVSLTVCFFKNIKNIIHAEM
210 220 230 240
>>CCDS8520.1 TSPAN9 gene_id:10867|Hs109|chr12 (239 aa)
initn: 296 init1: 123 opt: 313 Z-score: 390.9 bits: 80.0 E(33420): 1.9e-15
Smith-Waterman score: 334; 25.7% identity (58.7% similar) in 276 aa overlap (7-280:5-237)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSAQESCLSLIKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKTSFVSFVGLAFVPLQIWSKV
:: .::..:.:::.:.. : .. :::. ... .:..: .: :. . :
CCDS85 MARGCLCCLKYMMFLFNLIFWLCGCGLLGVGIWLSVSQGNFATFSP-SFPSLSAANLV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LAISGIFTMGIALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRAQLERSLR
.:: : ..: ..:::.::.:: .::: .: .::... ... : ::. . ..... .
CCDS85 IAI-GTIVMVTGFLGCLGAIKENKCLLLSFFIVLLVILLAELILLILFFVYMDKVNENAK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 DVVEKTIQKYGTNPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWHYPQDWFQVLILRGNGSEAHRVPCS
... . : :. .... ...:. .: ..:::: ::. :: :... ::
CCDS85 KDLKEGLLLYHTE-NNVGLKNAWNIIQAEMRCCGVTDYTDWYPVL---GENT----VPDR
120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 CYNLSATNDSTILDKVILPQLSRLGHLARSRHSADICAVPAESHIYREGCAQGLQKWLHN
: .... :. : . ..: :: . .. :. .
CCDS85 C----------------------------CMENSQGCGRNATTPLWRTGCYEKVKMWFDD
170 180 190 200
250 260 270 280
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