FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2703, 865 aa
1>>>pF1KE2703 865 - 865 aa - 865 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4487+/-0.00107; mu= 20.4931+/- 0.064
mean_var=80.3321+/-15.546, 0's: 0 Z-trim(104.0): 30 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.143097
statistics sampled from 7660 (7679) to 7660 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.589), E-opt: 0.2 (0.236), width: 16
Scan time: 4.180
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47029.1 PROM1 gene_id:8842|Hs108|chr4 ( 865) 5692 1185.7 0
CCDS54748.1 PROM1 gene_id:8842|Hs108|chr4 ( 842) 5493 1144.6 0
CCDS54747.1 PROM1 gene_id:8842|Hs108|chr4 ( 834) 5442 1134.1 0
CCDS54746.1 PROM1 gene_id:8842|Hs108|chr4 ( 856) 5025 1048.0 0
CCDS2012.1 PROM2 gene_id:150696|Hs108|chr2 ( 834) 1192 256.7 1.3e-67
>>CCDS47029.1 PROM1 gene_id:8842|Hs108|chr4 (865 aa)
initn: 5692 init1: 5692 opt: 5692 Z-score: 6348.0 bits: 1185.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5692; 100.0% identity (100.0% similar) in 865 aa overlap (1-865:1-865)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MALVLGSLLLLGLCGNSFSGGQPSSTDAPKAWNYELPATNYETQDSHKAGPIGILFELVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MALVLGSLLLLGLCGNSFSGGQPSSTDAPKAWNYELPATNYETQDSHKAGPIGILFELVH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 IFLYVVQPRDFPEDTLRKFLQKAYESKIDYDKPETVILGLKIVYYEAGIILCCVLGLLFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IFLYVVQPRDFPEDTLRKFLQKAYESKIDYDKPETVILGLKIVYYEAGIILCCVLGLLFI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 ILMPLVGYFFCMCRCCNKCGGEMHQRQKENGPFLRKCFAISLLVICIIISIGIFYGFVAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ILMPLVGYFFCMCRCCNKCGGEMHQRQKENGPFLRKCFAISLLVICIIISIGIFYGFVAN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 HQVRTRIKRSRKLADSNFKDLRTLLNETPEQIKYILAQYNTTKDKAFTDLNSINSVLGGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HQVRTRIKRSRKLADSNFKDLRTLLNETPEQIKYILAQYNTTKDKAFTDLNSINSVLGGG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 ILDRLRPNIIPVLDEIKSMATAIKETKEALENMNSTLKSLHQQSTQLSSSLTSVKTSLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ILDRLRPNIIPVLDEIKSMATAIKETKEALENMNSTLKSLHQQSTQLSSSLTSVKTSLRS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 SLNDPLCLVHPSSETCNSIRLSLSQLNSNPELRQLPPVDAELDNVNNVLRTDLDGLVQQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SLNDPLCLVHPSSETCNSIRLSLSQLNSNPELRQLPPVDAELDNVNNVLRTDLDGLVQQG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 YQSLNDIPDRVQRQTTTVVAGIKRVLNSIGSDIDNVTQRLPIQDILSAFSVYVNNTESYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YQSLNDIPDRVQRQTTTVVAGIKRVLNSIGSDIDNVTQRLPIQDILSAFSVYVNNTESYI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 HRNLPTLEEYDSYWWLGGLVICSLLTLIVIFYYLGLLCGVCGYDRHATPTTRGCVSNTGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HRNLPTLEEYDSYWWLGGLVICSLLTLIVIFYYLGLLCGVCGYDRHATPTTRGCVSNTGG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 VFLMVGVGLSFLFCWILMIIVVLTFVFGANVEKLICEPYTSKELFRVLDTPYLLNEDWEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VFLMVGVGLSFLFCWILMIIVVLTFVFGANVEKLICEPYTSKELFRVLDTPYLLNEDWEY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 YLSGKLFNKSKMKLTFEQVYSDCKKNRGTYGTLHLQNSFNISEHLNINEHTGSISSELES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YLSGKLFNKSKMKLTFEQVYSDCKKNRGTYGTLHLQNSFNISEHLNINEHTGSISSELES
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 LKVNLNIFLLGAAGRKNLQDFAACGIDRMNYDSYLAQTGKSPAGVNLLSFAYDLEAKANS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LKVNLNIFLLGAAGRKNLQDFAACGIDRMNYDSYLAQTGKSPAGVNLLSFAYDLEAKANS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 LPPGNLRNSLKRDAQTIKTIHQQRVLPIEQSLSTLYQSVKILQRTGNGLLERVTRILASL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LPPGNLRNSLKRDAQTIKTIHQQRVLPIEQSLSTLYQSVKILQRTGNGLLERVTRILASL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 DFAQNFITNNTSSVIIEETKKYGRTIIGYFEHYLQWIEFSISEKVASCKPVATALDTAVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DFAQNFITNNTSSVIIEETKKYGRTIIGYFEHYLQWIEFSISEKVASCKPVATALDTAVD
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 VFLCSYIIDPLNLFWFGIGKATVFLLPALIFAVKLAKYYRRMDSEDVYDDVETIPMKNME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VFLCSYIIDPLNLFWFGIGKATVFLLPALIFAVKLAKYYRRMDSEDVYDDVETIPMKNME
790 800 810 820 830 840
850 860
pF1KE2 NGNNGYHKDHVYGIHNPVMTSPSQH
:::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NGNNGYHKDHVYGIHNPVMTSPSQH
850 860
>>CCDS54748.1 PROM1 gene_id:8842|Hs108|chr4 (842 aa)
initn: 5493 init1: 5493 opt: 5493 Z-score: 6126.1 bits: 1144.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5493; 100.0% identity (100.0% similar) in 838 aa overlap (1-838:1-838)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MALVLGSLLLLGLCGNSFSGGQPSSTDAPKAWNYELPATNYETQDSHKAGPIGILFELVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MALVLGSLLLLGLCGNSFSGGQPSSTDAPKAWNYELPATNYETQDSHKAGPIGILFELVH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 IFLYVVQPRDFPEDTLRKFLQKAYESKIDYDKPETVILGLKIVYYEAGIILCCVLGLLFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IFLYVVQPRDFPEDTLRKFLQKAYESKIDYDKPETVILGLKIVYYEAGIILCCVLGLLFI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 ILMPLVGYFFCMCRCCNKCGGEMHQRQKENGPFLRKCFAISLLVICIIISIGIFYGFVAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ILMPLVGYFFCMCRCCNKCGGEMHQRQKENGPFLRKCFAISLLVICIIISIGIFYGFVAN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 HQVRTRIKRSRKLADSNFKDLRTLLNETPEQIKYILAQYNTTKDKAFTDLNSINSVLGGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HQVRTRIKRSRKLADSNFKDLRTLLNETPEQIKYILAQYNTTKDKAFTDLNSINSVLGGG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 ILDRLRPNIIPVLDEIKSMATAIKETKEALENMNSTLKSLHQQSTQLSSSLTSVKTSLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ILDRLRPNIIPVLDEIKSMATAIKETKEALENMNSTLKSLHQQSTQLSSSLTSVKTSLRS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 SLNDPLCLVHPSSETCNSIRLSLSQLNSNPELRQLPPVDAELDNVNNVLRTDLDGLVQQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SLNDPLCLVHPSSETCNSIRLSLSQLNSNPELRQLPPVDAELDNVNNVLRTDLDGLVQQG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 YQSLNDIPDRVQRQTTTVVAGIKRVLNSIGSDIDNVTQRLPIQDILSAFSVYVNNTESYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YQSLNDIPDRVQRQTTTVVAGIKRVLNSIGSDIDNVTQRLPIQDILSAFSVYVNNTESYI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 HRNLPTLEEYDSYWWLGGLVICSLLTLIVIFYYLGLLCGVCGYDRHATPTTRGCVSNTGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HRNLPTLEEYDSYWWLGGLVICSLLTLIVIFYYLGLLCGVCGYDRHATPTTRGCVSNTGG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 VFLMVGVGLSFLFCWILMIIVVLTFVFGANVEKLICEPYTSKELFRVLDTPYLLNEDWEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VFLMVGVGLSFLFCWILMIIVVLTFVFGANVEKLICEPYTSKELFRVLDTPYLLNEDWEY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 YLSGKLFNKSKMKLTFEQVYSDCKKNRGTYGTLHLQNSFNISEHLNINEHTGSISSELES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YLSGKLFNKSKMKLTFEQVYSDCKKNRGTYGTLHLQNSFNISEHLNINEHTGSISSELES
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 LKVNLNIFLLGAAGRKNLQDFAACGIDRMNYDSYLAQTGKSPAGVNLLSFAYDLEAKANS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LKVNLNIFLLGAAGRKNLQDFAACGIDRMNYDSYLAQTGKSPAGVNLLSFAYDLEAKANS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 LPPGNLRNSLKRDAQTIKTIHQQRVLPIEQSLSTLYQSVKILQRTGNGLLERVTRILASL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LPPGNLRNSLKRDAQTIKTIHQQRVLPIEQSLSTLYQSVKILQRTGNGLLERVTRILASL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 DFAQNFITNNTSSVIIEETKKYGRTIIGYFEHYLQWIEFSISEKVASCKPVATALDTAVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DFAQNFITNNTSSVIIEETKKYGRTIIGYFEHYLQWIEFSISEKVASCKPVATALDTAVD
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 VFLCSYIIDPLNLFWFGIGKATVFLLPALIFAVKLAKYYRRMDSEDVYDDVETIPMKNME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VFLCSYIIDPLNLFWFGIGKATVFLLPALIFAVKLAKYYRRMDSEDVYDDVETIPMKNPS
790 800 810 820 830 840
850 860
pF1KE2 NGNNGYHKDHVYGIHNPVMTSPSQH
CCDS54 QH
>>CCDS54747.1 PROM1 gene_id:8842|Hs108|chr4 (834 aa)
initn: 5442 init1: 5442 opt: 5442 Z-score: 6069.3 bits: 1134.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5442; 100.0% identity (100.0% similar) in 830 aa overlap (1-830:1-830)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MALVLGSLLLLGLCGNSFSGGQPSSTDAPKAWNYELPATNYETQDSHKAGPIGILFELVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MALVLGSLLLLGLCGNSFSGGQPSSTDAPKAWNYELPATNYETQDSHKAGPIGILFELVH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 IFLYVVQPRDFPEDTLRKFLQKAYESKIDYDKPETVILGLKIVYYEAGIILCCVLGLLFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IFLYVVQPRDFPEDTLRKFLQKAYESKIDYDKPETVILGLKIVYYEAGIILCCVLGLLFI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 ILMPLVGYFFCMCRCCNKCGGEMHQRQKENGPFLRKCFAISLLVICIIISIGIFYGFVAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ILMPLVGYFFCMCRCCNKCGGEMHQRQKENGPFLRKCFAISLLVICIIISIGIFYGFVAN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 HQVRTRIKRSRKLADSNFKDLRTLLNETPEQIKYILAQYNTTKDKAFTDLNSINSVLGGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HQVRTRIKRSRKLADSNFKDLRTLLNETPEQIKYILAQYNTTKDKAFTDLNSINSVLGGG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 ILDRLRPNIIPVLDEIKSMATAIKETKEALENMNSTLKSLHQQSTQLSSSLTSVKTSLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ILDRLRPNIIPVLDEIKSMATAIKETKEALENMNSTLKSLHQQSTQLSSSLTSVKTSLRS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 SLNDPLCLVHPSSETCNSIRLSLSQLNSNPELRQLPPVDAELDNVNNVLRTDLDGLVQQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SLNDPLCLVHPSSETCNSIRLSLSQLNSNPELRQLPPVDAELDNVNNVLRTDLDGLVQQG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 YQSLNDIPDRVQRQTTTVVAGIKRVLNSIGSDIDNVTQRLPIQDILSAFSVYVNNTESYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YQSLNDIPDRVQRQTTTVVAGIKRVLNSIGSDIDNVTQRLPIQDILSAFSVYVNNTESYI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 HRNLPTLEEYDSYWWLGGLVICSLLTLIVIFYYLGLLCGVCGYDRHATPTTRGCVSNTGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HRNLPTLEEYDSYWWLGGLVICSLLTLIVIFYYLGLLCGVCGYDRHATPTTRGCVSNTGG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 VFLMVGVGLSFLFCWILMIIVVLTFVFGANVEKLICEPYTSKELFRVLDTPYLLNEDWEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VFLMVGVGLSFLFCWILMIIVVLTFVFGANVEKLICEPYTSKELFRVLDTPYLLNEDWEY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 YLSGKLFNKSKMKLTFEQVYSDCKKNRGTYGTLHLQNSFNISEHLNINEHTGSISSELES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YLSGKLFNKSKMKLTFEQVYSDCKKNRGTYGTLHLQNSFNISEHLNINEHTGSISSELES
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 LKVNLNIFLLGAAGRKNLQDFAACGIDRMNYDSYLAQTGKSPAGVNLLSFAYDLEAKANS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LKVNLNIFLLGAAGRKNLQDFAACGIDRMNYDSYLAQTGKSPAGVNLLSFAYDLEAKANS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 LPPGNLRNSLKRDAQTIKTIHQQRVLPIEQSLSTLYQSVKILQRTGNGLLERVTRILASL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LPPGNLRNSLKRDAQTIKTIHQQRVLPIEQSLSTLYQSVKILQRTGNGLLERVTRILASL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 DFAQNFITNNTSSVIIEETKKYGRTIIGYFEHYLQWIEFSISEKVASCKPVATALDTAVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DFAQNFITNNTSSVIIEETKKYGRTIIGYFEHYLQWIEFSISEKVASCKPVATALDTAVD
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 VFLCSYIIDPLNLFWFGIGKATVFLLPALIFAVKLAKYYRRMDSEDVYDDVETIPMKNME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VFLCSYIIDPLNLFWFGIGKATVFLLPALIFAVKLAKYYRRMDSEDVYDDPSQH
790 800 810 820 830
850 860
pF1KE2 NGNNGYHKDHVYGIHNPVMTSPSQH
>>CCDS54746.1 PROM1 gene_id:8842|Hs108|chr4 (856 aa)
initn: 5025 init1: 5025 opt: 5025 Z-score: 5603.8 bits: 1048.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5609; 99.0% identity (99.0% similar) in 865 aa overlap (1-865:1-856)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MALVLGSLLLLGLCGNSFSGGQPSSTDAPKAWNYELPATNYETQDSHKAGPIGILFELVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MALVLGSLLLLGLCGNSFSGGQPSSTDAPKAWNYELPATNYETQDSHKAGPIGILFELVH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 IFLYVVQPRDFPEDTLRKFLQKAYESKIDYDKPETVILGLKIVYYEAGIILCCVLGLLFI
:::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS54 IFLYVVQPRDFPEDTLRKFLQKAYESKIDYDK---------IVYYEAGIILCCVLGLLFI
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 ILMPLVGYFFCMCRCCNKCGGEMHQRQKENGPFLRKCFAISLLVICIIISIGIFYGFVAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ILMPLVGYFFCMCRCCNKCGGEMHQRQKENGPFLRKCFAISLLVICIIISIGIFYGFVAN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 HQVRTRIKRSRKLADSNFKDLRTLLNETPEQIKYILAQYNTTKDKAFTDLNSINSVLGGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HQVRTRIKRSRKLADSNFKDLRTLLNETPEQIKYILAQYNTTKDKAFTDLNSINSVLGGG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 ILDRLRPNIIPVLDEIKSMATAIKETKEALENMNSTLKSLHQQSTQLSSSLTSVKTSLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ILDRLRPNIIPVLDEIKSMATAIKETKEALENMNSTLKSLHQQSTQLSSSLTSVKTSLRS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 SLNDPLCLVHPSSETCNSIRLSLSQLNSNPELRQLPPVDAELDNVNNVLRTDLDGLVQQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SLNDPLCLVHPSSETCNSIRLSLSQLNSNPELRQLPPVDAELDNVNNVLRTDLDGLVQQG
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 YQSLNDIPDRVQRQTTTVVAGIKRVLNSIGSDIDNVTQRLPIQDILSAFSVYVNNTESYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YQSLNDIPDRVQRQTTTVVAGIKRVLNSIGSDIDNVTQRLPIQDILSAFSVYVNNTESYI
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 HRNLPTLEEYDSYWWLGGLVICSLLTLIVIFYYLGLLCGVCGYDRHATPTTRGCVSNTGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HRNLPTLEEYDSYWWLGGLVICSLLTLIVIFYYLGLLCGVCGYDRHATPTTRGCVSNTGG
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 VFLMVGVGLSFLFCWILMIIVVLTFVFGANVEKLICEPYTSKELFRVLDTPYLLNEDWEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VFLMVGVGLSFLFCWILMIIVVLTFVFGANVEKLICEPYTSKELFRVLDTPYLLNEDWEY
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 YLSGKLFNKSKMKLTFEQVYSDCKKNRGTYGTLHLQNSFNISEHLNINEHTGSISSELES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YLSGKLFNKSKMKLTFEQVYSDCKKNRGTYGTLHLQNSFNISEHLNINEHTGSISSELES
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 LKVNLNIFLLGAAGRKNLQDFAACGIDRMNYDSYLAQTGKSPAGVNLLSFAYDLEAKANS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LKVNLNIFLLGAAGRKNLQDFAACGIDRMNYDSYLAQTGKSPAGVNLLSFAYDLEAKANS
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 LPPGNLRNSLKRDAQTIKTIHQQRVLPIEQSLSTLYQSVKILQRTGNGLLERVTRILASL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LPPGNLRNSLKRDAQTIKTIHQQRVLPIEQSLSTLYQSVKILQRTGNGLLERVTRILASL
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 DFAQNFITNNTSSVIIEETKKYGRTIIGYFEHYLQWIEFSISEKVASCKPVATALDTAVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DFAQNFITNNTSSVIIEETKKYGRTIIGYFEHYLQWIEFSISEKVASCKPVATALDTAVD
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 VFLCSYIIDPLNLFWFGIGKATVFLLPALIFAVKLAKYYRRMDSEDVYDDVETIPMKNME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VFLCSYIIDPLNLFWFGIGKATVFLLPALIFAVKLAKYYRRMDSEDVYDDVETIPMKNME
780 790 800 810 820 830
850 860
pF1KE2 NGNNGYHKDHVYGIHNPVMTSPSQH
:::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NGNNGYHKDHVYGIHNPVMTSPSQH
840 850
>>CCDS2012.1 PROM2 gene_id:150696|Hs108|chr2 (834 aa)
initn: 926 init1: 275 opt: 1192 Z-score: 1327.4 bits: 256.7 E(32554): 1.3e-67
Smith-Waterman score: 1226; 26.9% identity (65.0% similar) in 825 aa overlap (4-820:7-807)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MALVLGSLLLLGLCGNSFSGGQPSSTD----APKAWNYELPATN--YETQDSHKAGP
.:. :: ::: : ..: ..:: .: ::. . . . :
CCDS20 MKHTLALLAPLLGLGL-GLALSQLAAGATDCKFLGPAEHLTFTPAARARWLAPRVRAPGL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 IGILFELVHIFLYVVQPRDFPEDTLRKFLQKAYESKIDYDKPETVILGLKIVYYEAGIIL
. :. :. :: ::: :: . .. .:.. :.. ..: :::: ..
CCDS20 LDSLYGTVRRFLSVVQLNPFPSELVKALLNELASVKVN-----------EVVRYEAGYVV
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 CCVLGLLFIILMPLVGYFFCMCRCCNKCGGEMHQRQKENGPFLRKCFAISLLVICIIISI
: :.. :...:.: .: :: ::: .:::... ..: . : . . ::. ... :
CCDS20 CAVIAGLYLLLVPTAGLCFCCCRCHRRCGGRVKTEHKALA-CERAALMVFLLLTTLLLLI
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 GIFYGFVANHQVRTRIKRSRKLADSNFKDLRTLLNETPEQIKYILAQYNTTKDKAFTDLN
:. .::.:.... .. : . .. .: :....:.... . :.. .... .:.
CCDS20 GVVCAFVTNQRTHEQMGPSIEAMPETLLSLWGLVSDVPQELQAVAQQFSLPQEQVSEELD
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 SINSVLGGGILDRLRPNIIPVLDEIKSMATAIKETKEALENMNSTLKSLHQQSTQLSSSL
... .:..: .:: .. :.: . :.. ... . . :...:.:. :. . .: ..
CCDS20 GVGVSIGSAIHTQLRSSVYPLLAAVGSLGQVLQVSVHHLQTLNATVVELQAGQQDLEPAI
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 TSVKTSLRSSLNDPLCLVHPSSETCNSIRLSLSQ-LNSNPELRQLPPVDAELDNVNNVLR
. : :.. : . : . :: .. :. . .. :.: :: : ....: .
CCDS20 REHRDRLLELLQEARC-----QGDCAGA-LSWARTLELGADFSQVPSVDHVLHQLKGVPE
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 TDLDGLVQQGYQSLNDIPDRVQRQTTTVVAGIKRVLNSIGSDIDNVTQRLPIQDILSAFS
......::. ...: .: . ::..:: .:... . . .... .: . : ..
CCDS20 ANFSSMVQEENSTFNALPALAAMQTSSVVQELKKAVAQQPEGVRTLAEGFPGLEAASRWA
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 VYVNNTESYIHRNLPTLEEYDSYWWLGGLVICSLLTLIVIFYYLGLLCGVCGYDRHATPT
....: . : ...:..: :. : :.::.. ..:. ::: :. : . . :.
CCDS20 QALQEVEESSRPYLQEVQRYETYRWIVGCVLCSVVLFVVLCNLLGLNLGIWGLSARDDPS
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 TRGCVSNTGGVFLMVGVGLSFLFCWILMIIVVLTFVFGANVEKLICEPYTSKELFRVLDT
...:. :::.:::::::: :...: ::. :.::. :.:. . . :::. ::
CCDS20 HPEAKGEAGARFLMAGVGLSFLFAAPLILLVFATFLVGGNVQTLVCQSWENGELFEFADT
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 PYLLNEDWEYYLSGKLFNKSKMKLTFEQVYSDCKKNRGTYGTLHLQNSFNISEHLNINEH
: : . . :: .:.. : .....:.:..::.. . . .:.:..:... :::.::..
CCDS20 PGNLPPSMN--LS-QLLGLRK-NISIHQAYQQCKEGAALWTVLQLNDSYDLEEHLDINQY
530 540 550 560 570
600 610 620 630 640
pF1KE2 TGSISSELESLKVNLNIF-LLGAAGRKNLQDFAACGIDRMNYDSYLAQTGKSPAGVNLLS
:... .::.::::. . . ::..:.:..:. . . :..:..: ..:.: . . ... .
CCDS20 TNKLRQELQSLKVDTQSLDLLSSAARRDLEALQSSGLQRIHYPDFLVQIQRPVVKTSMEQ
580 590 600 610 620 630
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 FAYDLEAKANSLPPGNLRNSLKRDAQTIKTIHQQRVLPIEQSLSTLYQSVKILQRTGNGL
.: .:.. :.. . : . :...:: ....::..:.: .. .. : ::. :. .. .:
CCDS20 LAQELQGLAQAQDNSVLGQRLQEEAQGLRNLHQEKVVPQQSLVAKLNLSVRALESSAPNL
640 650 660 670 680 690
710 720 730 740 750 760
pF1KE2 LERVTRILASLDFAQNFITNNTSSVIIEETKKYGRTIIGYFEHYLQWIEFSISEKVASCK
... .::.. . .. . .. .. . .. . .::: .:. :.. .....:.:.
CCDS20 QLETSDVLANVTYLKGELPAWAARILRNVSECFLAREMGYFSQYVAWVREEVTQRIATCQ
700 710 720 730 740 750
770 780 790 800 810 820
pF1KE2 PVATALDTAVDVFLCSYIIDPLNLFWFGIGKATVFLLPALIFAVKLAKYYRRMDSEDVYD
:.. :::.. :.::... :: : ::: .. : ::.:..::::: .::.:
CCDS20 PLSGALDNS-RVILCDMMADPWNAFWFCLAWCTFFLIPSIIFAVKTSKYFRPIRKRLSST
760 770 780 790 800 810
830 840 850 860
pF1KE2 DVETIPMKNMENGNNGYHKDHVYGIHNPVMTSPSQH
CCDS20 SSEETQLFHIPRVTSLKL
820 830
865 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Sep 21 11:33:22 2017 done: Thu Sep 21 11:33:22 2017
Total Scan time: 4.180 Total Display time: 0.160
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]