Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2696
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2696, 307 aa
1>>>pF1KE2696 307 - 307 aa - 307 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5919+/-0.000841; mu= 13.9629+/- 0.050
mean_var=69.5529+/-14.008, 0's: 0 Z-trim(107.3): 25 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.153786
statistics sampled from 9476 (9495) to 9476 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.676), E-opt: 0.2 (0.292), width: 16
Scan time: 2.540
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3408.1 HS3ST1 gene_id:9957|Hs108|chr4 ( 307) 2109 476.8 8.7e-135
CCDS34517.1 HS3ST5 gene_id:222537|Hs108|chr6 ( 346) 1014 233.9 1.3e-61
CCDS53995.1 HS3ST4 gene_id:9951|Hs108|chr16 ( 456) 789 184.1 1.8e-46
CCDS10606.1 HS3ST2 gene_id:9956|Hs108|chr16 ( 367) 784 182.9 3.2e-46
CCDS45381.2 HS3ST6 gene_id:64711|Hs108|chr16 ( 342) 781 182.2 4.8e-46
CCDS11167.1 HS3ST3B1 gene_id:9953|Hs108|chr17 ( 390) 773 180.5 1.8e-45
CCDS11165.1 HS3ST3A1 gene_id:9955|Hs108|chr17 ( 406) 766 178.9 5.5e-45
CCDS3706.1 NDST4 gene_id:64579|Hs108|chr4 ( 872) 398 97.4 4e-20
CCDS3708.1 NDST3 gene_id:9348|Hs108|chr4 ( 873) 385 94.6 3e-19
CCDS7335.1 NDST2 gene_id:8509|Hs108|chr10 ( 883) 357 88.4 2.2e-17
>>CCDS3408.1 HS3ST1 gene_id:9957|Hs108|chr4 (307 aa)
initn: 2109 init1: 2109 opt: 2109 Z-score: 2533.3 bits: 476.8 E(32554): 8.7e-135
Smith-Waterman score: 2109; 99.7% identity (99.7% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAALLLGAVLLVAQPQLVPSRTAELGQQELLRKAGTLQDDVRDGVAPNGSAQQLPQTIII
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CCDS34 MAALLLGAVLLVAQPQLVPSRPAELGQQELLRKAGTLQDDVRDGVAPNGSAQQLPQTIII
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 GVRKGGTRALLEMLSLHPDVAAAENEVHFFDWEEHYSHGLGWYLSQMPFSWPHQLTVEKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GVRKGGTRALLEMLSLHPDVAAAENEVHFFDWEEHYSHGLGWYLSQMPFSWPHQLTVEKT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 PAYFTSPKVPERVYSMNPSIRLLLILRDPSERVLSDYTQVFYNHMQKHKPYPSIEEFLVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PAYFTSPKVPERVYSMNPSIRLLLILRDPSERVLSDYTQVFYNHMQKHKPYPSIEEFLVR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 DGRLNVDYKALNRSLYHVHMQNWLRFFPLRHIHIVDGDRLIRDPFPEIQKVERFLKLSPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DGRLNVDYKALNRSLYHVHMQNWLRFFPLRHIHIVDGDRLIRDPFPEIQKVERFLKLSPQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 INASNFYFNKTKGFYCLRDSGRDRCLHESKGRAHPQVDPKLLNKLHEYFHEPNKKFFELV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 INASNFYFNKTKGFYCLRDSGRDRCLHESKGRAHPQVDPKLLNKLHEYFHEPNKKFFELV
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 GRTFDWH
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CCDS34 GRTFDWH
>>CCDS34517.1 HS3ST5 gene_id:222537|Hs108|chr6 (346 aa)
initn: 1039 init1: 534 opt: 1014 Z-score: 1219.5 bits: 233.9 E(32554): 1.3e-61
Smith-Waterman score: 1014; 49.8% identity (79.8% similar) in 297 aa overlap (20-306:50-345)
10 20 30 40
pF1KE2 MAALLLGAVLLVAQPQLVPSRT-AELGQQELLRKAGTLQDDVRDGVAPN
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CCDS34 AVGSLLYLVARVGSLDRLQPICPIEGRLGGARTQAEFPLRALQFKRGLLHE-FRKGNASK
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 GSA------QQLPQTIIIGVRKGGTRALLEMLSLHPDVAAAENEVHFFDWEEHYSHGLGW
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CCDS34 EQVRLHDLVQQLPKAIIIGVRKGGTRALLEMLNLHPAVVKASQEIHFFDNDENYGKGIEW
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 YLSQMPFSWPHQLTVEKTPAYFTSPKVPERVYSMNPSIRLLLILRDPSERVLSDYTQVFY
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CCDS34 YRKKMPFSYPQQITIEKSPAYFITEEVPERIYKMNSSIKLLIIVREPTTRAISDYTQVLE
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 NHMQKHKPYPSIEEFLVRDG--RLNVDYKALNRSLYHVHMQNWLRFFPLRHIHIVDGDRL
.. .:.: : ..:.. . . ..:. :::. :.: :.. ::..::....:.::::::
CCDS34 GKERKNKTYYKFEKLAIDPNTCEVNTKYKAVRTSIYTKHLERWLKYFPIEQFHVVDGDRL
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270
pF1KE2 IRDPFPEIQKVERFLKLSPQINASNFYFNKTKGFYCLR-DSGRDRCLHESKGRAHPQVDP
: .:.::.: ::.::.: :.:. :.::: :.:::::: . ..:: :::: ::.:::
CCDS34 ITEPLPELQLVEKFLNLPPRISQYNLYFNATRGFYCLRFNIIFNKCLAGSKGRIHPEVDP
260 270 280 290 300 310
280 290 300
pF1KE2 KLLNKLHEYFHEPNKKFFELVGRTFDWH
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CCDS34 SVITKLRKFFHPFNQKFYQITGRTLNWP
320 330 340
>>CCDS53995.1 HS3ST4 gene_id:9951|Hs108|chr16 (456 aa)
initn: 582 init1: 213 opt: 789 Z-score: 947.9 bits: 184.1 E(32554): 1.8e-46
Smith-Waterman score: 789; 39.6% identity (73.4% similar) in 308 aa overlap (10-306:149-449)
10 20 30
pF1KE2 MAALLLGAVLLVAQPQLVPSRTAELGQ---QELLRKAGT
...:: : : : :. .. ..: . ..
CCDS53 AAPGTDGWGLPSGGGGAQDAWLRTPLAPSEMITAQSAL-PEREAQESSTTDEDLAGRRAA
120 130 140 150 160 170
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 LQDDVRDGVA--PNGSAQQLPQTIIIGVRKGGTRALLEMLSLHPDVAAAENEVHFFDWEE
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CCDS53 NGSSERGGAVSTPDYGEKKLPQALIIGVKKGGTRALLEAIRVHPDVRAVGVEPHFFD--R
180 190 200 210 220 230
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 HYSHGLGWYLSQMPFSWPHQLTVEKTPAYFTSPKVPERVYSMNPSIRLLLILRDPSERVL
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CCDS53 NYEKGLEWYRNVMPKTLDGQITMEKTPSYFVTNEAPKRIHSMAKDIKLIVVVRNPVTRAI
240 250 260 270 280 290
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 SDYTQVFYNHMQKHKPYPSIEEFLVRD---GRLNVDYKALNRSLYHVHMQNWLRFFPLRH
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CCDS53 SDYTQT----LSKKPEIPTFEVLAFKNRTLGLIDASWSAIRIGIYALHLENWLQYFPLSQ
300 310 320 330 340 350
220 230 240 250 260
pF1KE2 IHIVDGDRLIRDPFPEIQKVERFLKLSPQINASNFYFNKTKGFYCLR---DSGRDRCLHE
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CCDS53 ILFVSGERLIVDPAGEMAKVQDFLGLKRVVTEKHFYFNKTKGFPCLKKPEDSSAPRCLGK
360 370 380 390 400 410
270 280 290 300
pF1KE2 SKGRAHPQVDPKLLNKLHEYFHEPNKKFFELVGRTFDWH
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CCDS53 SKGRTHPRIDPDVIHRLRKFYKPFNLMFYQMTGQDFQWEQEEGDK
420 430 440 450
>>CCDS10606.1 HS3ST2 gene_id:9956|Hs108|chr16 (367 aa)
initn: 578 init1: 213 opt: 784 Z-score: 943.3 bits: 182.9 E(32554): 3.2e-46
Smith-Waterman score: 784; 42.3% identity (76.8% similar) in 267 aa overlap (46-306:106-366)
20 30 40 50 60 70
pF1KE2 QLVPSRTAELGQQELLRKAGTLQDDVRDGVAPNGSAQQLPQTIIIGVRKGGTRALLEMLS
.:. ....:::..:.::.::::::.::..
CCDS10 SGPTPSEPSAPSAPAAAVPAPRLSGSNHSGSPKLGTKRLPQALIVGVKKGGTRAVLEFIR
80 90 100 110 120 130
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 LHPDVAAAENEVHFFDWEEHYSHGLGWYLSQMPFSWPHQLTVEKTPAYFTSPKVPERVYS
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CCDS10 VHPDVRALGTEPHFFD--RNYGRGLDWYRSLMPRTLESQITLEKTPSYFVTQEAPRRIFN
140 150 160 170 180 190
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 MNPSIRLLLILRDPSERVLSDYTQVFYNHMQKHKPYPSIEEFLVRD---GRLNVDYKALN
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CCDS10 MSRDTKLIVVVRNPVTRAISDYTQT----LSKKPDIPTFEGLSFRNRTLGLVDVSWNAIR
200 210 220 230 240
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 RSLYHVHMQNWLRFFPLRHIHIVDGDRLIRDPFPEIQKVERFLKLSPQINASNFYFNKTK
..: .:...::..::: .::.:.:.::: :: :. .:. :: .. :. ..:::::::
CCDS10 IGMYVLHLESWLQYFPLAQIHFVSGERLITDPAGEMGRVQDFLGIKRFITDKHFYFNKTK
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300
pF1KE2 GFYCLRDSGRD---RCLHESKGRAHPQVDPKLLNKLHEYFHEPNKKFFELVGRTFDWH
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CCDS10 GFPCLKKTESSLLPRCLGKSKGRTHVQIDPEVIDQLREFYRPYNIKFYETVGQDFRWE
310 320 330 340 350 360
>>CCDS45381.2 HS3ST6 gene_id:64711|Hs108|chr16 (342 aa)
initn: 691 init1: 229 opt: 781 Z-score: 940.2 bits: 182.2 E(32554): 4.8e-46
Smith-Waterman score: 781; 39.5% identity (69.4% similar) in 314 aa overlap (1-306:34-341)
10 20
pF1KE2 MAALLLGAVLLVAQP-QLVPSRTAELGQQE
..::.::: : : : . :. :
CCDS45 SGGLGGGAGGGQGAGAGQGAALRASRAPMLLVALVLGAYCLCALPGRCPPAARAPAPAPA
10 20 30 40 50 60
30 40 50 60 70 80
pF1KE2 LLRKAGTLQDDVRDGV--APNGSAQQLPQTIIIGVRKGGTRALLEMLSLHPDVAAAENEV
. ..... :. : . . ...::..:.::.:::::::::.: ::::: : .:
CCDS45 PSEPSSSVHRPGAPGLPLASGPGRRRFPQALIVGVKKGGTRALLEFLRLHPDVRALGSEP
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 HFFDWEEHYSHGLGWYLSQMPFSWPHQLTVEKTPAYFTSPKVPERVYSMNPSIRLLLILR
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CCDS45 HFFD--RCYERGLAWYRSLMPRTLDGQITMEKTPSYFVTREAPRRIHAMSPDTKLIVVVR
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 DPSERVLSDYTQVFYNHMQKHKPYPSIEEFLVRDGRLNVD--YKALNRSLYHVHMQNWLR
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CCDS45 NPVTRAISDYAQT----LSKTPGLPSFRALAFRHGLGPVDTAWSAVRIGLYAQHLDHWLR
190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 FFPLRHIHIVDGDRLIRDPFPEIQKVERFLKLSPQINASNFYFNKTKGFYCLRDS---GR
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CCDS45 YFPLSHFLFVSGERLVSDPAGEVGRVQDFLGLKRVVTDKHFYFNATKGFPCLKKAQGGSR
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300
pF1KE2 DRCLHESKGRAHPQVDPKLLNKLHEYFHEPNKKFFELVGRTFDWH
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CCDS45 PRCLGKSKGRPHPRVPQALVRRLQEFYRPFNRRFYQMTGQDFGWG
300 310 320 330 340
>>CCDS11167.1 HS3ST3B1 gene_id:9953|Hs108|chr17 (390 aa)
initn: 578 init1: 207 opt: 773 Z-score: 929.7 bits: 180.5 E(32554): 1.8e-45
Smith-Waterman score: 773; 39.7% identity (72.3% similar) in 307 aa overlap (15-306:89-389)
10 20 30 40
pF1KE2 MAALLLGAVLLVAQPQLVPSRTAELGQQELLRKAGTLQD---DV
: .: : . .:. . :.. .. .:
CCDS11 PGLLLLGSGSRAAHDPPALATAPDGTPPRLPFRAPPATPLASGKEMAEGAASPEEQSPEV
60 70 80 90 100 110
50 60 70 80 90
pF1KE2 RDGVAP-----NGS-AQQLPQTIIIGVRKGGTRALLEMLSLHPDVAAAENEVHFFDWEEH
:. .: .:: ..::::.:::::.:::::::::.: .:::: :. : :::: .
CCDS11 PDSPSPISSFFSGSGSKQLPQAIIIGVKKGGTRALLEFLRVHPDVRAVGAEPHFFD--RS
120 130 140 150 160 170
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 YSHGLGWYLSQMPFSWPHQLTVEKTPAYFTSPKVPERVYSMNPSIRLLLILRDPSERVLS
:..::.:: . :: . :.:.::::.::.. ..: :. .:. . .:....::: :..:
CCDS11 YDKGLAWYRDLMPRTLDGQITMEKTPSYFVTREAPARISAMSKDTKLIVVVRDPVTRAIS
180 190 200 210 220 230
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 DYTQVFYNHMQKHKPYPSIEEFLVRD---GRLNVDYKALNRSLYHVHMQNWLRFFPLRHI
::::. ..:. :..: . .. : ......:.. ..: :...::: ::.:..
CCDS11 DYTQT----LSKRPDIPTFESLTFKNRTAGLIDTSWSAIQIGIYAKHLEHWLRHFPIRQM
240 250 260 270 280 290
220 230 240 250 260
pF1KE2 HIVDGDRLIRDPFPEIQKVERFLKLSPQINASNFYFNKTKGFYCLRD---SGRDRCLHES
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CCDS11 LFVSGERLISDPAGELGRVQDFLGLKRIITDKHFYFNKTKGFPCLKKAEGSSRPHCLGKT
300 310 320 330 340 350
270 280 290 300
pF1KE2 KGRAHPQVDPKLLNKLHEYFHEPNKKFFELVGRTFDWH
:::.::..: ... .:.:... : ::....:. : :
CCDS11 KGRTHPEIDREVVRRLREFYRPFNLKFYQMTGHDFGWD
360 370 380 390
>>CCDS11165.1 HS3ST3A1 gene_id:9955|Hs108|chr17 (406 aa)
initn: 578 init1: 207 opt: 766 Z-score: 921.1 bits: 178.9 E(32554): 5.5e-45
Smith-Waterman score: 766; 42.7% identity (76.0% similar) in 262 aa overlap (51-306:149-404)
30 40 50 60 70 80
pF1KE2 RTAELGQQELLRKAGTLQDDVRDGVAPNGSAQQLPQTIIIGVRKGGTRALLEMLSLHPDV
..::::.:::::.:::::::::.: .::::
CCDS11 GLSGGPGGSGAGSTVAEAPPGTLALLLDEGSKQLPQAIIIGVKKGGTRALLEFLRVHPDV
120 130 140 150 160 170
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 AAAENEVHFFDWEEHYSHGLGWYLSQMPFSWPHQLTVEKTPAYFTSPKVPERVYSMNPSI
:. : :::: . :..::.:: . :: . :.:.::::.::.. ..: :. .:. .
CCDS11 RAVGAEPHFFD--RSYDKGLAWYRDLMPRTLDGQITMEKTPSYFVTREAPARISAMSKDT
180 190 200 210 220 230
150 160 170 180 190
pF1KE2 RLLLILRDPSERVLSDYTQVFYNHMQKHKPYPSIEEFLVRD---GRLNVDYKALNRSLYH
.:....::: :..:::::. ..:. :..: . .. : ......:.. ..:
CCDS11 KLIVVVRDPVTRAISDYTQT----LSKRPDIPTFESLTFKNRTAGLIDTSWSAIQIGIYA
240 250 260 270 280 290
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 VHMQNWLRFFPLRHIHIVDGDRLIRDPFPEIQKVERFLKLSPQINASNFYFNKTKGFYCL
:...::: ::.:.. .:.:.::: :: :. .:. :: :. :. ..::::::::: ::
CCDS11 KHLEHWLRHFPIRQMLFVSGERLISDPAGELGRVQDFLGLKRIITDKHFYFNKTKGFPCL
300 310 320 330 340 350
260 270 280 290 300
pF1KE2 RD---SGRDRCLHESKGRAHPQVDPKLLNKLHEYFHEPNKKFFELVGRTFDWH
. :.: .:: ..:::.::..: ... .:.:... : ::....:. : :
CCDS11 KKAEGSSRPHCLGKTKGRTHPEIDREVVRRLREFYRPFNLKFYQMTGHDFGWDG
360 370 380 390 400
>>CCDS3706.1 NDST4 gene_id:64579|Hs108|chr4 (872 aa)
initn: 352 init1: 130 opt: 398 Z-score: 474.7 bits: 97.4 E(32554): 4e-20
Smith-Waterman score: 474; 31.5% identity (62.9% similar) in 286 aa overlap (39-302:577-855)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 VLLVAQPQLVPSRTAELGQQELLRKAGTLQDDVR--DGVAPNGSAQQLPQTIIIGVRKGG
:: : : . . . ..::. ..:: .: :
CCDS37 KLQTLPPVQLAHQYFELFPEQKDPLWQNPCDDKRHKDIWSREKTCDHLPKFLVIGPQKTG
550 560 570 580 590 600
70 80 90 100 110
pF1KE2 TRALLEMLSLHPDVAA------AENEVHFFDWEEHYSHGLGWYLS--QMPFSWPHQLTVE
: :: .: .::.. . . .::.::. . .: .:. ::.. : . .. :
CCDS37 TTALYLFLLMHPSIISNLPSPKTFEEVQFFNGN-NYHKGIDWYMDFFPTPSNTTSDFLFE
610 620 630 640 650 660
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 KTPAYFTSPKVPERVYSMNPSIRLLLILRDPSERVLSDYTQVFYNHMQKHKPYPSIEEF-
:. :: : ..:.:. :. :. ... :: :::.:. : .:.:...:. :. .:
CCDS37 KSANYFHSEEAPRRAASLVPKAKIITILIDPSDRAYS-----WYQHQRSHED-PAALRFN
670 680 690 700 710
180 190 200 210 220
pF1KE2 ---LVRDGRLN-VDYKALNR-----SLYHVHMQNWLRFFPLRHIHIVDGDRLIRDPFPEI
.. :. : :.:.: . : ::.. :: .: .. :.::..: :: .
CCDS37 FYEVISTGHWAPSDLKTLQRRCLVPGWYAVHIERWLTYFATSQLLIIDGQQLRSDPATVM
720 730 740 750 760 770
230 240 250 260 270 280
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