Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2682
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2682, 659 aa
1>>>pF1KE2682 659 - 659 aa - 659 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4906+/-0.000894; mu= 13.7923+/- 0.054
mean_var=86.2018+/-16.803, 0's: 0 Z-trim(107.9): 59 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.138139
statistics sampled from 9801 (9861) to 9801 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.662), E-opt: 0.2 (0.303), width: 16
Scan time: 3.870
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS58063.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 765) 4326 872.3 0
CCDS1542.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 750) 4269 860.9 0
CCDS1541.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 856) 4269 861.0 0
CCDS58062.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 667) 3495 706.7 2.7e-203
CCDS4877.1 PEX6 gene_id:5190|Hs108|chr6 ( 980) 798 169.2 2.4e-41
CCDS64710.1 PEX1 gene_id:5189|Hs108|chr7 (1226) 744 158.5 5.1e-38
CCDS5627.1 PEX1 gene_id:5189|Hs108|chr7 (1283) 744 158.5 5.3e-38
CCDS3730.1 SPATA5 gene_id:166378|Hs108|chr4 ( 893) 719 153.5 1.2e-36
CCDS6573.1 VCP gene_id:7415|Hs108|chr9 ( 806) 665 142.7 1.9e-33
CCDS9710.2 PSMC6 gene_id:5706|Hs108|chr14 ( 403) 599 129.4 9.4e-30
CCDS31956.1 KATNAL1 gene_id:84056|Hs108|chr13 ( 490) 593 128.3 2.6e-29
CCDS11859.1 AFG3L2 gene_id:10939|Hs108|chr18 ( 797) 587 127.2 9e-29
CCDS6343.1 ATAD2 gene_id:29028|Hs108|chr8 (1390) 586 127.0 1.7e-28
CCDS7935.1 PSMC3 gene_id:5702|Hs108|chr11 ( 439) 577 125.1 2.1e-28
CCDS10977.1 SPG7 gene_id:6687|Hs108|chr16 ( 795) 578 125.4 3.1e-28
CCDS81837.1 PSMC1 gene_id:5700|Hs108|chr14 ( 367) 572 124.0 3.6e-28
CCDS46076.1 PSMC4 gene_id:5704|Hs108|chr19 ( 387) 572 124.1 3.8e-28
CCDS12547.1 PSMC4 gene_id:5704|Hs108|chr19 ( 418) 572 124.1 4e-28
CCDS32139.1 PSMC1 gene_id:5700|Hs108|chr14 ( 440) 572 124.1 4.2e-28
CCDS5217.1 KATNA1 gene_id:11104|Hs108|chr6 ( 491) 558 121.3 3.2e-27
CCDS56043.1 PSMC5 gene_id:5705|Hs108|chr17 ( 398) 555 120.7 4e-27
CCDS11645.1 PSMC5 gene_id:5705|Hs108|chr17 ( 406) 555 120.7 4.1e-27
CCDS46227.1 ATAD2B gene_id:54454|Hs108|chr2 (1458) 550 119.9 2.6e-26
CCDS5731.1 PSMC2 gene_id:5701|Hs108|chr7 ( 433) 535 116.7 6.9e-26
CCDS11983.1 VPS4B gene_id:9525|Hs108|chr18 ( 444) 532 116.1 1.1e-25
CCDS5510.1 FIGNL1 gene_id:63979|Hs108|chr7 ( 674) 533 116.4 1.4e-25
CCDS58072.1 YME1L1 gene_id:10730|Hs108|chr10 ( 683) 528 115.4 2.7e-25
CCDS7151.1 YME1L1 gene_id:10730|Hs108|chr10 ( 716) 528 115.4 2.8e-25
CCDS7152.1 YME1L1 gene_id:10730|Hs108|chr10 ( 773) 528 115.4 3e-25
CCDS1779.1 SPAST gene_id:6683|Hs108|chr2 ( 584) 522 114.2 5.4e-25
CCDS1778.1 SPAST gene_id:6683|Hs108|chr2 ( 616) 522 114.2 5.7e-25
CCDS7386.1 ATAD1 gene_id:84896|Hs108|chr10 ( 361) 513 112.3 1.2e-24
CCDS45517.1 VPS4A gene_id:27183|Hs108|chr16 ( 437) 509 111.5 2.5e-24
CCDS10123.1 SPATA5L1 gene_id:79029|Hs108|chr15 ( 753) 474 104.6 5.2e-22
CCDS81877.1 SPATA5L1 gene_id:79029|Hs108|chr15 ( 620) 462 102.2 2.3e-21
CCDS32828.1 KATNAL2 gene_id:83473|Hs108|chr18 ( 466) 449 99.6 1.1e-20
CCDS2221.2 FIGN gene_id:55137|Hs108|chr2 ( 759) 414 92.7 2.1e-18
CCDS10978.1 SPG7 gene_id:6687|Hs108|chr16 ( 489) 367 83.2 9.2e-16
CCDS56456.1 KATNA1 gene_id:11104|Hs108|chr6 ( 311) 363 82.4 1.1e-15
CCDS42354.1 NSF gene_id:4905|Hs108|chr17 ( 744) 330 75.9 2.2e-13
>>CCDS58063.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 (765 aa)
initn: 4326 init1: 4326 opt: 4326 Z-score: 4657.4 bits: 872.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4326; 100.0% identity (100.0% similar) in 659 aa overlap (1-659:107-765)
10 20 30
pF1KE2 MEDYPDPQDSKDSSLLESDMKRKGKLKNKG
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ELEDEHLAKRARQGEEDNEYTESYSDDDSSMEDYPDPQDSKDSSLLESDMKRKGKLKNKG
80 90 100 110 120 130
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 SKRKKEDLQEVDGEIEAVLQKKAKARGLEFQISNVKFEDVGGNDMTLKEVCKMLIHMRHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SKRKKEDLQEVDGEIEAVLQKKAKARGLEFQISNVKFEDVGGNDMTLKEVCKMLIHMRHP
140 150 160 170 180 190
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 EVYHHLGVVPPRGVLLHGPPGCGKTLLAHAIAGELDLPILKVAAPEIVSGVSGESEQKLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EVYHHLGVVPPRGVLLHGPPGCGKTLLAHAIAGELDLPILKVAAPEIVSGVSGESEQKLR
200 210 220 230 240 250
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 ELFEQAVSNAPCIIFIDEIDAITPKREVASKDMERRIVAQLLTCMDDLNNVAATARVLVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ELFEQAVSNAPCIIFIDEIDAITPKREVASKDMERRIVAQLLTCMDDLNNVAATARVLVI
260 270 280 290 300 310
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 GATNRPDSLDPALRRAGRFDREICLGIPDEASRERILQTLCRKLRLPQAFDFCHLAHLTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GATNRPDSLDPALRRAGRFDREICLGIPDEASRERILQTLCRKLRLPQAFDFCHLAHLTP
320 330 340 350 360 370
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 GFVGADLMALCREAAMCAVNRVLMKLQEQQKKNPEMEDLPSKGVQEERLGTEPTSETQDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GFVGADLMALCREAAMCAVNRVLMKLQEQQKKNPEMEDLPSKGVQEERLGTEPTSETQDE
380 390 400 410 420 430
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 LQRLLGLLRDQDPLSEEQMQGLCIELNDFIVALSSVQPSAKREGFVTVPNVTWADIGALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LQRLLGLLRDQDPLSEEQMQGLCIELNDFIVALSSVQPSAKREGFVTVPNVTWADIGALE
440 450 460 470 480 490
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 DIREELTMAILAPVRNPDQFKALGLVTPAGVLLAGPPGCGKTLLAKAVANESGLNFISVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DIREELTMAILAPVRNPDQFKALGLVTPAGVLLAGPPGCGKTLLAKAVANESGLNFISVK
500 510 520 530 540 550
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 GPELLNMYVGESERAVRQVFQRAKNSAPCVIFFDEVDALCPRRSDRETGASVRVVNQLLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GPELLNMYVGESERAVRQVFQRAKNSAPCVIFFDEVDALCPRRSDRETGASVRVVNQLLT
560 570 580 590 600 610
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 EMDGLEARQQVFIMAATNRPDIIDPAILRPGRLDKTLFVGLPPPADRLAILKTITKNGTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EMDGLEARQQVFIMAATNRPDIIDPAILRPGRLDKTLFVGLPPPADRLAILKTITKNGTK
620 630 640 650 660 670
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 PPLDADVNLEAIAGDLRCDCYTGADLSALVREASICALRQEMARQKSGNEKGELKVSHKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PPLDADVNLEAIAGDLRCDCYTGADLSALVREASICALRQEMARQKSGNEKGELKVSHKH
680 690 700 710 720 730
640 650
pF1KE2 FEEAFKKVRSSISKKDQIMYERLQESLSR
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FEEAFKKVRSSISKKDQIMYERLQESLSR
740 750 760
>>CCDS1542.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 (750 aa)
initn: 4269 init1: 4269 opt: 4269 Z-score: 4596.2 bits: 860.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4269; 100.0% identity (100.0% similar) in 652 aa overlap (8-659:99-750)
10 20 30
pF1KE2 MEDYPDPQDSKDSSLLESDMKRKGKLKNKGSKRKKED
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 IDKTPSVKKDSFFLDLSCEKSNPKKPITEIQDSKDSSLLESDMKRKGKLKNKGSKRKKED
70 80 90 100 110 120
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 LQEVDGEIEAVLQKKAKARGLEFQISNVKFEDVGGNDMTLKEVCKMLIHMRHPEVYHHLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 LQEVDGEIEAVLQKKAKARGLEFQISNVKFEDVGGNDMTLKEVCKMLIHMRHPEVYHHLG
130 140 150 160 170 180
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 VVPPRGVLLHGPPGCGKTLLAHAIAGELDLPILKVAAPEIVSGVSGESEQKLRELFEQAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 VVPPRGVLLHGPPGCGKTLLAHAIAGELDLPILKVAAPEIVSGVSGESEQKLRELFEQAV
190 200 210 220 230 240
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 SNAPCIIFIDEIDAITPKREVASKDMERRIVAQLLTCMDDLNNVAATARVLVIGATNRPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 SNAPCIIFIDEIDAITPKREVASKDMERRIVAQLLTCMDDLNNVAATARVLVIGATNRPD
250 260 270 280 290 300
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 SLDPALRRAGRFDREICLGIPDEASRERILQTLCRKLRLPQAFDFCHLAHLTPGFVGADL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 SLDPALRRAGRFDREICLGIPDEASRERILQTLCRKLRLPQAFDFCHLAHLTPGFVGADL
310 320 330 340 350 360
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 MALCREAAMCAVNRVLMKLQEQQKKNPEMEDLPSKGVQEERLGTEPTSETQDELQRLLGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 MALCREAAMCAVNRVLMKLQEQQKKNPEMEDLPSKGVQEERLGTEPTSETQDELQRLLGL
370 380 390 400 410 420
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 LRDQDPLSEEQMQGLCIELNDFIVALSSVQPSAKREGFVTVPNVTWADIGALEDIREELT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 LRDQDPLSEEQMQGLCIELNDFIVALSSVQPSAKREGFVTVPNVTWADIGALEDIREELT
430 440 450 460 470 480
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 MAILAPVRNPDQFKALGLVTPAGVLLAGPPGCGKTLLAKAVANESGLNFISVKGPELLNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 MAILAPVRNPDQFKALGLVTPAGVLLAGPPGCGKTLLAKAVANESGLNFISVKGPELLNM
490 500 510 520 530 540
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 YVGESERAVRQVFQRAKNSAPCVIFFDEVDALCPRRSDRETGASVRVVNQLLTEMDGLEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 YVGESERAVRQVFQRAKNSAPCVIFFDEVDALCPRRSDRETGASVRVVNQLLTEMDGLEA
550 560 570 580 590 600
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 RQQVFIMAATNRPDIIDPAILRPGRLDKTLFVGLPPPADRLAILKTITKNGTKPPLDADV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 RQQVFIMAATNRPDIIDPAILRPGRLDKTLFVGLPPPADRLAILKTITKNGTKPPLDADV
610 620 630 640 650 660
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 NLEAIAGDLRCDCYTGADLSALVREASICALRQEMARQKSGNEKGELKVSHKHFEEAFKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 NLEAIAGDLRCDCYTGADLSALVREASICALRQEMARQKSGNEKGELKVSHKHFEEAFKK
670 680 690 700 710 720
640 650
pF1KE2 VRSSISKKDQIMYERLQESLSR
::::::::::::::::::::::
CCDS15 VRSSISKKDQIMYERLQESLSR
730 740 750
>>CCDS1541.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 (856 aa)
initn: 4269 init1: 4269 opt: 4269 Z-score: 4595.2 bits: 861.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4269; 100.0% identity (100.0% similar) in 652 aa overlap (8-659:205-856)
10 20 30
pF1KE2 MEDYPDPQDSKDSSLLESDMKRKGKLKNKGSKRKKED
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 IDKTPSVKKDSFFLDLSCEKSNPKKPITEIQDSKDSSLLESDMKRKGKLKNKGSKRKKED
180 190 200 210 220 230
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 LQEVDGEIEAVLQKKAKARGLEFQISNVKFEDVGGNDMTLKEVCKMLIHMRHPEVYHHLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 LQEVDGEIEAVLQKKAKARGLEFQISNVKFEDVGGNDMTLKEVCKMLIHMRHPEVYHHLG
240 250 260 270 280 290
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 VVPPRGVLLHGPPGCGKTLLAHAIAGELDLPILKVAAPEIVSGVSGESEQKLRELFEQAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 VVPPRGVLLHGPPGCGKTLLAHAIAGELDLPILKVAAPEIVSGVSGESEQKLRELFEQAV
300 310 320 330 340 350
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 SNAPCIIFIDEIDAITPKREVASKDMERRIVAQLLTCMDDLNNVAATARVLVIGATNRPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 SNAPCIIFIDEIDAITPKREVASKDMERRIVAQLLTCMDDLNNVAATARVLVIGATNRPD
360 370 380 390 400 410
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 SLDPALRRAGRFDREICLGIPDEASRERILQTLCRKLRLPQAFDFCHLAHLTPGFVGADL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 SLDPALRRAGRFDREICLGIPDEASRERILQTLCRKLRLPQAFDFCHLAHLTPGFVGADL
420 430 440 450 460 470
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 MALCREAAMCAVNRVLMKLQEQQKKNPEMEDLPSKGVQEERLGTEPTSETQDELQRLLGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 MALCREAAMCAVNRVLMKLQEQQKKNPEMEDLPSKGVQEERLGTEPTSETQDELQRLLGL
480 490 500 510 520 530
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 LRDQDPLSEEQMQGLCIELNDFIVALSSVQPSAKREGFVTVPNVTWADIGALEDIREELT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 LRDQDPLSEEQMQGLCIELNDFIVALSSVQPSAKREGFVTVPNVTWADIGALEDIREELT
540 550 560 570 580 590
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 MAILAPVRNPDQFKALGLVTPAGVLLAGPPGCGKTLLAKAVANESGLNFISVKGPELLNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 MAILAPVRNPDQFKALGLVTPAGVLLAGPPGCGKTLLAKAVANESGLNFISVKGPELLNM
600 610 620 630 640 650
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 YVGESERAVRQVFQRAKNSAPCVIFFDEVDALCPRRSDRETGASVRVVNQLLTEMDGLEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 YVGESERAVRQVFQRAKNSAPCVIFFDEVDALCPRRSDRETGASVRVVNQLLTEMDGLEA
660 670 680 690 700 710
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 RQQVFIMAATNRPDIIDPAILRPGRLDKTLFVGLPPPADRLAILKTITKNGTKPPLDADV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 RQQVFIMAATNRPDIIDPAILRPGRLDKTLFVGLPPPADRLAILKTITKNGTKPPLDADV
720 730 740 750 760 770
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 NLEAIAGDLRCDCYTGADLSALVREASICALRQEMARQKSGNEKGELKVSHKHFEEAFKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 NLEAIAGDLRCDCYTGADLSALVREASICALRQEMARQKSGNEKGELKVSHKHFEEAFKK
780 790 800 810 820 830
640 650
pF1KE2 VRSSISKKDQIMYERLQESLSR
::::::::::::::::::::::
CCDS15 VRSSISKKDQIMYERLQESLSR
840 850
>>CCDS58062.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 (667 aa)
initn: 4182 init1: 3495 opt: 3495 Z-score: 3763.3 bits: 706.7 E(32554): 2.7e-203
Smith-Waterman score: 4132; 96.0% identity (96.0% similar) in 667 aa overlap (20-659:1-667)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MEDYPDPQDSKDSSLLESDMKRKGKLKNKGSKRKKEDLQEVDGEIEAVLQKKAKARGLEF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MKRKGKLKNKGSKRKKEDLQEVDGEIEAVLQKKAKARGLEF
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 QISNVKFEDVGGNDMTLKEVCKMLIHMRHPEVYHHLGVVPPRGVLLHGPPGCGKTLLAHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QISNVKFEDVGGNDMTLKEVCKMLIHMRHPEVYHHLGVVPPRGVLLHGPPGCGKTLLAHA
50 60 70 80 90 100
130 140 150
pF1KE2 IAG---------------------------ELDLPILKVAAPEIVSGVSGESEQKLRELF
::: ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IAGAECSGMITAHCSFDFSGSNDPPASASQELDLPILKVAAPEIVSGVSGESEQKLRELF
110 120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 EQAVSNAPCIIFIDEIDAITPKREVASKDMERRIVAQLLTCMDDLNNVAATARVLVIGAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EQAVSNAPCIIFIDEIDAITPKREVASKDMERRIVAQLLTCMDDLNNVAATARVLVIGAT
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 NRPDSLDPALRRAGRFDREICLGIPDEASRERILQTLCRKLRLPQAFDFCHLAHLTPGFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NRPDSLDPALRRAGRFDREICLGIPDEASRERILQTLCRKLRLPQAFDFCHLAHLTPGFV
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 GADLMALCREAAMCAVNRVLMKLQEQQKKNPEMEDLPSKGVQEERLGTEPTSETQDELQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GADLMALCREAAMCAVNRVLMKLQEQQKKNPEMEDLPSKGVQEERLGTEPTSETQDELQR
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 LLGLLRDQDPLSEEQMQGLCIELNDFIVALSSVQPSAKREGFVTVPNVTWADIGALEDIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LLGLLRDQDPLSEEQMQGLCIELNDFIVALSSVQPSAKREGFVTVPNVTWADIGALEDIR
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 EELTMAILAPVRNPDQFKALGLVTPAGVLLAGPPGCGKTLLAKAVANESGLNFISVKGPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EELTMAILAPVRNPDQFKALGLVTPAGVLLAGPPGCGKTLLAKAVANESGLNFISVKGPE
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 LLNMYVGESERAVRQVFQRAKNSAPCVIFFDEVDALCPRRSDRETGASVRVVNQLLTEMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LLNMYVGESERAVRQVFQRAKNSAPCVIFFDEVDALCPRRSDRETGASVRVVNQLLTEMD
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 GLEARQQVFIMAATNRPDIIDPAILRPGRLDKTLFVGLPPPADRLAILKTITKNGTKPPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GLEARQQVFIMAATNRPDIIDPAILRPGRLDKTLFVGLPPPADRLAILKTITKNGTKPPL
530 540 550 560 570 580
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 DADVNLEAIAGDLRCDCYTGADLSALVREASICALRQEMARQKSGNEKGELKVSHKHFEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DADVNLEAIAGDLRCDCYTGADLSALVREASICALRQEMARQKSGNEKGELKVSHKHFEE
590 600 610 620 630 640
640 650
pF1KE2 AFKKVRSSISKKDQIMYERLQESLSR
::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AFKKVRSSISKKDQIMYERLQESLSR
650 660
>>CCDS4877.1 PEX6 gene_id:5190|Hs108|chr6 (980 aa)
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50 60 70 80 90 100
pF1KE2 DGEIEAVLQKKAKARGLEFQISNVKFEDVGGNDMTLKEVCKMLIHMRHPEVYHHLGVVPP
: . ..:.: .: .: :.
CCDS48 TSLYMVGSTLSPVPWLPSEESTLWSSLSPPGLEALVSELCAVLKPRLQPGGALLTGT---
410 420 430 440 450 460
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 RGVLLHGPPGCGKTLLAHAIAGELDLPILKVAAPEIVSGVSGESEQKLRELFEQAVSNAP
.:::.:::::::: .. : ..: : .::: . . :: : ::. .: .: :
CCDS48 SSVLLRGPPGCGKTTVVAAACSHLGLHLLKVPCSSLCAESSGAVETKLQAIFSRARRCRP
470 480 490 500 510 520
170 180 190 200 210
pF1KE2 CIIFIDEIDAITPKREVASKDMERRIVA---QLLTCMDDLNNVAATARVLVIGATNRPDS
.... .: . :. ..: :..: .:: : ::. ..:...:.: ..
CCDS48 AVLLLTAVDLLGRDRDGLGEDA--RVMAVLRHLLLNEDPLNSCPP---LMVVATTSRAQD
530 540 550 560 570
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 LDPALRRAGRFDREICLGIPDEASRERILQTLCRKLRLPQAFDFCHLAHLTPGFVGADLM
: .. : : .:. . .:..: ::..: .: : : .. .::. ::: .::.
CCDS48 LPADVQTA--FPHELEVPALSEGQRLSILRALTAHLPLGQEVNLAQLARRCAGFVVGDLY
580 590 600 610 620 630
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 ALCREAAMCAVNRVLMKLQEQQKKNPEMEDLPSKGVQEERLGTEPTSETQDELQRLLGLL
:: ... : .:. :: . . :. :: ::
CCDS48 ALLTHSSRAACTRI---------KNSGL----AGGLTEE-----------DE--------
640 650 660
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 RDQDPLSEEQMQGLCIELNDFIVALSSVQPSAKRE-GFVTVPNVTWADIGALEDIREELT
.: :. . .:: :: ..: . .. : .:.:.: :.:.:.....:.
CCDS48 ------GELCAAGFPLLAEDFGQALEQLQTAHSQAVGAPKIPSVSWHDVGGLQEVKKEIL
670 680 690 700 710
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 MAILAPVRNPDQFKALGLVTPAGVLLAGPPGCGKTLLAKAVANESGLNFISVKGPELLNM
.: :...:. . .::: .:.:: :::: ::::::::::.: .:.:.:::::::.::
CCDS48 ETIQLPLEHPELL-SLGL-RRSGLLLHGPPGTGKTLLAKAVATECSLTFLSVKGPELINM
720 730 740 750 760 770
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 YVGESERAVRQVFQRAKNSAPCVIFFDEVDALCPRR--SDRETGASVRVVNQLLTEMDGL
:::.::. ::.:: ::. .:::.:::::.:.: : : : :. :::.:::.:.:::
CCDS48 YVGQSEENVREVFARARAAAPCIIFFDELDSLAPSRGRSGDSGGVMDRVVSQLLAELDGL
780 790 800 810 820 830
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 EARQQVFIMAATNRPDIIDPAILRPGRLDKTLFVGLPPPADRLAILKTITKNGTKPPLDA
.. :.::...::::::..:::.:::::.:: .::: :: . :.... : :.
CCDS48 HSTQDVFVIGATNRPDLLDPALLRPGRFDKLVFVG--ANEDRASQLRVLSAITRKFKLEP
840 850 860 870 880 890
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 DVNLEAIAGDLRCDC---YTGADLSALVREASICALRQEMARQKSGNEKGE--LKVSHKH
.:.: . : : : ::::: .: .: ::.... . : : : : .. .
CCDS48 SVSLVNV---LDC-CPPQLTGADLYSLCSDAMTAALKRRVHDLEEGLEPGSSALMLTMED
900 910 920 930 940 950
640 650
pF1KE2 FEEAFKKVRSSISKKDQIMYERLQESLSR
. .: ... :.:... . :.:.:....
CCDS48 LLQAAARLQPSVSEQELLRYKRIQRKFAAC
960 970 980
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Smith-Waterman score: 744; 45.9% identity (72.2% similar) in 266 aa overlap (358-622:756-1014)
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 QDELQRLLGLLRDQDPLSEEQMQGLCIELNDFIVALSSVQPSAKREGFVTVP-NVTWADI
:: :: . :.. : . : .. : :
CCDS64 DFTVLVDRAIHSRLSRQSISTREKLVLTTLDFQKALRGFLPASLRSVNLHKPRDLGWDKI
730 740 750 760 770 780
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 GALEDIREELTMAILAPVRNPDQFKALGLVTPAGVLLAGPPGCGKTLLAKAVANESGLNF
:.:...:. : .: :.. :. : : . .:.:: :::: :::::: ..: :: .::
CCDS64 GGLHEVRQILMDTIQLPAKYPELFANLPIRQRTGILLYGPPGTGKTLLAGVIARESRMNF
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pF1KE2 ISVKGPELLNMYVGESERAVRQVFQRAKNSAPCVIFFDEVDALCPRRSDRETGASVRVVN
:::::::::. :.: ::.:::..: ::. . ::..:::: ... :::. .::.. ::::
CCDS64 ISVKGPELLSKYIGASEQAVRDIFIRAQAAKPCILFFDEFESIAPRRGHDNTGVTDRVVN
850 860 870 880 890 900
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 QLLTEMDGLEARQQVFIMAATNRPDIIDPAILRPGRLDKTLFVGLPPPADRLAILKTITK
::::..::.:. : :...:::.:::.::::.:::::::: .. : ..:: ::....
CCDS64 QLLTQLDGVEGLQGVYVLAATSRPDLIDPALLRPGRLDKCVYCPPPDQVSRLEILNVLSD
910 920 930 940 950 960
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 NGTKPPLDADVNLEAIAGDLRCDCYTGADLSALVREASICALRQEMARQKSGNEKGELKV
. :: ::.:. .:. : .:::::.::. .:.. ::. . .:: . :
CCDS64 SL---PLADDVDLQHVAS--VTDSFTGADLKALLYNAQLEALHGMLL--SSGLQDGSSSS
970 980 990 1000 1010
630 640 650
pF1KE2 SHKHFEEAFKKVRSSISKKDQIMYERLQESLSR
CCDS64 DSDLSLSSMVFLNHSSGSDDSAGDGECGLDQSLVSLEMSEILPDESKFNMYRLYFGSSYE
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>>CCDS5627.1 PEX1 gene_id:5189|Hs108|chr7 (1283 aa)
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30 40 50 60 70
pF1KE2 KRKGKLKNKGSKRKKEDLQEVDGEIEAVLQKKAKARGLEFQISNVKFEDVGG-NDMTLKE
:. ... ..: . .:. ..:: :.. ..
CCDS56 WEKEKDKNIFLLSPNLLQKTTIQVLLDPMVKEENSEEIDFILPFLKLSSLGGVNSLGVSS
510 520 530 540 550 560
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 VCKMLIH--MRHPEVYHHLGVVPP-RG--VLLHGPPGCGKTLLAHAIAGE----LDLPIL
. . . : . .: . ...: :. .:: : : ::. ::.:: : :: .
CCDS56 L-EHITHSLLGRPLSRQLMSLVAGLRNGALLLTGGKGSGKSTLAKAICKEAFDKLDAHVE
570 580 590 600 610 620
140 150 160 170 180
pF1KE2 KVAAPEIVSGVSGESEQKLREL-FEQAVSNAPCIIFIDEIDAIT-----PKREVASKDME
.: . . : :. :: :. : .:: : ....:..: :. :..: . ..
CCDS56 RVDC-KALRGKRLENIQKTLEVAFSEAVWMQPSVVLLDDLDLIAGLPAVPEHEHSPDAVQ
630 640 650 660 670 680
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 RRIVAQLLTCMDDLNNVAATARVLVIGATNRPDSLDPALRRAGRFDREICLGIPDEASRE
. .:. :. : . .. . : .:.... .:: : : : :. . ..:
CCDS56 SQRLAHALNDMIK-EFISMGSLVALIATSQSQQSLHPLLVSAQGVHIFQCVQHIQPPNQE
690 700 710 720 730 740
250 260 270 280 290
pF1KE2 RILQTLCR--KLRLP------QAFDFCHLAHLTPGFVGADLMALCREAAMCAVNRVLMKL
. . :: : .: .:. :.:. : :::. :. .: :.:.. .
CCDS56 QRCEILCNVIKNKLDCDINKFTDLDLQHVAKETGGFVARDFTVL--------VDRAIHS-
750 760 770 780 790
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 QEQQKKNPEMEDLPSKGVQEERLGTEPTSETQDELQRLLGLLRDQDPLSEEQMQGLCIEL
::. . : :...: .: :
CCDS56 ---------------------RLSRQSIS-TREKL--VLTTL------------------
800 810
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 NDFIVALSSVQPSAKREGFVTVP-NVTWADIGALEDIREELTMAILAPVRNPDQFKALGL
:: :: . :.. : . : .. : ::.:...:. : .: :.. :. : : .
CCDS56 -DFQKALRGFLPASLRSVNLHKPRDLGWDKIGGLHEVRQILMDTIQLPAKYPELFANLPI
820 830 840 850 860 870
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 VTPAGVLLAGPPGCGKTLLAKAVANESGLNFISVKGPELLNMYVGESERAVRQVFQRAKN
.:.:: :::: :::::: ..: :: .:::::::::::. :.: ::.:::..: ::.
CCDS56 RQRTGILLYGPPGTGKTLLAGVIARESRMNFISVKGPELLSKYIGASEQAVRDIFIRAQA
880 890 900 910 920 930
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 SAPCVIFFDEVDALCPRRSDRETGASVRVVNQLLTEMDGLEARQQVFIMAATNRPDIIDP
. ::..:::: ... :::. .::.. ::::::::..::.:. : :...:::.:::.:::
CCDS56 AKPCILFFDEFESIAPRRGHDNTGVTDRVVNQLLTQLDGVEGLQGVYVLAATSRPDLIDP
940 950 960 970 980 990
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 AILRPGRLDKTLFVGLPPPADRLAILKTITKNGTKPPLDADVNLEAIAGDLRCDCYTGAD
:.:::::::: .. : ..:: ::.... . :: ::.:. .:. : .::::
CCDS56 ALLRPGRLDKCVYCPPPDQVSRLEILNVLSDSL---PLADDVDLQHVAS--VTDSFTGAD
1000 1010 1020 1030 1040
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 LSALVREASICALRQEMARQKSGNEKGELKVSHKHFEEAFKKVRSSISKKDQIMYERLQE
:.::. .:.. ::. . .:: . :
CCDS56 LKALLYNAQLEALHGMLL--SSGLQDGSSSSDSDLSLSSMVFLNHSSGSDDSAGDGECGL
1050 1060 1070 1080 1090 1100
>>CCDS3730.1 SPATA5 gene_id:166378|Hs108|chr4 (893 aa)
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20 30 40 50 60 70
pF1KE2 DMKRKGKLKNKGSKRKKEDLQEVDGEIEAVLQKKAKARGLEFQISNVKFEDVGGNDMTLK
..:..: . .:... .. .:: . ::
CCDS37 ERLLKFSIGAKCNTDTFYFISSTTRVNFTEIDKNSKEQDNQFKVT---YDMIGGLSSQLK
310 320 330 340 350 360
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 EVCKML-IHMRHPEVYHHLGVVPPRGVLLHGPPGCGKTLLAHAIAGELDLPILKVAAPEI
. ... . ...::... :. ::::::.:::: :::..:.:.:.:. . . .:::
CCDS37 AIREIIELPLKQPELFKSYGIPAPRGVLLYGPPGTGKTMIARAVANEVGAYVSVINGPEI
370 380 390 400 410 420
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 VSGVSGESEQKLRELFEQAVSNAPCIIFIDEIDAITPKREVASKDMERRIVAQLLTCMDD
.: ::.: :::..: .:. : ::::::.::. :::: :....:.:.::.::: ::
CCDS37 ISKFYGETEAKLRQIFAEATLRHPSIIFIDELDALCPKREGAQNEVEKRVVASLLTLMDG
430 440 450 460 470 480
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 LNNVAATARVLVIGATNRPDSLDPALRRAGRFDREICLGIPDEASRERILQTLCRKLRLP
... .. ..:::.:::::: .:: :::: ::::.:: .:.:. .: ::: : : :.:
CCDS37 IGSEVSEGQVLVLGATNRPHALDAALRRPGRFDKEIEIGVPNAQDRLDILQKLLR--RVP
490 500 510 520 530 540
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 QAF---DFCHLAHLTPGFVGADLMALCREAAMCAVNRVLMKLQEQQKKNPEMEDLPSKGV
. . .. .::. . :.::::: .:: ::..::. :.: ::.:.. :.
CCDS37 HLLTEAELLQLANSAHGYVGADLKVLCNEAGLCALRRIL-------KKQPNLPDV-----
550 560 570 580
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pF1KE2 QEERLGTEPTSETQDELQRLLGLLRDQDPLSEEQMQGLCIELNDFIVALSSVQPSAKREG
.. ::.. : :.::. :.....::: ::
CCDS37 ------------------KVAGLVK--------------ITLKDFLQAMNDIRPSAMREI
590 600 610
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pF1KE2 FVTVPNVTWADIGALEDIREELTMAILAPVRNPDQFKALGLVTPAGVLLAGPPGCGKTLL
. ::::.:.:::.::.:. .: .:. :...:..: .:. : :::: :::::.::..
CCDS37 AIDVPNVSWSDIGGLESIKLKLEQAVEWPLKHPESFIRMGIQPPKGVLLYGPPGCSKTMI
620 630 640 650 660 670
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 AKAVANESGLNFISVKGPELLNMYVGESERAVRQVFQRAKNSAPCVIFFDEVDALCPRRS
:::.::::::::...:::::.: ::::::::::..:..:. :: .:::::.::: .:.
CCDS37 AKALANESGLNFLAIKGPELMNKYVGESERAVRETFRKARAVAPSIIFFDELDALAVERG
680 690 700 710 720 730
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pF1KE2 DRETGASV--RVVNQLLTEMDGLEARQQVFIMAATNRPDIIDPAILRPGRLDKTLFVGLP
. ...: ::. ::::::::.: ..: :.::::::: :: :..::::.:. ..: ::
CCDS37 SSLGAGNVADRVLAQLLTEMDGIEQLKDVTILAATNRPDRIDKALMRPGRIDRIIYVPLP
740 750 760 770 780 790
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 PPADRLAILKTITKNGTKPPLDADVNLEAIAGDLRCDCYTGADLSALVREASICALRQEM
: : :.: .. :.. .:.:. . :. : :.::.. :. :::.. ::....
CCDS37 DAATRREIFKLQFHSM---PVSNEVDLDELI--LQTDAYSGAEIVAVCREAALLALEEDI
800 810 820 830 840 850
620 630 640 650
pF1KE2 ARQKSGNEKGELKVSHKHFEEAFKKVRSSISKKDQIMYERLQESLSR
...: . ..:: .:.. : : .. . .:: ::
CCDS37 --------QANL-IMKRHFTQALSTVTPRIPESLRRFYEDYQEKSGLHTL
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30 40 50 60 70 80
pF1KE2 KGSKRKKEDLQEVDGEIEAVLQKKAKARGLEFQISNVKFEDVGGNDMTLKEVCKML-IHM
: ....: ..:.:: : .. .:. . .
CCDS65 VVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPL
170 180 190 200 210 220
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 RHPEVYHHLGVVPPRGVLLHGPPGCGKTLLAHAIAGELDLPILKVAAPEIVSGVSGESEQ
::: ... .:: ::::.::.:::: ::::.:.:.:.: .. . .:::.: ..::::.
CCDS65 RHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLINGPEIMSKLAGESES
230 240 250 260 270 280
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 KLRELFEQAVSNAPCIIFIDEIDAITPKREVASKDMERRIVAQLLTCMDDLNNVAATARV
.::. ::.: .::: ::::::.:::.:::: . ..:::::.:::: :: :.. :.:
CCDS65 NLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLTLMDGLKQ---RAHV
290 300 310 320 330 340
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 LVIGATNRPDSLDPALRRAGRFDREICLGIPDEASRERILQTLCRKLRLPQAFDFCHLAH
.:..:::::.:.:::::: ::::::. .:::: ..: .::: ....: . :. ..:.
CCDS65 IVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVAN
350 360 370 380 390 400
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pF1KE2 LTPGFVGADLMALCREAAMCAVNRVLMKLQEQQKKNPEMEDLPSKGVQEERLGTEPTSET
: : ::::: ::: :::. :. .:. .. ::
CCDS65 ETHGHVGADLAALCSEAALQAI-----------RKKMDLIDL------------------
410 420 430
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 QDELQRLLGLLRDQDPLSEEQMQGLCIELNDFIVALSSVQPSAKREGFVTVPNVTWADIG
.:: .. : :..: . ..:: :::. .::: :: : ::.::: :::
CCDS65 EDET------------IDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIG
440 450 460 470 480
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 ALEDIREELTMAILAPVRNPDQFKALGLVTPAGVLLAGPPGCGKTLLAKAVANESGLNFI
.:::...:: . ::..::.: .:. ::.
CCDS65 GLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGM-TPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANF
490 500 510 520 530
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 SVKGPELLNMYVGESERAVRQVFQRAKNSAPCVIFFDEVDALCPRRSDRETGASVRVVNQ
CCDS65 ISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADR
540 550 560 570 580 590
>--
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::::::.:. :::: ::..:..:...::::.::::.:.. :. ::. ::.:
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:. : : .. . :::::.. .: :.: .: :: . ..:..
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....:..::.: ::.:::: ::::::.:.:..:: .:::.. ::. ::: . .::.
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