Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2669
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2669, 354 aa
1>>>pF1KE2669 354 - 354 aa - 354 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6966+/-0.0012; mu= 14.0436+/- 0.071
mean_var=129.4460+/-39.749, 0's: 0 Z-trim(102.7): 206 B-trim: 983 in 2/45
Lambda= 0.112728
statistics sampled from 6730 (7053) to 6730 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.555), E-opt: 0.2 (0.217), width: 16
Scan time: 2.560
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3158.2 P2RY13 gene_id:53829|Hs108|chr3 ( 354) 2316 388.9 3.5e-108
CCDS3159.1 P2RY12 gene_id:64805|Hs108|chr3 ( 342) 1083 188.4 7.8e-48
CCDS3156.1 P2RY14 gene_id:9934|Hs108|chr3 ( 338) 1031 179.9 2.7e-45
CCDS3157.1 GPR87 gene_id:53836|Hs108|chr3 ( 358) 915 161.1 1.3e-39
CCDS3155.1 GPR171 gene_id:29909|Hs108|chr3 ( 319) 687 123.9 1.8e-28
CCDS14258.1 GPR34 gene_id:2857|Hs108|chrX ( 381) 537 99.6 4.5e-21
CCDS9492.1 GPR183 gene_id:1880|Hs108|chr13 ( 361) 500 93.6 2.8e-19
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 480 90.3 2.7e-18
CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX ( 337) 464 87.7 1.6e-17
CCDS318.1 PTAFR gene_id:5724|Hs108|chr1 ( 342) 447 84.9 1.1e-16
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 432 82.5 6e-16
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 432 82.6 6.3e-16
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 432 82.6 6.3e-16
CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX ( 365) 415 79.8 4.1e-15
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 410 78.9 6.9e-15
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 403 77.8 1.6e-14
CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 ( 373) 401 77.5 2e-14
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 399 77.1 2.4e-14
CCDS2931.1 GPR15 gene_id:2838|Hs108|chr3 ( 360) 397 76.8 3.1e-14
CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11 ( 377) 397 76.9 3.2e-14
CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11 ( 380) 393 76.2 5e-14
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 385 74.9 1.3e-13
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 385 74.9 1.3e-13
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 385 74.9 1.3e-13
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 385 74.9 1.3e-13
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 385 74.9 1.3e-13
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 385 74.9 1.3e-13
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 385 75.0 1.3e-13
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 385 75.0 1.3e-13
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 385 75.0 1.4e-13
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 384 74.7 1.4e-13
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 385 75.0 1.5e-13
CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 ( 391) 383 74.6 1.6e-13
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 382 74.4 1.7e-13
CCDS12669.1 GPR4 gene_id:2828|Hs108|chr19 ( 362) 379 73.9 2.4e-13
CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14 ( 353) 375 73.2 3.7e-13
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 368 72.1 8.1e-13
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 367 72.0 9.6e-13
CCDS14443.1 GPR174 gene_id:84636|Hs108|chrX ( 333) 360 70.8 1.9e-12
CCDS4032.1 F2R gene_id:2149|Hs108|chr5 ( 425) 356 70.2 3.5e-12
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 354 69.8 3.9e-12
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 353 69.7 4.5e-12
CCDS4033.1 F2RL1 gene_id:2150|Hs108|chr5 ( 397) 348 68.9 8.3e-12
CCDS53842.1 HCAR3 gene_id:8843|Hs108|chr12 ( 387) 347 68.7 9.1e-12
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrY ( 359) 345 68.4 1.1e-11
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrX ( 359) 345 68.4 1.1e-11
CCDS9235.1 HCAR2 gene_id:338442|Hs108|chr12 ( 363) 345 68.4 1.1e-11
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 345 68.4 1.1e-11
CCDS9879.1 GPR65 gene_id:8477|Hs108|chr14 ( 337) 343 68.0 1.3e-11
CCDS8553.1 LPAR5 gene_id:57121|Hs108|chr12 ( 372) 341 67.7 1.7e-11
>>CCDS3158.2 P2RY13 gene_id:53829|Hs108|chr3 (354 aa)
initn: 2316 init1: 2316 opt: 2316 Z-score: 2055.8 bits: 388.9 E(32554): 3.5e-108
Smith-Waterman score: 2316; 99.7% identity (99.7% similar) in 354 aa overlap (1-354:1-354)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MTAAIRRQRELSILPKVTLEAMNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQLVFPALYTVVFLTGIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MTAAIRRQRELSILPKVTLEAMNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQLVFPALYTVVFLTGIL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LNTLALWVFVHIPSSSTFIIYLKNTLVADLIMTLMLPFKILSDSHLAPWQLRAFVCRFSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LNTLALWVFVHIPSSSTFIIYLKNTLVADLIMTLMLPFKILSDSHLAPWQLRAFVCRFSS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 VIFYETMYVGIVLLGLIAFDRFLKIIRPLRNIFLKKPVFAKTVSIFIWFFLFFISLPNMI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS31 VIFYETMYVGIVLLGLIAFDRFLKIIRPLRNIFLKKPVFAKTVSIFIWFFLFFISLPNTI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 LSNKEATPSSVKKCASLKGPLGLKWHQMVNNICQFIFWTVFILMLVFYVVIAKKVYDSYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LSNKEATPSSVKKCASLKGPLGLKWHQMVNNICQFIFWTVFILMLVFYVVIAKKVYDSYR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 KSKSKDRKNNKKLEGKVFVVVAVFFVCFAPFHFARVPYTHSQTNNKTDCRLQNQLFIAKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KSKSKDRKNNKKLEGKVFVVVAVFFVCFAPFHFARVPYTHSQTNNKTDCRLQNQLFIAKE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE2 TTLFLAATNICMDPLIYIFLCKKFTEKLPCMQGRKTTASSQENHSSQTDNITLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TTLFLAATNICMDPLIYIFLCKKFTEKLPCMQGRKTTASSQENHSSQTDNITLG
310 320 330 340 350
>>CCDS3159.1 P2RY12 gene_id:64805|Hs108|chr3 (342 aa)
initn: 1102 init1: 1055 opt: 1083 Z-score: 972.3 bits: 188.4 E(32554): 7.8e-48
Smith-Waterman score: 1083; 49.1% identity (79.1% similar) in 316 aa overlap (36-349:17-332)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 RRQRELSILPKVTLEAMNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQLVFPALYTVVFLTGILLNTLA
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CCDS31 MQAVDNLTSAPGNTSLCTRDYKITQVLFPLLYTVLFFVGLITNGLA
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LWVFVHIPSSSTFIIYLKNTLVADLIMTLMLPFKILSDSHLAPWQLRAFVCRFSSVIFYE
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CCDS31 MRIFFQIRSKSNFIIFLKNTVISDLLMILTFPFKILSDAKLGTGPLRTFVCQVTSVIFYF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 TMYVGIVLLGLIAFDRFLKIIRPLRNIFLKKPVFAKTVSIFIWFFLFFISLPNMILSNKE
:::..: .::::..::. : ::... :. . :: .:. :: :.:..:::::::.:..
CCDS31 TMYISISFLGLITIDRYQKTTRPFKTSNPKNLLGAKILSVVIWAFMFLLSLPNMILTNRQ
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 ATPSSVKKCASLKGPLGLKWHQMVNNICQFIFWTVFILMLVFYVVIAKKVYDSYRKSKSK
..::::. ::. .:: ::..:: ::: ::: :....: :..:.:..: :: ....
CCDS31 PRDKNVKKCSFLKSEFGLVWHEIVNYICQVIFWINFLIVIVCYTLITKELYRSYVRTRGV
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 DRKNNKKLEGKVFVVVAVFFVCFAPFHFARVPYTHSQTNNKTDCRLQNQLFIAKETTLFL
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CCDS31 GKVPRKKVNVKVFIIIAVFFICFVPFHFARIPYTLSQTRDVFDCTAENTLFYVKESTLWL
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350
pF1KE2 AATNICMDPLIYIFLCKKFTEKLPCMQGRKTTASS--QENHSSQTDNITLG
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CCDS31 TSLNACLDPFIYFFLCKSFRNSLISMLKCPNSATSLSQDNRKKEQDGGDPNEETPM
290 300 310 320 330 340
>>CCDS3156.1 P2RY14 gene_id:9934|Hs108|chr3 (338 aa)
initn: 1009 init1: 988 opt: 1031 Z-score: 926.6 bits: 179.9 E(32554): 2.7e-45
Smith-Waterman score: 1031; 46.6% identity (79.0% similar) in 309 aa overlap (22-330:2-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MTAAIRRQRELSILPKVTLEAMNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQLVFPALYTVVFLTGIL
.:.: : ..: : .. :.: ..:.:: .::..:::
CCDS31 MINSTSTQPPDES--CSQNLLITQQIIPVLYCMVFIAGIL
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LNTLALWVFVHIPSSSTFIIYLKNTLVADLIMTLMLPFKILSDSHLAPWQLRAFVCRFSS
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CCDS31 LNGVSGWIFFYVPSSKSFIIYLKNIVIADFVMSLTFPFKILGDSGLGPWQLNVFVCRVSA
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 VIFYETMYVGIVLLGLIAFDRFLKIIRPLRNIFLKKPVFAKTVSIFIWFFLFFISLPNMI
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CCDS31 VLFYVNMYVSIVFFGLISFDRYYKIVKPLWTSFIQSVSYSKLLSVIVWMLMLLLAVPNII
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 LSNKEATPSSVKKCASLKGPLGLKWHQMVNNICQFIFWTVFILMLVFYVVIAKKVYDSYR
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CCDS31 LTNQSVREVTQIKCIELKSELGRKWHKASNYIFVAIFWIVFLLLIVFYTAITKKIFKSHL
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 KSKSKDRKNNKKLEGKVFVVVAVFFVCFAPFHFARVPYTHSQTNNKTDCRLQNQLFIAKE
::. .. . .:: ..: .: ::::::.:.:.::.:::.:::. . .:. .. : ::
CCDS31 KSSRNSTSVKKKSSRNIFSIVFVFFVCFVPYHIARIPYTKSQTEAHYSCQSKEILRYMKE
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350
pF1KE2 TTLFLAATNICMDPLIYIFLCKKFTEKLPCMQGRKTTASSQENHSSQTDNITLG
::.:.:.:.:.::.::.:::. : : : :
CCDS31 FTLLLSAANVCLDPIIYFFLCQPFREIL-CKKLHIPLKAQNDLDISRIKRGNTTLESTDT
280 290 300 310 320 330
>>CCDS3157.1 GPR87 gene_id:53836|Hs108|chr3 (358 aa)
initn: 918 init1: 640 opt: 915 Z-score: 824.4 bits: 161.1 E(32554): 1.3e-39
Smith-Waterman score: 915; 39.7% identity (77.2% similar) in 325 aa overlap (11-328:7-325)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MTAAIRRQRELSILPKVTLEAMNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQ----LVFPALYTVVFL
:. ::. :..... .. :::. ..: . . .:.:.:: ..:.
CCDS31 MGFNLTLAKLPNNELHGQES--HNSGNRSDGPGKNTTLHNEFDTIVLPVLYLIIFV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 TGILLNTLALWVFVHIPSSSTFIIYLKNTLVADLIMTLMLPFKILSDSHLAPWQLRAFVC
..:::: ::.:.: :: ....::.:::: .:::::::: .::.:. :. ..:: .. ..:
CCDS31 ASILLNGLAVWIFFHIRNKTSFIFYLKNIVVADLIMTLTFPFRIVHDAGFGPWYFKFILC
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 RFSSVIFYETMYVGIVLLGLIAFDRFLKIIRPLRNIFLKKPVFAKTVSIFIWFFLFFISL
:..::.:: .::..::.::::..::.::...:. . . . .:.:..:. .: .. .::
CCDS31 RYTSVLFYANMYTSIVFLGLISIDRYLKVVKPFGDSRMYSITFTKVLSVCVWVIMAVLSL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 PNMILSNKEATPSSVKKCASLKGPLGLKWHQMVNNICQFIFWTVFILMLVFYVVIAKKVY
::.::.: . : .... :..::.:::.::: :. . . .: .:..... :..:.. ..
CCDS31 PNIILTNGQPTEDNIHDCSKLKSPLGVKWHTAVTYVNSCLFVAVLVILIGCYIAISRYIH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 DSYRK---SKSKDRKNNKKLEGKVFVVVAVFFVCFAPFHFARVPYTHSQTNNKTDCRLQN
: :. ..:. ::.:.... :::::::.:: :.:. :.:.: :. . : :.
CCDS31 KSSRQFISQSSRKRKHNQSIR----VVVAVFFTCFLPYHLCRIPFTFSHLDRLLDESAQK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 QLFIAKETTLFLAATNICMDPLIYIFLCKKFTEKLPCMQGRKTTASSQENHSSQTDNITL
:. :: ::::.: :.:.::.::.:.:..:...:
CCDS31 ILYYCKEITLFLSACNVCLDPIIYFFMCRSFSRRLFKKSNIRTRSESIRSLQSVRRSEVR
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 G
CCDS31 IYYDYTDV
>>CCDS3155.1 GPR171 gene_id:29909|Hs108|chr3 (319 aa)
initn: 702 init1: 379 opt: 687 Z-score: 624.5 bits: 123.9 E(32554): 1.8e-28
Smith-Waterman score: 687; 33.3% identity (67.3% similar) in 318 aa overlap (31-347:3-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MTAAIRRQRELSILPKVTLEAMNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQLVFPALYTVVFLTGIL
: : :: . : .. .:::.::.
CCDS31 MTNSSFFCPVYKDLEP--FTYFFYLVFLVGII
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KE2 LNTLALWVFVHIPSSSTFI-IYLKNTLVADLIMTLMLPFKILSDSHLAPWQLRAFVCRFS
. .: :.:.. .. . ::: : :.::...:: :: ::. : .:::.:. : :. .
CCDS31 GSCFATWAFIQKNTNHRCVSIYLINLLTADFLLTLALPVKIVVDLGVAPWKLKIFHCQVT
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 SVIFYETMYVGIVLLGLIAFDRFLKIIRPLRNIFLKKPVFAKTVSIFIWFFLFFISLPNM
. ..: .::..:..:.....:: :.. . . ...: ::: .: .:.....: .:::
CCDS31 ACLIYINMYLSIIFLAFVSIDRCLQLTHSCKIYRIQEPGFAKMISTVVWLMVLLIMVPNM
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 ILSNKEATPSSVKKCASLKGPLGLKWHQMVNNICQFIFWTVFILMLVFYVVIAKKVYDSY
.. :. .: : .: .: .:: ..: :: :: . ..:. .. ...:
CCDS31 MIPIKDIKEKSNVGCMEFKKEFGRNWHLLTNFICVAIFLNFSAIILISNCLVIRQLY---
160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 RKSKSKDRKNNKKLEGKVFVVVAVFFVCFAPFHFARVPYTHSQTNNKTDCRLQNQLFIAK
:.. ... : :: ....:.. ...::.:.:..:.::: :::. ::: . .:: ::
CCDS31 RNKDNENYPNVKKALINILLVTTGYIICFVPYHIVRIPYTLSQTEVITDCSTRISLFKAK
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 ETTLFLAATNICMDPLIYIFLCKKFTEKLPCMQGRKTTASSQENHSSQTDNITLG
:.::.::..:.:.::..: : : : :. .: :: .:.....
CCDS31 EATLLLAVSNLCFDPILYYHLSKAFRSKVT-----ETFASPKETKAQKEKLRCENNA
270 280 290 300 310
>>CCDS14258.1 GPR34 gene_id:2857|Hs108|chrX (381 aa)
initn: 434 init1: 269 opt: 537 Z-score: 491.8 bits: 99.6 E(32554): 4.5e-21
Smith-Waterman score: 537; 30.7% identity (63.0% similar) in 300 aa overlap (36-330:46-339)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 RRQRELSILPKVTLEAMNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQLVFPALYTVVFLTGILLNTLA
:: : .... :. . :.:.:..:.. : .:
CCDS14 WPYSSHRMRFITNHSDQPPQNFSATPNVTTCPMDEKLLSTVLTTSYSVIFIVGLVGNIIA
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LWVFVHIPSSSTFI-IYLKNTLVADLIMTLMLPFKILSDSHLAPWQLRAFVCRFSSVIFY
:.::. : . . : ::: :. .:::.. . :::.:. . : : ...:. ...::
CCDS14 LYVFLGIHRKRNSIQIYLLNVAIADLLLIFCLPFRIMYHINQNKWTLGVILCKVVGTLFY
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 ETMYVGIVLLGLIAFDRFLKIIRPL---RNIFLKKPVFAKTVSIFIWFFLFFISLPNMIL
.::..:.:::.:..::..:: : . . : :. .. : ..:.. . : .::
CCDS14 MNMYISIILLGFISLDRYIKINRSIQQRKAITTKQSIY---VCCIVWMLALGGFLTMIIL
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 SNKEATPSSVKKCASLKGPLGLKWHQMVNNICQFIFWTVFILMLVFYVVIAKKVYD-SYR
. :.. .:. : . . : . . : : .:: .:.:... :. :.:.. : :
CCDS14 TLKKGGHNSTM-CFHYRDKHNAKGEAIFNFILVVMFWLIFLLIILSYIKIGKNLLRISKR
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 KSKSKDRKNNKKLEGKVFVVVAVFFVCFAPFHFARVPYTHSQTNNKTDCRLQNQLFIAKE
.:: . . . :.:. .: .::.:.: : : :: : ..: .. . ..:
CCDS14 RSKFPNSGKYATTARNSFIVLIIFTICFVPYHAFRFIYISSQLNV-SSCYWKEIVHKTNE
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350
pF1KE2 TTLFLAATNICMDPLIYIFLCKKFTEKLPCMQGRKTTASSQENHSSQTDNITLG
: :.. : :.::..: :: .. .:. :
CCDS14 IMLVLSSFNSCLDPVMY-FLMSSNIRKIMCQLLFRRFQGEPSRSESTSEFKPGYSLHDTS
320 330 340 350 360
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Smith-Waterman score: 500; 27.4% identity (64.0% similar) in 314 aa overlap (44-350:31-342)
20 30 40 50 60 70
pF1KE2 LPKVTLEAMNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQLVFPALYTVVFLTGILLNTLALWVFVHIP
..:.: :..::. :.. : ::: :.:.
CCDS94 MDIQMANNFTPPSATPQGNDCDLYAHHSTARIVMPLHYSLVFIIGLVGNLLALVVIVQNR
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.. .. .: : ...:...: :: .: . :.. .::.....:: . :.:.
CCDS94 KKINSTTLYSTNLVISDILFTTALPTRIAYYAMGFDWRIGDALCRITALVFYINTYAGVN
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140 150 160 170 180 190
pF1KE2 LLGLIAFDRFLKIIRPLRNIFLKKPVFAKTVSIFIWFFLFFISLPNMI--LSNKEATPSS
.. ...:::. ...::: .:. :: : ::.:...: .:: .: .:..:: .
CCDS94 FMTCLSIDRFIAVVHPLRYNKIKRIEHAKGVCIFVWILVFAQTLPLLINPMSKQEAERIT
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240
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. ... .: : .. . : . . .:..:. : : :.. . ... ....
CCDS94 CMEYPNFEETKSLPW--ILLGACFIGYVLPLIIILICYSQICCKLFRTAKQNPLTEKSGV
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pF1KE2 NKKLEGKVFVVVAVFFVCFAPFHFARVPYTHSQT--NNKTDCRLQNQLFIAKETTLFLAA
::: . ......:: .::.:.: : . . .. .: .: .... :. . :. :
CCDS94 NKKALNTIILIIVVFVLCFTPYHVAIIQHMIKKLRFSNFLECSQRHSFQISLHFTVCLMN
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KE2 TNICMDPLIYIFLCKKFTEKLPCMQGRKTTAS-SQENHSSQTDNITLG
: ::::.::.: :: . .:. : :....: :. .:. .:
CCDS94 FNCCMDPFIYFFACKGYKRKVMRMLKRQVSVSISSAVKSAPEENSREMTETQMMIHSKSS
300 310 320 330 340 350
CCDS94 NGK
360
>>CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 (367 aa)
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Smith-Waterman score: 480; 26.8% identity (62.2% similar) in 336 aa overlap (19-348:32-359)
10 20 30 40
pF1KE2 MTAAIRRQRELSILPKVTLEAMNTTVMQGFN--RSERCPRDTRIVQLV
::. .. .:. .:.: ..: . ...
CCDS21 SKRSWWAGSRKPPREMLKLSGSDSSQSMNGLEVAPPGLITNFSLATAEQCGQETPLENML
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: ..: . :. ... ::::::.:.. .:.: ..: . :::: .:.:: ...
CCDS21 FASFYLLDFILALVGNTLALWLFIRDHKSGTPANVFLMHLAVADLSCVLVLPTRLVYHFS
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pF1KE2 LAPWQLRAFVCRFSSVIFYETMYVGIVLLGLIAFDRFLKIIRPLRNIFLKKPVFAKTVSI
: . ..::... .:: .::..: .: :. :::: :..:.... :..:..:. .
CCDS21 GNHWPFGEIACRLTGFLFYLNMYASIYFLTCISADRFLAIVHPVKSLKLRRPLYAHLACA
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 FIWFFLFFISLPNMILSNKEATPSSVKKCASLKGPLGLKWHQMVNNICQFIFWTVFILML
:.: . ... ...: . . . . : .: . . : .:. : : :: .
CCDS21 FLWVVVA-VAMAPLLVSPQTVQTNHTVVCLQLYREKA-SHHALVSLAVAFTF--PFITTV
190 200 210 220 230
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pF1KE2 VFYVVIAKKVYDSYRKSKSKDRKNNKKLEGKVFVVVAVFFVCFAPFHFARVPYTHSQTNN
. :..: ... .. : : : ..: .. . .:.:.:.:::.:.: : :. ..
CCDS21 TCYLLIIRSLRQGLRVEK---RLKTKAVR-MIAIVLAIFLVCFVPYHVNRSVYVLHYRSH
240 250 260 270 280 290
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pF1KE2 KTDCRLQNQLFIAKETTLFLAATNICMDPLIYIFLCKKFTE---KLPCMQGRKTTASSQE
..: : : .:.. : :.. : .::..:.:. .:: . .: : . : : :
CCDS21 GASCATQRILALANRITSCLTSLNGALDPIMYFFVAEKFRHALCNLLCGKRLKGPPPSFE
300 310 320 330 340 350
350
pF1KE2 NHSSQTDNITLG
......
CCDS21 GKTNESSLSAKSEL
360
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:. .::... ..:.. : ..:.:... .
CCDS14 MDETGNLTVSSATCHDTIDDFRNQVYSTLYSMISVVGFFGNGFVLYVLIKTYHK
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.:.: .:. : ::::. . ::.... : . : . :.::.:. .: ..: .: ..
CCDS14 KSAFQVYMINLAVADLLCVCTLPLRVVYYVHKGIWLFGDFLCRLSTYALYVNLYCSIFFM
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..: : . :. :..:: : :. : . ::.:... : : ..... . .. ::
CCDS14 TAMSFFRCIAIVFPVQNINLVTQKKARFVCVGIWIFVILTSSP-FLMAKPQKDEKNNTKC
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CCDS14 FEPPQDNQTKNHVLVLHYVSLFVGFIIPFVIIIVCYTMI---ILTLLKKSMKKNLSSHKK
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: ..::.:.:.: : :.:. :. . : :. : :.:... : :: :::.
CCDS14 AIGMIMVVTAAFLVSFMPYHIQRTIHLHFLHNETKPCDSVLRMQKSVVI----TLSLAAS
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CCDS14 NCCFDPLLYFFSGGNFRKRLSTF--RKHSLSSVTYVPRKKASLPEKGEEICKV
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CCDS31 MEPHDSSHMDSEFRYTLFPIVYSIIFVLGVIANGYVLWV
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CCDS31 FARLYPCKKFNEIKIFMVNLTMADMLFLITLPLWIVYYQNQGNWILPKFLCNVAGCLFFI
40 50 60 70 80 90
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CCDS31 NTYCSVAFLGVITYNRFQAVTRPIKTAQANTRKRGISLSLVIWVAIVGAASYFLILDSTN
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CCDS31 TVPDSAGSGNVTRCFEHYEKGSVPV---LIIHIFIVFSFFLVFLIILFCNLVIIRTLLMQ
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pF1KE2 SYRKSKSKDRKNNKKLEGKVFVVVAVFFVCFAPFHFARVPYTHSQTNNKTDCRLQNQLFI
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CCDS31 PVQQQRNAEVK--RRALWMVCTVLAVFIICFVPHHVVQLPWTLAELGFQ-DSKFHQAIND
220 230 240 250 260 270
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CCDS31 AHQVTLCLLSTNCVLDPVIYCFLTKKFRKHLT--EKFYSMRSSRKCSRATTDTVTEVVVP
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CCDS31 FNQIPGNSLKN
340
354 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Jan 26 16:52:37 2017 done: Thu Jan 26 16:52:38 2017
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]