Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2625
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2625, 446 aa
1>>>pF1KE2625 446 - 446 aa - 446 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6252+/-0.000419; mu= 16.0242+/- 0.026
mean_var=76.9561+/-15.142, 0's: 0 Z-trim(111.3): 62 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.146202
statistics sampled from 19860 (19916) to 19860 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.603), E-opt: 0.2 (0.234), width: 16
Scan time: 8.560
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_060453 (OMIM: 609224) WD repeat domain phosphoi ( 446) 2904 622.4 7.2e-178
NP_001307701 (OMIM: 609224) WD repeat domain phosp ( 364) 2382 512.3 8.5e-145
XP_016880297 (OMIM: 609224) PREDICTED: WD repeat d ( 318) 2079 448.3 1.3e-125
NP_057087 (OMIM: 609225) WD repeat domain phosphoi ( 436) 1612 349.9 7.6e-96
NP_056425 (OMIM: 609225) WD repeat domain phosphoi ( 454) 1578 342.8 1.1e-93
NP_001028691 (OMIM: 609225) WD repeat domain phosp ( 425) 1566 340.2 6.2e-93
NP_001028690 (OMIM: 609225) WD repeat domain phosp ( 443) 1532 333.0 9.3e-91
NP_001028692 (OMIM: 609225) WD repeat domain phosp ( 384) 1424 310.2 6e-84
XP_006715748 (OMIM: 609225) PREDICTED: WD repeat d ( 310) 1115 245.0 2.1e-64
NP_001265228 (OMIM: 609225) WD repeat domain phosp ( 310) 1115 245.0 2.1e-64
XP_016867441 (OMIM: 609225) PREDICTED: WD repeat d ( 299) 1069 235.3 1.7e-61
NP_062559 (OMIM: 609226) WD repeat domain phosphoi ( 344) 428 100.1 9.5e-21
XP_005256434 (OMIM: 609226) PREDICTED: WD repeat d ( 310) 391 92.3 1.9e-18
NP_001025067 (OMIM: 300526,300894) WD repeat domai ( 360) 356 84.9 3.7e-16
NP_009006 (OMIM: 300526,300894) WD repeat domain p ( 361) 356 85.0 3.7e-16
XP_016880352 (OMIM: 609226) PREDICTED: WD repeat d ( 226) 342 81.9 1.9e-15
XP_016880351 (OMIM: 609226) PREDICTED: WD repeat d ( 226) 342 81.9 1.9e-15
>>NP_060453 (OMIM: 609224) WD repeat domain phosphoinosi (446 aa)
initn: 2904 init1: 2904 opt: 2904 Z-score: 3314.3 bits: 622.4 E(85289): 7.2e-178
Smith-Waterman score: 2904; 99.8% identity (99.8% similar) in 446 aa overlap (1-446:1-446)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MEAEAADAPPGGVESALSCFSFNQDCTSLAIGTKAGYKLFSLSSVEQLDQVHGSNEIPDV
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 MEAEAADAPPGGVESALSCFSFNQDCTSLATGTKAGYKLFSLSSVEQLDQVHGSNEIPDV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 YIVERLFSSSLVVVVSHTKPRQMNVYHFKKGTEICNYSYSSNILSIRLNRQRLLVCLEES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 YIVERLFSSSLVVVVSHTKPRQMNVYHFKKGTEICNYSYSSNILSIRLNRQRLLVCLEES
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 IYIHNIKDMKLLKTLLDIPANPTGLCALSINHSNSYLAYPGSLTSGEIVLYDGNSLKTVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 IYIHNIKDMKLLKTLLDIPANPTGLCALSINHSNSYLAYPGSLTSGEIVLYDGNSLKTVC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TIAAHEGTLAAITFNASGSKLASASEKGTVIRVFSVPDGQKLYEFRRGMKRYVTISSLVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 TIAAHEGTLAAITFNASGSKLASASEKGTVIRVFSVPDGQKLYEFRRGMKRYVTISSLVF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SMDSQFLCASSNTETVHIFKLEQVTNSRPEEPSTWSGYMGKMFMAATNYLPTQVSDMMHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 SMDSQFLCASSNTETVHIFKLEQVTNSRPEEPSTWSGYMGKMFMAATNYLPTQVSDMMHQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 DRAFATARLNFSGQRNICTLSTIQKLPRLLVASSSGHLYMYNLDPQDGGECVLIKTHSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 DRAFATARLNFSGQRNICTLSTIQKLPRLLVASSSGHLYMYNLDPQDGGECVLIKTHSLL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 GSGTTEENKENDLRPSLPQSYAATVARPSASSASTVPGYSEDGGALRGEVIPEHEFATGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 GSGTTEENKENDLRPSLPQSYAATVARPSASSASTVPGYSEDGGALRGEVIPEHEFATGP
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KE2 VCLDDENEFPPIILCRGNQKGKTKQS
::::::::::::::::::::::::::
NP_060 VCLDDENEFPPIILCRGNQKGKTKQS
430 440
>>NP_001307701 (OMIM: 609224) WD repeat domain phosphoin (364 aa)
initn: 2382 init1: 2382 opt: 2382 Z-score: 2720.6 bits: 512.3 E(85289): 8.5e-145
Smith-Waterman score: 2382; 100.0% identity (100.0% similar) in 364 aa overlap (83-446:1-364)
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 GSNEIPDVYIVERLFSSSLVVVVSHTKPRQMNVYHFKKGTEICNYSYSSNILSIRLNRQR
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MNVYHFKKGTEICNYSYSSNILSIRLNRQR
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 LLVCLEESIYIHNIKDMKLLKTLLDIPANPTGLCALSINHSNSYLAYPGSLTSGEIVLYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLVCLEESIYIHNIKDMKLLKTLLDIPANPTGLCALSINHSNSYLAYPGSLTSGEIVLYD
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 GNSLKTVCTIAAHEGTLAAITFNASGSKLASASEKGTVIRVFSVPDGQKLYEFRRGMKRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GNSLKTVCTIAAHEGTLAAITFNASGSKLASASEKGTVIRVFSVPDGQKLYEFRRGMKRY
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 VTISSLVFSMDSQFLCASSNTETVHIFKLEQVTNSRPEEPSTWSGYMGKMFMAATNYLPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VTISSLVFSMDSQFLCASSNTETVHIFKLEQVTNSRPEEPSTWSGYMGKMFMAATNYLPT
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 QVSDMMHQDRAFATARLNFSGQRNICTLSTIQKLPRLLVASSSGHLYMYNLDPQDGGECV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QVSDMMHQDRAFATARLNFSGQRNICTLSTIQKLPRLLVASSSGHLYMYNLDPQDGGECV
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 LIKTHSLLGSGTTEENKENDLRPSLPQSYAATVARPSASSASTVPGYSEDGGALRGEVIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LIKTHSLLGSGTTEENKENDLRPSLPQSYAATVARPSASSASTVPGYSEDGGALRGEVIP
280 290 300 310 320 330
420 430 440
pF1KE2 EHEFATGPVCLDDENEFPPIILCRGNQKGKTKQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EHEFATGPVCLDDENEFPPIILCRGNQKGKTKQS
340 350 360
>>XP_016880297 (OMIM: 609224) PREDICTED: WD repeat domai (318 aa)
initn: 2079 init1: 2079 opt: 2079 Z-score: 2376.0 bits: 448.3 E(85289): 1.3e-125
Smith-Waterman score: 2079; 100.0% identity (100.0% similar) in 318 aa overlap (129-446:1-318)
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 YSSNILSIRLNRQRLLVCLEESIYIHNIKDMKLLKTLLDIPANPTGLCALSINHSNSYLA
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MKLLKTLLDIPANPTGLCALSINHSNSYLA
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 YPGSLTSGEIVLYDGNSLKTVCTIAAHEGTLAAITFNASGSKLASASEKGTVIRVFSVPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YPGSLTSGEIVLYDGNSLKTVCTIAAHEGTLAAITFNASGSKLASASEKGTVIRVFSVPD
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 GQKLYEFRRGMKRYVTISSLVFSMDSQFLCASSNTETVHIFKLEQVTNSRPEEPSTWSGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GQKLYEFRRGMKRYVTISSLVFSMDSQFLCASSNTETVHIFKLEQVTNSRPEEPSTWSGY
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 MGKMFMAATNYLPTQVSDMMHQDRAFATARLNFSGQRNICTLSTIQKLPRLLVASSSGHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MGKMFMAATNYLPTQVSDMMHQDRAFATARLNFSGQRNICTLSTIQKLPRLLVASSSGHL
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 YMYNLDPQDGGECVLIKTHSLLGSGTTEENKENDLRPSLPQSYAATVARPSASSASTVPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YMYNLDPQDGGECVLIKTHSLLGSGTTEENKENDLRPSLPQSYAATVARPSASSASTVPG
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430 440
pF1KE2 YSEDGGALRGEVIPEHEFATGPVCLDDENEFPPIILCRGNQKGKTKQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YSEDGGALRGEVIPEHEFATGPVCLDDENEFPPIILCRGNQKGKTKQS
280 290 300 310
>>NP_057087 (OMIM: 609225) WD repeat domain phosphoinosi (436 aa)
initn: 1578 init1: 1537 opt: 1612 Z-score: 1841.7 bits: 349.9 E(85289): 7.6e-96
Smith-Waterman score: 1612; 59.1% identity (84.9% similar) in 418 aa overlap (21-434:19-433)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MEAEAADAPPGGVESALSCFSFNQDCTSLAIGTKAGYKLFSLSSVEQLDQVHGSNEIPDV
.:::: ::::.:.:.:::.::::::..:.:.. .. ::
NP_057 MNLASQSGEAGAGQLLFANFNQDNTSLAVGSKSGYKFFSLSSVDKLEQIYECTDTEDV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 YIVERLFSSSLVVVVSHTKPRQMNVYHFKKGTEICNYSYSSNILSIRLNRQRLLVCLEES
:::::::::::..:: ::...: ::::::::::::::..::...::::::.::::::
NP_057 CIVERLFSSSLVAIVSLKAPRKLKVCHFKKGTEICNYSYSNTILAVKLNRQRLIVCLEES
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 IYIHNIKDMKLLKTLLDIPANPTGLCALSINHSNSYLAYPGSLTSGEIVLYDGNSLKTVC
.:::::.:::.:.:. . : ::.::::::::..: ::::::: : ::. ..: .:...
NP_057 LYIHNIRDMKVLHTIRETPPNPAGLCALSINNDNCYLAYPGSATIGEVQVFDTINLRAAN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TIAAHEGTLAAITFNASGSKLASASEKGTVIRVFSVPDGQKLYEFRRGMKRYVTISSLVF
: ::.. :::..:.:::.:::.::::::::::::.:.::::.:::::.:: :.: ::.:
NP_057 MIPAHDSPLAALAFDASGTKLATASEKGTVIRVFSIPEGQKLFEFRRGVKRCVSICSLAF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SMDSQFLCASSNTETVHIFKLEQVTNSRPEEPSTWSGYMGKMFMAATNYLPTQVSDMMHQ
:::..:: :::::::::::::: : .. ::::.::.::.::..::.:.:::.::..:..:
NP_057 SMDGMFLSASSNTETVHIFKLETVKEKPPEEPTTWTGYFGKVLMASTSYLPSQVTEMFNQ
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 DRAFATARLNFSGQRNICTLSTIQKLPRLLVASSSGHLYMYNLDPQDGGECVLIKTHSLL
:::::.:: : :..:::.:.::::.:::::....:.:::::::::.::::.:.: : :
NP_057 GRAFATVRLPFCGHKNICSLATIQKIPRLLVGAADGYLYMYNLDPQEGGECALMKQHRLD
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410
pF1KE2 GS-GTTEE--NKENDLRPSLPQSYAATVARPS-ASSASTVPGYSEDGGALRGEVIPEHEF
:: ::.: .. . : . :.:.:.... . . :. : .:..: ::. : . ..
NP_057 GSLETTNEILDSASHDCPLVTQTYGAAAGKGTYVPSSPTRLAYTDDLGAVGGACLEDEAS
360 370 380 390 400 410
420 430 440
pF1KE2 ATGPVCLDDENEFPPIILCRGNQKGKTKQS
: . ::...: ::.::
NP_057 A---LRLDEDSEHPPMILRTD
420 430
>>NP_056425 (OMIM: 609225) WD repeat domain phosphoinosi (454 aa)
initn: 1544 init1: 1503 opt: 1578 Z-score: 1802.7 bits: 342.8 E(85289): 1.1e-93
Smith-Waterman score: 1578; 58.9% identity (84.9% similar) in 411 aa overlap (28-434:44-451)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MEAEAADAPPGGVESALSCFSFNQDCTSLAIGTKAGYKLFSLSSVEQLDQVHGSNEI
:::.:.:.:::.::::::..:.:.. ..
NP_056 QLLFANFNQDNTEVKGASRAAGLGRRAVVWSLAVGSKSGYKFFSLSSVDKLEQIYECTDT
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 PDVYIVERLFSSSLVVVVSHTKPRQMNVYHFKKGTEICNYSYSSNILSIRLNRQRLLVCL
:: :::::::::::..:: ::...: ::::::::::::::..::...::::::.:::
NP_056 EDVCIVERLFSSSLVAIVSLKAPRKLKVCHFKKGTEICNYSYSNTILAVKLNRQRLIVCL
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 EESIYIHNIKDMKLLKTLLDIPANPTGLCALSINHSNSYLAYPGSLTSGEIVLYDGNSLK
:::.:::::.:::.:.:. . : ::.::::::::..: ::::::: : ::. ..: .:.
NP_056 EESLYIHNIRDMKVLHTIRETPPNPAGLCALSINNDNCYLAYPGSATIGEVQVFDTINLR
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 TVCTIAAHEGTLAAITFNASGSKLASASEKGTVIRVFSVPDGQKLYEFRRGMKRYVTISS
.. : ::.. :::..:.:::.:::.::::::::::::.:.::::.:::::.:: :.: :
NP_056 AANMIPAHDSPLAALAFDASGTKLATASEKGTVIRVFSIPEGQKLFEFRRGVKRCVSICS
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 LVFSMDSQFLCASSNTETVHIFKLEQVTNSRPEEPSTWSGYMGKMFMAATNYLPTQVSDM
:.::::..:: :::::::::::::: : .. ::::.::.::.::..::.:.:::.::..:
NP_056 LAFSMDGMFLSASSNTETVHIFKLETVKEKPPEEPTTWTGYFGKVLMASTSYLPSQVTEM
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 MHQDRAFATARLNFSGQRNICTLSTIQKLPRLLVASSSGHLYMYNLDPQDGGECVLIKTH
..: :::::.:: : :..:::.:.::::.:::::....:.:::::::::.::::.:.: :
NP_056 FNQGRAFATVRLPFCGHKNICSLATIQKIPRLLVGAADGYLYMYNLDPQEGGECALMKQH
320 330 340 350 360 370
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 SLLGS-GTTEE--NKENDLRPSLPQSYAATVARPS-ASSASTVPGYSEDGGALRGEVIPE
: :: ::.: .. . : . :.:.:.... . . :. : .:..: ::. : . .
NP_056 RLDGSLETTNEILDSASHDCPLVTQTYGAAAGKGTYVPSSPTRLAYTDDLGAVGGACLED
380 390 400 410 420 430
420 430 440
pF1KE2 HEFATGPVCLDDENEFPPIILCRGNQKGKTKQS
. : . ::...: ::.::
NP_056 EASA---LRLDEDSEHPPMILRTD
440 450
>>NP_001028691 (OMIM: 609225) WD repeat domain phosphoin (425 aa)
initn: 1578 init1: 1537 opt: 1566 Z-score: 1789.4 bits: 340.2 E(85289): 6.2e-93
Smith-Waterman score: 1592; 58.8% identity (83.9% similar) in 417 aa overlap (21-434:19-422)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MEAEAADAPPGGVESALSCFSFNQDCTSLAIGTKAGYKLFSLSSVEQLDQVHGSNEIPDV
.:::: ::::.:.:.:::.::::::..:.:.. .. ::
NP_001 MNLASQSGEAGAGQLLFANFNQDNTSLAVGSKSGYKFFSLSSVDKLEQIYECTDTEDV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 YIVERLFSSSLVVVVSHTKPRQMNVYHFKKGTEICNYSYSSNILSIRLNRQRLLVCLEES
:::::::::::..:: ::...: ::::::::::::::..::...::::::.::::::
NP_001 CIVERLFSSSLVAIVSLKAPRKLKVCHFKKGTEICNYSYSNTILAVKLNRQRLIVCLEES
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 IYIHNIKDMKLLKTLLDIPANPTGLCALSINHSNSYLAYPGSLTSGEIVLYDGNSLKTVC
.:::::.:::.:.:. . : ::.::::::::..: ::::::: : ::. ..: .:...
NP_001 LYIHNIRDMKVLHTIRETPPNPAGLCALSINNDNCYLAYPGSATIGEVQVFDTINLRAAN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TIAAHEGTLAAITFNASGSKLASASEKGTVIRVFSVPDGQKLYEFRRGMKRYVTISSLVF
: ::.. :::..:.:::.:::.::::::::::::.:.::::.:::::.:: :.: ::.:
NP_001 MIPAHDSPLAALAFDASGTKLATASEKGTVIRVFSIPEGQKLFEFRRGVKRCVSICSLAF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SMDSQFLCASSNTETVHIFKLEQVTNSRPEEPSTWSGYMGKMFMAATNYLPTQVSDMMHQ
:::..:: :::::::::::::: : .. ::::.::.::.::..::.:.:::.::..:..:
NP_001 SMDGMFLSASSNTETVHIFKLETVKEKPPEEPTTWTGYFGKVLMASTSYLPSQVTEMFNQ
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 DRAFATARLNFSGQRNICTLSTIQKLPRLLVASSSGHLYMYNLDPQDGGECVLIKTHSLL
:::::.:: : :..:::.:.::::.:::::....:.:::::::::.::::.:.: : :
NP_001 GRAFATVRLPFCGHKNICSLATIQKIPRLLVGAADGYLYMYNLDPQEGGECALMKQHRLD
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410
pF1KE2 GS-GTTEE--NKENDLRPSLPQSYAATVARPSASSASTVPGYSEDGGALRGEVIPEHEFA
:: ::.: .. . : . :.:.:.... .:..: ::. : . .. :
NP_001 GSLETTNEILDSASHDCPLVTQTYGAAAGK----------AYTDDLGAVGGACLEDEASA
360 370 380 390 400
420 430 440
pF1KE2 TGPVCLDDENEFPPIILCRGNQKGKTKQS
. ::...: ::.::
NP_001 ---LRLDEDSEHPPMILRTD
410 420
>>NP_001028690 (OMIM: 609225) WD repeat domain phosphoin (443 aa)
initn: 1544 init1: 1503 opt: 1532 Z-score: 1750.4 bits: 333.0 E(85289): 9.3e-91
Smith-Waterman score: 1558; 58.5% identity (83.9% similar) in 410 aa overlap (28-434:44-440)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MEAEAADAPPGGVESALSCFSFNQDCTSLAIGTKAGYKLFSLSSVEQLDQVHGSNEI
:::.:.:.:::.::::::..:.:.. ..
NP_001 QLLFANFNQDNTEVKGASRAAGLGRRAVVWSLAVGSKSGYKFFSLSSVDKLEQIYECTDT
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 PDVYIVERLFSSSLVVVVSHTKPRQMNVYHFKKGTEICNYSYSSNILSIRLNRQRLLVCL
:: :::::::::::..:: ::...: ::::::::::::::..::...::::::.:::
NP_001 EDVCIVERLFSSSLVAIVSLKAPRKLKVCHFKKGTEICNYSYSNTILAVKLNRQRLIVCL
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 EESIYIHNIKDMKLLKTLLDIPANPTGLCALSINHSNSYLAYPGSLTSGEIVLYDGNSLK
:::.:::::.:::.:.:. . : ::.::::::::..: ::::::: : ::. ..: .:.
NP_001 EESLYIHNIRDMKVLHTIRETPPNPAGLCALSINNDNCYLAYPGSATIGEVQVFDTINLR
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 TVCTIAAHEGTLAAITFNASGSKLASASEKGTVIRVFSVPDGQKLYEFRRGMKRYVTISS
.. : ::.. :::..:.:::.:::.::::::::::::.:.::::.:::::.:: :.: :
NP_001 AANMIPAHDSPLAALAFDASGTKLATASEKGTVIRVFSIPEGQKLFEFRRGVKRCVSICS
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 LVFSMDSQFLCASSNTETVHIFKLEQVTNSRPEEPSTWSGYMGKMFMAATNYLPTQVSDM
:.::::..:: :::::::::::::: : .. ::::.::.::.::..::.:.:::.::..:
NP_001 LAFSMDGMFLSASSNTETVHIFKLETVKEKPPEEPTTWTGYFGKVLMASTSYLPSQVTEM
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 MHQDRAFATARLNFSGQRNICTLSTIQKLPRLLVASSSGHLYMYNLDPQDGGECVLIKTH
..: :::::.:: : :..:::.:.::::.:::::....:.:::::::::.::::.:.: :
NP_001 FNQGRAFATVRLPFCGHKNICSLATIQKIPRLLVGAADGYLYMYNLDPQEGGECALMKQH
320 330 340 350 360 370
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 SLLGS-GTTEE--NKENDLRPSLPQSYAATVARPSASSASTVPGYSEDGGALRGEVIPEH
: :: ::.: .. . : . :.:.:.... .:..: ::. : . ..
NP_001 RLDGSLETTNEILDSASHDCPLVTQTYGAAAGK----------AYTDDLGAVGGACLEDE
380 390 400 410 420
420 430 440
pF1KE2 EFATGPVCLDDENEFPPIILCRGNQKGKTKQS
: . ::...: ::.::
NP_001 ASA---LRLDEDSEHPPMILRTD
430 440
>>NP_001028692 (OMIM: 609225) WD repeat domain phosphoin (384 aa)
initn: 1436 init1: 1395 opt: 1424 Z-score: 1628.2 bits: 310.2 E(85289): 6e-84
Smith-Waterman score: 1450; 58.6% identity (83.1% similar) in 384 aa overlap (54-434:11-381)
30 40 50 60 70 80
pF1KE2 QDCTSLAIGTKAGYKLFSLSSVEQLDQVHGSNEIPDVYIVERLFSSSLVVVVSHTKPRQM
: . :: :::::::::::..:: ::..
NP_001 MFTHVLPFVISADTEDVCIVERLFSSSLVAIVSLKAPRKL
10 20 30 40
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 NVYHFKKGTEICNYSYSSNILSIRLNRQRLLVCLEESIYIHNIKDMKLLKTLLDIPANPT
.: ::::::::::::::..::...::::::.::::::.:::::.:::.:.:. . : ::.
NP_001 KVCHFKKGTEICNYSYSNTILAVKLNRQRLIVCLEESLYIHNIRDMKVLHTIRETPPNPA
50 60 70 80 90 100
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 GLCALSINHSNSYLAYPGSLTSGEIVLYDGNSLKTVCTIAAHEGTLAAITFNASGSKLAS
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NP_001 GLCALSINNDNCYLAYPGSATIGEVQVFDTINLRAANMIPAHDSPLAALAFDASGTKLAT
110 120 130 140 150 160
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 ASEKGTVIRVFSVPDGQKLYEFRRGMKRYVTISSLVFSMDSQFLCASSNTETVHIFKLEQ
::::::::::::.:.::::.:::::.:: :.: ::.::::..:: ::::::::::::::
NP_001 ASEKGTVIRVFSIPEGQKLFEFRRGVKRCVSICSLAFSMDGMFLSASSNTETVHIFKLET
170 180 190 200 210 220
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 VTNSRPEEPSTWSGYMGKMFMAATNYLPTQVSDMMHQDRAFATARLNFSGQRNICTLSTI
: .. ::::.::.::.::..::.:.:::.::..:..: :::::.:: : :..:::.:.::
NP_001 VKEKPPEEPTTWTGYFGKVLMASTSYLPSQVTEMFNQGRAFATVRLPFCGHKNICSLATI
230 240 250 260 270 280
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 QKLPRLLVASSSGHLYMYNLDPQDGGECVLIKTHSLLGS-GTTEE--NKENDLRPSLPQS
::.:::::....:.:::::::::.::::.:.: : : :: ::.: .. . : . :.
NP_001 QKIPRLLVGAADGYLYMYNLDPQEGGECALMKQHRLDGSLETTNEILDSASHDCPLVTQT
290 300 310 320 330 340
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 YAATVARPSASSASTVPGYSEDGGALRGEVIPEHEFATGPVCLDDENEFPPIILCRGNQK
:.:.... .:..: ::. : . .. : . ::...: ::.::
NP_001 YGAAAGK----------AYTDDLGAVGGACLEDEASA---LRLDEDSEHPPMILRTD
350 360 370 380
pF1KE2 GKTKQS
>>XP_006715748 (OMIM: 609225) PREDICTED: WD repeat domai (310 aa)
initn: 1081 init1: 1040 opt: 1115 Z-score: 1277.3 bits: 245.0 E(85289): 2.1e-64
Smith-Waterman score: 1115; 56.1% identity (82.9% similar) in 310 aa overlap (129-434:1-307)
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 YSSNILSIRLNRQRLLVCLEESIYIHNIKDMKLLKTLLDIPANPTGLCALSINHSNSYLA
::.:.:. . : ::.::::::::..: :::
XP_006 MKVLHTIRETPPNPAGLCALSINNDNCYLA
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 YPGSLTSGEIVLYDGNSLKTVCTIAAHEGTLAAITFNASGSKLASASEKGTVIRVFSVPD
:::: : ::. ..: .:... : ::.. :::..:.:::.:::.::::::::::::.:.
XP_006 YPGSATIGEVQVFDTINLRAANMIPAHDSPLAALAFDASGTKLATASEKGTVIRVFSIPE
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 GQKLYEFRRGMKRYVTISSLVFSMDSQFLCASSNTETVHIFKLEQVTNSRPEEPSTWSGY
::::.:::::.:: :.: ::.::::..:: :::::::::::::: : .. ::::.::.::
XP_006 GQKLFEFRRGVKRCVSICSLAFSMDGMFLSASSNTETVHIFKLETVKEKPPEEPTTWTGY
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 MGKMFMAATNYLPTQVSDMMHQDRAFATARLNFSGQRNICTLSTIQKLPRLLVASSSGHL
.::..::.:.:::.::..:..: :::::.:: : :..:::.:.::::.:::::....:.:
XP_006 FGKVLMASTSYLPSQVTEMFNQGRAFATVRLPFCGHKNICSLATIQKIPRLLVGAADGYL
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 YMYNLDPQDGGECVLIKTHSLLGS-GTTEE--NKENDLRPSLPQSYAATVARPS-ASSAS
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XP_006 YMYNLDPQEGGECALMKQHRLDGSLETTNEILDSASHDCPLVTQTYGAAAGKGTYVPSSP
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430 440
pF1KE2 TVPGYSEDGGALRGEVIPEHEFATGPVCLDDENEFPPIILCRGNQKGKTKQS
: .:..: ::. : . .. : . ::...: ::.::
XP_006 TRLAYTDDLGAVGGACLEDEASA---LRLDEDSEHPPMILRTD
280 290 300 310
>>NP_001265228 (OMIM: 609225) WD repeat domain phosphoin (310 aa)
initn: 1081 init1: 1040 opt: 1115 Z-score: 1277.3 bits: 245.0 E(85289): 2.1e-64
Smith-Waterman score: 1115; 56.1% identity (82.9% similar) in 310 aa overlap (129-434:1-307)
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 YSSNILSIRLNRQRLLVCLEESIYIHNIKDMKLLKTLLDIPANPTGLCALSINHSNSYLA
::.:.:. . : ::.::::::::..: :::
NP_001 MKVLHTIRETPPNPAGLCALSINNDNCYLA
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 YPGSLTSGEIVLYDGNSLKTVCTIAAHEGTLAAITFNASGSKLASASEKGTVIRVFSVPD
:::: : ::. ..: .:... : ::.. :::..:.:::.:::.::::::::::::.:.
NP_001 YPGSATIGEVQVFDTINLRAANMIPAHDSPLAALAFDASGTKLATASEKGTVIRVFSIPE
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 GQKLYEFRRGMKRYVTISSLVFSMDSQFLCASSNTETVHIFKLEQVTNSRPEEPSTWSGY
::::.:::::.:: :.: ::.::::..:: :::::::::::::: : .. ::::.::.::
NP_001 GQKLFEFRRGVKRCVSICSLAFSMDGMFLSASSNTETVHIFKLETVKEKPPEEPTTWTGY
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 MGKMFMAATNYLPTQVSDMMHQDRAFATARLNFSGQRNICTLSTIQKLPRLLVASSSGHL
.::..::.:.:::.::..:..: :::::.:: : :..:::.:.::::.:::::....:.:
NP_001 FGKVLMASTSYLPSQVTEMFNQGRAFATVRLPFCGHKNICSLATIQKIPRLLVGAADGYL
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 YMYNLDPQDGGECVLIKTHSLLGS-GTTEE--NKENDLRPSLPQSYAATVARPS-ASSAS
::::::::.::::.:.: : : :: ::.: .. . : . :.:.:.... . . :.
NP_001 YMYNLDPQEGGECALMKQHRLDGSLETTNEILDSASHDCPLVTQTYGAAAGKGTYVPSSP
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430 440
pF1KE2 TVPGYSEDGGALRGEVIPEHEFATGPVCLDDENEFPPIILCRGNQKGKTKQS
: .:..: ::. : . .. : . ::...: ::.::
NP_001 TRLAYTDDLGAVGGACLEDEASA---LRLDEDSEHPPMILRTD
280 290 300 310
446 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 17:19:18 2016 done: Tue Nov 8 17:19:19 2016
Total Scan time: 8.560 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]