FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2605, 595 aa
1>>>pF1KE2605 595 - 595 aa - 595 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7596+/-0.00107; mu= 17.4154+/- 0.064
mean_var=119.4682+/-24.005, 0's: 0 Z-trim(106.8): 171 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.117341
statistics sampled from 9023 (9221) to 9023 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.64), E-opt: 0.2 (0.283), width: 16
Scan time: 2.260
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44820.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12 ( 595) 4000 689.1 4.3e-198
CCDS41744.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12 ( 597) 3981 685.8 4e-197
CCDS44821.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12 ( 624) 3767 649.6 3.3e-186
CCDS9163.1 PTPN11 gene_id:5781|Hs108|chr12 ( 593) 2197 383.8 3.3e-106
CCDS81741.1 PTPN11 gene_id:5781|Hs108|chr12 ( 597) 2180 381.0 2.4e-105
CCDS58280.1 PTPN11 gene_id:5781|Hs108|chr12 ( 460) 1825 320.7 2.5e-87
CCDS47473.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1446) 700 130.8 1.2e-29
CCDS78179.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1462) 700 130.8 1.2e-29
CCDS7658.1 PTPRE gene_id:5791|Hs108|chr10 ( 642) 684 127.7 4.4e-29
CCDS7657.1 PTPRE gene_id:5791|Hs108|chr10 ( 700) 684 127.8 4.7e-29
CCDS75517.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1439) 679 127.3 1.4e-28
CCDS5137.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1440) 679 127.3 1.4e-28
CCDS42874.1 PTPRT gene_id:11122|Hs108|chr20 (1441) 669 125.6 4.4e-28
CCDS68127.1 PTPRT gene_id:11122|Hs108|chr20 (1460) 669 125.6 4.4e-28
CCDS5592.1 PTPN12 gene_id:5782|Hs108|chr7 ( 780) 665 124.6 4.7e-28
CCDS13039.1 PTPRA gene_id:5786|Hs108|chr20 ( 793) 660 123.8 8.5e-28
CCDS13038.1 PTPRA gene_id:5786|Hs108|chr20 ( 802) 660 123.8 8.5e-28
CCDS863.1 PTPN22 gene_id:26191|Hs108|chr1 ( 807) 657 123.3 1.2e-27
CCDS34740.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7 (2315) 659 124.1 2e-27
CCDS56505.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7 (1448) 654 123.0 2.6e-27
CCDS75813.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1496) 652 122.7 3.3e-27
CCDS55288.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1502) 652 122.7 3.3e-27
CCDS6472.2 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1505) 652 122.7 3.3e-27
CCDS55289.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1505) 652 122.7 3.3e-27
CCDS55290.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1506) 652 122.7 3.3e-27
CCDS43786.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1912) 652 122.8 3.9e-27
CCDS12139.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1501) 648 122.0 5.3e-27
CCDS74265.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1505) 648 122.0 5.3e-27
CCDS55846.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (1907) 649 122.3 5.6e-27
CCDS55845.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (1907) 649 122.3 5.6e-27
CCDS44944.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (1997) 649 122.3 5.7e-27
CCDS81713.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (2127) 649 122.4 6e-27
CCDS44943.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (2215) 649 122.4 6.2e-27
CCDS12140.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1910) 648 122.2 6.3e-27
CCDS45930.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1948) 648 122.2 6.3e-27
CCDS11840.1 PTPRM gene_id:5797|Hs108|chr18 (1452) 641 120.8 1.2e-26
CCDS58613.1 PTPRM gene_id:5797|Hs108|chr18 (1465) 641 120.8 1.2e-26
CCDS1398.2 PTPRC gene_id:5788|Hs108|chr1 (1145) 633 119.4 2.6e-26
CCDS1397.2 PTPRC gene_id:5788|Hs108|chr1 (1306) 633 119.4 2.8e-26
CCDS53754.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 ( 377) 625 117.5 3.1e-26
CCDS44837.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 ( 405) 625 117.5 3.3e-26
CCDS54321.1 PTPRH gene_id:5794|Hs108|chr19 ( 937) 626 118.1 5.1e-26
CCDS33110.1 PTPRH gene_id:5794|Hs108|chr19 (1115) 626 118.2 5.8e-26
CCDS8674.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 (1188) 625 118.0 6.8e-26
CCDS8675.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 (1216) 625 118.0 6.9e-26
CCDS490.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1898) 627 118.6 7.3e-26
CCDS489.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1907) 627 118.6 7.4e-26
CCDS13430.1 PTPN1 gene_id:5770|Hs108|chr20 ( 435) 613 115.5 1.4e-25
CCDS2129.1 PTPN4 gene_id:5775|Hs108|chr2 ( 926) 614 116.1 2.1e-25
CCDS2161.1 PTPN18 gene_id:26469|Hs108|chr2 ( 460) 600 113.4 6.7e-25
>>CCDS44820.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12 (595 aa)
initn: 4000 init1: 4000 opt: 4000 Z-score: 3669.8 bits: 689.1 E(32554): 4.3e-198
Smith-Waterman score: 4000; 100.0% identity (100.0% similar) in 595 aa overlap (1-595:1-595)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MVRWFHRDLSGLDAETLLKGRGVHGSFLARPSRKNQGDFSLSVRVGDQVTHIRIQNSGDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MVRWFHRDLSGLDAETLLKGRGVHGSFLARPSRKNQGDFSLSVRVGDQVTHIRIQNSGDF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 YDLYGGEKFATLTELVEYYTQQQGVLQDRDGTIIHLKYPLNCSDPTSERWYHGHMSGGQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YDLYGGEKFATLTELVEYYTQQQGVLQDRDGTIIHLKYPLNCSDPTSERWYHGHMSGGQA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 ETLLQAKGEPWTFLVRESLSQPGDFVLSVLSDQPKAGPGSPLRVTHIKVMCEGGRYTVGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ETLLQAKGEPWTFLVRESLSQPGDFVLSVLSDQPKAGPGSPLRVTHIKVMCEGGRYTVGG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 LETFDSLTDLVEHFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIENRVLELNKKQESEDTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LETFDSLTDLVEHFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIENRVLELNKKQESEDTA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 KAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKGKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKGKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 YINANYIKNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMAWQENSRVIVMTTREVEKGRNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YINANYIKNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMAWQENSRVIVMTTREVEKGRNK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 CVPYWPEVGMQRAYGPYSVTNCGEHDTTEYKLRTLQVSPLDNGDLIREIWHYQYLSWPDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 CVPYWPEVGMQRAYGPYSVTNCGEHDTTEYKLRTLQVSPLDNGDLIREIWHYQYLSWPDH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 GVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMENISTKGLDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMENISTKGLDC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 DIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVLQSQKGQESEYGNIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVLQSQKGQESEYGNIT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KE2 YPPAMKNAHAKASRTSSKHKEDVYENLHTKNKREEKVKKQRSADKEKSKGSLKRK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YPPAMKNAHAKASRTSSKHKEDVYENLHTKNKREEKVKKQRSADKEKSKGSLKRK
550 560 570 580 590
>>CCDS41744.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12 (597 aa)
initn: 3981 init1: 3981 opt: 3981 Z-score: 3652.4 bits: 685.8 E(32554): 4e-197
Smith-Waterman score: 3981; 100.0% identity (100.0% similar) in 592 aa overlap (4-595:6-597)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MVRWFHRDLSGLDAETLLKGRGVHGSFLARPSRKNQGDFSLSVRVGDQVTHIRIQNSG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MLSRGWFHRDLSGLDAETLLKGRGVHGSFLARPSRKNQGDFSLSVRVGDQVTHIRIQNSG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 DFYDLYGGEKFATLTELVEYYTQQQGVLQDRDGTIIHLKYPLNCSDPTSERWYHGHMSGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DFYDLYGGEKFATLTELVEYYTQQQGVLQDRDGTIIHLKYPLNCSDPTSERWYHGHMSGG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 QAETLLQAKGEPWTFLVRESLSQPGDFVLSVLSDQPKAGPGSPLRVTHIKVMCEGGRYTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QAETLLQAKGEPWTFLVRESLSQPGDFVLSVLSDQPKAGPGSPLRVTHIKVMCEGGRYTV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 GGLETFDSLTDLVEHFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIENRVLELNKKQESED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GGLETFDSLTDLVEHFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIENRVLELNKKQESED
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 TAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKGKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKGKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 SDYINANYIKNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMAWQENSRVIVMTTREVEKGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SDYINANYIKNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMAWQENSRVIVMTTREVEKGR
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 NKCVPYWPEVGMQRAYGPYSVTNCGEHDTTEYKLRTLQVSPLDNGDLIREIWHYQYLSWP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NKCVPYWPEVGMQRAYGPYSVTNCGEHDTTEYKLRTLQVSPLDNGDLIREIWHYQYLSWP
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 DHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMENISTKGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMENISTKGL
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 DCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVLQSQKGQESEYGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVLQSQKGQESEYGN
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 ITYPPAMKNAHAKASRTSSKHKEDVYENLHTKNKREEKVKKQRSADKEKSKGSLKRK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ITYPPAMKNAHAKASRTSSKHKEDVYENLHTKNKREEKVKKQRSADKEKSKGSLKRK
550 560 570 580 590
>>CCDS44821.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12 (624 aa)
initn: 3963 init1: 3767 opt: 3767 Z-score: 3456.4 bits: 649.6 E(32554): 3.3e-186
Smith-Waterman score: 3767; 99.6% identity (99.6% similar) in 561 aa overlap (1-561:1-561)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MVRWFHRDLSGLDAETLLKGRGVHGSFLARPSRKNQGDFSLSVRVGDQVTHIRIQNSGDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MVRWFHRDLSGLDAETLLKGRGVHGSFLARPSRKNQGDFSLSVRVGDQVTHIRIQNSGDF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 YDLYGGEKFATLTELVEYYTQQQGVLQDRDGTIIHLKYPLNCSDPTSERWYHGHMSGGQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YDLYGGEKFATLTELVEYYTQQQGVLQDRDGTIIHLKYPLNCSDPTSERWYHGHMSGGQA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 ETLLQAKGEPWTFLVRESLSQPGDFVLSVLSDQPKAGPGSPLRVTHIKVMCEGGRYTVGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ETLLQAKGEPWTFLVRESLSQPGDFVLSVLSDQPKAGPGSPLRVTHIKVMCEGGRYTVGG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 LETFDSLTDLVEHFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIENRVLELNKKQESEDTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LETFDSLTDLVEHFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIENRVLELNKKQESEDTA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 KAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKGKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKGKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 YINANYIKNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMAWQENSRVIVMTTREVEKGRNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YINANYIKNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMAWQENSRVIVMTTREVEKGRNK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 CVPYWPEVGMQRAYGPYSVTNCGEHDTTEYKLRTLQVSPLDNGDLIREIWHYQYLSWPDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 CVPYWPEVGMQRAYGPYSVTNCGEHDTTEYKLRTLQVSPLDNGDLIREIWHYQYLSWPDH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 GVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMENISTKGLDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMENISTKGLDC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 DIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVLQSQKGQESEYGNIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVLQSQKGQESEYGNIT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KE2 YPPAMKNAHAKASRTSSKHKEDVYENLHTKNKREEKVKKQRSADKEKSKGSLKRK
:::::::::::::::::: :
CCDS44 YPPAMKNAHAKASRTSSKSLESSAGTVAASPVRRGGQRGLPVPGPPVLSPDLHQLPVLAP
550 560 570 580 590 600
>>CCDS9163.1 PTPN11 gene_id:5781|Hs108|chr12 (593 aa)
initn: 2368 init1: 939 opt: 2197 Z-score: 2020.3 bits: 383.8 E(32554): 3.3e-106
Smith-Waterman score: 2197; 58.6% identity (81.2% similar) in 544 aa overlap (3-541:5-547)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MVRWFHRDLSGLDAETLLKGRGVHGSFLARPSRKNQGDFSLSVRVGDQVTHIRIQNSG
:::: ...:..::.:: ::: ::::::::..: :::.:::: . ::::.:::.:
CCDS91 MTSRRWFHPNITGVEAENLLLTRGVDGSFLARPSKSNPGDFTLSVRRNGAVTHIKIQNTG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 DFYDLYGGEKFATLTELVEYYTQQQGVLQDRDGTIIHLKYPLNCSDPTSERWYHGHMSGG
:.::::::::::::.:::.:: ...: :....: .:.:::::::.:::::::.:::.::
CCDS91 DYYDLYGGEKFATLAELVQYYMEHHGQLKEKNGDVIELKYPLNCADPTSERWFHGHLSGK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 QAETLLQAKGEPWTFLVRESLSQPGDFVLSVLS--DQPKAGPGSPLRVTHIKVMCEGGRY
.:: :: ::. .:::::: :.:::::::: . :. ... :. .:::. . :. .:
CCDS91 EAEKLLTEKGKHGSFLVRESQSHPGDFVLSVRTGDDKGESNDGKS-KVTHVMIRCQELKY
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 TVGGLETFDSLTDLVEHFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIENRVLELNKKQES
::: : ::::::::::.::. . :. :. . :.:: .::.:::.::.:: ::.: :.
CCDS91 DVGGGERFDSLTDLVEHYKKNPMVETLGTVLQLKQPLNTTRINAAEIESRVRELSKLAET
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 EDTAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKGKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNI
: .: :::::::.::.:: : :..: :::: :::.::::::::::::.::.:. : :
CCDS91 TDKVKQGFWEEFETLQQQECKLLYSRKEGQRQENKNKNRYKNILPFDHTRVVLHDGDPNE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 PGSDYINANYIKNQLLGPDENAK---TYIASQGCLEATVNDFWQMAWQENSRVIVMTTRE
: ::::::: : .. .:.: .:::.::::. ::::::.:..:::::::::::.:
CCDS91 PVSDYINANIIMPEFETKCNNSKPKKSYIATQGCLQNTVNDFWRMVFQENSRVIVMTTKE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 VEKGRNKCVPYWPEVGMQRAYGPYSVTNCGEHDTTEYKLRTLQVSPLDNGDLIREIWHYQ
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CCDS91 VERGKSKCVKYWPDEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQGNTERTVWQYH
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 YLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMENI
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CCDS91 FRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVHHKQESIMDAGPVVVHCSAGIGRTGTFIVIDILIDII
420 430 440 450 460 470
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pF1KE2 STKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVLQSQKGQE
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CCDS91 REKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVQTEAQYRFIYMAVQHYIETLQRRIEEEQKSKRKG
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 SEYGNITYPPAMKNAHAKASRTSSKHKEDVYENLHTKNKREEKVKKQRSADKEKSKGSLK
:: :: :
CCDS91 HEYTNIKYSLADQTSGDQSPLPPCTPTPPCAEMREDSARVYENVGLMQQQKSFR
540 550 560 570 580 590
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10 20 30 40 50
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:::: ...:..::.:: ::: ::::::::..: :::.:::: . ::::.:::.:
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pF1KE2 DFYDLYGGEKFATLTELVEYYTQQQGVLQDRDGTIIHLKYPLNCSDPTSERWYHGHMSGG
:.::::::::::::.:::.:: ...: :....: .:.:::::::.:::::::.:::.::
CCDS81 DYYDLYGGEKFATLAELVQYYMEHHGQLKEKNGDVIELKYPLNCADPTSERWFHGHLSGK
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CCDS81 EAEKLLTEKGKHGSFLVRESQSHPGDFVLSVRTGDDKGESNDGKS-KVTHVMIRCQELKY
130 140 150 160 170
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pF1KE2 TVGGLETFDSLTDLVEHFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIENRVLELNKKQES
::: : ::::::::::.::. . :. :. . :.:: .::.:::.::.:: ::.: :.
CCDS81 DVGGGERFDSLTDLVEHYKKNPMVETLGTVLQLKQPLNTTRINAAEIESRVRELSKLAET
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 EDTAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKGKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNI
: .: :::::::.::.:: : :..: :::: :::.::::::::::::.::.:. : :
CCDS81 TDKVKQGFWEEFETLQQQECKLLYSRKEGQRQENKNKNRYKNILPFDHTRVVLHDGDPNE
240 250 260 270 280 290
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pF1KE2 PGSDYINANYIKNQLLGPDENAK---TYIASQGCLEATVNDFWQMAWQENSRVIVMTTRE
: ::::::: : .. .:.: .:::.::::. ::::::.:..:::::::::::.:
CCDS81 PVSDYINANIIMPEFETKCNNSKPKKSYIATQGCLQNTVNDFWRMVFQENSRVIVMTTKE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KE2 VEKGRNKCVPYWPEVGMQRAYGPYSVTNCGEHDTTEYKLRTLQVSP----LDNGDLIREI
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CCDS81 VERGKSKCVKYWPDEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQALLQGNTERTV
360 370 380 390 400 410
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pF1KE2 WHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDML
:.:.. .::::::::.:::::.::......:::. :::..::::::::::::.::::.:
CCDS81 WQYHFRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVHHKQESIMDAGPVVVHCSAGIGRTGTFIVIDIL
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pF1KE2 MENISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVLQSQ
.. : ::.:::::. :::::::.::::::::::::.:::.:. ..::: ....: :..
CCDS81 IDIIREKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVQTEAQYRFIYMAVQHYIETLQRRIEEEQKS
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: . :: :: :
CCDS81 KRKGHEYTNIKYSLADQTSGDQSPLPPCTPTPPCAEMREDSARVYENVGLMQQQKSFR
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10 20 30 40 50
pF1KE2 MVRWFHRDLSGLDAETLLKGRGVHGSFLARPSRKNQGDFSLSVRVGDQVTHIRIQNSG
:::: ...:..::.:: ::: ::::::::..: :::.:::: . ::::.:::.:
CCDS58 MTSRRWFHPNITGVEAENLLLTRGVDGSFLARPSKSNPGDFTLSVRRNGAVTHIKIQNTG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 DFYDLYGGEKFATLTELVEYYTQQQGVLQDRDGTIIHLKYPLNCSDPTSERWYHGHMSGG
:.::::::::::::.:::.:: ...: :....: .:.:::::::.:::::::.:::.::
CCDS58 DYYDLYGGEKFATLAELVQYYMEHHGQLKEKNGDVIELKYPLNCADPTSERWFHGHLSGK
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pF1KE2 QAETLLQAKGEPWTFLVRESLSQPGDFVLSVLS--DQPKAGPGSPLRVTHIKVMCEGGRY
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CCDS58 EAEKLLTEKGKHGSFLVRESQSHPGDFVLSVRTGDDKGESNDGKS-KVTHVMIRCQELKY
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pF1KE2 TVGGLETFDSLTDLVEHFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIENRVLELNKKQES
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CCDS58 DVGGGERFDSLTDLVEHYKKNPMVETLGTVLQLKQPLNTTRINAAEIESRVRELSKLAET
180 190 200 210 220 230
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pF1KE2 EDTAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKGKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNI
: .: :::::::.::.:: : :..: :::: :::.::::::::::::.::.:. : :
CCDS58 TDKVKQGFWEEFETLQQQECKLLYSRKEGQRQENKNKNRYKNILPFDHTRVVLHDGDPNE
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pF1KE2 PGSDYINANYIKNQLLGPDENAK---TYIASQGCLEATVNDFWQMAWQENSRVIVMTTRE
: ::::::: : .. .:.: .:::.::::. ::::::.:..:::::::::::.:
CCDS58 PVSDYINANIIMPEFETKCNNSKPKKSYIATQGCLQNTVNDFWRMVFQENSRVIVMTTKE
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pF1KE2 VEKGRNKCVPYWPEVGMQRAYGPYSVTNCGEHDTTEYKLRTLQVSPLDNGDLIREIWHYQ
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CCDS58 VERGKSKCVKYWPDEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQGNTERTVWQYH
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pF1KE2 YLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMENI
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CCDS58 FRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVHHKQESIMDAGPVVVHCR
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pF1KE2 STKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVLQSQKGQE
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pF1KE2 YINANYIKNQLLGPD-ENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMAWQENSRVIVMTTREVEKGRN
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CCDS47 YINANYIDIWLYRDGYQRPSHYIATQGPVHETVYDFWRMIWQEQSACIVMVTNLVEVGRV
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pF1KE2 KCVPYWPEVGMQRAYGPYSVTNCGEHDT-TEYKLRTLQVSPLDNGDLIREIWHYQYLSWP
:: :::. ..:: ..:: : : . .:: .::. . .. :::. .... .::
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pF1KE2 DHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMENISTKGL
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.:: . .. .:..: .::::: :: ::. ::
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>--
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240 250 260 270 280 290
pF1KE2 DTAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKGKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIP
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CCDS47 TNSSHLKDEFQTLNSVTPRLQAEDCSIACLPRNHDKNRFMDMLPPDRCLPFLITIDGE--
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pF1KE2 GSDYINANYIKNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMAWQENSRVIVMTTREVEKG
.:.:::: :. .. ..:..: : ::.:::..... . ::: . ::. .
CCDS47 SSNYINAA-----LMDSYRQPAAFIVTQYPLPNTVKDFWRLVYDYGCTSIVMLN-EVDLS
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pF1KE2 RNKCVPYWPEVGMQRAYGPYSVT--NCG-EHDTTEYKLRTLQVSPLDNGDLIREIWHYQY
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CCDS47 QG-CPQYWPEEGMLR-YGPIQVECMSCSMDCDVINRIFRICNLTRPQEGYLM--VQQFQY
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pF1KE2 LSWPDHG-VPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHA-GPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMEN
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CCDS47 LGWASHREVPGSKRSFLKLILQVEKWQEECEEGEGRTIIHCLNGGGRSGMFCAIGIVVEM
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pF1KE2 ISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVLQSQKGQ
.. ... .:. .... .: .. .::.. ::.: : . ...:..
CCDS47 VKRQNV---VDVFHAVKTLRNSKPNMVEAPEQYRFCYDVALEYLESS
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pF1KE2 ESEYGNITYPPAMKNAHAKASRTSSKHKEDVYENLHTKNKREEKVKKQRSADKEKSKGSL
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190 200 210 220 230 240
pF1KE2 ETFDSLTDLVEHFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIENRVLELNKKQESEDTAK
:: . ... : :: .: .. . :.
CCDS78 VPITDENHSATAESSRLLDVPRYLCEGTESPYQTGQLHPA---IRVADLLQHINLMKTSD
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pF1KE2 A-GFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKGKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSD
. :: ::.::. . . . ... .:..:::: ::. .:::::::: ... :.::
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::::::: : . . :::.:: .. :: :::.: :::.: :::.: :: ::
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:: :::. ..:: ..:: : : . .:: .::. . .. :::. .... .::
CCDS78 KCYKYWPDD--TEVYGDFKVT-CVEMEPLAEYVVRTFTLERRGYNE-IREVKQFHFTGWP
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::::: . :.:::. .. . . : ::::.:::::: :::: ::::.... .:.
CCDS78 DHGVPYHATGLLSFIRRV--KLSNPPSAGPIVVHCSAGAGRTGCYIVIDIMLDMAEREGV
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CCDS78 ---VDIYNCVKALRSRRINMVQTEEQYIFIHDAILEACLCGETAIPVCEFKAAYFDMIRI
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pF1KE2 ITYPPAMKNAHAKASRTSSKHKEDVYENLHTKNKREEKVKKQRSADKEKSKGSLKRK
CCDS78 DSQTNSSHLKDEFQTLNSVTPRLQAEDCSIACLPRNHDKNRFMDMLPPDRCLPFLITIDG
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>--
initn: 133 init1: 100 opt: 383 Z-score: 355.9 bits: 77.2 E(32554): 1.7e-13
Smith-Waterman score: 383; 29.6% identity (64.2% similar) in 257 aa overlap (268-519:1221-1462)
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 DTAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKGKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIP
:.:. :::. ..:: :. .: :..
CCDS78 TNSSHLKDEFQTLNSVTPRLQAEDCSIACLPRNHDKNRFMDMLPPDRCLPFLITIDGE--
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.:.:::: :. .. ..:..: : ::.:::..... . ::: . ::. .
CCDS78 SSNYINAA-----LMDSYRQPAAFIVTQYPLPNTVKDFWRLVYDYGCTSIVMLN-EVDLS
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pF1KE2 RNKCVPYWPEVGMQRAYGPYSVT--NCG-EHDTTEYKLRTLQVSPLDNGDLIREIWHYQY
.. : :::: :: : ::: .: .:. . :. . .: ... ..: :. . ..::
CCDS78 QG-CPQYWPEEGMLR-YGPIQVECMSCSMDCDVINRIFRICNLTRPQEGYLM--VQQFQY
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pF1KE2 LSWPDHG-VPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHA-GPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMEN
:.: .: ::. . :... :... :: .. : :.:: : ::.: . .: ...:
CCDS78 LGWASHREVPGSKRSFLKLILQVEKWQEECEEGEGRTIIHCLNGGGRSGMFCAIGIVVEM
1360 1370 1380 1390 1400 1410
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pF1KE2 ISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVLQSQKGQ
.. ... .:. .... .: .. .::.. ::.: : . ...:..
CCDS78 VKRQNV---VDVFHAVKTLRNSKPNMVEAPEQYRFCYDVALEYLESS
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