Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2579
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2579, 555 aa
1>>>pF1KE2579 555 - 555 aa - 555 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7045+/-0.000401; mu= 17.4672+/- 0.025
mean_var=83.2217+/-17.282, 0's: 0 Z-trim(112.1): 75 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.140590
statistics sampled from 20868 (20943) to 20868 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.597), E-opt: 0.2 (0.246), width: 16
Scan time: 10.290
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003038 (OMIM: 107310,616291) sodium/hydrogen ex ( 815) 3226 664.7 3.2e-190
XP_011540323 (OMIM: 107310,616291) PREDICTED: sodi ( 705) 2447 506.6 1e-142
NP_003039 (OMIM: 600530) sodium/hydrogen exchanger ( 812) 1743 363.9 1.1e-99
NP_001011552 (OMIM: 600531) sodium/hydrogen exchan ( 798) 1484 311.3 7.2e-84
NP_001271280 (OMIM: 182307,616868) sodium/hydrogen ( 825) 1393 292.9 2.6e-78
NP_004165 (OMIM: 182307,616868) sodium/hydrogen ex ( 834) 1391 292.5 3.5e-78
XP_016879083 (OMIM: 600477) PREDICTED: sodium/hydr ( 544) 1349 283.8 9.2e-76
NP_001310900 (OMIM: 600477) sodium/hydrogen exchan ( 675) 1349 283.9 1.1e-75
NP_001310902 (OMIM: 600477) sodium/hydrogen exchan ( 895) 1349 284.0 1.4e-75
NP_004585 (OMIM: 600477) sodium/hydrogen exchanger ( 896) 1349 284.0 1.4e-75
XP_011509460 (OMIM: 600531) PREDICTED: sodium/hydr ( 769) 1191 251.9 5.4e-66
NP_001310901 (OMIM: 600477) sodium/hydrogen exchan ( 795) 945 202.0 5.8e-51
NP_056081 (OMIM: 612730) sodium/hydrogen exchanger ( 581) 746 161.6 6.4e-39
XP_016861692 (OMIM: 608396,613410) PREDICTED: sodi ( 528) 653 142.7 2.8e-33
XP_016861691 (OMIM: 608396,613410) PREDICTED: sodi ( 578) 653 142.7 3e-33
NP_775924 (OMIM: 608396,613410) sodium/hydrogen ex ( 645) 653 142.7 3.3e-33
NP_001317581 (OMIM: 300231,300243) sodium/hydrogen ( 617) 646 141.3 8.5e-33
XP_016884714 (OMIM: 300231,300243) PREDICTED: sodi ( 617) 646 141.3 8.5e-33
NP_006350 (OMIM: 300231,300243) sodium/hydrogen ex ( 669) 646 141.3 9.1e-33
NP_001171122 (OMIM: 300231,300243) sodium/hydrogen ( 649) 644 140.9 1.2e-32
XP_016884712 (OMIM: 300231,300243) PREDICTED: sodi ( 649) 644 140.9 1.2e-32
XP_016884713 (OMIM: 300231,300243) PREDICTED: sodi ( 649) 644 140.9 1.2e-32
XP_006724789 (OMIM: 300231,300243) PREDICTED: sodi ( 649) 644 140.9 1.2e-32
NP_001036002 (OMIM: 300231,300243) sodium/hydrogen ( 701) 644 140.9 1.3e-32
XP_006724627 (OMIM: 300368) PREDICTED: sodium/hydr ( 706) 624 136.9 2.1e-31
XP_016885395 (OMIM: 300368) PREDICTED: sodium/hydr ( 706) 624 136.9 2.1e-31
XP_011542292 (OMIM: 300368) PREDICTED: sodium/hydr ( 726) 624 136.9 2.1e-31
XP_005272739 (OMIM: 300368) PREDICTED: sodium/hydr ( 726) 624 136.9 2.1e-31
NP_001244220 (OMIM: 300368) sodium/hydrogen exchan ( 726) 624 136.9 2.1e-31
XP_005272738 (OMIM: 300368) PREDICTED: sodium/hydr ( 726) 624 136.9 2.1e-31
XP_016885394 (OMIM: 300368) PREDICTED: sodium/hydr ( 726) 624 136.9 2.1e-31
NP_115980 (OMIM: 300368) sodium/hydrogen exchanger ( 725) 605 133.0 3.1e-30
NP_001247420 (OMIM: 612730) sodium/hydrogen exchan ( 597) 588 129.5 2.9e-29
XP_011527041 (OMIM: 612730) PREDICTED: sodium/hydr ( 589) 567 125.3 5.5e-28
XP_011527040 (OMIM: 612730) PREDICTED: sodium/hydr ( 591) 481 107.8 9.8e-23
NP_001310903 (OMIM: 600477) sodium/hydrogen exchan ( 600) 466 104.8 8.2e-22
NP_001310904 (OMIM: 600477) sodium/hydrogen exchan ( 601) 466 104.8 8.2e-22
XP_011511005 (OMIM: 608396,613410) PREDICTED: sodi ( 429) 436 98.6 4.2e-20
XP_011511006 (OMIM: 608396,613410) PREDICTED: sodi ( 369) 427 96.7 1.3e-19
XP_016883243 (OMIM: 612730) PREDICTED: sodium/hydr ( 565) 376 86.5 2.4e-16
XP_006723819 (OMIM: 612730) PREDICTED: sodium/hydr ( 614) 373 85.9 4e-16
XP_011527044 (OMIM: 612730) PREDICTED: sodium/hydr ( 395) 368 84.8 5.6e-16
XP_016883244 (OMIM: 612730) PREDICTED: sodium/hydr ( 395) 368 84.8 5.6e-16
XP_011527042 (OMIM: 612730) PREDICTED: sodium/hydr ( 564) 370 85.3 5.6e-16
XP_011527039 (OMIM: 612730) PREDICTED: sodium/hydr ( 602) 370 85.3 6e-16
XP_011527038 (OMIM: 612730) PREDICTED: sodium/hydr ( 630) 370 85.3 6.2e-16
XP_011527045 (OMIM: 612730) PREDICTED: sodium/hydr ( 334) 366 84.3 6.5e-16
XP_016883245 (OMIM: 612730) PREDICTED: sodium/hydr ( 334) 366 84.3 6.5e-16
XP_011527046 (OMIM: 612730) PREDICTED: sodium/hydr ( 304) 338 78.6 3.1e-14
XP_011527043 (OMIM: 612730) PREDICTED: sodium/hydr ( 558) 274 65.8 4.1e-10
>>NP_003038 (OMIM: 107310,616291) sodium/hydrogen exchan (815 aa)
initn: 3226 init1: 3226 opt: 3226 Z-score: 3536.2 bits: 664.7 E(85289): 3.2e-190
Smith-Waterman score: 3226; 100.0% identity (100.0% similar) in 495 aa overlap (1-495:1-495)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MVLRSGICGLSPHRIFPSLLVVVALVGLLPVLRSHGLQLSPTASTIRSSEPPRERSIGDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MVLRSGICGLSPHRIFPSLLVVVALVGLLPVLRSHGLQLSPTASTIRSSEPPRERSIGDV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 TTAPPEVTPESRPVNHSVTDHGMKPRKAFPVLGIDYTHVRTPFEISLWILLACLMKIGFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TTAPPEVTPESRPVNHSVTDHGMKPRKAFPVLGIDYTHVRTPFEISLWILLACLMKIGFH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 VIPTISSIVPESCLLIVVGLLVGGLIKGVGETPPFLQSDVFFLFLLPPIILDAGYFLPLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VIPTISSIVPESCLLIVVGLLVGGLIKGVGETPPFLQSDVFFLFLLPPIILDAGYFLPLR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 QFTENLGTILIFAVVGTLWNAFFLGGLMYAVCLVGGEQINNIGLLDNLLFGSIISAVDPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QFTENLGTILIFAVVGTLWNAFFLGGLMYAVCLVGGEQINNIGLLDNLLFGSIISAVDPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 AVLAVFEEIHINELLHILVFGESLLNDAVTVVLYHLFEEFANYEHVGIVDIFLGFLSFFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 AVLAVFEEIHINELLHILVFGESLLNDAVTVVLYHLFEEFANYEHVGIVDIFLGFLSFFV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 VALGGVLVGVVYGVIAAFTSRFTSHIRVIEPLFVFLYSYMAYLSAELFHLSGIMALIASG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VALGGVLVGVVYGVIAAFTSRFTSHIRVIEPLFVFLYSYMAYLSAELFHLSGIMALIASG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 VVMRPYVEANISHKSHTTIKYFLKMWSSVSETLIFIFLGVSTVAGSHHWNWTFVISTLLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VVMRPYVEANISHKSHTTIKYFLKMWSSVSETLIFIFLGVSTVAGSHHWNWTFVISTLLF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 CLIARVLGVLGLTWFINKFRIVKLTPKDQFIIAYGGLRGAIAFSLGYLLDKKHFPMCDLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 CLIARVLGVLGLTWFINKFRIVKLTPKDQFIIAYGGLRGAIAFSLGYLLDKKHFPMCDLF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 LTAIITVIFFTVFVQVLGQGRAGPCLGDPHRLFPWKERKACDLKCDSSPSSTTNLLCDLG
:::::::::::::::
NP_003 LTAIITVIFFTVFVQGMTIRPLVDLLAVKKKQETKRSINEEIHTQFLDHLLTGIEDICGH
490 500 510 520 530 540
>>XP_011540323 (OMIM: 107310,616291) PREDICTED: sodium/h (705 aa)
initn: 2447 init1: 2447 opt: 2447 Z-score: 2683.1 bits: 506.6 E(85289): 1e-142
Smith-Waterman score: 2447; 100.0% identity (100.0% similar) in 378 aa overlap (118-495:8-385)
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 AFPVLGIDYTHVRTPFEISLWILLACLMKIGFHVIPTISSIVPESCLLIVVGLLVGGLIK
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MGKDACPGFHVIPTISSIVPESCLLIVVGLLVGGLIK
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 GVGETPPFLQSDVFFLFLLPPIILDAGYFLPLRQFTENLGTILIFAVVGTLWNAFFLGGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GVGETPPFLQSDVFFLFLLPPIILDAGYFLPLRQFTENLGTILIFAVVGTLWNAFFLGGL
40 50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 MYAVCLVGGEQINNIGLLDNLLFGSIISAVDPVAVLAVFEEIHINELLHILVFGESLLND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MYAVCLVGGEQINNIGLLDNLLFGSIISAVDPVAVLAVFEEIHINELLHILVFGESLLND
100 110 120 130 140 150
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 AVTVVLYHLFEEFANYEHVGIVDIFLGFLSFFVVALGGVLVGVVYGVIAAFTSRFTSHIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AVTVVLYHLFEEFANYEHVGIVDIFLGFLSFFVVALGGVLVGVVYGVIAAFTSRFTSHIR
160 170 180 190 200 210
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 VIEPLFVFLYSYMAYLSAELFHLSGIMALIASGVVMRPYVEANISHKSHTTIKYFLKMWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VIEPLFVFLYSYMAYLSAELFHLSGIMALIASGVVMRPYVEANISHKSHTTIKYFLKMWS
220 230 240 250 260 270
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 SVSETLIFIFLGVSTVAGSHHWNWTFVISTLLFCLIARVLGVLGLTWFINKFRIVKLTPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SVSETLIFIFLGVSTVAGSHHWNWTFVISTLLFCLIARVLGVLGLTWFINKFRIVKLTPK
280 290 300 310 320 330
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 DQFIIAYGGLRGAIAFSLGYLLDKKHFPMCDLFLTAIITVIFFTVFVQVLGQGRAGPCLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DQFIIAYGGLRGAIAFSLGYLLDKKHFPMCDLFLTAIITVIFFTVFVQGMTIRPLVDLLA
340 350 360 370 380 390
510 520 530 540 550
pF1KE2 DPHRLFPWKERKACDLKCDSSPSSTTNLLCDLGRATPPFWASVSSIVK
XP_011 VKKKQETKRSINEEIHTQFLDHLLTGIEDICGHYGHHHWKDKLNRFNKKYVKKCLIAGER
400 410 420 430 440 450
>>NP_003039 (OMIM: 600530) sodium/hydrogen exchanger 2 p (812 aa)
initn: 1780 init1: 1468 opt: 1743 Z-score: 1910.5 bits: 363.9 E(85289): 1.1e-99
Smith-Waterman score: 1743; 58.5% identity (80.3% similar) in 468 aa overlap (28-494:14-474)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MVLRSGICGLSPHRIFPSLLVVVALVGLLPVLRSHGLQLSPTASTIRSSEPPRERSIGDV
: :.: ::.. .... . :..: .
NP_003 MEPLGNWRSLRAPLPPMLLLLLLQVAGPVGALAETLLNAPRAMG-T
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 TTAPPEVTPESRPVNHSVTDHGMKPRKAFPVLGIDYTHVRTPFEISLWILLACLMKIGFH
...:: .: : : ..: . .. .::. .:: ::. ::::.:::::: : :::::
NP_003 SSSPP--SPASV-VAPGTT---LFEESRLPVFTLDYPHVQIPFEITLWILLASLAKIGFH
50 60 70 80 90
130 140 150 160 170
pF1KE2 VIPTISSIVPESCLLIVVGLLVGGLIKGVGE-TPPFLQSDVFFLFLLPPIILDAGYFLPL
. . .:::::::::.::::.::.: :: : .:: ...:::::.:::::.::::::.:
NP_003 LYHKLPTIVPESCLLIMVGLLLGGIIFGVDEKSPPAMKTDVFFLYLLPPIVLDAGYFMPT
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 RQFTENLGTILIFAVVGTLWNAFFLGGLMYAVCLVGGEQINNIGLLDNLLFGSIISAVDP
: : ::.:::. .::::::::.. .: ....: . . ...: ::.::::::.::::::
NP_003 RPFFENIGTIFWYAVVGTLWNSIGIGVSLFGICQIEAFGLSDITLLQNLLFGSLISAVDP
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 VAVLAVFEEIHINELLHILVFGESLLNDAVTVVLYHLFEEFANYEHVGIVDIFLGFLSFF
::::::::.::.:: :.::::::::::::::::::.::. : ... . .:.: :. .::
NP_003 VAVLAVFENIHVNEQLYILVFGESLLNDAVTVVLYNLFKSFCQMKTIETIDVFAGIANFF
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 VVALGGVLVGVVYGVIAAFTSRFTSHIRVIEPLFVFLYSYMAYLSAELFHLSGIMALIAS
::..::::.:. : :::::.::: .::::::::::::::..:..::.::::::::. :
NP_003 VVGIGGVLIGIFLGFIAAFTTRFTHNIRVIEPLFVFLYSYLSYITAEMFHLSGIMAITAC
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 GVVMRPYVEANISHKSHTTIKYFLKMWSSVSETLIFIFLGVSTVAGSHHWNWTFVISTLL
...: ::: :.:.::.::::::.:: :::::::::::.:::::. .:.:::.:: ::
NP_003 AMTMNKYVEENVSQKSYTTIKYFMKMLSSVSETLIFIFMGVSTVGKNHEWNWAFVCFTLA
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 FCLIARVLGVLGLTWFINKFRIVKLTPKDQFIIAYGGLRGAIAFSLGYLLDKKHFPMCDL
:::. :.:::. :: ::.:: . :: ::::::::::::::: :.: .:: :: :
NP_003 FCLMWRALGVFVLTQVINRFRTIPLTFKDQFIIAYGGLRGAICFALVFLLPAAVFPRKKL
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 FLTAIITVIFFTVFVQVLGQGRAGPCLGDPHRLFPWKERKACDLKCDSSPSSTTNLLCDL
:.:: :.:::::::.
NP_003 FITAAIVVIFFTVFILGITIRPLVEFLDVKRSNKKQQAVSEEIYCRLFDHVKTGIEDVCG
460 470 480 490 500 510
>>NP_001011552 (OMIM: 600531) sodium/hydrogen exchanger (798 aa)
initn: 1244 init1: 757 opt: 1484 Z-score: 1626.7 bits: 311.3 E(85289): 7.2e-84
Smith-Waterman score: 1484; 52.7% identity (81.5% similar) in 421 aa overlap (84-500:52-472)
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 ERSIGDVTTAPPEVTPESRPVNHSVTDHGMKPRKAFPVLGIDYTHVRTPFEISLWILLAC
.:.... :. .:: .:. :.:..::::::
NP_001 ECSEASSDLNESANSTAQYASNAWFAAASSEPEEGISVFELDYDYVQIPYEVTLWILLAS
30 40 50 60 70 80
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 LMKIGFHVIPTISSIVPESCLLIVVGLLVGGLIKGVG-ETPPFLQSDVFFLFLLPPIILD
: :::::. . ...:::::::.:: ::::.: :. ..:: ..:...::.:::::.:.
NP_001 LAKIGFHLYHRLPGLMPESCLLILVGALVGGIIFGTDHKSPPVMDSSIYFLYLLPPIVLE
90 100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 AGYFLPLRQFTENLGTILIFAVVGTLWNAFFLGGLMYAVCLVGGEQINNIGLLDNLLFGS
.:::.: : : ::.:.:: .::.:.: ::. .: .: .: : . .....::.::::::
NP_001 GGYFMPTRPFFENIGSILWWAVLGALINALGIGLSLYLICQVKAFGLGDVNLLQNLLFGS
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280
pF1KE2 IISAVDPVAVLAVFEEIHINELLHILVFGESLLNDAVTVVLYHL---FEEFANYEHVGIV
.::::::::::::::: ..:: :....:::.::::..:::::.. : .. ..: . :
NP_001 LISAVDPVAVLAVFEEARVNEQLYMMIFGEALLNDGITVVLYNMLIAFTKMHKFEDIETV
210 220 230 240 250 260
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 DIFLGFLSFFVVALGGVLVGVVYGVIAAFTSRFTSHIRVIEPLFVFLYSYMAYLSAELFH
::. : :.::.::::: :.:.: :.:: .:::..: .::::.::..::..::.:: ..
NP_001 DILAGCARFIVVGLGGVLFGIVFGFISAFITRFTQNISAIEPLIVFMFSYLSYLAAETLY
270 280 290 300 310 320
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 LSGIMALIASGVVMRPYVEANISHKSHTTIKYFLKMWSSVSETLIFIFLGVSTVAGSHHW
::::.:. : .:.:. ::: :.:. :.::::::.:: :::::::::::.:::::. .:.:
NP_001 LSGILAITACAVTMKKYVEENVSQTSYTTIKYFMKMLSSVSETLIFIFMGVSTVGKNHEW
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 NWTFVISTLLFCLIARVLGVLGLTWFINKFRIVKLTPKDQFIIAYGGLRGAIAFSLGYLL
::.:. :: :: : :...:..: .. :.:: .. ::: :: :.:.::: .:::..::
NP_001 NWAFICFTLAFCQIWRAISVFALFYISNQFRTFPFSIKDQCIIFYSGVRGAGSFSLAFLL
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 DKKHFPMCDLFLTAIITVIFFTVFVQVLGQGRAGPCLGDPHRLFPWKERKACDLKCDSSP
. :: .:.:: ..::.::::.: . :
NP_001 PLSLFPRKKMFVTATLVVIYFTVFIQGITVGPLVRYLDVKKTNKKESINEELHIRLMDHL
450 460 470 480 490 500
530 540 550
pF1KE2 SSTTNLLCDLGRATPPFWASVSSIVK
NP_001 KAGIEDVCGHWSHYQVRDKFKKFDHRYLRKILIRKNLPKSSIVSLYKKLEMKQAIEMVET
510 520 530 540 550 560
>>NP_001271280 (OMIM: 182307,616868) sodium/hydrogen exc (825 aa)
initn: 1194 init1: 529 opt: 1393 Z-score: 1526.8 bits: 292.9 E(85289): 2.6e-78
Smith-Waterman score: 1393; 52.0% identity (78.0% similar) in 419 aa overlap (89-502:42-459)
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 DVTTAPPEVTPESRPVNHSVTDHGMKPRKAFPVLGIDYTHVRTPFEISLWILLACLMKIG
: :. ....::. :. :.::::.: : :::
NP_001 GLLLALALGGLARAGGVEVEPGGAHGESGGFQVVTFEWAHVQDPYVIALWILVASLAKIG
20 30 40 50 60 70
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 FHVIPTISSIVPESCLLIVVGLLVGGLIKGVGETPPF-LQSDVFFLFLLPPIILDAGYFL
::. ..:.:::: ::::.::..::.. .. . : : :::..:::::.::::::.
NP_001 FHLSHKVTSVVPESALLIVLGLVLGGIVWAADHIASFTLTPTVFFFYLLPPIVLDAGYFM
80 90 100 110 120 130
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 PLRQFTENLGTILIFAVVGTLWNAFFLGGLMYAVCLVGGEQINNIGLLDNLLFGSIISAV
: : : ::::::..:::::.::: : .:.: : : .::::: :::::...::
NP_001 PNRLFFGNLGTILLYAVVGTVWNAATTGLSLYGVFLSGLMGDLQIGLLDFLLFGSLMAAV
140 150 160 170 180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 DPVAVLAVFEEIHINELLHILVFGESLLNDAVTVVLYHLFEEFANY--EHVGIVDIFLGF
:::::::::::.:.::.: :.::::::::::::::::..:: :. ..: :: :.
NP_001 DPVAVLAVFEEVHVNEVLFIIVFGESLLNDAVTVVLYNVFESFVALGGDNVTGVDCVKGI
200 210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 LSFFVVALGGVLVGVVYGVIAAFTSRFTSHIRVIEPLFVFLYSYMAYLSAELFHLSGIMA
.:::::.:::.:::::.. . ....:::.:.:.::: :::. ::..::..:.. ::.:.:
NP_001 VSFFVVSLGGTLVGVVFAFLLSLVTRFTKHVRIIEPGFVFIISYLSYLTSEMLSLSAILA
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 LIASGVVMRPYVEANISHKSHTTIKYFLKMWSSVSETLIFIFLGVSTVAGSHHWNWT--F
. :. . ::.::::..: ::..: .:: .: .::.::.:::.:.: . :.:. :
NP_001 ITFCGICCQKYVKANISEQSATTVRYTMKMLASSAETIIFMFLGISAV-NPFIWTWNTAF
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 VISTLLFCLIARVLGVLGLTWFINKFRIVKLTPKDQFIIAYGGLRGAIAFSLGYLLDKKH
:. ::.: . :..::. ::..:..:.:.: : :: ...:::::::.::.: ::: .
NP_001 VLLTLVFISVYRAIGVVLQTWLLNRYRMVQLEPIDQVVLSYGGLRGAVAFALVVLLDGDK
380 390 400 410 420 430
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 FPMCDLFLTAIITVIFFTVFVQVLGQGRAGPCLGDPHRLFPWKERKACDLKCDSSPSSTT
.::... : :.::::. : : :.
NP_001 VKEKNLFVSTTIIVVFFTVIFQWLKVKRSEHREPRLNEKLHGRAFDHILSAIEDISGQIG
440 450 460 470 480 490
>>NP_004165 (OMIM: 182307,616868) sodium/hydrogen exchan (834 aa)
initn: 1193 init1: 529 opt: 1391 Z-score: 1524.5 bits: 292.5 E(85289): 3.5e-78
Smith-Waterman score: 1391; 52.4% identity (78.5% similar) in 414 aa overlap (89-497:42-454)
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 DVTTAPPEVTPESRPVNHSVTDHGMKPRKAFPVLGIDYTHVRTPFEISLWILLACLMKIG
: :. ....::. :. :.::::.: : :::
NP_004 GLLLALALGGLARAGGVEVEPGGAHGESGGFQVVTFEWAHVQDPYVIALWILVASLAKIG
20 30 40 50 60 70
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 FHVIPTISSIVPESCLLIVVGLLVGGLIKGVGETPPF-LQSDVFFLFLLPPIILDAGYFL
::. ..:.:::: ::::.::..::.. .. . : : :::..:::::.::::::.
NP_004 FHLSHKVTSVVPESALLIVLGLVLGGIVWAADHIASFTLTPTVFFFYLLPPIVLDAGYFM
80 90 100 110 120 130
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 PLRQFTENLGTILIFAVVGTLWNAFFLGGLMYAVCLVGGEQINNIGLLDNLLFGSIISAV
: : : ::::::..:::::.::: : .:.: : : .::::: :::::...::
NP_004 PNRLFFGNLGTILLYAVVGTVWNAATTGLSLYGVFLSGLMGDLQIGLLDFLLFGSLMAAV
140 150 160 170 180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 DPVAVLAVFEEIHINELLHILVFGESLLNDAVTVVLYHLFEEFANY--EHVGIVDIFLGF
:::::::::::.:.::.: :.::::::::::::::::..:: :. ..: :: :.
NP_004 DPVAVLAVFEEVHVNEVLFIIVFGESLLNDAVTVVLYNVFESFVALGGDNVTGVDCVKGI
200 210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 LSFFVVALGGVLVGVVYGVIAAFTSRFTSHIRVIEPLFVFLYSYMAYLSAELFHLSGIMA
.:::::.:::.:::::.. . ....:::.:.:.::: :::. ::..::..:.. ::.:.:
NP_004 VSFFVVSLGGTLVGVVFAFLLSLVTRFTKHVRIIEPGFVFIISYLSYLTSEMLSLSAILA
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 LIASGVVMRPYVEANISHKSHTTIKYFLKMWSSVSETLIFIFLGVSTVAGSHHWNWT--F
. :. . ::.::::..: ::..: .:: .: .::.::.:::.:.: . :.:. :
NP_004 ITFCGICCQKYVKANISEQSATTVRYTMKMLASSAETIIFMFLGISAV-NPFIWTWNTAF
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 VISTLLFCLIARVLGVLGLTWFINKFRIVKLTPKDQFIIAYGGLRGAIAFSLGYLLDKKH
:. ::.: . :..::. ::..:..:.:.: : :: ...:::::::.::.: ::: .
NP_004 VLLTLVFISVYRAIGVVLQTWLLNRYRMVQLEPIDQVVLSYGGLRGAVAFALVVLLDGDK
380 390 400 410 420 430
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 FPMCDLFLTAIITVIFFTVFVQVLGQGRAGPCLGDPHRLFPWKERKACDLKCDSSPSSTT
.::... : :.::::. : :
NP_004 VKEKNLFVSTTIIVVFFTVIFQGLTIKPLVQWLKVKRSEHREPRLNEKLHGRAFDHILSA
440 450 460 470 480 490
>>XP_016879083 (OMIM: 600477) PREDICTED: sodium/hydrogen (544 aa)
initn: 1136 init1: 374 opt: 1349 Z-score: 1481.2 bits: 283.8 E(85289): 9.2e-76
Smith-Waterman score: 1349; 51.1% identity (78.6% similar) in 421 aa overlap (84-497:29-447)
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 ERSIGDVTTAPPEVTPESRPVNHSVTDHGMKPRKAFPVLGIDYTHVRTPFEISLWILLAC
.: .. .. .. .:..:. ..::::.:
XP_016 MLRAALSLLALPLAGAAEEPTQKPESPGEPPPGLELFRWQWHEVEAPYLVALWILVAS
10 20 30 40 50
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 LMKIGFHVIPTISSIVPESCLLIVVGLLVGGLIKGVGETPPF-LQSDVFFLFLLPPIILD
: :: ::. ..:.::::::::..::..::.. .:.. . :. .:::::::::.::
XP_016 LAKIVFHLSRKVTSLVPESCLLILLGLVLGGIVLAVAKKAEYQLEPGTFFLFLLPPIVLD
60 70 80 90 100 110
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 AGYFLPLRQFTENLGTILIFAVVGTLWNAFFLGGLMYAVCLVG--GEQINNIGLLDNLLF
.:::.: : : .:::.:: .:::::::::: :. .... .: . ... :::: :::
XP_016 SGYFMPSRLFFDNLGAILTYAVVGTLWNAFTTGAALWGLQQAGLVAPRVQA-GLLDFLLF
120 130 140 150 160 170
240 250 260 270 280
pF1KE2 GSIISAVDPVAVLAVFEEIHINELLHILVFGESLLNDAVTVVLYHLFEEFANY--EHVGI
::.:::::::::::::::.:.:: : :.::::::::::::::::.. . :... .:
XP_016 GSLISAVDPVAVLAVFEEVHVNETLFIIVFGESLLNDAVTVVLYKVCNSFVEMGSANVQA
180 190 200 210 220 230
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 VDIFLGFLSFFVVALGGVLVGVVYGVIAAFTSRFTSHIRVIEPLFVFLYSYMAYLSAELF
.: . : :.:::.:::. ::.:.. . :.:.:::...:.::::.::: .: :::.::.
XP_016 TDYLKGVASLFVVSLGGAAVGLVFAFLLALTTRFTKRVRIIEPLLVFLLAYAAYLTAEMA
240 250 260 270 280 290
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 HLSGIMALIASGVVMRPYVEANISHKSHTTIKYFLKMWSSVSETLIFIFLGVSTVAGSHH
::.:.:. :. . ::::::::::.::.:: .: .: .::.::..::.:.: .:.
XP_016 SLSAILAVTMCGLGCKKYVEANISHKSRTTVKYTMKTLASCAETVIFMLLGISAVDSSK-
300 310 320 330 340 350
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 WNWT--FVISTLLFCLIARVLGVLGLTWFINKFRIVKLTPKDQFIIAYGGLRGAIAFSLG
: : .:..::.: :. :.:::. :: .:.::.: : :: ...:::::::.::.:
XP_016 WAWDSGLVLGTLIFILFFRALGVVLQTWVLNQFRLVPLDKIDQVVMSYGGLRGAVAFALV
360 370 380 390 400 410
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 YLLDKKHFPMCDLFLTAIITVIFFTVFVQVLGQGRAGPCLGDPHRLFPWKERKACDLKCD
:::. . : : :... :.:.::::.:: :
XP_016 ILLDRTKVPAKDYFVATTIVVVFFTVIVQGLTIKPLVKWLKVKRSEHHKPTLNQELHEHT
420 430 440 450 460 470
530 540 550
pF1KE2 SSPSSTTNLLCDLGRATPPFWASVSSIVK
XP_016 FDHILAAVEDVVGHHGYHYWRDRWEQFDKKYLSQLLMRRSAYRIRDQIWDVYYRLNIRDA
480 490 500 510 520 530
>>NP_001310900 (OMIM: 600477) sodium/hydrogen exchanger (675 aa)
initn: 1136 init1: 374 opt: 1349 Z-score: 1479.8 bits: 283.9 E(85289): 1.1e-75
Smith-Waterman score: 1349; 51.1% identity (78.6% similar) in 421 aa overlap (84-497:29-447)
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 ERSIGDVTTAPPEVTPESRPVNHSVTDHGMKPRKAFPVLGIDYTHVRTPFEISLWILLAC
.: .. .. .. .:..:. ..::::.:
NP_001 MLRAALSLLALPLAGAAEEPTQKPESPGEPPPGLELFRWQWHEVEAPYLVALWILVAS
10 20 30 40 50
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 LMKIGFHVIPTISSIVPESCLLIVVGLLVGGLIKGVGETPPF-LQSDVFFLFLLPPIILD
: :: ::. ..:.::::::::..::..::.. .:.. . :. .:::::::::.::
NP_001 LAKIVFHLSRKVTSLVPESCLLILLGLVLGGIVLAVAKKAEYQLEPGTFFLFLLPPIVLD
60 70 80 90 100 110
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 AGYFLPLRQFTENLGTILIFAVVGTLWNAFFLGGLMYAVCLVG--GEQINNIGLLDNLLF
.:::.: : : .:::.:: .:::::::::: :. .... .: . ... :::: :::
NP_001 SGYFMPSRLFFDNLGAILTYAVVGTLWNAFTTGAALWGLQQAGLVAPRVQA-GLLDFLLF
120 130 140 150 160 170
240 250 260 270 280
pF1KE2 GSIISAVDPVAVLAVFEEIHINELLHILVFGESLLNDAVTVVLYHLFEEFANY--EHVGI
::.:::::::::::::::.:.:: : :.::::::::::::::::.. . :... .:
NP_001 GSLISAVDPVAVLAVFEEVHVNETLFIIVFGESLLNDAVTVVLYKVCNSFVEMGSANVQA
180 190 200 210 220 230
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 VDIFLGFLSFFVVALGGVLVGVVYGVIAAFTSRFTSHIRVIEPLFVFLYSYMAYLSAELF
.: . : :.:::.:::. ::.:.. . :.:.:::...:.::::.::: .: :::.::.
NP_001 TDYLKGVASLFVVSLGGAAVGLVFAFLLALTTRFTKRVRIIEPLLVFLLAYAAYLTAEMA
240 250 260 270 280 290
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 HLSGIMALIASGVVMRPYVEANISHKSHTTIKYFLKMWSSVSETLIFIFLGVSTVAGSHH
::.:.:. :. . ::::::::::.::.:: .: .: .::.::..::.:.: .:.
NP_001 SLSAILAVTMCGLGCKKYVEANISHKSRTTVKYTMKTLASCAETVIFMLLGISAVDSSK-
300 310 320 330 340 350
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 WNWT--FVISTLLFCLIARVLGVLGLTWFINKFRIVKLTPKDQFIIAYGGLRGAIAFSLG
: : .:..::.: :. :.:::. :: .:.::.: : :: ...:::::::.::.:
NP_001 WAWDSGLVLGTLIFILFFRALGVVLQTWVLNQFRLVPLDKIDQVVMSYGGLRGAVAFALV
360 370 380 390 400 410
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 YLLDKKHFPMCDLFLTAIITVIFFTVFVQVLGQGRAGPCLGDPHRLFPWKERKACDLKCD
:::. . : : :... :.:.::::.:: :
NP_001 ILLDRTKVPAKDYFVATTIVVVFFTVIVQGLTIKPLVKWLKVKRSEHHKPTLNQELHEHT
420 430 440 450 460 470
530 540 550
pF1KE2 SSPSSTTNLLCDLGRATPPFWASVSSIVK
NP_001 FDHILAAVEDVVGHHGYHYWRDRWEQFDKKYLSQLLMRRSAYRIRDQIWDVYYRLNIRDA
480 490 500 510 520 530
>>NP_001310902 (OMIM: 600477) sodium/hydrogen exchanger (895 aa)
initn: 1136 init1: 374 opt: 1349 Z-score: 1478.0 bits: 284.0 E(85289): 1.4e-75
Smith-Waterman score: 1349; 51.1% identity (78.6% similar) in 421 aa overlap (84-497:29-447)
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 ERSIGDVTTAPPEVTPESRPVNHSVTDHGMKPRKAFPVLGIDYTHVRTPFEISLWILLAC
.: .. .. .. .:..:. ..::::.:
NP_001 MLRAALSLLALPLAGAAEEPTQKPESPGEPPPGLELFRWQWHEVEAPYLVALWILVAS
10 20 30 40 50
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 LMKIGFHVIPTISSIVPESCLLIVVGLLVGGLIKGVGETPPF-LQSDVFFLFLLPPIILD
: :: ::. ..:.::::::::..::..::.. .:.. . :. .:::::::::.::
NP_001 LAKIVFHLSRKVTSLVPESCLLILLGLVLGGIVLAVAKKAEYQLEPGTFFLFLLPPIVLD
60 70 80 90 100 110
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 AGYFLPLRQFTENLGTILIFAVVGTLWNAFFLGGLMYAVCLVG--GEQINNIGLLDNLLF
.:::.: : : .:::.:: .:::::::::: :. .... .: . ... :::: :::
NP_001 SGYFMPSRLFFDNLGAILTYAVVGTLWNAFTTGAALWGLQQAGLVAPRVQA-GLLDFLLF
120 130 140 150 160 170
240 250 260 270 280
pF1KE2 GSIISAVDPVAVLAVFEEIHINELLHILVFGESLLNDAVTVVLYHLFEEFANY--EHVGI
::.:::::::::::::::.:.:: : :.::::::::::::::::.. . :... .:
NP_001 GSLISAVDPVAVLAVFEEVHVNETLFIIVFGESLLNDAVTVVLYKVCNSFVEMGSANVQA
180 190 200 210 220 230
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 VDIFLGFLSFFVVALGGVLVGVVYGVIAAFTSRFTSHIRVIEPLFVFLYSYMAYLSAELF
.: . : :.:::.:::. ::.:.. . :.:.:::...:.::::.::: .: :::.::.
NP_001 TDYLKGVASLFVVSLGGAAVGLVFAFLLALTTRFTKRVRIIEPLLVFLLAYAAYLTAEMA
240 250 260 270 280 290
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 HLSGIMALIASGVVMRPYVEANISHKSHTTIKYFLKMWSSVSETLIFIFLGVSTVAGSHH
::.:.:. :. . ::::::::::.::.:: .: .: .::.::..::.:.: .:.
NP_001 SLSAILAVTMCGLGCKKYVEANISHKSRTTVKYTMKTLASCAETVIFMLLGISAVDSSK-
300 310 320 330 340 350
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 WNWT--FVISTLLFCLIARVLGVLGLTWFINKFRIVKLTPKDQFIIAYGGLRGAIAFSLG
: : .:..::.: :. :.:::. :: .:.::.: : :: ...:::::::.::.:
NP_001 WAWDSGLVLGTLIFILFFRALGVVLQTWVLNQFRLVPLDKIDQVVMSYGGLRGAVAFALV
360 370 380 390 400 410
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 YLLDKKHFPMCDLFLTAIITVIFFTVFVQVLGQGRAGPCLGDPHRLFPWKERKACDLKCD
:::. . : : :... :.:.::::.:: :
NP_001 ILLDRTKVPAKDYFVATTIVVVFFTVIVQGLTIKPLVKWLKVKRSEHHKPTLNQELHEHT
420 430 440 450 460 470
530 540 550
pF1KE2 SSPSSTTNLLCDLGRATPPFWASVSSIVK
NP_001 FDHILAAVEDVVGHHGYHYWRDRWEQFDKKYLSQLLMRRSAYRIRDQIWDVYYRLNIRDA
480 490 500 510 520 530
>>NP_004585 (OMIM: 600477) sodium/hydrogen exchanger 5 i (896 aa)
initn: 1136 init1: 374 opt: 1349 Z-score: 1478.0 bits: 284.0 E(85289): 1.4e-75
Smith-Waterman score: 1349; 51.1% identity (78.6% similar) in 421 aa overlap (84-497:29-447)
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 ERSIGDVTTAPPEVTPESRPVNHSVTDHGMKPRKAFPVLGIDYTHVRTPFEISLWILLAC
.: .. .. .. .:..:. ..::::.:
NP_004 MLRAALSLLALPLAGAAEEPTQKPESPGEPPPGLELFRWQWHEVEAPYLVALWILVAS
10 20 30 40 50
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 LMKIGFHVIPTISSIVPESCLLIVVGLLVGGLIKGVGETPPF-LQSDVFFLFLLPPIILD
: :: ::. ..:.::::::::..::..::.. .:.. . :. .:::::::::.::
NP_004 LAKIVFHLSRKVTSLVPESCLLILLGLVLGGIVLAVAKKAEYQLEPGTFFLFLLPPIVLD
60 70 80 90 100 110
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 AGYFLPLRQFTENLGTILIFAVVGTLWNAFFLGGLMYAVCLVG--GEQINNIGLLDNLLF
.:::.: : : .:::.:: .:::::::::: :. .... .: . ... :::: :::
NP_004 SGYFMPSRLFFDNLGAILTYAVVGTLWNAFTTGAALWGLQQAGLVAPRVQA-GLLDFLLF
120 130 140 150 160 170
240 250 260 270 280
pF1KE2 GSIISAVDPVAVLAVFEEIHINELLHILVFGESLLNDAVTVVLYHLFEEFANY--EHVGI
::.:::::::::::::::.:.:: : :.::::::::::::::::.. . :... .:
NP_004 GSLISAVDPVAVLAVFEEVHVNETLFIIVFGESLLNDAVTVVLYKVCNSFVEMGSANVQA
180 190 200 210 220 230
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 VDIFLGFLSFFVVALGGVLVGVVYGVIAAFTSRFTSHIRVIEPLFVFLYSYMAYLSAELF
.: . : :.:::.:::. ::.:.. . :.:.:::...:.::::.::: .: :::.::.
NP_004 TDYLKGVASLFVVSLGGAAVGLVFAFLLALTTRFTKRVRIIEPLLVFLLAYAAYLTAEMA
240 250 260 270 280 290
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 HLSGIMALIASGVVMRPYVEANISHKSHTTIKYFLKMWSSVSETLIFIFLGVSTVAGSHH
::.:.:. :. . ::::::::::.::.:: .: .: .::.::..::.:.: .:.
NP_004 SLSAILAVTMCGLGCKKYVEANISHKSRTTVKYTMKTLASCAETVIFMLLGISAVDSSK-
300 310 320 330 340 350
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 WNWT--FVISTLLFCLIARVLGVLGLTWFINKFRIVKLTPKDQFIIAYGGLRGAIAFSLG
: : .:..::.: :. :.:::. :: .:.::.: : :: ...:::::::.::.:
NP_004 WAWDSGLVLGTLIFILFFRALGVVLQTWVLNQFRLVPLDKIDQVVMSYGGLRGAVAFALV
360 370 380 390 400 410
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 YLLDKKHFPMCDLFLTAIITVIFFTVFVQVLGQGRAGPCLGDPHRLFPWKERKACDLKCD
:::. . : : :... :.:.::::.:: :
NP_004 ILLDRTKVPAKDYFVATTIVVVFFTVIVQGLTIKPLVKWLKVKRSEHHKPTLNQELHEHT
420 430 440 450 460 470
530 540 550
pF1KE2 SSPSSTTNLLCDLGRATPPFWASVSSIVK
NP_004 FDHILAAVEDVVGHHGYHYWRDRWEQFDKKYLSQLLMRRSAYRIRDQIWDVYYRLNIRDA
480 490 500 510 520 530
555 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 16:04:04 2016 done: Fri Nov 4 16:04:05 2016
Total Scan time: 10.290 Total Display time: 0.110
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]