Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2542
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2542, 901 aa
1>>>pF1KE2542 901 - 901 aa - 901 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0290+/-0.000453; mu= 17.0135+/- 0.028
mean_var=82.3535+/-17.301, 0's: 0 Z-trim(111.1): 409 B-trim: 499 in 1/53
Lambda= 0.141330
statistics sampled from 19130 (19567) to 19130 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.578), E-opt: 0.2 (0.229), width: 16
Scan time: 10.180
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_077740 (OMIM: 125645,610476) desmocollin-2 isof ( 901) 6001 1234.3 0
NP_004940 (OMIM: 125645,610476) desmocollin-2 isof ( 847) 5549 1142.2 0
XP_005258263 (OMIM: 125645,610476) PREDICTED: desm ( 758) 5078 1046.1 0
NP_001932 (OMIM: 600271) desmocollin-3 isoform Dsc ( 896) 4123 851.4 0
NP_077741 (OMIM: 600271) desmocollin-3 isoform Dsc ( 839) 3775 780.4 0
NP_077739 (OMIM: 125643) desmocollin-1 isoform Dsc ( 894) 3204 664.0 8.8e-190
NP_004939 (OMIM: 125643) desmocollin-1 isoform Dsc ( 840) 2830 587.8 7.5e-167
XP_011524090 (OMIM: 114020) PREDICTED: cadherin-2 ( 821) 1344 284.8 1.2e-75
XP_016881003 (OMIM: 114020) PREDICTED: cadherin-2 ( 848) 1344 284.8 1.2e-75
NP_001295105 (OMIM: 114020) cadherin-2 isoform 2 [ ( 875) 1344 284.8 1.3e-75
NP_001783 (OMIM: 114020) cadherin-2 isoform 1 prep ( 906) 1344 284.8 1.3e-75
NP_001239268 (OMIM: 603006) cadherin-4 isoform 3 [ ( 842) 1246 264.8 1.3e-69
NP_001239267 (OMIM: 603006) cadherin-4 isoform 2 [ ( 879) 1246 264.8 1.3e-69
NP_001785 (OMIM: 603006) cadherin-4 isoform 1 prep ( 916) 1246 264.8 1.4e-69
NP_004924 (OMIM: 114019,612580) cadherin-15 prepro ( 814) 1230 261.5 1.2e-68
NP_004351 (OMIM: 114480,137215,167000,176807,19209 ( 882) 1213 258.1 1.4e-67
NP_001304125 (OMIM: 114021,225280,601553) cadherin ( 774) 1201 255.6 6.8e-67
NP_001304124 (OMIM: 114021,225280,601553) cadherin ( 784) 1201 255.6 6.8e-67
XP_011521102 (OMIM: 114021,225280,601553) PREDICTE ( 808) 1201 255.6 7e-67
NP_001784 (OMIM: 114021,225280,601553) cadherin-3 ( 829) 1201 255.6 7.2e-67
NP_001248 (OMIM: 601364) cadherin-13 isoform 1 pre ( 713) 1136 242.3 6.2e-63
NP_001207417 (OMIM: 601364) cadherin-13 isoform 2 ( 760) 1132 241.5 1.1e-62
XP_011521106 (OMIM: 601364) PREDICTED: cadherin-13 ( 612) 1114 237.8 1.2e-61
NP_001207418 (OMIM: 601364) cadherin-13 isoform 3 ( 674) 1092 233.3 3e-60
NP_817123 (OMIM: 607892,607903) desmoglein-4 isofo (1040) 1081 231.2 2e-59
NP_001127925 (OMIM: 607892,607903) desmoglein-4 is (1059) 1081 231.2 2.1e-59
NP_001934 (OMIM: 125671,610193,612877) desmoglein- (1118) 1074 229.8 5.8e-59
XP_011524152 (OMIM: 169615) PREDICTED: desmoglein- ( 998) 1000 214.7 1.8e-54
NP_001935 (OMIM: 169615) desmoglein-3 preproprotei ( 999) 1000 214.7 1.8e-54
XP_011521790 (OMIM: 114480,137215,167000,176807,19 ( 637) 956 205.6 6.3e-52
XP_011521791 (OMIM: 114480,137215,167000,176807,19 ( 637) 956 205.6 6.3e-52
XP_016881012 (OMIM: 605806) PREDICTED: cadherin-7 ( 785) 936 201.6 1.3e-50
NP_004352 (OMIM: 605806) cadherin-7 isoform 1 prep ( 785) 936 201.6 1.3e-50
NP_387450 (OMIM: 605806) cadherin-7 isoform 1 prep ( 785) 936 201.6 1.3e-50
NP_001304143 (OMIM: 605806) cadherin-7 isoform 2 p ( 630) 909 196.0 4.8e-49
NP_001207419 (OMIM: 601364) cadherin-13 isoform 4 ( 459) 902 194.5 9.8e-49
NP_004925 (OMIM: 603019) cadherin-18 isoform 1 pre ( 790) 897 193.6 3.1e-48
XP_006714498 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790) 897 193.6 3.1e-48
XP_016864419 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790) 897 193.6 3.1e-48
XP_016864415 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790) 897 193.6 3.1e-48
XP_016864420 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790) 897 193.6 3.1e-48
NP_001278885 (OMIM: 603019) cadherin-18 isoform 1 ( 790) 897 193.6 3.1e-48
XP_016864414 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790) 897 193.6 3.1e-48
XP_005248285 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790) 897 193.6 3.1e-48
XP_016864418 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790) 897 193.6 3.1e-48
XP_016864416 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790) 897 193.6 3.1e-48
XP_016864421 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790) 897 193.6 3.1e-48
XP_016864417 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790) 897 193.6 3.1e-48
XP_016864413 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790) 897 193.6 3.1e-48
NP_114097 (OMIM: 605807) cadherin-20 preproprotein ( 801) 856 185.3 1e-45
>>NP_077740 (OMIM: 125645,610476) desmocollin-2 isoform (901 aa)
initn: 6001 init1: 6001 opt: 6001 Z-score: 6610.3 bits: 1234.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6001; 100.0% identity (100.0% similar) in 901 aa overlap (1-901:1-901)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MEAARPSGSWNGALCRLLLLTLAILIFASDACKNVTLHVPSKLDAEKLVGRVNLKECFTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_077 MEAARPSGSWNGALCRLLLLTLAILIFASDACKNVTLHVPSKLDAEKLVGRVNLKECFTA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 ANLIHSSDPDFQILEDGSVYTTNTILLSSEKRSFTILLSNTENQEKKKIFVFLEHQTKVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_077 ANLIHSSDPDFQILEDGSVYTTNTILLSSEKRSFTILLSNTENQEKKKIFVFLEHQTKVL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 KKRHTKEKVLRRAKRRWAPIPCSMLENSLGPFPLFLQQVQSDTAQNYTIYYSIRGPGVDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_077 KKRHTKEKVLRRAKRRWAPIPCSMLENSLGPFPLFLQQVQSDTAQNYTIYYSIRGPGVDQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 EPRNLFYVERDTGNLYCTRPVDREQYESFEIIAFATTPDGYTPELPLPLIIKIEDENDNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_077 EPRNLFYVERDTGNLYCTRPVDREQYESFEIIAFATTPDGYTPELPLPLIIKIEDENDNY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 PIFTEETYTFTIFENCRVGTTVGQVCATDKDEPDTMHTRLKYSIIGQVPPSPTLFSMHPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_077 PIFTEETYTFTIFENCRVGTTVGQVCATDKDEPDTMHTRLKYSIIGQVPPSPTLFSMHPT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 TGVITTTSSQLDRELIDKYQLKIKVQDMDGQYFGLQTTSTCIINIDDVNDHLPTFTRTSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_077 TGVITTTSSQLDRELIDKYQLKIKVQDMDGQYFGLQTTSTCIINIDDVNDHLPTFTRTSY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 VTSVEENTVDVEILRVTVEDKDLVNTANWRANYTILKGNENGNFKIVTDAKTNEGVLCVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_077 VTSVEENTVDVEILRVTVEDKDLVNTANWRANYTILKGNENGNFKIVTDAKTNEGVLCVV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 KPLNYEEKQQMILQIGVVNEAPFSREASPRSAMSTATVTVNVEDQDEGPECNPPIQTVRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_077 KPLNYEEKQQMILQIGVVNEAPFSREASPRSAMSTATVTVNVEDQDEGPECNPPIQTVRM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 KENAEVGTTSNGYKAYDPETRSSSGIRYKKLTDPTGWVTIDENTGSIKVFRSLDREAETI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_077 KENAEVGTTSNGYKAYDPETRSSSGIRYKKLTDPTGWVTIDENTGSIKVFRSLDREAETI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 KNGIYNITVLASDQGGRTCTGTLGIILQDVNDNSPFIPKKTVIICKPTMSSAEIVAVDPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_077 KNGIYNITVLASDQGGRTCTGTLGIILQDVNDNSPFIPKKTVIICKPTMSSAEIVAVDPD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 EPIHGPPFDFSLESSTSEVQRMWRLKAINDTAARLSYQNDPPFGSYVVPITVRDRLGMSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_077 EPIHGPPFDFSLESSTSEVQRMWRLKAINDTAARLSYQNDPPFGSYVVPITVRDRLGMSS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 VTSLDVTLCDCITENDCTHRVDPRIGGGGVQLGKWAILAILLGIALLFCILFTLVCGASG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_077 VTSLDVTLCDCITENDCTHRVDPRIGGGGVQLGKWAILAILLGIALLFCILFTLVCGASG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 TSKQPKVIPDDLAQQNLIVSNTEAPGDDKVYSANGFTTQTVGASAQGVCGTVGSGIKNGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_077 TSKQPKVIPDDLAQQNLIVSNTEAPGDDKVYSANGFTTQTVGASAQGVCGTVGSGIKNGG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 QETIEMVKGGHQTSESCRGAGHHHTLDSCRGGHTEVDNCRYTYSEWHSFTQPRLGEKVYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_077 QETIEMVKGGHQTSESCRGAGHHHTLDSCRGGHTEVDNCRYTYSEWHSFTQPRLGEKVYL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 CNQDENHKHAQDYVLTYNYEGRGSVAGSVGCCSERQEEDGLEFLDNLEPKFRTLAEACMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_077 CNQDENHKHAQDYVLTYNYEGRGSVAGSVGCCSERQEEDGLEFLDNLEPKFRTLAEACMK
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 R
:
NP_077 R
>>NP_004940 (OMIM: 125645,610476) desmocollin-2 isoform (847 aa)
initn: 5702 init1: 5549 opt: 5549 Z-score: 6112.6 bits: 1142.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5549; 99.9% identity (100.0% similar) in 837 aa overlap (1-837:1-837)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MEAARPSGSWNGALCRLLLLTLAILIFASDACKNVTLHVPSKLDAEKLVGRVNLKECFTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MEAARPSGSWNGALCRLLLLTLAILIFASDACKNVTLHVPSKLDAEKLVGRVNLKECFTA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 ANLIHSSDPDFQILEDGSVYTTNTILLSSEKRSFTILLSNTENQEKKKIFVFLEHQTKVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ANLIHSSDPDFQILEDGSVYTTNTILLSSEKRSFTILLSNTENQEKKKIFVFLEHQTKVL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 KKRHTKEKVLRRAKRRWAPIPCSMLENSLGPFPLFLQQVQSDTAQNYTIYYSIRGPGVDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KKRHTKEKVLRRAKRRWAPIPCSMLENSLGPFPLFLQQVQSDTAQNYTIYYSIRGPGVDQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 EPRNLFYVERDTGNLYCTRPVDREQYESFEIIAFATTPDGYTPELPLPLIIKIEDENDNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EPRNLFYVERDTGNLYCTRPVDREQYESFEIIAFATTPDGYTPELPLPLIIKIEDENDNY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 PIFTEETYTFTIFENCRVGTTVGQVCATDKDEPDTMHTRLKYSIIGQVPPSPTLFSMHPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PIFTEETYTFTIFENCRVGTTVGQVCATDKDEPDTMHTRLKYSIIGQVPPSPTLFSMHPT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 TGVITTTSSQLDRELIDKYQLKIKVQDMDGQYFGLQTTSTCIINIDDVNDHLPTFTRTSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TGVITTTSSQLDRELIDKYQLKIKVQDMDGQYFGLQTTSTCIINIDDVNDHLPTFTRTSY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 VTSVEENTVDVEILRVTVEDKDLVNTANWRANYTILKGNENGNFKIVTDAKTNEGVLCVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VTSVEENTVDVEILRVTVEDKDLVNTANWRANYTILKGNENGNFKIVTDAKTNEGVLCVV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 KPLNYEEKQQMILQIGVVNEAPFSREASPRSAMSTATVTVNVEDQDEGPECNPPIQTVRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KPLNYEEKQQMILQIGVVNEAPFSREASPRSAMSTATVTVNVEDQDEGPECNPPIQTVRM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 KENAEVGTTSNGYKAYDPETRSSSGIRYKKLTDPTGWVTIDENTGSIKVFRSLDREAETI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KENAEVGTTSNGYKAYDPETRSSSGIRYKKLTDPTGWVTIDENTGSIKVFRSLDREAETI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 KNGIYNITVLASDQGGRTCTGTLGIILQDVNDNSPFIPKKTVIICKPTMSSAEIVAVDPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KNGIYNITVLASDQGGRTCTGTLGIILQDVNDNSPFIPKKTVIICKPTMSSAEIVAVDPD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 EPIHGPPFDFSLESSTSEVQRMWRLKAINDTAARLSYQNDPPFGSYVVPITVRDRLGMSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EPIHGPPFDFSLESSTSEVQRMWRLKAINDTAARLSYQNDPPFGSYVVPITVRDRLGMSS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 VTSLDVTLCDCITENDCTHRVDPRIGGGGVQLGKWAILAILLGIALLFCILFTLVCGASG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VTSLDVTLCDCITENDCTHRVDPRIGGGGVQLGKWAILAILLGIALLFCILFTLVCGASG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 TSKQPKVIPDDLAQQNLIVSNTEAPGDDKVYSANGFTTQTVGASAQGVCGTVGSGIKNGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TSKQPKVIPDDLAQQNLIVSNTEAPGDDKVYSANGFTTQTVGASAQGVCGTVGSGIKNGG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 QETIEMVKGGHQTSESCRGAGHHHTLDSCRGGHTEVDNCRYTYSEWHSFTQPRLGEKVYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
NP_004 QETIEMVKGGHQTSESCRGAGHHHTLDSCRGGHTEVDNCRYTYSEWHSFTQPRLGEESIR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 CNQDENHKHAQDYVLTYNYEGRGSVAGSVGCCSERQEEDGLEFLDNLEPKFRTLAEACMK
NP_004 GHTLIKN
>>XP_005258263 (OMIM: 125645,610476) PREDICTED: desmocol (758 aa)
initn: 5078 init1: 5078 opt: 5078 Z-score: 5594.3 bits: 1046.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5078; 100.0% identity (100.0% similar) in 758 aa overlap (144-901:1-758)
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 EHQTKVLKKRHTKEKVLRRAKRRWAPIPCSMLENSLGPFPLFLQQVQSDTAQNYTIYYSI
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MLENSLGPFPLFLQQVQSDTAQNYTIYYSI
10 20 30
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 RGPGVDQEPRNLFYVERDTGNLYCTRPVDREQYESFEIIAFATTPDGYTPELPLPLIIKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RGPGVDQEPRNLFYVERDTGNLYCTRPVDREQYESFEIIAFATTPDGYTPELPLPLIIKI
40 50 60 70 80 90
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 EDENDNYPIFTEETYTFTIFENCRVGTTVGQVCATDKDEPDTMHTRLKYSIIGQVPPSPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EDENDNYPIFTEETYTFTIFENCRVGTTVGQVCATDKDEPDTMHTRLKYSIIGQVPPSPT
100 110 120 130 140 150
300 310 320 330 340 350
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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.::: ::. :::::::::.:...:.::::: :: ::.:::: .::: . . ::::.::
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:::::::.:::.:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..
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pF1KE2 LCNQDENHKHAQDYVLTYNYEGRGSVAGSVGCCSERQEEDGLEFLDNLEPKFRTLAEACM
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pF1KE2 KR
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NP_001 KR
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NP_077 ADLIRSSDPDFRVLNDGSVYTARAVALSDKKRSFTIWLSDKRKQTQKEVTVLLEHQKKVS
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NP_077 KTRHTRETVLRRAKRRWAPIPCSMQENSLGPFPLFLQQVESDAAQNYTVFYSISGRGVDK
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pF1KE2 EPRNLFYVERDTGNLYCTRPVDREQYESFEIIAFATTPDGYTPELPLPLIIKIEDENDNY
:: ::::.:::::::.::::::::.:. :..::.:.: :::. .::::: :..::::::.
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.::: ::. :::::::::.:...:.::::: :: ::.:::: .::: . . ::::.::
NP_077 IKENLAVGSKINGYKAYDPENRNGNGLRYKKLHDPKGWITIDEISGSIITSKILDREVET
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NP_077 PKNELYNITVLAIDKDDRSCTGTLAVNIEDVNDNPPEILQEYVVICKPKMGYTDILAVDP
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:::.:: :: ::: ... :..:.: : .::::::::::.. : :..::::.:: :..
NP_077 DEPVHGAPFYFSLPNTSPEISRLWSLTKVNDTAARLSYQKNAGFQEYTIPITVKDRAGQA
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pF1KE2 SVTSLDVTLCDCITENDCTHRVDPRIGGGGVQLGKWAILAILLGIALLFCILFTLVCGAS
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:::::::.:::.:: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
NP_077 GQETIEMMKGGNQTLESCRGAGHHHTLDSCRGGHTEVDNCRYTYSEWHSFTQPRLGEESI
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pF1KE2 LCNQDENHKHAQDYVLTYNYEGRGSVAGSVGCCSERQEEDGLEFLDNLEPKFRTLAEACM
NP_077 RGHTG
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pF1KE2 MEAARPSGSWNGALCRLLLLTLAILIFASDACKNVTLHVPSKLDAEKLVGRVNLKECFTA
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::::::. .:.:.:::::::: :..:::::::: .::.:::.::::::.::: :::::
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.:: ::::.:.:::...::: .:::.::.: . ..::: :::.:: ::::::::::.:::
NP_077 KEPFNLFYIEKDTGDIFCTRSIDREKYEQFALYGYATTADGYAPEYPLPLIIKIEDDNDN
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pF1KE2 YPIFTEETYTFTIFENCRVGTTVGQVCATDKDEPDTMHTRLKYSIIGQVPPSPTLFSMHP
: : ... ::. :::: ::.::.: ::: :::::.::::::.:. :.: : ::.::
NP_077 APYFEHRVTIFTVPENCRSGTSVGKVTATDLDEPDTLHTRLKYKILQQIPDHPKHFSIHP
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:::::::. :::: : ::: ..:.:: :: ::: .:.: :...: ::. :.::.::
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::::::: ..:.:::.::.::: ::. :: .. .: :.::::.. :.::::::.::....
NP_077 VKPLNYEVNRQVILQVGVINEAQFSKAASSQTPTMCTTTVTVKIIDSDEGPECHPPVKVI
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pF1KE2 RMKENAEVGTTSNGYKAYDPETRSSSGIRYKKLTDPTGWVTIDENTGSIKVFRSLDREAE
. ... .: :::: ::: :. :.::.:: : .: :...::...... ::::..
NP_077 QSQDGFPAGQELLGYKALDPEISSGEGLRYQKLGDEDNWFEINQHTGDLRTLKVLDRESK
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pF1KE2 TIKNGIYNITVLASDQGGRTCTGTLGIILQDVNDNSPFIPKKTVIICKPTMSSAEIVAVD
.::. :::.:.: : ::.::::: . :.: ::..: : :. : ::. . . : . ::
NP_077 FVKNNQYNISVVAVDAVGRSCTGTLVVHLDDYNDHAPQIDKE-VTICQNNEDFAVLKPVD
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pF1KE2 PDEPIHGPPFDFSLESSTSEVQRMWRLKAINDTAARLSYQNDPPFGSYVVPITVRDRLGM
:: : .::::.: :..:.: . : .. . .: : ... .. : ::: ..:: :.
NP_077 PDGPENGPPFQFFLDNSAS---KNWNIEEKDGKTAILRQRQNLDYNYYSVPIQIKDRHGL
600 610 620 630 640 650
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pF1KE2 SSVTSLDVTLCDCITENDCTHR-VDPRIGGGGVQLGKWAILAILLGIALLFCILFTLVCG
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NP_077 VATHMLTVRVCDCSTPSECRMKDKSTRDVRPNVILGRWAILAMVLGSVLLLCILFTCFC-
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XP_016 TD-VD-RIVGAG--LGTGAIIAILLCIIILLILVLMFVVWMKRRDKERQAKQLLIDPEDD
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NP_001 LIYAQDKETQEKWQVAVKLSLKPTLTEESVKESAEVEEIVFPRQFSKHSGHLQRQKRDWV
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.:.:::: :.. : :. .: : :. ..:.. : ::: : : ..... :. :. .
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:: : : : : :.:.... :.: :..:.: :::..:... :: : :... :::: .
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260 270 280 290 300 310
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